Ponawiamy nasze zaproszenie na Warsztaty Bioinformatyczne

Szanowni Państwo!
Ponawiamy nasze zaproszenie na Warsztaty Bioinformatyczne Projektu PBZ-MNiI-2/1/2005 „Analiza danych w genomice
funkcjonalnej”, które odbędą się w Gliwicach w dniach 15-16 czerwca 2007r. Warsztaty zaplanowane są jako spotkanie osób
zajmujących się szeroko rozumianą analizą danych genomicznych. Do wzięcia udziału zachęcamy przede wszystkim uczestników
projektu PBZ-MNiI-2/1/2005 „Zastosowanie współczesnej genomiki funkcjonalnej i bioinformatyki do charakteryzacji i tworzenia
modeli procesów biologicznych o istotnym znaczeniu w medycynie i rolnictwie”, jak równieŜ zainteresowane zespoły nie biorące
udziału w tym projekcie. Celem planowanego spotkania jest porównanie technik i algorytmów stosowanych w analizie danych
genomicznych oraz moŜliwości biologicznej interpretacji uzyskanych wyników. Formuła spotkania zakłada analizę tych samych
danych przez wszystkie zespoły uczestniczące w warsztatach. Zapraszamy na stronę www gdzie znajdą Państwo aktualne informacje
na temat warsztatów. Adres strony: http://www.genomika.pl/bioinfoworkshops
Zgłoszenia uczestnictwa
Zapraszamy do zgłaszania uczestnictwa w konferencji - rejestracji uczestników jest moŜliwa poprzez formularz na stronie
www dostępny w zakładce „Zgłoszenie udziału”. Termin zgłaszania uczestnictwa upływa 30 kwietnia 2007r; decyduje kolejność
zgłoszeń.
Dane
Organizatorzy udostępnili trzy zbiory danych do analizy i zachęcają wszystkich uczestników do zgłaszania dalszych
własnych zbiorów danych oryginalnych, które mogą być podstawą przedstawianych analiz. RozwaŜamy takŜe moŜliwość analizy
wybranych publicznie dostępnych danych genomicznych. Zainteresowane zespoły prosimy o jak najszybszy kontakt z organizatorami
w celu uzgodnienia, jakimi danymi chcą się zająć. Przypominamy, Ŝe te same dane będą analizowane przez róŜne zespoły, konieczne
jest więc uzgodnienie zakresu materiału.
Do 30 kwietnia 2007r. planujemy zestawienie ostatecznej listy zbiorów danych, które będą podstawą warsztatów.
Zakładamy, Ŝe analiza będzie przeprowadzona przez uczestników w ciągu maja i czerwca. RównieŜ do tego czasu autorzy danych
określą szczegółowe cele analizy zarówno w aspekcie biologicznym jak i klinicznym.
Dane udostępnione przez uczestników projektu:
1.
2.
3.
Zbiór danych mikromacierzowych w przełyku Barretta (120 mikromacierzy oligonukleotydowych Affymetrix)
Zbiór danych dostępny pod adresem: http://gastrolab.coi.waw.pl/data/
Kontakt: prof. Jerzy Ostrowski ([email protected])
Zbiór danych mikromacierzowych w raku tarczycy (51 mikromacierzy oligonukleotydowych Affymetrix)
Zbiór danych dostępny pod adresem: http://www.genomika.pl/bioinfoworkshops/thyroid_cancer_data
Kontakt: prof. Barbara Jarząb ([email protected])
Zbiór danych proteomicznych
Zbiór udostępniony po wcześniejszym kontakcie i uzgodnieniu szczegółowych warunków wykorzystania danych. Korespondencja w sprawie udostępnienia
– prof. Michał Dadlez ([email protected])
Ze względu na to, Ŝe wszystkie te zbiory zawierają dane oryginalne, wszystkich uczestników przed podjęciem analizy prosimy
o kontakt z zespołami, które udostępniły te dane.
Lista publicznych repozytoriów danych macierzowych i propozycje zbiorów do analizy są równieŜ dostępne na stronie www
warsztatów w zakładce „Dane”. Zespoły zainteresowane przedstawieniem podczas warsztatów wyników analiz tych danych prosimy
o zgłaszanie propozycji wyboru zbiorów danych do analizy.
Opłata zjazdowa
Miło nam poinformować, Ŝe całkowity koszt uczestnictwa dla zespołów uczestniczących w projekcie PBZ-MNiI-2/1/2005
pokrywany jest przez organizatorów warsztatów (w tym opłaty hotelowe).
Opłata zjazdowa dla uczestników spoza projektu: 90 zł.
Opłatę zjazdową prosimy przelewać na konto: 37 1020 2401 0000 0402 0039 0609 (PTE Polska Grupa Nowotworów
Endokrynnych, WybrzeŜe Armii Krajowej 15, 44-100 Gliwice)
Hotele
Do Państwa dyspozycji zarezerwowaliśmy 1 i 2-osobowe pokoje w hotelu Centrum Onkologii oraz w hotelu „Sezam”.
Rezerwacji hoteli prosimy dokonywać wyłącznie poprzez formularz zgłoszeniowy uczestnika. Uczestnicy spoza projektu PBZ-MNiI2/1/2005 wnoszą opłatę za noclegi na miejscu, bezpośrednio w hotelu. Opłaty za hotele dla uczestników spoza projektu wynoszą:
• hotel Centrum Onkologii (w cenę noclegu nie jest wliczone śniadanie): pokój 1-osobowy – 100zł, pokój 2-osobowy – 140zł
• hotel „Sezam” (w cenę noclegu wliczone śniadanie): pokój 1-osobowy – 100zł, pokój 2-osobowy – 150zł
Komitet Organizacyjny Warsztatów Bioinformatycznych Projektu PBZ-MNiI-2/1/2005 „Analiza danych w genomice funkcjonalnej”
Zakład Medycyny Nuklearnej i Endokrynologii Onkologicznej
Centrum Onkologii – Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie Oddział Gliwice
WybrzeŜe Armii Krajowej 15, 44-100 Gliwice
Tel. 032 278 93 01 Tel. 032 278 93 39 Fax. 032 278 93 25 e-mail: [email protected]
Konto:
PTE Polska Grupa Nowotworów Endokrynnych
WybrzeŜe Armii Krajowej 15, 44-100 Gliwice
37 1020 2401 0000 0402 0039 0609