Techniki in silico we współczesnej farmacji_Kujawski

Techniki in silico we współczesnej farmacji_Kujawski

Techniki in silico we współczesnej farmacji
1z2
http://postepy-farmacji.pl/index.php?option=com_content&view=articl...
Dla autorów
Aktualności
Wydania
Pod Patronatem:
Informacje
Home
Nowinki
Nowinki
Dla czytelników
Artykuły naukowe i przeglądowe
Dla mecenasów
Autorzy
Techniki in silico we współczesnej farmacji
Dla recenzentów
O czasopiśmie
Nowy numer dostępny on line
Techniki in silico we współczesnej farmacji
Minioną dekadę uznać moŜna za okres wzrostu zainteresowania przemysłu
farmaceutycznego wykorzy-staniem zaawansowanych techniki obliczeniowych w
procesie poszukiwania nowych substancji biologicznie aktywnych. Obserwowany w
minionym dwudziestoleciu dynamiczny wzrost mocy obliczeniowych komputerów oraz
Wydział Farmaceutyczny z O. Analityki
Medycznej Akademii Medycznej im.
Piastów Śląskich we Wrocławiu
Wydawca:
pojawianie się coraz dokładniejszych i szybszych algorytmów oraz technologii
programowania powoduje obniŜenie kosztów oraz skrócenie czasu trwania tego
procesu. U podstaw metodologii tzw. racjonalnego projektowania leków (ang.
rationalized drug design) leŜą aspekty związane chemoinformatyką obejmujące
Zapraszamy do nadsyłania
artykułów, informacji i kontaktu
[email protected]
wykorzystanie technik komputerowych (in silico) w m.in. parametryzacji cząsteczek,
oszacowanie ich podstawowych właściwości fizyko-chemicznych i elektronowych, jak
równieŜ przewidywania szlaków ich syntezy oraz
predykcji
ich właściwości
biologicznych.
Fundacja Rozwoju Nauki i Biznesu w
obszarze Nauk Medycznych i Ścisłych
UŜytkownik
Hasło
W zaleŜności od typu i ilości informacji, jakimi dysponujemy, metody komputerowo
Polecamy:
wspomaganego projektowania leków (CADD, ang. Computer-Aided Drug Design CADD) mogą zostać podzielone na dwie główne rodziny: bazujące na strukturach
Zapamiętaj
znanych ligandów (ang. ligand-based approach) oraz trójwymiarowej strukturze miejsca
wiąŜącego (ang. structure-based approach). Niewątpliwie istotnym wstępnym krokiem
w projektowaniu tzw. struktur wiodących (ang. lead structure/target molecule) jest
Nie pamiętasz hasła?
optymalizacja jej geometrii przy wykorzystaniu róŜnorodnego oprogramowania
Nie pamiętasz nazwy?
(HyperChem, Gaussian, ADF, MOPAC etc.), licznych metod obliczeniowych (techniki
ZałóŜ swoje konto!
DFT, MP2, MM etc.) i związanych z nimi baz funkcyjnych. RóŜnorodność dostępnego
na rynku software’u, jak równieŜ znajomość środowiska oprogramowania i algorytmów
obliczeniowych pozwala przy tym równieŜ na przeprowadzenie dla badanego układu
teoretycznej analizy spektralnej i wygenerowanie widm: IR, UV-VIS, Raman, 1D NMR
Newsletter
(w tym m.in. 1H i13C NMR), co pozwala na skuteczne rozwiązanie wielu problemów
natury elektronowej związanej z interpretacją danego widma, jak równieŜ umoŜliwia
osiąganie satysfakcjonujących wyników w korelacji z danymi uzyskanymi na drodze
eksperymentalnej. Ponadto narzędzia współczesnej chemoinformatyki dają równieŜ
naukowcom
Numer archiwalny
moŜliwość
dokonania
analizy
podstawowych
właściwości
fizykochemicznych z uŜyciem wybranych deskryptorów strukturalnych i elektronowych
(w tym: PSA, log P), jak równieŜ stanowią cenne źródło wstępnego oszacowania
potencjalnych właściwości biologicznych cząsteczki docelowej (m.in. aplikacja PASS).
Sztandarowym przykładem wykorzystania metod bio- i cheminformatycznych w
Mecenasi
obszarze CADD jest tzw. wirtualny skrining (VS, ang. Virtual Screening). Jest to
metodologia przeszukiwania baz związków dostępnych komercyjnie (kilkadziesiąt
milionów unikalnych związków) lub wirtualnych bibliotek związków otrzymywanych na
drodze kombinatorycznej, modyfikacji rdzenia w związkach aktywnych (ang. scaffoldhopping), podmianie bioizo-sterycznej, hybrydyzacji znanych ligandów czy podejściu
bazującemu na algorytmach ewolucyjnych i/lub genetycznych. Owo pode-jście stanowi
równieŜ alternatywę dla klasy-cznego HTS (ang. High-throughput Screening).
Prezentacja dotycząca najwaŜniejszych narzędzi i metod przedstawiona została na
"Spotkaniu Młodych z Nauką 2012" przez doktoranta Jacka Kujawskiego z Katedry i
Wsparte przez:
Zakładu Chemii Organicznej Uniwersytetu Medycznego im. K. Marcinkowskiegow
Poznaniu. Więcej na www.molnet.eu
2012-10-13 20:55
Techniki in silico we współczesnej farmacji
2z2
Copyright 2011-2012. POSTĘPY FARMACJI www.postepy-farmacji.pl wszelkie prawa
http://postepy-farmacji.pl/index.php?option=com_content&view=articl...
Strona działa w oparciu o system Joomla! , szablon JSN Dome PRO edition.
zastrzeŜone.
2012-10-13 20:55