INSTYTUT MATKI I DZIECKA

Transkrypt

INSTYTUT MATKI I DZIECKA
INSTYTUT MATKI I DZIECKA
ZAKŁAD GENETYKI MEDYCZNEJ
Kierownik: prof. dr hab. n. med. Tadeusz Mazurczak
ul. Kasprzaka 17a, 01-211 Warszawa
Tel: (022) 632-96-57; Tel/fax: (022) 632 62 24
e-mail: [email protected]
EWA BOCIAN
DIAGNOSTYKA CYTOGENETYCZNA CHORÓB GENETYCZNYCH – KRYTERIA
I ZASADY PROCEDURY DIAGNOSTYCZNEJ ORAZ SYSTEMU KONTROLI
JAKOŚCI BADAŃ
CZ. II. WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH W 6
OŚRODKACH GENETYKI MEDYCZNEJ W POLSCE
EKSPERTYZA NAUKOWA
DLA MINISTERSTWA ZDROWIA
Warszawa 2000
1
DIAGNOSTYKA CYTOGENETYCZNA CHORÓB GENETYCZNYCH – KRYTERIA I ZASADY
PROCEDURY DIAGNOSTYCZNEJ ORAZ SYSTEMU KONTROLI JAKOŚCI BADAŃ
CZ. II. WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH W 6 OŚRODKACH GENETYKI
MEDYCZNEJ W POLSCE
Badania cytogenetyczne stanowią podstawę pre- i postnatalnej diagnostyki
specyficznych
chorób
i
zespołów
klinicznych
uwarunkowanych
aberracjami
chromosomowymi. Szczególna rola tych badań polega na tym, że ich wynik stanowi
nie tylko podstawę rozpoznania klinicznego choroby, lecz także umożliwia
identyfikację rodziny ryzyka genetycznego. Wyniki badań cytogenetycznych mają
więc zasadnicze znaczenie dla poradnictwa genetycznego i związanej z nim
profilaktyki chorób genetycznych. Niekiedy mają też wpływ na charakter decyzji
prokreacyjnych rodziny. Istnieje zatem uzasadniona konieczność, tak ze względów
klinicznych jak i prawnych, zapewnienia wysokiej ich skuteczności i wiarygodności.
Zapewnienie
zaś
odpowiedniego
standardu
badań
wymaga
prowadzenia
systematycznej wewnątrz laboratoryjnej, jak też zewnętrznej kontroli ich jakości. W
związku z tym podjęto próbę, w oparciu o opracowane wcześniej kryteria i standardy
(cz.
I
ekspertyzy),
oceny
jakości
cytogenetycznych
badań
diagnostycznych
wykonanych w 6 ośrodkach genetyki medycznej w Polsce. Analiza wyników
dokonanej oceny jest przedmiotem tego opracowania.
Ośrodki genetyki medycznej uczestniczące w pilotażowej ocenie jakości
badań cytogenetycznych
-
Zakład Genetyki Medycznej Instytutu Endokrynologii AM w Łodzi
-
Katedra i Zakład Biologii i Genetyki AM w Gdańsku
-
Zakład Genetyki Instytutu Psychiatrii i Neurologii w Warszawie
-
Zakład Genetyki Instytutu „Pomnik Centrum Zdrowia Dziecka” w Warszawie
-
Zakład Genetyki Klinicznej Instytutu Pediatrii AM w Poznaniu oraz
-
Zakład Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka w Warszawie
2
Metody i kryteria oceny jakości
Przedmiotem zewnętrznej, retrospektywnej oceny jakości były cytogenetyczne
badania diagnostyczne wykonane w wymienionych wcześniej ośrodkach w okresie od
1.04 do 31.08.2000. Zakład Genetyki Medycznej IMD uczestniczył tylko w pierwszej
części sprawdzianu jakości. Zastosowane do oceny kryteria i standardy jakości omówione zostały szczegółowo w części I ekspertyzy. Ocenie podlegały po trzy przypadki
diagnostyczne, wybrane losowo spośród badań wykonanych w próbkach krwi oraz
płynu owodniowego. Program oceny składał się z dwóch części. W jednej, oceniana
była skuteczność i czas badań w odniesieniu do minimalnych (możliwych do
zaakceptowania)
standardów.
W
drugiej
zaś
jakość
techniczna
preparatów
chromosomowych, poprawność zastosowanej procedury badania i uzyskanego
wyniku diagnostycznego, oraz sposób opisu wyniku badania. W opisie wyniku
oceniano poprawność zapisu kariotypu wzorem zgodnym z obowiązującymi
zasadami, poprawność interpretacji cytogenetycznej i klinicznej oraz czytelność,
zwięzłość i jednoznaczność opisu. Część druga oceny przeprowadzona została dla
badań wykonanych w 5 ośrodkach (z wyłączeniem Zakładu Genetyki Medycznej
IMD). Dokonano jej anonimowo. Osoba oceniająca znała jedynie numery kodowe
laboratoriów uczestniczących w sprawdzianie.
Minimalne standardy dotyczące skuteczności i czasu badań przedstawiono w
cz. I Ekspertyzy (str. 23). Przyjęto, że laboratorium spełnia wymogi dotyczące jakości
badań tylko wtedy, gdy odpowiednio 96 i 80% badań mieści się w zakresie
standardów przyjętych dla tych parametrów jakości. Minimalne standardy jakości
preparatów chromosomowych w odniesieniu do wskazania klinicznego, które
decydowało o przeprowadzeniu badania podano w tabeli 3 (cz. I, str.25).
Wyniki oceny jakości
Szczegółowe wyniki dokonanej oceny jakości badań cytogenetycznych
wykonywanych w 5 ośrodkach genetyki medycznej podane zostały w Aneksie.
Przedstawiono w nim indywidualne raporty z przeprowadzonej oceny, sporządzone
dla poszczególnych laboratoriów. Zawierają one wyniki oceny dokonanej w oparciu o
3
przyjęte kryteria (wraz ze szczegółowym komentarzem do ocenianych materiałów) a
także uwagi ogólne, wnioski i zalecenia osoby dokonującej sprawdzianu jakości. W
tym rozdziale przedstawiono ogólne wyniki oceny jakości, stanowiące podsumowanie
analizy danych zawartych w aneksie.
