2.2. Interpretacja widm ramanowskich
Transkrypt
2.2. Interpretacja widm ramanowskich
Kamil Jurowski Kamila Kochan Anna Jurowska Grzegorz Zając Kornel Roztocki mgr Kamil Jurowski [email protected] Absolwent Wydziału Chemii Uniwersytet Jagiellońskiego w Krakowie (2012) – praca pod tytułem „Zastosowanie metody LA ICP MS do obrazowania cynk w strukturach mózgu szczura jak narzędzie do badania patofizjologii depresji”. Obecnie doktorant na macierzystej jednostce. Jego zainteresowania naukowe dotyczą zastosowania technik spektrometrii mas w badaniach bioanalitycznych (metalomika, proteomika, lipidomika). W swoim dorobku posiada cztery publikacje związane z zastosowaniem spektrometrii mas w badaniach biomedycznych. Jest autorem wielu wystąpień konferencyjnych zarówno krajowych jak również międzynarodowych. Oprócz zainteresowań naukowych aktywnie zajmuje się dydaktyką akademicką. Od początku studiów doktoranckich jest stypendystą Konsorcjum „KNOW” (Krajowy Narodowy Ośrodek Wiodący) im. Mariana Smoluchowskiego w Krakowie. Członek Polskiego Towarzystwa Chemicznego oraz Polskiego Towarzystwa Spektrometrii Mas. mgr Kamila Kochan [email protected] Absolwentka Wydziału Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie (2012). Pracę magisterską pod tytułem „Obrazowanie pojedynczych komórek za pomocą spektroskopii FT-IR” zrealizowała w Zespole Obrazowania Ramanowskiego. Obecnie doktorantka na Wydziale Chemii UJ. W ramach pracy doktorskiej zajmuję się aplikacją komplementarnych technik obrazowania metodami spektroskopii oscylacyjnej (FT-IR, Raman) do badania modeli uszkodzenia wątroby. Skupia się stosowaniu technik spektroskopii oscylacyjnej zarówno ex vivo jak również do badań żywych komórek. W swoim dorobku posiada 11 publikacji w czasopismach z listy filadelfijskiej dotyczących aplikacji technik obrazowania metodami spektroskopii oscylacyjnej do badań biomedycznych. Jest autorką licznych wystąpień konferencyjnych, a także stypendystką Konsorcjum „KNOW” (Krajowy Narodowy Ośrodek Wiodący) im. Mariana Smoluchowskiego w Krakowie oraz kierownikiem i wykonawcą kilku grantów badawczych. mgr Anna Jurowska [email protected] Absolwentka Wydziału Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie – praca magisterska pt. „Synteza i charakterystyka fizykochemiczna nowych kompleksów Mo(IV) z ligandami N, i N,N-donorowymi”. Obecnie doktorantka II roku Chemii na macierzystej jednostce. Badania związane z tematem rozprawy doktorskiej realizuje w Zespole Chemii Koordynacyjnej. W swojej pracy naukowej zajmuje się syntezą i charakterystyką fizykochemiczną kompleksów metali d- elektronowych z dendrymerycznymi ligandami opartymi na strukturze triazyny. Od początku studiów doktoranckich jest stypendystką Konsorcjum „KNOW” (Krajowy Narodowy Ośrodek Wiodący) im. Mariana Smoluchowskiego w Krakowie. Jest autorką czterech publikacji z listy filadelfijskiej i kilkunastu wystąpień na konferencjach krajowych oraz międzynarodowych. mgr Grzegorz Zając [email protected] Tytuł magistra uzyskał w 2014 roku na Wydziale Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego; temat pracy: "Struktura, spektroskopia i stereochemia astaksantyny". W swoich badaniach, realizowanych na studiach doktoranckich, wykorzystuje nowoczesne techniki chiralooptyczne do badania struktury i równowagi konformacyjnej cząsteczek chiralnych o znaczeniu biologicznym. Jego zainteresowania naukowe dotyczą przede wszystkim badań układów chiralnych z wykorzystaniem ramanowskiej aktywności optycznej ROA (ang. Raman Optical Activity), oraz jej zaawansowanych rozwinięć: RROA (ang. Resonance Raman Optical Activity) i SEROA (ang. Surfaceenhanced Raman Optical Activity), jak również innych metod chiralooptycznych (ECD, VCD). Jest autorem dwóch publikacji w czasopismach z listy filadelfijskiej i licznych wystąpień na krajowych i międzynarodowych konferencjach naukowych. mgr Kornel Roztocki [email protected] Absolwent Wydziału Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie, studia magisterskiej ukończył z wyróżnieniem w 2014; tytuł pracy: „Synteza układów M-MOF z udziałem metaloligandów hydrazonowych”. Doktorat realizuje na macierzystej uczelni zajmując się głównie zagadnieniami związanymi z chemią koordynacyjną, a w szczególności chemią supramolekularną oraz związkami typu MOF (sieci metalo-organiczne). 11 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Intepretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 12 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Intepretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 13 ‡ W polskiej literaturze fachowej brak jest monografii, która przedstawiałaby w jednej pozycji różnorodne podejścia do interpretacji widm spektroskopowych i spektrometrycznych. Informacje na temat interpretacji widm opisane w niniejszej monografii są bardzo ważne z dydaktycznego punktu widzenia, bowiem stanowią zestawienie najważniejszych informacji w przypadku interpretacji widm w jednej monografii. Dla Autorów niniejszej monografii jest dużym zaskoczeniem, iż do tej pory nie było w polskiej literaturze żadnej pozycji poświęconej tym podstawowym, niezwykle ważnym zagadnieniom. We współczesnym Świecie dominuje komputeryzacja, cyfryzacja i coraz większa ilość monografii występuje w postaci elektronicznej (e-booki). W tego typu rozwiązaniach można dopatrywać się zarówno wad jak K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Intepretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 14 i zalet, niemniej jest to obecnie jedyny możliwy środek przekazu do najszerszego grona odbiorców. Taki właśnie cel przyświecał Autorom niniejszej monografii, którzy zdecydowali się wydać tę pozycję tylko w postaci elektronicznej. Autorzy dokonali możliwie największych starań, aby uniknąć ewentualnych błędów i zastosować poprawną nomenklaturę fachową. Niemniej Autorzy zdają sobie sprawę z ewentualnych niedoskonałości pracy i proszą o zgłaszanie swoich wątpliwości bezpośrednio na adresy mailowe przedstawione w notach biograficznych niniejszej monografii. Wszystkie zaprezentowane widma stanowią wyniki badań Autorów lub zostały zapożyczone z bezpłatnych i ogólnodostępnych baz danych, które mogą być wykorzystywane w monografiach na potrzeby dydaktyczne. Mamy nadzieję, iż praca ta będzie stanowić cenne źródło wiedzy w nowoczesnym wydaniu, które umożliwi zapoznanie wielu czytelników z obliczeniami spektroskopowymi i spektrometrycznymi, patrząc przez pryzmat młodych naukowców, którzy też byli studentami i zdają sobie sprawę jak trudno jest znaleźć źródło wiedzy związane z tego typu tematyką. Kraków, 2015 Autorzy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Intepretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 15 1 Spektrometria mas 1.1. Wstęp Widmo mas (z ang. mass spectrum) to graficzne przedstawienie zależności intensywności sygnału od stosunku m/z dla jonów. Innymi słowy, widmo mas w określonych warunkach eksperymentalnych stanowi zapis (wykres lub tabelę) natężenia sygnałów analitycznych (natężenie prądu wytwarzanego przez jony w miarę ich docierania do detektora) dla danych wartości m/z. Intensywność sygnału (piku) na widmie wskazuje zatem na względną liczbę jonów – im wyższy jest pik, tym większa jest populacja jonu, od którego ten pik pochodzi. Z uwagi na to, że na widmie mas można zaobserwować zazwyczaj sygnały charakteryzujące się smukłym i ostrym kształtem, sygnały te nazywa się pikami, a nie pasmami tak jak ma to miejsce w różnych metodach spektroskopowych. Poniżej przedstawiono przykładowe widmo mas dla o-ksylenu – rysunek 1.1 oraz tabela 1.1. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 16 Rys. 1.1. Widmo mas o-ksylenu w postaci wykresu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 17 Tabela 1.1. Widmo mas o-ksylenu w postaci tabeli. m/z 26 27 38 39 40 41 50 51 52 53 61 62 63 64 65 66 74 75 76 77 78 79 89 91 92 102 103 104 105 106 107 Intensywność względna [%] 1,29 9,61 2,77 18,12 2,19 3,09 7,09 16,7 7,41 5,03 1,42 3,16 7,67 1,81 9,80 1,29 2,26 1,74 1,55 18,43 8,83 7,22 2,83 99,99 8,32 1,35 5,8 2,77 21,92 55,77 5,09 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 18 Należy zauważyć, że najczęstszym sposobem przedstawiania widma mas jest prezentacja graficzna, a nie tabelaryczna. Niemniej w zależności od celu badań, obie formy prezentacji wyników są ważne. Powszechnie więc widmo mas kojarzy się z wykresem słupkowym, gdzie na osi x odłożona jest wartość (m/z), a na osi y odłożona jest intensywność względna (%). Na widmie mas najbardziej intensywny pik nazywany jest pikiem podstawowym. Wysokość piku podstawowego przyjmuje się za 100%, a wysokość pozostałych pików odnosi się do tej wartości. Z kolei jony powstałe w wyniku fragmentacji związku są rozdzielane w zależności od ich stosunku masy do ładunku (m/z). Warto zwrócić uwagę na to, że większa liczba jonów jest naładowana pojedynczo, stąd skalę widma traktuje się często jako skalę wyrażoną w jednostkach masy. Nie tak rzadko możliwe są jony naładowane podwójnie, które pojawiają się na skali m/z przy wartościach odpowiadających połowie ich masy. Na widmie mas mogą również występować takie jony, które powstały na skutek usunięcia z cząsteczki jednego elektronu – takie jony nazywają się jonami cząsteczkowymi (molekularnymi, M) i zazwyczaj występują na widmie mas przy największej wartości m/z. Wyjątkiem są grupy sygnałów charakteryzujących się wartościami m/z równymi: M+1, M+2, M+3, … itd. Sygnały tego typu noszą nazwę pików izotopowych. Źródłem takich pików jest to, że liczne pierwiastki obecne w związkach występują w przyrodzie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 19 w postaci wielu izotopów (wiele pierwiastków nie jest monoizotopowych). Liczba pików o znacznej intensywności w widmie mas oraz ich rozmieszczenie jest charakterystyczną cechą danej cząsteczki analitu. Masa i względne stężenie jonu molekularnego wskazują na wielkość i ogólną trwałość cząsteczki. Widmo mas zawierające kilka pików o znacznej intensywności wskazuje, że cząsteczka ulega tylko niewielkiej liczbie rozpadów, co świadczy o trwałości produktów lub o obecności małej liczby nietrwałych wiązań. 1.2. Interpretacja widm mas 1.2.1. Identyfikacja piku jonu molekularnego Z uwagi na to, że wzór cząsteczkowy jest zazwyczaj jedną z najważniejszych informacji otrzymywaną z widma mas, stąd należy mieć pewność, że w grupie pików o masach: M, M+1, M+2 itd. pik jonu molekularnego został prawidłowo zidentyfikowany. Wiadomo, że jon cząsteczkowy musi być jonem posiadającym nieparzystą liczbę elektronów, z uwagi na fakt, iż powstaje z cząsteczki na skutek utraty jednego elektronu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 20 1.2.1.1. Stopień nienasycenia (wskaźnik deficytu atomów wodoru) Jedną z metod umożliwiających określenie, czy dany jon ma nieparzystą liczbę elektronów jest tzw. stopień nienasycenia (S), który określa sumę wiązań wielokrotnych oraz układów pierścieniowych. W niektórych źródła literaturowych stopień nienasycenia określa się czasami jako tzw. wskaźnik deficytu atomów wodoru. Dla prostych cząsteczek organicznych, w których obecne są tylko atomy węgla, wodoru, tlenu, siarki, azotu oraz chlorowców można zapisać uproszczony wzór na stopień nienasycenia (S): 𝑆= 2𝑛𝐶 −𝑛𝐻 +𝑛𝑁 −𝑛𝑋 +2 2 (1.1) gdzie: 𝑛𝐶 – atomy węgla 𝑛𝐻 – atomy wodoru 𝑛𝑁 – atomy azotu 𝑛𝑋 – atomy chlorowców Podsumowując: Jeśli w cząsteczce są obecne atomy wodoru, to ich liczbę odejmuje się od podwójnej liczby atomów węgla; K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 21 Jeśli w cząsteczce są obecne atomy azotu, to ich liczbę dodaje się do podwójnej liczby atomów węgla; Jeśli w cząsteczce są obecne atomy chlorowców, to ich liczbę odejmuje się od podwójnej liczby atomów węgla; Niech jako przykład cynamonowego: posłuży cząsteczka kwasu W cząsteczce tej obecnych jest: 𝑛𝐶 = 9 𝑛𝐻 = 8 𝑛𝑁 – 0 𝑛𝑋 – 0 Wówczas stopień nienasycenia wynosi 6, ponieważ: 𝑆= 2𝑛𝐶 − 𝑛𝐻 + 𝑛𝑁 − 𝑛𝑋 + 2 2 ∙ 9 − 8 + 0 − 0 + 2 = =6 2 2 Analizując wzór półstrukturalny można stwierdzić, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 22 że w cząsteczce kwasu cynamonowego znajduje się 5 wiązań typu π (czerwone strzałki) oraz jeden pierścień aromatyczny (różowe tło) w sumie 6, co jest w zgodzie z wcześniejszymi obliczeniami: Z punktu widzenia spektrometrii mas, ważne jest, by pamiętać, że stopień nienasycenia dla jonów o nieparzystej liczbie elektronów musi być liczbą całkowitą. Z kolei dla jonów o parzystej liczbie elektronów, stopień nienasycenia będzie liczbą niecałkowitą. 1.2.1.2. Reguła azotowca Jeśli cząsteczka związku organicznego lub jon posiada nieparzystą liczbę atomów azotu, to liczba określająca jej masę cząsteczkową jest nieparzysta. Jeśli z kolei cząsteczka lub jon zawiera parzystą liczbę atomów azotu lub nie zawiera ich wcale, to masa cząsteczkowa jest wyrażona liczbą parzystą. Reguła ta znajduje K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 23 zastosowanie do wszystkich związków zawierających atomy: C, H, O, N, S, P, B, Si oraz atomy fluorowców. Na podstawie przedstawionych wcześniej informacji można dojść do następujących wniosków: Jony o nieparzystej liczbie elektronów (tzw. jony nieparzystoelektronowe), odpowiadające cząsteczce niezawierającej atomów azotu lub zawierających ich parzystą liczbę będą miały masę wyrażoną liczbą parzystą; Jony o parzystej liczbie elektronów (tzw. jony parzystoelektronowe), odpowiadające cząsteczce zawierającej nieparzystą liczbę atomów azotu będą miały masę wyrażoną liczbą nieparzystą. Warto zwrócić uwagę na to, że jony nieparzystoelektronowe powstają głównie w EI, z kolei jony parzystoelektronowe powstają głównie w ESI, APCI oraz MALDI. 1.2.1.3. Analiza pików jonów fragmentacyjnych w pobliżu piku badanego jonu Rozpoznawanie piku jonu molekularnego można również dokonać poprzez analizę pików jonów fragmentacyjnych w pobliżu badanego jonu. Utrata fragmentów o masach z zakresu: 3 – 15 oraz z zakresu: K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 24 20 – 26 jest bardzo mało prawdopodobna, stąd jeśli obserwuje się piki odpowiadające fragmentom o tak zmienionej masie, to można przypuszczać, że rozpatrywany jon jest raczej jonem fragmentacyjnym, a nie cząsteczkowym. 1.2.1.4. Zmiana warunków pomiaru Zmiana warunków pomiarowych daje również możliwości na dostarczenie dowodów potwierdzających właściwe rozpoznanie jonu cząsteczkowego. W takim przypadku pomocne może okazać się maksymalne wzmocnienie, co ułatwi obserwację bardzo słabego piku jonu molekularnego. Drugim sposobem może być zmniejszenie energii strumienia elektronów, co powoduje zmniejszenie intensywności jonów fragmentacyjnych w porównaniu z intensywnością jonu cząsteczkowego. Należy zauważyć, że dotyczy to również jonów fragmentacyjnych pochodzących od kontaminacji. Innym podejściem może być również zastosowanie innego typu jonizacji niż EI, np. jonizacja chemiczna, jonizacja polem w większym stopniu sprzyjają tworzeniu grupy pików jonu molekularnego, stąd jeśli są dostępne to również powinny być zastosowane. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 25 1.2.2. Intensywność piku jonu molekularnego Intensywność piku molekularnego w widmie mas jest tym większa, im mniejsza jest energia potrzebna do jonizacji cząsteczki i im trwalszy jest jon cząsteczkowy. Strukturze cząsteczki odpowiadają charakterystyczne wartości energii jonizacji, a to określa wielkość energii potrzebnej do wytworzenia jonu cząsteczkowego. Należy zwrócić uwagę, że jeśli cząsteczka zawiera wiązanie łatwo ulegające rozszczepieniu, to pik jonu molekularnego będzie charakteryzował się bardzo małą intensywnością. Zazwyczaj intensywność jonu molekularnego wzrasta ze wzrostem nienasycenia i ze wzrostem liczby pierścieni, przy czym jest mniejsza dla łańcuchów rozgałęzionych. Wzrost intensywności piku jonu cząsteczkowego może być z kolei powodem obecności heteroatomów, mających na zewnętrznych powłokach łatwo ulegające dysocjacji elektrony. W tabeli 1.2. przedstawiono ogólne wskazówki pomocne podczas przewidywania intensywności piku jonu molekularnego dla widm różnego rodzaju klasy związków organicznych. ……………………………………………………………………………………………….…… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………….. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 26 intensywność piku jonu molekularnego Tabela 1.2. Ogólne wskazówki pomocne podczas przewidywania intensywności piku jonu molekularnego. mała lub pik nie występuje klasa związków alkohole alifatyczne aminy alifatyczne nitryle średnia aromatyczne bromoi jodopochodne sprzężone alkeny pochodne benzylowe oraz benzoilowe związki o rozgałęzionych łańcuchach ketony i aldehydy o prostych łańcuchach, estry, kwasy karboksylowe, amidy związki nitrowe etery duża węglowodory aromatyczne aromatyczne nitryle i aminy oraz fluoro- i chloropochodne nasycone związki cykliczne halogenki alkilowe 1.2.3. Wzory cząsteczkowe Jedną z najbardziej użytecznych informacji, pozyskiwanych z widma mas, jest wzór cząsteczkowy danego związku. Jeśli istnieje możliwość identyfikacji jonu molekularnego, to istnieją dwa sposoby ustalania wzoru cząsteczkowego w zależności od rozdzielczości stosowanego spektrometru mas. Najlepszą metodą jest zastosowanie aparatu odznaczającego się dużą K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 27 zdolnością rozdzielczą, co umożliwia dokładny pomiar masy jonu molekularnego. Z uwagi na to, że masy atomowe nie wyrażają się liczbami całkowitymi, masa każdego zestawu atomów będzie wyrażona charakterystyczną liczbą niecałkowitą. Dokładny pomiar masy pozwala zatem odróżnić dwa sygnały. Warto zwrócić uwagę, iż istnieją różnorodne tabele, które ułatwiają powiązanie dokładnych mas ze wzorami cząsteczkowymi. Dokładne wyznaczanie masy cząsteczkowej jest szczególnie ważne podczas, gdy zachodzi potrzeba potwierdzenia poprawności identyfikacji konkretnego jonu cząsteczkowego, natomiast jest mało przydatne w przypadku prób ustalania wzoru nieznanego analitu. Inną metodą może być pomiar intensywności pików izotopowych, szczególnie jeśli wykorzystuje się widma mas wykonane przez spektrometry mas o małej rozdzielczości. W tym przypadku należy stosować abundancje trwałych izotopów. Dane dla poszczególnych izotopów są przedstawiane w dwojaki sposób – jako odsetek wszystkich występujących izotopów, albo jako odsetek izotopu występującego w największej ilości. Każda więc kombinacja atomów będzie dawała grupę pików izotopowych o możliwych do przewidzenia intensywnościach. Niech jako przykład posłuży metan, w którym stosunek intensywności pików 12CH4:13CH4 wynosi 100:1,08. Intensywność piku M+1 będzie równa 1,08% intensywności piku molekularnego. Warto K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 28 nadmienić, że bardzo mały wkład w intensywności tego piku będzie też wnosiła cząsteczka 12C1H32H. Należy zauważyć, że jednym z warunków, jaki musi być spełniony, aby możliwe było zastosowanie intensywności pików izotopowych do określenia wzoru cząsteczkowego, jest względnie duża intensywność piku molekularnego. W innym przypadku piki izotopowe mogą być zbyt słabe, aby można było zmierzyć ich intensywność z wymaganą dokładnością. Innym problemem może być nakładanie się piku sprotonowanego jonu molekularnego, słabych jonów tła lub pików kontaminacji próbki. Warto zwrócić uwagę, iż metoda ta daje poprawne wyniki tylko dla cząsteczek o masie nie większej niż 250 – 300. 1.2.4. Fragmentacja Pik jonu molekularnego dostarcza podstawowych informacji na temat tożsamości cząsteczki. Dalsze informacje można uzyskać z układu pików fragmentacyjnych, które pochodzą od jonów powstałych na drodze rozpadu jonu molekularnego. Ponieważ nie wszystkie jony mają takie samo znaczenie, poniżej zestawiono najważniejsze zasady i metody postepowania podczas interpretacji widm: Najważniejszy na widmie mas jest pik jonu molekularnego; K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 29 Spośród jonów o podobnej masie lub powstających w porównywalnych ilościach, jony o nieparzystej liczbie elektronów mają na ogół większe znaczenie niż jony o parzystej liczbie elektronów – jony o nieparzystej liczbie elektronów tworzą się zwykle w reakcjach przegrupowania, które mogą być charakterystyczne dla poszczególnych klas związków; można się spodziewać, że jony o dużych masach będą dostarczały ważniejszych informacji niż te, o małych masach powstających w wyniku prostych, łatwych do wyjaśnienia fragmentacji; Źródłem cennych informacji o rodzajach procesów rozpadu mogą być jony metastabilne; Istnieją dwa ważne czynniki decydujące o intensywności pików jonów fragmentacyjnych w widmie mas: 1) różnice między energiami wiązań rozrywających się i tworzących w trakcie powstawania jonu; 2) trwałość danego jonu. Widmo mas stanowi swojego rodzaju „molekularny odcisk palca”, ponieważ każda cząsteczka posiada własny, charakterystyczny szablon fragmentacji, a z kolei prawdopodobieństwo, że dwie cząsteczki będą posiadały identyczny szablon fragmentacyjny, jest bardzo małe. Obecnie bardzo rzadko dochodzi do samodzielnej K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 30 interpretacji złożonych widm mas, ponieważ możliwa jest komputerowa identyfikacja nieznanego związku poprzez analizę porównawczą badanego szablonu fragmentacyjnego z widmem mas z darmowych bibliotek widm mas, oferowanych przez różnorodne firmy specjalizujące się w budowie instrumentów analitycznych. Jeśli jednak zachodzi potrzeba samodzielnej analizy widma mas, to możliwe jest wyciąganie wniosków, dotyczących struktury badanej cząsteczki na podstawie sposobu jej fragmentacji. Wiadomo jest, że fragmentacja zachodzi wówczas, gdy wzbudzony, mający znaczną energię kationorodnik, rozpada się samorzutnie na mniejsze fragmenty - wiązania chemiczne pękają i powstają w najprostszym przypadku dwa fragmenty. Jeden z tych dwóch fragmentów ma ładunek dodatni, jest karbokationem, natomiast drugi jest obojętnym elektrycznie rodnikiem. Co więcej, ładunek dodatni pozostaje na tym fragmencie, na którym jest trwalszy, czyli lepiej stabilizowany - w czasie fragmentacji powstają karbokationy bardziej trwałe. Poniżej przedstawiono zarys informacji na temat charakterystycznych właściwości fragmentacyjnych niektórych wybranych grup funkcyjnych: alkohole – ta klasa związków organicznych posiada dwie charakterystyczne ścieżki fragmentacji: rozpad alfa oraz dehydratację; w przypadku pierwszej z nich K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 31 rozerwaniu ulega wiązanie C—C najbliższe grupy hydroksylowej, dając obojętny rodnik oraz fragment naładowany elektrycznie i zawierający atom tlenu, co można schematycznie przedstawić jako: W drugim przypadku (dehydratacja), eliminowana jest cząsteczka wody, dając alkenowy kationorodnik o 18 u lżejszy od masy jonu molekularnego, co można schematycznie przedstawić jako: aminy – ulegają charakterystycznemu rozpadowi α, podobnie jak alkohole; wiązanie C—C najbliższe do atomu azotu ulega rozerwaniu, dając obojętny rodnik alkilowy oraz kation z atomem azotu, co można schematycznie przedstawić jako: …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 32 aldehydy i ketony – jeśli na trzecim atomie węgla od grupy karbonylowej znajduje się atom wodoru (γ atom węgla), to ulegają charakterystycznemu rozczepieniu cząsteczki – tzw. rozszczepieniu McLaffertyego. W takim przypadku atom wodoru zostaje przeniesiony do atomu tlenu z grupy karbonylowej, następnie pęka wiązanie C—C, co z kolei prowadzi do powstania obojętnej cząsteczki alkenu, a ładunek dodatni pozostaje na fragmencie, zawierającym atom tlenu, co można schematycznie przedstawić jako: Oprócz tej przemiany aldehydy i ketony mogą ulegać również fragmentacji poprzez rozpad α, polegający na rozerwaniu wiązania między grupą karbonylową a najbliższym atomem węgla, w wyniku czego powstaje obojętny rodnik oraz kation zawierający atom tlenu, co można schematycznie przedstawić jako: K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 33 1.2.5. Reguły przydatne podczas interpretacji widm mas Podczas interpretacji widma mas, warto posługiwać się pewną strategią, której etapy przedstawiono poniżej. Należy jednakże zauważyć, że każde widmo mas stanowi indywidualny problem i nie można sztywno trzymać się jakiegokolwiek schematu postępowania. Dlatego też poniżej przedstawiono jedynie ogólne zasady, które mogą być przydatne podczas interpretacji widm mas: Etap I. Należy najpierw molekularny (M+); zidentyfikować jon Etap II. Poddać związek analizie elementarnej oraz obliczyć na jej podstawie stopień nienasycenia związku (S); Etap III. Na podstawie ogólnej analizy widma mas należy wyciągnąć wszystkie możliwe wnioski na temat struktury związku - zidentyfikować serie pików i jony charakterystyczne; Etap IV. Na podstawie obecności jonów o dużych masach należy ustalić prawdopodobną strukturę fragmentów obojętnych; K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 34 Etap V. Należy zidentyfikować piki jonów o nieparzystej liczbie elektronów i rozważyć możliwe przegrupowania; Etap VI. Na podstawie danych uzyskanych z widma mas oraz innych przesłanek należy zaproponować prawdopodobną strukturę związku, posiłkując się w razie potrzeby bazami danych lub tablicami spektrometrycznymi. 1.2.6. Przegląd widm mas wybranych klas związków organicznych Z uwagi na fakt, iż monografia ta nie jest dedykowana wyłącznie spektrometrii mas, stąd poniżej zestawiono jedynie zarys podstawowych informacji na temat widm mas wybranych klas związków organicznych. 