Diagnostyka Mikrobiologiczna

Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
Diagnostyka Mikrobiologiczna
1. Metryczka
Nazwa Wydziału:
WYDZIAŁ FARMACEUTYCZNY
Z ODDZIAŁEM MEDYCYNY LABORATORYJNEJ
ANALITYKA MEDYCZNA, STUDIA JEDNOLITE
Program kształcenia:
MAGISTERSKIE, STACJONARNE I NIESTACJONARNE
Rok akademicki:
2016/2017
Nazwa modułu/przedmiotu:
DIAGNOSTYKA MIKROBIOLOGICZNA
Kod przedmiotu:
am_s_s0_fk
Jednostka/i prowadząca/e kształcenie:
ZAKŁAD MIKROBIOLOGII FARMACEUTYCZNEJ,
KATEDRA I ZAKŁAD MIKROBIOLOGII LEKARSKIEJ
Kierownik jednostki/jednostek:
PROF. DR HAB. STEFAN TYSKI
PROF. DR HAB. GRAŻYNA MŁYNARCZYK
Rok studiów:
IV
Semestr studiów:
VII
Typ modułu/przedmiotu:
PRZEDMIOT FAKULTATYWNY
Prof. dr hab. Stefan Tyski, dr Anna Pietruczuk-Padzik, prof. dr hab.
Grażyna Młynarczyk,
dr Maciej Przybylski, prof. dr hab. Stanisława TylewskaWierzbanowska, prof. dr hab. Ewa Augustynowicz-Kopeć,
Osoby prowadzące:
prof. dr hab. Bogumiła Litwińska, dr hab. Tomasz Dzieciątkowski,
dr Piotr Leszczyński, dr Beata Sokół-Leszczyńska, dr Xenia
Szymanek, dr Marcin Bątkowski, dr Anna Majewska, mgr Szymon
Walter de Walthoffen, mgr Paulina Machura
Erasmus TAK/NIE:
NIE
Osoba odpowiedzialna za sylabus:
DR ANNA PIETRUCZUK-PADZIK
Liczba punktów ECTS:
2
Strona 1 z 6
Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
2. Cele kształcenia
1. Rozszerzenie wiadomości dotyczących drobnoustrojów chorobotwórczych oraz nowoczesnych,
często unikatowych metod diagnostyki mikrobiologicznej.
2. Zapoznanie studentów z nowymi drobnoustrojami chorobotwórczymi i wywoływanymi przez nie
chorobami.
3. Rozszerzenie wiadomości o zakażeniach szpitalnych (zakładowych) i ich diagnozowaniu,
profilaktyce, epidemiologii i leczeniu.
4. Rozszerzenie wiadomości na temat nowych mechanizmów lekooporności drobnoustrojów i metod
ich wykrywania.
3. Wymagania wstępne
1. Student zna podstawy mikrobiologii ogólnej i lekarskiej oraz zasady pracy w laboratorium
diagnostyczno-mikrobiologicznym (zakres materiału III roku studiów).
4. Przedmiotowe efekty kształcenia
Lista efektów kształcenia
Symbol
przedmiotowego efektu
kształcenia
Treść przedmiotowego efektu kształcenia
W1
zna podstawy metodyczne badań analitycznych
( w tym: rozdzielczych, fotometrycznych, spektrometrycznych,
elektrochemicznych, immunochemicznych, analizy enzymów i
substratów, kwasów nukleinowych) i ich zastosowanie w
medycynie laboratoryjnej w zakresie wyspecjalizowanych metod
biologii molekularnej stosowanych w diagnostyce
mikrobiologicznej
W2
zna zasady funkcjonowania aparatury stosowanej w medycynie
laboratoryjnej w zakresie znajomości zautomatyzowanej
aparatury stosowanej w diagnostyce mikrobiologicznej
W3
zna wskazania do poszerzenia diagnostyki laboratoryjnej w
wybranych stanach chorobowych oraz zalecane testy
specjalistyczne w zakresie specjalistycznych badań
mikrobiologicznych
W4
zna patogenezę, patomechanizm, epidemiologię, główne objawy
kliniczne, metody diagnostyki i zasady leczenia najważniejszych
chorób wywołanych przez bakterie, grzyby i wirusy, również w
przypadku komplikacji medycznych i w przypadku nowych
czynników zakaźnych
W5
W6
zna teoretyczne i praktyczne aspekty diagnostyki
mikrobiologicznej oraz jej znaczenie dla rozpoznawania
zakażeń, prognozowania przebiegu oraz oceny lekowrażliwości
w zakresie chorób infekcyjnych, również w przypadku
komplikacji medycznych i w przypadku nowych czynników
zakaźnych, a także w zakresie badań nad lekoopornością
nowych patogenów i nowych mechanizmów oporności
zna diagnostykę serologiczną chorób infekcyjnych oraz jej
znaczenie dla rozpoznawania, różnicowania, monitorowania
przebiegu choroby i oceny efektów leczenia w zakresie
rozszerzonym, w porównaniu z III r. studiów
Strona 2 z 6
Odniesienie do efektu
kierunkowego (numer)
K_W11
M2_W03
M2_W07
K_W16
M2_W07
K_W21
M2_W03
K_W30
M2_W03
M2_W07
K_W31
M2_W03
M2_W07
K_W33
M2_W03
M2_W07
Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
W7
W8
zna metody oceny czynności układu immunologicznego we
wrodzonych i nabytych zaburzeniach odporności i potrafi je
wykorzystać w interpretacji badań w przypadku chorób
infekcyjnych
zna zasady doboru, wykonywania i organizacji badań
