Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM Zakład Biochemii Klinicznej

Katedra Biochemii Klinicznej UJ CM
Zakład Biochemii Klinicznej (nr KIDL 2213)
9 Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii
Klinicznej (nr KIDL: 2660)
9 Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii
Klinicznej (nr KIDL 2659)
9 Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznej (nr KIDL: 2661)
Zakład Diagnostyki Genetycznej i Nurigenomiki
9 Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu
Diagnostyki (nr KIDL: 2214)
Zakład Diagnostyki ( Medycyna Laboratoryjna))
9 Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki (nr KIDL: 2951)
Chair and Department of Clinical Biochemistry
The Jagiellonian University Medical College (JUMC)
JUMC
Prof. dr hab. med. Aldona Dembińska-Kieć
Office: Joanna Rusek
Cell Culture and Immunofluorescence
Microscopy Labs
Urszula Raznyy
Urszula Cialowicz
Urszula Czech
Anna Knapp
pp
Magdalena Korczynska
Outpatient Clinic of Lipid
Disorders and Obesity
Malgorzata Malczewska-Malec
Malczewska Malec
Julita Stancel-Mozwillo
Iwona Leszczynska-Golabek
Dominika Siedlecka
Dept and Chair of Metabolic Disease JUMC
Dept and Chair of Endocrinology JUMC
Dept.of Pathology JUMC
MAŁOPOLSKIE CENTRUM BIOTECHNOLIOGII UJ
Biochemistry Labs
Anna Gruca
Joanna Góralska
Agnieszka Sliwa
Anna Zdzienicka
Malgorzata Kwasniak
Molecular Biology and Genetics Lab
Iwona Wybranska
Barbara Nowak
Anna Polus
LIP
Bioclaims
consortium
Beata Kiec-Wilk
Teresa Staszel
Magdalena Mikolajczyk
Lukasz Kaczynski
GENE
9
Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Patogenów, Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL: 2660
9
9
9
9
9
9
9
9
Hodowle pierwotnych komórek oraz linii komórek nowotworowych
Obrazowanie przyżyciowe procesów komórkowych (BIOIMAGER)
Izolacja
j DNA,, RNA , białek
Badanie ekspresji genów techniką Real-Time PCR (7900HT Fast system)
Badanie ekspresji genów w technice mikromacierzowej w oparciu o 7900 HF Fast System
Wykrywanie zakażeń wirusowych, bakteryjnych lub grzybowych w oparciu o techniki RT-PCR
Oznaczenia ilościowe i identyfikacja mikroorganizmów w lekach i żywności w oparciu o techniki RT-PCR
Oznaczanie białek metodą western
western-blot
blot
9
Pracownia Diagnostyki i Biochemii Zaburzeń Lipidów Zakładu Biochemii Klinicznej nr KIDL
2659
9
9
9
Oznaczenia ilościowe wolnych kwasów tłuszczowych
Oznaczenia parametrów stresu oksydacyjnego
Badanie funkcji metabolicznej mitochondriów (poziom zużycia tlenu elektroda tlenowa (OROBOROS),
produkcja ATP)
9
Pracownia Immunochemii Zakładu Biochemii Klinicznejj nr KIDL: 2661
9
9
Analiza cytokin, czynników wzrostu i hormonów metodami RIA i ELISA
Wykonanie oznaczeń z wykorzystaniem cytofluorymetru przepływowego CANTO II Becton Dickinson (np.
badanie apoptozy, badanie funkcji mitochondriów)
9
Pracownia Biologii Molekularnej i Diagnostyki Genetycznej Zakładu Diagnostyki Genetycznej i
Nurigenomiki nr KIDL: 2214
9
9
9
Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą metody RFLP
Wykrywanie mutacji punktowych za pomocą techniki Real
Real-Time
Time PCR
Wykrywanie nowych lub znanych mutacji/polimorfizmów metodą sekwencjonowania
9
Pracownia Biochemii Zakładu Diagnostyki nr KIDL: 2951
9
Markery i parametry związane z obrotem kostnym, interleukiny i chemokiny, czynniki wzrostowe, selektyny,
proteazy i ich inhibitory; hormony, markery krzepnięcia i fibrynolizy, cząsteczki adhezyjne i in.
Istnieje też możliwość wykonania podstawowych badań biochemicznych.