Czas i skuteczność badań
W tabelach 1-3 przedstawiono skuteczność i czas trwania cytogenetycznych
badań diagnostycznych wykonywanych w próbkach krwi oraz płynu owodniowego w
sześciu ośrodkach genetyki medycznej w Polsce. Ostatnia rubryka zawiera, dla
porównania, dane uzyskane w brytyjskim programie oceny jakości NEQAS w latach
1998/99. Skuteczność badań prenatalnych (odsetek badań zakończonych uzyskaniem
wyniku) we wszystkich poddających się ocenie laboratoriach była na najwyższym
poziomie (99,6 – 100%, tab. 1). Jednak średni czas trwania badania w
poszczególnych laboratoriach różnił się w znacznym stopniu (11 – 25,5 dni). W
jednym spośród pięciu laboratoriów wykonujących badania prenatalne, odsetek
badań spełniających wymogi minimalnego standardu dla czasu badania (20 dni)
wynosił zaledwie 8,3%. Jest to równoznaczne z niezadowalającą oceną jakości tych
badań, ze specyfiki których wynika konieczność uzyskiwania wyniku diagnostycznego
w jak najkrótszym czasie. W pozostałych czterech laboratoriach odsetek badań
mieszczących się w zakresie minimalnego standardu dla tego parametru był wyższy
niż wymagany (80%) dla wydania pozytywnej oceny jakości tych badań. Jednak
średni czas badań prenatalnych w polskich ośrodkach był o ponad cztery dni dłuższy
niż średni czas uzyskiwany przez laboratoria uczestniczące w systemie kontroli
NEQAS.
Skuteczność badań wykonywanych w próbkach krwi zarówno w przypadku
badań zwykłych jak i pilnych była wysoka (97,8 – 100%), znacznie wyższa od
określonej minimalnym standardem (96%) (tab.2 i 3). Jednak podobnie jak w
przypadku badań prenatalnych, średni czas trwania badań próbek krwi w
poszczególnych laboratoriach wykazywał znaczne zróżnicowanie. W badaniach
zwykłych od 14 do 75 dni, w badaniach pilnych natomiast od 7,5 do10 dni. We
wszystkich, za wyjątkiem jednego, laboratoriach czas trwania badań zwykłych był
znacznie krótszy od przyjętego standardu. W laboratorium, w którym średni czas
4
badania (75 dni) przekraczał niemal trzykrotnie czas określony minimalnym
standardem (28 dni) nie wykonano żadnego badania w określonym standardem
czasie. Przeważająca liczba badań pilnych (100% badań w czterech laboratoriach i
86% w jednym) wykonana została w akceptowanym dla tych badań czasie. Średni
czas trwania badań w próbkach krwi w krajowych laboratoriach (z pominięciem
ośrodka Nr 5) był niemal o 7 dni krótszy niż czas badań uzyskiwany w ośrodkach
poddających się ocenie w systemie NEQAS. Badania pilne wykonane w krajowych
ośrodkach trwały natomiast o dwa dni dłużej niż takie badania z laboratoriów zagranicznych.
Tabela 1. Skuteczność i czas trwania cytogenetycznych badań diagnostycznych wykonanych w
próbkach płynu owodniowego w 5 ośrodkach genetyki medycznej w Polsce
Odsetek badań, w
Średni czas których czas badania
mieścił się w
badania
dni
zakresie minimalnego standardu
Odsetek badań z
nieprawidłowym
kariotypem
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów chromosomowych
Zakres oceny
punktowej preparatów chromosomowych
Kod
Laboratorium
Liczba
badań
Skuteczność
%
1
43
100
11,0
100
6,9
6,3
6-7
2
68
100
18,7
98,5
4,2
4,3
4-5
3
-
-
-
-
-
-
-
4
36
100
25,5
8,3
8,3
6,6
6-7
5
283
99,6
18, 0
85,5
5,3
6,3
6-7
6
71
100
14,7
88,7
7,0
-
-
501
99,8
17,6
83,4
5,8
5,9
4-7
44 901
99,7
13,1
88,0
4,1
5,5
3-8
Razem
NEQAS
1998/99
5
Tabela 2. Skuteczność i czas trwania cytogenetycznych badań diagnostycznych wykonanych w próbkach
krwi w 6 ośrodkach genetyki medycznej w Polsce
Kod
Laboratorium
Liczba
badań
Skuteczność
%
100
2
35
157
3
345
4
225
5
6
1
Razem
NEQAS
1998/99
Odsetek badań, w
Średni czas których czas badania
badania
mieścił się w
zakresie minidni
malnego standardu
Odsetek badań z
nieprawidłowym
kariotypem
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów chromosomowych
Zakres oceny
punktowej preparatów chromosomowych
14
100
28,6
8
7 – 10
25,2
94,9
11,5
5
5–5
19,0
91,3
15,4
5,6
5-7
99,1
18,5
98,2
14,8
7
6–8
166
99,4
75,0
0
4,8
6,3
5–7
82
100
15,5
95,1
7,3
-
27,8
71,6
(18,4)*
(85,7)*
12,8
6,4
5 - 10
25,2
80,7
6,7
6,6
3-9
100
98,8
1010
99,3
53 369
98,4
*Wartości uzyskane dla 5 ośrodków z pominięciem laboratorium Nr 5
Tabela 3. Skuteczność i czas trwania cytogenetycznych badań diagnostycznych wykonanych w trybie
pilnym w próbkach krwi w 6 ośrodkach genetyki medycznej w Polsce
Kod
Laboratorium
1
Liczba
badań
Odsetek wszystkich
badań w próbkach
krwi
Średni czas
badania
dni
Skuteczność
%
Odsetek badań, w których
czas badania mieścił się w
zakresie minimalnego
standardu
Odsetek badań z
nieprawidłowym
kariotypem
12,7
100
8,4
100
20,0
2
5
2
1,2
100
10,0
100
0
3
-
-
-
-
-
4
3
1,3
100
9,3
100
0
5
36
17,8
7,8
8,0
86,1
16,7
6
17
17,2
100
7,5
100
17,6
Razem
63
8,6
98,4
8,6
92,0
15,8
10 205
173
6,8
95,3
20,4
NEQAS
1998/99
-
98,7
6
Jakość techniczna preparatów chromosomowych
Jakość techniczna preparatów uzyskiwanych z próbek krwi oraz płynu owodniowego we wszystkich ocenianych laboratoriach spełniała wymogi odpowiedniego
dla niej standardu. W jednym spośród czterech ocenianych pod tym względem
laboratoriów wykonujących badania prenatalne była ona znacznie niższa niż w
pozostałych laboratoriach.
Średnia ocena punktowa jakości technicznej preparatów chromosomowych z
próbek krwi uzyskanej w 3 spośród 5 ocenianych laboratoriów była dobra (6,3 – 8),
w dwóch dostateczna (5). We wszystkich laboratoriach była ona adekwatna do
wskazań, które zadecydowały o przeprowadzeniu analizy kariotypu. Średnia jakość
techniczna preparatów chromosomowych uzyskiwanych w naszym kraju i w
ośrodkach zagranicznych uczestniczących w sprawdzianie jakości NEQAS jest
podobna.
