Test nifty - Lecznica Medea

Test NIFTY oferowany przez firmę BGI określa ryzyko wystąpienia aneuplodii poprzez
detekcję materiału genetycznego dziecka tzw. cffDNA krążącego we krwi obwodowej
matki. DNA dziecka zostaje poddane analizie metodą Sekwencjonowania Nowej
Genaracji (ang. NGS) w połączeniuz zaawansowanymi analizami bioinformatycznymi.
Dzięki zastosowaniu najnowszych osiągnięć nauki, ten nieinwazyjny test nie niesie ze
sobą ryzyka poronienia oraz infekcji wewnątrzmacicznych, a ponadto charakteryzuje się
bardzo dużą czułością oraz dokładnością powyżej 99%.
Test jest przeznaczony do określenia ryzyka wystąpienia trisomii chromosmów: 21, 18,
13 pomiędzy 12 a 24 tygodniem
ciąży.
Instytut BGI to jeden z największych ośrodków zajmujących się genomiką na świecie.
Został założonyw 1999 roku z misją uczestnictwa w projekcie poznania genomu
ludzkiego (Human Genome Project). Obecnie jesteśmy czołowym partnerem naukowym
dla międzynarodowej społeczności badawczej. Celem firmy BGI jest stworzenie łatwo
dostępnej platformy naukowej poprzez inwestycje w infrastrukturę i wykorzystanie
wiedzy ekspertów z dziedziny bioinformatyki.
Firma BGI opracowała wysokie standardy na styku nauki i biznesu, czego dowodem jest
opracowanie innowacyjnych rozwiązań, które przyniosły ponad 170 publikacji w
najwyżej rankingowanych czasopismach takich jak”Nature” czy ”Science”.
W dniu 10 lutego 2012 w Kopenhaskim Parku Naukowo-Technologicznym otwarto
”Centrum Genomiki BGI Europe”, którego celem jest wspomagania globalnych badań
w dziedzinie genomiki i rozwoju w obszarze nauk medycznych, hodowli rolnej, jak
również ochrony środowiska.
Centrala ”BGIEurope”, wraz z laboratoriami zlokalizowanymi w Kopenhadze, tworzy
sieć współpracy z wiodącymi akademickimi i rządowymi instytucjami badawczymi, jak
również światowej sławy firmami działąjącymi w obszarach biotechnologii i farmacji.
Naszeplatformy technologiczne wykorzystują wielkoskalowe sekwencjonowanie
genomowe oraz umożliwiają przetwarzanie informacji. Zadaniem BGI jest wykorzystanie
opracowanych innowacyjnych technologii, w oparciu o doświadczenia i wiedzę
najlepszych ekspertów z dziedziny genomiki, w celu udoskonalania metod
diagnostycznych, udostępniania tych metod i rozwoju służby zrowia.
Trisomie chromosomów 21, 18, 13 są najczęściej występującymi zespołami wad
wrodzonych wywołanymi przez obecność dodatkowych kopii chromosomu 21, 18 lub 13.
Średnio 1 na 800 dzieci rodzi się z zespołem Down’a (trisomia 21), jedno na 6000 dzieci
rodzi się z zespołem Edwards’a (trisomia 18) oraz 1 na 10 000 dzieci rodzi się z
zespołem Patau (trisomia 13).
Zespół Downa, Trisomia 21 (ang. Down syndrome, trisomy 21), dawniej nazywany
mongolizmem – zespół wad wrodzonych spowodowany obecnością dodatkowego
chromosomu 21. Eponim pochodzi od nazwiska brytyjskiego lekarza Johna Langdona
Downa, który opisał go w 1866 roku. W 1959 roku Jérôme Lejeune odkrył, że u podstaw
zespołu wad wrodzonych leży trisomia chromosomu 21. U osób z zespołem Downa
istnieje zwiększone ryzyko wystąpienia: wad wrodzonych serca, refluksu żołądkowoprzełykowego, nawracających infekcji ucha, zespołu bezdechu śródsennego i chorób
gruczołu tarczowego.
