Prace magisterskie 2016 Magdalena Modrzejewska. Typowanie

Prace magisterskie 2016 Magdalena Modrzejewska. Typowanie

Prace magisterskie
2016
Magdalena Modrzejewska. Typowanie genetyczne i lekowrażliwość prątków Mycobacterium kansasii.
Promotor: Dr Tomasz Jagielski
Sylwia Gregorczuk. Propozycja nowej metody identyfikacji glonów Prototheca sp.na podstawie
analizy PCR-RFLP dla genu kodującego 18S rRNA. Promotor: Dr Tomasz Jagielski
Joanna Patrycja Wachowicz. Analiza ekspresji genu hemR Yersinia enterocolitica w układzie
natywnym oraz heterologicznym (Escherichia coli). Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
2015
Joanna Kalita. Zastosowanie analizy sekwencyjnej genów EF1α, TUB oraz regionu ITS do identyfikacji
gatunkowej grzybów z rodzaju Scopulariopsis. Propozycja nowych, molekularnych metod
diagnostycznych umożliwiających wykrywanie patogennych gatunków Scopulariopsis. Promotor: Dr
Tomasz Jagielski
Michał Wichowski. Identyfikacja grzybów z rodzaju Malassezia przy użyciu techniki PCR-sequencing
dla rybosomalnych sekwencji miedyzgenowych ITS. Promotor: Dr Tomasz Jagielski
Dorota Stosio. Funkcja białka OmpR Yersinia enterocolitica w regulacji ekspresji genów związanych z
transportem oligogalakturonianów. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
Agata Poświata. Klonowanie genów kodujących zmodyfikowane warianty listeriolizyny oraz białko
GFP do Bacillus subtilis. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Damian Kołakowski. Zmodyfikowana listeriolizyna O jako komponent cytotoksyczny immunotoksyn.
Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Paweł Laskowski. Biology and engineering of self-assembling aminoacyl-tRNA synthetases. Promotor:
Dr Radosław Stachowiak
2014
Kinga Kosim. Znaczenie analizy sekwencyjnej rDNA dla opracowania nowego systemu markerowego
do identyfikacji gatunkowej grzybów z rodzaju Scopulariopsis. Promotor: Dr Tomasz Jagielski
Helena Ignatowska. Poszukiwanie mutacji w genach rpsL, rrs i gidB jako molekularnych markerów
oporności na streptomycynę w szczepach klinicznych Mycobacterium tuberculosis. Promotor: Dr
Tomasz Jagielski
Aleksandra Ziółkowska. Wykorzystanie GFP do analizy ekspresji modelowych antygenów w Bacillus
subtilis. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Joanna Grzymała. Wpływ białek regulatorowych OmpR i Hfq oraz sRNA OmrA na poziom ekspresji
genów yadA, ail, ompX kodujących białka błony zewnętrznej Yersinia enterocolitica. Promotor: Dr
hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
Ewa Stefańska. Molekularny mechanizm regulacji ekspresji genu kdgM2 u Yersinia enterocolitica.
Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
2013
Marta Piotrowska. Konstrukcja szczepów Bacillus subtilis eksprymujących antygeny TB10.4 i Ag85B
Mycobacterium tuberculosis. Promotor: Dr Tomasz Jagielski
Rafał Ostrowski. Konstrukcja mutantów Listeria monocytogenes do zastosowań w biotechnologii
medycznej. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Magdalena Grzeszczuk. Wykorzystanie Bacillus subtilis do badania właściwości białka Iap Listeria
monocytogenes. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Robert Lamparski. Ocena inwazyjności szczepów B. subtilis eksprymujących gen hlyA względem
ludzkich komórek nabłonkowych. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Kamil Żyłka. Diagnostyka molekularna chorób nowotworowych. Zbadanie statusu genu TP53
i niestabilności mikrosatelitarnej w raku jelita grubego oraz ocena statusu genu BRAF w raku płuca.
Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Dominika Jurkiewicz. Immunoterapeutyczna szczepionka antynowotworowa. Klonowanie epitopu
białka CD20 w B. subtilis. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Monika Kosut. Funkcja białka OmpR w kontroli ekspresji genów ail, ompX i kdgM, kodujących białka
błony zewnętrznej Yersinia enterocolitica. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
Olga Lewandowska. Identyfikacja genów regulonu OmpR u Yersinia enterocolitica metodą
mutagenezy transpozonowej – analiza funkcji OmpR w kontroli ekspresji pompy oporności
wielolekowej AcrAB-TolC. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. U.W.