Metodyka i dokumentacja badań
Stosowana w badaniach diagnostycznych wykonywanych w próbkach krwi
metodyka analizy kariotypu oraz procedura diagnostyczna były prawidłowe we
wszystkich
poddających
się ocenie
laboratoriach.
To
samo
dotyczy
badań
prenatalnych (w próbkach płynu owodniowego) za wyjątkiem jednego elementu
procedury badania a mianowicie wymogu analizy komórek pochodzących z co
najmniej dwóch naczyń hodowlanych. Ten element poprawności metodycznej badań
nie mógł być oceniony z powodu braku informacji na ten temat w załączonej
dokumentacji badań.
Przesłana do oceny dokumentacja badań zawierała formularz skierowania na
badanie, kartę analizy chromosomowej oraz wynik badania, a w niektórych przypadkach także kartę informacyjną pacjenta. Skierowania na badanie zawierały
podstawowe dane osoby badanej, nie zawsze natomiast podawały, istotne dla
cytogenetyka wykonującego badanie, informacje kliniczne. Generalnie, dokumentacja
zawierała podstawowe dane pacjenta numer i datę badania oraz informację o
zastosowanej metodzie badania. Informacje te podane były w wyniku badania.
Żadne z ocenianych laboratoriów wykonujących badania prenatalne nie przesłało
dokumentacji prowadzenia hodowli komórek płynu owodniowego, w dwóch
7
przypadkach brak jest także informacji dotyczących zabiegu i wyniku amniopunkcji.
Żadna z nadesłanych do oceny kart analizy chromosomowej nie zawierała
szczegółowych informacji o tym co osoba analizująca widzi pod mikroskopem, które
powinny stanowić dokument przeprowadzonej analizy.
Opis i interpretacja wyniku badania
Wszystkie oceniane ośrodki przedstawiły wynik badania cytogenetycznego w
postaci zapisu kariotypu wzorem zgodnie z zasadami skróconego opisu aberracji.
Popełniono kilka drobnych i jeden istotny błąd w zapisie stwierdzonych aberracji
(omówienie błędów zawarte jest w Aneksie). Większość ośrodków podała opis
słowny kariotypu oraz interpretację cytogenetyczną i kliniczną stwierdzonych
aberracji w karcie informacyjnej lub w innych dokumentach. Można zatem
przypuszczać, że autorami opisu są lekarze poradni genetycznych, a nie biolodzy.
Tylko jeden ośrodek przedstawił dwa dokumenty, z których jeden zatytułowany jest
„wynik badania kariotypu” i zawiera zarówno zapis wzorem jak i opis słowny
kariotypu drugi zaś, „karta informacyjna” zawierający wynik badania i szczegółową
interpretację cytogenetyczną i kliniczną tego wyniku. Jeden ośrodek nie przedstawił
żadnego opisu ani interpretacji kariotypu zapisanego odręcznie wzorem. Sposób
opisu kariotypu w poszczególnych ośrodkach był zróżnicowany, od bardzo
lakonicznego do nadmiernie rozbudowanego, w większości jednak przypadków
zawierał istotne dla lekarza klinicysty informacje.
Omówienie
Uzyskana,
skuteczność
w
ocenianych
w
cytogenetycznych
tym
badań
pilotażu
laboratoriach
diagnostycznych
krajowych,
była
na
najwyższym poziomie (> 98%) i nie różniła się od skuteczności badań
wykonywanych w ośrodkach zagranicznych uczestniczących w systemie
kontroli jakości NEQAS.
Drugi parametr jakości, czas trwania badań, w ośrodkach krajowych,
był zróżnicowany, odbiegał od przedstawionego w raporcie NEQAS i wymaga
szerszego omówienia. Średni czas badania uzyskany przez 6 polskich laboratoriów,
niezależnie od rodzaju badanej próbki (krew, płyn owodniowy) był dłuższy od
odpowiednich wartości uzyskanych dla tego parametru przez ośrodki zagraniczne.
8
Dotyczy to szczególnie badań prenatalnych (różnica 4 dni), ale także pilnych badań w
próbkach krwi (różnica 2 dni). Na czas trwania badań diagnostycznych mogą mieć
wpływ takie czynniki jak: stosowana metodyka badań (dotyczy to badań
prenatalnych), liczba badań w odniesieniu do liczby cytogenetyków wykonujących te
badania oraz organizacja, wydajność i czas pracy.
Zestawienie danych zebranych w tabeli 4 nie wykazuje jednoznacznej
zależności, chociaż nie wyklucza związku, pomiędzy liczbą wykonanych badań, liczbą
cytogenetyków i czasem badania. Wprawdzie ośrodki Nr 1 i 6 wykonujące najmniej
badań miały też najkrótsze czasy ich trwania a najbardziej obciążony badaniami
ośrodek Nr 5 najdłuższy czas badania to jednak w ośrodkach Nr 2 i 4 mimo podobnej
ogólnej liczby badań i osób je wykonujących czasy trwania badań były zróżnicowane.
Wątpliwości co do istnienia prostej zależności pomiędzy liczbą i czasem badań jeszcze
lepiej dokumentuje ponad dwukrotna różnica czasu badania prenatalnego pomiędzy
ośrodkami Nr 1 i 4, w których podobną liczbę badań wykonywały po 2 osoby. W tym
przypadku
czynnikiem
decydującym
o
zróżnicowaniu
czasu
badania
była
prawdopodobnie inna procedura badawcza.
Tabela 4. Czas trwania badań diagnostycznych w odniesieniu do liczby badań
Kod
laboratorium
Liczba i czas badań (dni)
Ogółem
1
Liczba osób
wykonujących
badania
5
83
40 (14,0)
W próbkach płynu
owodniowego
43 (11,0)
2
5
227
159 (25,2)
68 (18,7)
3
5
345
345 (19,0)
4
5
264
228 (18,5)
36 (25,5)
5
6
485
202 (75,0)
283 (18,0)
6
5
170
99 (15,5)
71 (14,7)
W próbkach krwi
-
-
Bardzo istotnym czynnikiem, od którego zależy czas trwania badań
diagnostycznych
jest
wydajność
pracy
cytogenetyka.
Specyfika
badań
cytogenetycznych decyduje o tym, że wydajnym pracownikiem w tej dziedzinie
można być dopiero po zdobyciu doświadczenia wymagającego co najmniej kilku lat
pracy. Problem polega także na tym, że nie ma w polskich uczelniach programu
nauczania cytogenetyki, nie funkcjonują też żadne formalne systemy szkolenia
9
podyplomowego i specjalizacji w tej dziedzinie. Normalną praktyką jest więc
zdobywanie podstawowej wiedzy z zakresu cytogenetyki klinicznej, zarówno
teoretycznej jak i praktycznej po rozpoczęciu pracy w laboratorium diagnostycznym.
