Rozwój, różnicowanie się i skład komórek włókna lnianego
Transkrypt
Rozwój, różnicowanie się i skład komórek włókna lnianego
Rozwój, różnicowanie się i skład komórek włókna lnianego Marta Preisner Wioleta Wojtasik Jan Szopa Anna Kulma Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Wrocławski, Wrocław Wydział Biotechnologii, Uniwersytet Wrocławski, ul. Przybyszewskiego 63/77, 51148 Wrocław; tel.: (71) 375 63 26, e-mail: marta. [email protected] * Artykuł otrzymano 26 sierpnia 2015 r. Artykuł zaakceptowano 22 października 2015 r. Słowa kluczowe: skład ściany komórkowej, różnicowanie się włókna lnianego, właściwości włókna lnianego, len, Linum usitatissimum Wykaz skrótów: PSC — pierwotna ściana komórkowa; WSC — wtórna ściana komórkowa; CesA — kompleks syntaz celulozy; XG — ksyloglukan; XXT — ksylozylotransferaza; HG — homogalakturonian; RG-I i RG-II — ramnogalakturonian I i II; PMEs — metyloesterazy pektynowe; PG — egzo- i endopoligalakturonazy; 4CL — ligaza hydroksycynamoilo:CoA; CAD — dehydrogenaza alkoholu hydroksycynamonowego; SAD — dehydrogenaza alkoholu sinapylowego; C4H — hydroksylaza kwasu cynamonowego; WAK (ang. wall-associated kinase) — kinazy związane ze ścianą komórkową; THE (ang. receptor-like protein kinase THESEUS 1) — kinazy podobne do receptora białka THESEUS 1; FEI (ang. LRR receptor-like serine/ threonine-protein kinase FEI) — kinazy podobne do receptora LPR seryny/treoniny białka FEI; COBRA (ang. GPI-anchor protein) — białka COBRA zakotwiczone w błonie związane z GPI; PERK (ang. pro-rich extensin-like receptor kinase) — kinazy receptora bogatego w prolinę, podobne do ekstensyny; MYB — białka zawierające domenę wiążącą bogatą w motyw AC; SND — białka związane z WSC zawierające domenę NAC; NST — czynniki wzrostu WSC zawierające domenę NAC Podziękowania: Praca częściowo finansowana przez granty badawcze Narodowego Centrum Nauki nr. 2012/06/A/NZ1/00006 oraz nr. 2014/15/N/NZ9/00444. STRESZCZENIE W łókno lniane wywodzi się z wiązek przewodzących, należy do tkanki wzmacniającej, a jego skład ogranicza się do ściany komórkowej. Tym, co decyduje o jego właściwościach jest właśnie kompozycja, czyli w praktyce kompozycja wtórnej ściany komórkowej. Składają się na nią cztery główne polimery, które stanowią ok. 90% składu włókna: celuloza, hemicelulozy, pektyny, ligniny oraz szereg metabolitów drugorzędowych, białek, wosków i związków nieorganicznych. Ściana komórkowa jest strukturą o dużej złożoności, zarówno składu jak i wzajemnych oddziaływań poszczególnych elementów między sobą. Jest to determinowane przez różnicowanie się i rozwój komórek, a także czynniki środowiskowe, stresy biotyczne i abiotyczne. Molekularne podstawy tych procesów, jak i mechanizmy regulujące syntezą i rearanżacją wtórnej ściany komórkowej są obecnie intensywnie badane. W tej pracy zebrano i przedstawiono najnowsze doniesienia o rozwoju, składzie i metabolizmie składników ściany komórkowej włókna lnianego wraz z molekularnymi podstawami tych procesów. WPROWADZENIE — DLACZEGO LEN? Len zwyczajny (Linum usitatissimum L.) jest najczęściej uprawianą rośliną włóknistą w umiarkowanej strefie klimatycznej. Roślina ta posiada kilka szczególnych cech, które czynią ją niezwykle wartościową, przede wszystkim daje dwa produkty użytkowe: włókno i nasiona. Włókno lniane jest jednym z najmocniejszych pośród naturalnych włókien (bardziej wytrzymałe na rozciąganie od bawełny). Cechuje się również bardzo wysoką chłonnością wody oraz jest bogate w związki o charakterze przeciwutleniającym (bawełna takich związków nie posiada) [1]. Z kolei nasiona, a w konsekwencji olej lniany, są źródłem kwasów tłuszczowych wielonienasyconych z grupy ω-3, witamin A i E oraz lignanów. Len nie jest już postrzegany tylko jako źródło tkaniny na ubrania lub pościel, czy jadalnego oleju. Wraz z rozwojem cywilizacji i zaawansowanej technologii, obserwowany jest wzrost zapotrzebowania na nowe źródła surowców biodegradowalnych czy różnych towarów zgodnych z ogólnie przyjętymi zasadami proekologicznymi. Aby sprostać tym wyzwaniom, w ostatnich latach została przeprowadzona bądź zainicjowana ogromna liczba badań, a len może być potencjalnym źródłem przyjaznych środowisku, naturalnych surowców przemysłowych. Obecnie len dostarcza surowca dla przemysłu spożywczego, tekstylnego, chemicznego, kosmetycznego, motoryzacyjnego oraz papierniczego [1,2]. Znaczenie upraw lnu jest szczególnie istotne w krajach, w których ze względu na uwarunkowania klimatyczne, bawełna nie może być uprawiana, tj. w klimacie umiarkowanym. Włókno lniane nie jest niestety pozbawione wad. Z uwagi na obecność lignin jest stosunkowo sztywne, trudne w obróbce, a tkanina łatwo się gniecie. Ponadto, sam proces otrzymania włókna jest czasochłonny, a jakość włókna zależy od szeregu czynników. W związku z tym, istotne jest, aby dokładnie poznać skład i strukturę włókna lnianego oraz zidentyfikować enzymy (i kodujące je geny) zaangażowane w proces biosyntezy włókna, aby skutecznie tworzyć nowe odmiany roślin o precyzyjnie ulepszonych właściwościach dedykowane konkretnym zastosowaniom. STRUKTURA I SKŁAD WŁÓKNA LNIANEGO POCHODZENIE I ROZWÓJ WŁÓKNA LNIANEGO Zgodnie z pochodzeniem botanicznym, włókno lniane jest włóknem łodygi, podobnie jak włókna juty, konopi przemysłowych, ketmii konopiowatej, ramii i bambusa. Włókno lniane pochodzi z komórek łyka i jest zlokalizowane na obwodzie łodygi, pod warstwą epidermy i komórek parenchymy (Ryc. 1). Pojedyncza komórka włókna lnianego ma wydłużony, cylindryczny kształt oraz zgrubiałą ścianę komórkową i zanikający w trakcie rozwoju protoplast. Średnia długość wynosi 27 mm, ale wartość ta waha się od 9 do nawet 70 mm, natomiast średnia szerokość takiej komórki to 23 µm [3]. Przekrój poprzeczny rozwijających się ko- 416www.postepybiochemii.pl pektyny są syntetyzowane na wczesnych etapach rozwoju komórki, a co za tym idzie, najwięcej jest ich w blaszce środkowej oraz PSC. Synteza celulozy i hemiceluloz rozpoczyna się w późniejszych etapach, a ich największa akumulacja jest we WSC. Najpóźniej rozpoczyna się produkcja lignin i one jako ostatnie są wbudowywane w strukturę ściany komórkowej [5]. CHARAKTERYSTYKA BLASZKI ŚRODKOWEJ Rycina 1. Zdjęcie mikroskopowe przekroju poprzecznego łodygi lnianej. EP — epiderma; KP — kora pierwotna; WWL — wiązka włókna lnianego; FL — floem; WFL — wtórny floem; KS — ksylem; WKS — wtórny ksylem [89]. mórek włókna ukazuje ich poligonalny lub okrągły kształt (Ryc. 1). Rozwój komórek włókna jest podzielony na trzy etapy: różnicowanie się, wydłużanie oraz grubienie ściany komórkowej [4]. Po podziale komórek i specyfikacji, komórki włókna zaczynają się wydłużać i odróżniać od siebie. Proces wzrostu jest znacznie dłuższy niż w przypadku innych rodzajów komórek w łodydze, co umożliwia komórkom włókien osiągnięcie ich niezwykłej długości [4]. Podczas tego etapu protoplast stopniowo zanika. Kiedy komórki zakończą już wzrost, ostatnim etapem jest intensywne pogrubienie ściany komórkowej z równoczesnym ciągłym zanikaniem protoplastów. W ten sposób komórki włókna osiągają swój stan dojrzałości, ze stosunkowo grubą ścianą komórkową i małym światłem komórki. Po dojrzewaniu i zbiorze roślin to, co pozostaje z komórki włókna, to ściana komórkowa — struktura, tworząca włókno lniane. FORMOWANIE SIĘ ŚCIANY KOMÓRKOWEJ Pierwsza warstwa ściany komórkowej, która powstaje jeszcze w trakcie podziału komórki, to płytka równikowa pomiędzy potomnymi komórkami. Płytka ta jest produkowana z pęcherzyków aparatu Golgiego, które zlewając się, wyrzucają swoją zawartość. W ten sposób tworzy się również nowa błona komórkowa. Kolejno powstaje blaszka środkowa, a z początkiem różnicowania się komórek jest syntetyzowana pierwotna ściana komórkowa (PSC). Struktura ściany komórkowej jest stale modyfikowana w celu dostosowania jej do stadium rozwoju oraz stresów biotycznych i abiotycznych. W wielu rodzajach komórek ściana pierwotna jest wzmocniona i pogrubiona przez dodanie wtórnej ściany komórkowej (WSC) [5]. W czasie wzrostu i różnicowania się komórek, nowy materiał budulcowy ściany jest odkładany w pobliżu błony komórkowej, a starsze warstwy ściany są przesuwane na zewnątrz, w stronę blaszki środkowej. W ten sposób skład i struktura ściany komórkowej nie są jednolite, a każda warstwa może mieć inny skład chemiczny i budowę przestrzenną. Innymi słowy, sam proces syntezy ściany komórkowej przebiega w sposób, który umożliwia olbrzymie zróżnicowanie w kompozycji i aranżacji nawet w obrębie komórki, zapewnia różnorodność i elastyczność składu w zależności od zmiennych czynników środowiskowych i regulatorowych, a także wyznacza samą dynamikę syntezy [5,6]. Uważa się, że poszczególne elementy nie są syntetyzowane jednocześnie, a na różnych etapach życia komórki, i tak np. Postępy Biochemii 61 (4) 2015 Blaszka środkowa znajduje się pomiędzy pierwotnymi ścianami komórkowymi przylegających komórek roślinnych. Jest cienka, ma od 0,5 do 1,5 µm grubości i jest zbudowana z pektyn, które w trakcie różnicowania mogą być wzbogacone w niewielką ilość lignin [7]. Pektyny blaszki środkowej są bogato usieciowione jonami magnezu i wapnia, tworząc sole kwasów uronowych. Jej podstawową funkcją jest spajanie komórek oraz zapewnienie przekazywania sygnałów pomiędzy poszczególnymi komórkami [5]. Jest ona podatna na trawienie enzymatyczne przez poligalakturonazy i inne enzymy degradujące pektyny, pochodzenia zarówno roślinnego, jak i grzybowego [8,9]. Blaszka środkowa jest rozkładana w procesach termicznych (gotowanie), ulega również częściowemu rozpuszczeniu w zasadach. CHARAKTERYSTYKA PIERWOTNEJ ŚCIANY KOMÓRKOWEJ Pierwotna ściana komórkowa jest usytuowana najbardziej na zewnątrz komórki, w lnie ma grubość jedynie ok. 0,2 µm [5,7]. Najważniejsze funkcje pełni w rosnących komórkach, gdyż poprzez mobilność i zdolność do poddawania się turgorowi komórki umożliwia wzrost, nadaje kształt oraz zapewnia integralność. Bierze również udział w adhezji komórek i przekazywaniu sygnałów pomiędzy komórkami. Jest strukturą elastyczną i wysoce uwodnioną, a jej charakterystyczny skład przekłada się na pełnione funkcje. PSC jest zbudowana z wielocukrów (nawet do 90%), pośród których dominują pektyny. Brak jest w niej natomiast lignin, jednak niektóre źródła podają, że w PSC można znaleźć śladowe ilości lignin [6,7]. W porównaniu do WSC, PSC jest uboższa w celulozę i hemicelulozy, a mikrofibryle celulozowe mają niską masę cząsteczkową w porównaniu do celulozy we WSC [6]. Procentowy udział poszczególnych wielocukrów w suchej masie jest zróżnicowany i zależy