Recenzja rozprawy doktorskiej mgra Andrzeja Mazurka

Recenzja rozprawy doktorskiej mgra Andrzeja Mazurka

Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej
Katedra i Zakład Farmacji Fizycznej
41-200 Sosnowiec, ul. Jagiellońska 4
tel.: +48 32 364 15 80-3
Sosnowiec, 20.05.2015
Prof. dr hab. n. farm. Anna Sułkowska
Recenzja rozprawy doktorskiej
mgra Andrzeja Mazurka
„Deskryptory efektu inkorporacji i efektu podstawnika połączonego
wiązaniem podwójnym w układach typowych dla substancji aktywnych
farmakologicznie. Badania obliczeniowe”
na stopień doktora nauk farmaceutycznych
Przedstawiona mi do recenzji rozprawa napisana została pod kierunkiem prof. dr hab. Jana
Czesława Dobrowolskiego. Tematem pracy doktorskiej mgra farm. Andrzeja Mazurka jest
konstrukcja deskryptorów molekularnych, które mogłyby być następnie wykorzystane
w analizach QSAR. Nowe, zaproponowane i opracowane przez Doktoranta parametry
uwzględniają efekt wbudowania heteroatomu do cyklicznego układu nienasyconego oraz oraz
efekt podstawnika połączonego wiązaniem podwójnym.
Przedstawiona mi do recenzji praca doktorska mgra Andrzeja Mazurka ma nietypowy układ.
Po Spisie treści następuje krótki Wstęp (1), w którym Autor tłumaczy konieczność
opracowania nowych molekularnych deskryptorów. Po Celu pracy (2) mgr Andrzej Mazurek
przedstawia (3) 6 hipotez zakładających, ze możliwe będzie skonstruowanie deskryptorów
inkorporacji heteroatomów w cyklicznych i wielocyklicznych układach, jak również
deskryptorów efektu podstawników połączonych podwójnym wiązaniem z układem
podstawionym. Część (4) rozprawy stanowi 2-stronicowy opis deskryptorów EDA, tj. modele
strukturalne używane do ich budowy, ogólny wzór, za pomocą którego można wyznaczyć
deskryptory EDA każdego typu i zwięzły komentarz wyjaśniający, że wzory można także
stosować do struktur niepłaskich. W zakończeniu tej części Autor zwraca uwagę na
nietypowe użycie nazwy „podstawnik”, np. na określenie inkorporacji heteroatomu do układu
cyklicznego lub policyklicznego. Część (5) stanowi opis rezultatów zaprezentowanych przez
mgra Andrzeja Mazurka w 4. publikacjach, stanowiących treść niniejszej rozprawy.
Kolejno opisane 3 oryginalne publikacje można traktować jako 3 kolejne rozdziały opisujące
konstrukcję deskryptorów sigma- i pi-elektronowych (sEDA(II) i pEDA(II) efektu
inkorporacji heteroatomu w nienasyconych układach cyklicznych (Rozdział 5.1.),
deskryptorów sigma- i pi-elektronowych sEDA(III) i pEDA(III) inkorporacji heteroatomu
1
w pozycję węzłową układów wielocyklicznych (Rozdział 5.2.) oraz deskryptorów
podstawienia poprzez podwójne wiązanie sEDA(=) i pEDA(=), niezwykle nowatorskiego.
Powyższe publikacje zamieszczone są odpowiednio w Journal of Organic Chemistry (IF
4.638), Journal of Physical Organic Chemistry (IF 1.245) oraz Organic and Biomolecular
Chemistry (IF 3.487).
W przypadku, gdy większość wyników rozprawy doktorskiej została oceniona przez
niezależnych międzynarodowych ekspertów, rola recenzenta może spełnić się w stwierdzeniu
możliwości aplikacji opracowanych wyników.
Opracowane parametry świadczą o nowatorskim podejściu Doktoranta do problemu
konstrukcji deskryptorów projektowania leków i innych substancji bioaktywnych,
uwzględniających modyfikacje struktury, prowadzącą do uzyskania odpowiedniej aktywności
biologicznej
substancji
prawdopodobieństwo,
że
lub
znalezienie
deskryptory
miejsca
wbudowania
wiążącego.
Jest
w
węzłową
pozycję
także
duże
układów
wieloaromatycznych będą wykorzystywane w biotechnologii.
Rozdział 5.4. jest opisem samodzielnej publikacji przeglądowej, która ukaże się w bieżącym
roku w Acta Poloniae Pharmaceutica - Drug Research (IF 0.693). Świadczy ona o posiadaniu
przez Doktoranta ogólnej wiedzy teoretycznej w dziedzinie, będącej przedmiotem rozprawy
doktorskiej.
