Zarządzanie dokumentacją_STARLIMS SDMS

W kierunku jednolitej laboratoryjnej platformy informatycznej
SYSTEM ZARZĄDZANIA DANYMI NAUKOWYMI STARLIMS
INTEGRACJA LIMS I SDMS
W JEDNEJ PLATFORMIE
ZWIĘKSZA UŻYTECZNOŚĆ,
WARTOŚĆ, DOSTĘPNOŚĆ
I TRWAŁOŚĆ ZASOBÓW
INFORMATYCZNYCH
ORGANIZACJI.
System zarządzania danymi
naukowymi STARLIMS (SDMS –
Scientific Data Management
System) jest pierwszym w swoim
rodzaju produktem w pełni
zintegrowanym z systemem
zarządzania informacją
laboratoryjną (LIMS). Wśród
ważnych zalety tej integracji
wymienić należy: zwiększoną
użyteczność, ochronę danych
i własności intelektualnej,
eliminację powielonych
wyszukiwań oraz usprawnienie
zarządzania informacją w całej
organizacji. Cele te zostają
osiągnięte bez potrzeby
rozwoju i utrzymywania drogich
interfejsów.
Zaprojektowany by sprostać
surowym wymaganiom, SDMS
firmy STARLIMS to idealne
rozwiązanie do przechwytywania
danych z aparatury i aplikacji
biznesowych: plików wyjściowych
z aparatury, certyfikatów
analiz i raportów, specyfikacji
produktów, standardowych
procedur działania (SOP) itp.
Jako aplikacja w pełni usługowa,
STARLIMS SDMS umożliwia
dostęp do informacji każdemu
uprawnionemu użytkownikowi
standardowej przeglądarki
internetowej. Każdy dokument
może być odzyskany lub
przechowany poprzez aplikacje
Microsoft Office® po dodaniu
do nich przycisków „Wybierz
z SDMS” i „zapisz w SDMS”.
Zadania STARLIMS SDMS można podsumować w czt
Krok 1: Przechwytywanie
Bezproblemowe przechwytywanie danych i
generowanie raportów w cyklu pracy LIMS
Pliki tworzone w trakcie cyklu pracy LIMS – włączając
raporty, dokumenty, multimedia, obrazy,
są zapisywane w repozytorium SDMS. Dodatkowo
STARLIMS SDMS automatyzuje przechwytywanie
zawartości monitorując skonfigurowane źródła
danych, takie jak: aparatura, skrzynki poczty email,
itd. Funkcjonalność tę zapewnia SDMS Grabber,
który monitoruje zdarzenia tworzenia plików przez
system operacyjny. Narzędzie to po utworzeniu
pliku natychmiast przenosi go do bezpiecznego,
zgodnego z CFR Część 11 repozytorium i udostępnia
do dalszego przetwarzania. Możliwe jest również
bezpośrednie zapisywanie plików do repozytorium
STARLIMS SDMS przy użyciu konfigurowalnych
przycisków Microsoft Office®.
Krok 2: Dzielenie
Zawartość jest rozpoznawana przez sztuczną
inteligencję
STARLIMS stosuje algorytmy sztucznej inteligencji
do przetwarzania nieustrukturyzowanych
dokumentów w sposób automatyczny. STARLIMS
SDMS wyciąga zawartość dokumentów i przechowuje
je wraz z ważnymi zakładkami metadanych. W ten
sposób nieustrukturyzowane dane są przekształcane
do formatu XML, który jest zestandaryzowany i
przystępny. Następnie w odpowiednim module
STARLIMS tworzony jest link do dokumentu,
a w przypadku danych z aparatury aktualizowana jest
tabela wyników.
Przed automatycznym przekazaniem danych
STARLIMS SDMS dokonuje:
• identyfikacji źródła pliku (Varian Galaxy,
Chemstation, Finigan GCMS, SOP, COA, itd.)