nie tylko od gatunku, odmiany, ale nawet od tkanki. Lniana PSC należy do typu I, do którego należą wszystkie rośliny dwuliścienne oraz część roślin jednoliściennych. Ten typ ściany jest bogaty w pektyny, a celuloza i hemicelulozy występują w porównywalnej ilości. W łodydze (skąd pochodzi włókno), PSC jest stosunkowo bogata w celulozę, nawet do 33% suchej masy, pektyny (głównie homogalakturonian oraz ramnogalakturonian I i II) stanowią 30-40%, hemicelulozy (przede wszystkim ksyloglukan oraz w niewielkich ilościach arabinoksylan i glukuronoarabinoksylan) stanowią do 26%, a białka to od 2 do 10% PSC [6,10]. Luźno i nieregularnie ułożone mikrofibryle celulozowe są usieciowione hemicelulozami poprzez wiązania wodorowe, tworząc rusztowanie ściany, a wolne przestrzenie są wypełnione przez pektyny i niewielką ilość białek. Dzięki swej strukturze, celuloza pełni w PSC ważną rolę w nadawaniu komórce kierunku rozrostu. Białka obecne w PSC dzielą się na dwie 417 klasy: białka strukturalne i enzymatyczne. Te pierwsze są częścią szkieletu ściany komórkowej, podczas gdy białka enzymatyczne biorą udział w rearanżacji ściany komórkowej i szlakach sygnalnych [6]. CHARAKTERYSTYKA WTÓRNEJ ŚCIANY KOMÓRKOWEJ WSC jest charakterystyczna dla komórek, które przestały już rosnąć i dzielić się, przy czym nie występuje we wszystkich typach komórek. Otacza wyspecjalizowane komórki np. ksylemu czy komórki włókien. WSC, w odróżnieniu od PSC, dzieli się na trzy warstwy: S1, S2 i S3, a jej podstawowym budulcem jest celuloza, wzbogacona w hemicelulozy i pektyny, a także ligniny, które nadają sztywność [11]. Dodatkowo, WSC zawiera niewielkie ilości związków o różnym pochodzeniu i charakterze chemicznym, które wpływają na jej właściwości mechaniczne i przepuszczalność. Należy zauważyć, że S1, S2 i S3 różnią się proporcjami pomiędzy poszczególnymi składowymi oraz orientacją mikrofibryli celulozowych. Te trzy warstwy mogą być modyfikowane w okresie dojrzewania komórek w zależności od warunków środowiskowych. S1 jest najcieńszą spośród warstw WSC, ma grubość ok. 0,1 do 0,35 µm. Mikrofibryle celulozowe są w niej zorganizowane w taki sposób, że z główną osią włókna tworzą bardzo duży kąt (60–80°) [7]. Często jest postrzegana jako warstwa przejściowa pomiędzy PSC a WSC. Warstwą dominującą w WSC jest S2, która stanowi ok. 75–85% całej WSC i to ta warstwa przede wszystkim jest odpowiedzialna za mechaniczne właściwości włókna lnianego. Grubość warstwy S2 waha się od 1 do nawet 10 µm [11]. Mikrofibryle celulozowe są w niej ułożone niemal równolegle do osi włókna, z niewielkim odchyleniem około 10–11°, które zapewnia niezwykłą odporność takiej struktury na działanie sił zewnętrznych [7,12]. Najbardziej wewnętrzna warstwa WSC–S3, choć podobna w swej strukturze do S1, jest jednak od niej nieco grubsza, ma od 0,5 do 1,1 µm [7]. CHARAKTERYSTYKA POLIMERÓW ŚCIANY KOMÓRKOWEJ Dojrzałe włókno lniane, będące surowcem technologicznym, to w rzeczywistości ściana komórkowa, w skład której poza celulozą, która stanowi ok. 65–70% suchej masy włókna, wchodzą jeszcze hemicelulozy (15%), pektyny oraz ligniny (razem 10–12%). Polimery te wspólnie tworzą sieć przestrzenną za pomocą różnego rodzaju wiązań chemicznych i oddziaływań fizycznych, co przekłada się na wytrzymałość i odporność na stresy mechaniczne włókna lnianego. Ściana komórkowa włókna zawiera również śladowe ilości innych związków, takich jak cukry proste oraz metabolity szlaku fenylopropanoidowego, woski, sterole i niskocząsteczkowe związki hydrofobowe oraz związki nieorganiczne (pozostałe 3–10%) [13,14]. Komórka roślinna modyfikuje strukturę ściany komórkowej w odpowiedzi na wzrost, różnicowanie, warunki klimatyczne i bodźce środowiskowe (zranienie, infekcja patogenna, stres metaboliczny) jakim ulegają rośliny. Ilość składowych polimerów we włóknie, proporcje pomiędzy nimi, skład monomerów, stopień rozgałęzienia i rodzaje wiązań zależą od wielu czynników i są bardzo różne pomiędzy poszczególnymi gatunkami roślin, odmianami, a nawet w pojedynczej komórce. To zjawisko tłumaczy tak dużą różnorodność pomiędzy właściwościami włókien naturalnych. Rośliny mają dużą zdolność dostosowania się do trudnych czy zmiennych warunków środowiska, przeciwstawienia się infekcjom patogennym, a także do konkurencji z innymi roślinami o światło, wodę i substancje odżywcze. W związku z tym, ściana komórkowa podlega ciągłym modyfikacjom, żeby dostosować swój skład i funkcje do odpowiedniego stadium w rozwoju rośliny czy do warunków środowiska [6]. CELULOZA BUDOWA I FUNKCJE CELULOZY Celuloza jest najpowszechniejszym biopolimerem w przyrodzie i głównym budulcem ścian komórkowych roślin. Mikrofibryle celulozowe są zbudowane z nierozgałęzionych łańcuchów β-1,4-glukanu i stabilizowane wewnątrz- i zewnątrzcząsteczkowymi wiązaniami wodorowymi oraz oddziaływaniami sił Van der Waalsa (Ryc. 2) [6,15]. Pojedyncza mikrofibryla ma średnicę ok. 0,1 do 0,3 μm i wysoką masę molekularną. W ścianie komórkowej celuloza jest obecna w dwóch konformacjach: amorficznej, o nieuporządkowanych, luźno ułożonych mikrofibrylach i krystalicznej, o wysoce uporządkowanej strukturze i równolegle ułożonych mikrofibrylach (Ryc. 2) [16]. We wszystkich roślinach, naturalnie występuje tylko celuloza typu I, gdzie łańcuchy glukanowe mikrofibryli są ułożone równolegle [6]. Łańcuchy ułożone antyrównolegle tworzą celulozę typu II. Włókno lniane charakteryzuje przesunięcie płaszczyzny osi mikrofibryl i osi włókna. Właśnie w celulozie krystalicznej oś mikrofibryli jest ułożona pod kątem ok. 10–11° w stosunku do osi włókna [7,12]. Procentowy udział obszarów o strukturze krystalicznej w całym biopolimerze celulozowym jest nazywany indeksem krystaliczności i w dużym stopniu determinuje właściwości fizyczne i mechaniczne włókna [16,17]. Obszary krystaliczne są odporne na enzymatyczną i chemiczną degradację oraz zapewniają sztywność włókna [9]. Z kolei, im mniej obszarów krystalicznych w ścianie komórkowej, tym większa wytrzymałość zmęczeniowa, rozciągalność i odporność na uderzenia. Ponadto, ze spadkiem indeksu krystaliczności rośnie chłonność wody, gdyż amorficzna Rycina 2. Schemat obrazujący syntezę celulozy wraz z niezbędnymi substratami i enzymami. Frc — fruktoza; UDP-glukoza — urydyno-5’-difosforan glukozy; UDP — urydyno-5’-difosforan; SUS — syntaza sacharozy; P — reszta fosforanowa [20]. 418www.postepybiochemii.pl celuloza przypomina swą strukturą gąbkę (przestrzenie pomiędzy niezorganizowanymi łańcuchami celulozy wiążą cząsteczki wody) [18]. Co więcej, liczba wolnych grup hydroksylowych nadaje celulozie hydrofilowy charakter, co ma też wpływ na późniejsze mieszanie włókien lnianych z hydrofobowymi matrycami kompozytów [19]. Podsumowując, celuloza pełni w ścianie komórkowej rolę strukturalną, będąc głównym budulcem i rusztowaniem ściany komórkowej, wokół którego pozostałe polimery są ułożone przestrzennie. Ponadto, celuloza nadaje ścianie wytrzymałość, determinując właściwości mechaniczne i fizykochemiczne. METABOLIZM CELULOZY Kompleks syntaz celulozy (CesA) jest heksamerem o strukturze przypominającej rozetę. Każda z 6 podjednostek składa się z 6 mniejszych podjednostek, co sugeruje, że jednocześnie może być syntetyzowanych 36 łańcuchów glukanowych, które łączą się w jedną mikrofibrylę (Ryc. 2). Jednak ostatnie doniesienia wskazują, że część mikrofibryli może składać się z 18 lub nawet mniejszej liczby łańcuchów [20]. Ponadto, w modelowej roślinie rzodkiewnika pospolitego wyodrębniono dotychczas 10 genów odpowiadających różnym podjednostkom kompleksu CesA. Licznie prowadzone badania wskazują, że białka kodowane przez te geny pełnią różne funkcje. CesA1, CesA3 i CesA6 biorą udział w syntezie PSC, a CesA4, CesA7 i CesA8 odpowiadają za pogrubianie WSC w wiązkach przewodzących. Badania wykazały, że CesA9 uczestniczy w syntezie WSC w nasionach rzodkiewnika pospolitego. Natomiast białka CesA2 i CesA5 również częściowo uczestniczą w syntezie PSC, jednak nie są niezbędne, a ich dokładna funkcja nie jest jeszcze poznana, podobnie jak białka CesA10 [20]. Substratem do produkcji celulozy jest UDP-glukoza, która jest syntetyzowana przez pirofosforylazę UDP-glukozy lub syntazę sacharozy. Pirofosforylaza UDP-glukozy katalizuje przeniesienie reszty UDP na cząsteczkę glukozy. Natomiast syntaza sacharozy katalizuje zarówno proces syntezy sacharozy, jak i reakcję odwrotną, przeniesienie reszty UDP na glukozę pochodzącą z sacharozy (Ryc. 2) [15,20]. Syntaza sacharozy może być zintegrowana z kompleksem CesA lub może funkcjonować indywidualnie w cytoplazmie. Ponadto, dwa dodatkowe enzymy zaangażowane w syntezę i fosforylację fosforanu sacharozy, to odpowiednio syntaza fosforanu sacharozy i fosfataza fosforanu sacharozy. Upraszczając, dwie kolejno katalizowane przez te enzymy reakcje prowadzą do otrzymania UDP-glukozy i D-fruktozo- 6-fosforanu z sacharozy [15,20]. W czasie wzrostu i rozwoju roślin dochodzi do reorganizacji ściany komórkowej oraz zmian w jej elastyczności i właściwościach, w zależności od organu czy tkanki. Rearanżacja polimerów ściany komórkowej zachodzi na skutek działania wielu enzymów. Celuloza jest modyfikowana przez celulazy, do których m. in. należą β-1,4-glukanazy [21]. Białka te, podobnie jak kompleks CesA, są zakotwiczone w błonie komórkowej. Hydrolizują wiązania β-1,4glikozydowe w łańcuchach glukanowych celulozy amorficznej oraz częściowo mają zdolność usuwania wolnych reszt glukozy z ksyloglukanów. Natomiast degradacja celuPostępy Biochemii 61 (4) 2015 lozy następuje wyłącznie przez działanie zewnątrzkomórkowych β-1,4-glukanaz pochodzenia bakteryjnego bądź grzybowego [21]. Synteza celulozy jest obecnie jednym z intensywnie badanych zagadnień. Znany jest mechanizm tego procesu, natomiast wiedza o jego podstawach molekularnych nadal jest niekompletna. Z uwagi na rolę i istotność celulozy w ścianie komórkowej, proces jej syntezy jest pod ścisłą kontrolą. Dotyczy to zarówno grubości mikrofibryli, liczby łańcuchów glukanowych w mikrofibryli, stopnia krystaliczności czy organizacji mikrofybryli [22]. Prawdopodobnie również białka z innych rodzin uczestniczą w syntezie celulozy, choć ich funkcja w tym procesie nadal pozostaje niejasna [20]. HEMICELULOZY BUDOWA I FUNKCJE HEMICELULOZ Hemicelulozy, to drugi po celulozie najczęściej występujący w przyrodzie wielocukier, który stanowi nawet 25% biomasy (w suchej masie roślin) [23]. Jest to całkowicie amorficzny heteropolimer, na który składają się rozgałęzione łańcuchy cukrowe, skomponowane głównie z β-1,4polisacharydów: ksyloglukanu (XG), ksylanu, mannanu, glukomannanu i mieszanych β-(1→3, 1→4)-glukanów (Ryc. 3). Dodatkowo może być wydzielonych wiele podgrup hemiceluloz, w zależności od składu łańcuchów bocznych. W przeciwieństwie do celulozy, masa cząsteczkowa łańcuchów hemiceluloz jest znacznie mniejsza, mogą one również zawierać, oprócz wolnych grup -OH, pewną liczbę wolnych grup acetylowych, które powodują, że hemicelulozy są częściowo rozpuszczalne w wodzie [23,24]. Ksyloglukan wiąże się z mikrofibrylami celulozowymi w różnych konformacjach, co powoduje, że w odróżnieniu od celulozy, XG może być podatny na degradację [6]. Hemicelulozy w PSC typu I roślin wyższych, w tym lnu, składają się głównie z ksyloglukanu, którego szkielet tworzą reszty D-glukozy połączone wiązaniami β-1,4glikozydowymi; jest on podstawiony łańcuchami bocznymi D-ksylozy złączonymi wiązaniami β-1,6-glikozydowymi (Ryc. 3). We wtórnej ścianie komórkowej roślin okrytonasiennych dominującymi są ksylany, których łańcuch główny stanowi D-ksyloza połączona wiązaniami β-(1→4) [23]. Większość ksylanów WSC roślin dwuliściennych ulega różnym modyfikacjom: acetylacji bądź estryfikacji kwasami fenolowymi. Dzięki temu ściana komórkowa jest bardziej odporna chemicznie oraz wytrzymalsza mechanicznie [25]. Ksylany są również dość powszechne w PSC, jednak mają inne podstawniki. Pozostałe grupy hemiceluloz występują w roślinach wyższych w znacznie mniejszych ilościach, w odniesieniu do ksylanów i ksyloglukanów. Mieszane glukany występują przede wszystkim w PSC, gdzie wspomagają elastyczność i rozszerzanie ściany komórkowej [20]. Funkcje hemiceluloz dzielą się na strukturalne i zapasowe, i różnią się w zależności od tkanki oraz są silnie określane przez ich skład [24]. Prawdopodobnie złożoność ich struktury i właściwości chemicznych powoduje, że hemicelulozy mogą różnorako oddziaływać z pozostałymi skła- 419 białek transferaz glikozylowych, które są podobne do syntaz celulozy. Zidentyfikowano kilka klas tych enzymów, które odpowiadają za syntezę łańcuchów głównych poszczególnych klas hemiceluloz. Z uwagi na ogromne zróżnicowanie składu hemiceluloz, w ich syntezę jest zaangażowanych wiele rodzajów transferaz o różnej swoistości substratowej. Jak dotąd, dopiero nieliczne zostały zidentyfikowane i opisane [23,24]. Jednym z ważniejszych enzymów jest α-(1→6)ksylozylotransferaza (XXT), która przyłącza D-ksylozę do łańcucha głównego ksyloglukanów. W rzodkiewniku pospoliRycina 3. Schemat przykładowej budowy i składu hemiceluloz. XG — ksyloglukan; α/β — rodzaj wiązań glikozydowych [90]. tym zidentyfikowano i opisano dwa takie enzymy XXT1 i XXT2 dowymi ściany komórkowej [26]. W PSC hemicelulozy bez[27]. Natomiast łańcuchy boczpośrednio decydują o stopniu rozciągliwości ściany, a tym ne ksylanów syntetyzowane są przez enzymy z grupy samym tempie rozrostu komórek. Ponadto zapewniają inα-glukuronozylotransferaz i α-arabinofuranozylotransferaz. tegralność całej struktury ściany. Przede wszystkim jednak, Innym przykładem enzymów syntetyzujących hemicew kontekście struktury ściany komórkowej i wpływu na jej lulozy są: galaktozylotransferaza glukomannanu oraz właściwości, a co za tym idzie, właściwości włókna lnianeβ-mannozylotransferaza glukomannanu. Pierwsza bierze go, hemicelulozy sieciują mikrofibryle celulozy za pomocą udział w syntezie galaktomannanów w bielmie nasion, a wiązań wodorowych i kowalencyjnych [6]. Ksyloglukan druga posiada aktywność syntazy mannanu i glukomannawiąże się z mikrofibrylami celulozy już w momencie, kiedy nu. Enzymy te wykorzystują GDP-mannozę lub GDP-glusą one syntetyzowane do macierzy PSC, co powoduje, że kozę jako substraty [28]. mikrofibryle celulozowe mają mniejszą średnicę (mniej łańcuchów glukozowych na mikrofibrylę) niż te w WSC. HeW degradacji hemiceluloz, podobnie jak w syntezie, bierze micelulozy osłabiają sieć celulozową (gdyż uniemożliwiają udział wiele enzymów z różnych grup, które hydrolizując tworzenie się krystalicznej formy celulozy), z drugiej jednak wiązania glikozydowe wewnątrz łańcuchów lub na ich koństrony, dzięki temu, zwiększają rozciągliwość i poprawiają cach, odcinają pojedyncze cząsteczki cukrów lub ich krótwłaściwości mechaniczne, co pozwala PSC na rozszerzanie kie łańcuchy (oligocukry). Do tych enzymów należą m. in.: się i daje odporność na stresy, którym poddawana jest koβ-(1-4)-glukanazy, glukozydazy (β-glukozydaza), ksylanamórka w czasie wzrostu [6]. Podsumowując, przez udział w zy (endo-β-1,4-ksylanaza), ksylozydazy (α-1,4-ksylozydaza; zapewnieniu odpowiedniej orientacji celulozy oraz tworząc β-1,4-ksylozydaza), mannozydazy (β-mannozydaza), garusztowanie dla celulozy i/lub regulując przestrzenie polaktozydazy (α-galaktozydaza) [29]. między mikrofibrylami, hemicelulozy przyczyniają się do wytrzymałości włókna. Ponadto istnieją doniesienia o koPEKTYNY walencyjnych oddziaływaniach hemiceluloz z pektynami BUDOWA I FUNKCJE PEKTYN i ligninami, co również stabilizuje i modyfikuje strukturę ściany komórkowej [23]. Celulozowo-hemicelulozowe rusztowanie ściany komórkowej jest wzmocnione pektynami. Jest to kolejny, obok Drugą ważną funkcją hemiceluloz jest funkcja zapasowa. hemiceluloz, polimer cukrowy o zróżnicowanej budowie. Wielocukry, wchodzące w ich skład, stanowią ruchome źróPektyny różnią się znacznie składem, nawet w zależności dło węgla w stanach niedoboru glukozy lub zwiększonego od frakcji komórki, gdyż ich funkcja jest określana przez zapotrzebowania na energię, przede wszystkim w ściakompozycję. Uogólniając, pektyny są zbudowane z kwasonach komórkowych nasion np. ksyloglukany i glukomanwego łańcucha głównego oraz zawierających cukry obojętnany są wykorzystywane przez nasiona niektórych roślin ne łańcuchów bocznych (Ryc. 4) [30]. Najczęściej występudwuliściennych jako materiał zapasowy uruchamiany po jącym monomerem jest kwas galakturonowy, który stanowi etapie kiełkowania [23,24,26]. ok. 70% wszystkich cukrów pektynowych. Łańcuch główny zbudowany z reszt tego kwasu jest rozgałęziony łańcuchami METABOLIZM HEMICELULOZ bocznymi różnych cukrów połączonych wiązaniami α-1,4glikozydowymi. W pektynach, poza kwasem galakturoHemicelulozy są syntetyzowane w cysternach aparatu nowym, najczęściej występują: ramnoza, arabinoza, ksyloGolgiego przez szereg enzymów, należących do rodziny za, kwas glukuronowy oraz galaktoza. Można wyróżnić 5 420www.postepybiochemii.pl Rycina 4. Schemat przykładowej budowy, degradacji i modyfikacji pektyn. głównych klas strukturalnych pektyn: homogalakturonian (HG), ramnogalakturonian I i II (odpowiednio RG-I i RG-II), ksylogalakturonian oraz apiogalakturonian. Dwa ostatnie polimery są charakterystyczne tylko dla określonych grup roślin i w ścianie komórkowej lnu występują w śladowych ilościach. Inny podział, który dobrze sprawdza się we włóknie lnianym, to podział pektyn na dwie grupy. Pierwsza to pektyny obecne w PSC i blaszce środkowej, a druga to pektyny obecne w WSC [31]. Do pierwszej grupy należą pektyny wielkocząsteczkowe, pośród których dominuje homogalakturonian (65%) i ramnogalakturonian-I (25– 30%), które są podstawione krótkimi łańcuchami bocznymi, zbudowanymi głównie z galaktozy. Drugi rodzaj pektyn, związany funkcjonalnie z celulozą, jest reprezentowany głównie przez ramnogalakturonian I z dłuższymi łańcuchami bocznymi galaktozy [31,32]. Pektyny łączą się ze sobą różnymi rodzajami wiązań, które obejmują nie tylko łańcuchy boczne, ale i łańcuchy główne, tworząc wiele poziomów usieciowania. Składają się na nie: wiązania glikozydowe, sieciowanie jonami wapnia, wiązania estrowe z boranami oraz wiązania kowalencyjne ze związkami fenolowymi i ewentualnie innymi związkami [6]. Homogalakturonian jest polimerem zbudowanym z podjednostek kwasu galakturonowego połączonych wiązaniami α-1,4-glikozydowymi. Jest to podstawowy wielocukier pektynowy występujący w ścianach komórkowych (60–65%). HG łączy się kowalencyjnie z RG-I, RG-II, a także prawdopodobnie tworzy sieć z ksyloglukanem, która wspiera strukturę ściany komórkowej. Łańcuchy HG mogą być modyfikowane przez metylację lub acetylację, co znacząco wpływa na ich właściwości. Wzór i stopień metyloestryfikacji/acetylacji zależy od gatunku rośliny i często jest przez nie dziedziczony. Ponadto, metyloestryfikacja jest silnie regulowana przez roślinę na różnych etapach rozwoju i jest tkankowo specyficzna, a demetyloestryfikacja jest narzędziem modyfikującym funkcje pektyn, gdyż bezpośrednio wpływa na powinowactwo do kationów wapnia zaangażowanych w proces żelowania łańcuchów HG oraz na powinowactwo RG-II do boranów [6,30]. Wolne, niemetylowane grupy COOPostępy Biochemii 61 (4) 2015 degradację [30,34]. kwasu galakturonowego są ujemnie naładowane i mogą oddziaływać z kationami Ca2+, tworząc stabilne struktury żelowe. Najbardziej podatny na chelatację jonami Ca2+ jest niemetylestryfikowany HG, a silnie wspiera ją redukcja łańcuchów bocznych RG-I [6,30]. Przykładowo, w ścianie komórkowej groszku demetyloestryfikacja HG oraz usunięcie łańcuchów bocznych RG-I skutkowało wzmocnieniem jej struktury [33]. Demetyloestryfikacja ma również przełożenie na procesy fizjologiczne roślin i odporność na infekcje patogenne przez rozluźnienie struktury ściany komórkowej i zwiększenie jej podatności na enzymatyczną Ramnogalakturonian I jest zbudowany z łańcucha głównego, który składa się z powtarzanych dwóch reszt cukrowych: kwasu galakturonowego i ramnozy, połączonych wiązaniami α-1,2- i α-1,4-glikozydowymi. Rdzeń RG-I jest kontynuacją HG, a nie osobnym łańcuchem polimerowym. Jako podstawniki dominują łańcuchy arabinowe, arabinogalaktanowe oraz galaktanowe [35]. Ponadto cząsteczki kwasu galakturonowego RG-I mogą być metylowane, podobnie jak w homogalakturonianie. Ramnogalakturonian II to fragment HG o długości ok. 7-9 reszt kwasu galakturonowego, które są podstawione czterema charakterystycznymi łańcuchami bocznymi o określonej budowie. W sumie, RG-II jest zbudowany z 12 różnych typów reszt cukrowych. Jego udział w strukturze ściany komórkowej nie przekracza kilku procent. HG, RG-I i RG-II wpływają na funkcje PSC w odniesieniu do wytrzymałości, adhezji komórek, funkcji aparatów szparkowych i odpowiedzi rośliny na infekcje. Pektyny zapewniają ścianie komórkowej odpowiednią gęstość, porowatość oraz dystrybucję enzymów i innych białek. Te, a także inne doniesienia literaturowe wskazują, że raczej geny odpowiedzialne za modyfikację bądź degradację pektyn, niż geny syntetyzujące, decydują o właściwościach WSC [30]. Dodatkowo, obecność pektyn w PSC i WSC zwiększa pojemność wymiany kationowej i sorpcji wody. Pektyny są także inkrustowane kwasami fenolowymi, będąc ich nośnikiem i rezerwuarem w roślinie [6]. Jak już wspomniano, pektyny są trawione przez patogeny na wczesnych etapach infekcji. W związku z czym produkty ich rozpadu, oligogalakturoniany, są cząsteczkami sygnalnymi indukującymi mechanizmy obronne, takie jak produkcja fitoaleksyn lub innych związków o charakterze antybiotykowym, synteza białek oraz toksycznych dla patogenu peptydów w odpowiedzi na infekcję, wzmacnianie ściany komórkowej (wzmożone wbudowywanie lignin, białek i cukrów w ścianę komórkową) [6,36]. Oligogalakturoniany uczestniczą także we wzroście i rozwoju rośliny, np. w dojrzewaniu owoców. 