Przy dużej fluktuacji pracowników w laboratoriach cytogenetycznych, związanej
zarówno z niskimi płacami w służbie zdrowia, jak i nie rzadko zdarzającym się
brakiem predyspozycji do tego typu pracy, wydajność pracy zespołu wykonującego
badania nie może być wysoka. Omawiając zagadnienie wydajności pracy nie można
też nie zauważyć faktu, że wszystkie oceniane laboratoria diagnostyczne umiejscowione są w instytutach naukowo badawczych lub Akademiach Medycznych co
nakłada na nie także inne obowiązki poza pracą usługową na rzecz służby zdrowia i
dydaktyki studentów. W tej sytuacji wewnętrzna organizacja pracy i zakres
prowadzonych w ośrodku prac badawczych nie pozostają bez wpływu na wydajność
pracy diagnostycznej.
Ostatni, choć równie ważny jak omówione wcześniej, czynnik decydujący o
liczbie
i
czasie
trwania
badań
wykonywanych
w
polskich
laboratoriach
cytogenetycznych, to obowiązujący w tych laboratoriach czas pracy. Wynosi on,
zgodnie z Rozporządzeniem Rady Ministrów z dnia 27.12.1974 (Dz. U. Nr 51, §2,
ust.1,
pkt
2)
dotyczącym
uciążliwych
warunków
pracy
w
laboratoriach
cytodiagnostycznych tylko 5 godzin dziennie. Takie przepisy nie obowiązują w
żadnym innym kraju europejskim.
Jakość techniczna preparatów chromosomowych decydująca w dużym stopniu
o wiarygodności wyników diagnostycznych spełniała we wszystkich ocenianych
laboratoriach
Stosunkowo
wymogi
często
określone
występujące
minimalnym
różnice
w
standardem
ocenie
w
tym
rozdzielczości
zakresie.
prążkowej
chromosomów pomiędzy laboratorium (wynik oceny zazwyczaj zawyżony) i osobą
oceniającą wskazują na konieczność ustalenia precyzyjniejszych kryteriów tej oceny.
Przesłana do oceny dokumentacja badań była w wielu przypadkach niepełna.
Dotyczy to głównie dokumentacji procedury diagnostycznej (opisu metody badania,
przebiegu hodowli komórek i analizy chromosomów) w związku z czym trudno jest
omawiać to zagadnienie. Można natomiast wyciągnąć stąd wniosek, że przesłany do
ośrodków opis wymagań odnośnie niezbędnej do oceny dokumentacji był za mało
10
dokładny. Omówienia wymaga natomiast sposób przedstawiania i
interpretacji
wyniku badania cytogenetycznego.
Wynik badania powinien mieć standardowy charakter, powinien być wypisany
drukiem
na
odpowiednim
formularzu
z
nagłówkiem
„wynik
badania
cytogenetycznego” i zawierać jasny i zrozumiały dla niespecjalisty opis kariotypu.
Poza podstawowymi informacjami identyfikującymi pacjenta i wykonane badanie,
powinien zawierać, zgodny z obowiązującymi zasadami ISCN 1995, zapis kariotypu
wzorem, zwięzły opis stwierdzonej nieprawidłowości (z określeniem czy jest ona
zrównoważona czy nie), sformułowaną czytelnie interpretację cytogenetyczną oraz
określenie dalszego postępowania diagnostycznego. Taki opis wyniku badania
kariotypu leży w kompetencjach cytogenetyka i powinien być
przez niego
stosowany. Niestety tylko jedno z 5 ocenianych laboratoriów spełniło te wymogi.
Interpretacji klinicznej stwierdzonego kariotypu może dokonać lekarz, specjalista z
zakresu genetyki, podając ją w karcie informacyjnej lub formularzu konsultacji
genetycznej. W większości ocenianych ośrodków opis słowny kariotypu, jego
interpretacja
cytogenetyczna
i
kliniczna
podawane
były
w
dokumentach
sporządzanych, jak należy sądzić, w poradniach genetycznych.
Wnioski
Dokonana
analiza
jakości
cytogenetycznych
badań
diagnostycznych
wykonanych w 6 ośrodkach genetyki medycznej w kraju upoważnia do wyciągnięcia
następujących wniosków:
1. Standard badań cytogenetycznych w ocenianych ośrodkach zapewnia należytą
jakość pre- i postnatalnej diagnostyki cytogenetycznej chorób genetycznych.
2. Konieczne jest dalsze doskonalenie jakości badań, a szczególnie skracanie czasu
ich trwania oraz jakości technicznej preparatów chromosomowych.
3. Średni czas badania prenatalnego uzyskany przez 4 spośród 5 laboratoriów wskazuje na możliwość zmiany minimalnego standardu dla tego parametru. Przyjęty
obecnie czas 20 dni można byłoby skrócić do 18 dni. Podwyższanie standardów
stanowi zazwyczaj skuteczny czynnik mobilizujący do podnoszenia jakości badań.
11
4. Konieczne jest dostosowanie opisu kariotypu do obowiązujących w tym zakresie
zasad. Pożądane jest także wprowadzenie standardowej formy opisu wyniku
badania cytogenetycznego.
5. Pilnych ustaleń wymaga określenie minimalnego standardu dla liczby badań
przypadających na jednego cytogenetyka rocznie. Kraje zachodnioeuropejskie
przyjmują liczbę 200 przy 40 godzinnym tygodniowym czasie pracy.
6. Konieczne jest podjęcie działań zmierzających do opracowania i wdrożenia
systemu
nauczania
i
specjalizacji
w
zakresie
cytogenetyki
klinicznej.
Funkcjonowanie takiego systemu jest podstawą i warunkiem prawidłowej, w pełni
profesjonalnej opieki genetycznej nad pacjentem, której istotnym elementem jest
diagnostyka cytogenetyczna chorób dziedzicznych.
7. Dokonana ocena pilotażowa zaproponowanego systemu kontroli jakości badań
cytogenetycznych według przyjętych wcześniej kryteriów i zasad potwierdza
konieczność podjęcia prac nad wprowadzeniem ogólnopolskiego systemu kontroli
jakości
laboratoriów
cytogenetycznych.
System
taki
wymusi
powstanie
profesjonalnego programu szkolenia w zakresie cytogenetyki klinicznej, a jego
wyniki stanowić powinny podstawę do przyznawania akredytacji lub licencji na
wykonywanie badań diagnostycznych w zakresie cytogenetyki klinicznej. Zasady
organizacji i funkcjonowania systemu kontroli jakości badań cytogenetycznych
zostały omówione i zaakceptowane przez zespół specjalistów i zamieszczone
zostały w I części ekspertyzy.