Ostateczny stopień rozwoju i komfort życia dziecka z zespołem Downa mogą poprawić
działania zainicjowane już we wczesnym dzieciństwie, tj. prawidłowa opieka lekarska,
akceptacja i zaangażowanie rodziny oraz edukacja i szkolenie zawodowe. Istnieją jednak
pewne fizjologiczne i genetyczne ograniczenia, których nie można pokonać
Zespół Edwards'a, Trisomia 18. Około 95% płodów z trisomią 18 ulega
spontanicznemu poronieniu. 30% żywo urodzonych dzieci z zespołem Edwardsa umiera
w pierwszym miesiącu życia, tylko 10% przeżywa 1 rok.
Częstość zespołu Edwardsa wzrasta z wiekiem matki, podobnie jak w zespole Downa;
zespół Edwardsa cztery razy częściej dotyczy dziewczynek niż chłopców. Dziecko z
zespołem Edwardsa jest znacznie mniejsze od normalnego noworodka.
Charakterystyczną cechą są szeroko rozstawione oczy (hiperteloryzm) często z opadającą
górną powieką. W czaszce stwierdza się cystę splotu naczyniówkowego czyli zbiorniczek
z płynem. Poza tym zaburzone są funkcje wielu układów m.in. oddechowego i krążenia,
częste są wady serca, przepuklina pępkowa i pachwinowa, u chłopców niezstąpienie
jąder. Dziecko na ogół nie jest w stanie samo jeść, dlatego musi być karmione sondą lub
przez wytworzoną gastrostomię (przetoka prowadząca wprost do żołądka). Dzieci, nawet
jeśli przeżyją dłużej niż rok, nie są w stanie same chodzić, a ich zdolności poznawcze i
komunikacyjne są bardzo ograniczone.
Zespół Patau, Trisomia 13. Występuje z częstością 1 na 8000-12000 urodzeń. Podobnie
jak w przypadku zespołu Edwarda (trisomia chromosomu 18) nie została ustalona
bezpośrednia przyczyna tego schorzenia.
Ryzyko urodzenia dziecka z tym syndromem wzrasta jednak wraz z wiekiem matki.
Często płód obumiera jeszcze w macicy lub dziecko rodzi się martwe. Jeśli dojdzie do
urodzenia dziecka, można wtedy obserwować postępujące upośledzenie jego rozwoju.
Dzieci z zespołem Patau umierają najczęściej w pierwszych latach swojego życia,
zdarzają się jednak przypadki dojścia do okresu dojrzewania lub też dorosłości.
Najstarsza osoba dotknięta tą choroba dożyła 33 roku życia. Objawy choroby są
najczęściej widoczne już tuż po urodzeniu dziecka. U dzieci dotkniętych zespołem Patau
najczęściej uszkodzeniu ulegają układ nerwowy oraz układ krążenia. Wśród wad tych
układów występują dysfunkcje serca w postaci wady przegrody międzykomorowej i/lub
międzyprzedsionkowej a także położenie serca zamiast po lewej to po prawej stronie
klatki piersiowej. Często nie dochodzi także do pełnego podziału mózgowia na lewą i
prawą półkulę. Taka sytuacja doprowadza do występowania u tych dzieci ciężkich
zaburzeń neurologicznych. Niestety nie ma środka, który dzięki wczesnym badaniom,
poprzez wykrycie choroby pozwoli jej zapobiec lub zniwelować jej objawy. Profilaktyka
jest niemożliwa.
• Kobiety, które chcą przeprowadzić nieinwazyjny test w kierunku trisomi 21, 18 i 13
płodu
• Kobiety, w wieku powyżej 35 roku życia, które nie chcą zdecydować się na inwazyjne
badania prenatalne
• Kobiety, których wyniki badań biochemicznych i ultrasonograficznych w pierwszym i
drugim trymestrze ciąży sugerują duże ryzyko aneuploidii chromosomowych
• Kobiety, które mają przeciwwskazania do inwazyjnych badań prenatalnych, takie jak
łożysko przodujące, wysokie ryzyko poronienia, zakażenie HBV, HIV, itd.
• Kobiety, które poddały się zabiegowi zapłodnienia In Vitro
Porównanie testu NIFTY z innymi metodami badań prenatalnych w Polsce.