421 Pektyny są obecne w blaszce środkowej, gdzie pełnią kluczową rolę jako substancja spajająca komórki, przez co zapewniają spoistość wiązkom komórek włókna. Sieciowanie pektyn (tu głównie HG) odbywa się w tym elemencie strukturalnym rośliny za pomocą różnych wiązań, wśród których dominują mostki wapniowe. Ze względu na fakt, że pektyny są łącznikiem pomiędzy komórkami, są one głównym celem dla mikroorganizmów podczas ekstrakcji włókna ze słomy (roszenia). Zasadą jest, że im dłuższe roszenie, tym gorsza jakość włókna. Nasunęło to hipotezę, że niższy poziom pektyn w pewnym stopniu może poprawić jakość włókna [37]. Istotnie, obniżenie poziomu pektyn spowodowało przyspieszenie roszenia. Pektyny w komórkach są ściśle związane z WSC, prawdopodobnie wiążąc się z celulozą tuż po jej syntezie, co powoduje, że przyjmuje ona postać amorficzną (nieuporządkowaną), co z kolei zwiększa wytrzymałość na rozciąganie takiego polimeru. Istnieją doniesienia sugerujące, że obniżenie zawartości pektyn negatywnie wpływa na niektóre właściwości mechaniczne włókien poprzez zmniejszenie interakcji pomiędzy obszarami amorficznymi i krystalicznymi [38,39]. Z kolei wzrost zawartości egzo-PG w roślinie wywołał obniżenie zawartości pektyn, co spowodowało pogorszenie właściwości mechanicznych w ryżu, liściach jabłoni i tytoniu [40,41,42]. Uważa się, że zmniejszenie rozciągliwości i większa sztywność ściany komórkowej korelują się z mniejszą liczbą łańcuchów arabinowych i galaktanowych oraz zwiększonym stopniem usieciowienia HG przez kationy wapnia. Również kompleksy RG-II z boranem przyczyniają się do zwiększenia mechanicznej siły ściany komórkowej. Boran jest bezpośrednio zaangażowany w odwracalną dimeryzację dwóch cząsteczek RG-II. Jego dimery odgrywają ważną rolę w wytrzymałości ścian komórkowych na naprężenia mechaniczne, biorąc udział w utrzymaniu wertykalnej orientacji roślin, a także mogą ułatwiać rozpoczęcie lignifikacji WSC [6,30]. Ponadto pektyny, jako regulatory zawartości jonów Ca2+, odgrywają ważną rolę w procesie polimeryzacji lignin, który jest inicjowany w regionach blaszki środkowej bogatych w pektyny. Wskazuje to na możliwość funkcjonalnego powiązania pektyn i lignin na wczesnych etapach lignifikacji WSC [30]. METABOLIZM PEKTYN Z uwagi na zróżnicowaną budowę, w syntezę pektyn zaangażowanych jest wiele enzymów, w tym: glikozylotransferazy, metylotransferazy i acetylotransferazy. Enzymy biosyntezy pektyn do swej aktywności wymagają specyficznych substratów, cukrów z przyłączonym nukleotydem (NDP-cukier) oraz akceptorów. Obecny model biosyntezy pektyn zakłada, że glikozylotransferazy zlokalizowane są wewnątrz aparatów Golgiego, gdzie następuje synteza łańcuchów pektynowych wzdłuż całego organellum. Pektyny ulegają metyloestryfikacji już w trakcie syntezy i w takiej formie są transportowane za pomocą pęcherzyków aparatu Golgiego i wydzielane do apoplastu. Podstawowym donorem do syntezy HG jest UDP-D-galakturonian, który powstaje z UDP-D-glukuronianu w reakcji katalizowanej przez 4-epimerazę UDP-D-glukuronianu [35,43]. Synteza HG wymaga aktywności więcej niż jednego enzymu, i biorą w niej udział również m. in. α-1,4- galakturonozylotransferazy. Enzymy te przenoszą reszty kwasu galakturonowego z UDP-α-D-galakturonianu na niezredukowany koniec wydłużanego łańcucha HG. Biosynteza pozostałych rodzajów wielocukrów pektynowych zachodzi dzięki aktywności wielu enzymów, wśród których można wyróżnić ksylozylotransferazę ramnogalakturonianu II, ksylozylotransferazę, arabinozylotransferazę oraz galaktozylotransferazę. Ksylozylotransferaza bierze udział w syntezie ksylogalakturonianu, katalizując przyłączanie D-ksylozy do rdzenia HG. Natomiast arabinozylotransferaza oraz galaktozylotransferaza biorą udział w syntezie ramnogalakturonianu I. Pierwszy enzym katalizuje przeniesienie D-arabinozy na arabinian i galaktan, a drugi przyłącza D-galaktozę do rdzenia RG-I. Natomiast jedynym zidentyfikowanym enzymem biorącym udział w syntezie RG-II jest ksylozylotransferaza ramnogalakturonianu II, która katalizuje syntezę łańcucha bocznego RG-II, składającego się z cząsteczek D-ksylozy i D-fukozy [35,43]. Modyfikacje pektyn, przez dodanie grup metylowych lub acetylowych są powiązane z rozwojem rośliny. Metylotransferazy są aktywne głównie podczas syntezy pektyn, w aparacie Golgiego. Donorami grup metylowych są cząsteczki S-adenozylo-metioniny, a akceptorami cząsteczki kwasu galakturonowego HG, RG-II oraz ksylogalakturonianu. Pektyny są wydzielane do macierzy ściany komórkowej w postaci silnie metyloestryfikowanej. Dopiero na zewnątrz błony komórkowej działają metyloesterazy pektynowe (PMEs), które selektywnie usuwają grupy metylowe. PMEs między innymi biorą udział w rearanżacji ściany komórkowej związanej z atakiem patogenu bądź mechanizmami obronnymi. Duża metylacja pektyn (niski poziom białek PMEs) wspomaga obronę roślin przed atakiem patogenu i degradacją ściany komórkowej [44]. Ponadto PMEs są bardzo bogatą rodziną białek, o różnej specyficzności, w związku z czym, efektywne wyciszenie konkretnej PME aktywowanej przez infekujący patogen prowadzi do wzrostu odporności rośliny [45,46]. Odwrotnie, wzrost syntezy PMEs mógłby prowadzić do obniżenia odporności roślin. Różnice w podatności Solanum tuberosum na infekcję bakterią Erwinia carotovora korelują ze stopniem metylacji pektyn, odmiany bardziej odporne mają wyższy poziom metylacji [47]. Podobnie rośliny rzodkiewnika pospolitego ze zredukowaną aktywnością PME są bardziej odporne na grzybowe infekcje Botrytis cinerea [48]. Acetylacja również zachodzi w aparacie Golgiego, dzięki aktywności acetylotransferazy pektynowej, która katalizuje przeniesienie grupy octanowej z acetylo-CoA na reszty kwasu uronowego w HG, RG-I i RG-II [6]. Po osadzeniu w strukturze ściany komórkowej pektyny ulegają również selektywnej deacetylacji przez acetyloesterazy pektynowe [34]. Chociaż architektura ściany komórkowej zapewnia jej elastyczność w trakcie wzrostu i rozwoju komórki (a także rośliny), to w cyklu życiowym rośliny są etapy, kiedy konieczne jest bardzo duże przebudowanie ściany komórkowej tak, aby zmniejszyć lub nawet całkowicie usunąć ograniczenia, jakie nakłada ściana komórkowa. Na przykład, przed zrzuceniem poszczególnych organów (np. liści, owoców) musi mieć miejsce wystarczającą 422www.postepybiochemii.pl rearanżacja ściany komórkowej, aby możliwe było całkowite oddzielenie komórek, co wiąże się z degradacją pektyn blaszki środkowej. Podobnie podczas dojrzewania owoców, ich miąższ ulega szeregowi biochemicznych i komórkowych przemian, tak by uległ on zmiękczeniu. Polimer pektynowy jest degradowany w ścianie komórkowej enzymatycznie przez działanie szeregu enzymów, które są klasyfikowane w zależności od miejsca cięcia (Ryc. 4). Nie wszystkie enzymy zostały do tej pory zidentyfikowane i opisane. Spośród znanych enzymów najważniejsze, które uczestniczą w degradacji HG to: egzo- i endopoligalakturonazy (PG), liazy pektynowe, częściowo również PME oraz acetyloesterazy pektynowe, które przez deestryfikację bądź deacetylację rozluźniają upakowanie HG, co powoduje, że łatwiej ulega enzymatycznej degradacji [49]. Poligalakturonazy hydrolizują wiązania glikozydowe HG, w skutek czego uwalniane są monomery, dimery bądź oligomery kwasu galakturonowego. Zarówno endo- jak i egzopoligalakturonazy mają wysokie powinowactwo do niezestryfikowanych reszt kwasu galakturonowego [8]. Badania opisujące rośliny ze zwiększoną aktywnością zarówno endo- jak i egzo-PG wskazują na ogólną zmianę struktury polisacharydowej ściany komórkowej, ze szczególnym uwzględnieniem blaszki środkowej i PSC bogatej w HG i RG-I [30,42]. Co więcej, istnieją również doniesienia, że HG jest kowalencyjnie związany z ksyloglukanami [6,50]. Potwierdzeniem tego, może być przykład tytoniu, gdzie zahamowanie aktywności PG przez syntezę inhibitora PG z winogron, skutkowało reorganizacją całej sieci celulozowo-ksyloglukanowej [51]. Liazy pektynowe działają przez transeliminację, katalizując selektywną degradację pektyn na mniejsze fragmenty. Ich aktywność zależy od stopnia metyloestryfikacji HG. Liaza pektynowa I jest specyficzna dla niskometylowanego HG i wymaga obecności jonów wapnia [52]. Z kolei transeliminaza kwasu poligalakturonowego hydrolizuje wiązanie α-D-(1→4) w galakturonianie, powodując uwolnienie oligogalakturonianu. Drugi najczęściej występujący rodzaj pektyn, RG-I, jest rozkładany m. in. przez: hydrolazę ramnogalakturonianu, liazę ramnogalakturonianu, ramnohydrolazę ramnogalakturonianu, galakturonohydrolazę ramnogalakturonianu i acetyloesterazę ramnogalakturonianu. Ponadto w procesie degradacji pektyn uczestniczą również α-arabinofuranozydaza, endoarabinaza, β-galaktozydaza, endogalaktanaza i feruloilo- i p-kumaroiloesterazy [52]. Rycina 5. Przykładowa struktura lignin. Postępy Biochemii 61 (4) 2015 LIGNINY BUDOWA I FUNKCJE LIGNIN Ostatnim polimerem, wchodzącym w skład ściany komórkowej są ligniny, które jako jedyne nie są polimerem cukrowym, a zbudowane są z pochodnych związków fenolowych. Największa akumulacja lignin występuje w WSC komórek ksylemu. Jeśli chodzi o oddziaływania z innymi polimerami w ścianie komórkowej, potwierdzono kowalencyjne oddziaływania lignin z hemicelulozami [53]. Jest to hydrofobowy, aromatyczny polimer bez zdefiniowanej struktury pierwszorzędowej zbudowany z podjednostek syntetyzowanych w ramach szlaku fenylopropanoidowego. Są to: p-hydroksyfenyl (podjednostka H), guajacyl (podjednostka G) i syringal (podjednostka S), które są pochodnymi alkoholi fenolowych, odpowiednio alkoholu: p-kumarowego, koniferylowego i sinapylowego (Ryc. 5). Monolignole łączą się poprzez różne rodzaje wiązań skondensowanych, takich jak wiązania eterowe, wiązania węgiel-węgiel, wiązania difenylowe czy fenylowo-eterowe, a także przez liczne wiązania nieskondensowane (βO-4 i α-O-4) [54]. Dodatkowo, w strukturę lignin mogą być