Wykłady 7 i 8 - Warszawski Uniwersytet Medyczny
Transkrypt
Wykłady 7 i 8 - Warszawski Uniwersytet Medyczny
MIEJSCE DROBNOUSTROJÓW W PRZYRODZIE JOANNA KĄDZIELSKA KATEDRA MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ WARSZAWSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY ROZKŁAD BIOMASY PODSTAWA WSZYSTKICH ŁAŃCUCHÓW POKARMOWYCH WPŁYW NA SKŁAD ATMOSFERY wytwarzanie / zużywanie metanu, CO2, O2, N2 TYP METABOLIZMU ENERGETYCZNEGO BAKTERII DECYDUJE O JEJ MIEJSCU W PRZYRODZIE Bakterie „martwej strefy” (inne akceptory elektronów) Bakterie mlekowe (egzogenne aminokwasy) Względnie beztlenowce (różne miejsca) Syntrofia (oddziaływania energetyczne między organizmami) UDZIAŁ BAKTERII W OBIEGU AZOTU W PRZYRODZIE UDZIAŁ BAKTERII W OBIEGU WĘGLA W PRZYRODZIE MECHANIZM EMISJI DROBNOUSTROJÓW CHOROBOTWÓRCZYCH Z POWIERZCHNI WODY BAKTERIE MOGĄ ROSNĄĆ W RÓŻNYCH ZAKRESACH TEMPERATUR PSYCHROFILNE Mogą przedostać się z wody do mleka MEZOFILNE Niszczone przez pasteryzację, może dojść do ponownego skażenia mleka TERMOFILNE obecne w ziemi, sianie, suchych paszach, w mleczarniach nie umyta aparatura i nie dezynfekowana, mleko przechowywane zbyt długo, w zbyt wysokiej temperaturze WYKORZYSTANIE BAKTERII W PRZEMYŚLE DO PRODUKCJI ARTYKUŁY SPOŻYWCZE (Bakterie fermentacyjne) SERY, KEFIRY, JOGURTY KISZENIE (KAPUSTY, OGÓRKÓW, KISZONKI DLA ZWIERZĄT) KWASY ORGANICZNE WITAMINY, AMINOKWASY BIOGAZ (metan z obornika) ANTYBIOTYKI (np. Promieniowce - STREPTOMYCYNA, TETRACYCLINY) DEKSTRAN (podstawa płynu krwiozastępczego) INNE ZASTOSOWANIA INŻYNIERIA GENETYCZNA METODY MOLEKULARNE Polimeraza do reakcji PCR GEOBAKTERY MIKROORGANIZMY PRODUKUJĄCE PRZEWODY BAKTERIE OPORNE NA ANTYBIOTYKI W PRZEMYŚLE ROLNICZYM SZCZEPY OPORNE NA FARMACH, W GLEBIE, W WODZIE GRUNTOWEJ DODATEK ANTYBIOTYKÓW DO PASZ DLA ZWIERZĄT MORSKIE BAKTERIE PRZYJAZNE DLA SRODOWISKA ŹRÓDŁO ENERGII ŻYJĄ W OCEANACH ROZKŁADAJĄ 1 MLD TON MARTWEJ MATERII ORGANICZNEJ SKĄD SIĘ BIERZE ZAPACH MORZA? BAKTERIE W SYMBIOZIE W okolicach Hawajów żyje mała kałamarnica Euprymna Posiada ona narząd świetlny, który zamieszkuja symbiotyczne bakterie Vibrio fischeri Bakterie te wytwarzają białko – lucyferazę, które odpowiada za przeprowadzenie reakcji, w wyniku której powstaje światło Jest to przykład symbiozy mutualistycznej (korzyści dla obu organizmów) OBUMIERANIE RAFY KORALOWEJ VIBRIO SHILOI VIBRIO CORALLILYTICUS INNE BAKTERIE BAKTERIE ŻYJĄ W ŚRODOWISKACH EKSTREMALNYCH TEMPERATURA ZASOLENIE pH 0°C - 100°C NISKIE, SREDNIE, WYSOKIE < 5% DO 25% 1 - 14 ŹRÓDŁO ENERGII SŁOŃCE LUB ZWIĄZKI CHEMICZNE ŹRÓDŁO WĘGLA ORGANICZNE (CUKRY, BIAŁKA, TŁUSZCZE) LUB NIEORGANICZNE: CO2 HCO3 TLEN TAK LUB NIE MIKROBIOTA CZŁOWIEKA NOSICIELSTWO CHOROBOTWÓRCZYCH BAKTERII ZAKAŻENIA OPORTUNISTYCZNE ZAKAŻENIA U PACJENTÓW Z OBNIŻONĄ ODPORNOŚCIĄ JOANNA KĄDZIELSKA KATEDRA MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ WARSZAWSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY RÓWNOWAGA MIĘDZY MIKROORGANIZMAMI A CZŁOWIEKIEM MIKROBIOTA CZŁOWIEKA Populacje mikroorganizmów, które zaczynają się rozwijać w różnych miejscach ciała wkrótce po narodzinach i pozostają w nich przez całe życie. GDZIE W NASZYM CIELE PRZEBYWAJĄ MIKROORGANIZMY? SKÓRA NOS JAMA USTNA ŻOŁĄDEK I JELITO CIENKIE OKRĘŻNICA POCHWA ROLA MIKROBIOTY OCHRONNA ODŻYWCZA POTENCJALNE ŹRODŁO