Anna Misiukiewicz. Udział czynników środowiskowych oraz dwuskładnikowych systemów regulacji
w modulowaniu ekspresji genu omrA kodującego regulatorowy sRNA u Yersinia enterocolitica.
Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2012
Fadhel Abbas. Oporność drobnoustrojów powodujących oportunistyczne zakażenia ludzi i zwierząt na
antybiotyki i jej genetyczne determinanty. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Zofia Bakuła. Projektowanie układów immobilizacyjnych w kierunku bakteryjnych terapii
implantacyjnych i doustnych. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Maja Grabowska. Wykorzystanie streptawidyny do konstrukcji listeriolizyny o ukierunkowanej
cytotoksyczności. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Katarzyna Jopek. Liposomy niosące cargo kierowane do jądra komórkowego w celu regulacji
procesów epigenetycznych. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Joanna Grzymała. Adhezyny Yersinia enterocolitica - GFP w badaniach oddziaływań bakterii
chorobotwórczych z komórkami eukariotycznymi. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Patrycja Szewczyk. Identyfikacja kompleksów OmpR/DNA metodą immunoprecypitacji oraz w testach
EMSA. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
Karolina Prokopiuk. Udział regulatorów transkrypcyjnych OmpR i RcsB w ekspresji operonu
rzęskowego flhDC Yersinia enterocolitica. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2011
Paweł Rudowski. Konstrukcja wektora wahadłowego do heterologicznej ekspresji genu actA z Listeria
monocytogenes. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Małgorzata Staworzyńska. Konstrukcja wektorów plazmidowych niosących modelowe antygeny:
nukleoproteinę wirusa grypy i owoalbuminę. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Michał Kamiński. Konstrukcja szczepów Bacillus subtilis eksprymujących antygen modelowy
owalbuminę w fuzji z immunogennym białkiem p60 z Listeria monocytogenes. Promotor: Dr
Radosław Stachowiak
Karolina Kamińska. Poszukiwanie OmpR-zależnych genów w mutantach transpozonowych Yersinia
enterocolitica niosących fuzje transkrypcyjne promotorów z genem reporterowym lacZ. Promotor: Dr
hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Anna Piasecka. Regulatory aktywności transkrypcyjnej genu receptora androgenowego: cykl
komórkowy oraz napięcie komórki. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2010
Kinga Dymecka. Analiza ekspresji genu actA Listeria monocytogenes w szczepie Bacillus subtilis.
Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Justyna Lesiak. Escherichia coli jako uniwersalny wektor skonstruowany metodami biologii
syntetycznej. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Gabriela Szmyd. Wpływ listeriolizyny O wydzielanej przez zrekombinowane szczepy Bacillus subtilis
na komórki makrofagopodobne linii J774. Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Łukasz Mruk. Otrzymanie oraz analiza mutacji punktowej w genie prfA Listeria monocytogenes.
Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Dorota Nowak. Regulacja ekspresji genu fliA Yersinia enterocolitica. Promotor: Dr hab. Katarzyna
Brzostek, prof. UW
Izabela Zasada. Regulacja ekspresji genów wirulencji z udziałem białka OmpR - badania w układzie
natywnym (Yersinia enterocolitica) i heterologicznym (Escherichia coli). Promotor: Dr hab. Katarzyna
Brzostek, prof. UW
Katarzyna Obszańska. Rola białka OmpR w odpowiedzi na stres kwasowy u Yersinia enterocolitica.
Poszukiwanie genów regulonu OmpR. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2009
Anita Chodkowska. Ocena udziału internaliny F Listeria monocytogenes w procesie patogenezy.
Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Maria Karwowska. Charakterystyka produktu genu lmo0171 Listeria monocytogenes przy udziale
szczepu Bacillus subtilis SBB. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Daliya Akram Humoodi. Charakterystyka biologiczna szczepów Bacillus subtilis produkujących różne
typy listeriolizyny O Listeria monocytogens. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Katarzyna Golec. Sekrecja listeriolizyny O przez Bacillus subtilis i jej wpływ na limfocyty T linii Jurkat.
Promotor: Dr Radosław Stachowiak
Karolina Skorek. Rola białka OmpR w regulacji ekspresji genów regulonu rzęski Yersinia enterocolitica.
Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Dominika Czapla. Udział dwuskładnikowego systemu regulacji EnvZ/OmpR w modulacji właściwości
inwazyjnych Yersinia enterocolitica. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2008
Jarosław Boberek. Interakcje pomiędzy regulatorami transkrypcyjnymi CysB i SsuR oraz relacje
między ścieżkami biosyntezy cysteiny i metioniny u Burkholderia cenocepacia. Promotor: Prof. dr
hab. Jacek Bielecki
Paweł Wawrzyniak. Modyfikacja wektora ekspresyjnego pSW12 umożliwiającego produkcję
listeriolizyny O w Bacillus subtilis. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Agnieszka Gil. Cytotoksyczność wybranych czynników patogenezy Listeria monocytogenes. Promotor:
Dr Radosław Stachowiak
Agnieszka Szymańska. Udział białka RovA Yersinia enterocolitica w regulacji ekspresji genu
kodującego inwazynę. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Paulina Nojek. Rola białka EnvZ, sensora szlaku sygnałowego EnvZ/OmpR Y. enterocolitica, w regulacji
syntezy poryn. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Katarzyna Zacharczuk. Badanie regulacji ekspresji operonu ompB Yersinia enterocolitica. Promotor:
Dr Adrianna Raczkowska
Agnieszka Witek. Udział białek OmpR i RovA w regulacji ekspresji inwazyny Yersinia enterocolitica.
Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2007
Paulina Godzik. Rola białka Lmo0409 we wczesnych etapach patogenezy Listeria monocytogenes.
Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Paweł Gunerka. Wstępna charakterystyka bioinformatyczna wybranych białek powierzchniowych
Listeria monocytogenes. Rola białka Lmo0171 i Lmo2027 we wczesnych etapach patogenezy.
Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Marta Turyk. Wstępna charakterystyka roli białek Lmo1289 i Lmo2026 we wczesnych etapach
patogenezy Listeria monocytogenes. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Maciej Czerkies. Rola białka OmpR w regulacji osmotycznej inwazyny Yersinia enterocolitica.
Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Małgorzata Bill. Regulacja ekspresji yenI, systemu „quorum sensing” u Yersinia enterocolitica serotyp
0:9. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
2006
Agata Goryluk. Charakterystyka szczepu Bacillus subtilis produkującego natywną i zmodyfikowaną
hemolizynę Listeria monocytogenes. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Kamila Oliwa. Charakterystyka szczepu Listeria monocytogenes eksprymującego zmodyfikowaną
hemolizynę. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Anna Piasecka. Właściwości fragmentu 296-299 a-hemolizyny Escherichia coli. Promotor: Prof. dr
hab. Jacek Bielecki
Ewa Karwicka. Wpływ warunków środowiska na ekspresję inwazyny Yersinia enterocolitica O:9 - rola
białka OmpR w osmoregulacji. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Iwona Bukowska. Analiza funkcjonalna białka OmpR Yersinia enterocolitica – oddziaływanie OmpR
z sekwencją promotorową genu inwazyny. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Mariusz Żak. Charakterystyka fenotypowa mutanta w genie gnd kodującym dehydrogenazę 6fosfoglukonianową Yersinia enterocolitca. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
Agnieszka Sobolewska. Wpływ regulatora MalK na produkcję białek Yop - czynników wirulencji
Yersinia enterocolitica O:9. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska
2005
Tomasz Jagielski. Klonowanie genów kodujących istotne determinanty patogenezy Listeria
monocytogenes do szczepu Bacillus subtilis. Promotor: Prof. dr hab. Jacek Bielecki
Marta Brzóstkowska. Udział białka MalT w regulacji ekspresji i sekrecji czynników wirulencji Yersinia
enterocolitica serotyp O:9. Promotor: Dr hab. Katarzyna Brzostek, prof. UW
Magdalena Kieliszek. Wpływ mutacji w genie ompR na poziom ekspresji genów wirulencji Yersinia
enterocolitica O:9. Udział białek porynowych w antybiotykooporności szczepu. Promotor: Dr hab.
Katarzyna Brzostek, prof. UW
Tomasz Dyda. Wpływ globalnego regulatora transkrypcji Mlc na produkcję białek Yop Yersinia
enterocolitica O:9. Promotor: Dr Adrianna Raczkowska