wbudowane bezpośrednio kwasy hydroksycynamonowe, bądź inne związki, które znajdą się w centrum reakcyjnym i mają zdolność tworzenia wolnych rodników (Ryc. 5) [55]. Wszystko to powoduje, że polimer ligninowy ma tak złożoną i zróżnicowanej budowę. Ogólna zasada przyjmuje, że ligniny roślin nagonasiennych są zbudowane głównie z podjednostek G z dodatkiem monolignoli H, natomiast u okrytonasiennych ligniny składają się z podjednostek G i S [55]. Niedawne badania wykazały, że ligniny we włóknie lnianym mają nietypową kompozycję [54]. Choć len jest rośliną okrytonasienną i ligniny ksylemowe są typowe dla tej klasy roślin, to ligniny we włóknie swą budową silnie przypominają ligniny nagonasiennych. Mają nawet do 25% podjednostek H oraz bardzo niski stosunek monomerów S/G (0,2 do 0,4). Dla porównania, stosunek S/G w ligninach floemowych lucerny, konopi, juty i ketmii trzcinowatej wynosi odpowiednio 0,4; 0,9; 2,1 i 3,9. Ponadto, włókna lniane mają jeden z najniższych stopni lignifikacji (tylko włókna szczmielu białego mają mniejszy) oraz najwyższy stopień kondensacji spośród włókien naturalnych. Taka struktura czyni ligniny praktycznie niedegradowanymi chemicznie czy enzymatycznie [54,56]. Ligniny, będąc drugim najczęściej występującym biopolimerem w biosferze, są rezerwuarem ok. 30% niekopalnego organicznego węgla. Ich najważniejszą funkcją jest zapewnienie ścianom komórkowym mechanicznej wytrzymałości, co pozwala na wzrost i utrzymanie pionowej orientacji łodygi, a także przewodzenie wody i substancji odżywczych. Kolejną rolą lignin jest ich udział w odpowiedzi roślin na biotyczne i abiotyczne czynniki stresowe. Ligniny hamują ataki wszelkiego rodzaju patogenów czy insektów, stanowiąc dla nich mechaniczną barierę odporną na degradację [57]. Co więcej, w odpowiedzi na czynniki stresowe następuje wzmożona synteza lignin, aby wzmocnić tę barierę. Przykładowo, na ilość lignin i celulozy, odłożonych we 423 wtórnej ścianie komórkowej, może mieć wpływ wiele abiotycznych czynników takich jak naprężenia mechaniczne, wynikające z wiatru i wyginania się łodygi w czasie wzrostu rośliny. Jeśli chodzi o możliwości zastosowania włókien (lub słomy lnianej), ligniny są główną przeszkodą przy wykorzystaniu biomasy roślinnej jako źródła do produkcji bioetanolu, biogazu, papieru czy karmy dla zwierząt (utrudniają dostęp enzymów scukrzających/degradujących do celulozy). Delignifikacja, niezbędna w procesach technologicznych, jest procesem czaso- i energochłonnym, kosztownym oraz generuje duże ilości zanieczyszczeń środowiska [58,59]. Ligniny obniżają też wartość tkaniny lnianej, gdyż odpowiadają za słabą elastyczność (gniecenie się). METABOLIZM LIGNIN Lignifikacja to proces dynamiczny, który wzmacnia ścianę komórkową roślin w zależności od potrzeb (przewodzenie wody, wzmocnienie mechaniczne czy odpowiedź na stresy środowiskowe). Monolignole są syntetyzowane w cytoplazmie, w obszarze przylegającym do ER, następnie są transportowane na zewnątrz komórki, gdzie zachodzi polimeryzacja w wyniku reakcji wolnorodnikowej i wbudowanie w strukturę ściany komórkowej. Dotychczas opisane enzymy, które biorą udział w syntezie monolignoli dzielą się na dwie grupy: te rozpuszczalne w cytoplazmie i te, będące składowymi rodziny cytochromów P450, które są zakotwiczone w błonie retikulum endoplazmatycznego. Do pierwszej grupy należą: liaza amoniako-fenyloalaninowa (PAL); ligaza 4-hydroksycynamoilo:CoA (4CL); hydroksycynamoilotransferaza p-hydroksycynamoiloCoA: kwas szikimowy/chinonowy (HCT); O-metylotransferaza kawoiloCoA (CCoAOMT); 3/5-O-metylotransferaza kwasu kawowego/kwasu 5-hydroksyfenolowego (COMT); reduktaza hydroksycynamoiloCoA (CCR), dehydrogenaza alkoholu hydroksycynamonowego (CAD) i dehydrogenaza alkoholu sinapylowego (SAD). Do drugiej grupy należą: 4-hydroksylaza kwasu cynamonowego (C4H); 3-hydroksylaza kwasu p-kumarowego (C3H) i 5-hydroksylaza aldehydu koniferylowego/kwasu ferulowego (F5H). Pierwszy etap, otrzymanie monomerów lignin, zachodzi jako odgałęzienie szlaku fenyloproponoidowego, które, mimo że jest dobrze opisane w literaturze, to wciąż niektóre jego etapy (nieliniowe przejścia i transformacje związków pośrednich) pozostają niewiadomą, a przeprowadzone na roślinach transgenicznych eksperymenty wskazują na wielogenowe rodziny kodujące białka syntezy lignin. Opisanym przykładem wielogenowości jest dehydrogenaza alkoholu sinapylowego, która należy do tej samej rodziny dehydrogenaz alkoholowych co CAD. SAD charakteryzuje się dużym powinowactwem do aldehydu sinapylowego. Jednak wykazano, że nie jest ona niezbędna do syntezy podjednostki S lignin [60,61]. Struktura i funkcja CAD, enzymu o podobnej aktywności jak SAD, jako końcowego enzymu na szlaku syntezy monomerów lignin, jest dobrze poznana [62,63]. Jednak dopiero ostatnio pojawiły się pierwsze prace, opisujące całą rodzinę białek CAD oraz ich identyfikację w modelowych roślinach [64,65]. Uogólniając, rodzinę białek CAD można umownie podzielić na 3 grupy pod względem ewolucyjno-funcjonalno-strukturalnym [61,63]. Ważną obserwacją, która potwierdza, że enzymy ze szlaku syntezy lignin należą do wielogenowych rodzin jest fakt dużej rozbieżności skutków wyciszenia poszczególnych genów na fenotyp roślin transgenicznych i ich odporność na czynniki stresowe. Redukcja poziomu lignin przez wyciszanie genów ze szlaku biosyntezy monolignoli powoduje zahamowanie wzrostu rzodkiewnika pospolitego, sosny kalifornijskiej i innych gatunków roślin [66-68]. Z drugiej strony, inne dane pokazują, że redukcja ekspresji genów szlaku biosyntezy lignin w Brassica napus skutkowało zmniejszeniem poziomu lignin, jednak wzrost roślin był porównywalny z nietransgeniczną kontrolą [69]. Również obniżanie ilości lignin przez wyciszanie genów zaangażowanych w biosyntezę lignin w lnie, kukurydzy i prosie rózgowym nie spowodowało zmian we wzroście roślin [64,70,71]. Natomiast najnowsze badania pokazują, że rośliny transgeniczne uprawiane w próbie polowej poddane czynnikom środowiskowym mogą wykształcić mechanizmy niwelujące wprowadzone zmiany, by zapewnić roślinie przetrwanie. Niedawno wykazano, że rośliny Nicotiana attenuata z wyciszonym genem CAD uprawiane w szklarni cechowały się karłowatością, jednak wyprowadzone w pole wykształciły normalny fenotyp, nieróżniący się od roślin kontrolnych [68]. Stwierdzono, że obniżenie ekspresji genu CAD nadal było u tych roślin obserwowane, jednak inne związki fenolowe zostały wbudowane w strukturę lignin, aby zapewnić prawidłową orientację łodygi. W przypadku lnu z wyciszonym genem CAD, rośliny z najsilniejszą represją wykazywały zahamowanie wzrostu w kulturach in vitro, co skutkowało nawet śmiercią rośliny. Natomiast umiarkowana redukcja ekspresji genu CAD skutkowała fenotypem zbliżonym do roślin kontrolnych w kulturach in vitro i w uprawie polowej [72,73]. Zebrane wyniki sugerują, że silna redukcja lignin powoduje zaburzenia fenotypowe, takie jak wiotkość czy karłowatość. Natomiast niewielka redukcja lignin wpływa na zmianę składu i struktury ściany komórkowej nie wpływając negatywnie na fenotyp modyfikowanych roślin. Ponadto stresy biotyczne i abiotyczne są w stanie aktywować mechanizmy kompensacyjne wyrównujące poziom lignin in vivo mimo wprowadzonej modyfikacji. Istnieje wiele hipotez dotyczących sposobu transportu monomerów lignin na zewnątrz błony komórkowej, jednak żadna z nich nie została jak dotąd ostatecznie potwierdzona lub obalona. Jedna z nich zakłada, że monolignole są transportowane przez błonę w ich glukozylowanej formie, a następnie glukozydazy obecne w ścianie komórkowej usuwają cząsteczkę cukru [74]. Inny model zakłada, że monomery lignin są transportowane w pęcherzykach aparatu Golgiego, a kolejny proponuje specyficzne transportery błonowe, jako mechanizmy przenoszące monolignole na zewnątrz komórki. Alternatywnie, alkohole koniferylowy i sinapylowy mogą przenikać przez błonę komórkową na zasadzie dyfuzji [74]. Być może wszystkie te hipotezy są prawdziwe. Ten etap syntezy lignin wymaga dalszych dokładnych badań, gdyż wydajność i rodzaj transportu może decydować o tym jaki jest skład lignin. 424www.postepybiochemii.pl Niemniej, gdy monolignole znajdą się już na zewnątrz błony komórkowej następuje polimeryzacja monomerów lignin w reakcji wolnorodnikowej. Ten etap również nie jest ostatecznie potwierdzony doświadczalnie i funkcjonuje w formie hipotezy, która obecnie najlepiej wyjaśnia obserwowany złożony skład i strukturę lignin. Kompozycja lignin zależy od tego, jakie wolnorodnikowe substraty są dostępne w obszarze reakcji oraz jaką specyficzność mają obecne tam enzymy katalizujące ostatni etap syntezy lignin. Należą do nich peroksydazy i lakazy. Wszystkie fenolowe związki, które znajdą się w centrum reakcyjnym mogą ulec reakcji rodnikowej i zostać wbudowane w ligniny. Ten model syntezy odpowiada zróżnicowanej budowie lignin, jak i obecności różnego rodzaju wiązań. Co więcej, wskazuje to raczej na przypadkową polimeryzację związków, która prawdopodobnie zależy od mikrośrodowiska reakcji (pH, obecności cukrów itp.) [55]. Jak dotąd nie opisano żadnych enzymów roślinnych, które miałyby zdolność degradacji lignin. Taką aktywność mają jedynie enzymy pochodzące z mikroorganizmów i są to enzymy z tych samych klas, które uczestniczą w polimeryzacji lignin: peroksydazy, oksydoreduktazy, lakazy, a także eterazy [75]. Biosynteza lignin jest obecnie wnikliwie badana z tej przyczyny, że choć obecność lignin jest niezbędna dla prawidłowego rozwoju i funkcjonowania roślin, to dla zastosowania biomasy roślinnej czy surowców pochodzenia naturalnego, ligniny są poważnym utrudnieniem [76]. Dlatego efekty obniżenia ekspresji poszczególnych genów biosyntezy ligniny są dokładnie analizowane i weryfikowane [74,77]. Badania nad znaczeniem poszczególnych enzymów syntezy lignin dla metabolizmu roślin pozwoliły zaobserwować, że zmiany w szlaku biosyntezy lignin mogą powodować wzrost zawartości celulozy. Akumulacja celulozy, zwłaszcza przy redukcji lignin, jest korzystna przy zastosowaniu biomasy roślinnej jako paszy dla zwierząt czy surowca do produkcji biopaliw. W kukurydzy z represją genu CAD aktywność białka CAD była różna w zależności od tkanki, co skutkowało różnymi efektami modyfikacji w poszczególnych organach [71]. Przykładowo, w łodygach transgenicznej kukurydzy całkowita zawartość lignin pozostała na niezmienionym poziomie, natomiast zaobserwowano akumulację celulozy i arabinoksylanów. Z kolei, w ścianach komórkowych międzywęźli ilość lignin wyraźnie spadła, czemu towarzyszyła redukcja polimerów