• ekstrakcji metadanych, zawartości z plików (ID
próbki, nazwa aparatu) i tabeli wyników (nazwa
piku, czas retencji, jednostki)
• mapowania wyciągniętych danych
do skonfigurowanego przez użytkownika formatu XML
• definicji kierunków przekierowania, np.:
• wszystkie pliki przechwycone z CDS muszą
być zatwierdzone przed wprowadzeniem
do tabeli wyników LIMS
• wszystkie standardowe procedury
poszczególnych muszą być przejrzane przez
kierownika laboratorium, a następnie muszą
przejść QC i QA włączeniem do systemu
STARLIMS
Zastosowanie algorytmów sztucznej inteligencji
do ekstrahowania danych z plików jest rozwiązaniem
wyjątkowym. STARLIMS SDMS podejmie próbę
automatycznej identyfikacji następujących
składników dokumentu:
• Znaczników – słów zawsze obecnych w docelowym
dokumencie, pozwalających na identyfikację źródła
• Słów kluczowych (zielony) – etykiety metadanych
• Tabel (żółty) – program automatycznie wykrywa
tabele danych
• Wykresów (purpurowy) – algorytm wykrywa
wykresy, które można wyekstrahować,
np. chromatogramy.
terech krokach:
Wszelkie niedokładności w ekstrakcji danych
z nieznanego dokumentu mogą zostać poprawione
metodą przeciągnij i upuść. Zmiany zostaną
zapamiętane i uwzględnione w przetwarzaniu
kolejnych plików. To podejście sprawia, iż trudne
zadanie tworzenia skryptów wyciągających dane
z plików staje się znacznie łatwiejsze. Skraca
to czas konieczny do konfiguracji i eliminuje
potrzebę uczenia się złożonych aplikacji.
Krok 3: Zarządzanie cyklem pracy
Standaryzacja procesów i zapewnienie
zgodności z wymaganiami
Używanie aplikacji do zarządzania cyklem pracy
pozwala tworzyć, przeglądać, modyfikować i
zatwierdzać dokumenty wewnątrz kontrolowanego
środowiska, spełniającego wymagania wynikające
z przepisów. Dokumenty są przekierowywane do cyklu
pracy automatycznie lub ręcznie poprzez dołączenie
dokumentu do unikatowego ID cyklu pracy.
Pokazany poniżej edytor cyklu pracy pozwala
definiować własne cykle pracy dostosowane
do różnych typów dokumentów i określić zasady
przekierowań. Każde utworzenie, odtworzenie i
edycja dokumentu tworzy nową wersję, a integracja
systemu zarządzania dokumentami Documentum®
pozwala zapisywać i utrzymywać każdą wersję.
Wszystkie dokumenty są opatrzone podpisami
elektronicznymi, dzięki czemu dostępny jest
pełny audyt zmian. Użytkownicy są informowani
o zaległych krokach cyklu pracy przez interfejs
użytkownika STARLIMS SDMS lub przez włączenie
przypomnień na pulpicie STARLIMS.
Krok 4: Bezpieczne odzyskiwanie i raportowanie
Ograniczenie dostępu tylko do dozwolonych
plików.
Możliwość wydajnego wyszukiwania i używania
zgromadzonych informacji jest kluczem do ich
wartości. STARLIMS SDMS pozwala efektywnie
przeszukiwać i odzyskiwać informacje na podstawie
znaczników metadanych.
Intuicyjny kreator nawigacji pozwala użytkownikom
definiować ścieżkę nawigacji. Dla przykładu:
1. Pokaż dokumenty należące do próbek wody
•Zawężenie wyszukiwania do szczególnego
zakresu danych
•Zawężenie wyszukiwania do dokumentów
testowanych przez GC
•Zawężenie wyszukiwania do dokumentów,
dla których test=Btex
2. Pokaż dokumenty specyfikacji dla aspiryny
•Zawężenie wyszukiwania do wersji 2
Często używane reguły mogą być przechowywane
w celu ponownego użycia. Aktywny monitor
bezpieczeństwa pozwala użytkownikom na dostęp
tylko do dozwolonych dla nich dokumentów. Pełna
integracja z produktami Microsoft Desktop® pozwala
generować raporty w dokumentach programów
Word®, Excel® i PowerPoint. Dodatkowo integracja
z produktem takim jak Documentum® sprawia,
iż wszystkie oryginalne pliki pozostają dostępne
i mogą być odzyskane dzięki wbudowanym
mechanizmom wyszukiwania w pełnym tekście.
