Badania środowiskowe, opis i charakterystyka biologiczna nowego
Transkrypt
Badania środowiskowe, opis i charakterystyka biologiczna nowego
Badania środowiskowe, opis i charakterystyka biologiczna nowego gatunku Babesia, odkrytego u gryzoni z masywu Synaju (Egipt) Cel badań Pierwotniaki z rodzaju Babesia to kosmopolityczne pasożyty wielu gatunków zwierząt i ludzi. Obecnie na świcie opisano kilkadziesiąt gatunków i genotypów Babesia, wykazujących pewną specyficzność żywicielską do swoich żywicieli. W roku 2000 rozpoczęliśmy w Egipcie, w unikalnym środowisku suchych dolin (wadis) masywu Synaju, badania zespołów pasożytów gryzoni. W próbach krwi pozyskanych w latach 2004 i 2008 w jednej z najwyżej położonych dolin górskich, zaobserwowaliśmy nietypowe formy Babesia. Przeprowadzona w naszym zakładzie analiza molekularna produktu PCR na fragmencie genu 18 S rRNA wykazała odmienność Babesia z Synaju od B. microti i innych opisanych u gryzoni gatunków. Celem niniejszego projektu badawczego jest opisanie nowego gatunku Babesia, poprzez (1) rozpoznanie w powtórzonych badaniach terenowych: zakresu typowych żywicieli, dokładnej lokalizacji w obrębie masywu Synaju, ekstensywności i intensywności zarażenia w naturalnie zarażonych populacjach oraz identyfikacji możliwego wektora; (2) przeprowadzenie charakterystyki biologicznej nowego gatunku Babesia: określenie zmienności morfologicznej i porównanie wymiarów trofozoitów w rozmazach krwi od naturalnych żywicieli; określenie zakresu parazytemii u naturalnych żywicieli; ustawienie modelu eksperymentalnego i określenie przebiegu parazytemii; oraz zbadanie zakresu reakcji krzyżowej pomiędzy B.microti i nowym gatunkiem Babesia z wykorzystaniem surowic myszy Balb/c zarażonych B.microti i surowic pozyskanych od naturalnie zarażonych żywicieli. (3) Ostatnim etapem charakterystyki nowego gatunku będą badania molekularne, aby na podstawie analizy filogenetycznej kilku loci (18S rDNA, betatubulina, HSP) wykazać pokrewieństwo nowego gatunku Babesia z gatunkami/ genotypami wcześniej opisanymi u gryzoni i innych ssaków. Metody badawcze Badania ekologiczne: Określenie zarażenia Babesia spp. u gryzoni z Egiptu za pomocą diagnostyki mikroskopowej i molekularnej (barwienie Giemza, PCR, sekwencjonowanie) Wykrywanie DNA Babesia u ektopasożytów zebranych z gryzoni i ze środowiska Porównanie ekstensywności i intensywności zarażenia Babesia w naturalnie zarażonych populacjach gryzoni na przestrzeni lat 2000- 2012 Określenie wpływu czynników środowiskowych (rok i miejsce badań) i populacyjnych (gatunek, wiek i płeć żywicieli) na ekstensywność i intensywność zarażenia Określenie wpływu koinwazji Babesia i innymi gatunkami pasożytów krwi – analiza struktury i różnorodności zgrupowania pasożytów krwi gryzoni Badania laboratoryjne: Określenie zakresu zmienności morfologicznej trofozoitów nowego gatunku na podstawie pomiarów i dokumentacji fotograficznej rozmazów krwi Pasaż nowego gatunku w warunkach laboratoryjnych- przeniesienie izolatu pasożyta na wrażliwe szczepy myszy laboratoryjnych wg metodyki stosowanej w pasażu B. microti, prowadzonego w naszym Zakładzie od kilkunastu lat przez dr Małgorzatę Bednarską. Określenie przebiegu parazytemii za pomocą diagnostyki mikroskopowej (intensywność parazytemii) i molekularnej (długość fazy chronicznej) Zbadanie stopnia reakcji krzyżowej surowic gryzoni po zarażeniu B.microti i nowym gatunkiem Babesia (ELISA) Badania molekularne: Określenie zmienności genetycznej izolatów pasożyta pozyskanych od różnych gatunków żywicieli (Acomys dimidiatus, Acomys russatus, Dipodillus dasyurus) Określenie zmienności genetycznej izolatów pasożyta pozyskanych w różnych dolinach i w różnym czasie (wpływ lokalizacji i zmienności w czasie na różnorodność genetyczną pasożyta) Wykrywanie DNA Babesia spp. u potencjalnych wektorów- ektopasożytów zebranych z gryzoni (PCR, sekwencjonowanie) Analizy filogenetyczna na podstawie kilku loci (18S rDNA, beta-tubulina, HSP)- określenie pokrewieństwa nowego gatunku Babesia z gatunkami/ genotypami wcześniej opisanymi u gryzoni i innych ssaków. Wpływ rezultatów na rozwój nauki Efektem podjętych badań będzie opisanie nowego dla nauki gatunku pasożyta wraz z jego kompleksową charakterystyką ekologiczną, biologiczną i molekularną. W ten sposób zostanie poszerzona wiedza na temat ewolucji układów pasożyt-żywiciel, na przykładzie istotnych dla zdrowia ludzi i zwierząt obligatoryjnych pasożytów erytrocytów z rodzaju Babesia. Unikalne środowisko izolowanych silnie od siebie dolin górskich w masywie Synaju jest doskonałym i wyjątkowym naturalnym modelem do przeprowadzenia podstawowych badań nad ewolucją układów pasożyt– żywiciel, a zebrane przez nas dane o zarażeniu tych samych populacji gryzoni z lat 2000-2012 będą unikalne w skali świata i zaowocują publikacjami na światowym poziomie.