cukrowych. Również dla innych mutantów kukurydzy z obniżonym poziomem lignin obserwowano akumulację cukrów pektynowych [78]. Podobnie transgeniczna osika z wyciszonym genem 4CL charakteryzowała się wyraźnym spadkiem poziomu lignin (do 45%), czemu towarzyszył około 15% wzrost poziomu celulozy [79]. Inne rośliny hybrydowe osiki, które cechował niski poziom lignin miały jednocześnie zwiększoną zawartość celulozy [80]. Również w topoli, redukcja lignin przez wyciszenie genu C4H skutkowała akumulacją celulozy [81]. W lnie, redukcja ekspresji CAD spowodowała obniżenie zawartości lignin we włóknie lnianym przy jednoczesnej akumulacji celulozy [73]. Ponadto wykazano, że biosynteza celulozy i lignin silnie zależy od zawartości azotu, węgla i fosforu w roślinie. Zebrane wyniki sugerują, że pula makroelementów niezużyta przy mniejszej biosyntezie lignin jest przekierowywana do syntezy celulozy [80]. Można przyPostępy Biochemii 61 (4) 2015 puszczać, że redukcja lignin powoduje rozluźnienie ściany komórkowej, a zmiany te wiążą się z akumulacją polimerów cukrowych w ścianie komórkowej prawdopodobnie by wspierać jej integralność. Wzbogacenie ściany komórkowej w celulozę, która jest głównym nośnikiem siły mechanicznej, wzmacnia strukturę ściany osłabioną ubytkiem lignin. Rozbudowanie celulozowo-hemicelulozowego rusztowania w ścianie komórkowej jest sposobem na utrzymanie pionowej orientacji łodyg, prawidłowej wytrzymałości, a przez to prawidłowego wzrostu i rozwoju roślin. Chociaż molekularne wytłumaczenie tych zmian jest nadal niejasne, to opisano wiele przykładów obrazujących taki mechanizm kompensacyjny obecny w roślinach [82-84]. Badania nad skutkami redukcji poziomu lignin w roślinach mają charakter nie tylko poznawczy, ale i aplikacyjny. Ligniny, jako istotny element wytrzymałościowy ściany komórkowej nadają jej sztywność i określone parametry mechaniczne. Doniesienia literaturowe na temat wpływu obniżenia lignin na właściwości mechaniczne są rozbieżne. W transgenicznej topoli obniżenie poziomu lignin wpłynęło na poprawę elastyczności, podobnie jak w komórkach elementarnych jodły chińskiej spowodowało poprawę elastyczności i wytrzymałości na rozciąganie [81,85]. Podobnie w lnie z represją O-metylotransferazy kawoilo-CoA obniżenie ilości lignin wpłynęło pozytywnie na wytrzymałość na rozciąganie i zredukowało sztywność powodując wiotkość ściany komórkowej i całej rośliny [70]. W tym wypadku nie badano jednak włókien lnianych, a parametry całej łodygi. Jak dotąd w literaturze brak danych o skutkach redukcji lignin czy innych polimerów ściany komórkowej na skład i strukturę produktów użytkowych roślin, do jakich należy włókno lniane. Jednak pierwsze doniesienia wskazują, że obniżenie lignin w lnie ma również wpływ na kompozycję ściany komórkowej włókna, a tym samym na potencjał aplikacyjny surowca przemysłowego, jakim jest włókno i pochodząca z niego przędza lniana. Włókna z lnu o obniżonej zawartości lignin przez wyciszenie genu CAD charakteryzowały się redukcją zawartości lignin oraz stosunku lignin do celulozy, akumulacją celulozy i hemiceluloz oraz większym upakowaniem łańcuchów HG. Zmiany te miały przełożenie na większą wytrzymałość na rozciąganie oraz większą sztywnością wyrażoną jako moduł Young’a, którego wzrost w stosunku do kontroli świadczy o mniejszej sprężystości danego materiału. Prawdopodobnie, ten wynik należy wiązać z akumulacją celulozy i hemiceluloz, co podniosło bazową sztywność materiału i zniwelowało spadek zawartości lignin [73]. MECHANIZMY SYGNALNE I ODCZYTUJĄCE ZMIANY W ŚCIANIE KOMÓRKOWEJ Ściana komórkowa jest strukturą o dużej złożoności, zarówno składu jak i wzajemnych oddziaływań poszczególnych elementów między sobą. Z uwagi na zróżnicowane funkcje oraz istotność ściany komórkowej dla wzrostu i rozwoju roślin, w czasie życia rośliny niezbędne są zmiany w strukturze i składzie ściany komórkowej w zależności od potrzeb, np. ulega ona kontrolowanemu rozluźnieniu w trakcie wzrostu komórki, a w przypadku infekcji patogennej jest wzmacniana. Również zranienie jest zewnętrznym bodźcem wpływającym na ścianę komórkową. 425 Rycina 6. Schemat funkcji białek potencjalnie zaangażowanych w odczytywanie zmian w ścianie komórkowej. Ca2+-ch – kanały jonowe przewodzące Ca2+; COBRA – białka zakotwiczone w błonie związane z GPI; FEI – kinazy podobne do receptora LPR seryny/treoniny białka FEI; GRP3 – białko bogate w glicynę; MAPK – kinazy aktywowane mitogenami; NOX – oksydaza NADPH; PERK kinazy receptora bogatego w prolinę, podobne do ekstensyny; RFT – reaktywne formy tlenu; SOS5 – białko stresu solnego 5; THE – kinazy podobne do receptora białka THESEUS 1; WAK – kinazy związana ze ścianą komórkową. Białko COBRA jest niezbędne do prawidłowej orientacji mikrofibryl celulozy w cytoszkielecie, podczas gdy FEI odpowiadają za indeks krystaliczności, a THE indukują zmiany w ścianie komórkowej na skutek obniżenia zawartości celulozy. Zmiany w strukturze homogalakturonianu, przez jego oddziaływanie z WAK, prowadzą do zmian pH w komórce i w konsekwencji turgoru. Podobnie białka PERK zmieniają pH komórki i prowadzą do syntezy reaktywnych form tlenu, co wpływa na procesy regulujące wzrost komórki [86]. Jednym z kluczowych zagadnień w badaniach ściany komórkowej roślin jest ustalenie relacji między strukturalną złożonością polimerów ściany komórkowej, a ich biologiczną funkcją. Dlatego niezwykle istotne jest, aby dowiedzieć się czy bodźce wywołujące zmiany strukturalne ściany komórkowej są odbierane przez specyficzne receptory. Obecnie intensywnie poszukuje się związków, które działałyby jako sensory zmian w ścianie komórkowej i cząsteczki sygnalne przekazujące sygnał do cytoplazmy. Najlepszymi kandydatami do tej roli są białka błonowe należące do grupy kinaz o charakterze receptorów (ang. receptor-like kinase). Posiadają one zewnątrzkomórkową domenę wiążącą ligand, pojedynczą domenę transbłonową i cytosolową domenę kinazy. Możliwości transgenezy pozwoliły otrzymać dużą gamę mutantów o zahamowanym wzroście, zmienionym kształcie komórek czy zmodyfikowanej wytrzymałości na rozciąganie, co jest doskonałym materiałem do badań nad cząsteczkami sygnalnymi. Jak dotąd, wskazano na kilka rodzin białek jako potencjalnych sensorów i regulatorów składu i struktury ściany komórkowej: kinazy związane ze ścianą komórkową (WAK, ang. wall-associated kinase); kinazy podobne do receptora białka THESEUS 1 (THE, ang. receptor-like protein kinase THESEUS 1); kinazy podobne do receptora LPR seryny/treoniny białka FEI (FEI, ang. LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI); białka COBRA zakotwiczone w błonie związane z GPI (COBRA, ang. GPI-anchor protein); kinazy receptora bogatego w prolinę, podobne do ekstensyny (PERK, ang. pro-rich extensin-like receptor kinase) (Ryc. 6). Białka WAK są zaangażowane we wzrost komórki oraz są indukowane infekcją patogenną lub odpowiedzią na stres. W ścianie komórkowej roślin wiążą się kowalencyjnie do HG i niekowalencyjnie do kompleksu Ca2+-oligogalakturonian, mogą też przyłączać białko bogate w glicynę (ang. glycine-rich protein). Dane te wskazują, że WAK może być sensorem struktury pektyn in vivo. Ponadto, związanie WAK z pektynami prawdopodobnie powoduje indukcję kaskady sygnalnej (przez kinazy aktywowane mitogenami, ang. mitogen-activated protein kinases), która stymuluje inwertazę w wakuoli i powoduje zmiany turgoru komórki [86,87]. Rola kinaz THE jest wiązana z monitorowaniem integralności ściany komórkowej. Są one sensorami redukcji celulozy i indukują związane z tym zmiany w ścianie komórkowej np. wykazano, że wzmożona synteza THE prowadzi do ektopowej akumulacji lignin [86]. Inną rodziną kinaz o charakterze receptorów są białka PERK, nierozpuszczalne w przestrzeni zewnątrzkomórkowej, które kowalencyjnie i jonowo oddziałują z pektynami. Związanie pektyn powoduje aktywację kanałów Ca2+, co prowadzi do wzrostu jonów Ca2+ w komórce i zmian pH, a w konsekwencji produkcji reaktywnych form tlenu zależnych od oksydazy NADPH. Najprawdopodobniej, białka PERK, wiążąc się z pektynami są sensorami mechanicznego stresu w ścianie komórkowej i przez zmianę pH sterują procesami regulującymi wzrost komórki [86]. Białka FEI należą do klasy kinaz o charakterze receptorów, posiadającej zewnątrzkomórkową domenę lektynową o prawdopodobnej funkcji wiązania wielocukrów. Udowodniono, że FEI są związane z biosyntezą i strukturą celulozy. Wykazano, że wyciszenie genów FEI w rzodkiewniku pospolitym skutkowało redukcją indeksu krystaliczności celulozy. Sugeruje się, że FEI są częścią tego samego szlaku sygnalnego, co białko stresu solnego 5, czyli szlaku odpowiedzi na wzrost zasolenia w celu utrzymania homeostazy jonowej [86]. Z kolei COBRA jest rodziną białek odpowiedzialnych za prawidłową orientację celulozy w ścianie komórkowej (w stosunku do osi komórki). Wykazano, że białko COBRA jest niezbędne do prawidłowego działania kompleksu syntazy celulozy i właściwego pozycjonowania mikrotubul celulozowych w szkielecie ściany komórkowej, a redukcja aktywności tego białka skutkuje nieprawidłową depozycją mikrofibryl celulozy w ścianie komórkowej i/lub zmniejszoną ilością celulozy [86]. Inną grupą regulatorów są czynniki sterujące syntezą ściany komórkowej, w szczególności WSC komórek sklerenchymy (do której należą również komórki włókna lnianego). Należą tu rodziny czynników transkrypcyjnych: MYB, NST oraz SND. Przede wszystkim biorą one udział w lignifikacji i przyroście na grubość WSC, w związku z czym są najważniejszymi kandydatami do regulatorów wzrostu i rozwoju komórek włókna w lnie. Jak dotąd, pojawiło się już kilka prac o mechanizmach regulujących syntezą WSC w rzodkiewniku pospolitym, to jednak wciąż niewiele wiadomo o oddziaływaniach DNA-białko czy białko-białko, a także o dynamice i funkcyjności całej sieci wzajemnych oddziaływań, które sterują procesem biosyntezy WSC [88]. SND1, NST1 i NST2 są uważne za główne czynniki regulatorowe powstawania WSC z uwagi na ich wydajność dla zewnętrznego odkłada- 426www.postepybiochemii.pl nia się WSC w niektórych typach nieskleroidalnych komórek [83]. SND1 to białko zawierające domenę NAC, które bywa utożsamiane z NST3 [83]. W rzodkiewniku pospolitym jest znanych 11 czynników transkrypcyjnych (m. in. SND2, SND3 i cały szereg białek MYB), które są aktywowane przez SND1. Z kolei SND2, SND3, MYB103, MYB85, MYB52 i MYB54 indukują geny zaangażowane w syntezę WSC (celulozy, ksylanów i jako ostatnich lignin). NST, to podobnie jak SND, czynniki wzrostu WSC zawierające domenę NAC. Dwa bliskie homologi SND1, NST1 