WYDZIAŁ LEKARSKI II

Transkrypt

WYDZIAŁ LEKARSKI II
WYDZIAŁ LEKARSKI II
Nazwa
kierunku
Nazwa
przedmiotu
Jednostka
realizująca
Rodzaj
przedmiotu
Obszar
nauczania
Cel kształcenia
Treści
programowe
Biotechnologia, specjalność Poziom i forma
Biotechnologia Medyczna studiów
I stopień
Inżynieria genetyczna
Punkty ECTS
Katedra Biotechnologii
Medycznej
Osoba odpowiedzialna
obowiązkowy
semestr
V
10
(imię, nazwisko, email, nr tel.
służbowego)
Rodzaj zajęć
i liczba godzin
stacjonarne
wykłady
Eliza KwiatkowskaBorowczyk
[email protected]
618850669
ćwiczenia
90
seminaria
45
P1A, M1
W trakcie zajęć seminaryjnych studenci poznają podstawowe pojęcia i techniki wykorzystywane w
inżynierii i genetycznej wykorzystywane do rekombinacji genetycznych i tworzenia organizmów
genetycznie modyfikowanych. Przedstawiane są możliwości wykorzystania inżynierii genetycznej
w biotechnologii, medycynie, agrobiotechnologii. W trakcie ćwiczeń laboratoryjnych studenci
opanowują zasady bezpiecznej pracy w laboratorium i standardowe techniki inżynierii genetycznej
realizując projekt badawczy polegający na uzyskaniu linii komórek ssaczych z ekspresją białka
GFP. Wśród praktycznych elementów szkolenia jest nauka przygotowania protokołu badawczego
oraz interpretacja wyników eksperymentów.
Wykłady
Ćwiczenia
Uzyskanie linii komórek ssaczych wykazujących ekspresję białka GFP
1. Obliczenia
2. Izolacja RNA
3. Odwrotna trankrypcja
4. Amplifikacja PCR, ligacja
5. Transformacja bakterii/założenie płynnych hodowli. Mapy restrykcyjne
6. Izolacja plazmidów (minipreparacja), analiza restrykcyjna klonów
7. Klonowanie do wektora ekspresyjnego (przygotowanie wektora, insertu, ligacja)
8. Transformacja bakterii wektorem ekspresyjnym
9. Analiza klonów (PCR), założenie płynnych hodowli
10. Przygotowanie plazmidów do transfekcji komórek ssaczych (minipreparacja-kolumny, analiza
restrykcyjna)
11. Określenie stężenia i czystości uzyskanych wektorów ekspresyjnych. Transfekcja komórek
ssaczych
12. Analiza ekspresji wprowadzonych genów – mikroskop, cytometr przepływowy
13. PCR w czasie rzeczywistym – analiza ekspresji
14. PCR w czasie rzeczywistym – analiza sekwencji
Seminaria
1. Izolacja kwasów nukleinowych.
2. Kolokwium- biologia molekularna
3. Enzymy stosowane w inżynierii genetycznej
4. Amplifikacja DNA –PCR, sekwencjonowanie
5. Wektory: bakteryjne, ekspresyjne, wirusowe
6. Metody wprowadzania materiału genetycznego do komórek. Czynniki selekcyjne
7. Prokariotyczne systemy ekspresji białek. Białka fuzyjne, oczyszczanie białek
8. Eukariotyczne systemy ekspresji białek
9. Techniki hybrydyzacyjne I
10. Techniki hybrydyzacyjne II
11. Wyciszanie ekspresji genów
12. Systemy reporterowe
13. Systemy regulowanej ekspresji genów
14. Zwierzęta transgeniczne
15. PCR w czasie rzeczywistym
Inne
Formy
i metody
dydaktyczne
Forma
i warunki
zaliczenia
Literatura
podstawowa
(nie więcej niż 3
pozycje)
Seminaria, ćwiczenia laboratoryjne
Prezentacja multimedialna, dyskusja, rozwiązywanie zadań laboratoryjnych (obliczenia, projekt
eksperymentu, raport z eksperymentu), praca eksperymentalna
Zaliczenie przedmiotu odbywa się po zdaniu egzaminu końcowego (krótkie pytania otwarte),
obejmującego materiał zajęć seminaryjnych i ćwiczeń. Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest
obecność i aktywność na wszystkich wymaganych seminariach, przygotowanie i przedstawienie
dwóch prezentacji ustnych dotyczących wykorzystania metod inżynierii genetycznej w
biotechnologii/medycynie i pozytywne zaliczenie ćwiczeń.
Warunkiem uczestnictwa w ćwiczeniach jest zaliczenie kolokwium obejmującego materiał kursu
Biologii molekularnej (II rok studiów), które odbywa się na drugim seminarium (test). Warunkiem
zaliczenia ćwiczeń jest zaliczenie wszystkich ćwiczeń (ocena przygotowania studenta do zajęć,
pracy podczas ćwiczeń, prowadzonej dokumentacji), przedstawienie pisemnego raportu
przedstawiającego opracowanie wyników uzyskanych podczas realizacji projektu w trakcie
ćwiczeń oraz zdanie kolokwium ustnego z zakresu ćwiczeń.