Metoda
Inwazyjna/Nieinwazyj Wiek płodu Opis
na
Badania
Nieinwazyjna
biochemiczne
krwi matki
11-13
tydzień
USG płodu
11-13
tydzień
Fałszywie dodatnie wyniki 5%
10-13
tydzień
Ryzyko poronienia 1%-2%
16-21
tydzień
Ryzyko poronienia 0,5%-1%
Biopsja
kosmówki
(ang. CVS)
Nieinwazyjna
Inwazyjna
Amniopunkcja Inwazyjna
Fałszywie dodatnie wyniki 5%
Wykrywalność 60%-80%
14-20
tydzień
Wykrywalność 60%-80%
Wykrywalność powyżej 99%
Wykrywalność powyżej 99%
Kardocenteza Inwazyjna
(PUBS)
20-28
tydzień
Ryzyko poronienia 1%-2%
NIFTY
12-24
tydzień
Brak ryzyka poronienia
Nieinwazyjna
Wykrywalność powyżej 99%
Fałszywie dodatnie wyniki
poniżej 1%
Wykrywalność powyżej 99%
Ubezpiecznie testu NIFTY
Aby zapewnić większy komfort naszym pacjentkom firma BGI postanowiła zaoferować
ubezpieczenie testu NIFTY, jak również wziąć na siebie formalności
związane z wykupieniem polisy i pokrycie kosztów ubezpieczenia w firmie
ubezpieczeniowej Health Insurance Company PICC Ltd.
Test NIFTY jest jedynym testem dostępnym na rynku, który posiada ubezpieczenie. W
przypadku wydania wyniku fałszywie negatywnego, czyli w sytuacji kiedy test nie
wykryje Trisomii płodu a dziecko urodzi się z zespołem wad wrodzonych takich jak
zespół Downa, zespół Edwadsa czy zespół Pataua firma ubezpieczeniowa Health
Insurance Company PICC Ltd. wypłaci odszkodowanie w wysokości 32 000 USD.
W przypadku wyniku "pozytywnego" testu NIFTY, firma BGI zaleca wykonanie badań
inwazyjnych w celu potwierdzenia wyniku. Również w tym przypadku firma
ubezpieczeniowa Health Insurance Company PICC Ltd. zwróci część kosztów
wykonania prywatnego zabiegu inwazyjnego do kwoty 400 USD.
1.
Jaka jest zasada działania test NIFTY?
Test NIFTY to Nieinwazyjny Test Prenatalny w Kierunku Trisomii (ang. Non invasive
Fetal Trisomy Test). Określa ryzyko wystąpienia trisomii, poprzez
wykrycie i analizę materiału genetycznego dziecka krążącego we krwi obwodowej matki.
DNA płodu (ang. cfDNA) poddaje się analizie z użyciem
techniki sekwencjonowania nowej genereacji (ang. NGS) a ryzyko trisomi określane jest
z zastosowaniem opatentowanych narzędzi bioinformatycznych.
2.
Czym różni się test NIFTY od testów biochemicznych wykonywanych z krwi
matki?
Testy biochemiczne określają poziom stężenia markerów biochemiczny takich jak białko
PAPP-A lub podjednostka β gonadotropiny kosmówkowej
(β-hCG) w organizmie matki a nie płodu. Zmainy w stężeniu tych białek u kobiet w ciąży
mogą świadczyć o ryzyku wystąpienia trisomii.
Z tego względu określenie stężenia markerów biochemicznych pozwala na dość dokładne
oszacowanie ryzyka trisomii. Test NIFTY polega na izolacji
płodowego DNA z krwi matki, a nastepnie analizie tego DNA za pomocą technik
sekwencjonowania.
3.
Czy producent testu opublikował wyniki badania walidacyjnego?
Tak. Firma BGI opublikowała 3 duże studia walidacyjne. Pierwsze z nich wykonane jest
na grupie kobiet z przedziału wysokiego ryzyka (wiek powyżej 35 lat,
historia chorób genetycznych w rodzinie). Badanie obejmowało populacje 3464 kobiet.
