politechnika łódzka
Transkrypt
politechnika łódzka
POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ BŁONĘ KOMÓRKOWĄ Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową I. WSTĘP TEORETYCZNY Każda komórka, zarówno roślinna, jak i zwierzęca jest otoczona błoną komórkową, która stanowi selektywną, półprzepuszczalną barierę dla substancji znajdujących się we wnętrzu komórki i w jej otoczeniu. Wszystkie błony biologiczne zbudowane są przede wszystkim z lipidów oraz białek. Cząsteczki białek zanurzone są w dwuwarstwowej błonie fosfolipidowej, której strukturę określa się mianem płynnej mozaiki błony. Cząsteczki fosfolipidów błonowych składają się z hydrofilowych główek i hydrofobowych ogonków. W wodzie ogonki dążą do siebie, a główki na zewnątrz – w ten sposób powstaje błona komórkowa (rys.1.). Rys.1. Model struktury błony cytoplazmatycznej B1 – białko integralne (wewnętrzne), B2–B5 - białka powierzchniowe (peryferyjne) Błony biologiczne są strukturami dynamicznymi, zmieniającymi się w czasie. Przez płynność błony należy rozumieć możliwość przemieszczania się elementów tworzących błonę, szczególnie białek. Stopień płynności danego obszaru błony zależy od czynników środowiskowych (temperatura, charakter chemiczny roztworów stykających się z błoną) oraz strukturalnych: większą sztywność wykazują błony o dużej zawartości płaskich cząsteczek cholesterolu i nienasyconych kwasów tłuszczowych w fosfolipidach. Cząsteczki białek błonowych mogą przenikać w poprzek całą błonę (białka integralne lub transmembranowe) bądź tylko przyczepione do niej po obu jej stronach. 1 Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową Funkcje błon biologicznych są różnorodne. Lipidy błonowe nie przepuszczają substancji rozpuszczonych w wodzie, powodując oddzielnie roztworów znajdujących się po obu stronach błony. Transport substancji chemicznych przez błony odbywa się głównie za pośrednictwem białek. Są wśród nich cząsteczki tworzące kanały, które w miarę potrzeb mogą być otwierane i zamykane. Są białka, które po pobraniu cząsteczek czy jonów po jednej stronie błony wędrują na drugą stronę, by tam je uwolnić. Istnieją białka, które obracają się w błonie o 180o, przenosząc tym samym cząsteczki z jednej strony błony na drugą, niekiedy jednocześnie dwa rodzaje cząsteczek w przeciwnych kierunkach. Jeśli transport odbywa się zgodnie z gradientem stężeń danej substancji, tj. z obszaru o większym stężeniu do obszaru o mniejszym stężeniu, nie sprawia to problemów. Transport wbrew gradientowi stężeń wymaga natomiast nakładu energii – jest to transport aktywny. Pobieranie substancji chemicznych przez komórkę może odbywać się także poprzez wpuklanie fragmentów błony i tworzenie pęcherzyków zawierających obiekt, który przylegał do błony po stronie zewnętrznej. Odpowiednio – wydzielanie substancji poza komórkę może polegać na łączeniu się błony otaczającej pęcherzyk zawierający tę substancję z błoną komórkową. Oprócz pełnienia licznych funkcji ochronnych i transportowych błony biologiczne, biorą udział w odbieraniu i przewodzeniu sygnałów. Sygnały docierają do komórek najczęściej w postaci pewnych cząsteczek, np. hormonów. Aby komórka mogła odebrać dany sygnał, musi mieć na powierzchni błony swoisty receptor – białko, glikoproteinę, wiążące się z cząsteczką sygnałową. Związanie tej cząsteczki powoduje zmiany w strukturze białka receptora, wpływające na białka enzymatyczne we wnętrzu komórki. 