1.2.6.1. Węglowodory 1.2.6.1.1. Alkany Ponieważ do zjonizowania węglowodorów nasyconych jest wymagana relatywnie duża wartość energii, stąd powstałe jony ulegają najczęściej przypadkowym przegrupowaniom. Zazwyczaj jon molekularny daje się zaobserwować, ale jego intensywność może być niewielka. Zwykle widma mas alkanów zawierają serię K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 35 pików, których położenie różni się o czternaście jednostek masy, co odpowiada jonom różniącym się liczbą grup metylenowych (-CH2- lub =CH2). Warto zwrócić również uwagę na to, że jon M-CH3 zazwyczaj nie jest obecny na widmie mas. Dla węglowodorów o prostych łańcuchach intensywność pików innych jonów stopniowo się zwiększa, osiągając maksimum przy m/z 43 (C3H7+) lub m/z 57 (C4H9+) – piki te powstają od jonów znacznie rozgałęzionych, powstających w wyniku przegrupowań cząsteczkowych. Przykład widma mas dla alkanów nierozgałęzionych na przykładzie undekanu przedstawiono na rysunku 1.2. W przypadku alkanów rozgałęzionych można zaobserwować piki odpowiadające preferowanym rozszczepieniom przy III° lub IV° atomach węgla. Przykładem tego może być pik m/z 113 na widmie mas dla 2,6-dimetylooktanu, które zostało przedstawione na rysunku 1.3. Pik m/z 113 odpowiada drugorzędowemu karbokationowi, który powstaje poprzez oderwanie grupy etylenowej. …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………. …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………….. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 36 Rys. 1.2. Widmo mas nierozgałęzionego węglowodoru nasyconego na przykładzie undekanu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 37 Rys. 1.3. Widmo mas rozgałęzionego węglowodoru nasyconego na przykładzie 2,6-dimetylooktanu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 38 1.2.6.1.2. Alkeny Zazwyczaj na widmach mas alkenów, pik jonu molekularnego jest wyraźny. Ponadto, bardziej intensywna w porównaniu do alkanów jest seria pików odpowiadająca masie CnH+n-1. Seria ta jest widoczna np. w widmie mas heks-1-enu, które zostało przedstawione na rysunku 1.4. Zazwyczaj określenie położenia wiązania podwójnego nie jest możliwe z uwagi na łatwo zachodzące przegrupowania. 1.2.6.1.3. Areny Z uwagi na stabilizujący wpływ pierścienia aromatycznego, w widmach mas arenów występuje zazwyczaj bardzo intensywny pik jonu molekularnego. Zazwyczaj można również zanotować piki jonów podwójnie zjonizowanych, które występują w widmie mas przy wartościach odpowiadających połowie ich masy rzeczywistej. W widmach pochodnych benzenu obecny jest pik m/z 91, który pochodzi od jonu tropyliowego (C7H7+), który po utracie obojętnej cząsteczki etynu przekształca się w jon o wartości m/z 65 (C5H5+). Przykład widma mas pochodnej benzenu na przykładzie toluenu przedstawiono na rysunku 1.5. Warto zwrócić uwagę, że w przypadku związków aromatycznych podstawionych grupami alkilowymi posiadającymi co najmniej trzy atomy węgla, atom wodoru z pozycji γ może ulegać przeniesieniu – w analogii do K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 39 przegrupowania McLafferty’ego. Efektem tego jest pik m/z 92. Przykład widma mas dla tego typu związków aromatycznych na przykładzie butylobenzenu przedstawiono na rysunku 1.6. Rys. 1.4. Widmo mas alkenu na przykładzie heks-1-enu. …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………….. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 40 Rys. 1.5. Widmo mas pochodnej benzenu na przykładzie toluenu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 41 Rys. 1.6. Widmo mas związku aromatycznego podstawionego grupami alkilowymi, posiadającymi co najmniej trzy atomy węgla na przykładzie butylobenzenu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 42 1.2.6.2. Alkohole, fenole i etery Zazwyczaj pik jonu molekularnego na widmach mas alkoholi jest bardzo słaby lub wręcz niezauważalny. W przypadku tej klasy związków charakterystycznymi jonami są stabilizowane przez rezonans karbokationu, powstałe na drodze rozpadu α. Preferowanym kierunkiem tego rozpadu jest ten, w którym oderwaniu ulegają jak największe grupy alkilowe. W przypadku alkoholi I° charakterystycznym pikiem jest M – 18, co wynika z utraty cząsteczki wody przez jon molekularny. Warto zwrócić uwagę na to, że pik ten może również pochodzić od jonu powstałego na drodze termicznego rozkładu alkoholu w komorze jonizacyjnej. Jako przykład może posłużyć widmo mas propan-1-olu przedstawione na rysunku 1.7. Na widmie tym można zauważyć pik m/z 42 z uwagi na utratę cząsteczki wody, pik m/z 59 z uwagi na utratę atomu wodoru oraz jon m/z 31, który pochodzi od jonu CH2=O+H. W przypadku fenoli na widmie mas występuje intensywny pik jonu molekularnego. Do charakterrystycznych pików fenoli można zaliczyć takie, które pochodzą od jonów M-28 (co wynika z utraty CO i powstania jonu nieparzystoelektronowego) oraz M-29 (co wynika z utraty CHO). Na rysunku 1.8 przedstawiono widmo mas dla fenolu (hydroksybenzenu). Charakterystycznymi pikami na tym widmie są: m/z 65 (pochodzący z utraty CHO) oraz m/z 66 (pochodzący z utraty CO), a ponadto pik jonu molekularnego m/z 94. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 43 W przypadku eterów pik jonu molekularnego jest bardzo mało intensywny lub niezauważalny. W przypadku tej klasy związków obserwuje się bardzo często piki pochodzące z dwóch charakterystycznych procesów fragmentacyjnych. Pierwszy z nich to rozpad wiązania węgiel-tlen, co skutkuje pojawieniem się piku o największej intensywności. Drugi proces polega na rozerwaniu wiązania między atomami węgla α oraz β (czyli rozszczepienie α). Przykładem może być widmo mas eteru dietylowego, na którym obserwuje się intensywne piki: m/z 59, m/z 45 oraz m/z 31- rysunek 1.9. Rys. 1.7. Widmo mas alkoholu I° na przykładzie propan-1-olu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 44 Rys. 1.8. Widmo mas fenolu (hydroksybenzenu). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 45 Rys. 1.9. Widmo mas eteru dietylowego. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 46 1.2.6.3. Aldehydy i ketony W przypadku aldehydów i ketonów pik dla jonu molekularnego jest zazwyczaj zauważalny. Na widmie mas dla tych klas związków istnieją charakterystyczne piki pochodzące od karbokationów, jakie powstają w wyniku rozpadu α względem grupy karbonylowej, co prowadzi do powstania dwóch możliwych jonów acyliowych, które w konsekwencji tracą cząsteczkę tlenku węgla(II). W przypadku aldehydów oraz ketonów aromatycznych pikiem podstawowym jest zazwyczaj pik jonu C6H5-C≡O+, co daje pik m/z 105. Warto zauważyć, że rozpad α ma mniejsze znaczenie niż w przypadku ketonów, chociaż intensywny pik przy m/z 29, odpowiadający CHO, jest czasami obecny na widmie mas. Dla aldehydów i ketonów charakterystyczne jest również przegrupowanie McLafferty’ego, pod warunkiem jednak, że grupa alkilowa związana z grupą karboksylową ma łańcuch zbudowany z co najmniej trzech atomów węgla. Na drodze tej przemiany powstają jony o nieparzystej liczbie elektronów, co jest pomocne podczas analizy widma. Pik tego typu odpowiadający jonowi nieparzystoelektronowemu o m/z 43 może być zaobserwowany np. na widmie 4-metylopentan-2-onu – rysunek 1.10. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 47 Rys. 1.10. Widmo mas 4-metylopentan-2-onu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 48 1.2.6.4. Kwasy karboksylowe W przypadku widm mas kwasów monokarboksylowych pik jonu molekularnego zazwyczaj jest obecny. Rozpad α daje dwa piki jonów o masach: M-17 (OH) oraz M-45 (COOH), np. widmo mas dla C3H5COOH – rysunek 1.11. 1.2.6.5. Estry kwasów karboksylowych W przypadku estrów kwasów karboksylowych o ogólnym wzorze R1COOR2 pik pochodzący od jonu molekularnego jest zazwyczaj widoczny, jeśli grupa alkilowa R1 zawiera mniej niż cztery atomy węgla. Piki charakterystyczne pochodzą od jonów powstałych na skutek przegrupowania McLafferty’ego. Przegrupowanie to może zachodzić z udziałem grup alkilowych takich jak – acylowa oraz alkoksylowa, ale pod warunkiem, że grupy te są zbudowane przynajmniej z trzech (w przypadku pierwszej grupy) lub dwóch (w przypadku drugiej grupy) atomów węgla. Warto zauważyć, że charakterystyczny jon dla estrów alkoholi, charakteryzujących się długimi łańcuchami, powstaje na skutek przegrupowania dwóch atomów wodoru – jest to tzw. przegrupowanie typu „McLafferty’ego + 1”. Przykładowo w widmie mas butanianu etylu przedstawionym na rysunku 1.12., obecne są dwa charakterystyczne piki pochodzące od nieparzystoelektronowych jonów o m/z 88 oraz m/z 60, które powstały na skutek dwóch następujących po sobie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 49 przegrupowań McLafferty’ego. Co więcej, odczepienie grupy alkoksylowej powoduje intensywny pik o m/z 71 (M-OCH2CH3). Często w spektrometrii mas mówi się o tzw. „diagnostycznym wskaźniku”, jakim jest pik o m/z 71. Rys. 1.11. Widmo mas dla kwasu masłowego. ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………... K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 50 Rys. 1.12. Widmo mas dla butanianu etylu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 51 1.2.6.6. Aminy W przypadku amin alifatycznych pik jonu molekularnego posiada małą intensywność, z kolei w przypadku amin aromatycznych intensywność ta jest wysoka. Charakterystyczne reakcje rozpadu są analogiczne jak w przypadku alkoholi i eterów. W przypadku amin I° podstawionych w pozycji α jest preferowane odczepienie największej grupy alkilowej – analogiczna sytuacja jest w przypadku amin II° oraz III°. Niech jako przykład posłuży widmo mas dla dietyloaminy przedstawione na rysunku 1.13. 1.2.6.7. Amidy Jeśli chodzi o zachowanie amidów, to rozpad ich przebiega podobnie jak ma to miejsce w przypadku odpowiednich kwasów karboksylowych i estrów metylowych. Dla wszystkich amidów charakterystyczne jest tworzenie jonów o masie M+1 w reakcji między jonami i cząsteczkami. Co więcej, w widmach amidów I° występuje zwykle intensywny pik przy m/z 44. Co więcej, podobnie jak w innych klasach związków organicznych, obserwuje się przegrupowania McLafferty’ego. Na rysunku 1.14 przedstawiono przykładowe widmo mas dla acetamidu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 52 Rys. 1.13. Widmo mas dla dietyloaminy. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 53 Rys. 1.14. Widmo mas dla acetamidu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 54 2 Spektroskopia ramanowska 2.1. Wstęp Widma ramanowskie dostarczają informacji o kompozycji badanej próbki na poziome molekularnym. Oznacza to, że pozwalają one na identyfikację wszystkich składników próbki. Spektroskopia ramanowska może być stosowana zarówno do oznaczeń jakościowych, jak i ilościowych. W przypadku analizy ilościowej konieczne jest jednak wykonanie odpowiedniej kalibracji. Co więcej, możliwe jest określenie np. konformacji molekuł, długości łańcucha, czy stopnia nienasycenia kwasów tłuszczowych. W poniższym rozdziale przedstawione zostanie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 55 podejście do interpretacji widm ramanowskich na przykładzie odpowiednio dobranych związków chemicznych z grupy lipidów, białek i węglowodanów, a także na przykładzie widm pochodzących z bardziej skomplikowanych układów biologicznych. Przy analizie widm ramanowskich wyodrębnić można zazwyczaj dwa interesujące zakresy: tzw. fingerprint (0 – 1800 cm-1) oraz wysoki zakres (2800 – 3200 cm-1). Ze względu na brak pasm w obszarze pomiędzy tymi dwoma zakresami (1800 – 2800 cm-1) region ten zazwyczaj nie jest przedstawiany na widmach materiałów biologicznych. 2.2. Interpretacja widm ramanowskich - lipidy Lipidy stanowią grupę związków doskonale nadających się do badania techniką spektroskopii ramanowskiej, ze względu na duży przekrój czynny molekuł na rozpraszanie. Sygnały lipidowe charakteryzują się zazwyczaj dobrą intensywnością. W przypadku mieszanin lipidów, oprócz identyfikacji ich obecności w próbce, możliwe jest również oznaczenie np. stopnia nienasycenia komponentów lipidowych, czy rozgałęzienia łańcucha lipidowego. Na rysunku 2.1 przedstawiono widmo ramanowskie kwasu palmitynowego wraz z przypisanymi najważniejszymi pasmami. W obszarze odcisku palca wyraźnie widoczne jest kilka pasm. W zakresie pomiędzy 1000 a ok. 1200 cm-1 obserwujemy pasma związane z drganiami rozciągającymi szkieletu C – C. Następnie, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 56 widoczne są pasma związane z drganiami skręcającymi grupy CH2 (δ(CH2), z ang. twisting) oraz drganiami deformacyjnymi grup CH3 i CH2 (δ(CH3) i δ(CH2)). W wysokim zakresie z kolei widoczne są pasma związane z drganiami rozciągającymi wiązań C – H, odpowiednio dla grup CH2 oraz CH3, przy czym pasma, odpowiadające drganiom rozciągającym asymetrycznym, pojawiają się przy niższej wartości liczby falowej niż pasma odpowiadające drganiom rozciągającym symetrycznym. W tabeli 2.1 zestawiono obserwowane pasma dla widma ramanowskiego kwasu palmitynowego wraz z ich odpowiednim przypisaniem. Tabela 2.1. Zestawienie położenia pasm wraz z ich przypisaniem dla widma kwasu palmitynowego (rys.2.1). Położenie pasma [cm-1] Przypisanie 1068 ν (C – C) 1134 ν (C – C) 1300 τ (CH2) 1427 β (CH2) 1442 α (CH2 /CH3) 1467 β (CH2 /CH3) 2848 νs (=CH2) 2882 νas (=CH2) 2925 νs (=CH3) 2967 νas (=CH3) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 57 Rys. 2.1. Widmo ramanowskie kwasu palmitynowego wraz z przypisaniem najważniejszych pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 58 Kwas palmitynowy stanowi przykład lipidu nasyconego. W przypadku obecności wiązań wielokrotnych na widmie ramanowskim pojawiają się dodatkowe pasma, związane z ich drganiami. Przykład takiego widma przedstawiono na rysunku 2.2. Przykładem wymienionych pasm, pochodzących od drgań wiązań wielokrotnych, mogą być m.in. pasma położone przy 1266, 1657 i 3012 cm-1. Ich obecność pozwala na jednoznaczną identyfikację nienasyconych lipidów. W tabeli 2.2 zestawiono obserwowane pasma dla widma ramanowskiego kwasu oleinowego wraz z ich odpowiednim przypisaniem. Tabela 2.2. Zestawienie położenia pasm wraz z ich przypisaniem dla widma kwasu oleinowego (rys.2.2). Pasma pochodzące od wiązań wielokrotnych zaznaczono kolorem czerwonym. Położenie pasma [cm-1] Przypisanie 1084 ν (C – C) 1266 δ(CH2) 1305 τ (CH2) 1444 α (CH2 /CH3) 1657 ν(C=C) 2852 νs (=CH2) 2892 νas (=CH2) 3012 ν(=CH) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 59 Rys. 2.2. Widmo ramanowskie kwasu oleinowego wraz z przypisaniem najważniejszych pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 60 Fakt występowania pasm pochodzących wyłącznie od drgań wiązań wielokrotnych pozwala nie tylko zidentyfikować obecność takich związków w badanej próbce, ale również zbadać ich stopień nienasycenia. Stopień nienasycenia rozumiany może być jako stosunek ilości wiązań wielokrotnych do ilości wiązań pojedynczych. Intensywność każdego pasma, odpowiadającego danemu drganiu danego wiązania, rozpatrywanego jako oscylator, uzależniona jest od ilości tych wiązań. A zatem intensywność pasm związanych z wiązaniami wielokrotnymi będzie proporcjonalna do ich ilości. Analogiczna sytuacja ma miejsce dla wiązań pojedynczych. Zatem stosunek intensywności pasm odpowiadający wiązaniom wielokrotnym do intensywności pasm odpowiadających wiązaniom pojedynczym będzie ściśle powiązany ze stopniem nienasycenia. W spektroskopii ramanowskiej najczęściej wykorzystuje się tzw. intensywność integralną pasma, tj. wartość całki odpowiadającej polu powierzchni pod pasmem. W spektroskopii ramanowskiej możemy wyodrębnić trzy kryteria wyznaczania stopnia nienasycenia, przy czym pod pojęciem kryterium rozumiany jest zestaw pasm wykorzystywanych do oceny stopnia nienasycenia. Pierwszym z nich są pasma położone przy ok. 1266 i 1305 cm-1, pochodzące odpowiednio od wiązań nienasyconych i nasyconych. Kryterium to jest stosowane powszechnie. Znaczącą trudnością z nim związaną jest jednak słabe rozdzielenie wymienionych pasm. Powoduje to konieczność arbitralnego i często niejednoznacznego K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 61 określenia granic całkowania. Drugim, najpowszechniej wykorzystywanym kryterium, jest stosunek intensywności pasm położonych przy 1657 i 1444 cm-1. W tym przypadku pasma są zdecydowanie rozdzielone, a ich granice wyraźnie określone. W przypadku skomplikowanych mieszanin, zawierających również składniki białkowe, należy jednak mieć na uwadze fakt, iż pasmo położone przy 1657 cm -1 może częściowo pokrywać się z pasmem amidowym I. Trzecim możliwym do wykorzystania kryterium jest stosunek pasm położonych przy 3012 i 2852 cm -1. Kryterium to jest jednak wykorzystywane stosunkowo rzadko ze względu na jego słabą czułość. Pasmo położone przy 3012 cm-1 (pochodzące od lipidów nienasyconych) jest znacząco mniejsze od pasma położonego przy 2852 cm-1. Tym samym, aby stosunek intensywności wymienionych pasm uległ niewielkiej zmianie konieczna jest istotna zmiana zawartości lipidów nienasyconych. Na rysunku 2.3 przedstawiono zestaw widm kwasów tłuszczowych o wzrastającym stopniu nienasycenia. ………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 62 Rys. 2.3. Zestaw widm ramanowskich kwasów tłuszczowych o różnym stopniu nienasycenia. *** Innym interesującym przykładem zastosowania spektroskopii ramanowskiej do analizy lipidów jest ocena obecności izomerów geometrycznych trans w badanej próbce. Wykorzystywane jest do tego pasmo pochodzące od drgań rozciągających wiązanie C=C. W przypadku obecności izomeru cis pasmo to położone jest przy około 1656 cm-1, natomiast w przypadku konformeru trans ulega K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 63 przesunięciu do około 1675 cm-1. Na rysunku 2.4 przedstawiono tą zależność na przykładzie kwasu oleinowego oraz jego izomeru geometrycznego – kwasu elaidynowego. Rys. 2.4. Widma ramanowskie kwasu oleinowego (wiązanie podwójne w konformacji cis) oraz jego izomeru geometrycznego – kwasu elaidynowego (wiązanie podwójne w konformacji trans) z zaznaczonym charakterystycznym położeniem pasma od drgania rozciągającego C=C dla obu konformerów. *** Kolejnym interesującym zagadnieniem, możliwym do obserwacji i oceny za pomocą spektroskopii ramanowskiej K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 64 jest długość (oraz rozgałęzienie) łańcuchów lipidowych. Jak można było zaobserwować na zaprezentowanych dotychczasowo widmach oraz w tabelach, ugrupowania CH2 i CH3 są źródłem różnych pasm (choć często położonych blisko siebie). Zarówno długość, jak i rozgałęzienie łańcucha kwasów tłuszczowych (i innych lipidów) przekładają się bezpośrednio na ilość ugrupowań CH2 i CH3 w molekule. Poprzez ocenę stosunku intensywności odpowiadających im pasm możliwe jest – podobnie jak w przypadku stopnia nienasycenia – określenie długości/rozgałęzienia łańcucha lipidowego. Na rysunku 2.5 przedstawiono przykład dwóch nasyconych kwasów tłuszczowych o różnej długości łańcucha. Rys. 2.5. Widma ramanowskie kwasu palmitynowego i stearynowego. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 65 Na rysunku 2.5 zaznaczono dwa obszary, w których występują wyraźne różnice. Pierwszym z nich jest zakres pomiędzy 1400 a 1500 cm-1. W przypadku obu kwasów występują trzy pasma . W przypadku kwasu stearynowego (wyższy stosunek ilości grup CH2 do grup CH3) pasmo od drgań β grupy CH2 ulega jednak przesunięciu w kierunku niższej wartości liczby falowej. Zmianie ulegają również stosunki intensywności poszczególnych pasm (rysunek 2.6). . Rys. 2.6. Widma ramanowskie kwasu palmitynowego i stearynowego -1 w zakresach głównych różnic: 1400 – 1500 cm (po lewej) oraz 2800 -1 – 3050 cm (po prawej). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 66 Różnicę długości łańcucha (rozumianą jako różnicę stosunku ilości grup CH2 do ilości grup CH3) można wyraźniej zaobserwować w wysokim zakresie (2800 – 3050 cm-1), gdzie pasma od drgań ugrupowań CH2 i CH3 są lepiej rozdzielone. W przypadku obu kwasów najintensywniejszym jest pasmo odpowiadające drganiu rozciągającemu asymetrycznemu grupy CH2 (νas (=CH2), ok. 2882 cm-1). Wyraźnie widoczne (choć mniej intensywne) jest również pasmo pochodzące od drgań rozciągających symetrycznych tej grupy (νs (=CH2), ok. 2848 cm-1). Różnicę w długości łańcucha możemy jednak zaobserwować na podstawie pasm odpowiadających drganiom ugrupowań CH3. Chociaż liczba tych grup w obu cząsteczkach jest taka sama, to jednak stosunek ilości grup CH3 do grup CH2 jest wyższy w kwasie palmitynowym. W widmie kwasu palmitynowego wyraźnie widoczne są zarówno drgania asymetryczne jak i symetryczne grup CH3, podczas gdy w widmie kwasu stearynowego intensywność pasma pochodzącego od drgania symetrycznego CH3 jest już zbyt mała. *** Do grupy lipidów, oprócz kwasu tłuszczowych, zaliczamy szereg innych związków chemicznych, m.in. trójglicerydy, cholesterol i jego estry oraz fosfolipidy. Różnice w budowie chemicznej z oczywistych względów znajdują swoje odzwierciedlenie w widmach ramanowskich. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 67 Trójglicerydy są to estry glicerolu oraz trzech kwasów tłuszczowych. Z tego względu w ich widmie pojawiać się będą nie tylko pasma od kwasów tłuszczowych (nasyconych i/lub nienasyconych – w zależności od trójglicerydu), ale również pasma m.in. od wiązania estrowego. Na rysunku 2.7 przedstawiono widma trójglicerydu nasyconego (tripalmitynian glicerolu) oraz kwasu tłuszczowego, budującego dany trójgliceryd (kwas palmitynowy) wraz z przypisaniem charakterystycznych pasm. Jak widać, widmo trójglicerydu różni się nieco od widma budującego go kwasu tłuszczowego. Podstawową różnicą jest obecność pasma pochodzącego od drgania rozciągającego wiązanie estrowe (ν(C=O)), polożonego przy ok. 1745 cm-1 (zaznaczonego na rysunku 2.7 kolorem czerwonym). Pasmo to będzie obecne w widmach ramanowskich wszystkich trójglicerydów, a także estrów. Poza obecnością wymienionego pasma, na widmie trójglicerydu zauważyć można szereg innych różnic. Wysoki zakres charakteryzuje się wiekszą intesywnością w stosunku do zakresu odcisku palca (600 – 1800 cm-1) w porówananiu do widma kwasu tłuszczowego. Wynika to z faktu, iż w wysokim zakresie obecne są pasma związane z drganiami ugrupowań CH2 i CH3. Cząsteczka trójglicerydu posiada w swojej strukturze aż trzy cząsteczki kwasu tłuszczowego (stąd około trzykrotnie większą liczbę ugrupowań CH2). Pasma powiązane z ugrupowaniami CH2 (≈2850 cm-1 oraz 2885 cm-1) będą K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 68 zatem znacznie trójglicerydu. bardziej intensywne w widmie Rys. 2.7. Widma ramanowskie kwasu palmitynowego (niebieskie) oraz tripalmitynianu glicerolu (czarne) wraz z położeniem pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 69 Z drugiej strony jednak czasteczka trójglicerydu posiada nieznacznie większą ilość ugrupowań CH3 niż cząsteczka kwasu tłuszczowego. Wyraźna zmiana stosunku ilości ugrupowań CH2 do ilości ugrupowań CH3 w przypadku trójglicerydu w porównaniu do kwasu tłuszczowego powoduje, że dla trójglicerydu pasma pochodzace od drgań ugrupowań CH3 są niewidoczne. Pomimo opisanych różnic pomiędzy widmami kwasu tłuszczowego oraz odpowiadającego mu trójglicerydu daje się pomiędzy nimi zauważyć również pewne podobieństwo. Obecność tych samymch pasm lipidowych (z wyjątkiem pasma pochodzącego od drgania rozciągającego C=O), ich zbliżone położenie oraz profil spektralny widma pozwalają wnioskować, że w obrębie obu tych związków występują podobne ugrupowania. Opisane różnice miedzy widmem kwasu tłuszczowego i pochodzącego od niego trójglicerydu są zdecydowanie mniejsze niż różnice pomiędzy widmami ramanowskimi dwóch trójglicerydów o różnym stopniu nienasycenia. Widma takie przedstawiono na rysunku 2.8. Podobnie jak w przypadku kwasów tłuszczowych, również dla trójglicerydów możliwe jest określenie stopnia nienasycenia. Jak widać na rysunku 2.8, obecność wiązań wielokrotnych w łańcuchu kwasu tłuszczowego trójglicerydu jest źródłem pasm pochodzących od drgań rozciągających oraz deformacyjnych tego wiązania. Są to pasma położone (analogicznie jak w widmie ramanowskim kwasu tłuszczowego) przy ok. 1270, 1659 oraz 3008 cm -1 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 70 (zaznaczone na rysunku 2.8 kolorem niebieskim). W tabeli 2.3 zestawionio pasma obserowane na widmach ramanowskich tripalmitynianu oraz trioleinianu glicerolu wraz z ich przypisaniem. Tabela 2.3. Zestawienie położenia pasm wraz z ich przypisaniem dla widma trójglicerydów przedstawionych na rysunku 2.8. Położenie pasma [cm-1] Przypisanie 875 ν (C – C) 1066 ν (C – C) 1084 ν (C – C) 1270 δ(CH2) 1302(6) τ (CH2) 1445 (7) α (CH2 /CH3) 1470 β (CH2 /CH3) 1659 ν(C=C) 1745(9) ν(C=O) 2850(3) νs (=CH2) 2884 νas (=CH2) 2905 νas (=CH2) 2932 νs (=CH3) 3008 ν(=CH) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 71 Rys. 2.8. Widma dwóch trójglicerydów o różnym stopniu nienasycenia: tripalmitynianu oraz trioleinianu glicerolu wraz z położeniem pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 72 *** Kolejną interesującą grupą lipidów są cholesterole (tj. cholesterol oraz jego estry). Związki te mają w swojej strukturze pierścień, którego drgania są źródłem szeregu specyficznych pasm. Na rysunku 2.9 przedstawiono ramanowskie widmo cholesterolu oraz jego dwóch estrów – palmitynianu oraz oleinianu. Widmo ramanowskie cholesterolu jest bogate w pasma. Niektóre z nich – jak np. pasmo położone przy 1442 cm -1 – nie są specyficzne wyłącznie dla cholesterolu, a raczej dla całej grupy lipidów. Widoczne jest również pasmo pochodzące od drgań wiązań podwójnych w pierścieniu (około 1672 cm-1). Nie oznacza to jednak, że są to wiązania w konformacji trans. Energia drgań wiązań wielokrotnych w pierścieniu będzie jednak nieco inna niż w przypadku wolnych kwasów tłuszczowych. Profil spektralny widma – szczególnie w wysokim zakresie – jest dla cholesterolu na tyle charakterystyczny, że pozwala go jednoznacznie odróżnić od pozostałych lipidów. Przykładem pasma pochodzącego od pierścienia cholesterolu jest pasmo położone przy około 700 cm -1, związane z drganiami deformacyjnymi pierścienia cholesterolu. Estry cholesterolu zbudowane są z pierścienia cholesterolu oraz odpowiedniej reszty kwasu tłuszczowego przyłączonej za pomocą wiązania estrowego. Z tego względu w ich widmie ramanowskim – K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 73 podobnie jak w przypadku każdego estru – obserwować będziemy pasmo położone przy około 1740 cm-1 (drganie rozciągające wiązanie C=O). Widoczne będą również pasma markerowe dla reszty kwasu tłuszczowego. A zatem, np. w przypadku gdy jest to kwas tłuszczowy nienasycony, obserwować będziemy pasma pochodzące od drgań wiązań wielokrotnych w łańcuchu (tj. m.in. pasma przy około 1659 i 3009 cm-1). Ponieważ w obrębie takiej molekuły występuje w dalszym ciągu pierścień cholesterolowy na widmie występować będą również pasma charakterystyczne dla niego – tj. przy ok. 700 cm-1 (drgania deformacyjne pierścienia) oraz 1668 cm -1 (drgania wiązań podwójnych w pierścieniu). Warto zwrócić tutaj uwagę na przykład oleinianu cholesterolu, dla którego w zakresie 1620 – 1700 cm-1 pojawiają się w rzeczywistości dwa pasma (niezbyt wyraźnie rozdzielone) – jedno, od drgania wiązania podwójnego w łańcuchu kwasu tłuszczowego (ok. 1659 cm -1) oraz drugie od drgań wiązań podwójnych pierścienia (ok. 1668 cm-1). ………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 74 Rys. 2.9. Widma ramanowskie cholesterolu oraz jego dwóch estrów – nasyconego (palmitynian) i nienasyconego (oleinian). