Techniki diagnostyki molekularnej - Współczesne metody analityki z

załącznik do zarządzenia Rektora UG nr 78/R/11
Nazwa przedmiotu
Techniki diagnostyki molekularnej
Kod ECTS
Uzupełnia pracownik toku studiów, według ustalonego w UG wzoru
Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot
Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG-GUMed
Studia
kierunek
Studia podyplomowe
stopień
Nie dotyczy
tryb
podyplomowe
specjalność
Nie dotyczy
specjalizacja
Nie dotyczy
Nazwisko osoby prowadzącej (osób prowadzących)
Joanna Nakonieczna, Mariusz Grinholc
Formy zajęć, sposób ich realizacji i przypisana im liczba godzin
Liczba punktów ECTS
A. Formy zajęć
• wykład
• ćwiczenia laboratoryjne
6
B. Sposób realizacji
• zajęcia w sali dydaktycznej
C. Liczba godzin
Wykład 15 godzin
Ćwiczenia laboratoryjne 10 godzin
Cykl dydaktyczny
2012/2013 semestr letni
Status przedmiotu
• obowiązkowy
Język wykładowy
polski
Metody dydaktyczne
• wykład z prezentacją multimedialną
• ćwiczenia laboratoryjne: wykonywanie doświadczeń
Forma i sposób zaliczenia oraz podstawowe kryteria oceny lub wymagania egzaminacyjne
A. Sposób zaliczenia
• egzamin
• zaliczenie z oceną
B. Formy zaliczenia
• egzamin pisemny: testowy i z pytaniami otwartymi
•
W przypadku ćwiczeń laboratoryjnych formę zaliczenia stanowi wykonanie zaplanowanych w ramach ćwiczeń badań,
zaprezentowanie uzyskanych wyników w formie sprawozdania
pisemnego oraz wykonywanie określonych czynności
laboratoryjnych.
• ustalenie oceny zaliczeniowej na podstawie ocen cząstkowych
otrzymywanych w trakcie trwania semestru.
C. Podstawowe kryteria
•
Egzamin obejmuje treści wskazane w sylabusie w polu „Treści
programowe”. Termin I egzaminu oraz termin poprawkowy –
egzamin z pytaniami testowymi i otwartymi. Normę zaliczenia stanowi wskaźnik procentowy zawarty w Regulaminie Studiów UG.
Ocena końcowa z egzaminu będzie średnią ocen uzyskanych z
poszczególnych zakresów wiedzy. Normą zaliczenia każdego efektu kształcenia jest udzielenie poprawnej odpowiedzi na minimum
50% pytań obejmujących poszczególne efekty uczenia się. Pytania
egzaminacyjne obejmują wszystkie efekty wskazane w sylabusie w
polu „Efekty uczenia się”.
•
Kryteria oceny z wykonania pracy zaliczeniowej stanowi poprawne wykonanie przewidzianych ćwiczeń. Wynik ćwiczenia musi zostać zaprezentowany przez studenta w formie pisemnej w po-
staci sprawozdania (pierwsza ocena cząstkowa, 50% oceny końcowej). Kolejną ocenę cząstkową student otrzymuje za poprawne wykonanie określonej pracy praktycznej (umiejętność zachowania zasad bezpieczeństwa i higieny pracy; umiejętność postępowania z
materiałem potencjalnie zakaźnym; poprawne wykonanie analizy
materiału genetycznego za pomocą przewidzianych w ramach zajęć
metod, postępowanie z odpadami medycznymi, 50% oceny końcowej)
Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymogami wstępnymi
A. Wymagania formalne: brak
B. Wymagania wstępne: podstawowe informacje z zakresu nauk przyrodniczych (biologia, chemia, ochrona środowiska)
Cele przedmiotu
Celem wykładu jest zapoznanie studentów z podstawami wybranych technik wykorzystywanych w diagnostyce molekularnej,
zarówno w laboratoriach badawczych jak i rutynowo wykonujących analizy oparte o badanie kwasów nukleinowych. W czasie
kursu przedstawiane będą zasady działania metod poparte przykładami konkretnych analiz.
Celem ćwiczeń laboratoryjnych jest zapoznanie studentów z praktycznym aspektem technik wykorzystywanych w diagnostyce
molekularnej, w oparciu o przeprowadzenie konkretnych analiz.