9
METODY BILOGII MOLEKULARNEJ:
Badanie ekspresji genów: TaqMan
Applied microarray system (TLDA)
oparty na reakcji Real –time
Sekwencjonowanie metodą cykliczną :
3130xl Genetic Analyzer, Applied Biosystems
Reakcja amplifikacji PCR (LabCycler), ocena jakości materiału
genetycznego(Spectrophotometer NanoDrop)
■ Analiza wybranych parametrów komórek z wykorzystaniem cytometrii
przepływowej:
p
py
j FACS Canto II firmy
y Becton Dickinson
■ Pracownia hodowli komórek
Metody obrazowania komórek przy użyciu: mikroskopu BD Pathway 855
barwienie komórek utrwalonych
ilościowe obrazowanie zmian ekspresji białek PAT,
białek stresu ER, kropli lipidowych
ADRP
Koneksyna 43
Hoechst
Białko
Bodipy
Krople lipidowe
Kalregulina
Wizualizacja ekspresji wybranych białek w komórkach SVF pod wpływem TNFα
barwienie komórek przyżyciowe
ilościowe obrazowanie zmian w potencjale błon
mitochondrialnych (MMP, ΔΨ)
BD Pathway 855
High-Content
C
C
Cell
Analysis Workflow
ctrl
CCCP
EPA
PA
Hoechst
MMP
Zmiany MMP(ΔΨ) w komórkach SVF pod wpływem kwasów tłuszczowych
BADANIE FUNKCJI ENERGETYCZNYCH MITOCHONDRIÓW:
■ Pomiar procesów oddechowych mitochondriów: elektroda tlenowrażliwa
Oxygraph-2k OROBOROS
■ Pomiar g
generacji
j ATP: metoda luminescencji
j z wykorzystaniem
y
y
kitu:
ATP Lite,Parkin Elmer Kit oraz czytnika GENios TECAN Reader
Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (2000-2009)
zrealizowane w latach 2000-2008:
INCO-COPERNICUS; POLONIUM.
COST-918 Action: Body
y Weight
g and Energy
gy Expenditure,
p
, Functional Food and Energy
gy
Expenditure
COST-B17 action Insulin resistance, obesity and diabetes mellitus in the elderly
COST -926 “Impact of new technologies on the health benefits and safety of bioactive plant
compounds
compounds”
DLARFID “Dietary lipids as Risk Factors in Development. Mechanistic Issues QLK1-CT-200100183
Stem Cells Excellence Center in Poland, QLK3-CT-2002-30307 acronym STEC, Integrated
project
SC&CR RTD: "Application and Process Optimization of Stem Cell Products for Myocardial
Repair" (Contract no: 502988).
LIPGEN: Diet, genomics and the metabolic syndrome: an integrated nutrition, agro-food, social
and economic analysis dietary fat modification, genotype and the metabolic syndrome
(contract nr. FOOD-CT-2003-505944).
Projekty Katedry Biochemii Klinicznej (realizowane 2009/2010):
COST- FA 0602COST
0602 “BIOACTVE FOOD COMPONENTS,
COMPONENTS MITOCHONDRIAL FUNCTION AND
HEALTH”
COST BM 0602 Adipose tissue: A key target for prevention of the metabolic syndrome
The European Network of Excellence: " The European Nutrigenomics Organisation linking
genomics, nutrition and health research" NuGO (contract nr FP6-2004-506360)
Lipid droplets as dynamic organelles connecting influx,
f
efflux,
ff
and storage off lipids:
Translational research towards human disease “Lipid droplets” LipidomicNet
„Ochrona
Ochrona przed zwyrodnieniem układu nerwowego: rola peptydów endogennych
endogennych, L
L-argininy
argininy i
kwasów tłuszczowych jako potencjalnych czynników modulujących czynność
mitochondriów, zwiększających żywotność mózgu poddanego działaniu bodźców
stresowych” (PNRF-104-AI-1/07)
BIOmarkers of Robustness of Metabolic Homeostasis for Nutrigenomics-derived Health
CLAIMS Made on Food (FP7-KBBE-2009-3 nr 244995) Bioclaims
Zapraszamy do współdziałania
z Katedrą Biochemii Klinicznej CM UJ w ramach
projektu
„Interdyscyplinarne
I t d
li
Studia
St di Doktoranckie
D kt
ki
„Nauki molekularne dla medycyny”