Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii
Transkrypt
Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii
Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r. Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc KIEROWNIK: Prof. dr hab. n. med. Joanna Chorostowska-Wynimko Sekretariat: tel. 022.43.12.158 Laboratorium: tel. 022.43.12.105 fax. 022.43.12.358 e-mail: [email protected] Badanie Kontakt Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowopęcherzykowych dr n. med. A. Roży, mgr A. Stępniewska, tech. analit. B. Szumna 22.43.12.105 α1-antytrypsyna (A1AT) – stężenie, określenie fenotypu/genotypu dr n. med. A. Roży, mgr K. Duk, mgr A. Zdral 22.43.12.105 ACE - Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę dr n. med. A. Roży, mgr A. Zdral, tech. analit. B. Szumna 22.43.12.105 Diagnostyka molekularna raka płuca mgr K. Duk , mgr inż. P. Skrońska, mgr A. Zdral 22.43.12. 256 Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy (PCP) dr n. med. A. Roży, mgr K. Duk , mgr inż. P. Skrońska, mgr A. Zdral, mgr A. Stępniewska, tech. analit. B. Szumna 22.43.12.105 UWAGA! Materiały biologiczny na badania: Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych, Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów oddechowych met. immunofluorescencji pośredniej, Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii (CMV) met. immunofluorescencji pośredniej przyjmowane są od poniedziałku do piątku w godz. 8:00 – 11:00, badania wykonywane tylko w dniu pobrania materiału. Materiały biologiczny na pozostałe badania przyjmowane są od poniedziałku do piątku, w godzinach 8.00 -15.00 Str. 1 z 3 Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r. l.p. Badanie Materiał Metoda Zakres biologicznych wartości referencyjnych: do 5 dni roboczych do 5 dni roboczych 1 Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych płyn z BAL Manualna Cytometria przepływowa Osoby zdrowe niepalące palące Całkowita liczba komórek [x106] < 10 < 20 Makrofagi [%] > 80 > 90 Limfocyty [%] < 15 < 10 Granulocyty obojętnochłonne [%] <3 <3 Granulocyty kwasochłonne [%] < 0,5 < 0,5 Stosunek odsetka limfocytów 1,5- 2,5 0,5- 1,5 CD4+/CD8+ 2 Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę ACE surowica kinetyczna dla dorosłych: 8 – 52 U/l surowica l.p. Badanie Materiał Metoda Zakres biologicznych wartości referencyjnych Wynik Wynik alfa1 – Antytrypsyna (AAT) 3 Stężenie alfa1-antytrypsyny surowica Nefelometryczna 4 Diagnostyka wrodzonego niedoboru alfa1- antytrypsyny (fenotypowanie/genotypowanie) krew żylna EDTA Ogniskowanie izoelektryczne Real time PCR Sekwencjonowanie dla dorosłych: 88 – 183 mg/dl do 5 dni roboczych Wynik opisowy do 21 dni roboczych Wynik opisowy do 10 dni roboczych Diagnostyka molekularna raka płuca 5 6 Mutacje w genie EGFR Rearanżacja genu ALK tkanki i komórki FFPE , rozmazy komórkowe tkanki i komórki FFPE Allelospecyficzny Real-time PCR PNA-LNA PCR clamp Sekwencjonowanie FISH (Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ) Str. 2 z 3 Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r. l.p. Badanie Materiał Metoda Zakres biologicznych wartości referencyjnych Wynik Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy (PCP) Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów wymaz z gardła Immunofluorescencja pośrednia Wynik opisowy wymaz z gardła Real time PCR Wynik opisowy wymaz z gardła, wymaz z nosogardła Real time PCR Wynik opisowy CMV - Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii. krew żylna EDTA Immunofluorescencja pośrednia Wynik opisowy 11 CMV - Wykrywanie sekwencji genu kodującego białko ppUL83 (pp65) wirusa cytomegalii krew żylna EDTA osocze EDTA płyn z BAL mocz płyn m-r Real time PCR Wynik opisowy 12 Wykrywanie obecności oocyst Pneumocystis jirovecii. 13 Wykrywanie obecności materiału genetycznego Pneumocystis jirovecii. 7 oddechowych: wirusa grypy typ A i typu B; wirusa para grypy typu 1, 2, 3; syncytialnego wirusa oddechowego, adenowirusa. 8 Wykrywanie i identyfikacja wirusa grypy typu A i podtypu AH1N1 oraz grypy typu B Wykrywanie i identyfikacja 21 patogenów oddechowych: Adenowirus (HAdV), Bokawirus (HBoV), Koronawirus ( 229E, HKU1, NL63, OC43), Ludzki metapneumowirus (HMPV), Wirus grypy typu 9 A (podtyp: H1, H3, 2009 H1), Wirus grypy typuB; Wirus paragrypy w dniu dostarczenia materiału do ZGiIK lub następnym dniu roboczym typu 1, 2, 3, 4; Enterowirus, Rinowirus (HRV), Syncytialny wirus oddechowy (RSV) oraz Bordetella pertussis, Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae. 10 płyn z BAL plwocina Immunofluorescencja pośrednia Wynik opisowy Real time PCR Str. 3 z 3