Najnowsze studium walidacyjne obejmuje badania przesiewowe
dużej populacji-ponad 11 000 kobiet. W oparciu o te dane firma BGI informuje pacjentki
na temat skuteczności testu NIFTY. Listę publikacji można znaleźć
poniżej.
4.
Publikacje
- Clinical application of massively parallel sequencingbased prenatal noninvasive fetal
trisomy test for trisomies 21 and 18 in 11 105 pregnancies with mixed risk
factors. (Prenatal Diagnosis, 2012 Nov 9)
- Non invasive prenatal diagnosis of common fetal chromosomal aneuploidies by
maternal plasma DNA sequencing （Journal of Maternal Fetal and Neonatal Medicine,
2012）
-Prenatal Detection of Aneuploidy and Imbalanced Chromosomal Arrangements by
Massively Parallel Sequencing (PLoS ONE, 2012)
-Clinical utility of Non-Invasive Fetal Trisomy (NIFTY) test – Early experience （The
Journal of Maternal-Fetal and Neonatal Medicine）
-Hongyao, et al. (2012) Noninvasive prenatal genetic testing for fetal aneuploidy detects
maternal trisomy X. (Prenatal Diagnosis).
5.
Jak można porównać czułość testu NIFTY do konwencjonalnych testów
wykonywanych w pierwszym i drugim trymestrze ciąży
(test zintegrowany - badanie przezierności karkowej + test βhCG i PAPP-A)?
Test zintegrowany wykonywany jest w 11-13 i 15-19 tygodniu ciąży z wykrywalnością
około 90%- 95%. Ten rodzaj testu nieinwazyjnego-jest całkowicie bezpieczny dla matki i
dziecka, jednak ma stosunkowo niższy poziom wykrywalności niż test NIFTY oraz około
5% wyników fałszywie
pozytywnych. Badania kliniczne testu NIFT pokazują wyższą czułość i swoistość
(powyżej 99%). Test NIFTY dostępny jest dla kobiet w 12-24 tygodniu ciąży. Test
NIFTY daje mniej niż 1% wyników fałszywie pozytywnych. Jak dotąd w ponad 80 000
wykonanych testów nie odnotowano
wyniku fałszywie negatywnego.
6.
Jak można porównać czułość NIFTY do metod inwazyjnych takich jak
amniopunkcja, biopsja kosmówki (CVS), Kordocynteza?
Test NIFTY jest stosowany jako bardzo dokładny test przesiewowy w kierunku trisomii
płodu. Nie można go jednak stosować do diagnostyki strukturalnych
anomalii chromosomów, translokacji czy chimeryzmu, które mogą być wykryte
metodami inwazyjnymi. Z tego względu test NIFTY w żadnym wypadku nie
może zastępować diagnostyki inwazyjnej.
7.
Czy w każdym przypadku otrzymując wynik w postaci „wysokiego ryzyka”
testu NIFTY, trzeba zrobić badanie inwazyjne?
Tak.
8.
Co oznacza wynik fałszywie pozytywny?
Wynik fałszywie pozytywny testu NIFTY określamy jako wynik podany jako „wysokie
ryzyko trisomii”, podczas gdy po przeprowadzeniu badań
inwazyjnych okazuje się, że dziecko nie jest dotknięte trisomią. Dla testu NIFTY wyniki
fałszywie pozytywne stanowią mniej niż 1%.
9.
Co oznacza wynik fałszywie negatywny?
Wynik fałszywie negatywny testu NIFTY określamy, jako wynik podanyjako „niskie
ryzyko trisomii”, podczas gdy dziecko urodzi się dotknięte trisomią.
W ponad 80 000 wykonanych testów firma BGI nie odnotowała takiego wyniku.
10. Kiedy najwcześniej i kiedy najpóźniej można zrobić test NIFTY?
Test NIFTY mogą zrobić kobiety między 12-24 tygodniem ciąży.
11. Czy test NIFTY można przeprowadzić równolegle z badaniami w pierwszym
trymestrze ciąży?
Tak, nie ma ku temu żadnych przeciwwskazań.
12. Co zrobić, gdy wynik testu NIFTY jest sprzeczny z wynikami testu PAPPA lub
βhCG?
