Stanowisko doktoranta oferowane w projekcie prof. Martina Kukwy

Stanowisko doktoranta
oferowane w projekcie prof. Martina Kukwy na Uniwersytecie Gdańskim
Opis projektu:
Zespół profesora Martina Kukwy (Pracownia Taksonomii Grzybów, Katedra Taksonomii Roślin i Ochrony Przyrody
UG) otrzymał projekt przyznany w ramach konkursu OPUS 9 pt. „Sterylne porosty skorupiaste neotropikalnych
ekosystemów leśnych jako źródło ukrytej różnorodności genetycznej - innowacyjne studia na przykładzie Boliwii, kraju
o wysokiej różnorodności biologicznej”.
Porosty sterylne o plechach skorupiastych zawsze uważane były za bardzo trudne we wszystkich typach badań
lichenologicznych i z tego powodu były często pomijane przez lichenologów. Ta grupa porostów, pomimo i tak
stosunkowo niewielkiej ilości badań, została najlepiej poznana w Europie. Dzięki wykorzystaniu cech chemicznych, a
także stosowaniu technik molekularnych i analiz filogenetycznych opisano wiele gatunków, czy nawet rodzajów.
Grupa ta jest również badana w Ameryce Północnej, jednak mało jest danych na temat sterylnych porostów
skorupiastych w tropikach. Pomimo wielu prac, wiedza na temat rozmieszczenia takich gatunków w tych regionach
jest fragmentaryczna, co jest wynikiem większego zainteresowania porostami wytwarzającymi zarodniki jako
potencjalnie łatwiejszymi w identyfikacji. Porosty sterylne produkują zwykle diaspory, które propagują grzybowego i
fotosyntetyzującego bionta, co jest niespotykane u innych przedstawicielu królestwa grzybów. Ok. 85% grzybów
lichenizujących związanych jest z zielenicami, jednak powiązania między obydwoma partnerami są bardzo słabo
poznane. Przykładowo, gatunki fotobiontów zostały zidentyfikowane tylko w przypadku niektórych gatunków porostów.
Jeszcze mniej wiadomo na temat możliwości wiązania się jednego bionta grzybowego z różnymi szczepami
fotobiontów. Porosty tropikalne pod tym względem są najsłabiej poznane z wszystkich grup.
Proponujemy w tym projekcie połączenie różnych metod badania tej trudnej grupy organizmów jakimi są sterylne
porosty skorupiaste. Analizy wtórnych metabolitów i cech morfologicznych będą prowadzone w celu
scharakteryzowania okazów. Następnie prowadzone będą badania molekularne mające na celu uzyskanie
barkodowych sekwencji ITS, które będą pozwalały na szybką identyfikację gatunków o takiej samej lub bardzo
podobnej morfologii. Zastosowanie rejonu ITS, obecnie szeroko akceptowanego w środowiskach naukowych markera
barkodowego, wydaje się być obiecujące w tej grupie porostów. Uzyskane sekwencje będą mogły być wykorzystane
do podobnych badań w regionach Neotropiku oraz stymulować dalsze badania nad tą trudną i pomijaną, ale szeroko
rozpowszechnioną i ważną z ekologicznego punktu widzenia grupą porostów. Biorąc pod uwagę symbiotyczną naturę
porostów, chcemy także zbadać różnorodność fotobiontów u wybranych gatunków porostów skorupiastych.
Można założyć, że duża różnorodność gatunkowa bioty porostów w obszarach leśnych Neotropiku pociąga za sobą
również dużą różnorodność w grupie sterylnych porostów skorupiastych. W ramach projektu zamierzamy
zweryfikować tę hipotezę, starając się odpowiedzieć na następujące pytania:
1. Jaki poziom zróżnicowania osiągają sterylne porosty skorupiaste w Neotropiku? 2. Jaka jest różnorodność
sterylnych porostów skorupiastych w zdegradowanych ekosystemach leśnych Boliwii i czy jest podobna do tej obecnej
w lasach naturalnych? 3. Czy barkoding DNA z wykorzystaniem sekwencji ITS nu-rDNA może być sprawnym
narzędziem do szybkiej i prawidłowej identyfikacji sterylnych porostów skorupiastych w obszarach tropikalnych? 4.