i NST2 działają na te same czynniki transkrypcyjne co SND1 [88]. Z kolei białka MYB, zawierające domenę wiążącą bogatą w motyw AC, są głównymi aktywatorami syntezy lignin. Większość promotorów genów syntezy lignin zawiera właśnie takie powtarzające się motywy AC. Wyjątkiem jest tu hydroksylaza kwasu ferulowego, która jest odpowiedzialna za otrzymanie monolignoli S. Promotor tego genu nie zawiera powtarzającego się motywu AC, jest natomiast indukowany bezpośrednio przez czynnik transkrypcyjny NST3 lub SND1 [84]. Różnicowanie się komórek ksylemu i floemu, a także ich końcowa funkcja są określane przez stężenie: hormonów, czynników wzrostu, miRNAs, peptydów czy proteoglukanów w merystemie wiązek przewodzących. Przykładowo, stężenie auksyn niższe od tego, które występuje w merystemach naczyń pobudza różnicowanie ksylemu w obecności cytokinin, podczas gdy różnicowanie się floemu znajduje się pod kontrolą czynników transkrypcyjnych z rodziny białek MYB, które są sterowane SND1, NST1 i NST3. Indukcja SND1 w niezróżnicowanej zawiesinie transgenicznych komórek rzodkiewnika pospolitego jest wystarczająca dla różnicowania się komórek przypominających włókno, co sugeruje, że białka SND1/NST1 są wystarczające dla różnicowania się włókien. Ich preferencyjne wzory ekspresji w kwiatostanie i łodydze hipokotylu rzodkiewnika pospolitego są silnie charakterystyczne dla włókien i wiązek przewodzących. Co więcej, te wzory ekspresji są zgodne z fenotypem komórek w mutantach z wyłączoną funkcją genu [83]. PODSUMOWANIE Ściana komórkowa jest strukturą dynamiczną i interaktywną, gdzie zmiany w ilości jednego składnika pociągają za sobą zmiany w ilości pozostałych składników, co przekłada się na sieć zależności genetycznych dotyczących ściany komórkowej. Zmiany w jej strukturze (indukowane, związane z czynnikami środowiskowymi czy rozwojowymi), a przez to właściwościach mechanicznych są odbierane przez obecne w błonie komórkowej białka – sensory, które najprawdopodobniej należą do rodziny kinaz o charakterze receptorów (przede wszystkim białka WAK, THE, FEI, COBRA i PERK). Następnie sygnał jest przekazywany do genów, powodując mechanizm kompensacyjny na poziomie transkrypcyjnym i potranslacyjnym, aby utrzymać prawidłowe parametry funkcjonale ściany komórkowej. Badania nad redukcją lignin wykazały istnienie mechanizmu kompensacyjnego pomiędzy ligninami a celulozą i hemicelulozami. Choć molekularne wytłumaczenie tego procesu jeszcze nie jest w pełni wyjaśnione, to prawdopodobnie kompensacja ta odbywa się poprzez sieć zależności czynników transkrypcyjnych SND, NST i MYB, które sterują biosyntezą Postępy Biochemii 61 (4) 2015 lignin, celulozy i ksylanów. Prowadzi to do rearanżacji ściany komórkowej oraz zmian w ilości i proporcjach poszczególnych składników. Przykładowo obniżenie ilości lignin może być kompensowane przez zwiększenie się zawartości celulozy, jako głównego składnika odpowiedzialnego za wytrzymałość ściany komórkowej. Ponadto, dowiedziono, że modyfikacja ilością jednego składnika ściany komórkowej powoduje zmiany w składzie i właściwościach surowca lnu — włókna oraz wyraźnie wpływa na jego parametry użytkowe, a białka zaangażowane w syntezę lignin są reprezentowane przez wielogenowe rodziny. Przykładem może być już dobrze opisana i zidentyfikowana rodzina dehydrogenaz alkoholowych, które redukują aldehydy fenolowe do ich alkoholowych pochodnych. PIŚMIENNICTWO 1. Czemplik M, Boba A, Kostyn K, Kulma A, Mituła A, M S, Wróbel-Kwiatkowska M, Żuk M, Szopa J, Skórkowska-Telichowska K (2011) Flax engineering for biomedical application, W: Komorowska MA and Olsztynska-Janus S (red) Biomed Eng, Trends, Res Technol INTECH, str. 407-434 2. Preisner M, Wojtasik W, Kulma A, Zuk M, Szopa J (2014) Flax fiber, W: (red) Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology. John Wiley and Sons, Inc 3. Charlet K, Jernot J-P, Breard J, Gomin M (2010) Scattering of morphological and mechanical properties of flax fibres. Industrial Crops and Products 32: 220-224 4. Lev-Yadun S (2001) Intrusive growth – the plant analog of dendrite and axon growth in animals. New Phytologist 150: 508–512 5. Keegstra K (2010) Plant Cell Wall. Plant Physiol 154: 483-486 6. Caffall KH, Mohnen D (2009) The structure, function, and biosynthesis of plant cell wall pectic polysaccharides. Carbohydrate Res 344: 18791900 7. Plomion C, Leprovost G, Stokes A (2001) Wood Formation in Trees. Plant Physiol 127: 1513-1523 8. Voragen AJ, Coenen G-J, Verhoef R, Schols H (2009) Pectin, a versatile polysaccharide present in plant cell walls. Struct Chem 20: 263-275 9. Hamann T (2012) Plant cell wall integrity maintenance as an essential component of biotic stress response mechanisms. Front Plant Sci 3 10.Burton RA, Gidley MJ, Fincher GB (2010) Heterogeneity in the chemistry, structure and function of plant cell walls. Nature Chem Biol 6: 724-732 11.Gierlinger N, Schwanninger M (2006) Chemical imaging of poplar wood cell walls by confocal Raman microscopy. Plant Physiol 140: 1246-1254 12.Astley OM, Donald AM (2003) The tensile deformation of flax fibres as studied by X-ray scattering. J Materials Sci 38: 165-171 13.Weng J-K, Li X, Bonawitz ND, Chappl C (2008) Emerging strategies of lignin engineering and degradation for cellulosic biofuel production. Cur Opin Biotechnol 19: 166-172 14.Fincher G (2009) Revolutionary times in our understanding of cell wall biosynthesis and remodeling in the grasses. Plant Physiol 149: 27-37 15.Taylor NG (2008) Cellulose biosynthesis and deposition in higher plants. New Phytologist 178: 239-252 16.Park S, Baker JO, Himmel ME, Parilla PA, Johnson DK (2010) Cellulose crystallinity index: measurement techniques and their impact on interpreting cellulase performance. Biotechnol Biofuels 3 17.Hall M, Bansal P, Lee JH, Realff MJ, Bommarius AS (2010) Cellulose crystallinity – a key predictor of the enzymatic hydrolysis rate. FEBS J 277: 1571-1582 18.Bos HL, Oever MJAVD, Peters OCJJ (2002) Tensile and compressive properties of flax fibres for natural fibre reinforced composites. J Materials Sci 37: 1683-1692 427 19.Bledzki AK, Mamun AA, Lucka-Gabor M, Gutowski VS (2008) The effects of acetylation on properties of flax fibre and its polypropylene composites. eXPRESS Polymer Lett 2: 413-422 20.Endler A, Persson S (2011) Cellulose Synthases and Synthesis in Arabidopsis. Mol Plant 4: 199-211 21.Buchanan M, Burton R, Dhugga K, Rafalski A, Tingey S, Shirley N, Fincher G (2012) Endo-(1,4)-β-Glucanase gene families in the grasses: temporal and spatial Co-transcription of orthologous genes1. BMC Plant Biol 12: 1-19 22.Li S, Bashline L, Lei L, Gu Y (2014) Cellulose synthesis and its regulation. Arabidopsis Book 13: 13 23.Hoch G (2007) Cell wall hemicelluloses as mobile carbon stores in non-reproductive plant tissues. Funct Ecol 21: 823-834 24.Scheller HV, Ulvskov P (2010) Hemicelluloses. Annu Rev Plant Biol 61: 263-289 25.Grabber JH (2005) How Do Lignin Composition, Structure, and Cross-Linking Affect Degradability? A Review of Cell Wall Model Studies This paper was originally presented at the Lignin and Forage Digestibility Symposium, 2003 CSSA Annual Meeting, Denver, CO Crop Sci 45: 820-831 26.Ordaz-Ortiz JJ, Marcus SE, Knox JP (2009) Cell wall microstructure analysis implicates hemicellulose polysaccharides in cell adhesion in tomato fruit pericarp parenchyma. Mol Plant 2: 910-921 27.Faik A, Price NJ, Raikhel NV, Keegstra K (2002) An Arabidopsis gene encoding an alpha-xylosyltransferase involved in xyloglucan biosynthesis. Proc Natl Acad Sci USA 99: 7797-7802 28.Liepman AH, Wilkerson CG, Keegstra K (2005) Expression of cellulose synthase-like (Csl) genes in insect cells reveals that CslA family members encode mannan synthases. Proc Natl Acad Sci USA 102: 2221-2226 29.Minic Z (2008) Physiological roles of plant glycoside hydrolases. Planta 227: 723-740 30.Xiao C, Anderson C (2013) Roles of pectin in biomass yield and processing for biofuels. Frontiers Plant Sci 4: 1-7 31.Baley C, Le Duigou A, Bourmaud A, Davies P (2012) Influence of drying on the mechanical behaviour of flax fibres and their unidirectional composites. Composites Part A: Appl Sci Manufacturing 43: 1226-1233 32.Alix S, Colasse L, Morvan C, Lebrun L, Marais S (2014) Pressure impact of autoclave treatment on water sorption and pectin composition of flax cellulosic-fibres. Carbohydrate Polymers 102: 21-29 33.Stolle-Smits T, Beekhuizen JG, Kok MTC, Pijnenburg M, Recourt K, Derksen J, Voragen AGJ (1999) Changes in cell wall polysaccharides of green bean pods during development. Plant Physiol 121: 363-372 34.Lionetti V, Cervone F, Bellincampi D (2012) Methyl esterification of pectin plays a role during plant-pathogen interactions and affects plant resistance to diseases. J Plant Physiol 169: 1623-1630 pression of a fungal polygalacturonase Alters Plant Growth. Plant Physiol 135: 1294-1304 42.Liu H, Ma Y, Chen N, Guo S, Liu H, Guo X, Chong K,Xu Y (2014) Overexpression of stress-inducible OsBURP16, the β subunit of polygalacturonase 1, decreases pectin content and cell adhesion and increases abiotic stress sensitivity in rice. Plant, Cell Environment 37: 1144-1158 43.Mohnen D (2008) Pectin structure and biosynthesis. Curr Opin Plant Biol 11: 266-277 44.Willats WG, Orfila C, Limberg G, Buchholt HC, van Alebeek GJ, Voragen AG, Marcus SE, Christensen TM, Mikkelsen JD, Murray BS, Knox JP (2001) Modulation of the degree and pattern of methyl-esterification of pectic homogalacturonan in plant cell walls. Implications for pectin methyl esterase action, matrix properties, and cell adhesion. J Biol Chem 276: 19404-19413 45.Raiola A, Lionetti V, Elmaghraby I, Immerzeel P, Mellerowicz EJ, Salvi G, Cervone F, Bellincampi D (2011) Pectin methylesterase is induced in Arabidopsis upon infection and is necessary for a successful colonization by necrotrophic pathogens. Mol Plant Microbe Interact 24: 432-440 46.Lionetti V, Giancaspro A, Fabri E, Giove SL, Reem N, Zabotina OA, Blanco A, Gadaleta A, Bellincampi D (2015) Cell wall traits as potential resources to improve resistance of durum wheat against Fusarium graminearum. BMC Plant Biol 15: 6 47.Marty P, Jouan B, Bertheau Y, Vian B, Goldberg R (1997) Charge density in stem cell walls of Solanum tuberosum genotypes and susceptibility to blackleg. Phytochemistry 44: 1435-1441 48.Lionetti V, Raiola A, Camardella L, Giovane A, Obel N, Pauly M, Favaron F, Cervone F,Bellincampi D (2007) Overexpression of pectin methylesterase inhibitors in Arabidopsis restricts fungal infection by Botrytis cinerea. Plant