prezentacja na temat zależności w mieszaninach DNA

Odkrywanie zależności w
mieszaninach DNA
Mariusz Godlewski
Analiza DNA
●
●
●
Allel
Profil genetyczny
Markery genetyczne STR
Profile jednoznaczne
●
Heterozygota
Pr i =2⋅p a⋅p b
●
Homozygota
Pr i = pa
●
2
Prawdopodobieństwo genotypu - n markerów
n
Pr=∏ Pr i
i
Mieszaniny, hipotezy pochodzenia
Hipoteza oskarżyciela Hp:
E = S+V
●
Hipoteza obrony Hd:
E = U+V
Iloraz wiarygodności:
Pr  E∣H p 
LD=
Pr  E∣H d 
Mieszaniny, intepretacja danych
●
International Society of Forensic Genetics
Mieszaniny, genotypowanie
●
Profil mieszaniny
●
Stosunek udziału
 a b
M x=
a b c  d
●
Genotypy
Major
ab
ac
ad
cd
bd
bc
Mx ( major/minor)
Hb major
Minor
cd
0.70
0.9
bd
0.53
0.3
bc
0.51
0.3
ab
0.30
0.9
ac
0.48
0.3
ad
0.49
0.3
Równowaga
heterozygotyczna
●
Hb minor
0.9
0.3
0.3
0.9
0.3
0.3
Result
Passes
Fails Hb
Fails Hb
Fails Mx
Fails Hb
Fails Hb
a
H b= 0,6
b
Mieszaniny, maskowanie wzajemne
alleli
●
Nakładanie się alleli
Artefakty - stutter
●
Allele b w pozycji stutter
 st
0,15
c
Artefakty - allel drop-out