Test NIFTY ma ponad 99% wartość detekcji oraz odsetek wyników fałszywie
pozytywnych na poziomie 1%. W przyszłości, test NIFTY będzie mógł
zastąpić test PAPPA oraz βhCG w kierunku diagnostyki trisomii. W przypadku
sprzecznych wyników rekomendujemy uwzględnienie wyników testu NIFTY
z powodu jego większej dokładności i niezawodności.
13. W jaki sposób pobiera się krew do badania?
Rekomendujemy, aby porać 10 ml krwi żylnej. Procedura jest analogiczna do pobrania
krwi na badania morfologiczne.
14. Dlaczego wynik testu NIFTY jest podawany jako ryzyko trisomii (wartość
procentowa) a nie w postaci odpowiedzi TAK lub NIE?
Test NIFTY podobnie jak test PAPPA czy βhCG jest testem przesiewowym określającym
ryzyko trisomii i nie stanowi ostatecznej diagnozy klinicznej.
Test PAPPA czy βhCG mają znacznie mniejszą wykrywalność i większy odsetek
wyników fałszywie pozytywnych. Oznacza to, że tylko 1 na 20 przypadków
z wynikiem pozytywnym testu PAPPA czy βhCG zostanie potwierdzony diagnostyką
inwazyjną. Pozostałe fałszywie pozytywne wyniki nie tylko wywołują lęk
przyszłych matek związany z koniecznością przeprowadzenia badań inwazyjnych, ale
także pozwalają uniknąć około 1-2% poronień spowodowanych
komplikacjami związanymi z diagnostyką inwazyjną. Zatem test NIFTY, który cechuje
się wysokim współczynnikiem wykrywalności (powyżej 99%) oraz
niskim odsetkiem wyników fałszywie dodatnich (poniżej 1%), nie tylko złagodzi
niepokój ciężarnej kobiety przed koniecznością niepotrzebnego zabiegu
inwazyjnego, ale w znacznym stopniu może pomóc pacjentkom, które mają
przeciwwskazania do przeprowadzenia inwazyjnych badań prenatalnych.
15. Czy rezultat testu NIFTY, którego wynik wskazywał na wysokie ryzyko trisomii
można traktować, jako podstawę do terminacji ciąży?
Nie. Wynik testu NIFTY nie jest wskazaniem do terminacji ciąży. W przypadku wyniku
„pozytywnego” należy przeprowadzić dodatkowe badania inwazyjne
w celu postawienia ostatecznej diagnozy klinicznej.
16. Czy test NIFTY jest przeznaczony tylko dla kobiet w określonym przedziale
wiekowym lub pochodzeniu etnicznym?
Test NIFTY jest przeznaczony dla kobiet ciężarnych w różnym wieku i o różnym
pochodzeniu etnicznym.
17. Gdzie jest wykonywany test NIFTY?
Test NIFTY nie jest wykonywany na terenie Polski. Do przeprowadzenia badania
potrzebne są specjalne, kosztowne urządzenia tzw. Sekwenatory.
Firma BGI posiada laboratoria na całym świecie ale niestety nie na terenie Polski. Próbki
krwi pobrane od pacjentek transportowane są do centralnego
labolatorium firmy BGI w Shenzhen.
Artykuły do pobrania:
1. Clinical Application of MPS-based Prenatal Noninvasive Fetal Trisomy (NIFTY) Test
for Trisomy 21 and 18 in 11,105 Pregnancies with Mixed Risk Factors
2. Clinical utility of noninvasive fetal trisomy (NIFTY) test early experience
3. Non-invasive prenatal screening of fetal Down syndrome by maternal plasma DNA
sequencing in twin pregnancies
4. Non-invasive prenatal assessment of trisomy 21 by multiplexed maternal plasma
5. Noninvasive prenatal diagnosis of common fetal chromosomal aneuploidies by
maternal plasma DNA sequencing
6. Noninvasive Prenatal Diagnosis of Fetal Trisomy 18 and Trisomy 13 by Maternal
Plasma DNA Sequencing
7. Prenatal Detection of Aneuploidy and Imbalanced Chromosomal Arrangements by
Massively Parallel Sequencing