1. Materiały udostępnione przez prowadzącego zajęcia (protokoły, opis przebiegu ćwiczeń)
2. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Sambrook J, Russel DW. Cold Spring Harbour
Laboratory Press, Third Edition
3. Principles of Gene Manipulations and Genomics. Primrose SD, Twyman RM.
BlackwellPublishing, Seventh Edition
Literatura
uzupełniająca
Efekty kształcenia
Przedmiotowe
efekty
kształcenia
E_W01
E_W02
E_W03
E_W04
E_U01
E_U02
E_U03
Przedstawić w formie operatorowej:
- zna
- potrafi
- rozumie
- wykazuje umiejętności…..
Zna i opisuje podstawowe pojęcia z zakresu inżynierii genetycznej, w
języku polskim i angielskim
Zna i opisuje podstawowe metody izolacji, analizy i modyfikacji
kwasów nukleinowych
Zna i opisuje metody stałej lub czasowej modyfikacji genetycznej
bakterii i organizmów wyższych
Opisuje wykorzystanie inżynierii genetycznej w biotechnologii, ochronie
zdrowia, agrobiotechnologii
Potrafi przygotować prezentację multimedialną dotyczącą wybranego
problemu naukowego
Samodzielnie wykorzystuje poznane techniki inżynierii genetycznej
(izolacja kwasów nukleinowych, analiza restrykcyjna DNA, PCR,
modyfikacja genetyczna bakterii i komórek eukariotycznych, analiza
ekspresji genów w komórce)
Rozumie i tłumaczy zasady posługiwania się sprzętem
Odniesienie do
kierunkowych
efektów kształcenia
K_W06
K_W07, K_W12,
K_W16
K_W08, K_W10,
K_W11, K_W16
K_W06
K_U02, K_U03,
K_U11, K_U12,
K_U14
K_U01, K_U04,
K_U05
K_U01
E_U04
E_U05
E_U06
E_K01
E_K03
E_K04
wykorzystywanym w biologii molekularnej/ inżynierii genetycznej i ten
sprzęt potrafi obsługiwać
Rozumie i wykorzystuje literaturę z zakresu inżynierii genetycznej w
języku polskim i proste teksty naukowe w języku angielskim
Uczy się samodzielnie w sposób ukierunkowany
Poprawnie opracowuje wyniki eksperymentu, przeprowadza ich analizę i
formułuje odpowiednie wnioski
Rozumie potrzebę stałego aktualizowania wiedzy
Jest odpowiedzialny za własną pracę i powierzony sprzęt, szanuje pracę
własną i innych
Jest odpowiedzialny za bezpieczeństwo własne i innych, umie
postępować w stanach zagrożenia
Na jeden pkt ECTS przypada od 25-30 godzin nakładu pracy studenta,
w tym godziny kontaktowe z nauczycielem akademickim ( wykłady,
seminaria, ćwiczenia, konsultacje) plus samodzielna praca studenta
(przygotowanie do zajęć, do kolokwiów, do egzaminu, przygotowaniu
projektów, prezentacji, opracowywanie protokołów)
Godziny kontaktowe z nauczycielem akademickim
udział w wykładach
Bilans nakładu udział w ćwiczeniach
pracy studenta udział w seminariach
udział w konsultacjach związanych z zajęciami
Samodzielna praca studenta
przygotowanie do ćwiczeń
przygotowanie do seminariów
przygotowanie do kolokwiów
przygotowanie do egzaminu
K_U02
K_U15
K_U13
K_K02
K_K05
K_K06
15x6
9x2+9x3
90
45
Razem
135
15x1
15x 1
+2x5
2x5
20
Razem
15
25
Liczba
godzin
Wskaźniki
ilościowe
10
20
70
Liczba
ECTS
Nakład pracy studenta związany z zajęciami wymagającymi
bezpośredniego udziału nauczyciela
135
5
Nakład pracy studenta związany z zajęciami o charakterze praktycznym
Łącznie (godziny kontaktowe z nauczycielem i samodzielna praca)
105
205
4
10
Metody weryfikacji efektu kształcenia
Formujące
Nr efektu
kształcenia
(np. wejściówka, obserwacja pracy studenta
w trakcie zajęć, ocena zdolności
do samodzielnej pracy….)
Podsumowujące
(np. egzamin praktyczny, teoretyczny,
kolokwium…)
Kolokwium, egzamin końcowy
Egzamin końcowy
E_W01-W03
E_W04
E_U01-U02
E_U03
E_U04
E_U05-U06
E_K01-K03
Obserwacja pracy studenta w trakcie zajęć
Obserwacja pracy studenta w trakcie zajęć
Obserwacja pracy studenta w trakcie zajęć
Data
opracowania
programu
4.03.2013
Kolokwium
Egzamin końcowy
Kolokwium, egzamin końcowy
Obserwacja pracy studenta w trakcie zajęć
Program opracował
Eliza KwiatkowskaBorowczyk