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 75 Podsumowanie: Obecność lipidów w próbce na podstawie widma ramanowskiego można zidentyfikować z łatwością m.in. na podstawie pasm położonych przy 1300 i 1444 cm -1. Obecność wiązania wielokrotnego w lipidach potwierdzają pasma pochodzące od ich drgań położone przy ~1266, 1656 oraz 3010 cm-1. Stopień nienasycenia można wyznaczyć z widma ramanowskiego korzystając ze stosunków intensywności (integralnej) pasm pochodzących od wiązań wielokrotnych i pojedynczych, korzystając z następujących kryteriów: I1266/I1305 I1656/I1444 I3010/I2885 Obecność estrów (kwasów tłuszczowych, cholesterolu, itd.) można potwierdzić na podstawie występowania pasma od drgania rozciągającego wiązanie estrowe, położonego przy ok. 1740 cm-1. Obecność cholesterolu można potwierdzić na podstawie jego profilu spektralnego (wysoki zakres, tj. 2800 – 3050 cm-1) oraz obecności pasm pochodzących od drgań pierścienia cholesterolu (np. ok. 701 cm -1). O obecności estrów cholesterolu świadczy natomiast współwystępowanie pasma pochodzące od estrów (~1740 cm-1) oraz pasm pochodzących od pierścienia cholesterolu (np. ~701 cm-1). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 76 2.3. Interpretacja widm ramanowskich - białka Kolejną grupą związków, których analizę można przeprowadzić metodą spektroskopii ramanowskiej są białka. W przypadku białek najbardziej charakterystyczne pasma związane są z grupą CONH. W tabeli 2.4 zestawiono położenia pasm amidowych oraz ich pochodzenie. Dla identyfikacji konformacji białek szczególne znaczenie ma położenie pasm amidowych I, II oraz III. Położenia tych pasm zmieniają się znacznie, w zależności od tego, czy dane białko występuje w formie α lub β. Typowo, dla struktury α pasmo amidowe I położone jest w zakresie pomiędzy 1655 a 1662 cm-1. Dla struktury β natomiast pasmo amidowe I przesunięte jest w kierunku wyższych wartości liczb falowych, tj. 1672 – 1674 cm-1. Odwrotną zależność możemy zaobserwować dla pasma amidowego III, występującego zazwyczaj w przedziale 1264 – 1274 cm-1 dla struktury α oraz w przedziale 1227 – 1242 cm-1 dla białek w konformacji β-kartki. Z powyższych informacji wynika jasno, iż spektroskopia ramanowska pozwala na identyfikację struktury II-rzędowej białek. W niniejszym rozdziale przedstawione zostaną przykłady widm białek o budowie wyłącznie α-helisy, β-kartki oraz złożonych, zaliczanych do grup α/β i α + β (posiadających fragmenty formujące zarówno strukturę wyłącznie α-helisy jak i β-kartki, ulokowane w sposób uporządkowany lub nieuporządkowany). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 77 Tabela 2.4. Zestawienie zakresów występowania charakterystycznych pasm amidowych oraz ich pochodzenia. Pasmo Położenie pasma (zakres) [cm-1] Amidowe A ~ 3500 Amidowe B ~ 3100 Amidowe I 1600 – 1690 Amidowe II 1480 – 1580 Amidowe III 1230 – 1300 Amidowe IV 625 – 770 Amidowe V 640 – 800 Amidowe VI 540 – 600 Amidowe VII ~ 200 Pochodzenie Drganie rozciągające N-H Drganie rozciągające N-H Drganie rozciągające C=O Drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H* Drganie zginające O-C-N Drganie zginające** N-H Drganie zginające** C=O Drgania szkieletowe * drgania sprzężone ** poza płaszczyznę (z ang. out – of – plane) Na rysunku 2.10 przedstawiono widmo albuminy – białka należącego do grupy α. Jest to klasyczny przykład białek o konformacji α (zerowa zawartość struktury β). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 78 Rys. 2.10. Widma ramanowskie albuminy (reprezentującej białka grupy α) z zaznaczonymi położeniami pasm oraz pochodzeniem (dla wybranych). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 79 Jak widać na widmie ramanowskim, zarówno położenie pasma amidowego I (1657 cm-1), jak i pasma amidowego III (1273 cm-1) potwierdzają strukturę albuminy jako α- helisę. W przypadku analizy widm ramanowskich białek należy również liczyć się z obecnością pasm pochodzących od aminokwasów budujących owe białka. Przykładem tego mogą być pasma położone przy 1009 cm-1 oraz przy 1321 i 1341 cm-1, pochodzące odpowiednio od fenyloalaniny i tryptofanu. W tabeli 2.5 zestawiono przypisanie pasm widocznych na widmie albuminy. Tabela 2.5. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla widma albuminy (α-helisa) przedstawionego na rysunku 2.10. Położenie pasma [cm-1] 1009 Przypisanie Fenyloalanina 1273 Amidowe III (ν(C-N) + δ(N-H)) 1321 Tryptofan (δ(Ca – H) 1341 Tryptofan (δ(Ca – H) 1454 δ(C-H) 1657 Amidowe I (ν(C=O) 3060 ν(N-H) Na rysunku 2.11 przedstawiono przykład białka – elastyny – o strukturze β-kartki. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 80 Rys. 2.11. Widmo ramanowskie elastyny (reprezentującej białka grupy β) z zaznaczonymi położeniami pasm oraz pochodzeniem (dla wybranych). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 81 Jak można zauważyć, położenia pasm amidowych są wyraźnie różne niż dla albuminy (struktura α). Szczególnie przydatne do oceny konformacji okazuje się być ponownie pasmo amidowe I (1668 cm-1) oraz pasmo amidowe III (1240 cm-1). Poza charakterystycznymi pasmami amidowymi obserwujemy szereg pasm pochodzących od aminokwasów, w szczególności od fenyloalaniny, tyrozyny oraz tryptofanu. W tabeli 2.6 zestawiono położenia oraz pochodzenie pasm widocznych na widmie elastyny. Tabela 2.6. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla widma elastyny (β-kartka) przedstawionego na rysunku 2.11. Położenie pasma [cm-1] 760 Przypisanie Tryptofan 1009 Fenyloalanina 1240 Amidowe III (ν(C-N) + δ(N-H)) 1343 Tryptofan (δ(Ca – H) 1452 δ(C-H) 1544 Tryptofan (pierścień indolowy) 1621 Tyrozyna, tryptofan, fenyloanalina 1668 Amidowe I (ν(C=O) 3062 ν(N-H) Na rysunku 2.12 przedstawiono dwa przykłady białek o mieszanej strukturze K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 82 Rys. 2.12. Widma ramanowskie proteinazy i papainy (reprezentującej białka z grup α/β oraz α+β) z zaznaczonymi położeniami pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 83 W tabeli 2.7 zestawiono przypisanie poszczególnych pasm widocznych na widmach. Tabela 2.7. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla widm białek mieszanych (α/β i α+β) przedstawionych na rysunku 2.12. Położenie pasma [cm-1] Przypisanie 820 Tryptofan 851(6) Tyrozyna 931 N – Cα – C (α-helisa) 1006(11) Fenyloalanina 1240 1273 Amidowe III (ν(C-N) + δ(N-H)) (β-kartka) Amidowe III (ν(C-N) + δ(N-H)) (α-helisa) 1339(47) Tryptofan (δ(Ca – H) 1452(6) δ(C-H) 1546 Tryptofan (pierścień indolowy) 1617(19) Tyrozyna, tryptofan, fenyloanalina 1668(9) Amidowe I (ν(C=O) 3062 ν(N-H) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 84 Jak widać, na widmie białek mieszanych również pojawiają się sygnały od aminokwasów wchodzących w ich skład. Położenia pasm amidowych sugerują obecność zarówno struktury α, jak i β. Jest to widoczne szczególnie w przypadku pasma amidowego III, o złożonej strukturze. W zakresie pomiędzy 1200 a 1300 cm -1 widoczny jest szereg pasm o maksimach odpowiadających zarówno α-helisie (1273 cm-1) jak i βkartce (1240 cm-1). Również położenie pasma amidowego I sugeruje strukturę mieszaną – leży ono w zakresie pomiędzy zakresem charakterystycznym dla struktury β (1672 – 1674 cm-1) a zakresem charakterystycznym dla struktury α (1655 – 1662 cm-1). Podsumowanie: W widmach ramanowskich białek widoczne będą sygnały charakterystyczne zarówno dla ugrupowania CONH (pasma amidowe), jak i pasma pochodzące od poszczególnych aminokwasów, budujących białka. Określenie struktury białka z widm ramanowskich jest możliwe na podstawie położenia pasm amidowych (w szczególności pasma amidowego I i III). Dla struktury α pasma te leżą odpowiednio w zakresach: 1655 – 1662 cm-1 (pasmo amidowe I) i 1264 – 1274 cm-1 (pasmo amidowe III), natomiast dla struktury β: 1672 – 1674 cm-1 (pasmo amidowe I) i 1227 – 1242 cm-1 (pasmo amidowe III). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 85 2.4. Interpretacja węglowodany widm ramanowskich - Kolejną grupa związków chemicznych są węglowodany. Widma ramanowskie węglowodanów są bogate w sygnały, szczególnie w zakresie niskich wartości liczb falowych. Przykład widma glukozy oraz galaktozy przedstawiono na rysunku 2.13. Jak można zauważyć na rysunku 2.13, w przypadku widm ramanowskich węglowodanów, obserwujemy szereg pasm w zakresie 200 – 1400 cm-1. ”Bogactwo” pasm w widmie ramanowskim jest charakterystyczne dla cukrów, szczególnie w odniesieniu do pasm położonych w zakresie niższych wartości liczb falowych. Intensywność i położenia poszczególnych pasm są różne dla różnych cukrów. Co więcej, przykładowo dla Dgalaktozy pasma z wysokiego zakresu nie są znacząco intensywniejsze od pasm w zakresie odcisku palca. Szczegółowe przypisanie poszczególnych pasm przedstawiono w tabeli 2.8. …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 86 Rys. 2.13. Widma ramanowskie D-glukozy (niebieskie) i D-galaktozy (czerwone) z zaznaczonymi położeniami pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 87 Tabela 2.8. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla widm węglowodanów przedstawionych na rysunku 2.13. Położenie pasma [cm-1] Przypisanie D-glukoza D-galaktoza 405 395 543 515 843 830 917 891 1077 - ν(C-O), ν(C-C) 1109 - ν(C-O), ν(C-C) 1348 1249 δ(CH2), δ(CH2OH), 2890 2916 ν(CH2) 2944 2971 ν(CH2) 3393 3378 ν(NH), ν(OH) Odkształcenia endocykliczne Odkształcenia egzocykliczne δ(COH), δ(CCH), δ(OCH) δ(COH), δ(CCH), δ(OCH) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 88 2.5. Interpretacja widm ramanowskich - układy złożone Znając spektralną charakterystykę poszczególnych grup związków oraz przydatność spektroskopii ramanowskiej do ich badania możliwa jest interpretacja widm, pochodzących nie tylko z prostych próbek, ale również ze złożonych układów, np. materiałów biologicznych. Na rysunku 2.14 przedstawiono widma pochodzące z różnych obszarów tkanki wątroby. Widmo tkanki będzie zawierać jednocześnie sygnały od wszystkich grup związków omówionych dotychczasowo. Zbliżone położenie dla wielu pasm pochodzących od różnych związków czyni widma takie trudnymi do interpretacji. Jako przykład podać można położenie pasma amidowego I (~1650 cm-1) i pasma pochodzącego od lipidów nienasyconych (~1656 cm-1). W celu uniknięcia błędnego przypisania pasm analizę należy prowadzić z uwzględnieniem profilu spektralnego widma. W takim wypadku warto zwracać uwagę na współwystępowania pasm. Przykładowo, na rysunku 2.14 zarówno na widmie niebieskim, jak i czerwonym obserwujemy pasma położone odpowiednio przy 1659 i 1657 cm-1. W przypadku widma niebieskiego jednakże wyraźnie widoczne są również inne pasma charakterystyczne dla lipidów (w tym również lipidów nienasyconych) – tj. pasma położone przy 1268 cm-1, 1304 cm-1, 1443 cm-1, czy 3011 cm-1. Profil spektralny widma oraz współobecność K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 89 innych pasm lipidowych pozwalają zatem na przypisanie pasma położonego przy 1659 cm-1 przede wszystkim do drgań rozciągających ugrupowania C=C w lipidach. Należy jednak pamiętać, że w przypadku rzeczywistego widma materiału biologicznego, wkład do wspominanego pasma mają również sygnały białkowe. Na podstawie profilu spektralnego widma niebieskiego można stwierdzić, że jest to wkład niewielki, nie można go jednak zupełnie wyeliminować. Analizując widmo niebieskie z rysunku 2.14 można zatem stwierdzić, że pochodzi ono z obszaru bogatego w lipidy. Co więcej, w obszarze tym z pewnością znajdują się zarówno lipidy nasycone, jak i nienasycone. Obecność pasma pochodzącego od drgania wiązania C=O wskazuje również na obecność estrów. Brak charakterystycznych sygnałów dla estrów cholesterolu pozwala przypuszczać, że w próbce obecne są trójglicerydy. Na podstawie zaprezentowanego widma możliwe jest również określenie np. stopnia nienasycenia w badanej próbce. W przypadku obszaru II (widmo czerwone) widmo staje się nieco bardziej skomplikowane. Na podstawie obecności pasm położonych przy 1444 i 3006 cm -1 stwierdzić można obecność lipidów. Niewielka intensywność tych pasm sugeruje jednak ich małą zawartość. Tym samym pasmo położone przy ok. 1657 cm-1 pochodzi zarówno od drgań rozciągających wiązania C=C w lipidach (obecność pasma położonego przy ok. 3006 cm-1 wskazuje na obecność lipidów K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 90 nienasyconych), jak i od drgań rozciągających C=O w białkach (pasmo amidowe I), przy czym wkład drugiego czynnika jest znacząco większy. Rys. 2.14. Widma ramanowskie pochodzące z dwóch obszarów tkanki wątroby o różnej kompozycji z zaznaczonymi położeniami pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 91 Podobnie, interpretacja pochodzenia pasma przy ok. 1258 cm-1 jest skomplikowana. Może ono pochodzić zarówno od białek (pasmo amidowe III), jak i lipidów. Pozostałe pasma widoczne na widmie, potwierdzają obecność obu tych grup komponentów. Profil spektralny widma oraz kształt wspomnianego pasma sugerują znacznie większy udział drgań amidowych. Wreszcie, najintensywniejsze pasmo na widmie – położone przy ok. 1590 cm-1 – jest pasmem charakterystycznym dla ugrupowań hemowych. Ich wysoką zawartość potwierdza również obecność pasm położonych przy 751 i 1134 cm -1 (pasma markerowe ugrupowań hemowych), a także znaczące podniesienie tła w zakresie 600 – 1600 cm-1. W tabeli 2.9 zestawiono położenia pasm zaobserwowanych na dwóch widmach pochodzących z tkanki wątroby wraz z ich przypisaniem. Tabela 2.9. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla widm tkanki wątroby przedstawionych na rysunku 2.14. Położenie pasma [cm-1] Przypisanie Obszar I Obszar II - 751 856 - Prolina, hydroksyprolina, tyrozyna 1070 - νs (PO2-) (DNA) 1134 Ugrupowania hemowe Ugrupowania hemowe K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 92 δ(CH2) (lipidy) 1268 - - 1258 δ(CH2) (lipidy) + pasmo amidowe III 1304 1304 τ (CH2) 1443 1444 α (CH2 /CH3) - 1590 Ugrupowania hemowe - 1657 ν(C=C) (lipidy) = pasmo amidowe I 1659 - 2853 2850 νs (=CH2) - 2894 νas (=CH2) - 2932 νs (=CH3) 3006 3011 ν(=CH) ν(C=C) (lipidy) …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 93 3 Spektroskopia IR 3.1. Wstęp Absorpcyjna spektroskopia w podczerwieni (IR) jest metodą komplementarną do spektroskopii ramanowskiej (RS). Dla obu tych technik obowiązuję tzw. zakaz alternatywny, zgodnie z którym dla molekuł centrosymetrycznych drgania aktywne w spektroskopii IR nie będą aktywne w spektroskopii RS (oraz odwrotnie). Dlatego też, pełne widmo oscylacyjne możemy uzyskać dzięki zastosowaniu obu tych technik równocześnie. Widmo absorpcyjne w podczerwieni reprezentuje K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 94 zależność intensywności promieniowania od jego częstości, przedstawianą najczęściej w postaci krzywej Lorentza. Pasma na widmie – niosące informację o wzbudzonych oscylacjach molekularnych – charakteryzuje się poprzez podanie takich parametrów jak: położenie maksimum, intensywność integralną pasma oraz jego szerokość połówkową. Absorpcja promieniowania podczerwonego indukuje przejścia pomiędzy poziomami oscylacyjnymi. Każda cząsteczka chemiczna posiada swój własny, niepowtarzalny zestaw poziomów energetycznych, a tym samym również unikatowe widmo w podczerwieni. Jednakże te same grupy funkcyjne, ujęte jako indywidualne oscylatory, występujące w różnych molekułach charakteryzują się zbliżoną wartością energii drgań. Oznacza to, że pasma o określonej częstości mogą być przypisane konkretnym drganiom odpowiednich grup atomów. Co prawda, każde pasmo stanowi w rzeczywistości złożenie kilku drgań normalnych, zazwyczaj jednak jedno z nich charakteryzuje się znacznie większą amplitudą drgań od pozostałych, a tym samym jego wkład w dane pasmo jest największy. Stanowi to fundament standardowego podejścia do analizy widm, polegającego na przypisaniu pasm do konkretnych drgań grup atomów oraz – na tej podstawie – określenia składu chemicznego. Podobnie jak w przypadku spektroskopii RS, możliwe jest przeprowadzenie analizy jakościowej oraz ilościowej. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 95 Do analizy ilościowej konieczna jest wcześniejsza kalibracja. Spektroskopia IR wykorzystuje dwa interesujące zakresy: tzw. fingerprint (0 – 1800 cm-1) oraz wysoki zakres (2800 – 3500 cm-1). W obszarze pomiędzy tymi dwoma zakresami (1800 – 2800 cm-1) nie występują zazwyczaj pasma (z wyjątkiem pasma od CO2 lub pasm związanych z ligandami cyjanowymi). W przypadku spektroskopii IR do analizy wykorzystuje się zazwyczaj nie tylko same widma, ale również ich drugie pochodne. Do wyliczania drugich pochodnych wykorzystuje się różne algorytmy, jednak najpowszechniejszym jest algorytm Savitzky – Golay’a. Algorytm ten dopasowuje wielomian n – tego rzędu do widma, uwzględniając każdorazowo określoną liczbę punktów (definiowaną przez osobę analizującą) wokół każdego maksimum. Przykładowo, wybór 9 punktów wygładzania oznacza, iż algorytm uwzględni po 4 punkty po prawej oraz lewej stronie maksimum pasma oraz samo maksimum i na podstawie tych punktów dopasuje krzywą. Dobór liczby punktów wygładzania jest uzależniony od jakości widma. Im wyższy poziom szumów, tym większa liczba stosowanych punktów wygładzania. Jednocześnie, należy mieć jednak na uwadze, że zbyt duża liczba punktów wygładzania doprowadzi do zniekształcenia pasm oraz zafałszowania informacji w widmie. W niniejszym rozdziale przedstawione zostanie podejście do interpretacji widm na przykładzie wybranych K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 96 związków z grupy lipidów, białek oraz cukrów, a także na przykładzie rzeczywistych próbek. Przed analizą wybranych widm w podczerwieni czytelnik zostanie wprowadzony w praktyczne różnice pomiędzy technikami pomiarowymi. Przy interpretacji wykorzystane zostaną zarówno widma, jak i ich drugie pochodne, wyliczane za pomocą algorytmy Savitzky’ego – Golay’a, z zastosowaniem 9 punktów wygładzania. 3.1.1. Tryby pomiarowe Absorpcyjna spektroskopia w podczerwieni umożliwia wykonywanie pomiarów w różnych trybach: transmisji, refleksji, transfleksji (połączenie trybu transmisji i refleksji) oraz techniką ATR (z ang. Attenuated Total Reflectance), wykorzystującą zjawisko całkowitego wewnętrznego odbicia. Widma, zarejestrowane w różnych trybach pomiarowych, będą wykazywały charakterystyczne cechy. Poniżej przedstawiono w skrócie istotne zagadnienia dotyczące pomiarów w różnych trybach. 3.1.1.1. Porównanie transmisji i transfleksji Najczęstszym sposobem rejestracji widm jest technika transmisji. Coraz większą popularność zyskuje również tryb transfleksji, szczególnie w kontekście cienkich materiałów (np. biologicznych) ze względu na niemal dwukrotne wydłużenie drogi optycznej (a tym samym – K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 97 wzrost intensywności sygnału). Na rysunku 3.1 przedstawiono przykład dwóch widm wątroby (w bloku parafinowym), zarejestrowanych w trybie transmisji oraz transfleksji. Pomiędzy przedstawionymi widmami występują oczywiście pewne różnice natury biologicznej. Z punktu widzenia niniejszego rozdziału istotnymi są jednak różnice wynikające z trybów pomiarowych. Najistotniejszą różnicą między widmami rejestrowanymi w trybie transmisji i transfleksji jest różny stosunek pasm z wysokiego zakresu (tj. 2800 – 3500 cm-1) do pasm z obszaru odcisku palca (tj. dla widm z rysunku 3.1: 900 – 1800 cm-1). Można to zaobserwować na rysunku 3.1 poprzez porównanie stosunku intensywności pasm wysokiego zakresu np. do pasma amidowego I (~ 1650 cm-1). Różnice te stają się zdecydowanie bardziej widoczne podczas analizy drugich pochodnych (rysunek 3.2). Można stwierdzić, że stosunek intensywności pasm z zakresu odcisku palca do intensywności pasm z wysokiego zakresu jest wyższy dla widm mierzonych w trybie transmisji, w porównaniu do widm mierzonych techniką transfleksji. …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 98 Rys. 3.1. Widma IR tkanki wątroby w bloku parafinowym zarejestrowane w trybie transmisji (czerwone) oraz transfleksji (czarne). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 99 Rys. 3.2. Pochodne widm IR tkanki wątroby w bloku parafinowym zarejestrowanych w trybie transmisji (czerwone) oraz transfleksji (czarne). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 100 3.1.1.2. Widma rejestrowane techniką ATR Intensywność sygnału rejestrowanego w technice ATR jest uzależniona od głębokości penetracji fali stojącej, zgodnie z zależnością: 𝑧 𝐼(𝑧) = 𝐼(0) exp(− 𝑑 ) 𝑝 (3.1) gdzie: 𝐼(𝑧) − natężenie fali stojącej w odległości z 𝐼(0) − natężenie fali stojącej na granicy ośrodków 𝑧 − odległość od powierzchni kryształu 𝑑𝑝 − głębokość penetracji Głębokość penetracji fali zależy z kolei od długości fali światła padającego w następujący sposób: 𝑑𝑝 = 𝜆 2𝜋𝑛𝑐 √𝑠𝑖𝑛2 (𝜃)− (𝑛𝑝 −𝑛𝑐 ) 2 (3.2) gdzie: 𝜆 − długość fali światła padającego Θ − kąt padania 𝑛𝐶 − współczynnik refrakcji kryształu 𝑛𝑝 − współczynnik refrakcji próbki Należy więc spodziewać się na widmie ATR zmienności w zależności intensywności sygnału od liczby K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 101 falowej, przy której jest ona rejestrowana. Dlatego też, w celu umożliwienia porównywania widm uzyskanych techniką ATR z widmami transmisyjnymi, konieczne jest wprowadzenie odpowiedniej korekty. Na rysunku 3.3 przedstawiono przykład widm ATR kolagenu przed oraz po korekcie ATR. Wskutek zastosowania poprawki na względną intensywność wyraźnemu zwiększeniu uległa intensywność wszystkich pasm. Przykładem obserwowanej zależności może być pasmo amidowe I (~ 1647 cm-1), stanowiące najintensywniejsze pasmo na obu widmach. Wskutek wprowadzenia korekty jego intensywność wzrasta około 2,5 razy. Zmiana intensywności następuje w różnym stopniu dla poszczególnych pasm. Miarą tego zróżnicowania może być stosunek intensywności względem standardu. Znaczące uwypuklenie obserwowane jest dla pasm z zakresu powyżej 2600 cm-1, a więc dla mniejszych długości fali. Przykładem może być pasmo przy ~3300 cm-1, którego intensywność wskutek korekty wzrasta niemal 5 – krotnie. Z kolei pasmo przy ok. 1072 cm-1 ulega „spłaszczeniu”. Chociaż jego intensywność również wzrasta, to jest to wzrost mniejszy niż dla pasma amidowego I, stąd intensywność pasma przy ok. 1072 cm-1 względem pasma amidowego I maleje. Powyższe obserwacje są zgodne z przewidywaniami teoretycznymi. Na podstawie wzorów 1 i 2 można bowiem stwierdzić, że głębokość penetracji fali stojącej, a więc K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 102 również intensywność rejestrowanego sygnału, wzrasta w kierunku niższych liczb falowych. Rys. 3.3. Widma ATR IR kolagenu przed (czarne) i po porawce ATR (czerwone). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 103 3.2. Interpretacja widm IR - lipidy Znając różnice wynikające z trybów pomiarowych oraz konieczne poprawki można przystąpić do analizy przykładowych widm. Pierwszą grupą związków prezentowanych w niniejszym rozdziale są lipidy. Na rysunku 3.4 przedstawiono widmo reprezentanta tej grupy – kwasu palmitynowego. W tabeli 3.1 zestawiono natomiast obserwowane położenia pasm wraz z przypisaniem ich pochodzenia. Rys. 3.4. Widmo IR kwasu palmitynowego wraz z przypisanym położeniem pasm. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 104 Tabela 3.1. Zestawienie pasm widocznych na widmie IR kwasu palmitynowego (rys. 3.4) wraz z ich przypisaniem. Położenie pasma [cm-1] 698 772 940 Przypisanie δ(O-C=O) δ(CH2) δ(COH) 1098 1188 1228 1271 1293 1411 δ(CH2) δ(CH2) δ(CH2) ν(C-OH) ν(C-OH) δ(CH2) (drganie zginające) 1430 1463 2847 2914 2954 δ(COH) δ(CH2) (drganie nożycowe) νs(CH2) νas(CH2) νas(CH3) Jak widać, widmo kwasu palmitynowego jest bogate w sygnały zarówno w wysokim zakresie, jak i w obszarze odcisku palca. Szczególnie pasma z wysokiego zakresu charakteryzują się dużą intensywnością. Oczywiście, w spektroskopii IR, podobnie jak w spektroskopii RS możliwa jest identyfikacja obecności lipidów nienasyconych, a także estrów (w tym trójglicerydów oraz estrów cholesterolu). Szczególną K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 105 cechą spektroskopii IR, w kontekście tych ostatnich, jest możliwość identyfikacji i potwierdzenia obecności cholesterolu przy współobecności jego estrów. Na rysunku 3.5 przedstawiono widmo czystego cholesterolu oraz jego estru – oleininanu cholesterolu. Jak można zaobserwować, widma cholesterolu i jego estru różnią się istotnie. Przede wszystkim, na widmie oleinianu cholesterolu obecne jest pasmo pochodzące od drgania rozciągającego wiązanie estrowe C=O. Pasmo to będzie obecne na widmach wszystkich estrów, pozwalając na ich łatwe odróżnienie od widm czystych kwasów tłuszczowych. Jednakże w przypadku badania próbki, będącej mieszaniną czystego cholesterolu i jego estrów (lub też – cholesterolu i dowolnych estrów), istotne znaczenie dla jednoznacznego potwierdzenia obecności niezwiązanego cholesterolu ma fakt, iż na jego widmie widoczne jest pasmo nieobecne w przypadku widm jego estrów. Pasmo to jest położone przy ok. 1055 cm -1. W tabeli 3.2 zestawiono położenia pasm zaznaczonych na rysunku 3.5 wraz z ich przypisaniem. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 106 Rys. 3.5. Widma IR cholesterolu i oleinianu cholesterolu z zaznaczonymi pasmami charakterystycznymi dla: cholesterolu (niebieskie) i estrów (czerwone). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 107 Tabela 3.2. Zestawienie pasm widocznych na widmach IR cholesterolu i oleinianu cholesterolu (rys.3.5) wraz z ich przypisaniem. Położenie pasma [cm-1] Oleinian Cholesterol cholesterolu Przypisanie 1055 - - 1169 1464 1465 Pasmo markerowe cholesterolu Pasmo markerowe estrów cholesterolu δ(CH2) (drganie nożycowe) - 1737 ν (C=O) (estry) 2868 2885 νs(CH2) 2933 2930 νs(CH2) 3.3. Interpretacja widm IR - białka Kolejną grupą omawianych związków chemicznych są białka. Podobnie, jak w przypadku rozdziału dotyczącego interpretacji widm RS, również w spektroskopii IR możemy zidentyfikować 9 podstawowych pasm związanych z drganiami grup amidowych. Pasma te (pochodzenie oraz zakres ich występowania) zestawiono w tabeli 3.3. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 108 Tabela 3.3. Zestawienie zakresów występowania charakterystycznych pasm amidowych oraz ich pochodzenia w spektroskopii IR. Pasmo Położenie pasma (zakres) [cm-1] Amidowe A ~ 3300 Amidowe B ~ 3100 Amidowe I 1600 – 1700 Amidowe II 1480 – 1575 Amidowe III 1230 – 1300 Amidowe IV 625 – 770 Amidowe V 640 – 800 Amidowe VI 540 – 600 Amidowe VII ~ 200 Pochodzenie Drganie rozciągające N-H Drganie rozciągające N-H (ok. 80%) Drganie rozciągające C=O (40 – 60 %) Drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H* Drganie zginające O-C-N Drganie zginające** N-H Drganie zginające** C=O Drgania szkieletowe Spektroskopia IR doskonale nadaje się do określania struktury II-rzędowej białek. Szczególnie przydatne do tego celu są pasma amidowe I i II, pochodzące od drgań ugrupowań peptydowych. Ponieważ geometria grupy peptydowej zależy od struktury II-rzędowej, pasma te uważane są za markery owej struktury. W tabeli 3.4 zastawiono położenia pasm amidowych I i II w zależności K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 109 od struktury II-rzędowej białka. Tabela 3.4. Położenie pasm amidowych I i II w zależności od struktury II-rzędowej białka. Pasmo Pasmo amidowe I Pasmo amidowe II Położenie [cm-1] ~ 1695 ~ 1685 ~ 1650 Struktura IIrzędowa Antyrównoległa β-kartka α helisa ~ 1640 β-kartka ~ 1540 α helisa ~ 1550 β-kartka Poniżej przedstawiono przykłady widm IR (oraz ich drugich pochodnych) dla białek reprezentujących strukturę α, β oraz struktury mieszane – α+β i α/β. Rysunek 3.6 przedstawia widmo IR białka, reprezentującego grupę białek o strukturze α. Widmo to zostało wykonane w pastylce KBr. Jak widać, widmo IR – choć uboższe w pasma od widma RS – pozwala wyraźnie zaobserwować co najmniej trzy pasma amidowe. Pasmo amidowe I oraz II charakteryzują się znaczącą intensywnością. Ich położenia – odpowiednio przy 1659 i 1537 cm-1 – odpowiadają strukturze α. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 110 Rys. 3.6. Widmo IR albuminy wykonane w pastylce KBr. Na rysunku 3.7 przedstawiono widmo tego samego białka, jednak wykonane w trybie ATR (po uwzględnieniu korekty ATR) oraz drugą pochodną tego widma. Jak widać, położenia pasm różnią się nieznacznie. W dalszym ciągu pozostają jednak charakterystyczne dla struktury α. Co więcej, położenia pasm pozostają stałe również dla drugich pochodnych. Jednakże, zastosowanie drugich pochodnych pozwala na „rozdzielenie” sygnałów, które na widmie IR widoczne są jako pojedyncze pasmo. Przykładowo, w zakresie 1500 – 1700 cm-1 na widmie IR obserwujemy dwa pasma (amidowe I i II), podczas gdy na drugiej pochodnej widma, możliwe jest wyodrębnienie co najmniej 4 maksimów. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 111 Rys. 3.7. Widmo IR albuminy wykonane w trybie ATR oraz jego druga pochodna. Na rysunku 3.8 przedstawiono z kolei widmo IR (ATR) trypsyny – białka należącego do grupy β. Już z samego K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 112 widma odczytać można położenie pasma amidowego I charakterystyczne dla struktury β-kartki (1637 cm-1). Z drugich pochodnych widma można jednak oczytać znacznie więcej informacji. Przede wszystkim, oprócz zdecydowanie dominującej składowej pasma amidowego I położonej przy 1637 cm-1, widoczne są również niewielkie sygnały przy 1665 cm-1 i 1686 cm-1. Świadczą one o pewnej – niewielkiej – zawartości struktur α i β antyrównoległej. Widoczne również staję się położenie pasma amidowego II (1538 cm-1) oraz szereg innych sygnałów. Pochodzenie pasm, widocznych na rysunku 3.8 przedstawiono w tabeli 3.5. Tabela 3.5. Zestawienie położenia pasm wraz z ich przypisaniem dla widm (drugich pochodnych) trypsyny (rys. 3.8). Położenie pasma [cm-1] 1686 β – kartka antyrów 1665 α helisa 1637 β – kartka Przypisanie Pasmo amidowe I 1538 Pasmo amidowe II 1518 Tyrozyna 1453 δ (CH2 ,CH3) 1389 νs(COO-) 1235 Pasmo amidowe III K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 113 Rys. 3.8. Widmo IR trypsyny wykonane w trybie ATR oraz jego druga pochodna. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 114 Na rysunku 3.9 przedstawiono widma dwóch białek o strukturze mieszanej: proteinazy (zaliczanej do grupy białek α/β) oraz papainy (należącej do grupy α+β). Jak widać, położenia pasm amidowych różnią się między tymi dwoma widmami. Są to jednak różnice nieznaczne. Dla proteinazy, położenie pasma amidowego I sugeruje dominujący udział struktury β. Z kolei położenie pasma amidowego II wydaje się być bliższe położeniu charakterystycznemu dla struktury α. W przypadku papainy natomiast pasmo amidowe I położone jest dokładnie pomiędzy położeniem charakterystycznym dla struktury α i struktury β. Świadczy to o obecności obu tych struktur w cząsteczce. Dokładniejszych informacji o strukturze II-rzędowej analizowanych białek dostarczyć mogą drugie pochodne widm, zaprezentowane na rysunku 3.10. W przypadku obu analizowanych białek pasmo amidowe I jest stosunkowo szerokie. Jego maksimum znajduje się w pozycji ok. 1638 cm-1, co świadczy o dużym udziale struktury β-kartki. Co więcej, widoczny jest również niewielki sygnał, odpowiadający strukturze antyrównoległej β-kartki. Szerokość pasm, oraz obecność pasma amidowego II w położeniu ~1540 cm-1 potwierdza obecność również struktury α helisy. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 115 Rys. 3.9. Widma IR białek mieszanych: proteinazy (α/β) oraz papainy (α+β) wykonane w trybie ATR. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 116 Rys. 3.10. Drugie pochodne widm IR białek mieszanych: proteinazy (α/β) i papainy (α+β) wykonane w trybie ATR. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 117 3.4. Interpretacja widm IR - węglowodany Absorpcyjna spektroskopia w podczerwieni pozwala również na badanie grupy węglowodanów. Na rysunku 3.11 przedstawiono przykładowe widmo oraz jego drugą pochodną dla D-glukozy. Jak widać, widmo to cechuje się dużym bogactwem sygnałów. Profil spektralny pasm w wysokim zakresie jest charakterystyczny dla cukrów. Pasma występujące w tym zakresie są zazwyczaj związane z drganiami grup N-H lub O-H. W przypadku węglowodanów bogactwo grup OH w strukturze cząsteczki powoduje wystąpienie charakterystycznego, szerokiego pasma w wysokim zakresie. Porównując wyłącznie kształt pasm w wysokim zakresie (profil widma) możliwe jest szybkie rozróżnienie węglowodanów, lipidów i białek. W tabeli 6 zestawiono położenia pasm zaznaczonych na rysunku 3.11 wraz z ich przypisaniem. Na rysunku 3.11 przedstawiono również drugą pochodną widma D-glukozy. Widmo to zawiera szereg pasm w zakresie odcisku palca, stanowiące w większości złożenia różnych drgań (tabela 3.6). Stanowi ono bardzo dobry przykład, ilustrujący zasadność i ułatwienie interpretacji widm IR poprzez drugie pochodne. Przykładowo, pasmo zaznaczone na widmie kolorem czerwonym (~616 cm-1), jest w rzeczywistości złożeniem co najmniej dwóch pasm, co pokazują wyraźnie drugie pochodne (obszar zaznaczony kolorem czerwonym na drugiej pochodnej widma). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 118 Tabela 3.6. Zestawienie położenia pasm wraz z ich przypisaniem dla widm D-glukozy (rys. 3.11). Położenie [cm-1] Przypisanie 616 CH2 775 δ(CCO) + δ(CCH) 838 δ(CH) 913 ν(CO)+ ν(CCH) 994 ν(CO)+ ν(CC) 1121 ν(CO) 1110 ν(CO) 1146 ν(CO)+ ν(CC) 1339 δ(CCH) + δ(OCH) 1380 δ(OCH)+ δ(COH)+ δ(CCH) 1453 δ (CH2)+ δ(OCH)+ δ(CCH) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 119 Rys. 3.11. Widmo IR D-glukozy wraz z jego drugą pochodną. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 120 3.5. Interpretacja widm IR - układy złożone Użyczeczność spektroskopii IR jest nieoceniona w zakresie badania układów złożonych. Przykładem takich układów mogą być materiały biologiczne. Na ich widmach obserwować będzie można sygnały pochodzące od wszystkich grup związków omówionych w niniejszym rozdziale. Podczas interpretacji, szczególnie przydatne okazują się drugie pochodne widma. Na rysunku 3.12 przedstawiono przykłady drugich pochodnych widm pochodzących z tkanek: mózgu oraz wątroby. Przedstawione widma różnią się dość znacząco. W przypadku mózgu wyraźnie intensywniejsze jest pasmo położone przy ok. 1731 cm-1, co świadczy o wyższej zawartości lipidów (w formie estrów). Są one również obecne w wątrobie, jednak w mniejszej zawartości. Co więcej, w przypadku mózgu pojawia się wyraźnie pasmo położone przy ok. 1059 cm-1, świadczące o obecności cholesterolu w formie niezwiązanej. W przypadku mózgu położenie pasma amidowego I oraz amidowego II wyraźnie wskazuje na dominujący udział struktury α białek budujących tkankę. W przypadku wątroby natomiast pasmo amidowe I przesunięte jest nieco w kierunku wyższych wartości liczb falowych. Co więcej, widoczne jest niewielkie ramię pasma, przy ok. 1685 cm -1, wskazujące na obecność również struktury β-antyrównoległej. Podobnie, położenie pasma amidowego II sugeruje obecność również białek w formie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 121 β-kartki. W tabeli 3.7 zestawiono położenia pasm obserwowanych na rysunku 3.12 wraz z ich przypisaniem. Tabela 3.7. Zestawienie położeń pasm wraz z ich przypisaniem dla drugich pochodnych widm mózgu i wątroby przedstawionych na rysunku 3.12. Położenie pasma [cm-1] Mózg Wątroba Przypisanie 1056 - Cholesterol - 1085 s(PO2-): fosfolipidy, kwasy nukleinowe 1241 1238 as(PO2-): fosfolipidy, kwasy nukleinowe, proteiny 1452 1451 δ(CH2) 1540 1546 Pasmo amidowe II 1651 1657 Pasmo amidowe I - 1686 Pasmo amidowe I (struktura β antyrównoległa) 1731 1740 ν (C=O), estry K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 122 Rys. 3.12. Drugie pochodne widma IR dla tkanki mózgu i wątroby. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 123 4 Spektroskopia UV-Vis 4.1. Wstęp W spektroskopii UV-Vis wykorzystuje się absorpcję promieniowania. Jest to metoda oparta na pomiarze stosunku natężeń lub absorbancji będącej funkcją tego stosunku, dwóch wiązek promieniowania w funkcji długości fali. Warunkiem wystąpienia absorpcji jest odpowiednia energia promieniowania padającego, która odpowiada różnicy energii poziomów elektronowych danej cząsteczki. Do zmiany w rozmieszczeniu elektronów w cząsteczce wymagana jest energia wynosząca kilka elektronowoltów. Emitowane, bądź absorbowane fotony K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 124 w czasie takiej zmiany, pochodzą z części widzialnej widma (obejmującego długość fali od 380 – 780 nm) lub z zakresu nadfioletowego (poniżej 380 nm). Dla próbek stałych oraz ciekłych obserwuje się szerokie pasma z uwagi na zlewanie się poszczególnych linii, z kolei dla próbek gazowych obserwuje się oscylacyjną strukturę widma. Przejście elektronowe polega na wzbudzeniu elektronu ze stanu podstawowego do stanu wzbudzonego, posiadającego wyższą energię. Wyróżniamy kilka typów przejść elektronowych: przejście typu charge-transfer, które polega na przeniesieniu elektronu z jednej cząsteczki na niezapełniony orbital drugiej cząsteczki; pierwsza cząsteczka pełni rolę donora, a druga akceptora elektronów; występują przejścia elektronu z ligandu na orbital typu d atomu centralnego (LMCT), bądź odwrotne przejście (MLCT), przejścia pomiędzy metalami (MMCT) oraz pomiędzy ligandami (LLCT), a także pomiędzy metalem a rozpuszczalnikiem (MSCT), bądź odwrotne (SMCT); istnieje również przejście pomiędzy parami jonowymi (IPCT); przejście typu d-d, które jest charakterystyczne dla związków kompleksowych metali, należących do bloku d układu okresowego pierwiastków; rozszczepienie poziomów w kompleksach K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 125 o symetrii oktaedrycznej jest niewielkie, a przejścia tego typu obserwowane są w zakresie widzialnym widma; rozszczepienie orbitali typu d jest odpowiedzialne za powstawanie barwy związków kompleksowych, w zależności od tego, jaki będzie stopień rozszczepienia orbitali różne będą barwy związków, gdyż różna będzie wartość energii przejść d-d; przejścia w związkach organicznych: z orbitalu σ na σ* oraz z orbitalu n na σ* wymagają znacznych energii, stąd pasma będą występowały w zakresie dalekiego ultrafioletu; przejścia z orbitalu π na π* oraz z orbitalu n na π* wymagają do przejścia mniejszej energii, i dlatego pasma będą obserwowane przy dłuższej długości fali niż w przypadku przejść na antywiążący orbital σ*. Istotne z punktu widzenia interpretacji widm jest zjawisko solwatochromizmu, które polega na zmianie położenia pasma w zależności od polarności rozpuszczalnika. Rozpuszczalniki polarne charakteryzują się znacznym momentem dipolowym, z kolei rozpuszczalniki niepolarne mają niewielki moment dipolowy. Wraz ze zmianą rozpuszczalnika ulegają przesunięciu pasma typu charge-transfer. Dla tego K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 126 samego związku, rozpuszczonego w różnych rozpuszczalnikach, będą posiadały pasma absorpcji przy różnej długości fali. W przypadku rozpuszczalnika mniej polarnego pasmo będzie przesunięte w stronę większej długości fali (mniejszej energii). Widma w fazie stałej wykonuje się przy użyciu BaSO4 metodą odbiciową (refleksyjną). W technikach refleksyjnych, jako miarę absorpcji promieniowania, wykorzystywane są wielkości, które stanowią analogi do absorbancji i transmitancji – tak zwaną reflektancję, bądź jej ujemny logarytm (wzory 4.1, 4.2). Reflektancja podaje stosunek intensywności promieniowania odbitego od próbki (I) do intensywności promieniowania padającego (I0): 𝑅= 𝐼 (4.1) 𝐼0 𝐼 − log(𝑅) = 𝑙𝑜𝑔 ( 𝐼0 ) (4.2) Promieniowanie, które pada na powierzchnię próbki wnika do jej wnętrza, a następnie ulega wielokrotnemu odbiciu oraz osłabieniu i opuszcza próbkę pod innym kątem. Równanie Kubelki – Munka często wykorzystywane jest w pomiarach widm elektronowych w fazie stałej i podaje zależność intensywności promieniowania rozproszonego K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 127 (w postaci reflektantcji R) od stężenia (c) i molowego współczynnika absorbcji (ε): (1−𝑅)2 2𝑅 = 𝑐 𝜀 (4.3) 4.2. Interpretacja widm UV-Vis – związki nieorganiczne Na początku omówione zostaną widma elektronowe w fazie stałej oraz w roztworze dla cyjanowych kompleksów molibdenu(IV) z ligandami organicznymi. Na rysunku 4.1 zaprezentowane zostało widmo dla kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O rozpuszczonego w wodzie. Z przedstawionego widma można odczytać maksymalną wartość absorbancji dla danej długości fali i wyznaczyć stężenie badanego związku, korzystając z prawa Lamberta-Beera (wzór 4.4). ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 128 Rys. 4.1. Zależność absorbancji od długości fali dla kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O rozpuszczonego w wodzie. 𝐴=𝜀∙𝑑∙𝑐 (4.4) gdzie: 𝐴 − absorbancja (wartość absobrancji dla pasma przy długości fali λ = 596 nm → 𝐴 = 0,272) 𝜀 − molowy współczynnik absorpcji (𝜀 = 45,8 dm3/(mol·cm)) 𝑑 − grubość kuwety (d = 1 cm) 𝑐 − stężenie roztworu [mol/dm3] Wstawiając podane dane do stężenie wzoru 4.4 otrzymujemy: przekształconego na K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 129 𝑐= 𝐴 = 𝜀∙𝑑 0,272 𝑚𝑜𝑙 = 5,94 ∙ 10−3 3 𝑑𝑚 𝑑𝑚3 45,8 ∙ 1𝑐𝑚 𝑚𝑜𝑙 ∙ 𝑐𝑚 Absorpcja przy tej długości fali odpowiada przejściu typu d-d. Badany kompleks posiada symetrię oktaedryczną w związku z tym przejście to zabronione jest regułami wyboru, konkretnie regułą Laporte’a, w której przejścia parzyste oraz nieparzyste (czyli g → g i u → u) są niedozwolone. Obserwowane jest ono ze względu na sprzężenie wibronowe (oddziaływanie pomiędzy elektronowymi i jądrowymi ruchami cząsteczek). Na rysunku 4.2 zamieszczono widma wykonane dla kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O po dodaniu 1,10fenantroliny w odstępach czasowych. Rys. 4.2. Zależność absorbancji od długości fali dla kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O z 1,10-fenantroliną w czasie. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 130 Na widmie można zaobserwować, że pod wpływem dodania 1,10-fenantroliny do roztworu kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O pasmo uległo przesunięciu od około 596 nm do około 455 nm. Ponadto wraz z upływem czasu nastąpił wzrost absorbancji. Można przypuszczać, iż przesunięcie jest wynikiem wymiany ligandów w kompleksie K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O i powstawaniem kompleksu, w którym 1,10-fenantrolina występuje jako ligand. Reakcja wymiany zachodzi zgodnie ze stałymi tworzenia tych dwóch kompleksów. Zwiększenie intensywności pasma absorpcji wskazuje na postępujący proces wymiany ligandów w stronę zwiększenia stężenia kompleksu z 1,10-fenantroliną. W tabeli 4.1 zamieszczono długość fali, przy której obserwowane jest pasmo dla kompleksów [Mo(CN)4O2]4oraz [Mo(CN)3O(phen)]- wraz z przypisaniem typu przejścia elektronowego. Tabela 4.1. Obserwowane przejścia elektronowe dla badanych kompleksów. Wzór jonu kompleksowego Długość fali [nm] Typ przejścia elektronowego [Mo(CN)4O2]4- 596 d-d spinowo zabronione [Mo(CN)3O(phen)]- 455 charge-transfer W celu porównania przejść typu d-d z przejściami typu charge-transfer wykonano rysunek 4.3, na którym K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 131 zamieszczono widma obydwu kompleksów. Rys. 4.3. Zależność absorbancji od długości fali dla badanych kompleksów. Widać wyraźną różnicę między tymi dwoma widmami. Przejawia się ona przede wszystkim w położeniu pasma oraz w jego intensywności. Przejścia typu d-d są mniej intensywne niż przejścia typu charge-transfer. Leżą one w zakresie około 590 nm, z kolei CT w rejonie około 450 nm. Szerokość pasma dla kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O jest większa niż dla kompleksu podstawionego 1,10-fenantroliną. Dla przejść typu charge-transfer można zaobserwować zjawisko solwatochromizmu, Na rysunku 4.4 zamieszczono otrzymane widma kompleksu [Mo(CN)3O(phen)]- w różnych rozpuszczalnikach. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 132 Rys. 4.4. Zależność absorbancji od długości fali dla roztworu kompleksu [Mo(CN)3O(phen)] w różnych rozpuszczalnikach (MeCN – acetonitryl, DMSO – dimetylu sulfotlenek, EtOH – etanol, MeOH – metanol). Można zauważyć, że wraz ze zmianą rozpuszczalnika następuje przesunięcie pasm, co jest zgodne z efektem solwatochromowym. Ściślej rzecz ujmując zaobserwowano efekt batochromowy, względem rozpuszczalnika, jakim jest woda, ponieważ w miarę zmniejszania się polarności rozpuszczalników maksima pasm absorpcyjnych uległy przesunięciu w kierunku fal dłuższych (mniejszych energii). W celu wyznaczenia rodzaju przejść typu chargetansfer (CT) dla kompleksu Mo(CN)3O(phen)]- w różnych rozpuszczalnikach, należy obliczyć energię dla długości fali, przy której zaobserwowano maksimum pasma, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 133 korzystając ze wzoru 4.5. Wyniki obliczeń zestawione zostały w tabeli 4.2. Następnie należy wykonać wykresy zależności energii od liczby akceptorowej (rysunek 4.5) oraz liczby donorowej (rysunek 4.6). 𝑐 ∆𝐸 = ℎ ∙ ʋ = ℎ ∙ 𝜆 (4.5) gdzie: ∆𝐸 − energia przejścia [J] ℎ − stała Plancka (6,626 · 10-34 J·s) ʋ − częstotliwość promieniowania [1/s] 𝑐 − prędkość światła (2,9979 · 108 m/s) 𝜆 − długość fali elektromagnetycznej [m] Tabela 4.2. Wyznaczone wartości energii dla poszczególnych pasm odpowiednich rozpuszczalników. Długość Energia Liczba Liczba Rozpuszczalnik fali -19 E [10 J] akceptorowa donorowa λ [nm] H2O 453 4,38 54,8 18,0 MeOH EtOH MeCN DMSO 499 506 530 535 3,99 3,93 3,75 3,72 41,3 37,1 18,9 19,3 19,0 20,0 14,1 29,8 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 134 4,5 4,4 4,3 E [10 -19J] 4,2 4,1 4,0 3,9 3,8 3,7 3,6 17 22 27 32 37 42 47 52 57 liczba akceptorowa Rys. 4.5. Zależność energii od liczby akceptorowej. 4,5 4,4 E [10 -19J] 4,3 4,2 4,1 4,0 3,9 3,8 3,7 3,6 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 liczba donorowa Rys. 4.6. Zależność energii od liczby donorowej. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 135 Analizując otrzymane wykresy można zauważyć, iż dla zależności energii od liczby akceptorowej można wyznaczyć w przybliżeniu zależność liniową. Nie da się tego wykonać dla drugiego wykresu. Na podstawie rysunku 4.5 można stwierdzić, iż wraz ze wzrostem kwasowości Lewisa pasmo ulega przesunięciu w kierunku wyższych energii (krótszych długości fal). W związku z tym wszystkie rozpuszczalniki wykazują efekt hipsochromowy. W przypadku drugiej zależności (rysunek 4.6) trudno jest wyznaczyć jakąkolwiek zależność położenia pasma absorpcji od zasadowości Lewisa. Z otrzymanych wyników można również wyciągnąć wniosek, iż przebadane rozpuszczalniki charakteryzują się zdolnościami akceptorowymi - zachowują się jak kwasy, zgodnie z teorią Lewisa (w danych warunkach reakcji przyjmują elektron). W związku z tym przeniesienie elektronu następuje od metalu (molibdenu) do liganda (1,10-fenantroliny), jest to więc przejście typu MLCT (metal to ligand charge-transfer). *** Kolejny ze związków otrzymano w wyniku reakcji kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O z 2,3-dicyjanopirazyną. Reakcja syntezy związku kompleksowego [PPh4]2[Mo(CN)3O(pz{COO}{CONH2})]·2H2O, którego wzór anionu zaprezentowano na rysunku 4.7, przebiega poprzez częściową hydrolizę liganda 2,3K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 136 dicyjanopirazynowego. Grupy nitrylowe ulegają hydrolizie, jednak tylko jedna ze wspomnianych grup (nieskoordynowana do molibdenu) przekształca się w grupę karboksylową. Drugi podstawnik nitrylowy ulega częściowej hydrolizie do amidu. 2- Rys. 4.7. Struktura anionu [Mo(CN)3O(pz{COO}{CONH2})] . Atomy wodoru zostały pominięte dla przejrzystości. Dla uzyskanego kompleksu wykonano widma elektronowe w dwóch rozpuszczalnikach organicznych – etanolu oraz acetonitrylu oraz widmo w fazie stałej przy użyciu BaSO4. Poszczególne widma zaprezentowano na rysunkach 4.8. oraz 4.9. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 137 Rys. 4.8. Widmo UV-VIS dla uzyskanego kompleksu Mo(IV) w etanolu (linia czarna) oraz acetonitrylu (linia czerwona). Rys. 4.9. Widmo elektronowe w fazie stałej dla uzyskanego kompleksu Mo(IV) po transformacji Kubelki-Munk'a. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 138 W badanym związku powinny występować cztery typy przejść elektronowych: pasma związane z przejściami w obrębie liganda; przejścia typu charge-transfer pomiędzy molibdenem a ligandami nieorganicznymi oraz ligandem organicznym (typu metal-ligandcharge-transfer – MLCT); przejścia typu charge-transfer pomiędzy ligandami nieorganicznymi oraz ligandem organicznym a molibdenem (typu ligand to metal charge-transfer – LMCT); przejścia typu d-d. W części widzialnej można zaobserwować intensywne pasma charge-transfer (MLCT), natomiast w części ultrafioletowej następuje nałożenie pasm liganda z pasmami jonu kompleksowego (typu LMCT), co utrudnia ich interpretację. Biorąc pod uwagę relatywnie mniejszą intensywność pasm LMCT, obserwowane pasma są głównie powiązane z ligandem (pz{COO}{CONH2}). Ich pozycje są przesunięte ze względu na koordynację, jak i nakładanie się na pasma LMCT. Pasma typu d-d widoczne są jedynie na widmie refleksyjnym (na rysunku 4.8. mają słabą intensywność i są trudno zauważalne), jako przegięcie przy ok. 700 nm K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 139 i nałożone są na pasma MLCT, widoczne przy ok. 500 nm. Pasma MLCT dla kompleksów Mo(IV) charakteryzują się silnym solwatochromizmem - w zależności od zastosowanego rozpuszczalnika położenie tych pasm ulega zmianie. Podobny efekt solwatochromowy obserwuje się w przypadku otrzymanego kompleksu, przykładowo w etanolu widoczne jest maksimum przy długości fali 506 nm, natomiast w acetonitylu przy długości 493 nm. Pasma jednakże nie są zbyt czułe na zmianę rozpuszczalnika, w przeciwieństwie do innych jonów typu [Mo(CN)3O(LL)]n-. *** Kolejny związek kompleksowy, dla którego zostaną omówione widma elektronowe wykonane w roztworze oraz w fazie stałej, otrzymano w wyniku reakcji kompleksu K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O z 2-(aminometylo)pirydyną (wzór anionu kompleksowego zaprezentowano na rysunku 4.10). ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 140 - Rys. 4.10. Struktura anionu [Mo(CN)3O(ampy)] (ampy = 2(aminometylo)pirydyna). Atomy wodoru zostały pominięte dla przejrzystości. Widmo elektronowe w fazie stałej przedstawiono na rysunku 4.11 z kolei widma w roztworze zaprezentowano na rysunku 4.12. W trakcie pomiarów wykorzystano szeroką gamę rozpuszczalników organicznych (polarnych oraz niepolarnych) w celu przypisania pasm do odpowiedniego typu przejścia oraz zobrazowania zjawiska solwatochromizmu. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 141 Rys. 4.11. Widmo elektronowe w fazie stałej dla [Mo(CN)3O(ampy)] po transformacji Kubelki-Munk'a. - W części widzialnej widma refleksyjnego, przedstawionego na rysunku 4.11, można zaobserwować dobrze wykształcone pasmo charge-transfer (MLCT) przy długości fali 414 nm. Widoczne jest również szerokie pasmo w rejonie 657 nm, które można przypisać do pasma typu d-d. Takie przypisanie jest potwierdzone widmami zmierzonymi dla roztworów preparatu, gdyż pasmo przy 657 nm jest bardzo słabo intensywne. Intensywne z kolei są pasma MLCT zlokalizowane w zakresie 390 – 439 nm widoczne na rysunku 4.12. Pasma te dla kompleksów Mo(IV) charakteryzują się silnym solwatochromizmem - w zależności od K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 142 zastosowanego rozpuszczalnika położenie tych pasm ulega zmianie. Maksima poszczególnych pasm przesuwają się w stronę krótszych długości fal (wyższych energii) wraz ze wzrostem polarności rozpuszczalnika, co jest związane z oddziaływaniami donorowoakceptorowymi oraz tworzeniem wiązań wodorowych pomiędzy ligandami a rozpuszczalnikiem. - Rys. 4.12. Widmo elektronowe w roztworach dla [Mo(CN)3O(ampy)] (Me2CO – aceton, DMF – dimetyloformamid, DMSO – dimetylu sulfotlenek, EtOH – etanol, MeCN – acetonitryl, MeOH – metanol, AmOH – alkohol amylowy/pentan-1-ol, 1-BuOH – butan-1-ol, CHCl3 – chloroform, C2H4Cl2 – dichloroetan, CH2Cl2 – dichlorometan, 2-PrOH – propan-2-ol, t-BuOH – tert-butanol). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 143 Widma elektronowe w roztworach badanych rozpuszczalników nie wykazują istotnych zmian w czasie, co świadczy o stabilności preparatu w badanych rozpuszczalnikach. Przykładowe widmo w acetonitrylu zaraz po przygotowaniu roztworu oraz po 45 minutach przedstawiono na rysunku 4.13. - Rys. 4.13. Widmo elektronowe dla [Mo(CN)3O(ampy)] w acetonitrylu w czasie. Dla lepszego zobrazowania zjawiska solwatochromizmu w badanym kompleksie, sporządzony został wykres zależności liczby falowej od parametru Reichardta ET (rysunek 4.14). Dane potrzebne do sporządzenia wykresu zamieszczone zostały w tabeli 4.3. Pominięto K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 144 dwa rozpuszczalniki – wodę oraz alkohol amylowy ze względu na słabą rozpuszczalność kompleksu w tych rozpuszczalnikach i związany z tym brak możliwości dokładnego wyznaczenia położenia pasma MLCT. Tabela 4.3. Położenia pasma MLCT w kompleksie [Mo(CN)3O(ampy)] oraz parametr ET rozpuszczalnika. Rozpuszczalnik λ [nm] ET [kcal∙mol-1] CHCl3 431 39,1 CH2Cl2 424 41,1 C2H4Cl2 426 41,9 Me2CO 439 42,2 DMF 435 43,8 t-BuOH 419 43,9 DMSO 427 45,0 MeCN 418 46,0 2-PrOH 410 48,6 1-BuOH 409 50,2 EtOH 396 51,9 MeOH 390 55,5 - Na wykresie (rysunek 4.14) zamieszczone zostały trzy grupy rozpuszczalników: hydroksylowe, niehydroksylowe i halogenki alkilów. Do każdej z tych grup uzyskuje się K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 145 różne nachylenia krzywych korelacyjnych. Podobne zależności można zauważyć dla innych kompleksów typu [Mo(CN)3O(LL)]n- i świadczą one o specyficznym oddziaływaniu rozpuszczalnika z ligandami. Rys. 4.14. Wykres zależności liczby falowej od ET dla kompleksu [Mo(CN)3O(ampy)] . *** Ostatni z cyjanowych kompleksów molibdenu, dla którego omówione zostaną widma elektronowe, został otrzymany w wyniku syntezy K3Na[Mo(CN)4O2]·6H2O z aminoetanolem. Wzór anionu kompleksowego przedstawiono na rysunku 4.15. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 146 2- Rys. 4.15. Struktura jonu [Mo(CN)4O(amet)] (amet = aminoetanol). Atomy wodoru zostały pominięte dla przejrzystości. Widma elektronowe w fazie stałej i w roztworze zostały przedstawione kolejno na rysunkach 4.16 oraz 4.17. Rys. 4.16. Widmo elektronowe w fazie stałej dla kompleksu 2[Mo(CN)4O(amet)] po transformacji Kubelki-Munk'a. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 147 Rys. 4.17. Widma elektronowe w roztworach dla kompleksu 2[Mo(CN)4O(amet)] (DMSO – dimetylu sulfotlenek, EtOH – etanol, MeOH – metanol). Na widmie wykonanym w fazie stałej (rysunek 4.16) widoczne są pasma przy długości fali: 273, 350, 510, 664 oraz 769 nm. Pasmo o najwyższej energii pochodzi od kationu tetrafenylofosfoniowego (PPh4), pasmo przy 350 nm można przypisać skoordynowanemu aminoetanolowi i pasmom typu charge-transfer kompleksu. W zakresie widzialnym obserwowane przejścia przypisuje się, dla kompleksów tetracyjanowych, wyłącznie przejściom typu d-d. Obecność trzech pasm w tym zakresie wskazywać może na niską symetrię kompleksu. Obecność niskoenergetycznego pasma przy 769 nm sugeruje całkowite zniesienie degeneracji orbitali t2g K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 148 w zdeformowanym oktaedrze, co skutkować może pojawieniem się niskoenergetycznego przejścia elektronowego. Widma elektronowe w roztworze (rysunek 4.17) wykonane zostały w trzech rozpuszczalnikach – etanolu, metanolu oraz DMSO. Charakteryzują się one nietypową liczbą oraz położeniem pasm. Analiza widm pokazuje, że następuje rozkład związku kompleksowego, uwolnienie 2-aminoetanolu i koordynacja rozpuszczalnika. W przypadku widma wykonanego w metanolu pojawia się pasmo w rejonie 613 nm, które jest charakterystyczne dla jonu [M(CN)4O(H2O)]2- (M = W lub Mo). 4.3. Interpretacja widm UV-Vis – związki organiczne Wiązania wielokrotne węgiel-węgiel Dla izolowanego wiązania podwójnego węgiel-węgiel pasmo absorpcyjne występuje przy ok. 180 nm, co jest wynikiem przejścia elektronowego π→π*. W tym przypadku grupy alkilowe powodują niewielkie batochromowe przesunięcie tego pasma, wskutek czego czteropodstawione acykliczne alkeny absorbują przy ok. 200 nm. Przybliżone położenia pasm absorpcji izolowanych wiązań wielokrotnych między atomami węgla przedstawiono w tabeli a) w podrozdziale 7.4. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 149 Warto zwrócić uwagę, że również izolowanemu wiązaniu potrójnemu węgiel-węgiel odpowiada pasmo przy ok. 180 nm – dla etynu λmax = 173 nm. Co więcej, obecność grup alkilowych powoduje przesunięcie maksimum absorpcji w kierunku fal dłuższych. Z kolei sprzężenie wiązań podwójnych węgiel-węgiel prowadzi do znacznych zmian wartości λmax oraz molowego współczynnika aborpcji. Ponadto, wraz ze wzrostem liczby sprzężonych wiązań podwójnych obserwuje się systematyczne, batochromowe przesunięcie pasma, co przedstawiono w tabeli b) w podrozdziale 7.4. Warto zauważyć, że podstawniki alkilowe, związane z atomem węgla, tworzącym wiązanie wielokrotne, przesuwają maksimum absorpcji o stałą wartość równą 5 nm. Podobnie sprzężenie wiązania potrójnego węgiel-węgiel z innymi wiązaniami potrójnymi (poliyny) lub podwójnymi (polienyny) prowadzi do stopniowego przesuwania się maksimum absorpcji w kierunku fal dłuższych. Jeśli chodzi o układy acykliczne, to położenie omawianego pasma absorpcyjnego często ma tzw. „wartość diagnostyczną” przy określaniu liczby wiązań wielokrotnych układu sprzężonego. Podstawą do sformułowania zbioru empirycznych reguł, na podstawie których można przewidzieć położenie maksimum absorpcji dla podstawionych dienów sprzężonych, jest regularność zmian maksimum absorpcji, spowodowanych zmianą liczby sprzężonych wiązań podwójnych oraz stopień podstawienia i geometria układu K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 150 sprzężonego. Jeżeli możliwe są dwie izomeryczne struktury związku, to porównanie wartości λmax obliczonej o eksperymentalnie wyznaczone wartości, może ułatwić przypisanie badanej cząsteczce właściwej budowy. W tabeli 4.4 przedstawiono tzw. reguły FieseraWoodwarda dotyczące absorpcji promieniowania przez cząsteczki zawierające dienowy układ sprzężony: Tabela 4.4. Reguły Fiesera-Woodwarda dotyczące absorpcji promieniowania przez cząsteczki zawierające dienowy układ sprzężony. dien heteroannularny lub dien dien homoannularny poprawki dla: wiązania podwójnego przedłużającego sprzężenie grupy alkilowej lub fragmentu pierścienia wiązania podwójnego egzocyklicznego ugrupowań polarnych: OCOCH3 ugrupowań polarnych: OR ugrupowań polarnych: SR ugrupowań polarnych: Cl, Br ugrupowań polarnych: -NR2 wpływu rozpuszczalnika λmax [nm] 214 253 30 5 5 0 6 30 5 60 0 suma=λmax obl. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 151 Podczas formułowania reguł przedstawionych w tabeli 4.4, dotyczących dienów cyklicznych, wzięte jest pod uwagę to, czy dieny są heteroannularne, czy homoannularne, np.: Ponadto przyjęto, że podstawowa wartość λmax dla dienu heteroannularnego wynosi 214 nm, a dla homoannularnego 253 nm. Do wartości tych dodaje się przedstawione w tabel 4.4 poprawki, właściwe dla występujących w związku podstawników i innych cech strukturalnych. Jeśli w cząsteczce występują jednocześnie chromofory homoannularne i heteroannularne i są one ze sobą sprzężone, to do obliczeń przyjmuje się wartość λmax dla układu homoannularnego i do tej wartości dodaje się odpowiednią poprawkę, traktując układ heteroannularny, jako przedłużenie układu sprzężonego. Należy także zauważyć, że w przypadku pierścieniowych dienów homoannularnych o pierścieniach innych niż sześcioczłonowe, nie uzyskuje się zadawalającej zgodności pomiędzy obliczonymi a eksperymentalnymi wartościami λmax. Warto zwrócić uwagę, że przedstawione reguły są K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 152 słuszne dla dienów acyklicznych i heteroannularnych, ale tylko wówczas, gdy struktura geometryczna nie utrudnia płaskiego ułożenia układu wiązań σ, co związane byłoby z ograniczeniem stopnia nakładania się orbitali π. *** Grupa karbonylowa W przypadku acetonu w roztworze cykloheksanu, na widmie występują dwa pasma absorpcyjne – jedno występuje przy 190 nm i odpowiada przejściu π→π*, a drugie pasmo przy 280 nm odpowiada przejściu n→π*. Należy zdawać sobie sprawę, iż położenie tych pasm zależy od rozpuszczalnika. Z kolei w widmach UV nasyconych aldehydów, kwasów karboksylowych i estrów występuje podobny układ pasm absorpcyjnych i dlatego znaczenie w interpretacji widm jest nieznaczne. Warto zwrócić uwagę, że sprzężenie grupy karbonylowej z podwójnym wiązaniem węgiel-węgiel w istotny sposób zmienia układ pasm absorpcyjnych. W przypadku widm prostych enonów pasmo absorpcyjne, odpowiadające wzbudzeniu elektronu z orbitalu π wiązania węgiel-węgiel na antywiążący orbital grupy karbonylowej – tzw. pasmo przeniesienia elektronu (pasmo E.T.), występuje w zakresie: 220 – 250 nm. Ponadto, obserwuje się pasmo o niewielkiej intensywności w zakresie 310 - 330 nm, które odpowiada przejściu n→π* K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 153 w grupie karbonylowej. Należy zauważyć, że położenie pasma przeniesienia elektronu zależy m. in. od długości układu sprzężonego oraz stopnia podstawienia i można je wyznaczyć, stosując analogiczne reguły, podobne do wcześniej podanych do przewidywania położenia charakterystycznych pasm dienów sprzężonych. Zestaw reguł przedstawiono w tabeli 4.5. W przypadku enonów acyklicznych oraz enonów cyklicznych sześcioczłonowych za wartość podstawową λmax przyjmuje się 215 nm, a dla α,β-nienasyconych aldehydów – 207 nm. Jako układy enonów przyjmuje się: Tabela 4.5. Reguły Fiesera-Woodwarda promieniowania przez cząsteczki enonów. dotyczące absorpcji λmax [nm] Enon acykliczny lub cykliczny sześcioczłonowy Enon cykliczny pięcioczłonowy aldehyd α,β-nienasycony poprawki dla: wiązania podwójnego przedłużającego sprzężenie grupy alkilowej lub fragmentu pierścienia w pozycji: 215 202 207 30 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 154 α β γ i dalszych ugrupowań polarnych: -OH, w pozycji α ugrupowań polarnych: -OH, w pozycji β ugrupowań polarnych: -OH, w pozycji γ ugrupowań polarnych: -OCOCH3, w pozycji α, β, γ ugrupowań polarnych: -OCH3, w pozycji α ugrupowań polarnych: -OCH3, w pozycji β ugrupowań polarnych: -OCH3, w pozycji γ ugrupowań polarnych: -OCH3, w pozycji δ ugrupowań polarnych: -Cl, w pozycji α ugrupowań polarnych: -Cl, w pozycji β ugrupowań polarnych: -Br, w pozycji α ugrupowań polarnych: -Br, w pozycji β ugrupowań polarnych: -NR2, w pozycji β wiązania podwójnego egzocyklicznego układu homodienowego 10 12 18 35 30 50 6 35 30 17 31 15 12 25 30 95 5 39 suma=λmax obl. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 155 *** Związki aromatyczne Związki aromatyczne dają charakterystyczne pasma w nadfioletowym i widzialnym zakresie widma i chociaż można je łatwo zidentyfikować na podstawie innych właściwości spektroskopowych, to widma elektronowe umożliwiają uwidocznienie albo potwierdzenie faktu posiadania przez cząsteczkę pewnych specyficznych cech strukturalnych. *** Areny W przypadku widma benzenu (w heksanie) obecne są trzy pasma absorpcyjne λ1, λ2 oraz λ3, których maksima wypadają odpowiednio przy 184 nm, 204 nm oraz 254 nm. Odpowiadają one różnym dozwolonym przejściom π→π*. Ponadto, podstawniki alkilowe powodują batochromowe przesunięcie pasm λ2 oraz λ3, z kolei w małym stopniu wpływają na wartość molowego współczynnika absorpcji. Dla policyklicznych węglowodorów aromatycznych o pierścieniach skondensowanych zarówno kątowo, jak również liniowo, krzywe absorpcji posiadają kształt podobny do krzywej absorpcji benzenu, ale maksima absorpcji są przesunięte w kierunku fal dłuższych, im K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 156 większa jest liczba pierścieni. *** Układy heterocykliczne W przypadku np. pirydyny widmo elektronowe jest podobne do widma benzenu, ale zawiera dodatkowe pasmo przy 270 nm, które przypisuje się przejściu, w którym bierze udział wolna para elektronowa azotu. Również widma izochinoliny oraz chinoliny, są bardzo podobne do widma naftalenu. Warto zauważyć, że widma pięcioczłonowych związków heterocyklicznych (pirol, tiofen, furan), pomimo ich charakteru aromatycznego, charakteryzują się znacznymi różnicami w porównaniu z widmem benzenu. *** Podstawione układy benzenoidowe Podstawniki halogenowe wykazują podobny efekt do wcześniej opisanych efektów wywołanych przez podstawniki alkilowe – niewielkie przesunięcia batochromowe pasm λ2 oraz λ3. Z kolei podstawniki zawierające grupy z wiązaniem wielokrotnym, np. C=O, NO2, C≡N, C=C, C≡C, a w mniejszym stopniu podstawniki posiadające niewiążące elektrony sprzężone z układem K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 157 elektronów π, powodują znaczne batochromowe przesunięcia tych dwóch pasm. Warto zauważyć, że przesunięciom tym towarzyszy często wzrost wartości molowego współczynnika absorpcji pasma λ3. Ponadto, w niektórych przypadkach na widmie pojawia się dodatkowe pasmo odpowiadające przejściom elektronowym, które związane jest z podstawnikiem. Obserwowane w większości przypadków przesunięcia batochromowe są wynikiem silniejszej stabilizacji mezomerycznej badanych związków, co powoduje zmniejszenie różnicy energetycznej między stanem podstawowym i stanami wzbudzonymi. Efektem tego jest przesunięcie pasma w kierunku fal dłuższych. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 158 5 Spektroskopia NMR 5.1. Wstęp Spektroskopia NMR opiera się na pomiarze absorpcji promieniowania o częstości radiowej przez układ zawierający jądra magnetyczne, będące pod wpływem zewnętrznego pola magnetycznego, wytworzonego przez elektromagnes. Konieczność stosowania pola magnetycznego jest jedną z głównych różnic w stosunku do optycznych metod spektroskopowych. Aby mogło dojść do rezonansowej absorpcji promieniowania, badany układ należy poddać działaniu pola magnetycznego, które powoduje rozsunięcie się poziomów spinowych jąder o niezerowej kwantowej liczbie spinowej 𝐼 (efekt K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 159 Zeemana). Różnica energii między rozszczepionymi poziomami wzrasta proporcjonalnie do wzrostu indukcji pola magnetycznego, a więc warunek rezonansu (Δ𝐸 = 𝛾𝐼 ℏ𝐵0 = ℎ𝜈) można uzyskać dla wielu kombinacji energii promieniowania Δ𝐸 i indukcji pola 𝐵0. Podstawowa metoda pomiaru to metoda fali ciągłej, w której dla stałej indukcji pola przemiata się częstością promieniowania lub dla stałej energii promieniowania przemiata się indukcją pola. Jednak obecnie stosuje się metody impulsowe z transformatą Fouriera, gdzie do próbki będącej w stałym zewnętrznym polu magnetycznym dostarcza się impuls promieniowania o pewnym zadanym zakresie częstości (częstości radiowe), które powodują wzbudzenie wszystkich interesujących nas jąder jednocześnie. Następnie obserwuje się swobodny zanik indukcji (FID – ang. Free Induction Decay), czyli powrót spinów jądrowych do warunków równowagi, a uzyskany sygnał (w domenie czasu) poddaje się transformacji Fouriera i uzyskuje się widmo w domenie częstości. Interpretację widm NMR dokonuje się w oparciu o kilka podstawowych informacji. Pierwszą z nich jest ilość sygnałów rezonansowych, która mówi o ilości grup nierównoważnych chemicznie jąder (np. 1H). Druga informacja to położenie danej linii – wartość przesunięcia chemicznego, odpowiadającego częstości rezonansowej danego sygnału. Na podstawie tych wartości jesteśmy w stanie oszacować jakie grupy funkcyjne znajdują się w bliskim sąsiedztwie danego jądra magnetycznego. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 160 Kolejną informacją jest intensywność integralna sygnału (powierzchnia pod krzywą), która jest proporcjonalna do ilości jąder równoważnych, tworzących dany sygnał. W ten sposób możemy odpowiedzieć na pytanie ile dokładnie jąder (np. 1H) jest w badanej cząsteczce oraz jakie równoważne grupy tworzą. Na widmie NMR możemy zaobserwować również sprzężenie spinowo-spinowe między nierównoważnymi zarówno chemicznie, jak i magnetycznie jądrami, będącymi w swoim sąsiedztwie. Sprzężenie to powoduje rozszczepienie sygnału na składowe, których liczba związana jest z ilością jąder sprzęgających się z rozpatrywanym jądrem oraz z wartością ich spinu. Rozpatrywanie tych wszystkich informacji może doprowadzić nas do odpowiedzi na pytanie z jaką cząsteczką mamy do czynienia, jednak w przypadku bardziej skomplikowanych struktur, niezbędne jest zastosowanie metod dwuwymiarowych. 5.2. Podział spektroskopii NMR W zależności od tego, jakie jądro magnetyczne badamy, możemy wyróżnić szereg technik NMR. Zdecydowanie najpopularniejszymi są 1H NMR oraz 13C NMR. Dość często wykorzystuje się również 15N, 19F czy 31 P NMR. Eksperyment NMR wykonać można dla większości jąder magnetycznych, dobierając odpowiednie parametry pomiaru. Jest również wiele technik dwuwymiarowych NMR, które pozwalają nam na jeszcze K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 161 dokładniejszą dedukcję połączeń między atomami w cząsteczkach. Wyróżnić tu można metody homojądrowe, gdzie obserwuje się oddziaływania spinów tych samych jąder, bądź heterojądrowe polegające na obserwacji oddziaływania różnych jąder ze sobą. 5.3. Przesunięcie chemiczne Częstość rezonansowa jądra zależy również od jego otoczenia elektronowego i jest różna dla różnych ugrupowań chemicznych. Elektrony rozpatrywanego jądra powodują jego przesłanianie (ekranowanie), co związane jest z efektem diamagnetycznym. W przypadku elektronów grup sąsiednich mamy do czynienia z przesłanianiem, jak i odsłanianiem w zależności od orientacji układu w stosunku do kierunku indukcji pola magnetycznego. W roztworze jednak przyczynki przesłaniania i odsłaniania nie uśredniają się do zera i obserwujemy efekt wypadkowy. Przesunięcie chemiczne 𝛿 jest względną skalą częstości rezonansowych jąder. Definiowane jest następująco: 𝛿= gdzie: 𝜈 i 𝜈𝑤𝑧 - 𝜈−𝜈𝑤𝑧 𝜈𝑤𝑧 ∙ 106 [ppm] częstość rezonansowa danego i częstość rezonansowa wzorca. (5.1) jądra K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 162 W spektroskopii 1H NMR i 13C NMR najczęściej stosowanym wzorcem jest trimetylosilan (TMS). Ze względu na niskie wartości, przesunięcie chemiczne podaje się w ppm (ang. part per milion) Przesunięcie chemiczne nie zależy zatem od indukcji przyłożonego pola magnetycznego, a więc można porównywać eksperymenty wykonywane na różnych spektrometrach NMR. Przesunięcia chemiczne dla jąder, znajdujących się w konkretnych ugrupowaniach atomów są stabelaryzowane i można je obliczyć nawet dla skomplikowanych układów molekularnych. W Internecie można znaleźć również kilka bardzo pomocnych darmowych programów, które symulują widma NMR (najczęściej 1H NMR oraz 13C NMR). Typowe zakresy przesunięcia chemicznego dla 1H NMR obserwować możemy w granicach 0-15 ppm, natomiast 13C NMR 0-250 ppm. Najniższe przesunięcia chemiczne obserwowane są dla protonów i węgli alifatycznych, a najwyższe dla protonów i węgli w związkach karbonylowych. Przyjęta, względna skala przesunięcia chemicznego nie wyklucza ujemnych wartości, co może mieć miejsce gdy badane jądra są silniej ekranowane od jąder substancji wzorcowej. Typowe zakresy przesunięć chemicznych (1H NMR, 13C NMR) dla wybranych grup funkcyjnych, przedstawiono na rysunku 5.1 i 5.2. Niektóre zakresy przesunięć chemicznych dla K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 163 konkretnych grup funkcyjnych mogą nakładać się na siebie, dlatego nie zawsze możemy być pewni z jakim ugrupowaniem atomów mamy do czynienia. Przesunięcie chemiczne protonów grup –OH czy –NH2 może znacznie się zmieniać w zależności od rozpuszczalnika i stężenia substancji badanej. W dodatku pasmo jest poszerzone, co związane jest z wymianą labilnych protonów tych grup z protonami rozpuszczalnika. 1 Rys. 5.1. Typowe zakresy przesunięć chemicznych w H NMR. X – oznacza atom chlorowca, Ar – cząsteczkę aromatyczną. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 164 Rys. 5.2. Typowe zakresy przesunięć chemicznych w oznacza cząsteczkę aromatyczną. 13 C NMR. Ar 5.4. Sprzężenie spinowo-spinowe Sprzężenie spinowo-spinowe między sprzęgającymi się nierównoważnymi chemicznie (czy magnetycznie patrz rozdział 5.6) jądrami powoduje rozszczepienie sygnałów rezonansowych na składowe. Miarą tego oddziaływania jest stała sprzężenia spinowo-spinowego 𝐽 podawana najczęściej w Hz. Stała sprzężenia zależy tylko od rodzaju sprzęgających się jąder i odległości między nimi. Sprzężenie obserwuje się najczęściej dla jąder odległych od siebie o trzy wiązania chemiczne, jednak jest wiele odstępstw od tej reguły. Odległość między rozdzielonymi składowymi sygnału jest równa stałej sprzężenia, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 165 natomiast ilość składowych zadana jest wzorem: 𝑁𝐴 = 2𝑛𝑋 𝐼𝑋 + 1, (5.2) gdzie: 𝑁𝐴 - liczba składowych sygnału rezonansowego jąder (równoważnych) 𝐴; 𝑛𝑋 i 𝐼𝑋 - ilość i spin jąder (równoważnych) 𝑋, sprzęgających się z jądrem (jądrami) 𝐴. Pamiętajmy, że liczba składowych sygnału jądra (jąder) 𝐴 nie zależy od liczebności tych jąder w cząsteczce. Zmienia się jedynie intensywność sygnału (całka pod pasmem), która jest proporcjonalna do ilości jąder równoważnych. Należy również podkreślić, że jądra 𝐴 oraz jądra 𝑋 są nierównoważne względem siebie, natomiast wszystkie jądra 𝐴, jak również wszystkie jądra 𝑋, są równoważne. W rozważaniach odnośnie sprzężenia, mówi się również o multipletowości sygnału. Gdy sygnał nie jest sprzęgany lub tego sprzężenia nie widać (ze względu na niską stałą sprzężenia) mówi się, że jest to singlet. Gdy mamy do czynienia z dwoma składowymi jest to dublet, a z trzema tryplet, i tak dalej. Względna intensywność rozszczepionych składowych sygnału jądra 1 𝐴, gdy spin jądra 𝑋, 𝐼𝑋 = 2, zadana jest trójkątem Pascala: K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 166 Multipletowość singlet dublet tryplet kwartet kwintet sekstet septet oktet nonet Względna intensywność 1 1 1 1 2 1 1 3 3 1 1 4 6 4 1 1 5 10 10 5 1 1 6 15 20 15 6 1 1 7 21 35 35 21 7 1 1 8 28 56 70 56 28 8 1 Zatem, dla najczęściej rozpatrywanych jąder (1H i 13C), ilość składowych sygnału rozszczepionego będzie zwiększona o 1 w stosunku do liczby sprzęgających go jąder. Gdy mamy do czynienia z większą ilością nierównoważnych grup jąder sprzęgających się z jądrem rozpatrywanym, wzór 5.2 możemy przepisać: 𝑁𝐴 = ∏𝑖 (2𝑛𝑖 𝐼𝑖 + 1), (5.3) gdzie: 𝑛𝑖 oraz 𝐼𝑖 - ilość oraz spin 𝑖-tych sprzęgających się jąder. Ilość składowych, jaka wychodzi z tego wyrażenia, może się różnić od faktycznej ilości obserwowanej na widmie NMR, co ma miejsce, gdy stałe sprzężenia 𝑖-tych jąder są zbliżone. Nazwy multipletowości stają się bardziej skomplikowane i przykładowo dla dwóch sprzęgających się grup jąder nazwy multipletów będą dwuczłonowe. Gdy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 167 jedna grupa jąder powoduje rozszczepienie na dwie składowe, a druga grupa na trzy składowe, będziemy mówić o dublecie trypletów albo tryplecie dubletów. W przypadku, gdy mamy do czynienia z większą ilością nierównoważnych grup jąder sprzęgających się, względne intensywności sygnałów są trudniejsze do rozstrzygnięcia. W celu uproszczenia sobie zadania najlepiej rozrysować tak zwane drzewko sprzężeń. Aby zaznajomić się z ideą drzewka sprzężeń, dla przykładu zajmiemy się układem jąder 𝐴𝑋2 , w którym 1 jądro 𝐴 oraz 𝑋 charakteryzuje się spinem 𝐼 = 2. Jak wynika ze wzoru 5.2, każde jądro 𝑋 powoduje rozszczepienie sygnału 𝐴 na dwie składowe, ale ze względu na fakt, iż są to jądra równoważne, otrzymamy trzy składowe o stosunku intensywności 1:2:1. Pierwsze jądro 𝑋 powoduje rozszczepienie sygnału na dwie składowe oddalone od siebie o stałą sprzężenia 1𝐽𝐴𝑋 . Drugie jądro 𝑋 powoduje kolejne rozszczepienie na dwie składowe, a ze względu na tą samą stałą sprzężenia, dwie z czterech rozszczepionych składowych nakładają się, co na drzewku sprzężeń obrazujemy jako podwójna linia (rysunek 5.3). Sygnał jąder 𝑋 będzie dubletem, w którym składowe sygnału będą oddalone od siebie o tą samą stałą sprzężenia 1𝐽𝐴𝑋 . Ze względu na dwukrotnie wyższą zawartość jąder w cząsteczce, intensywność sygnału 𝑋 będzie dwukrotnie wyższa od intensywności sygnału 𝐴. Wartość przesunięcia chemicznego jąder 𝐴 i 𝑋 będzie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 168 wyznaczona przez środek multipletu, w przypadku jądra 𝐴 będzie to położenie środkowej składowej trypletu, natomiast w przypadku jądra 𝑋 będzie to środek pomiędzy składowymi dubletu (rysunek 5.4). Rys. 5.3. Drzewko sprzężeń oraz rozszczepiony sygnał jądra 𝐴 1 w układzie 𝐴𝑋2 (𝐼𝐴 = 𝐼𝑋 = ). 1𝐽𝐴𝑋 – stała sprzężenia między jądrami 𝐴 2 i 𝑋. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 169 Rys. 5.4. Drzewko sprzężeń oraz rozszczepiony sygnał jądra 𝑋 1 w układzie 𝐴𝑋2 (𝐼𝐴 = 𝐼𝑋 = ). 