IDT Zen - Symbios
Transkrypt
IDT Zen - Symbios
ZEN Internal Quencher TM Double-Quenched Probes Firma IDT opracowa³a nowe wewnêtrzne wygaszacze ZEN™, które umo¿liwiaj¹ produkcjê podwójnie wygaszanych sond, cechuj¹cych siê mniejszym t³em i silniejszym sygna³em. Niski poziom zabarwienia t³a – umiejscowienie Zen™ Internal Quencher w odleg³oœci tylko 9pz od barwnika znacz¹co redukuje fluorescencjê t³a. Zwiêkszona czu³oœæ – u¿ycie podwójnie wygaszanych sond wzmacnia sygna³ i redukuje wartoœci Cq. Zwiêkszona precyzja dzia³ania dziêki zmniejszeniu szumu t³a. Maksymalne wygaszenie dla d³ugich sond – dziêki bliskoœci wygaszacza ZEN oraz barwnika reporterowego nawet sondy o d³ugoœci 40pz spe³niaj¹ swoj¹ rolê. Mo¿liwoœæ wyboru 5 barwników – ZEN™ Internal Quencher jest dostêpny z barwnikami FAM, HEX, TET, MAX i JOE. Podwójnie wygaszane sondy (5'FAM/ZEN/3'IBFQ) charakteryzuj¹ siê zarówno niskim poziomem t³a, jak i silnym sygna³em, w porównaniu do tradycyjnych po³¹czeñ wygaszacz-barwnik. Fluorescencja t³a (Rn) podwójnie wygaszanych sond jest prawie 4 razy ni¿sza, w porównan iu do tradycyjnych sond podwójnie znakowanych (Wykres 1A). Wartoœæ delta Rn sygna³u jest zwiêkszona œrednio o 30% w sondach 5'FAM/ZEN/3'IBFQ (Wykres 1B). Wiêcej informacji znajduje siê na stronie www.idtdna.com. Wykres 1A i 1B. Sondy znakowane 5'FAM z piêcioma ró¿nymi wygaszaczami: ZEN –Iowa Black® FQ (ZEN/IBFQ), Black Hole Quencher® (BHQ), Eclipse®, Iowa Black® FQ (IBFQ) oraz TAMRA. Celem ka¿dej sondy by³o locus ACTB i ka¿da by³a trzykrotnie przetestowana z u¿yciem tych samych starterów oraz 0,5ng cDNA. ZEN Internal Quencher TM Udoskonalona precyzja i czu³oœæ qPCR. Podwójnie wygaszane sondy cechuj¹ siê mniejsz¹ œredni¹ wartoœci¹ Cq i zwiêkszon¹ wartoœci¹ Cq precyzji, w porównaniu do tradycyjnych, podwójnie znakowanych sond, w ró¿nych zakresach stê¿enia cDNA. Tak wiêc u¿ycie podwójnie wygaszanych sond mo¿e pozwoliæ zarówno na zwiêkszenie czu³oœci, jak i precyzji eksperymentów qPCR. Wykres 2A i 2B. Sondy znakowane 5'FAM z piêcioma ró¿nymi wygaszaczami: ZEN –Iowa Black® FQ (ZEN/IBFQ), Black Hole Quencher® (BHQ), Eclipse®, Iowa Black® FQ (IBFQ) oraz TAMRA zosta³y pojedynczo syntezowane w sumie 10 razy dla ka¿dego typu wygaszacza dla przeprowadzania w sumie 50 testów. . Celem ka¿dej sondy by³o locus ACTB i ka¿da by³a trzykrotnie przetestowana z u¿yciem tych samych starterów oraz wskazan¹ iloœci¹ cDNA. Ni¿sze szumy t³a nawet przy d³ugich sondach. W przeprowadzonych testach, podwójnie wygaszane sondy wykaza³y zmniejszony poziom fluorescencji t³a. Nawet podwójnie wygaszane sondy o d³ugoœci 40pz dzia³aj¹ 4 razy lepiej pozostawiaj¹c mniejsze t³o, w porównaniu do sond z BHQ. Tak d³ugie sondy s¹ równie¿ efektywne przy cDNA bogatych w pary AT. Wykres 3. Sondy z piêcioma ró¿nymi wygaszaczami: ZEN –Iowa Black® FQ (ZEN/IBFQ), Black Hole Quencher® (BHQ), Eclipse®, Iowa Black® FQ (IBFQ) oraz TAMRA oraz o piêciu ró¿nych d³ugoœciach (40, 35, 30, 25 oraz 20pz) zosta³y przetestowane w sumie z dwudziestoma piêcioma sondami ró¿nego typu. Wykonano szeœæ powtórzeñ ka¿dej z sondy i zmieszano z 10ng/µl cDNA, reakcje przeprowadzono w standardowych warunkach. Œredni¹ wartoœæ t³a (Rn) obliczono do wyznaczenia œredniego sygna³u fluorescencji t³a. W celu zamówienia produktu, skontaktuj siê z Doradc¹ Symbios pod adresem [email protected] lub telefonicznie 058 692 80 83. Zapraszamy do odwiedzenia naszej strony www.symbios.pl. UL. MODRZEWIOWA 37, 83-010 STRASZYN