12
ANEKS
WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH
Raport indywidualny – Laboratorium Nr 1
Podsumowanie wyników
Liczba Skuteczność
badań
%
Materiał
badany
Średni czas
badania
dni
% badań w których
czas badania był w
zakresie min.
standardu
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów
chromosomowych
Krew
(badania
zwykłe)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
35
1010
100
99,3
14
27,8
100
71,6
8
5,6
Krew
(badania
pilne)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
5
63
100
98,4
8,4
8,6
100
92,0
-
Płyn
Oceniane Laboratorium
owodniowy Wszystkie oceniane
laboratoria
43
501
100
99,8
11
17,6
100
83,4
6,3
5,9
Nr preparatu
Ocena punktowa preparatu
dokonana przez laboratorium
Ocena punktowa preparatu
osoby oceniającej
Komentarz osoby
oceniającej
Krew
1.
6709
6/8-9
5/7
1)
2.
6723
8/10
8/10
-
3.
6732
6/8
5/7
2)
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
6/8
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Płyn owodniowy
1.
AC – 1699
6/8
5/7
3)
2.
AC – 1714
4/6
4/6
-
3.
AC – 1717
4/6-7
4/6
4)
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4,3/6,3
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Komentarz:
1) - Przy rozdzielczości prążkowej ocenionej na 6 punktów, całkowita liczba punktów oceny
preparatu może być maximum 8 (skala oceny ogólnej jakości preparatu jest 2-punktowa)
- Zastosowano nieaktualny zapis inwersji, aktualny wg ISCN 1995 jest 9 ph
- Brak w opisie wyniku komentarza, że inv(9) jest wariantem morfologicznym tego chromosomu
i nie ma znaczenia klinicznego
2) Nie uwzględniono w zapisie wzorem oraz w opisie kariotypu stwierdzonego wariantu morfologicznego Yqh+
3) Identyfikacja wszystkich par chromosomów („analiza całkowita”) polega na szczegółowej analizie
„prążek po prążku” każdej pary chromosomów. Czy w ten sposób analizowano 44 metafazy, a
jeśli tak to w jakim celu?
4) Całkowita liczba punktów może być 6 a nie 7 (patrz komentarz 1)
13
Uwagi ogólne i wnioski
Czas i skuteczność badań
Skuteczność badań wykonanych zarówno w próbkach krwi jak i płynu owodniowego jest na
najwyższym poziomie. Czas trwania wszystkich badań mieścił się w zakresie minimalnego
standardu dla tego parametru. Na szczególne wyróżnienie zasługuje krótki (11 dni), nie uzyskany
w żadnym innym laboratorium, średni czas badań prenatalnych.
Metodyka i dokumentacja badań
Zastosowana w badaniach limfocytów metodyka była prawidłowa. Nie można w pełni ocenić
poprawności metodycznej badań w próbkach płynu owodniowego, ponieważ w załączonej
dokumentacji brak jest informacji z ilu naczyń hodowlanych pochodziły analizowane komórki.
Wątpliwości budzi celowość „pełnej analizy” 15, a nawet 44 płytek metafazowych. Przypuszczam,
że jest to nieporozumienie wynikające z błędnego zrozumienia określenia „pełna analiza”. Należy
pod nim rozumieć analizę „prążek po prążku” wszystkich chromosomów. Takiej analizy dokonuje
się zazwyczaj w kilku (3-5) komórkach. Pozostałe są analizowane częściowo.
W przesłanej do oceny dokumentacji badań brak jest danych dotyczących zabiegu i wyniku
amniopunkcji (liczba nakłuć, ilość i wygląd płynu owodniowego, wiek ciąży itp.). Dokumentacja
analizy cytogenetycznej jest niezwykle lakoniczna i nie zawiera szczegółowych informacji o tym
co osoba analizująca widzi pod mikroskopem (nie w każdej komórce obraz prążkowy wszystkich
chromosomów jest w pełni jednoznaczny).
Jakość techniczna preparatów
Techniczną jakość preparatów należy ocenić jako dobrą. Zarówno rozdzielczość prążkowa
chromosomów jak i liczba płytek metafazowych, o określonej wymogami diagnostycznymi
rozdzielczości, jest dobra, a w niektórych przypadkach, bardzo dobra.
Opis i interpretacja wyniku badania
Formularz wyniku badania kariotypu zawiera tylko zapis kariotypu wzorem. Opis kariotypu wraz z
interpretacją cytogenetyczną i kliniczną wyniku zawarte są w karcie informacyjnej. Przyjęty przez
ośrodek system opisu, znaczna część którego poświęcona jest informacji o prawidłowym
zróżnicowaniu prążkowym chromosomów, układaniu chromosomów zgodnie z określonymi
zasadami jest dyskusyjny. Opis wyniku powinien być zwięzły, precyzyjny i czytelny. Informacja w
nim zawarta powinna być jednoznaczna. Zbyt szczegółowy i rozwlekły opis wyniku sprawia, że
staje się on mało czytelny, gubi się w nim to co najważniejsze. Zamiast dwóch zadań o
odmiennym układzie prążków w chromosomach pary 9 pozwalającym rozpoznać inwersję
wystarczyło by napisać „stwierdzono inwersję...”. Kariotyp prawidłowy wystarczy opisać
„stwierdzono prawidłowy kariotyp męski/żeński”.
Wnioski
Przesłane do oceny materiały stanowią podstawę do pozytywnej oceny jakości badań
cytogenetycznych. Standard tych badań zapewnia należytą jakość pre- i postnatalnej diagnostyki
cytogenetycznej chorób genetycznych. Zalecane jest prowadzenie pełnej dokumentacji analizy
chromosomowej. Powinna ona uwzględniać zapis wszystkich wątpliwości powstających podczas
14
analizy obrazu prążkowego chromosomów. Rozważyć także należy zmianę formuły opisu
słownego kariotypu.
WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH
Raport indywidualny – Laboratorium Nr 2
Podsumowanie wyników
Materiał
badany
Liczba
badań
Skuteczność
%
Średni czas
badania
dni
% badań w których
czas badania był w
zakresie min.
standardu
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów
chromosomowych
Krew
(badania
zwykłe)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
157
1010
100
99,3
25,2
27,8
94,9
71,6
5,0
5,6
Krew
(badania
pilne)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
2
63
100
98,4
10,0
8,6
100
92,0
-
Płyn
Oceniane Laboratorium
owodniowy Wszystkie oceniane
laboratoria
68
501
100
99,8
18,7
17,6
98,5
83,4
4,3
5,9
Nr preparatu
Ocena punktowa preparatu
dokonana przez laboratorium
Ocena punktowa preparatu
osoby oceniającej
Komentarz osoby
oceniającej
Krew
1.