2 Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową III. PRZEBIEG ĆWICZENIA Niezbędne materiały do przeprowadzenia ćwiczenia ♦ zawiesina komórek drożdży Saccharomyces cerevisiae, ♦ pipety, ♦ wirówka, ♦ kapilary szklane Odczynniki wykorzystywane podczas analizy transportu: ! FURA - 2 AM - indykator do oznaczania wolnych jonów wapnia ! EDTA – (wersenian dwusodowy) substancja wiążąca jony dwuwartościowe ! bufor fosforanowy pH 7,6 III. PRZEBIEG ĆWICZENIA A. Metody 1) Przygotowanie materiału do badań Drożdże należy zbierać przez odwirowanie przy 10000 x g przez 1 min. (wirówka Micro–centrifuge type 320) w temperaturze pokojowej. Następnie otrzymany osad przemywać trzykrotnie w buforze fosforanowym w celu usunięcia pożywki i doprowadzić do cytokrytu 2%(v/v) 2) Określenie cytokrytu (ilości komórek ) drożdży poddanych badaniom: Tok postępowania: - odwirowanie 2-krotnie, 4 probóki typu eppendorf, każdorazowo napełnianych po 1ml zawiesiny drożdży - zwieszenie odwirowanych drożdży w 0,1ml buforu i napełnienie kapilar pomiarowych, następnie odwirowanie i pomiar odcinka skupienia drożdży w stosunku do odcinka zawartości płynu w kapilarze 3 Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową - podstawienie danych do zależności c1=(ldrożdży * 100)/ lcałkowite [%] ldrożdży – długość odcinka z płynem w kapilarze lcałkowite - długość odcinka ze skupionymi drożdżami, następnie należy obliczyć objętość drożdży w\g wzoru: µl] v2=( v1c2 )/ c1 [µ v2 – szukana objętość drożdży v1 – objętość drożdży odwirowanych c2 – ilość odwirowywań Znając objętość (v2) drożdży przeprowadzić badania: B. Zakres badań 1. Badanie transportu FURA - 2 AM - 40 µmol 2. Badanie transportu FURA - 2 AM w obecności EDTA (40 µmol FURA - 2 AM + 100 µl roztworu 1 mmol EDTA) C. Tok postępowania a) odwirować określoną ilość drożdży, b) odmyć 3-krotnie odwirowane drożdże w buforze, c) zawiesić w 1ml buforu, dodać odpowiedni odczynnik i odwirowywać po upływie 0, 5, 10, 20, 30 minut, d) po odwirowaniu zawiesić w 2ml buforu, e) dokonać odczytu fluorymetrem (fluorymetr TKO 100), f) zanotować wyniki w tabelach 1 i 2. 4 Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową Tab.1. Badanie transportu FURA - 2 AM - 40 µmol CZAS (min) 40 µl FURA - 2 40 µl FURA - 2 40 µl FURA - 2 AM AM AM 0 Średnia 5 10 20 30 Tab.2. Badanie transportu FURA - 2 AM w obecności EDTA 100µl EDTA 100µl EDTA 100µl EDTA 100µl EDTA + + + + CZAS (min) 40 µl FURA - 40 µl FURA - 40 µl FURA - 40 µl FURA 2 AM 2 AM 2 AM 2 AM 0 Średnia 5 10 20 30 IV. SPRAWOZDANIE POWINNO ZAWIERAĆ 1. Krótki wstęp teoretyczny. 2. Cel przeprowadzonego ćwiczenia. 3. Objaśnienie symboli stosowanych w sprawozdaniu. 4. Tabele z wartościami wielkości mierzonych. 5. Wykres szybkości transportu 10µM FURA – 2 AM. 5 Analiza transportu substancji niskocząsteczkowych przez błonę komórkową 6. Dyskusję i wnioski. V. PYTANIA KONTROLNE 1. Budowa błony komórkowej. 2. Rodzaje transportu przez błonę – omówić transport aktywny . 3. Zjawisko osmozy. 4. Zjawisko luminescencji. LITERATURA 1. J. St. Szopa: Biologia i inżynieria komórki - laboratorium; PŁ,Łódź 1994r. 2. F. Jaroszka: Biofizyka; Wydawnictwo Lekarskie PZWL; Warszawa 2001r. 3. K. Ostrowski: J.Kawiaka: Cytofizjologia; Państwowy Zakład Wydawnictw Lekarskich; Warszawa 1990r. 4. A. Pilawski: Podstawy biofizyki; Państwowy Zakład Wydawnictw Lekarskich; Warszawa 1985r. 5. A. Batko, W.kofta i in.: Botanika i biologia komórki; Prószyński i S–ka; Warszawa 1998 6