przesiewowych w profilaktyce i leczeniu w zakresie dotyczącym
badań mikrobiologicznych i wybranych chorób infekcyjnych
K_W36
M2_W03
M2_W07
K_W46
M2_W08
M2_W09
K_U04
U1
potrafi skutecznie komunikować się ze współpracownikami,
innymi pracownikami ochrony zdrowia i odbiorcami wyników
w specyficznych warunkach pracowni diagnostycznomikrobiologicznych różnej wielkości i o różnych profilach
specjalistycznych
M2_U01
M2_U03
M2_U04
M2_U09
U2
potrafi pobierać materiał do badań, ocenić jego przydatność,
przechowywać i przygotowywać do analizy w zakresie materiału
do badań mikrobiologicznych, również specjalistycznych i
nietypowych
K_U05
M2_U01
M2_U06
K_U24
M2_U01
U3
potrafi uzyskiwać wiarygodne wyniki badań cytogenetycznych i
molekularnych (w tym: analiza kariotypu, genów i czynników
infekcyjnych) oraz profesjonalnie opracować i interpretować
wyniki tych analiz w zakresie chorób infekcyjnych
M2_U02
M2_U04
M2_U05
M2_U06
M2_U07
M2_U08
5. Formy prowadzonych zajęć
Forma
Liczba godzin
Liczba grup
Minimalna liczba osób
w grupie
Wykład
30
1
nieobowiązkowe
Seminarium
-
-
nieobowiązkowe
Ćwiczenia
30
6
nieobowiązkowe
6. Tematy zajęć i treści kształcenia
W1-Wykład 1 - Diagnostyka laboratoryjna zakażeń wirusowych w rozszerzonym zakresie. W1, W2
W2-Wykład 2 - Metody diagnostyczne oparte na wykrywaniu kwasów nukleinowych w rozszerzonym
zakresie. W1
W3-Wykład 3 - Diagnostyka laboratoryjna zakażeń grzybiczych w rozszerzonym zakresie. W2
W4-Wykład 4 - Walidacja metod biologii molekularnej w mikrobiologii. W1
W5-Wykład 5 - Diagnostyka wirusowych zapaleń wątroby oraz zakażeń HIV. W7
Strona 3 z 6
Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
W6-Wykład 6 - Współpraca laboratorium mikrobiologicznego z zespołem zakażeń szpitalnych. Rola
mikrobiologa w kontroli zakażeń szpitalnych. W5, W8
W7-Wykład 7 - Ogólne założenia diagnostyki bakteriologicznej i wykorzystywane metody. Założenia i
metody stosowane w diagnostyce serologicznej zakażeń. Metody molekularne w dochodzeniach
epidemiologicznych. Genetyczne różnicowanie szczepów drobnoustrojów (całość w rozszerzonym
zakresie). W1, W3, W6, W7
W8-Wykład 8 - Zakażenia przenoszone przez kleszcze w Polsce – szczegółowe informacje nt. borelioz i
innych krętkowic oraz informacje o riketsjach – w tym nowych gatunkach. W4, W8
W9-Wykład 9 - Gruźlica i inne mykobakteriozy – epidemiologia, diagnostyka, problemy lekooporności. W1,
W4, W8
W10-Wykład 10 - Wybrane zakażenia wirusowe – w tym centralnego układu nerwowego, epidemiologia
zakażeń i specjalistyczna diagnostyka.W1, W4
C1-C2 Ćwiczenie 1-2 - Izolacja całogenomowego DNA adenowirusów i EBV. PCR w czasie rzeczywistym
w diagnozowaniu adenowirusowych i EBV zakażeń człowieka. W1, U3
C3-C6 Ćwiczenie 3-6 - Diagnostyka mikrobiologiczna zakażeń układu moczowego, zakażeń skóry i ran,
zakażeń układowych, zakażeń grzybiczych, prowadzona w laboratorium szpitala klinicznego z użyciem
zautomatyzowanych systemów. W2, W3, W5, U2, U3
C7-C8 Ćwiczenie 7-8 - Izolacja całogenomowego bakteryjnego DNA. PCR w czasie rzeczywistym i analiza
krzywych topnienia sond w identyfikacji patogenów bakteryjnych i wirusowych. W1, U3
C9-Ćwiczenie 9 - Diagnostyka zakażeń bakteryjnych oka. W3, W6, U2, U3
C10-Ćwiczenie 10 - Podsumowanie zajęć, odczytanie i analiza wyników z pracy laboratoryjnej. W3, U1
7. Sposoby weryfikacji efektów kształcenia
Symbol
przedmiotowego
efektu
kształcenia
Symbole form
prowadzonych zajęć
Sposoby weryfikacji efektu
kształcenia
W1-W8, U1-U3
W1_W10, C1 – C10
Kolokwium ustne
Kryterium zaliczenia
60% poprawnych odpowiedzi
8. Kryteria oceniania
Forma zaliczenia przedmiotu: kolokwium ustne - zaliczenie z oceną
Ocena
kryteria
2,0 (ndst)
< 60% poprawnych odpowiedzi
3,0 (dost)
60-70% poprawnych odpowiedzi
3,5 (ddb)
71-77% poprawnych odpowiedzi
4,0 (db)
78-83% poprawnych odpowiedzi
4,5 (pdb)
84-89% poprawnych odpowiedzi
5,0 (bdb)
90-100% poprawnych odpowiedzi
Strona 4 z 6
Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
9. Literatura
Literatura obowiązkowa:
1. Hryniewicz W., Mészáros J. [red]: Antybiotyki w profilaktyce i leczeniu zakażeń; Wyd. Lekarskie
PZWL, Warszawa 2001.