6695
4/6
4/5
1)
2.
6781
4/6
4/5
2)
3.
6820
4/6
4/5
-
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4/5
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Płyn owodniowy
1.
P – 288
4/4
3/4
-
2.
P – 312
5/6
3/5
3)
3.
P – 336
4/4
3/4
-
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
3,3/4,4
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Komentarz:
1) Ponieważ badanie wykonano metodą GTG i FISH zapis kariotypu wzorem powinien to uwzględniać. Najpierw należy zapisać to co udało się stwierdzić met. GTG, a potem po kropce wynik badania metodą FISH. Wynik badania tą metodą powinien być opisany dla każdej pochodnej translokacji (dla każdego nieprawidłowego chromosomu) osobno. W przeciwnym razie nie jest on zrozumiały i jednoznaczny. 45,XX,- - - . ish der(13;14)(q- -q)(wcp4+,wcp13+)t (4;13)(q- q)(wcp4+,wcp13+). Brak również we wzorze „pat”.
15
2) Niezgodność danych zawartych w formularzu 2 dotyczących liczby analizowanych komórek
(30+10) z danymi zawartymi w wyniku badania (20+10). Zapis wyniku badania metodą rutynową
powinien być oddzielony kropką od zapisu wyniku uzyskanego metodą FISH.
3) Brak w zapisie wzorem kariotypu płodu stwierdzenia, że inwersja pochodzi od matki („mat”). W
opisie wyniku nie podano rodzaju stwierdzonej inwersji oraz jej rodzicielskiego pochodzenia.
Komentarz diagnostyczny w opisie wyniku badania kariotypu matki nie jest dla mnie zrozumiały.
Co oznacza stwierdzenie „nosicielstwo inwersji ... bez konsekwencji klinicznych”? Miejsca złamań
w stwierdzonej inwersji są w 10p11.2 (nie ma we wzorcu prążkowym prążka 11) i w 10q21.2.
Uwagi ogólne i wnioski
Czas i skuteczność badań
Skuteczność badań wykonanych zarówno w próbkach krwi jak i płynu owodniowego
jest na najwyższym poziomie. Odsetek badań, w których czas badania mieścił się w
zakresie minimalnego standardu dla tego parametru był wyższy niż wymagany do
spełnienia kryterium pozytywnej oceny jakości badań. Średni czas trwania badań
prenatalnych był nieco dłuższy od średniego czasu wszystkich ocenianych
laboratoriów.
Metodyka i dokumentacja badań
Zastosowana w badaniach limfocytów krwi obwodowej metodyka była prawidłowa.
Nie można w pełni ocenić poprawności metodycznej badań w próbkach płynu
owodniowego, ponieważ w załączonej dokumentacji brak jest informacji z ilu naczyń
hodowlanych pochodziły analizowane komórki. Wątpliwości budzi celowość „pełnej
analizy” 10 czy 20 płytek metafazowych. Przypuszczam, że jest to nieporozumienie
wynikające z błędnego zrozumienia określenia „pełna analiza”. Oznacza ono analizę
„prążek po prążku” wszystkich chromosomów. Takiej analizy dokonuje się zazwyczaj
w kilku (3 – 5) komórkach. Pozostałe są analizowane częściowo.
W przesłanej do oceny dokumentacji badań brak jest skierowań na badania oraz
danych dotyczących zabiegu i wyniku amniopunkcji (liczba nakłuć, ilość i wygląd
płynu owodniowego, wiek ciąży itp.). Dokumentacja analizy cytogenetycznej jest
niezwykle lakoniczna i nie zawiera szczegółowych informacji o tym co osoba
analizująca widzi pod mikroskopem (nie w każdej komórce obraz prążkowy
chromosomów jest w pełni jednoznaczny).
Jakość techniczna preparatów
Jakość techniczną preparatów należy ocenić jako dostateczną. We wszystkich
preparatach widać cytoplazmę w płytkach metafazowych. W znacznej części
preparatów laboratoryjna ocena rozdzielczości prążkowej chromosomów oraz liczby
płytek metafazowych, o określonej wymogami diagnostycznymi rozdzielczości była
16
zawyżona. W dwóch przypadkach (nr 6695 i 6820) uzyskana rozdzielczość prążkowa
była niższa od wymaganej dla określonego wskazania do badania.
Opis i interpretacja wyniku badania
Wynik badania cytogenetycznego przedstawiony jest w formularzu zatytułowanym
„Wynik konsultacji genetycznej”. Zawiera on istotne informacje dotyczące
zastosowanej w badaniu metodyki, zapis kariotypu wzorem oraz bardzo zwięzły (w
niektórych przypadkach zbyt lakoniczny) komentarz diagnostyczny. Brak w nim
słownego opisu kariotypu. Dla przykładu, w przypadku kariotypu 47,XX,+21 w
komentarzu nie ma stwierdzenia, że zidentyfikowano trisomię chromosomu 21 co
odpowiada rozpoznaniu zespołu Downa jest tylko stwierdzenie „zespół Downa”.
Złożoną translokację pomiędzy trzema chromosomami skomentowano „nosicielstwo
zrównoważonej translokacji” a inwersję pericentryczną chromosomu 10 pochodzenia
matczynego stwierdzoną u płodu „nosicielstwo inwersji chromosomu 10”. Popełniono
kilka drobnych błędów w zapisie kariotypu wzorem.
Wnioski
Przesłane do oceny materiały stanowią podstawę do pozytywnej oceny jakości
diagnostycznych badań cytogenetycznych. Wskazane jest doskonalenie jakości
technicznej preparatów chromosomowych oraz dążenie do skrócenia średniego czasu
badań prenatalnych.
17
WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH
Raport indywidualny – Laboratorium Nr 3
Podsumowanie wyników
Materiał
badany
Liczba Skuteczność
badań
%
Krew
(badania
zwykłe)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
345
1010
Krew
(badania
pilne)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
-
Płyn
Oceniane Laboratorium
owodniowy Wszystkie oceniane
laboratoria
-
Nr preparatu
98,8
99,3
Średni czas
badania
dni
% badań w których
czas badania był w
zakresie min.
standardu
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów
chromosomowych
19,0
27,8
91,3
71,6
5,6
6,4
Ocena punktowa preparatu
dokonana przez laboratorium
Ocena punktowa preparatu
osoby oceniającej
Komentarz osoby
oceniającej
Krew badanie zwykłe
1.
513
brak
5/7
1
2.
608
brak
4/5
2
3.
737
Brak
4/5
3
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4,3 / 5,6
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Komentarz:
Dotyczy wszystkich nadesłanych przypadków: podane w formularzu 3 liczby komórek liczonych / analizowanych nie odpowiadają liczbom podanym w wynikach badań. Nie jest zrozumiałe dlaczego w każdym wyniku badania liczba metafaz liczonych odpowiada liczbie metafaz analizowanych.