INFEKCJI Zmiana składu populacji (choroby przyzębia) Translokacja do tkanek i krwi (infekcje pooperacyjne, pozabiegowe) MIKROBIOTA CZŁOWIEKA STAŁA (osiadła) PRZEJŚCIOWA (kolonizacja) SKÓRA GRONKOWCE MIKROKOKI MACZUGOWCE INNE GRONKOWCE: biofilm na implantach, wlewach dożylnych • NOS Nosicielstwo gronkowca złocistego Kontrola pracowników medycznych MRSA JAMA USTNA ZŁOŻONA MIKROBIOTA zęby szczelina dziąsłowa kieszonka dziąsłowa policzki język MIKROBIOTA JAMY USTNEJ LICZNE PACIORKOWCE LACTOBACILLUS ACTINOMYCES DROŻDŻE =CANDIDA ALBICANS(NIELICZNE) Kolonizacja: dwoinka zapalenia płuc JAMA USTNA ANTYBIOTYKOTERAPIA / HIV / CHEMIOTERAPIA Drożdżyca PRÓCHNICA Dieta wysokocukrowa Zła higiena ZABIEGI CHIRURGICZNE/ URAZY Promienica MIKROBIOTA PRZYZĘBIA PŁYTKA NAZĘBNA ZMIANA SKŁADU GATUNKOWEGO PREVOTELLA, PORPHYROMONAS DOROŚLI ŻOŁĄDEK pH 1-2 nieliczne LACTOBACILLUS JELITO CIENKIE LICZNA MIKROBIOTA OKRĘŻNICA FERMENTACJA WIELOCUKRÓW PRZEZ ENZYMY BAKTERYJNE DOMINACJA BEZTLENOWCÓW PAŁECZKA OKRĘŻNICY = ESCHERICHIA COLI MIKROBIOTA OKRĘŻNICY MIKROBIOTA JELITA BALANS EKOLOGICZNY BIOCHEMICZNA I METABOLICZNA ROLA MIKROBIOTY JELITA CZYNNIKI ŚRODOWISKOWE I MIKROBIOTY JELITA RZEKOMOBŁONIASTE ZAPALENIE OKRĘŻNICY ANTYBIOTYKOTERAPIA SPADEK LICZEBNOŚCI DOMINUJĄCYCH GATUNKÓW MIKROBIOTY PRZEROST LASECZKI CLOSTRIDIUM DIFFICILE WYTWARZANIE TOKSYN USZKODZENIE NABŁONKA ŚMIERĆ RZEKOMOBŁONIASTE ZAPALENIE JELIT MIKROBIOTA OKRĘŻNICY JAKO ŹRÓDŁO INFEKCJI OPERACJE CHIRURGICZNE URAZY WIELONARZĄDOWE MIKROBIOTA POCHWY LACTOBACILLUS Antybiotyki – drożdżyca Zmiana składu – bakteryjne zapalenie pochwy KOLONIZACJA: choroby przenoszone drogą płciową BEZWZGLĘDNE BEZTLENOWCE DOMINUJĄCY SKŁADNIK MIKROBIOTY MIKROBIOTA CZŁOWIEKA BEZTLENOWCE : TLENOWCE JAMA USTNA / NOS 3–5 : 1 KIESZONKA DZIĄSŁOWA 1000 : 1 JELITO GRUBE 1000 : 1 POCHWA 3–5 : 1 MIKROBIOTA CZŁOWIEKA CZYNNIKI WPŁYWAJĄCE NA ZMIANĘ SKŁADU BAKTERIE OPORTUNISTYCZNE ŚCISŁE PATOGENY GRUŹLICA Ścisłe patogeny = PRĄTKI GRUŹLICY DROGA KROPELKOWA NOSICIEL Osoba, która jest skolonizowana przez mikroorganizmy, ale nie wykazuje objawów choroby Bezobjawowy Rekowalescent ! Przejściowo ! Chronicznie NOSICIELSTWO NOS – METYCYLINOOPORNY GRONKOWIEC ZŁOCISTY (MRSA) JAMA USTNA – NEISSERIA MENINGITIDIS, CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE, HAEMOPHILUS INFLUENZAE JELITO GRUBE – SALMONELLA SPP. SHIGELLA SPP. ZAKAŻENIA OPORTUNISTYCZNE Zakażenia w stanach upośledzonej odporności - w niedoborach odporności humoralnej i komórkowej - wśród pacjentów z neutropenią - u pacjentów z obniżoną odpornością w przebiegu chorób metabolicznych, starzenia się - u narkomanów i alkoholików - w chorobach nowotworowych, po transplantacji narządów i tkanek u pacjentów z AIDS u pacjentów hospitalizowanych, po operacjach, inwazyjnych zabiegach leczniczych i diagnostycznych ZAKAŻENIA OPORTUNISTYCZNE PACJENCI HOSPITALIZOWANI NATURALNA MIKROBIOTA DROBNOUSTROJE ZE ŚRODOWISKA SZPITALNEGO MIKROORGANIZMY PRZYNIESIONE PRZEZ ODWIEDZAJĄCYCH ZAKAŻENIA OPORTUNISTYCZNE DUŻA PODATNOŚĆ NA ZAKAŻENIA BAKTERYJNE INWAZYJNE ZAKAŻENIA GRZYBICZE ( ŚMIERTELNOŚĆ) ZAKAŻENIA WIRUSOWE: NAWRACAJĄCA OPRYSZCZKA, PÓŁPASIEC, INNE O NIETYPOWYM PRZEBIEGU ZAKAŻENIA OPORTUNISTYCZNE INFEKCJE MOGĄ BYĆ ŚMIERTELNE PRZESTRZEGANIE WŁAŚCIWEJ HIGIENY (MYCIE RĄK !!!!!!!!) WCZESNA DIAGNOZA OPIEKA MEDYCZNA