1𝐽𝐴𝑋 – stała sprzężenia między jądrami 𝐴 2 i 𝑋. Rozważmy teraz układ 𝑋 − 𝐴 − 𝑌, w którym stałe sprzężenia 1𝐽𝐴𝑋 oraz 1𝐽𝐴𝑌 różnią się wartością, załóżmy, że druga z nich jest mniejsza. Po analogicznej dedukcji dochodzimy do wniosku, że sygnał 𝐴 będzie dubletem dubletów. Jądra 𝑋 oraz 𝑌 również się sprzęgają, jednak stała sprzężenia 2𝐽𝑌𝑋 będzie miała niższą wartość od stałych 1𝐽𝐴𝑋 i 1𝐽𝐴𝑌 , gdyż jądra 𝑋 i 𝑌 są oddalone od siebie o dwa wiązania. Zatem sygnały 𝑋 i 𝑌 również będą dubletami dubletów (rysunek 5.5 i 5.6). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 170 Rys. 5.5. Drzewko sprzężeń oraz rozszczepiony sygnał jądra 𝐴 1 w układzie 𝑌 − 𝐴 − 𝑋 (𝐼𝐴 = 𝐼𝑋 = 𝐼𝑌 = ). 2 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 171 Rys. 5.6. Drzewko sprzężeń oraz rozszczepiony sygnał jądra 𝑋 1 w układzie 𝑌 − 𝐴 − 𝑋 (𝐼𝐴 = 𝐼𝑋 = 𝐼𝑌 = ). 2 Sygnał jądra 𝑌 byłby analogiczny do sygnału jądra 𝑋. Dla większej ilości jąder sprzęgających się, oraz dla jąder o spinie większym od 1 , sprawa coraz bardziej 2 1 komplikuje się. Rozważmy układ 𝐴𝑋3 (𝐼𝐴 = 2, 𝐼𝑋 = 1). Każde z trzech jąder 𝑋 rozszczepią sygnał jądra 𝐴 na trzy linie, ale poszczególne składowe nałożą się i otrzymamy septet o stosunku intensywności 1:3:6:7:6:3:1, co przedstawiono na rysunku 5.7. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 172 Rys. 5.7. Drzewko sprzężeń oraz rozszczepiony sygnał jądra 𝐴 1 w układzie 𝐴𝑋3 (𝐼𝐴 = , 𝐼𝑋 = 1). 2 Oczywiście w tym przypadku sygnał jąder 𝑋 byłby dubletem o trzykrotnie wyższej intensywności od sygnału jądra 𝐴. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 173 5.5. Stałe sprzężenia spinowo-spinowego Wartości stałych sprzężenia zależą od wielu czynników, najważniejsze z nich to rodzaj sprzęgających się jąder, ilość wiązań dzielących sprzęgające się jądra, czy kąt między nimi. Stałe sprzężenia mogą charakteryzować się również różnym znakiem, co związane jest z energetyką sprzęgającego się układu. Gdy bardziej korzystnym ułożeniem spinów jądrowych (ze względu na oddziaływania kontaktowe Fermiego, zakaz Pauliego i regułę Hunda) jest orientacja antyrównoległa, stałe sprzężenia są dodatnie. Gdy bardziej korzystną orientacją jest orientacja równoległa, stałe sprzężenia są ujemne. Zazwyczaj zatem, stałe sprzężenia przez jedno wiązanie (na przykład C-H) będę charakteryzowały się dodatnią wartością, przez dwa wiązania ujemną, przez trzy dodatnią, i tak dalej. Oczywiście w praktyce obserwuje się wiele odstępstw od tego rozumowania, co związane jest na przykład z obecnością grup elektronoakceptorowych i elektronodonorowych. W przypadku stałej sprzężenia przez dwa wiązania (geminalana stała sprzężenia), podstawniki σ-akceptorowe i π-donorowe powodują, że stała sprzężenia jest bardziej dodatnia, natomiast podstawniki σ-donorowe i π- akceptorowe powodują, że stała sprzężenia jest bardziej ujemna. Dalsze rozważania na temat stałych sprzężenia będziemy prowadzić głównie dla spektroskopii 1H NMR. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 174 5.5.1. Geminalna stała sprzężenia Geminalna stała sprzężenia, to stała przez dwa wiązania 2𝐽𝐻𝐻 . A więc jądra 1H sprzęgające się tą stałą będą połączone z tym samym atomem węgla (H-C-H). Geminalna stała sprzężenia powinna charakteryzować się wysoką wartością, ze względu na bliską odległość między dzielącymi je sprzęgającymi się jądrami; jednak jak się okazuje nie we wszystkich przypadkach. Typowe wartości geminalnej stałej sprzężenia przedstawiono poniżej (rysunek 5.8 i 5.9). Rys. 5.8. Przykłady geminalnych stałych sprzężenia (hybrydyzacja 3 sp ). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 175 Rys. 5.9. Przykłady geminalnych stałych sprzężenia (hybrydyzacja 2 sp ). Geminalne stałe sprzężenia protonów można podzielić zatem na dwie główne grupy. Dla protonów w układach sp3 stała sprzężenia będzie wysoka (zazwyczaj 12 Hz), natomiast dla protonów w układach sp2 (protony winylowe) stała sprzężenia będzie dużo niższa (około 2-3 Hz). Na rysunkach 5.8 i 5.9 przedstawiono również wpływ grup elektronodonorowych oraz elektronoakceptorowych na wartość tej stałej sprzężenia. 5.5.2. Wicynalna stała sprzężenia Wicynalna stała sprzężenia, to stała przez trzy wiązania 𝐽𝐻𝐻 (na przykład H-C-C-H). Wartość tej stałej zazwyczaj 3 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 176 mieści się w zakresie od 0 do nawet 15 Hz i silnie zależy od kąta torsyjnego między sprzęgającymi się jądrami. Fakt ten implikuje możliwość wykorzystania tej informacji do dedukcji struktury konformacyjnej badanej cząsteczki. Zależność stałej sprzężenia 3𝐽𝐻𝐻 od kąta torsyjnego 𝜙 sprzęgających się jąder opisuje równanie Karplusa: 3 𝐽𝐻𝐻 = 𝐴 + 𝐵 cos 𝜙 + 𝐶 cos 2𝜙, (5.4) gdzie: 𝐴, 𝐵, 𝐶 - stałe empiryczne wyznaczane dla różnych grup związków. Dla 𝐴 = 7, 𝐵 = −1, 𝐶 = 5 Hz otrzymamy krzywą przedstawioną na rysunku 5.10. Rys. 5.10. Wykres równania Karplusa dla 𝐴 = 7, 𝐵 = −1, 𝐶 = 5 Hz. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 177 5.5.3. Sprzężenie dalekozasięgowe Bardzo często mamy do czynienia ze stałą sprzężenia przez większą ilość wiązań. Są to dalekozasięgowe stałe sprzężenia, które dochodzą nawet do pięciu wiązań 5𝐽𝐻𝐻 . Sprzężenia przez cztery wiązania, obserwowane są najczęściej w związkach aromatycznych, układach nienasyconych oraz w związkach cyklicznych. Dla związków aromatycznych oraz układów z wiązaniami wielokrotnymi obserwowane są również sprzężenia przez pięć wiązań, jednak dla tych pierwszych, stałe sprzężenia są na tyle niskie, że często nie można ich dokładnie określić. W związkach nasyconych bardzo rzadko obserwuje się sprzężenia przez więcej niż trzy wiązania, jednak są pewne wyjątki. Typowe wartości stałych sprzężenia dalekozasięgowego przedstawiono na rysunku 5.11 i 5.12. Rys. 5.11. Stałe sprzężenia przez cztery wiązania. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 178 Rys. 5.12. Stałe sprzężenia przez pięć wiązań. 5.6. Jądra równoważne chemicznie i magnetycznie Jądra równoważne chemicznie, to takie jądra (tego samego pierwiastka), które mają to samo otoczenie elektronowe, co w konsekwencji prowadzi do otrzymania tej samej częstości rezonansowej i przesunięcia chemicznego. Oczywiście istnieje prawdopodobieństwo, że dwa jądra nierównoważne będą miały podobną, a nawet bardzo zbliżoną częstość rezonansową, co zdecydowanie może utrudnić interpretację widma NMR. Jeżeli jądra równoważne chemicznie sprzęgają się z pozostałymi jądrami w cząsteczce z taką samą stałą sprzężenia, możemy również mówić, że te jądra są K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 179 równoważne magnetycznie, jeżeli tak nie jest, są one równoważne chemicznie, ale nierównoważne magnetycznie. Jądra nierównoważne chemicznie są również w konsekwencji nierównoważne magnetycznie. Zatem wyróżnić możemy nierównoważność magnetyczną, która objawia się różnym przesunięciem chemicznym jąder i co się z tym wiąże najczęściej również różnymi stałymi sprzężenia z innymi jądrami (kryterium przesunięcia chemicznego), oraz nierównoważność magnetyczną związaną tylko z różnicami w stałych sprzężenia, przy takich samych przesunięciach chemicznych (kryterium stałej sprzężenia). Symetria cząsteczki ma duże znaczenie w ustalaniu równoważności chemicznej i magnetycznej jąder. Okazuje się bowiem, że jeżeli dwa równoważne chemicznie jądra powiązane są ze sobą tylko jedną operacją symetrii (na przykład płaszczyzna zwierciadlana) będą one nierównoważne magnetycznie. Natomiast, gdy operacji tych będzie więcej, jądra te będą równoważne magnetycznie. Zatem sprzężeniu ulec mogą jądra nierównoważne chemicznie, ale również jądra równoważne chemicznie, ale nierównoważne magnetycznie, co zostanie wyjaśnione niżej. Zastanówmy się na początek, które jądra można uznać za równoważne chemicznie. Weźmy na warsztat cząsteczkę etanolu. Wyobrazić możemy sobie szereg konformacji grupy –CH3 względem reszty cząsteczki. Dla każdej z nich, poszczególne protony będą miały inne K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 180 otoczenie. Jednak w temperaturze pokojowej, obrót wokół wiązania C-C jest na tyle szybki, że możliwe orientacje uśredniają się i w konsekwencji wszystkie protony z grupy –CH3 są równoważne chemicznie (to samo przesunięcie chemiczne) jak i magnetycznie, gdyż każdy z nich sprzęga się z obydwoma jądrami grupy –CH2– z tą samą stałą sprzężenia. Podobnie się rzecz ma dla protonów z grupy – CH2–. 1 Rys. 5.13. Symulowane widmo H NMR etanolu. Zatem w przypadku etanolu, na widmie 1H NMR uzyskamy trzy sygnały rezonansowe, pochodzące od protonów grup –CH3, –CH2–, oraz –OH. Przesunięcie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 181 chemiczne protonów grupy –CH2– będzie wyższe niż grupy –CH3 ze względu na bezpośrednie sąsiedztwo grupy –OH. Sygnał grupy –CH3 będzie trypletem ze względu na sprzężenie z dwoma jądrami z grupy –CH2–, natomiast sygnał grupy –CH2– będzie kwartetem gdyż sprzęga się z trzema równoważnymi jądrami grupy –CH3. Sygnał pochodzący od grupy –OH nie będzie rozszczepiony (singlet) ani nie będzie powodował rozszczepienia, co związane jest z jego dynamiczną wymianą z protonami rozpuszczalnika (rysunek 5.13) Równocenność chemiczną protonów możemy klasyfikować w różny sposób. Dla dwóch protonów, połączonych do węgla o hybrydyzacji sp3, mamy szereg możliwości. Protony grupy –CH2– w n-propanie będą homotopowe (równoważne chemicznie), po zastąpieniu jednego z nich inną grupą, dostaniemy dwa identyczne, nierozróżnialne związki chemiczne. Gdy jedną z grup – CH3 w propanie zastąpimy atomem chloru, protony grupy –CH2– będą enancjotopowe (równoważne chemicznie, rozróżnialne w środowisku chiralnym), po zastąpieniu jednego protonu enancjotopowego inną grupą, dostaniemy enancjomery. Gdy zaś zamiast jednej grupy – CH3 wstawimy chiralny atom węgla, protony grupy –CH2– będą diastereotopowe (nierównoważne chemicznie), po podstawieniu jednego z nich uzyskuje się diastereoizomery (rysunek 5.14). Protony grupy =CH2 będą równoważne pod warunkiem, że po drugiej stronie wiązania podwójnego znajdować się K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 182 będą dwa te same podstawniki (rysunek 5.15). W przypadku podstawionych związków cyklicznych (na przykład w chlorocyklopropanie) protony danej grupy – CH2–, znajdujące się ponad płaszczyzną i pod płaszczyzną pierścienia, będą nierównoważne chemicznie (rysunek 5.16). Rys. 5.14. Różne relacje protonów grupy –CH2–. Gdzie R* to grupa z centrum stereogenicznym . K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 183 Rys. 5.15. Różne relacje protonów grupy =CH2. Rys. 5.16. Różne relacje protonów związków cyklicznych. 5.7. Widma drugiego rzędu – silnego sprzęgania Gdy sygnały sprzęgających się jąder są wystarczająco dobrze odseparowane i jesteśmy w stanie ustalić ich multipletowość, są to widma pierwszego rzędu. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 184 W przeciwnym wypadku uzyskuje się widma silnego sprzęgania, których analiza jest bardzo trudna, często możliwa jedynie na podstawie obliczeń kwantowochemicznych. Sygnały sprzęgających się jąder nachodzą na siebie, tworząc skomplikowany multiplet. Aby temu przeciwdziałać, pomiar widma NMR można powtórzyć na spektrometrze wyposażonym w magnes o wyższej indukcji pola magnetycznego. Jak wiemy, stałe sprzężenia wyrażone w Hz nie zależą od indukcji pola. Zatem, gdy przyłożymy wyższe pole magnetyczne zmieni się warunek rezonansu (wyższa częstość promieniowania). Skala przesunięć chemicznych pozostanie taka sama, natomiast skala częstości się poszerzy, powodując rozsunięcie się multipletów. Powyższe rozważania przedstawiono na rysunku 5.17. Widać, że wraz ze zwiększającą się indukcją pola, sygnały przechodzą ze struktury drugorzędowej do pierwszorzędowej, co pozwala na ich interpretację. Warto również zauważyć, że sygnały pochodzące od jąder sprzęgających się ze sobą, wykazują tzw. efekt dachowy, który objawia się nieco innym rozłożeniem intensywności poszczególnych składowych w multipletach. Składowe będące najbliżej siebie zwiększają swoją intensywność, a te będące najbardziej oddalone, zmniejszają. Efekt ten zwiększa się, gdy przesunięcia chemiczne sprzęgających się jąder są zbliżone, lub gdy indukcja pola magnetycznego ma odpowiednio niską wartość (rysunek 5.17 i 5.18). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 185 Rys. 5.17. Efekty drugorzędowe (widma silnego sprzęgania) dla różnych warunków rezonansu: a) AB, b) A2B2. Widma symulowane. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 186 Rys. 5.18. Efekty drugorzędowe (widma silnego sprzęgania) dla zmniejszającej się różnicy przesunięć chemicznych sygnałów sprzęgających się jąder: a) układ spinowy AB, b) układ spinowy A 2B2. Widma symulowane. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 187 Efekty drugorzędowe nie objawiają się tylko nakładaniem sygnałów, wchodzą tutaj w grę również inne mechanizmy, powodujące dodatkowe rozszczepienia sygnałów, tak jak ma to miejsce na rysunku 5.17 b) i 5.18 b). Istotny jest również fakt, że w widmach silnego sprzężenia, składowe sygnałów obserwowanych jąder, przestają być rozmieszczone symetrycznie wokół wartości przesunięcia chemicznego, co widać wyraźnie na rysunkach 5.17 i 5.18. Zwiększanie indukcji pola nie pomoże jednak w przypadku układów spinowych z jądrami równoważnymi chemicznie, ale nierównoważnymi magnetycznie (na przykład AA’BB’), gdyż sygnały nierównoważnych magnetycznie jąder A i A’ (oraz B i B’) będą miały to samo przesunięcie chemiczne, którego nie można zmienić zwiększając indukcję pola. Tak więc efekty drugorzędowe, związane z nakładaniem się sygnałów jąder A i A’ (oraz B i B’), są niemożliwe do usunięcia. 5.8. Typy układów spinowych W praktyce spotkać się możemy z szeregiem typów sprzężonych układów spinowych. Według nazewnictwa Pople’a, jądra równoważne chemicznie i magnetycznie oznacza się tą samą literą, na przykład A2. Gdy mamy do czynienia z jądrami nierównoważnymi chemicznie, stosujemy różne litery alfabetu, z tym że jeżeli różnica przesunięć chemicznych dwóch sprzęgających się jąder K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 188 jest na tyle duża, że nie obserwuje się efektów drugorzędowych, stosuje się oznaczenia AX, AX2, A2Y (litery odległe od siebie w alfabecie). W przypadku, gdy sprzęgające się jądra mają zbliżone przesunięcie chemiczne i efekty drugorzędowe zaczynają dawać o sobie znać, stosujemy sąsiadujące litery alfabetu, na przykład AB, A2B2. Gdy sprzęgające się jądra są równoważne chemicznie, ale nierównoważne magnetycznie, do oznaczenia stosujemy te same litery, z tym że dodajemy apostrof. Zatem w przypadku dwóch jąder równoważnych chemicznie i nierównoważnych magnetycznie mamy: AA’; w przypadku trzech jąder AA’A’’, a w przypadku czterech AA’A’’A’’’. Możemy mieć również układy zawierające parami jądra równoważne chemicznie, ale nierównoważne magnetycznie, na przykład: AA’BB’ albo AA’XX’. 5.9. Przykładowe widma dla różnych typów układów spinowych W tym rozdziale przedstawione zostaną przykładowe widma 1H NMR dla różnych typów układów spinowych, których nomenklatura została przedstawiona wyżej. 5.9.1. Układ AX Najprostszym układem spinowym sprzęgających się K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 189 jąder, jaki jesteśmy sobie w stanie wyobrazić, jest układ AX. Jeżeli zawęzimy rozpatrywane przykłady do sytuacji, w której oba jądra (A oraz X) charakteryzują się spinem 1 równym 2, otrzymujemy dla każdego jądra sygnał, który będzie dubletem ze stałą sprzężenia 𝑛𝐽𝐴𝑋 . Przykładem takich układów może być cis i trans-3-chloroakrylonitryl (rysunek 5.19 i 5.20). Przy okazji pokażemy na tym przykładzie jak wicynalna stała sprzężenia potrafi zmieniać się w takich układach. Rys. 5.19. Widmo symulowane. 1 H NMR trans-3-chloroakrylonitrylu. Widmo K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 190 Rys. 5.20. Widmo symulowane. 1 H NMR cis-3-chloroakrylonitrylu. Widmo Jak można było się spodziewać, widma obu związków, charakteryzują się dwoma dubletami. Jednak stała sprzężenia w przypadku trans-3-chloroakrylonitrylu jest prawie dwukrotnie wyższa. Dla wielu układów stała sprzężenia w izomerze trans jest większa, co jest bardzo dobrym indykatorem w badaniu izomerii cis-trans. 5.9.2. Układ AX2 Dla układu AX2 obserwować będziemy dublet, pochodzący od jądra X oraz tryplet, pochodzący od jądra A. Przykładem takiego układu może być 1,1,21 tribromoetan. Widmo H NMR tego związku K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 191 przedstawiono na rysunku 5.21. 1 Rys. 5.21. Symulowane widmo H NMR 1,1,2-tribromoetanu. 5.9.3. Układy A2M2X3 oraz A2MnX3 W przypadku układów A2M2X3 obserwować będziemy trzy sygnały o multipletowości: tryplet, sekstet i tryplet. Okazuje się bowiem, że w takich układach bardzo często stałe sprzężenia 𝐽𝐴𝑋 i 𝐽𝐴𝑀 są równe, co sprawia, że sygnał jąder M zamiast być dubletem kwartetów, jest sekstetem. Przykładem takiego układu jest kwas masłowy, którego widmo 1H NMR przedstawiono na rysunku 5.22. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 192 1 Rys. 5.22. Symulowane widmo H NMR kwasu masłowego. W przypadku związków długołańcuchowych (kwasy tłuszczowe, alkohole), sygnały grup –CH2– mają bardzo zbliżone przesunięcie chemiczne, co powoduje powstanie intensywnego pasma o skomplikowanej strukturze subtelnej (ze względu na efekty drugorzędowe). Widmo 1H NMR kwasu mirystynowego pokazano na rysunku 5.23. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 193 1 Rys. 5.23. Symulowane widmo H NMR kwasu mirystynowego. 5.9.4. Układy AA’BB’, AMX oraz AA’A’’A’’’ na przykładzie chlorowcopochodnych benzenu Efekt drugorzędowy w układach AA’BB’, AMX i AA’A’’A’’’ można dobrze zobrazować na przykładzie 1,2 dipodstawionych pochodnych benzenu. Cząsteczka benzenu będzie charakteryzowała się K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 194 pojedynczym sygnałem (zarówno na widmie 1H NMR, jak i 13C NMR), gdyż wszystkie jądra wodoru i węgla, znajdujące się w cząsteczce, mają takie same otoczenie elektronowe – równoważność chemiczna. Gdy do struktury benzenu wprowadzimy podstawniki (na przykład dwa atomy bromu) sytuacja diametralnie się zmienia. Wyróżnić możemy trzy dibromowe pochodne benzenu. Najpierw zajmijmy się 1,2-dibromobenzenem (rysunek 5.24), gdzie podstawniki bromowe są względem siebie w pozycji orto. Mamy tutaj do czynienia z dwoma grupami (HA, HB) równoważnych chemicznie jąder, które są parami nierównoważnymi magnetycznie (HA, HA’ i HB, HB’) i będą sprzęgać się ze stałymi sprzężenia 5𝐽𝐴,𝐴′ i 3𝐽𝐵,𝐵′ . Związane jest to z faktem, iż jądro HA oddziałuje inaczej z jądrami HB i HB’ niż jądro HA’ (i vice versa), to znaczy stałe sprzężenia 3𝐽𝐴,𝐵 ≠ 4𝐽𝐴,𝐵′ ≠ 4𝐽𝐴′ ,𝐵 nie są sobie równe. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 195 1 Rys. 5.24. Widmo H NMR 1,2-dibromobenzenu. Symulacja na podstawie eksperymentalnych wartości przesunięć chemicznych i stałych sprzężeń. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 196 Zatem oprócz sprzężeń między nierównoważnymi chemicznie jądrami, obserwować będziemy sprzężenia między jądrami równoważnymi chemicznie, ale nierównoważnymi magnetycznie: HA i HA’ oraz HB i HB’. Warto również zwrócić uwagę, że stałe sprzężenia 3𝐽𝐴,𝐵 i 3𝐽𝐴′,𝐵′ są równe. Każde z jąder HA, HA’, HB oraz HB’ powinno dawać sygnały o multipletowości dublet dubletów dubletów (ddd), jednak ze względu na nałożenie się sygnałów HA i HA’ oraz HB i HB’ obserwujemy bardziej skomplikowane multiplety (widma silnego sprzęgania; w grę wchodzi również efekt dachowy (obniżona intensywność najbardziej skrajnych składowych). Jest to typowe widmo dla układu spinowego AA’BB’ (lub AA’XX’), których analiza w literaturze jest dość dobrze przedstawiona. Trzeba pamiętać, że w przypadku takich widm (widma silnego sprzęgania) trudno jest wyciągnąć wnioski na temat stałych sprzężenia z prostego obliczania odległości między składowymi multipletów. W przypadku układów AA’BB’ mamy do czynienia z dość skomplikowanymi zależnościami między przesunięciami chemicznymi uzyskiwanych sześciu składowych dla każdego z sygnałów a rzeczywistymi stałymi sprzężenia. W przypadku 1,3-dibromobenzenu (metadibromobenzen) mamy do czynienia z trzema grupami nierównoważnych chemicznie jąder (HA, HM, HX). Na widmie protonowym obserwować będzie się zatem trzy sygnały (rysunek 5.25). Sygnał protonu HA będzie trypletem dubletów ze względu na sprzężenie z dwoma K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 197 równoważnymi chemicznie jądrami HM oraz jądrem HX (podobnie będzie dla jądra HX). Sygnał jąder HM będzie dubletem dubletów ze względu na sprzężenie z protonem HX, oraz HA. Jednak ze względu na niską stałą sprzężenia 5 𝐽𝐴,𝐶 rozszczepienia związane z tą stałą nie będą widoczne. Ostatecznie otrzymamy: dwa tryplety (HA i HX), oraz dublet dubletów (HM). W przypadku 1,4-dibromobenzenu (rysunek 5.26) wszystkie protony będą miały to samo otoczenie chemiczne, a więc będą równoważne chemicznie, ale nie będą równoważne magnetycznie (HA, HA’, HA’’, HA’’’), gdyż stałe sprzężenia 3𝐽𝐴,𝐴′ ≠ 4𝐽𝐴,𝐴′′ ≠ 5𝐽𝐴,𝐴′′′ nie są równe. Ze względu na jednakowe przesunięcie chemiczne tych jąder, na widmie protonowym obserwowany będzie pojedynczy sygnał o niezauważalnej strukturze subtelnej (bardzo silny efekt dachowy). Widać, że na podstawie widma 1H NMR jesteśmy w stanie w prosty sposób sprawdzić podstawienie cząsteczek benzenu. W naszym przypadku wystarczy policzyć ilość sygnałów. Dla 1,2-dibromobenzenu obserwujemy dwa sygnały, dla 1,3-dibromobenzenu trzy sygnały, natomiast dla 1-4-dibromobenzenu tylko jeden sygnał. Sytuacja oczywiście komplikuje się, gdy mamy do czynienia z różnymi podstawnikami. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 198 1 Rys. 5.25. Widmo H NMR 1,3-dibromobenzenu. Symulacja na podstawie eksperymentalnych wartości przesunięć chemicznych i stałych sprzężeń. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 199 1 Rys. 5.26. Widmo H NMR 1,4-dibromobenzenu. Symulacja na podstawie eksperymentalnych wartości przesunięć chemicznych i stałych sprzężeń. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 200 5.10. Widma 13C NMR … Abundancja (naturalna zawartość) jąder 13C jest bardzo niska (około 1,1 %), co sprawia, że w praktyce nie obserwuje się sprzężeń C-C, gdyż prawdopodobieństwo znalezienia dwóch jąder 13C w bliskim sąsiedztwie w jednej cząsteczce jest bardzo niskie. Jednak ze względu na niemal stuprocentową zawartość jąder 1H, na widmach 13 C NMR obserwować będziemy sprzężenia C-H. Tutaj pewnie czytelnik zada sobie pytanie, dlaczego zatem nie obserwuje się sprzężeń C-H na widmie protonowym. Otóż z tego samego powodu, dla którego nie widzimy sprzężeń C-C, czyli ze względu na niską zawartość jąder 13C. Sprzężenia C-H, obserwowane na widmach 13C NMR, mogą nam dać informację o ilości protonów połączonych z danym atomem węgla. Jednak w praktyce takie sprzężenia bardziej przeszkadzają niż pomagają, powodując, że widma przestają być widmami pierwszego rzędu i trudno jest rozszyfrować pochodzenie poszczególnych sygnałów. Dlatego w spektroskopii 13C NMR stosuje się szerokopasmowe odsprzęganie spinów protonów, co sprawia, że sygnały tracą strukturę subtelną i zyskują na intensywności. Szerokopasmowe odsprzęganie spinów protonów polega na naświetlaniu mierzonej próbki promieniowaniem rezonansowym dla protonów, co powoduje zwiększenie intensywności i zanik składowych struktury subtelnej sygnałów. Z powodu niskiej zawartości naturalnej jąder 13C zwiększenie K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 201 intensywności jest bardzo istotne. Jak się okazuje, po odsprzęganiu spinów protonów, intensywność sygnałów 13 C rośnie nie tylko z powodu utraty struktury subtelnej, ale przede wszystkim ze względu na jądrowy efekt Overhausera NOE (ang. – Nucler Overhauser Effect). Skutkiem występowania tego efektu jest brak proporcjonalności intensywności sygnału (po odsprzęganiu) do ilości jąder. Zatem podstawową informacją, jaką możemy uzyskać ze spektroskopii 13C NMR, jest ilość nierównoważnych jąder 13C (na podstawie liczby sygnałów), oraz w skład jakich grup funkcyjnych wchodzą, tudzież z jakimi grupami funkcyjnymi są związane (na podstawie wartości przesunięcia chemicznego). ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 202 6 Spektroskopia EPR 6.1. Wstęp Spektroskopia elektronowego rezonansu paramagnetycznego (EPR – ang. Electron Paramagnetic Resonance, lub ESR – ang. Electron Spin Resonance) to technika, która umożliwia badanie substancji paramegnetycznych, czyli substancji posiadających niesparowane elektrony. Przykładem mogą być rodniki, jony metali przejściowych, defekty w ciele stałym lub cząsteczki wzbudzone do stanu trypletowego. W spektroskopii EPR można zaobserwować sprzężenie momentów magnetycznych niesparowanych elektronów z momentami magnetycznymi jąder i jest to tak zwane K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 203 oddziaływanie nadsubtelne. W metodzie tej wymagane jest przyłożenie zewnętrznego pola magnetycznego, które powoduje tzw. rozszczepienie Zeemana, czyli rozszczepienie elektronowych poziomów spinowych, w wyniku którego możliwe jest zaobserwowanie sygnału na widmie. Rozszczepienie Zeemana spinowych poziomów elektronu jest znacznie większe niż w przypadku jąder magnetycznych. W związku z tym, do jego uzyskania, wykorzystuje się pole magnetyczne, które posiada niższą wartość indukcji, niż to stosowane w spektroskopii NMR. Warunek rezonansu spełniony jest przy wyższych częstościach promieniowania elektromagnetycznego (promieniowanie mikrofalowe). Eksperyment fali ciągłej, czyli podstawowy eksperyment EPR, wykonuje się przemiatając indukcją pola magnetycznego (przy ustalonej częstości promieniowania elektromagnetycznego) lub przemiatając promieniowaniem (przy ustalonej indukcji magnetycznej). W momencie spełnienia warunków rezonansu danego wzorem 6.1, na widmie pojawia się pasmo. Δ𝐸 = ℎ𝜈 = 𝑔𝑒 𝜇𝐵 𝐵 (6.1) gdzie: ℎ − stała Plancka, ℎ = 6,636·10−34 J·s 𝑣 − częstość [s-1] 𝑔𝑒 − czynnik 𝒈 zwany czynnikiem rozszczepienia spekK. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 204 troskopowego; dla swobodnego elektronu, czynnik ten wynosi 2,0023 𝜇𝐵 −- magneton Bohra, 𝜇𝐵 = 9,27 ·10−24 J∙T-1 𝜇𝐵 = 𝑒ℏ = 9,237 ∙ 10−24 J ∙ T −1 2𝑚𝑒 gdzie: 𝑒 – ładunek elementarny 𝑚𝑒 – masa elektronu 𝐵 - indukcja pola magnetycznego [T] Ze względów aparaturowych pomiar zwykle przeprowadza się przy ustalonej częstości promieniowania, przemiatając indukcją pola magnetycznego. Wówczas warunek rezonansu można zapisać przy użyciu wzoru 6.2. ℎ𝜈 𝐵𝑟 = 𝑔 𝑒 𝜇𝐵 (6.2) gdzie: 𝐵𝑟 - rezonansowa indukcja pola magnetycznego. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 205 6.2. Interpretacja widm EPR Widmo elektronowego rezonansu magnetycznego nieznanej substancji składa się z pojedynczej linii. Podczas pomiaru indukcja pola magnetycznego miała stałą wartość 3400 G (gdzie G - gaus), a próbka absorbowała promieniowanie elektromagnetyczne o częstości równej 9,40 GHz. Obliczono czynnik rozszczepienia spektroskopowego g (czynnik Landego) oraz wyciągnięto wnioski na temat jego otoczenia chemicznego. Dane: 𝐵 = 3400 G 𝑣 = 9,40 GHz 𝑔=? W celu obliczenia czynnika rozszczepienia spektroskopowego 𝑔 należy skorzystać z poniższego równania: 𝑔= ℎ∙𝑣 𝜇𝐵 ∙ 𝐵 gdzie: 𝑔 - czynnik Landego ℎ - stała Plancka h = 6,636·10−34 J·s 𝑣 - częstość [s-1] K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 206 𝜇𝐵 - magneton Bohra 𝜇𝐵 = 9,27 ·10−24 J∙T-1 𝐵 - indukcja pola magnetycznego [T] W celu obliczenia czynnika Landego dla elektronu w badanej próbce, w pierwszej kolejności należy dokonać zmiany jednostek dla indukcji pola magnetycznego oraz częstości na jednostki SI. Wiedząc, że: 1 𝐺 = 1 ∙ 10−4 𝑇 oraz 1 𝐻𝑧 = 1 ∙ 𝑠 −1 Znajdujemy: 𝐵 = 3400 G = 0,3400 T 𝑣 = 9,45 GHz = 9,45∙109 s-1 Wstawiając wszystkie wartości do wzoru wcześniej podanego wzoru otrzymuje się: 𝑔= ℎ∙𝑣 6,636 · 10−34 J · s ∙ 9,45 ∙ 109 s −1 = = 1,99 𝜇𝐵 ∙ 𝐵 9,27 · 10−24 J ∙ T −1 ∙ 0,3400 T Analizując jednostki w powyższym równaniu, okazuje się zgodnie z teorią, że czynnik rozszczepienia spektroskopowego jest liczbą bezwymiarową. Interpretacja danych eksperymentalnych wskazuje, że K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 207 w badanej próbce nie dochodzi do powstania struktury nadsubtelnej. Czyli rodnik nie oddziałuje z jądrami atomowymi w próbce lub wszystkie jądra atomowe w badanej próbce mają spin jądrowy I = 0. *** Widmo elektronowego rezonansu paramagnetycznego rodnika hydroksymetylowego ·CH2OH w roztworze kwasu siarkowego (pH = 1), zarejestrowane przy stałej wartości częstości promieniowania elektromagnetycznego (𝜈 = 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡), zostało przedstawione na rysunku 6.1. Na podstawie widma wyciągnięto wnioski o oddziaływaniach nadsubtelnych w ·CH2OH. Rys. 6.1. Izotropowe widmo EPR rodnika ·CH 2OH o dwóch równocennych jądrach o spinie I = 1/2. Pod widmem zaznaczono względne intensywności sygnałów, wynikające ze struktury nadsubtelnej, powstałej w wyniku degeneracji poziomów energetycznych. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 208 Na widmie EPR dla rodnika ·CH2OH obserwuje się trzy sygnały związane z rozszczepieniem poziomów energetycznych paramagnetyka przez dwa równocenne atomy wodoru z grupy metylowej (·CH2). Jądro w izotopie wodoru 1H ma spin równy 𝐼 = 1/2, każde jądro wodoru powoduje rozszczepienie poziomu zeemanowskiego na dwa podpoziomy energetyczne, różniące się magnetyczną liczbą spinową (𝑚𝐼,1 = ∓1/2). Powstałe podpoziomy ulegają dalszemu rozszczepieniu w wyniku oddziaływania z kolejnym jądrem 1H (𝑚𝐼,2 = ∓1/2). Oddziaływania nadsubtelne powodują powstanie 6 podpoziomów energetycznych o 4 różnych kombinacjach liczb kwantowych 𝑚𝐼,1i 𝑚𝐼,2 . Poziomy o pośrednich wartościach energii są dwukrotnie zdegenerowane, ponieważ odpowiadające im pary magnetycznych liczb kwantowych (mI,1;mI,2) posiadają identyczne wartości (patrz rysunek 6.2). ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 209 ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… Rys. 6.2. Diagram energetyczny poziomów spinowych dowolnego paramagnetyka o dwóch równocennych spinach jądrowych (𝐼 = 1/2). (mI,1;mI,2 kombinacje magnetycznych liczb spinowych odpowiadających danemu podpoziomowi); strzałkami oznaczono dozwolone przejścia EPR. Zgodnie z regułami wyboru spektroskopii EPR dozwolone są jedynie przejścia, dla których nie ulega zmianie mI, natomiast zmienia się o jeden Δ𝑚𝑠 = 1. W wyniku połączenia odpowiednich podpoziomów otrzymano trzy możliwe przejścia w EPR dla paramagnetyka w otoczeniu dwóch równocennych jąder atomowych o spinie I = ½, co jest zgodne z widmem EPR ·CH2OH, na którym obserwuje się tryplet o względnej intensywności sygnału 1:2:1. Większa intensywność środkowego sygnału jest spowodowana podwójną K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 210 degeneracją podpoziomu, charakteryzującego się zestawem liczb kwantowych: mI,1 = +1/2; mI,2 = -1/2 . Warto zwrócić uwagę, że w rodniku ·CH2OH jest jeden atom wodoru, który powinien powodować dalsze rozszczepianie się podpoziomów energetycznych (różnica w otoczeniu chemicznym powinna wpływać na wartość stałej sprzężenia nadsubtelnego). Proton z grupy hydroksylowej jest bardzo szybko wymieniany przez kationy wodorowe, znajdujące się w roztworze (pH = 1). W wyniku tego procesu nie obserwuje się struktury nadsubtelnej związanej z grupą OH. Gdyby proton z grupy hydroksylowej oddziaływał z elektronem byłoby to przyczyną dalszego rozszczepienia się podpoziomów energetycznych, co byłoby zaobserwowane na widmie EPR poprzez wzrost liczby składowych linii struktury nadsubtelnej. Na podstawie widma EPR rodnika ·CH2OH można wyznaczyć stałą sprzężenia nadsubtelnego, będącą miarą oddziaływania pomiędzy momentami magnetycznymi elektronu a wodoru w ·CH2OH. 𝐴′ jest równe odległości pomiędzy którąkolwiek z linii o względnej intensywności 1 oraz linią o względnej intensywności 2. Zgodnie z rysunkiem 6.1 stała sprzężenia nadsubtelnego jest równa A'H =1,92 mT. *** K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 211 Przy stałej wartości częstości promieniowania elektromagnetycznego (𝜈 = 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡) zarejestrowano widmo elektronowego rezonansu paramagnetycznego dla anionorodnika butadienowego (rysunek 6.3). Rys. 6.3. Wzór strukturalny anionorodnika butadienowego. Cząsteczka anionorodnika butadienowego) posiada dwie grupy protonów (𝐼=1/2). Cztery atomy wodoru połączone do terminalnych atomów węgla (1 i 4) posiadają takie same otoczenie chemiczne, dlatego stała sprzężenia nadsubtelnego będzie dla nich równa. Drugą grupę protonów stanowią dwa atomy wodoru połączone do drugiego i trzeciego atomu węgla. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 212 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… Rys. 6.4. Od góry: schemat rozszczepienia jednego z poziomów energetycznych anionorodnika butadienowego; względna intensywność poszczególnych linii EPR; widmo EPR dla anionorodnika butadienowego z zaznaczonymi wartościami stałych sprzężenia subtelnego. Zgodnie z rysunkiem 6.3 anionorodnik butadienowy posiada dwie nierównoważne grupy protonów. Wiedząc, że 𝐼1 = 𝐼2, a liczba równoważnych jąder w pierwszej K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 213 grupie jest równa n1 = 2, a w drugiej n2 = 4 można podać maksymalną teoretyczną liczbę linii struktury nadsubtelnej w spektroskopii elektronowego rezonansu paramagnetycznego: 𝑁 = ∏(2𝑛𝑖 𝐼𝑖 + 1) = (2 ∙ 4 ∙ 𝑖 1 1 + 1) (2 ∙ 2 ∙ + 1) = 3 ∙ 5 2 2 = 15 gdzie: 𝑁 − maksymalna liczba linii w strukturze nadsubtelnej 𝐼𝑖 − spin jądra 𝑛𝑖 − liczba równoważnych jader Liczba składowych struktury nadsubtelnej obliczona teoretycznie, zgadza się z liczbą obserwowaną na widmie EPR (rysunek 6.4). Widmo EPR dla anionorodnika butadienowego składa się z pięciu grup trypletów o intensywności 1:2:1 (kwintet trypletów). Atomy wodoru, przyłączone do drugiego i trzeciego atomu węgla, mają taką samą wartość stałej sprzężenia nasubtelnego, równą odległości pomiędzy pierwszą a drugą składową struktury nadsubtelnej w widmie EPR: 𝐴′𝐻2 = 𝐴′𝐻3 = 0,28 𝑚𝑇 Natomiast stała sprzężenia nadsubtelnego od drugiej grupy protonów, zgodnie ze schematem rozszczepienia K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 214 poziomów energetycznych anionorodnika butadienowego, jest równa odległości pomiędzy pierwszą a czwartą składową linii w widmie EPR (rysunek 6.4): 𝐴′𝐻1 = 𝐴′𝐻4 = 0,076𝑚𝑇 Jeżeli wartości stałych sprzężenia nadsubtelnego zostały wyznaczone poprawnie, to teoretycznie obliczona wartość długość widma EPR (czyli odległości pomiędzy dwoma skrajnymi składowymi linii struktury nadsubtelnej) powinna równać się wartości eksperymentalnej. W celu obliczenia długości widma EPR należy skorzystać z poniższego równania: 𝑟 1 1 𝐿 = ∑ 2𝑛𝑖 𝐼𝑖 𝐴′𝑖 = 2 ∙ 2 ∙ ∙ 0,28𝑚𝑇 + 2 ∙ 4 ∙ ∙ 0,76𝑚𝑇 2 2 𝑖=1 = 3,6 𝑚𝑇 gdzie: 𝐿 − długość widma EPR 𝐴′𝑖 − stała sprzężenia nadsubtelnego i tego jądra Wynik eksperymentalny jest zgodny z wynikiem teoretycznym, co potwierdza poprawne wyznaczenie stałych sprzężeń nadsubtelnych. Przy stałej *** wartości częstości promieniowania K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 215 elektromagnetycznego (𝜈 = 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑡) zarejestrowano widmo elektronowego rezonansu paramagnetycznego dla obojętnego rodnika 2,6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowego (rysunek 6.5). Rys. 6.5. Wzór strukturalny obojętnego rodnika ,6-di-tert-butylo-4aminofenoksylowego. Analizując wzór strukturalny rodnika ,6-di-tert-butylo-4aminofenoksylowego można zauważyć, że posiada on trzy grupy protonów, tylko dwie z nich biorą udział w oddziaływaniach nadsubtelnych. Gęstość elektronowa w cząsteczce rodnika fenylowego jest głównie zlokalizowana na 3 i 5 atomie węgla oraz na atomie azotu. Dlatego istnieje całkowity lub prawie całkowity zanik oddziaływania nadsubtelnego protonów, pochodzących z grup metylowych z elektronem zlokalizowany na atomie tlenu. Wkład w strukturę nadsubtelną w widmie EPR rodnika 6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowego dają tylko: atom azotu o spinie 𝐼 = 1, atomy wodoru grupy aminowej oraz protony dołączone do 3 i 5 atomu węgla (patrz rysunek 6.6). K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 216 Rys. 6.6. Od góry: schemat rozszczepienia jednego z poziomów energetycznych rodnika 6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowego; względna intensywność poszczególnych linii EPR; widmo EPR dla rodnika 6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowego z zaznaczonymi wartościami stałych sprzężenia subtelnego. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 217 Maksymalna liczba możliwych składowych linii w widmie EPR dla rodnika 6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowego jest równa: 𝑁 = ∏(2𝑛𝑖 𝐼𝑖 + 1) = (2 ∙ 2 ∙ 𝑖 1 1 + 1) ∙ (2 ∙ 2 ∙ + 1) ∙ 2 2 ∙ (2 ∙ 1 ∙ 1 + 1) = 3 ∙ 3 ∙ 3 = 27 Dokładnie 27 składowych linii obserwuje się dla tego rodnika (rysunek 6.6). W celu obliczenia stałej sprzężenia nadsubtelnego dla rodnika fenylowego od poszczególnych atomów należy zmierzyć odległość między: Pierwszą a piątą składową linii EPR dla atomu azotu z grupy aminowej: 𝐴′𝑁 𝑁𝐻3 = 0,43 𝑚𝑇 Pierwszą a czwartą składową linii EPR dla atomów wodoru z grupy aminowej: 𝐴′𝐻 𝑁𝐻3 = 0,39 𝑚𝑇 Pierwszą a drugą składową linii EPR dla atomów wodoru, przyłączonych do 3 i 5 atomu węgla pierścienia benzenowego: 𝐴′𝐻 3,5 = 0,06 𝑚𝑇 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 218 Przypisanie stałych sprzężeń do danego atomu lub grupy atomów zostało poparte symulacją komputerową widma EPR. Aby obliczyć teoretyczną długość widma EPR należy skorzystać z poniższego równania: 𝑟 𝐿 = ∑ 2𝑛𝑖 𝐼𝑖 𝐴′𝑖 = 2 ∙ 2 ∙ 𝑖=1 1 1 ∙ 0,06𝑚𝑇 + 2 ∙ 2 ∙ ∙ 0,39𝑚𝑇 + 2 2 + 2 ∙ 1 ∙ 1 ∙ 0.43𝑚𝑇 = 1,76 𝑚𝑇 W rodniku 6-di-tert-butylo-4-aminofenoksylowym atom tlenu nie oddziałuje z niesparowanym elektronem, co jest spowodowane naturą jądra atomowego izotopu 16O, które posiada spin 𝐼 = 0. Mimo to, widmo elektronowego rezonansu paramagnetycznego tego rodnika, cechuje wysoki stopień komplikacji, co jest powodem trudności jego interpretacji. Z powodu bardzo małej różnicy wartości stałych sprzężeń nadsubtelnych dla atomu azotu oraz atomów wodoru, pochodzących z grupy aminowej, dochodzi do nałożenia się składowych w centralnej części widma EPR. Bardzo pomocne w rozwiązywaniu złożonych problemów jest oprogramowanie komputerowe służące do symulowania widm EPR. Po wyznaczeniu z widm eksperymentalnych wartości stałych sprzężenia nadsubtelnego od danych jąder, można sprawdzić poprawność wyznaczonych parametrów. Na rysunku 6.7 przedstawiono dwa symulowane widma EPR dla układu odpowiadającemu rodnikowi 6-di-tert-butylo-4-aminofenoK. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 219 ksylowemu przy różnych wartościach stałych sprzężenia nadsubtelnego. Rys. 6.7. Symulowane widmo EPR rodnika 6-di-tert-butylo-4aminofenoksylowego dla różnych wartości stałych sprzężenia 𝐻 𝑁 𝑁 nadsubtelnego: a) 𝐴′𝑁𝐻 = 0,43 𝑚𝑇, 𝐴′𝑁𝐻 = 0,39 𝑚𝑇, 𝐴′3,5 = 0,06 𝑚𝑇; 3 3 𝐻 𝑁 𝐻 b) 𝐴′𝑁𝐻 = 0,75 𝑚𝑇, 𝐴′𝑁𝐻 = 0,32 𝑚𝑇, 𝐴′3,5 = 0,06 𝑚𝑇. 3 3 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 220 Symulowane widmo układu, w którym elektron oddziałuje z dwiema grupami (po dwa atomy) nierównocennych jąder atomowych o spinie 𝐼 = 1/2 oraz jednym jądrem atomowym o spinie 𝐼 = 1 ma taką samą postać jak widmo eksperymentalne (porównaj rysunek 6.6 i 6.7 a), co dowodzi poprawności wyznaczenia sprzężeń nadsubtelnych. 𝑁 𝑁 Różnica wartości stałych sprzężenia 𝐴′𝑁𝐻 i 𝐴′𝑁𝐻 jest 3 3 bardzo niewielka w przypadku widma EPR rodnika 6-ditert-butylo-4-aminofenoksylowego, co jest powodem nakładania się na siebie sygnałów. Zgodnie z rysunkiem 6.6 linie w widmie eksperymentalnym EPR rodnika fenylowego można podzielić na pięć grup. Zwiększenie 𝑁 𝑁 różnicy wartości stałych 𝐴′𝑁𝐻 i 𝐴′𝑁𝐻 powoduje rozdzielenie 3 3 sygnałów: na symulowanym widmie EPR (rysunek 6.7 b) 𝑁 𝑁 widać, że wzrost różnicy 𝐴′𝑁𝐻 − 𝐴′𝑁𝐻 jest 3 3 odpowiedzialny za separację składowych linii. Na modelowanym widmie z rysunku 6.7 b obserwuje się aż siedem grup sygnałów. *** Na rysunku 6.9 przedstawiono symulowane widmo EPR obojętnego rodnika nitroksydu di-tert-butylu, którego wzór strukturalny został przedstawiony na rysunku 6.8. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 221 Rys. 6.8. Wzór strukturalny obojętnego rodnika nitroksydu di-tertbutylowego. Niesparowany elektron w rodniku nitroksydu di-tertbutylu jest zlokalizowany na atomie tlenu (𝐼 = 0). Na elektron oddziałuje tylko moment jądra azotu o spinie 𝐼 = 1, ponieważ elektron nie kontaktuje się z protonami (gęstość ładunku wolnego elektronu jest zerowa na grupach tert-butylowych). Rys. 6.9. Izotropowe widmo EPR nitroksydu di-tert-butylu (przy założeniu oddziaływania tylko z atomem azotu o I = 1). Każda z linii odpowiada różnym orientacjom przestrzennym wektora 𝑰 ( 𝑚𝐼 = -1,0,1) K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 222 Z powodu braku oddziaływania protonów z niesparowanym elektronem w widmie EPR rodnika z rysunku 6.9 obserwuje się tylko trzy linie składowe (o takiej samej względnej intensywności 1:1:1). Jest to zgodne z przewidywaniami teoretycznymi: 𝑁 = ∏(2𝑛𝑖 𝐼𝑖 + 1) = 2 + 1 = 3 𝑖 Stała sprzężenia nadsubtelnego elektronu z jądrem azotu jest równa 𝐴′𝑁 = 1,51 𝑚𝑇, natomiast teoretyczna długość widma jest równa: 𝑟 𝐿 = ∑ 2𝑛𝑖 𝐼𝑖 𝐴′𝑖 = 2 ∙ 1 ∙ 1 ∙ 1,51 𝑚𝑇 = 3,02 𝑚𝑇 𝑖=1 Aby określić względną intensywność linii w strukturze nadsubtelnej dla n równocennych jąder o spinie 𝐼 = 1 można skorzystać ze schematu umieszczonego na rysunku 6.10. ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 223 n 1 1 1 1 1 2 3 2 1 1 3 6 7 6 2 1 4 10 16 19 16 10 4 2 3 4 1 1 Rys. 6.10. Trójkąt opisujący względne intensywności linii EPR dla układu składającego się z n równocennych jąder o spinie 𝐼 = 1. *** Spektroskopia EPR może służyć do badania rotacji paramagnetyków w ciele stałym. Przykładowo widmo EPR obojętnego rodnika cyklopentadienylowego (rysunek 6.11) zarówno w roztworze, jak i w ciele stałym jest sekstetem. Rys. 6.11. Wzór strukturalny obojętnego rodnika cyklopentylodienowego. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 224 Zgodnie z rysunkiem 6.11 rodnik ten posiada pięć równocennych protonów 𝐼 = 1/2, które oddziałują z niesparowanym elektronem, powodując, że widmo EPR jest sekstetem o stosunku intensywności sygnałów 1:5:10:10:5:1. Taka sama liczba sygnałów dla próbki w ciele stałym (pomiar przy 120 K; rysunek 6.12) oraz w fazie ciekłej świadczy o tym, że rodnik cyklopentylodienylowy w niskiej temperaturze ulega bardzo szybkiej rotacji, powodując, że wszystkie z protonów są równocenne. W związku z tym gęstość elektronowa niesparowanego elektronu w niskiej temperaturze jest równomiernie rozłożona na wszystkie atomy wodoru. Rys. 6.12. Od góry: schemat rozszczepienia jednego z poziomów energetycznych rodnika cyklopentadienowego; względna intensywność poszczególnych linii EPR; widmo EPR dla rodnika cyklopentadienowego z zaznaczoną wartością stałej sprzężenia. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 225 Liczba linii składowych w widmie rodnika cyklopentadienowego jest równa maksymalnej możliwej: 𝑁 = ∏(2𝑛𝑖 𝐼𝑖 + 1) = 2 ∙ 5 ∙ 𝑖 1 +1=6 2 Wyznaczono stałą sprzężenia nadsubtelnego, będącą odległością między pierwszą oraz drugą składową widma EPR 𝐴′𝐻 = 0,60 𝑚𝑇, a następnie długość widma EPR: 𝑟 𝐿 = ∑ 2𝑛𝑖 𝐼𝑖 𝐴′𝑖 = 2 ∙ 5 ∙ 𝑖=1 1 ∙ 0,60 𝑚𝑇 = 3,00 𝑚𝑇 2 Podobnie jak w przypadku układów zbudowanych z n równoważnych jąder o spinie 𝐼 = 1 dla jąder atomowych o spinie 𝐼 = 1/2 można zbudować trójkąt, opisujący względne intensywności poszczególnych składowych linii widma EPR (rysunek 6.13). Korzystanie z takiego trójkąta często ułatwia interpretację wyników pomiarowych. Bardzo łatwo można zbudować trójkąt przedstawiony na rysunku 6.13. Każda kolejna liczba w następnym wierszu jest obliczana z poprzednich, jako suma liczb przylegających. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 226 n 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7 8 1 1 8 3 5 7 6 15 1 4 10 20 35 56 1 3 10 21 28 2 4 6 1 5 15 35 70 1 1 6 21 56 1 7 28 1 8 1 Rys. 6.13. Trójkąt opisujący względne intensywności linii EPR dla układu składającego się z n równocennych jąder o spinie 𝐼 = 1/2. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 227 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………… 7 TABLICE 7.1. Tabele do rozdziału 1. Spektrometria mas a) masy atomowe izotopów dla pierwiastków najbardziej rozpowszechnionych izotop masa atomowa 1 1,007825 2 2,014102 H H 12 12,000000 13 13,003354 C C K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 228 14 14,003354 15 N 15,000108 16 O 15,994915 17 16,999133 18 17,999160 N O O 19 F 18,998405 28 Si 27,976927 29 28,976491 30 29,973761 Si Si 31 30,993763 32 31,972094 33 32,971461 34 33,967865 36 S 35,967090 35 Cl 34,968855 37 Cl 36,965896 79 Br 78,918348 81 80,916344 P S S S Br 127 I 126,904352 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 229 b) izotopy ważniejszych pierwiastków i ich rozpowszechnienie w przyrodzie rozpowszechnienie w przyrodzie odsetek w stosunku do izotopu najbardziej rozpowszechnionego odsetek w stosunku do wszystkich izotopów 1 100 99,985 2 0,016 0,015 12 100 98,89 13 1,08 1,11 14 100 99,63 15 N 0,36 0,37 16 O 100 99,79 17 0,04 0,037 18 0,20 0,204 19 F 100 100 28 Si 100 92,21 29 5,09 4,70 30 3,35 3,09 100 100 izotop H H C C N O O Si Si 31 P K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 230 32 100 95,0 33 0,80 0,76 34 S 4,44 4,22 35 Cl 100 75,33 37 Cl 32,40 24,47 79 Br 100 50,54 81 97,85 49,46 100 100 S S Br 127 I 7.2. Tabele do rozdziału 2. Spektroskopia ramanowska a) położenie pasma, pochodzenie oraz grupa związków, której dane dotyczą w spektroskopii ramanowskiej położenie pasma [cm-1] ~ 200 pochodzenie pasmo amidowe VI, drgania szkieletowe grupa związków białka K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 231 ~ 400 odkształcenia endocykliczne pierścienia węglowodany 510 – 540 odkształcenia egzocykliczne pierścienia węglowodany 540 – 600 pasmo amidowe VI, drganie zginające C=O białka 625 – 770 pasmo amidowe IV, drgania zginające O-C-N białka 640 – 800 pasmo amidowe V, drgania zginające N – H białka ~ 750 ugrupowania hemowe białka 760 tryptofan białka 820 tryptofan białka K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 232 830 – 850 δ(COH), δ(CCH), δ(OCH) węglowodany 850 tyrozyna białka 875 ν (C – C) lipidy 890 – 920 δ(COH), δ(CCH), δ(OCH) węglowodany 931 N – Cα – C (α-helisa) białka 1009 fenyloalanina białka 1066 ν (C – C) lipidy 1068 ν (C – C) lipidy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 233 1070 νs (PO2-) kwasy nukleinowe ~ 1080 ν(C-O), ν(C-C) węglowodany 1084 ν (C – C) lipidy 1110 ν(C-O), ν(C-C) węglowodany 1134 ν (C – C) lipidy 1135 ugrupowania hemowe białka 1230 – 1300 pasmo amidowe III, (40 – 60 %) drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H białka 1250 – 1350 δ(CH2), δ(CH2OH), węglowodany K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 234 1260 – 1270 δ(CH2) lipidy nienasycone 1300 τ (CH2) lipidy 1321 tryptofan (δ(Ca – H) białka 1340 tryptofan (δ(Ca – H) białka 1427 β (CH2) lipidy 1442 α (CH2 /CH3) lipidy 1467 β (CH2 /CH3) lipidy 1480 – 1575 pasmo amidowe II, 40 – 60 %) drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H białka K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 235 1544 tryptofan (pierścień indolowy) białka 1590 ugrupowania hemowe białka 1621 tyrozyna, tryptofan, fenyloalanina białka 1600 – 1700 pasmo amidowe I, (ok. 80%) drganie rozciągające C=O białka 1657 ν(C=C) lipidy nienasycone 1740 – 1750 ν(C=O) lipidy (estry) ~2850 νs (=CH2) lipidy 2880 – 2895 νas (=CH2) lipidy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 236 2925 νs (=CH3) lipidy 2967 νas (=CH3) lipidy 3012 ν(=CH) lipidy nienasycone ~ 3100 pasmo amidowe B, drganie rozciągające N-H białka ~ 3300 pasmo amidowe A, drganie rozciągające N-H białka ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 237 7.3. Tabele do rozdziału 3. Spektroskopia IR a) położenie pasma, pochodzenie oraz grupa związków której dane dotyczą w spektroskopii IR położenie pasma [cm-1] pochodzenie grupa związków ~ 200 pasmo amidowe VI, drgania szkieletowe białka 540 – 600 pasmo amidowe VI, drganie zginające C=O białka 616 drgania CH2 węglowodany 625 – 770 pasmo amidowe IV, drgania zginające O-C-N białka 640 – 800 pasmo amidowe V, drgania zginające N – H białka 698 δ(O-C=O) lipidy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 238 772 δ(CH2) lipidy 775 δ(CCO) + δ(CCH) węglowodany 838 δ(CH) węglowodany 913 ν(CO)+ ν(CCH) węglowodany 940 δ(COH) lipidy 994 ν(CO)+ ν(CC) węglowodany 1021 ν(CO) węglowodany 1055 cholesterol lipidy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 239 1098 δ(CH2) lipidy 1110 ν(CO) węglowodany 1146 ν(CO)+ ν(CC) węglowodany 1169 estry cholesterolu lipidy 1085 s(PO2-) fosfolipidy, kwasy nukleinowe 1188 δ(CH2) lipidy 1228 δ(CH2) lipidy 1230 – 1300 pasmo amidowe III, (40 – 60 %) drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H białka K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 240 1271 ν(C-OH) lipidy 1293 ν(C-OH) lipidy 1339 δ(CCH) + δ(OCH) węglowodany 1380 δ(OCH)+ δ(COH)+ δ(CCH) węglowodany 1411 δ(CH2) (drganie zginające) lipidy 1430 δ(COH) lipidy 1453 δ (CH2)+ δ(OCH)+ δ(CCH) węglowodany ~ 1465 δ(CH2) (drganie nożycowe) lipidy K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 241 1480 – 1575 1600 – 1700 pasmo amidowe II*, 40 – 60 %) drganie rozciągające C-N oraz drganie zginające N-H pasmo amidowe I*, (ok. 80%) drganie rozciągające C=O białka białka 1737 ν (C=O) (estry) lipidy 2847 νs(CH2) lipidy 2914 νas(CH2) lipidy 2954 νas(CH3) lipidy ~ 3100 pasmo amidowe B, drganie rozciągające N-H białka ~ 3300 pasmo amidowe A, drganie rozciągające N-H białka ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 242 7.4. Tabele do rozdziału 4. Spektroskopia UV-Vis a) przybliżone położenia pasm absorpcji izolowanych wiązań wielokrotnych między atomami węgla związek λmax [nm] RCH=CH2 177 trans RCH=CHR 180 cis RCH=CHR 183 RC≡CH 185 RC≡CR 196 R2C=CR2 200 b) przybliżone położenia pasm absorpcji izolowanych wiązań wielokrotnych między atomami węgla związek λmax [nm] CH3(CH≡CH)3CH3 207 CH3(CH≡CH)4CH3 234 CH3(CH≡CH)5CH3 261 CH3(CH=CH)3CH3 275 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 243 CH3(CH≡CH)6CH3 284 CH3(CH=CH)4CH3 310 CH3(CH=CH)5CH3 342 CH3(CH=CH)6CH3 380 7.5. Tabele do rozdziału 5. Spektroskopia NMR a) zakresy przesunięć funkcyjnych 1H NMR chemicznych niektórych grup grupa funkcyjna przesunięcie chemiczne [ppm] -CH3 0,8 – 1,8 -CH2- 1,0 – 2,3 -CH- 2,0 – 3,2 X-CH3 2,1 – 4 ≡C-H 1,7 – 3,2 -CHX 3,1 – 4,8 RCOCH3 3,3 – 4 ArOCH3 3,7 – 4 -COOCH3 3,8 – 4,1 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 244 -C=CH- 5,0 – 7,1 Ar-H 6,8 – 8,1 -CHO 8,8 – 10,1 -COOH 10,9 – 13,2 b) zakresy przesunięć chemicznych funkcyjnych 13C NMR niektórych grup grupa funkcyjna przesunięcie chemiczne [ppm] Alkany 5 - 75 R3-C-O- 50 - 90 -C≡C- 70 - 95 >C=C< 95 – 150 -C≡N 100 – 120 Związki aromatyczne 110 – 175 R-COOH 150 – 180 >C=O 185 - 225 >C=C=C< 200 - 220 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 245 7.6. Tabele do rozdziału 6. Spektroskopia EPR a) spin jądrowy, wartość czynnika gN i izotropowego sprzężenia nadsubtelnego 𝐴′ (10-4 cm-1) oraz naturalna zawartość izotopowa (abundancja izotopu) dla wybranych jąder jądro 1 H 2 H 7 Li 9 Be 10 B 11 B 13 C 14 N 15 N 17 O 19 F 23 Na 27 Al 29 Si 31 P 35 Cl 37 Cl spin (I) 1/2 1 3/2 3/2 3 3/2 1/2 1 1/2 5/2 1/2 3/2 5/2 1/2 1/2 3/2 3/2 gN 5,5854 0,8574 2,1707 -0,7849 0,6002 1,7920 1,108 0,4036 -0,5661 -0,7572 5,2546 0,4322 1,4554 -1,1095 2,2610 0,5473 0,4555 A'/10-4 cm-1 473,7 72,7 134,1 -119,4 224,2 673,8 1037,4 513,7 -720,5 -1543,7 15981,1 295,5 916 -1127,8 3395 1555,7 1294,2 abudancja % 99,985 0,015 92,58 100 19,91 80,89 1,108 99,63 0,37 0,037 100 100 100 4,67 100 75,53 24,47 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 246 39 K Ti 51 V 55 Mn 57 Fe 59 Co 3/2 5/2 7/2 5/2 1/2 7/2 0,2606 -0,3148 1,4683 1,3844 0,25 1,3254 77,1 -164,1 871,6 1021,7 150 1,3254 93,1 7,26 99,76 100 2,18 100 61 3/2 -0,167 -504 1,19 63 3/2 3/2 5/2 3/2 1/2 3/2 3/2 9/2 5/2 5/2 1/2 1/2 1,4804 1,5860 0,3494 0,9566 1,0667 1,3993 1,5084 1,3652 -0,3640 -0,3716 -0,226 -0,2598 1651,8 1769,6 417,3 3196,2 4492,4 7251 7816,1 -1176,8 -1201,2 -1174,1 -1348,9 69,09 30,91 4,11 100 7,58 50,54 49,46 100 15,72 9,46 51,28 48,18 47 Ni Cu Cu 67 Zn 75 As 77 Se 79 Br 81 Br 93 Nb 95 Mo 95 Mo 107 Ag 109 Ag 65 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 247 b) wartości stałych sprzężenia struktury nadsubtelnej (dla atomu wodoru) i gęstości spinowe (cX) dla wybranych jonorodników węglowodorowych, posiadających sprzężony układ wiązań chemicznych (𝐴′𝑋− ; 𝐴′𝑋+ - wartości kolejno dla anionorodnika i kationorodnika; X-numer atomu wodoru w strukturze) węglowodór X (nr at. H) 𝑨′− 𝑿 𝑨′+ 𝑿- cH 1 0,375 - 0,167 1 0,495 - 0,181 2 0,183 - 0,069 1 0,360 - 0,116 2 0,032 - 0,002 3 0,288 - 0,099 4 0,072 - 0,054 9 0,432 - 0,172 K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 248 1 0,274 0,306 0,097 2 0,151 0,138 0,048 9 0,534 0,653 0,193 2 0,273 - 0,090 3 0,043 - 0,020 4 0,564 - 0,158 1 0,475 0,538 - 2 0,109 0,118 - 4 0,208 0,218 0,087 1 0,321 - 0,125 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 249 c) oznaczanie, wartość częstości promieniowania elektromagnetycznego, odpowiadające im indukcja pola magnetycznego przy wartości czynnika 𝑔=2.000 i wybrane zastosowania pasm dostępnych w handlowych spektroskopach elektronowego rezonansu paramagnetycznego oznaczenie pasma 𝝂/𝑮𝑯𝒛 𝑩/𝒎𝑻 zastosowanie L 1,5 54 niewielkie zwierzęta, próbki wodne o bardzo dużych rozmiarach S 3,0 110 uwodnione próbki biologiczne X 9,5 340 roztwory; proszki K 24 900 kompleksy; metale przejściowe, Q 35 1250 niewielkie próbki zawierające wode W 95 3400 G 135 4800 wysokospinowe kompleksy metali przejściowych najwyższa czułość, bardzo małe ilości próbki K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 250 d) izotropowe stałe sprzężenia (mT) oraz wartość czynnika g dla rodników fluorometylowych otrzymanych przez naświetlenie próbek w środowisku gazu szlachetnego. rodnik CH3∙ CH2F∙ CHF2∙ CF3∙ e) 𝑨′𝑪 /𝐦𝐓 3,85 5,48 14,88 27,16 𝑨′𝑭 /𝐦𝐓 6,43 8,42 14,24 g 2,0026 2,0045 2,0041 2,0031 izotropowe stałe sprzężenia nadsubtelnego -4 -1 (10 ∙cm ) oraz wartość czynnika g0 dla atomów wodoru uzyskanych w różnych ośrodkach ośrodek H (gazowy) Ne Ar Kr HClO4 CaF2 f) 𝑨′ 𝑯 /𝐦𝐓 2,30 2,11 2,22 - T [K] 4 4 4 77 300 𝑨′ /𝐦𝐓 473,8 475,8 471,6 470,9 469,4 487,1 g 2,00226 2,00207 2,00220 2,00179 2,0022 2,00247 izotropowe stałe sprzężenia nadsubtelnego (mT), wartość czynnika g0, procentowy udział centrów magnetycznych względem wzorca dla klasterów wybranych metali pierwszej grupy, srebra i wodoru w zeolitach różnego typu K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 251 klaster Na43+ Na32+ Na45+ Na65+ Ag6x+ Ag4x+ K32+ Na2+ zeolit Y X,A X X A rho A X A g0 2,0002 2,0028 2,0022 2,0022 1,999 1,973 1,9992 2,0063 1,9983 𝑨′ /𝐦𝐓 3,32 4,50 2,50 2,50 6,66 14,0 1,28 8,5 10,0 [𝒏𝑨/𝑨𝟎 ]·100% 32–40 63–38 40 45 56 79 47 74 64–46 ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 252 8 Bibliografia 8.1. Bibliografia do rozdziału 1. Spektrometria mas CYGAŃSKI, Andrzej. Metody spektroskopowe w chemii analitycznej, Wydawnictwo WNT, 2013. DE HOFFMANN, Edmond; CHARETTE, Jean Joseph; STROOBANT, Vincent. Spektrometria mas, Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, 1998. DE HOFFMANN, Edmond. Mass spectrometry, John Wiley & Sons, Inc., 1996. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 253 GROSS, Jürgen H., Mass spectrometry: a textbook, Springer Science & Business Media, 2004. JOHNSTONE, R., Rose M., Spektrometria mas, PWN, Warszawa, 2001 MCMURRY, J., Chemia organiczna, t.2, Wydawnictwo Naukowe PWN, WARSZAWA, 2007. SUDER, P; SILBERRING J., Spektrometria Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, 2006. mas, VOGEL, Arthur Israel, Preparatyka organiczna, WNT, 2006. WATSON, J. Throck; SPARKMAN, O. David, Introduction to mass spectrometry: instrumentation, applications, and strategies for data interpretation, John Wiley & Sons, 2007. 8.2. Bibliografia do rozdziału 2. Spektroskopia ramanowska ALMOND, L. Max, HUTCHINGS, Joanne, LLOYD, Gavin, BARR, Hugh, SHEPHERD, Neil, DAY, John, STEVENS, Oliver et al., Endoscopic Raman spectroscopy enables objective diagnosis of dysplasia in Barrett's esophagus, Gastrointestinal endoscopy, 2014, 79.1: 37-45. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 254 ALMOND, L. Max, HUTCHINGS, Joanne, SHEPHERD, Neil, BARR, Hugh, STONE, Nick, KENDALL, Catherine, Raman spectroscopy: a potential tool for early objective diagnosis of neoplasia in the oesophagus, Journal of Biophotonics, 2011, 4.10: 685-695. BARANSKA, Malgorzata, KACZOR, Agnieszka, MALEK, Kamilla, JAWORSKA, Aleksandra, MAJZNER, Katarzyna, STANISZEWSKA-SLEZAK, Emilia, PACIA, Marta Z., ZAJAC, Grzegorz, DYBAS, Jakub, WIERCIGROCH, Ewelina, Raman microscopy as a novel tool to detect endothelial dysfunction, Pharmacological Reports, 2015, DOI: 10.1016/j.pharep.2015.03.015. BARAŃSKA, Małgorzata, Optical Spectroscopy and Computational Methods in Biology and Medicine, Springer, Series: Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, 2013, ISBN 978-94-007-7831-3. BONNIER, Franck, KNIEF, LIM, Peter, B., MEADE, Aidan D., DORNEY, J., BHATTACHARYA, Kunal, LYNG, Fiona M., BYRNE, Hugh J, Imaging live cells grown on a three dimensional collagen matrix using Raman microspectroscopy, Analyst, 2010, 135.12: 3169-3177. BONNIER, Franck, MEHMOOD, A., KNIEF, Peter, MEADE, Aidan D., HORNEBECK, W., LAMBKIN, H., FLYNN, K., et al., In vitro analysis of immersed human tissues by Raman K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 255 microspectroscopy, Journal of Raman spectroscopy, 2011, 42.5: 888-896. CZAMARA, Krzystof, MAJZNER, Katarzyna, PILARCZYK, Marta, KOCHAN, Kamila, KACZOR, Agnieszka, BARANSKA, Małgorzata, Raman spectroscopy of lipids: a review, J. Raman Spectr., 2015, 46.1: 4 – 20. DUESBERG, G. S., BLAU, W. J., BYRNE, Hugh J., MUSTER, J., BURGHARD, M., ROTH, S., Experimental observation of individual single-wall nanotube species by Raman microscopy, Chemical physics letters, 1999, 310.1: 8-14. FAOLAIN, Eoghan Ó., HUNTER, Mary B, BYRNE, Joe M, KELEHAN, Peter, LAMBKIN, Helen A., BYRNE, Hugh J., BYRNE, LYNG, Fiona M., Raman spectroscopic evaluation of efficacy of current paraffin wax section dewaxing agents, Journal of Histochemistry & Cytochemistry, 2005, 53.1: 121129. KNIEF, Peter, CLARKE, Colin, HERZOG, Eva, DAVOREN Maria, LYNG, Fiona M., MEADE, Aidan D., BYRNE Hugh J., Raman spectroscopy–a potential platform for the rapid measurement of carbon nanotube-induced cytotoxicity, Analyst, 2009, 134.6: 1182-1191. KOCHAN, Kamila, MARZEC, Katarzyna, CHRUSZCZLIPSKA, Katarzyna, JASZTAL, Agnieszka, MAŚLAK, Edyta, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 256 MUSIOLIK, Hanna, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Małgorzata, Pathological changes in biochemical profile of liver in atherosclerosis and diabetes assessed by Raman spectroscopy, Analyst, 2013, 138: 3885-3890. KOCHAN, Kamila, MARZEC, Katarzyna, MASLAK, Edyta, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Malgorzata, Raman spectroscopic studies of vitamin A content in the liver: a biomarker of healthy liver, Analyst, 2015, 140: 2074-2079. KOCHAN, Kamila, MAŚLAK, Edyta, KRAFFT, Christoph, KOSTOGRYS, Renata, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Małgorzata, Raman spectroscopy analysis of lipid droplets content, distribution and saturation level in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease in mice, J. Biophotonics, 2014, DOI: 10.1002/jbio.201400077. KRAFFT, Christoph, DIETZEK, Benjamin, POPP, Jürgen, Raman and CARS microspectroscopy of cells and tissues, Analyst, 2009, 134. 6: 1046-1057. KRAFFT, Christoph, KNETSCHKE, Thomas, FUNK Richard H.W., SALZER, Reiner, Studies on stress-induced changes at the subcellular level by Raman microspectroscopic mapping, Analytical chemistry, 2006, 78.13: 4424-4429. KRAFFT, Christoph, NEUDERT, Lars, SIMAT, Thomas, SALZER, Reiner, Near infrared Raman spectra of human brain lipids Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 257 Spectroscopy, 2005, 61.7: 1529-1535. KRAFFT, Christoph, POPP, Jurgen, The many facets of Raman spectroscopy for biomedical analysis, Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2014, DOI: 10.1007/s00216-0148311-9. KRAFFT, Christoph, STEINER, Gerald, BELEITES, Claudia, SALZER, Reiner, Disease recognition by infrared and Raman spectroscopy, Journal of Biophotonics, 2009, 2.1‐2: 13-28. KRAFFT, Chritopch, SERGO, Valter, Biomedical applications of Raman and infrared spectroscopy to diagnose tissues, Journal of Spectroscopy, 2006, 20.5-6: 195-218. MAJZNER, Katarzyna, KACZOR, Agnieszka,, KACHAMAKOVA-TROJANOWSKA, Neli, FEDOROWICZ, Andrzej, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Malgorzata, 3D confocal Raman imaging of endothelial cells and vascular wall: perspectives in analytical spectroscopy of biomedical research, Analyst, 2013, 138.2: 603-610. MARZEC, Katarzyna M., RYGULA, Anna, GASIOR – GLOGOWSKA, Marlena, KOCHAN, Kamila, CZAMARA, Krzysztof, BULAT, Katarzyna, MALEK, Kamilla, KACZOR, Agnieszka, BARANSKA, Malgorzata, Vascular diseases investigated ex vivo by using Raman, FT-IR and complementary methods, Pharmacological Reports, 2015, DOI: K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 258 10.1016/j.pharep.2015.05.001. MEADE, Aidan D., LYNG, Fiona M., KNIEF, Peter, BYRNE, HUGH, J., Growth substrate induced functional changes elucidated by FTIR and Raman spectroscopy in in–vitro cultured human keratinocytes, Analytical and bioanalytical chemistry, 2007, 387. 5: 1717-1728. SATTLECKER, Martina, BESSANT, Conrad, SMITH, Jennifer, STONE, Nick, Investigation of support vector machines and Raman spectroscopy for lymph node diagnostics, Analyst 2010, 135, no. 5: 895-901. WOOD, Bayden R., MCNAUGHTON, Don, Raman excitation wavelength investigation of single red blood cells in vivo, Journal of Raman Spectroscopy, 2002, 33.7:517-523. WOOD, Bayden R., TAIT Brian, MCNAUGHTON, Donald, Micro-Raman characterisation of the R to T state transition of haemoglobin within a single living erythrocyte, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research, 2001, 1539. 1: 58-70. 8.3. Bibliografia do rozdziału 3. Spektroskopia IR BAKER, Matthew J., GAZI, Ehsan, BROWN, Michael D., SHANKS, Jonathan H., GARDNER, Peter, CLARKE, Noel K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 259 W., FTIR-based spectroscopic analysis in the identification of clinically aggressive prostate cancer, British Journal of Cancer, 2008, 99.11: 1859-1866. BASSAN, Paul, BYRNE, Hugh J., LEE, Joe, BONNIER, Franck, CLARKE, Colin, DUMAS, Dumas, GAZI, Ehsan, BROWN, Michael D., CLARKE, Noel W., GARDNER, Peter, Reflection contributions to the dispersion artefact in FTIR spectra of single biological cells, Analyst, 2009, 134.6: 11711175. BASSAN, Paul, KOCHLER, Achim, MARTENS, Harald, LEE, Joe, BYRNE, Hugh J., DUMAS, Paul, GAZI, Ehsan, BROWN, Michael, CLARKE, Noel, GARDNER, Peter, Resonant Mie scattering (RMieS) correction of infrared spectra from highly scattering biological samples, Analyst, 2010, 135.2: 268-277. BEEKES, Michael, LASCH, Peter, NAUMANN, Dieter, Analytical applications of Fourier transform-infrared (FT-IR) spectroscopy in microbiology and prion research, Veterinary microbiology, 2007, 123.4 : 305-319. BIRD, Benjamin, MILJKOVIC, Milos, ROMEO, Melissa J., SMITH, Jennifer, STONE, Nicholas, GEORGE, Michael W., DIEM, Max, Infrared micro-spectral imaging: distinction of tissue types in axillary lymph node histology, BMC Clinical Pathology, 2008, 8.1: 8. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 260 DIEM, Max, BOYDTON-WHITE, Susie, CHIRIBOGA, Luis, Infrared spectroscopy of cells and tissues: shining light onto a novel subject, Applied Spectroscopy, 1999, 53: 148A-161A. GAZI, Ehsan, DWYER, John, GARDNER, Peter, GHANABARI-SIAHKALI, A., WADE, A. P., MIYAN, J., LOCKYER, Nicholas P., Applications of Fourier transform infrared microspectroscopy in studies of benign prostate and prostate cancer. A pilot study, The Journal of Pathology, 2003, 201.1: 99-108. GIORDANO, Mario, KANISZ, Mustafa, HERAUD, Philip, BEARDALL, JohN, WOOD, Bayden, MCNAUGHTON, Don, Fourier transform infrared spectroscopy as a novel tool to investigate changes in intracellular macromolecular pools in the marine microalga Chaetoceros muellerii (Bacillariophyceae), Journal of Phycology, 2001, 37.2: 271-279. GRIFFITS, Peter R., CHALMERS, John M., Vibrational spectroscopy for medical diagnosis. Vol. 40. Chichester: Wiley, 2008, ISBN: 978-0-470-01214-7. HERAULD, Philip, WOOD, Bayden R., TOBIN, Mark J., BEARDALL, John, MCNAUGHTON, Don, Mapping of nutrient-induced biochemical changes in living algal cells using synchrotron infrared microspectroscopy, FEMS Microbiology Letters, 2005, 249.2: 219-225. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 261 KANISZ, Mustafa, HERAUD, Philip, WOOD, Bayden, BURDEN, Frank, BEARDALL, John, MCNAUGHTON, Don, Fourier transform infrared microspectroscopy and chemometrics as a tool for the discrimination of cyanobacterial strains, Photochemistry, 1999, 52.3: 407-417. KOCHAN, Kamila, HERAUD, Philip, M. Kiupele, V. Yuzbasiyan-Gurkan, D. MCNAUGHTON, M. BARANSKA, B.R. WOOD, Comparison of FTIR transmission and transfection substrates for canine liver cancer detection, Analyst, 2015, 140.7: 2402-2411. KOCHAN, Kamila, MASLAK, Edyta, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Małgorzata, FT-IR imaging for quantitative determination of liver fat content in Non-Alcoholic Fatty Liver, Analyst, 2015, DOI: 10.1039/C5AN00737B. LASCH, Peter, BOESE, Matthias, PACIFICO, Anthony, DIEM, Max, FT-IR spectroscopic investigations of single cells on the subcellular level, Vibrational spectroscopy, 2002, 28.1: 147-157. LASCH, Peter, HAENSCH, Wolfgang, NAUMANN, Dieter, DIEM, Max, Imaging of colorectal adenocarcinoma using FTIR microspectroscopy and cluster analysis, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Basis of Disease, 2004, 1688.2: 176-186. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 262 LASCH, Peter, NAUMANN, Dieter, FT-IR microspectroscopic imaging of human carcinoma thin sections based on pattern recognition techniques, Cellular and Molecular Biology, 1998, 44.1: 189-202. LASCH, Peter, NAUMANN, Dieter, Infrared spectroscopy in microbiology, Encyclopedia of analytical chemistry, Chichester: Wiley, 2000, DOI: 10.1002/9780470027318.a0117. LASCH, Peter, PACIFICO, Anthony, DIEM, Max, Spatially resolved IR microspectroscopy of single cells, Biopolymers, 2002, 67.4‐5: 335-338. MAJZNER, Katarzyna, WROBEL, Tomasz, FEDOROWICZ, Andrzej, CHLOPICKI, Stefan, BARANSKA, Małgorzata, Secondary structure of proteins analyzed ex vivo in vascular wall in diabetic animals using FT-IR spectroscopy, Analyst, 2013, 138 .24: 7400-7410. MATTHAUS, Christian, BOYDSTON-WHITE, Susie, MILJKOVIC, Miloš, ROMEO, Melissa, DIEM., Max, Raman and infrared microspectral imaging of mitotic cells, Applied Spectroscopy, 2006, 60.1: 1-8. PEREZ-GUAITA, David, HERAUD, Philip, MARZEC, Katarzyna M., GUARDIA, M. KIUPEL, M. WOOD, Bayden R., Comparison of transflection and transmission FTIR imaging measurements performed on differentially fixed tissue sections, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 263 Analyst, 2015, 140: 2376-2382. STANISZEWSKA, Emilia, MALEK, Kamilla, BARANSKA, Małgorzata, Rapid approach to analyse biochemical variation in rat organs by ATR FTIR spectroscopy, Spectrosc. Chim. Acta A, 2014, 118: 981-986. STANISZEWSKA, Emilia, MALEK, Kamilla, KASZOWSKA, Zofia , Studies on paint cross sections of a glass painting by using FT-IR and Raman microspectroscopy supported by univariate and Hierarchical Cluster analysis, J. Raman Spectrosc., 2013, 44.8: 1144-1155. STANISZEWSKA-ŚLĘZAK, Emilia, MALEK, Kamilla, BARANSKA, Complementary analysis of tissue homogenates composition obtained by Vis and NIR laser excitations and Raman spectroscopy, Spectrochimica Acta A, 2015, 147: 245256. TOBIN, Mark J., PUSKAR, Ljiljana, BARBEL, Richard L., HARVEY, Erol C., HERAUD, Philip, WOOD, Baydern R., BAMBERY, Keith R., DILLON, Carolyn T., MUNRO, Kristie L., FTIR spectroscopy of single live cells in aqueous media by synchrotron IR microscopy using microfabricated sample holders, Vibrational Spectroscopy, 2010, 53.1: 34-38. WOOD, Bayden R., QUINN, Michael A., BURDEN, Frank R., MCNAUGHTON, Donald, An investigation into FTIR K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 264 spectroscopy as a biodiagnostic tool for cervical cancer, Biospectroscopy, 1996, 2.3: 143-153. WOOD, Bayden R., QUINN, Michael A., TAIT, Brian, ASHDOWN, Martin, HISLOP, Tracy, ROMEO, Melissa, MCNAUGHTON, Don, FTIR microspectroscopic study of cell types and potential confounding variables in screening for cervical malignancies, Biospectroscopy, 1998, 4.2: 75-91. 8.4. Bibliografia do rozdziału 4. Spektroskopia UVVis CYGAŃSKI, Andrzej, Metody spektroskopowe w chemii analitycznej, Wydawnictwo WNT, 2013. HULANICKI, Adam (ed.), Podstawy chemii analitycznej, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2007. JUROWSKA, Anna, SZKLARZEWICZ, Janusz, KURPIEWSKA, Katarzyna, TOMECKA, Monika, Diverse coordination of Schiff bases based on 2-(aminomethyl) pyridine or 2-acetylpyridine at Mo (IV) centre: Synthesis, crystal structures and physicochemical properties, Polyhedron, 2014, 75: 127-134. JUROWSKA, Anna, SZKLARZEWICZ, Janusz, HODOROWICZ, Maciej, TOMECKA, Monika, LIPKOWSKI, Janusz, NITEK, Wojciech, N-substituted monodentate alcohols K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 265 as ligands modifying structure, properties and thermal stability of Mo (IV) complexes, Journal of Molecular Structure, 2015, 1081: 6-13. RYNIEWICZ, Anna, TOMECKA, Monika, SZKLARZEWICZ, Janusz, MATOGA, Dariusz, Nucleophically transformed Nheterocyclic nitriles trapped by cyanooxomolybdates (IV): Crystallographic and spectroscopic study, Polyhedron, 2012, 45.1: 229-237. SZCZEPANIAK, W. Metody instrumentalne w analizie chemicznej, 2011. Wydawnictwo Naukowe PWN. VOGEL, Arthur Israel. Preparatyka organiczna, WNT, 2006. 8.5. Bibliografia do rozdziału 5. Spektroskopia NMR AIRES-DE-SOUSA, João, HEMMER, Markus C., GASTEIGER, Johann, Prediction of 1H NMR chemical shifts using neural networks, 2002, Analytical chemistry, 74.1: 80-90. ATKINS, Peter William, Chemia fizyczna, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2007. ATKINS, Peter William, Podstawy Wydawnictwo Naukowe PWN, 1999. BANFI, Damiano, PATINY, Luc, chemii www. fizycznej, nmrdb. org: K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 266 Resurrecting and Processing NMR Spectra On-line. CHIMIA International Journal for Chemistry, 2008, 62.4: 280-281. BINEV, Yuri, AIRES-DE-SOUSA, João, Structure-based predictions of 1H NMR chemical shifts using feed-forward neural networks, Journal of chemical information and computer sciences, 2004, 44.3: 940-945. BINEV, Yuri, CORVO, Marta, AIRES-DE-SOUSA, João, The impact of available experimental data on the prediction of 1H NMR chemical shifts by neural networks, Journal of chemical information and computer sciences, 2004, 44.3: 946-949. CASTELLANO, S., KOSTELNIK, R, NMR spectral parameters of Ortho-disubstituted benzenes. Investigation of the additivity of substituent effects on the proton-proton coupling constants. Tetrahedron Letters, 1967, 8.51: 5211-5216. CASTILLO, Andrés M., PATINY, Luc, WIST, Julien, Fast and accurate algorithm for the simulation of NMR spectra of large spin systems, Journal of Magnetic Resonance, 2011, 209.2: 123-130. CRECELY, R. W., et al., dihalobenzenes and substituent coupling effects, Spectrochimica Acta Part A: Molecular Spectroscopy, 1968, 24.6: 685-694. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 267 EJCHART, A., GRYFF-KELLER, A., Wpływ częściowego uporządkowania orientacji cząsteczek na ich widma NMR dużej zdolności rozdzielczej, Wiadomości Chemiczne, 2000, 949-969. HAYAMIZU, Kikuko, YAMAMOTO, Osamu, The analysis of the proton magnetic resonance spectra of monosubstituted benzenes: The ring proton chemical shifts at infinite dilution, Journal of Molecular Spectroscopy, 1968, 28.1: 89100. KARPLUS, Martin, Vicinal proton coupling in nuclear magnetic resonance, Journal of the American Chemical Society, 1963, 85.18: 2870-2871. KĘCKI, Zbigniew, Podstawy spektroskopii Wydawnictwo Naukowe PWN, 2013. molekularnej, MILLER, Bernard, KALNINS, Malda V., Reactions of halogenated acrylonitrile derivatives with arylsulfinate salts: A novel chain shortening reaction, Tetrahedron, 1967, 23.3: 11451152. PIGOŃ, K., RUZIEWICZ, Z., Chemia fizyczna, 2007, 2. SHEPPARD, N., TURNER, J. J., High-resolution nuclearmagnetic-resonance spectra of hydrocarbon groupings. II. Internal rotation in substituted ethanes and cyclic ethers, Proceedings of the Royal Society of London A: Mathematical, K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 268 Physical and Engineering Sciences. The Royal Society, 1959, p. 506-519. Wybrane metody spektroskopii i spektrometrii molekularnej w analizie strukturalnej. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, 2005. 8.6. Bibliografia do rozdziału 6. Spektroskopia EPR ANDERSON, P. A., et al., Structure and Electronic Properties of Potassium-Loaded Zeolite L, The Journal of Physical Chemistry B, 1997, 101.48: 9892-9900. BOLTON, J. R., CARRINGTON, A., DOS SANTOS-VEIGA, J., Analysis of high resolution electron spin resonance spectra: A reinterpretation of the Wurster's Blue ion spectrum, Molecular Physics, 1962, 5.6: 615-619. BOLTON, James R., FRAENKEL, George K., Electron spin resonance study of the pairing theorem for alternant hydrocarbons: 13C splittings in the anthracene positive and negative ions, The Journal of Chemical Physics, 1964, 40.11: 3307-3320. GERSON, F., WEIDMANN, B., HEILBRONNER, E., Eine Neuaufnahme* der ESR.‐Spektren der Radikal‐Anionen symmetrisch substituierter Dimethylnaphtaline. Helvetica Chimica Acta, 1964, 47.7: 1951-1961. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 269 GLARUM, Sivert H., SNYDER, Lawrence C., Electron Spin Resonance of the Phenanthrene Negative Ion, The Journal of Chemical Physics, 1962, 36.11: 2989-2990. HALL, J. L., SCHUMACHER, R. T., Electron Spin Resonance of Hydrogen Atoms in CaF2, Physical Review, 1963, 131.6: 2839. JEN, C. K., FONER, S. N., COCHRAN, E. L., BOWERS, V. A., Electron spin resonance of atomic and molecular free radicals trapped at liquid helium temperature, Physical Review, 1958, 112.4: 1169. KASAI, P.H., BISHO,,P.R.J ,RABO, J.A., Zeolite Chemistry and Catalysis. ACS Monograph 171, American Chemical Society, Washington, DC, 1976, p 350. KIRMSE, Reinhard, STACH, Joachim, ESR-Spektroskopie: Anwendungen in der Chemie. Wiss. Taschenb@: ucher, 1985. LAWLER, R. G., BOLTON, J. R., FRAENKEL, G. K., BROWN, T. H., Orbital Degeneracy and the electron spin resonance spectrum of the benzene-1-d negative Ion, Journal of the American Chemical Society, 1964, 86.3: 520-521. LEWIS, I. Co, SINGER, L. S., Electron spin resonance of radical cations produced by the oxidation of aromatic hydrocarbons with SbCl5, The Journal of Chemical Physics, 1965, 43.8: 2712-2727. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 270 LIVINGSTON, Ralph, ZELDES, Henry, TAYLOR, Ellison H., Paramagnetic resonance studies of atomic hydrogen produced by ionizing radiation, Discussions of the Faraday Society, 1955, 19: 166-173. MONTES, C., DAVIS, M. E., MURRAY, B., NARAYANA, M., Isolated redox centers within microporous environments. Cobalt-containing aluminophosphate molecular sieve five, Journal of Physical Chemistry, 1990, 94.16: 6425-6430. RAO, P.R., HARI, PRASAD, et al., Studies on Crystalline Microporous Vanadium Silicates: II. FTIR, NMR, and ESR Spectroscopy and Catalytic Oxidation of Alkylaromatics over VS-2, Journal of Catalysis, 1993, 141.2: 595-603. SCHOONHEYDT, Robert A., LEEMAN, Hugo, Formation of the silver hexameric (Ag6x+) cluster in zeolite A, The Journal of Physical Chemistry, 1989, 93.5: 2048-2053. SCHOONHEYDT, Robert A., Transition metal ions in zeolites: siting and energetics of Cu2+, Catalysis Reviews—Science and Engineering, 1993, 35.1: 129-168. STRAUSS, Herbert L., KATZ, Thomas J., FRAENKEL, George K., Electron spin resonance studies of the cyclooctatetraenyl anions, Journal of the American Chemical Society, 1963, 85.16: 2360-2364. K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 271 XU, Bo, KEVAN, Larry, Formation of silver ionic clusters and silver metal particles in zeolite rho studied by electron spin resonance and far-infrared spectroscopies, The Journal of Physical Chemistry, 1991, 95.3: 1147-1151. ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… K. Jurowski, K. Kochan, A. Jurowska, G. Zając, K. Roztocki, Interpretacja widm spektroskopowych i spektrometrycznych okiem młodych naukowców, Scientiae et Didactics, 2015, ISBN 978-83-941637-2-3 Od recenzenta dr Aleksandra Jaworska Od wydawnictwa Wydawnictwo Scientiae et Didactics przekazuje Czytelnikom pierwszą w Polsce monografię, w której przedstawiono dogłębny opis różnorodnych zagadnień związanych z interpretacją widm spektroskopowych oraz spektrometrycznych. W pracy zawarto bardzo wiele widm oraz autorskie strategie przydatne w interpretacji, które nadają wysokie walory dydaktyczne. Na końcu monografii znajduje się przydatny spis tabel ułatwiających interpretację widm. Monografia ta została napisana przez młodych naukowców – doktorantów Wydziału Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie. Książka adresowana jest zarówno do studentów wydziałów chemicznych uniwersytetów oraz politechnik, a także innych kierunków stykających się z opisywanymi technikami spektroskopowymi oraz spektrometrią mas. www.scientiaeetdidactics.wordpress.com ISBN 978-83-941637-2-3