1 Ćwiczenie 3. Metabolizm organizmów Cel ćwiczeń
Transkrypt
1 Ćwiczenie 3. Metabolizm organizmów Cel ćwiczeń
wiczenie 3. Metabolizm organizmów Cel wicze : Zapoznanie si z przebiegiem podstawowych procesów metabolicznych towarzysz cych neutralizacji zanieczyszcze i wykorzystywanych w rozwi zaniach technologicznych in ynierii rodowiska. Zagadnienia teoretyczne: 1. Typy od ywiania si organizmów – ródła makroelementów i mikroelementów 2. Sposoby zdobywania energii – oddychanie tlenowe, beztlenowe, fermentacja 3. Rodzaje substratów energetycznych wykorzystywanych przez organizmy ywe 4. Asymilacja dwutlenku w gla: fotosynteza bakteryjna i ro linna, chemosynteza 5. Fosforylacja substratowa, oksydatywna, fotooksydacja Materiały: podło a stałe, ró nicuj ce: McConkey agar, ENDO agar, agar od ywczy + purpura bromokrezolowa + ró ne ródła w gla (glukoza, glicerol, mannitol, cytrynian Na, laktoza), agar od ywczy + skrobia. podło a płynne: bulion od ywczy + laktoza + purpura bromokrezolowa. szczepy bakteryjne: Escherichia coli, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Pseudomonas fluorescens, Bacillus subtilis, Sarcina lutea. zielona masa ro linna (natka pietruszki lub in.), 96% alkohol etylowy, płyn rozwijaj cy: toluen: eter: aceton (10:2,5:2) moczarka kanadyjska ziemia ogrodowa, 50mM KOH, 50mM HCl, glukoza, oran metylowy Aparatura i szkło: Probówki (20 i 60cm3), płytki Petriego, zlewki (50 i 500cm3), słoiki 1L Twist, kolby sto kowe (100 i 500cm3), biureta, mo dzierz porcelanowy, piasek, bibuła filtracyjna, cylindry miarowe (50 i 100cm3), bagietki z gumk recepturk , linijka z podziałk , termometr Wykonanie wiczenia: 1. Identyfikacja szczepów bakteryjnych: W celu identyfikacji szczepów nale y: - dokona obserwacji wzrostu, wygl du i barwy wyrosłych kolonii szczepów bakterii na stałych podło ach ró nicuj cych, zmiany barwy podło a stałego i płynnego w przypadku zdolno ci poszczególnych szczepów bakterii do rozkładu zawartych w podło u ródeł w gla, - rozpozna szczepy bakterii na podstawie wy ej wymienionych cech na płytkach z numerowanymi posiewami. 2. Wpływ nat enia wiatła i temperatury na proces fotosyntezy Pomiary intensywno ci fotosyntezy oparte s na oznaczaniu wymiany gazowej ro lin i polegaj na okre leniu ilo ci pobranego dwutlenku w gla lub wydzielonego tlenu. Do tego celu słu metody chemiczne b d gazometryczne. Do nich m.in. zalicza si półilo ciow metod polegaj c na liczeniu p cherzyków tlenu wydzielonego przez fotosyntetyzuj ce gał zki ro lin wodnych. Przebieg wiczenia: 1 - gał zk moczarki kanadyjskiej umie ci w p tli gumki recepturowej przymocowanej do szklanej bagietki i zanurzy (wierzchołkiem do dołu) w probówce (lub cylindrze) z wod wodoci gow wzbogacon kilkoma kroplami mineralnej wody gazowanej, cało umie ci w kolbie sto kowej napełnionej wod , ustali 3 punkty w odległo ci 2 i 45 cm mi dzy ródłem wiatła a ro lin , w ka dym punkcie kolejno umie ci moczark i okre li ilo wydzielanych p cherzyków tlenu; pomiary wykonywa w ci gu 2 minut po 4 minutach adaptacji ro lin do warunków wietlnych, trzykrotnie dla ka dej odległo ci od ródła wiatła, wyniki bada zestawi w tabeli, Tabela 1. Wpływ nat enia wiatła na proces fotosyntezy odległo od ilo p cherzyków O2 w ci gu 2 minut ródła wiatła powtórzenia (cm) 1 2 3 rednia 2 45 - do dwu kolb sto kowych napełnionych wod wodoci gow o temperaturze 5oC i 25oC wstawia kolejno probówk z zanurzon w wodzie gał zk moczarki kanadyjskiej, po odczekaniu 5 minut, w celu adaptacji moczarki do warunków temperaturowych, liczy wydzielane p cherzyki tlenu przez 2 minuty, pomiar w ka dej temperaturze powtórzy trzykrotnie, wyniki bada zestawi w tabeli, Tabela 2. Wpływ temperatury na proces fotosyntezy