1. Niezgodność komentarza dotyczącego charakteru stwierdzonej translokacji w opisie
wyniku badania i w karcie informacyjnej. W opisie wyniku podano, że translokacja jest
niezrównoważona, w karcie informacyjnej, że niezrównoważenie jest prawdopodobne,
ale niemożliwe do wykazania.
2. Słowny opis wyniku badania nie zawiera stwierdzenia, że translokacja jest zrównoważona. Zawyżona, w stosunku do rzeczywistej, rozdzielczość prążkowa chromosomów
podana w wyniku badania.
3. Nawet przy rozdzielczości 400 prążków chromosom 1 ma prążki p34.1-3, a nie jak
podano w zapisie kariotypu wzorem p34. Podana w wyniku rozdzielczość 550 prążków
jest zawyżona w stosunku do uzyskanej.
18
Uwagi ogólne i wnioski
Czas i skuteczność badań
Skuteczność badań należy ocenić jako bardzo wysoką. Odsetek badań odpowiadający
minimalnemu standardowi czasu trwania badania jest także wysoki. Oba parametry
spełniają wymogi należytej jakości badań.
Metodyka i dokumentacja badań
Zastosowana metodyka badań była prawidłowa. Przesłana dokumentacja ocenianych
przypadków zawiera odpowiednie dane za wyjątkiem brakującego dokumentu analizy
chromosomowej.
Jakość techniczna preparatów
Techniczną jakość preparatów można ocenić jako zadowalającą. W dwóch przypadkach ocena rozdzielczości prążkowej podana w wyniku badania była zawyżona a
ogólna jakość preparatów słaba (mało metafaz). Niestety nie została podana, w
załączonym do wypełnienia formularzu, laboratoryjna ocena rozdzielczości prążkowej
chromosomów oraz ogólnej jakości preparatów przesłanych do oceny.
Opis i interpretacja wyniku badania
Wynik badania zawiera poprawny (za wyjątkiem jednego drobnego błędu) zapis
kariotypu wzorem oraz bardzo zwięzły opis słowny stwierdzonej nieprawidłowości.
Szczegółowa interpretacja kliniczna wyniku podana w karcie informacyjnej zawiera
odpowiednie i podane we właściwej formie informacje.
Wnioski
Przesłane do oceny materiały stanowią podstawę do pozytywnej oceny jakości badań
cytogenetycznych. Zalecane jest doskonalenie jakości technicznej preparatów
chromosomowych.
19
WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH
Raport indywidualny – Laboratorium Nr 4
Podsumowanie wyników
Materiał
badany
Liczba Skuteczność
badań
%
Średni czas
badania
dni
% badań w których
czas badania był w
zakresie min.
standardu
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów
chromosomowych
Krew
(badania
zwykłe)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
225
1010
99,1
99,3
18,5
27,8
98,2
71,6
7,0
5,6
Krew
(badania
pilne)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
3
63
100
98,4
9,3
8,6
100
92,0
-
Płyn
Oceniane Laboratorium
owodniowy Wszystkie oceniane
laboratoria
36
501
100
99,8
25,5
17,6
8,3
83,4
6,6
5,9
Nr preparatu
Ocena punktowa preparatu
dokonana przez laboratorium
Ocena punktowa preparatu
osoby oceniającej
Komentarz osoby
oceniającej
Krew
1.
310
6/7
5/6
-
2.
197
6/8
6/8
1)
3.
388
6/8
5/7
-
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
5,3/7
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Płyn owodniowy
1.
A - 5025
4/8
5/7
2)
2.
A – 5036
6/9
5/7
3)
3.
A – 5015
4/7
4/6
4)
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4,6/6,6
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Komentarz:
Uwaga odnosząca się do wszystkich wyników badań krwi i płynu owodniowego – brak opisu
słownego i interpretacji cytogenetycznej uzyskanych wyników.
Uwagi szczegółowe:
1) Uzyskana w badaniu rozdzielczość prążkowa umożliwia precyzyjniejsze określenie
miejsc złamań
2) i 3) Nieprawidłowa punktacja jakości preparatu chromosomowego. Przy rozdzielczości
prążkowej ocenionej na 4 punkty, całkowita liczba punktów nie może być wyższa niż 6
(ogólna jakość preparatu oceniana jest w skali 2-punktowej). Nieprawidłowy zapis polimorfizmu satelitów w zapisie kariotypu wzorem ps+, a nie ps+. Brak komentarza cytogenetycznego co ten zapis oznacza.
4) Nieprawidłowa punktacja oceny jakości preparatu chromosomowego.
20
Uwagi ogólne i wnioski
Czas i skuteczność badań
Skuteczność badań wykonanych zarówno w próbkach krwi jak i płynu owodniowego należy
ocenić jako bardzo wysoką. Odsetek badań próbek krwi odpowiadających minimalnemu standardowi czasu trwania badania był także wysoki. Tylko 8,3% badań prenatalnych spełniało
wymagania dotyczące czasu trwania badania a średni czas tych badań przekraczał minimalny
standard o ponad 5 dni.
Metodyka i dokumentacja badań
Metodyka badań limfocytów krwi obwodowej była prawidłowa. Nie można w pełni ocenić
poprawności metodycznej badań komórek płynu owodniowego ponieważ w załączonej dokumentacji nie podano informacji z ilu naczyń hodowlanych pochodziły analizowane komórki.
Pełnej analizy oznaczającej „analizę prążek po prążku” wszystkich chromosomów dokonuje
się zazwyczaj w 3-5 komórkach. Mam wątpliwości czy rzeczywiście analizowano w ten
sposób po 10 komórek, jak zaznaczono to w większości ocenianych przypadków. Przesłana
dokumentacja badań jest skąpa. Nie ma w niej dokumentacji analizy chromosomowej.
Skierowania nie zawierają żadnych szczegółowych informacji o cechach klinicznych pacjenta.
Formularz skierowania zawiera rubryki „dane kliniczne uzasadniające rozpoznanie”, „wywiad
rodzinny”, które nie są wypełnione. Jeśli skierowanie jest tak lakoniczne jak „podejrzenie
aberracji chromosomowej” to brak jest informacji stanowiących podstawę do określenia
rozdzielczości prążkowej, która powinna być zastosowana w badaniu.
Jakość techniczna preparatów
Techniczną jakość preparatów należy ocenić jako dobrą. Uzyskana rozdzielczość prążkowa
była adekwatna do wskazań, które zadecydowały o wykonaniu badania cytogenetycznego. W
trzech przypadkach laboratoryjna ocena rozdzielczości prążkowej chromosomów oraz liczby
płytek metafazowych w preparacie, o określonej wymogami diagnostycznymi rozdzielczości,
była nieco zawyżona.