Treści programowe
A. Problematyka wykładu
Wykład obejmuje treści z zakresu wykorzystania technik opartych o analizę kwasów nukleinowych w celu charakterystyki i identyfikacji patogenów chorób zakaźnych, chorób uwarunkowanych genetycznie, nowotworów (PCR i inne metody
oparte na amplifikacji materiału genetycznego, mikromacierze, sekwencjonowanie). Ponadto, wykład zawiera treści
związane z informacjami na temat współczesnych trendów w rozwoju diagnostyki molekularnej, jej powiązań z innymi
dziedzinami nauki, głównie medycyną, biologią molekularną. W czasie wykładów wskazuje się na praktyczny aspekt
diagnostyki molekularnej w diagnozowaniu i leczeniu konkretnego pacjenta. W czasie wykładu przedstawiane są informacje dotyczące dostępnych na rynku komercyjnych rozwiązań diagnostycznych, platform sprzętowych i rozwiązań
technologicznych. Treści programowe obejmują przedstawienie możliwości korzystanie z literaturowych i biologicznych
baz danych dostępnych online.
B. Problematyka ćwiczeń laboratoryjnych
Treści programowe ćwiczeń laboratoryjnych obejmują poznanie technik biologii molekularnej stosowanych w diagnostyce opierającej się o analizę materiału genetycznego (ludzkiego, mikrobiologicznego). Ponadto, ćwiczenia laboratoryjne
obejmują znajomość oceny jakości materiału genetycznego, jego przydatności do wykonania określonych analiz. Ważnym elementem ćwiczeń jest nauka pracy w jałowych warunkach i zdolność samodzielnej organizacji miejsca i czasu
pracy.
Wykaz literatury
A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć (zdania egzaminu):
A.1. wykorzystywana podczas zajęć
Analiza DNA. Teoria i praktyka. Pod redakcją Ryszarda Słomskiego. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w
Poznaniu (2008)
A.2. studiowana samodzielnie przez studenta
Badania Molekularne w Medycynie, Elementy Genetyki Klinicznej. Pod redakcją Jerzego Bala, Wydawnictwo Naukowe
PWN (2006)
B. Literatura uzupełniająca
internetowe bazy danych typu Medline
SEK_W01
ma uporządkowaną i pogłębioną wiedzę w dziedzinie
nauk ścisłych i dyscyplin
naukowych chemii, biotechnologii i ochrony środowiska oraz dyscyplin
pokrewnych, w szczególno-
Wiedza
Zna techniki stosowane w analizie materiału genetycznego.
Potrafi wyjaśnić zasadę działania technik diagnostycznych opartych na analizie materiału genetycznego.
Zna szczegóły budowy urządzeń wykorzystywanych w analizie materiału genetycznego.
Potrafił wskazać kierunki rozwoju technik diagnostycznych opartych o analizę kwasów nukleinowych.
ści w zakresie stosowania
metod analitycznych w tych
dyscyplinach
SEK_W04
zna szczegóły budowy i
działania aparatury oraz
urządzeń praktycznie stosowanych w analityce i
diagnostyce molekularnej
SEK_W05
ma pogłębioną wiedzę o
aktualnych
kierunkach
rozwoju i najnowszych
odkryciach w zakresie analityki i diagnostyki molekularnej
SEK_U03
potrafi znajdować niezbędne informacje w literaturze
fachowej, bazach danych i
innych źródłach, zna czasopisma naukowe podstawowe z zakresu analityki i
diagnostyki molekularnej
SEK_U05
potrafi przedstawić wyniki
badań z zakresu analityki i
diagnostyki molekularnej w
postaci samodzielnie przygotowanego raportu (sprawozdania) zawierającego
opis, cel pracy, przyjętą
metodologię, wyniki, ich
interpretację oraz znaczenie na tle innych podobnych
badań
SEK_K01
rozumie potrzebę uczenia
się przez całe życie, potrafi
inspirować proces uczenia
się innych osób
SEK_K03
rozumie potrzebę samodzielnego
wyszukiwania
informacji w literaturze
naukowej oraz czasopismach
popularnonaukowych
SEK_K04
Wykazuje
odpowiedzialność za podejmowane inicjatywy badań, eksperymentów lub obserwacji; ma
świadomość odpowiedzialności za społeczne aspekty
praktycznego
stosowania
zdobytej wiedzy i umiejętności
Kontakt
[email protected]
Umiejętności
Planuje przeprowadzenie doświadczenia w przestrzeni laboratoryjnej, zgodnie z programem wyznaczonym przez prowadzącego, organizuje miejsce pracy, przestrzega zasad bhp.
Przeszukuje literaturowe bazy danych z zakresu studiowanej dyscypliny naukowej.
Potrafi samodzielnie sporządzić sprawozdanie z przeprowadzonych badań materiału genetycznego
oraz przedstawić interpretację uzyskanego wyniku.
Kompetencje społeczne (postawy)
Rozumie konieczność ustawicznego kształcenia w oparciu o najnowsze dane literaturowe.
Mając świadomość zagrożeń pracy z materiałem potencjalnie zakaźnym oraz mając świadomość
następstw pracy z materiałem genetycznym (manipulacji genetycznych), wykazuje odpowiedzialność za działania związane z prowadzeniem badań w tym zakresie.