lista 1 1. Przed przystąpieniem do rozwiązywani

Podstawy bioinformatyki: lista 1
1. Przed przystąpieniem do rozwiązywania zadań, dowiedz się czym charakteryzują się
dwa popularne formaty danych: GenBank oraz FASTA. Który z nich jest bardziej
informatywny i dlaczego?
2. Na stronie NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) odnajdź sekwencje o numerach
GU827394 oraz CP000964. Dla każdej z nich, korzystając z informacji zawartych w
formacie GenBank, odpowiedź na następujące pytania:
a. Z jakiego organizmu pochodzi sekwencja?
b. Jaką ma długość?
c. Czy dany rekord zawiera dane na temat publikacji związanej z daną sekwencją?
Zacytuj.
d. Jakie geny są kodowane przez daną sekwencję?
e. Czy sekwencja pochodzi z genomu jądrowego?
3. Ze strony głównej NCBI, przejdź do bazy PubMed. Korzystając z zaawansowanego
sposobu wyszukiwania zapytań, odnajdź artykuły naukowe dotyczące:
a. SNP i napisanych przez autora Kyung-Won Hong
b. niedźwiedzia brunatnego i opublikowanych po 2014
Wykorzystaj opcję „Advance” lub wyrażenia logiczne. Jeśli to możliwe zacytuj po 2
artykuły. W jakich czasopismach zostały one opublikowane?
theta.edu.pl
Magda Mielczarek
Podstawy bioinformatyki