Rozdział (6) Wnioski (Conclusions) stanowi 6 wniosków zakończonych wzmianką
o możliwości wykorzystania nowych deskryptorów.
Należy zaznaczyć, że w 3. oryginalnych publikacjach o łącznym współczynniku
oddziaływania IF 9.37 mgr Andrzej Mazurek jest pierwszym autorem, mając za współautora
swojego promotora. Publikacja przeglądowa (IF 0.693) jest jego autorstwa.
Wskazuje to na indywidualny wkład Kandydata w część doświadczalną, stanowiącą istotę
przeprowadzonych badań oraz interpretację i dyskusję wyników.
Rozdział (7), to spis literatury (31 pozycji), na której oparł Autor opis prac, stanowiących
rozprawę doktorską.
Dorobek naukowy, nie będący treścią rozprawy doktorskiej, ale wskazujący naukową drogę
mgra Andrzeja Mazurka, to 5 wieloautorskich publikacji o sumarycznym współczynniku
oddziaływania IF 14.915 (Rozdział 8.2.) i uczestnictwo w 7 konferencjach (Rozdział (9).
Wybór tematu uważam za trafny, zgodny z kierunkiem współczesnych badań nauk
farmaceutycznych i biomedycznych. Oceniana rozprawa doktorska jest częścią prac
prowadzonych przez zespół prof. dr hab. Jana Cz. Dobrowolskiego, promotora rozprawy,
w ramach realizowanej tematyki badawczej.
2
Z obowiązku recenzenta podam kilka niedociągnięć Autora rozprawy, które zwróciły moją
uwagę:
Cytowana literatura powinna zawierać tytuły artykułów, gdyż bez nich trudno jest czytać
Wstęp.
Cel pracy powinien być, moim zdaniem, pozbawiony odnośników literaturowych. Temu
celowi służy w przypadku rozprawy mgra Andrzeja Mazurka – Wstęp/Introduction.
Ponieważ Autor nie przewidział odrębnej Dyskusji, można było wykorzystać część Konkluzje
do
wskazania
przewidywanych
zastosowań
skonstruowanych
deskryptorów
(leki,
oddziaływania, aktywność, właściwości materiałowe, itp.).
Powyższe uwagi nie zmieniają mojej opinii, że wybór i sposób przedstawienia zagadnień
świadczą o dużej wiedzy i dobrym teoretycznym przygotowaniu Doktoranta do badań,
będących tematem Jego pracy doktorskiej. Nie wpływają na moją bardzo dobrą ocenę
wyników przeprowadzonych przez Doktoranta studiów, ich interpretacji i na moje
przekonanie o ich praktycznym znaczeniu.
art. 13 ustawy o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie
sztuki rozstrzyga, że:
„rozprawa doktorska ma być przygotowana pod opieką promotora”. Tak właśnie jest w
przypadku mgra Andrzeja Mazurka – jedynym współautorem prac, które stanowią Jego
rozprawę doktorską, jest prof. dr hab. Jan Cz. Dobrowolski.
„ma stanowić samodzielne rozwiązanie problemu naukowego lub artystycznego i być
dowodem umiejętności samodzielnego prowadzenia pracy naukowej lub artystycznej” - Tak
właśnie jest w przypadku mgra Andrzeja Mazurka – układ każdej z przedstawionych prac jest
klasyczny. Zawiera Wstęp, część Wyniki i Dyskusja/Obliczenia i Konkluzje. Pozwala to
pozytywnie ocenić specjalistyczną
wiedzę
Doktoranta, umiejętność rozwiązywania
problemów oraz korzystania z literatury.
Po dogłębnym zapoznaniu się z treścią przedstawionej mi do oceny pracy doktorskiej Pana
mgra Andrzeja Mazurka stwierdzam, że w pełni odpowiada ona wymogom stawianym
rozprawom doktorskim, określone w art. 13 ustawy z dnia 14 marca 2003 o stopniach
naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach naukowych i tytule naukowym w zakresie
sztuki (Dz.U. z 2003 r., nr 65, poz. 595; z późniejszymi zmianami). Ma ona charakter
naukowy i aplikacyjny.
Ponadto, biorąc pod uwagę odważne podejście do podjętego tematu, ważne nie tylko z
naukowego, ale także aplikacyjnego punktu widzenia, potwierdzone współautorstwem w
3
publikacjach w renomowanych czasopismach oraz nowatorski charakter dyskusji, składam
wniosek o wyróżnienie rozprawy doktorskiej mgra Andrzeja Mazurka.
Przedkładam Panu Dziekanowi oraz Wysokiej Radzie Wydziału Farmaceutycznego
Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego wniosek o dopuszczenie Pana mgra Andrzeja
Mazurka do dalszych etapów przewodu doktorskiego.
4