Program mini-workshopu „BioInformatyka w Toruniu

Program mini-workshopu „BioInformatyka w Toruniu – BIT03”
24 X – 25 X 2003
Miejsce: sala 20, Instytut Fizyki UMK, 87-100 Torun, ul. Grudziadzka 5
Organizator, info: dr hab. Wieslaw Nowak, (56) 611-3204, [email protected]
http://www.phys.uni.torun.pl/~wiesiek/BIT03
PIATEK 24.10.2003
11:15-11:20
Otwarcie workshopu – prof. dr hab. J. Szudy (Dziekan WFAiIS)
11:20-12:15
Jaroslaw Meller,
Cinncinati Childrens Hospital (Cinncinati USA i KIS-UMK Torun)
"Odkrywanie podobienstwa i ewolucyjnych relacji pomiedzy bialkami:
praktyczne wprowadzenie do metod porównywania sekwencji i rozpoznawania
struktur bialkowych".
12:15-13:15
Janusz M. Bujnicki (HHMI YI)
GeneSilico, Miedzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej w Warszawie
"Potwor Frankensteina (czyli jak zbudowac dobry model struktury bialka z
kawalków modeli blednych) - strategia stosowana w konkursie CASP-5 przez
grupe GeneSilico"
13:15 – 15:15 – przerwa na obiad
15:15 -16:00 Marcin von Grotthus ( BioInfoBank Institute, Poznan)
"Ligand.Info: poszukiwania potencjalnych lekarstw w strukturalnych
bazach danych"
16:00-16:30
przerwa na kawe
16:30-17:15 Jakub Pas ( BioInfoBank Institute, Inst. Ch. Bioorganicznej. PAN, Poznan)
"Analiza funkcji bialek przy uzyciu modelowania molekularnego"
17:15-18:00 Wieslaw Nowak (W. Fizyki, Astron. i Informatyki Stosowanej UMK)
„Sterowana dynamika molekularna a eksperymenty na pojedynczych czasteczkach”
18:05-18:20 Pawel Kedzierski (Politechnika Wroclawska)
„Oddzialywania w centrach aktywnych enzymów . Przyklad metylotransferazy”
~20 – pub: Krzywa Wieza w Toruniu, ul. Pod Krzywa Wieza, IIp. (spotkanie towarzyskie
przy produktach biotechnologicznych i modulowanych drganiach powietrza– na koszt wlasny)
SOBOTA, 25 X 2003
9:15-10:00
Janusz M. Bujnicki (Warszawa)
"Analiza doswiadczalna i modelowanie oddzialywan bialko-RNA i mechanizmu
reakcji katalizowanej przez metylotransferazy Erm odpowiadajace za
bakteryjna opornosc na antybiotyki".
10-13 - warsztaty w Pracowni Dynamiki Molekularnej i Bioinformatyki WFAiIS UMK
A. „Metody dynamiki molekularnej (NAMD, VMD) „
– B. Dobrzelecki (IF UMK)
lub (do wyboru)
B. „Poszukiwania bialek podobnych” – J. Meller (U.Cinncinati, USA)
(kawa przy pracy)
13:15-14:00 Piotr Bala ( W.Matematyki i Informatyki UMK/ ICM Warszawa)
„UNICORE - technologia gridowa dla bioinformatyki”
14:00 Zakonczenie BIT03
Obiad – w stolówce itp. (na koszt uczestników)
Cwiczenia nieformalne – otwarta pracownia dla chetnych….