2. Kayser F.H., Bienz K.A., Eckert J., Zinkernagel R.M.: Mikrobiologia lekarska. Wyd. Lek. PZWL,
Warszawa 2007.
3. Heczko P.B., Wróblewska M., Pietrzyk A. [red.]: Mikrobiologia lekarska. Wydawnictwo Lekarskie
PZWL, Warszawa 2014.
4. Szewczyk E. [red]: Diagnostyka bakteriologiczna. Wydanie II zmienione, Wyd. Naukowe PWN,
Warszawa 2013.
5. Maciąg I. E., Starościak B. J. [red.]: Mikrobiologia praktyczna. Materiały do ćwiczeń dla studentów
Wydziału Farmaceutycznego i Oddziału Analityki Medycznej. Oficyna Wydawnicza WUM,
Warszawa 2010
6. Wolinowska R.: Metody molekularne w diagnostyce mikrobiologicznej. Oficyna Wydawnicza
WUM, Warszawa 2010
7. Materiały internetowe Krajowego Ośrodka Referencyjnego ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów
(www.korld.edu.pl): Rekomendacje doboru testów do oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki
i chemioterapeutyki.
Literatura uzupełniająca:
1. Baj J., Markiewicz Z. [red.]: Biologia molekularna bakterii. Wyd. Naukowe PWN, Warszawa 2006.
2. Gołąb J., Jakóbisiak M., Lasek W., Stokłosa T. [red]: Immunologia; Wyd. Naukowe PWN,
Warszawa 2012.
3. Krawczyk B., Kur J. Diagnostyka molekularna w mikrobiologii. Wyd. Politechniki Gdańskiej,
Gdańsk 2008.
4. Magdzik W., Naruszewicz-Lesiuk D., Zieliński A. [red.]: Choroby zakaźne i pasożytnicze epidemiologia i profilaktyka. Alfa-medica press Bielsko-Biała 2007.
5. Magdzik W., Naruszewicz-Lesiuk D., Zieliński A. [red]: Wakcynologia. Wyd.II. Alfa-medica press,
Bielsko-Biała 2007.
6. Murray P. R., Rosenthal K. S., Pfaller M. A.: Mikrobiologia. Wyd. Elsevier – Urban&Partner,
Wrocław 2011.
7. Piekarowicz A.: Podstawy wirusologii molekularnej. Wyd. Naukowe PWN, Warszawa 2004.
8. Tyski S.: Antyseptyka. W: Zakażenia szpitalne. Podręcznik dla zespołów kontroli zakażeń. Red.
Heczko P.B., Wójkowska-Mach J., Wyd. Lekarskie PZWL, Warszawa 2009, str. 184-202.
9. Krzyściak P., Skóra M., Macura A. B. : Atlas grzybów chorobotwórczych człowieka, MedPharm
Polska, Wrocław 2011.
10. Kalkulacja punktów ECTS
Forma aktywności
Liczba godzin
Liczba punktów ECTS
Godziny kontaktowe z nauczycielem akademickim:
Wykład
30
1
Seminarium
-
-
Ćwiczenia
30
1
Samodzielna praca studenta:
Przygotowanie studenta do zajęć
15
Przygotowanie studenta do zaliczeń
15
Inne (jakie?)
90
Razem
Strona 5 z 6
2
Załącznik nr 1 do zarządzenia nr 54/2015 Rektora WUM z dnia 14.07.2015 r.
Załącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia
11. Informacje dodatkowe
Zakład Mikrobiologii Farmaceutycznej http://zmf.wum.edu.pl
Warszawa, ul. Oczki 3, tel. 22 628-08-22
Przy Zakładzie Mikrobiologii Farmaceutycznej działa Koło Naukowe, zarejestrowane od dn. 25.01.2005 r.
Członkowie Koła w przyszłości będą mieli pierwszeństwo w podjęciu w Zakładzie prac magisterskich.
Informacje o tematach realizowanych w ramach działalności Koła dostępne są na stronie internetowej ZMF.
Podpis Kierownika Jednostki
Podpis osoby odpowiedzialnej za sylabus
Strona 6 z 6