Opis i interpretacja wyniku badania
Wynik badania zawiera jedynie zapis kariotypu wzorem. Brak jest opisu słownego kariotypu
oraz interpretacji cytogenetycznej stwierdzonych nieprawidłowości. Wynik badania kariotypu
powinien zawierać informację zrozumiałą dla każdego lekarza, a nie tylko dla specjalisty genetyka klinicznego. Przedstawienie kariotypu jedynie w postaci wzoru, szczególnie w
przypadku stwierdzenia aberracji strukturalnej wymogu tego nie spełnia.
Wnioski
Przesłane do oceny materiały stanowią podstawę do pozytywnej oceny jakości
diagnostycznych badań cytogenetycznych w próbkach krwi. Konieczne jest skrócenie czasu
trwania badań prenatalnych tak aby w 80% tych badań czas badania nie przekraczał 20 dni.
Do wyniku badania należy wprowadzić opis i interpretację cytogenetyczną stwierdzonego
kariotypu.
21
WYNIKI OCENY JAKOŚCI BADAŃ CYTOGENETYCZNYCH
Raport indywidualny – Laboratorium Nr 5
Podsumowanie wyników
Liczba Skuteczność
badań
%
Materiał
badany
Średni czas
badania
dni
% badań w których
czas badania był w
zakresie min.
standardu
Średnia ocena
punktowa jakości
preparatów
chromosomowych
Krew
(badania
zwykłe)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
166
1010
99,4
99,3
75
27,8
0
71,6
6,3
5,6
Krew
(badania
pilne)
Oceniane Laboratorium
Wszystkie oceniane
laboratoria
36
63
97,8
98,4
8
8,6
86,1
92,0
-
Płyn
Oceniane Laboratorium
owodniowy Wszystkie oceniane
laboratoria
283
501
99,6
99,8
18
17,6
85,5
83,4
6,3
5,9
Nr preparatu
Ocena punktowa preparatu
dokonana przez laboratorium
Ocena punktowa preparatu
osoby oceniającej
Komentarz osoby
oceniającej
Krew
1.
12531
6/7
5/7
1)
2.
12578
5/6
5/7
-
3.
12634
4/6
4/5
-
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4,6/6,3
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Płyn owodniowy
1.
8056
5/7
5/7
2)
2.
8263
5/7
4/6
-
3.
8232
4/6
4/6
3)
Średnia ocena punktowa osoby oceniającej
4,3/6,3
(rozdzielczość prążkowa/całkowita liczba punktów)
Komentarz:
1) Nieprawidłowy zapis kariotypu wzorem, sugerujący, że ramię p jednego chromosomu
połączyło się z ramieniem q drugiego, podczas gdy nastąpiło połączenie dwóch ramion p
i dwóch ramion q. Prawidłowy zapis 46,XY,t(4;5)(p10;p10)
2) We wzorach prążkowych chromosomów nie ma prążków 1p36 i 7q11, są odpowiednio
1p36.1-3 i 7q11.2. Uzyskana w badaniu rozdzielczość prążkowa umożliwia precyzyjniejsze określenie punktów złamań niż podaje zapis kariotypu. Są one 1p36.3 i 7q11.21.
3) W badaniu policzono za mało komórek w stosunku do standardu analizy (15-20), chociaż
można było policzyć więcej. Osoba oceniająca znalazła komórkę 47,XXY, co sugeruje
obecność drugiej linii komórkowej.
22
Uwagi ogólne i wnioski
Czas i skuteczność badań
Skuteczność badań wykonanych zarówno w próbkach krwi jak i płynu owodniowego
jest na wysokim poziomie i spełnia wymagania określone minimalnym standardem
dla tego kryterium jakości. W przypadku badań prenatalnych średni czas badania
oraz odsetek badań mieszczących się w zakresie minimalnego standardu dla tego
parametru spełniał wymogi odpowiedniego dla tych badań standardu jakości. Średni
czas badań w próbkach krwi przekraczał niemal trzykrotnie czas określony dla tych
badań jako minimalny standard jakości. W żadnym ze 166 badań nie uzyskano
wyniku w określonym tym standardem czasie.
Metodyka i dokumentacja badań
Zastosowana w badaniach limfocytów krwi obwodowej metodyka była poprawna. W
przypadku badań prenatalnych brak jest informacji z ilu naczyń hodowlanych pochodziły analizowane komórki co ma istotne znaczenie dla oceny metodyki badań.
Przesłana dokumentacja badań nie zawiera dokumentu analizy chromosomowej, w
części przypadków brak jest także skierowania na badanie.
Jakość techniczna preparatów
Jakość techniczną preparatów chromosomowych należy ocenić jako zadawalającą.
Rozdzielczość prążkowa była adekwatna do wskazań, które zadecydowały o
wykonaniu badania. W dwóch badaniach ocena rozdzielczości dokonana przez
laboratorium była nieco zawyżona.
Opis i interpretacja wyniku badania
Wynik badania kariotypu podany jest w dwóch dokumentach (bez nagłówków). W
jednym z nich kariotyp zapisany jest odręcznie i tylko wzorem, bez żadnego
komentarza. Drugi dokument zawiera wynik badania kariotypu wraz z odpowiednim
komentarzem cytogenetycznym i klinicznym. Jeśli pierwszy z dokumentów
wypisywany jest, jak można się domyślać, w laboratorium to powinien zawierać opis
słowny i interpretację cytogenetyczną uzyskanego wyniku.
23
Wnioski
Przesłane do oceny materiały stanowią podstawę do pozytywnej oceny jakości
diagnostycznych badań cytogenetycznych. Konieczne jest skrócenie czasu trwania
badań w próbkach krwi.
Streszczenie
Dokonane opracowanie stanowi zbiór przedyskutowanych i zaakceptowanych przez
zespół
ekspertów
cytogenetycznych.
zasad
Jest
i
organizacji
odzwierciedleniem
systemu
kontroli
powszechnie
jakości
uznawanej
badań
potrzeby
poddawania nowoczesnych procedur diagnostycznych stosowanych w genetyce
klinicznej kontroli jakości. Przeprowadzone badania pilotażowe w 6 ośrodkach
genetyki
medycznej
prowadzących
badania
cytogenetyczne
są
ilustracją
funkcjonowania i sprawdzeniem w praktyce zaproponowanego systemu, którego
wyniki stanowić mogą podstawę oceny poziomu profesjonalnego uczestniczących w
badaniu laboratoriów. Wykonana praca jest jednocześnie propozycją dla Ministerstwa
Zdrowia wprowadzenia opracowanego systemu kontroli jakości w kraju.
24

Podobne dokumenty