Physiol 143: 1871-1880 49.Zinnia H, González-Carranza ZA, Elliott KA, Roberts JA (2007) Expression of polygalacturonases and evidence to support their role during cell separation processes in Arabidopsis thaliana. J Exp Botany 58: 3719-3730 50.Ridley BL, O’Neill MA, Mohnen D (2001) Pectins: structure, biosynthesis, and oligogalacturonide-related signaling. Phytochemistry 57: 929-967 51.Nguema-Ona E, Moore JP, Fagerström AD, Fangel JU, Willats WG, Hugo A,Vivier MA (2013) Overexpression of the grapevine PGIP1 in tobacco results in compositional changes in the leaf arabinoxyloglucan network in the absence of fungal infection. BMC Plant Biol 13: 46 52.Yadav PK, Singh VK, Yadav S, Yadav KD, Yadav D (2009) In silico analysis of pectin lyase and pectinase sequences. Biochemistry 74: 1049-1055 53.Jin Z, Katsumata KS, Lam TBT, Iiyama K (2006) Covalent linkages between cellulose and lignin in cell walls of coniferous and nonconiferous woods. Biopolymers 83: 103-110 35.Harholt J, Suttangkakul A, Vibe Scheller H (2010) Biosynthesis of Pectin. Plant Physiol 153: 384-395 54.Day A, Ruel K, Neutelings G, Crônier D, David H, Hawkins S, Chabbert B (2005) Lignification in the flax stem: evidence for an unusual lignin in bast fibers. Planta 222: 234-245 36.Decreux A, Messiaen J (2005) Wall-associated kinase WAK1 interacts with cell wall pectins in a calcium-induced conformation. Plant Cell Physiol 46: 268-278 55.Vanholme R, Demedts B, Morreel K, Ralph J, Boerjan W (2010) Lignin biosynthesis and structure. Plant Physiol 153: 895-905 37.Musialak M, Wróbel-Kwiatkowska M, Kulma A, Starzycka E,Szopa J (2008) Improving retting of fibre through genetic modification of flax to express pectinases. Transgenic Res 17: 133-147 38.Bourmaud A, Morvan C,Baley C (2010) Importance of fiber preparation to optimize the surface and mechanical properties of unitary flax fiber. Industrial Crops Products 32: 662-667 39.Raj G, Balnois E, Baley C, Grohens Y (2011) Role of polysaccharides on mechanical and adhesion properties of flax fibres in Flax/PLA biocomposite. Internat J Polymer Sci 2011 40.Atkinson RG, Schröder R, Hallett IC, Cohen D, MacRae EA (2002) Overexpression of Polygalacturonase in transgenic apple trees leads to a range of novel phenotypes involving changes in cell adhesion. Plant Physiol 129: 122-133 41.Capodicasa C, Vairo D, Zabotina O, McCartney L, Caprari C, Mattei B, Manfredini C, Aracri B, Benen J, Knox JP, Lorenzo GD,Cervone F (2004) Targeted modification of homogalacturonan by transgenic ex- 56.Gorshkova T, Morvan C (2006) Secondary cell-wall assembly in flax phloem fibres: role of galactans. Planta 223: 149-158. 57.Sattler SE, Funnell-Harris DL (2013) Modifying lignin to improve bioenergy feedstocks: strengthening the barrier against pathogens? Front Plant Sci 4: 70 58.Becker H (2008) Growing and hand processing Fiber Flax and Hemp for Hand Papermaking. International Conference on Flax and Other Bast Plants: 150-158 59.Sticklen MB (2008) Plant genetic engineering for biofuel production: towards affordable cellulosic ethanol. Nat Rev Genet 9: 433-443 60.Barakat A, Stephens J, Goldie A, Hunter WN, Marshall D, Hancoc RD, Lapierre C, Morreel K, Boerjan W, Halpin C (2011) Syringyl lignin is unaltered by severe sinapyl alcohol dehydrogenase suppression in Tobacco. Plant Cell 23: 4492-4506 61.Guo D-M, Ran J-H, Wang X-Q (2010) Evolution of the Cinnamyl/Sinapyl Alcohol Dehydrogenase (CAD/SAD) Gene Family: The Emer- 428www.postepybiochemii.pl gence of Real Lignin is Associated with the Origin of Bona Fide CAD. J Mol Evol 71: 202-218 74.Wang Y, Chantreau M, Sibout R, Hawkins S (2013) Plant cell wall lignification and monolignol metabolism. Front Plant Sci 4: 200 62.Goffner D, Joffroy I, Grima-Pettenati J, Halpin C, Knight M, Schuch W, Boudet AM (1992) Purification and characterization of isoforms of cinnamyl alcohol dehydrogenase from Eucalyptus xylem. Planta 188: 48-53 75.Chen Y-R, Sarkanen S, Wang Y-Y (2012) Lignin-degrading enzyme activities. Meth Mol Biol 908: 251-268 63.Barakat A, Bagniewska-Zadworna A, Choi A, Plakkat U, DiLoreto DS, Yellanki P, Carlson JE (2009) The cinnamyl alcohol dehydrogenase gene family in Populus: phylogeny, organization, and expression. BMC Plant Biol 9: 26 77.Vanholme R, Morreel K, Darrah C, Oyarce P, Grabber JH, Ralph J, Boerjan W (2012) Metabolic engineering of novel lignin in biomass crops. New Phytologist 196: 978-1000 64.Saathoff AJ, Sarath G, Chow EK, Dien BS, Tobias CM (2011) Downregulation of cinnamyl-alcohol dehydrogenase in switchgrass by RNA silencing results in enhanced glucose release after cellulase treatment. PLoS One 6: e16416 65.Ma Q-H (2010) Functional analysis of a cinnamyl alcohol dehydrogenase involved in lignin biosynthesis in wheat. J Exp Botany 61: 27352744 66.Li X, Bonawitz ND, Weng J-K, Chapple C (2010) The growth reduction associated with repressed lignin biosynthesis in Arabidopsis thaliana is independent of flavonoids. Plant Cell 22: 1620-1632 67.Wagner A, Donaldson L, Kim H, Phillips L, Flint H, Steward D, Torr K, Koch G, Schmitt U, Ralph J (2009) Suppression of 4-coumarate-CoA ligase in the coniferous gymnosperm Pinus radiata. Plant Physiol 149: 370-383 68.Kaur H, Shaker K, Heinzel N, Ralph J, Gális I, Baldwin IT (2012) Environmental stresses of field growth allow cinnamyl alcohol dehydrogenase-deficient Nicotiana attenuata plants to compensate for their structural deficiencies. Plant Physiol 159: 1545-1570 69.Bhinu V-S, Li R, Huang J, Kaminskyj S, Sharpe A, Hannoufa A (2009) Perturbation of lignin biosynthesis pathway in Brassica napus (canola) plants using RNAi. Can J Plant Sci 89: 441 453 70.Day A, Neutelings G, Nolin Fdr, Grec Sb, Habrant A, Croˆnier D, Maher B, Christia R, David Hln, Chabber B,Hawkins S (2009) Caffeoyl coenzyme A O-methyltransferase down-regulation is associated with modifications in lignin and cell-wall architecture in flax secondary xylem. Plant Physiol Biochem 47: 9-19 71.Fornalé S, Capellades M, Encina A, Wang K, Irar S, Lapierre C, Ruel K, Joseleau J-P, Berenguer J, Puigdomènech P, Rigau J, Caparrós-Ruiz D (2012) Altered lignin biosynthesis improves cellulosic bioethanol production in transgenic maize plants down-regulated for cinnamyl alcohol dehydrogenase. Mol Plant 5: 817-830 72.Wróbel-Kwiatkowska M, Starzycki M, Zebrowski J, Oszmiański J, Szopa J (2007) Lignin deficiency in transgenic flax resulted in plants with improved mechanical properties. J Biotechnol 128: 919-934 73.Preisner M, Kulma A, Zebrowski J, Dymińska L, Hanuza J, Arendt M, Starzycki M, Szopa J (2014) Manipulating cinnamyl alcohol dehydrogenase (CAD) expression in flax affects fibre composition and properties. BMC Plant Biol 14: 50 76.Pedersen JF, Vogel KP, Funnell DL (2005) Impact of reduced lignin on plant fitness. Crop Sci 45: 812-819 78.Vermerris W, Sherman DM, McIntyre LM (2010) Phenotypic plasticity in cell walls of maize brown midrib mutants is limited by lignin composition. J Exp Bot 61: 2479-2490 79.Hu WJ, Harding SA, Lung J, Popko JL, Ralph J, Stokke DD, Tsai CJ, Chiang VL (1999) Repression of lignin biosynthesis promotes cellulose accumulation and growth in transgenic trees. Nature Biotechnol 17: 808-812 80.Arvo Tullus, Mandre M, Soo T, Tullus H (2010) Relationships between cellulose, lignin and nutrients in the stemwood of hybrid aspen in estonian plantations. Cellulose Chem Technol 44: 101-109 81.Bjurhager I, Olsson A-M, Zhang B, Gerber L, Kumar M, Berglund LA, Burgert I, Sundberg B, Salmén L (2010) Ultrastructure and mechanical properties of populus wood with reduced lignin content caused by transgenic down-regulation of cinnamate 4-hydroxylase. Biomacromolecules 11: 2359-2365 82.Hamann T, Denness L (2011) Cell wall integrity maintenance in plants: lessons to be learned from yeast? Plant Signal Behav 6: 1706-1709 83.Hussey SG, Mizrachi E, Creux NM, Myburg AA (2013) Navigating the transcriptional road map regulating plant secondary cell wall deposition. Front Plant Sci 4: 325 84.Zhao Q, Dixon RA (2011) Transcriptional networks for lignin biosynthesis: more complex than we thought? Trends Plant Sci 16: 227-233 85.Shuang-Yan Zhang, Ben-Hua Fei, Yan Yu, Hai-Tao Cheng,Wang C-G (2013) Effect of the amount of lignin on tensile properties of single wood fibers. Forest Sci Practice 15 86.Ringli C (2010) Monitoring the outside: cell wall-sensing mechanisms. Plant Physiol 153: 1445-1452 87.Seifert GJ, Blaukopf C (2010) Irritable walls: the plant extracellular matrix and signaling. Plant Physiol 153: 467-478 88.Zhong R, Lee C, Zhou J, McCarthy RL, Ye Z-H (2008) A battery of transcription factors involved in the regulation of secondary cell wall biosynthesis in Arabidopsis. Plant Cell 20: 2763-2782 89.Zuk M, Richter D, Matyła J, Szopa J (2015) Linseed, the multipurpose plant. Industrial Crops and Products [in press, corrected proof] 90.Martens E, Lowe E, Chiang H, Pudlo N, Wu M, McNulty N, Abbott D, Henrissat B, Gilbert H, Bolam D, Gordon J (2011) Recognition and degradation of plant cell wall polysaccharides by two human gut symbionts. PLoS Biol 9: e1001221 The development, differentiation and composition of flax fiber cells Marta Preisner , Wioleta Wojtasik, Jan Szopa, Anna Kulma Faculty of Biotechnology, University of Wroclaw, 63/77 Przybyszewskiego St., 51-148 Wrocław, Poland * e-mail: [email protected] Key words: cell wall composition, flax fiber differentiation, flax fiber properties, flax, Linum usitatissimum ABSTRACT Having vascular origin, flax fiber belongs to the sclerenchyma (steroids) and its structure is limited to the cell wall. What determines fiber properties is its composition, which in practice means the composition of the secondary cell wall. It consists of four main polymers which constitute approximately 90% of the fiber: cellulose, hemicellulose, pectin, lignin, and a variety of secondary metabolites, proteins, waxes and inorganic compounds. The cell wall is a structure with a high complexity of both the composition and interactions of the particular elements between themselves. It is determined by differentiation and cell growth as well as environmental factors, biotic and abiotic stresses. The molecular background of these processes and mechanisms regulating the synthesis and rearrangement of secondary cell walls components are being intensively studied. In this work we described the latest news about the development, composition and metabolism of flax fiber cell wall components together with the molecular explanation of these processes. Postępy Biochemii 61 (4) 2015 429