Typowe zastosowania STARLIMS SDMS
Narzędzie zarządzania projektem promuje
współpracę w ramach przedsiębiorstwa.
• Współpraca w projektach działu
badań i rozwoju - STARLIMS SDSM
działa z używanymi w firmie
narzędziami do zarządzania
projektem silnie promując
współpracę w projektach
badawczo-rozwojowych. Projekty
te wymagają współpracy wielu
jednostek oraz łatwego dostępu
do danych generowanych
przez współpracowników.
Narzędzia zarządzania
projektem STARLIMS umożliwiają
tworzenie harmonogramu
zadań wykonywanych przez
kilka jednostek. SDMS zapisuje
dokumenty wytworzone w wyniku
tych działań tworząc spójny
obraz całego projektu. To duży
krok naprzód w realizacji celu
i udostępnienia wyników całej
organizacji.
STARLIMS Corporation
4000 Hollywood Blvd. #515S
Hollywood, FL 33021-6755 USA
Tel: +1 954 964 8663
Fax: +1 954 964 8113
• Integracja aparatury – dzięki
STARLIMS SDMS dane mogą być
przechwycone z dowolnego
instrumentu zapisującego pliki
o znanej strukturze. System łatwo
radzi sobie z pojedynczymi lub
wieloma wynikami dla jednej
próbki oraz wieloma wynikami
dla wielu próbek. Informacje
mogą być zapisane do formatu
Unified XML (który pozwala
przechowywać także obrazy)
i importowane do innego
systemu. Dodatkowo oryginalny
plik może być przechowywany
dzięki zarządzaniu zawartością
i odtworzony przy użyciu XML.
Zapewnia to nie tylko integrację
z aparaturą, ale także pozwala
na przechowywania informacji
w neutralnym formacie,
zapewniając długoterminową
dostępność ważnych danych.
• Certyfikaty analiz i raporty –
materiały dostarczane
do laboratorium mogą zawierać
dołączone certyfikaty analiz
producenta. Jeśli są one dostępne
w formie elektronicznej mogą
być automatycznie przetworzone
i przechowywane. Zapewnia
to ekstrakcję danych testowych
i wyników oraz automatyczny
import tych informacji
do systemu, który ich potrzebuje,
np.: LIMS czy ERP. Te same
działania mogą dotyczyć
certyfikatów i raportach
generowanych w laboratorium.
Regional Centers
Selvita sp. z o.o.
ul. Ostatnia 1c, 31-444 Kraków
Polska
Tel: +48 12 410 73 80
Fax: +48 12 410 73 82
[email protected]
• Specyfikacje produktów –
w przypadku wykorzystywania
specyfikacji surowców
w procesie produkcyjnym,
ich utrzymywanie, aktualizowanie
i zarządzanie nimi może stanowić
problemem, zwłaszcza w dużym
środowisku złożonym z wielu
podjednostek. Specyfikacje muszą
być tworzone, aktualizowane,
zatwierdzane i dystrybuowane.
Mechanizmy przeglądania i
zatwierdzania mogą być ustalane
w czasie definiowania cyklu
pracy. Podczas zatwierdzania
szczegóły specyfikacji mogą być
konwertowane do formatu XML,
stając się dostępnymi
dla dowolnego systemu.
• Standardowe procedury
operacyjne (SOP) – SOP i metody
mogą być zarządzane w ten
sam sposób jak specyfikacje
produktów. Podczas
zatwierdzania dane mogą być
ekstrahowane, przetwarzane i
dowolnie udostępniane.
• Zarządzanie wiedzą –
implementacja zarządzania
plikami i dokumentami
przy pomocy STARLIMS SDMS
zapewnia dostęp do danych
i informacji w pojedynczym,
zunifikowanym systemie.
Zarządzanie wiedzą możliwe jest
dzięki łatwemu dostępowi do
danych i informacji tworzonych i
używanych przez laboratorium.
Europe
Tel: +44 1204 546700
Asia Pacific
Tel: +852 8208 0830
www.starlims.com
© Copyright 2008 STARLIMS Corporation. All brand names and product names used here are trademarks, registered trademarks or trade names of their respective holders. STARLIMS is a registered trade mark of STARLIMS Corporation.