Które cechy morfologiczne i wtórne metabolity sterylnych porostów skorupiastych są homoplastyczne i nie nadają się
do rozpoznawania taksonów na poziomie gatunku? 5. Jak liczna jest grupa gatunków kryptycznych w tej grupie
porostów i czy gatunki kryptyczne różnią się między sobą wymaganiami siedliskowymi? 6. Czy populacje fotobiontów
u sterylnych porostów skorupiastych wykazują zmienność genetyczną w transekcie wysokościowym? 7. Czy gatunki
porostów sterylnych o szerokiej amplitudzie siedliskowej posiadają ten sam typ fotobionta czy też są one różne i
zależne od warunków siedliskowych?
Opis zadań:
• Badania laboratoryjne sterylnych porostów skorupiastych • Analiza uzyskanych danych • Współpraca przy pisaniu
publikacji • Aktywny udział w badaniach i spotkaniach zespołu, • Udział w międzynarodowych i krajowych
konferencjach i stażach naukowych.
Zespół:
Projekt realizowany jest we współpracy z Katedrą Biologii Molekularnej UG (dr Beata Guzow-Krzemińska), Instytutem
Botaniki im. W. Szafera PAN w Krakowie (dr A. Flakus, mgr Pamela Rodriguez Flakus), Muzeum Historii Naturalnej w
Paryżu (prof. Marc-André Selosse, obecnie prof. wizytujący w Katedrze Taksonomii Roślin i Ochrony Przyrody UG)
oraz Herbario Nacional de Bolivia z La Paz w Boliwii.
Oferujemy:
Rozwijanie umiejętności w zakresie badań chemotaksonomicznych, molekularnych i filogenetycznych • Współpracę z
uznanymi specjalistami • Finansowanie: stypendium 2000 zł/miesiąc, przez rok z możliwością przedłużenia do 32
miesięcy • Po wykazaniu się odpowiednimi umiejętnościami, doktorantka/doktorant może współpracować w realizacji
innych projektów.
Wymagania podstawowe
• Tytuł magistra biologii lub dziedzin pokrewnych.
• Dobra znajomość języka angielskiego umożliwiająca swobodne porozumiewanie się i czytanie oraz redagowanie
artykułów naukowych
• Doświadczenie w pracy laboratoryjnej
• Dodatkowym atutem będzie znajomość metod i programów do badań filogenetycznych
Jak się zgłosić?
• Wnioski będą przyjmowane do 13 lipca 2016, drogą e-mailową na adres kierownika projektu: ([email protected]).
Pytania również prosimy kierować na ten sam adres. Aplikacja w języku polskim lub angielskim w postaci jednego
pliku pdf, powinna zawierać: CV (maksimum 2 strony), list motywacyjny oraz kontakty do minimum dwóch osób, które
mogą udzielić referencji, w tym co najmniej jeden od przełożonego. Rozstrzygnięcie konkursu przewidziane na 14
lipca 2016 r.
• Termin przyjmowania wniosków może zostać wydłużony do czasu znalezienia odpowiedniego kandydatki/a.
• Wniosek powinien zawierać następujące oświadczenie: "Wyrażam zgodę na przetwarzanie danych osobowych w
celach rekrutacji zgodnie z ustawą z dnia 29 sierpnia 1997 r. o ochronie danych osobowych (tekst jedn.: Dz U. z 2002
r. Nr 101, poz. 926 z późn. zm.)" •
• Rekrutacja będzie prowadzona zgodnie z „Regulaminem przyznawania stypendiów naukowych dla młodych
naukowców w projektach badawczych ze środków Narodowego Centrum Nauki” (Uchwała Rady NCN nr 50/2013 z
dnia 3 czerwca 2013 roku”.
•Wybrany kandydat/ka będzie zobowiązany do rekrutacji na Studia Doktoranckie z Biologii, Ekologii i
Mikrobiologii na Wydziale Biologii UG (uzyskanie statusu doktorantki/a – słuchaczki/a studium doktoranckiego).