temperatura ilo p cherzyków O2 w ci gu 2 minut o ( C) powtórzenia 1 2 3 rednia 5 25 3. Wyodr bnianie i rozdzielanie barwników asymilacyjnych Reakcje fotosyntezy zachodz w specjalnych strukturach komórkowych zawieraj cych barwniki fotosyntetyczne. U fotosyntetyzuj cych Procaryota odbywaj si one w wypustkach błon plazmatycznych, za w komórkach Eucaryota w chloroplastach. Barwniki zwi zane z fotosyntez zalicza si do trzech głównych klas: chlorofili, karotenoidów i fikobilin. Chlorofile i karotenoidy s zwi zkami dobrze rozpuszczalnymi w rozpuszczalnikach organicznych, a fikobiliny dobrze rozpuszczaj si w wodzie. Przebieg wiczenia: - mas ro linn rozetrze w mo dzierzu z piaskiem; uzyskan miazg wymiesza z 96% alkoholem etylowym z dodatkiem acetonu; po ponownym utarciu mieszanin przes czy przez s czek bibułowy; ekstrakt chroni przed wiatłem. - Przygotowa pasek bibuły filtracyjnej o wymiarach 2x20 cm i bibuły chromatograficznej; nanie kolejno kroplami w jednym miejscu (3 cm od dolnej kraw dzi bibuły) wyci g barwników; po ka dym naniesieniu kropli pasek bibuły wysuszy , - do cylindra wla płyn rozwijaj cy (warstwa 1-1,5 cm); pasek bibuły z naniesionymi barwnikami umie ci w cylindrze tak, aby ko cem dotykał płynu rozwijaj cego; cylinder 2 szczelnie przykry ; rozdział barwników prowadzi pod wł czonym dygestorium!; po 30 minutach wyj pasek bibuły, dokładnie wysuszy i rozpozna barwniki. 4. Oznaczanie aktywno ci oddechowej mikroorganizmów glebowych indukowanej substratem (glukoz ) Wyst puj ce w glebie mikroorganizmy oraz zwierz ta bezkr gowe pobieraj w procesie oddychania z powietrza glebowego tlen, a wydzielaj dwutlenek w gla, co mo na wykaza do wiadczalnie. Zazwyczaj ok. 10% mikroorganizmów glebowych zachowuje aktywno . Pozostałe 90% znajduje si w stanie u pienia lub ycia utajonego. Po wprowadzeniu do gleby odpowiednich składników pokarmowych, st enie aktywnych komórek ro nie. Miar aktywno ci oddechowej organizmów jest ilo wydzielonego dwutlenku w gla. W trakcie wiczenia wydzielany CO2 (produkt oddychania) ulega absorpcji przez roztwór KOH, stosownie do reakcji: KOH + CO2 K+ + HCO3Nadmiar KOH jest okre lony ilo ciowo za pomoc miareczkowania HCl. Przebieg wiczenia: - do dwóch słojów litrowych wprowadzi po 400g yznej ziemi ogrodowej; do jednego z nich doda 4g glukozy i wymiesza dokładnie cukier z ziemi , - do słojów wstawi małe zlewki zawieraj ce po 20ml KOH (50mM); słoje szczelnie zakr ci i pozostawi na 24h, - po inkubacji wyj zlewki, zawarto przela do kolb sto kowych o pojemno ci 100ml; doda 2-3 krople wska nika pH – oran u metylowego; nadmiar KOH miareczkowa 50mM HCl do zmiany barwy z ółtej na czerwon , - ilo wydzielonego CO2 obliczy ze wzoru: y= (V0 − V ) ⋅ 50 1000 ⋅ m gdzie: y - aktywno oddechowa gleby [mM CO2/ g gleby/ doba], V0 - obj to KOH u yta do absorpcji CO2 [ml], V - obj to KOH nie zoboj tniona przez HCO3- [ml], odpowiadaj ca obj to ci HCl zu ytego do miareczkowania, m - masa próbki gleby w słoju [g], - porówna aktywno oddechow indukowan dodatkiem glukozy. mikroorganizmów glebowych indukowan i nie Literatura: 2. Kunicki-Goldfinger W.: ycie bakterii, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 1998. 3. Ró alski A.: wiczenia z mikrobiologii ogólnej, cz.1 i cz.2, Wydawnictwo Uniwersytetu Łódzkiego, Łód 1998. 4. Schlegel H.: Mikrobiologia ogólna, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2001. 5. Zmysłowska I.: Mikrobiologia ogólna i rodowiskowa, Wydawnictwo Uniwersytetu Warmi sko-Mazurskiego, Olsztyn 2002. 6. Solomon E.P., Berg L.R., Martin D.W., Villee C.A.: Biologia, Oficyna Wydawnicza Multico, Warszawa 2000. 7. Uziak Z.: Przewodnik do wicze z fizjologii ro lin, Wydawnictwo Akademii Rolniczej, Lublin 1985. 3