Przejścia fazowe - WFiIS

Transkrypt

Przejścia fazowe - WFiIS
Uporządkowanie molekularne
Przejścia fazowe
Zwykle przejście stanu o większym uporządkowaniu
do stanu o mniejszym uporządkowaniu
1. Wprowadzenie.
2. Przejście helisa - łańcuch nieuporządkowany.
3. Przejście globina - łańcuch nieuporządkowany.
4. Krystalizacja.
5. Separacja faz (ciecz-ciecz).
Mogą występować w równowadze
stabilnej
niestabilnej
Diagram fazowy
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Stany materii:
Funkcje termodynamiczne
korzystając z I-go i II-go prawa termodynamiki
dU = dQ + dW
Krystaliczna
(regularna,
nieściśliwa sieć)
Ciekła
(nieregularna,
nieściśliwa sieć)
Gazowa
(nieregularna,
ściśliwa sieć)
dS / dt ≥ 0
dS ≥ dQ/T
dG = -SdT + VdP + µ1dN1 + µ2dN2 + ... + µidNi
Amorficzne ciała
stałe
Gumy
Szkła
dA = -SdT - PdV + µ1dN1 + µ2dN2 + ... + µidNi
dU = TdS - PdV + µ1dN1 + µ2dN2 + ... + µidNi
Ciekłe kryształy
Żele
w biologii
Květoslava Burda, AGH WFiIS
dH = TdS + VdP + µ1dN1 + µ2dN2 + ... + µidNi
U – energia wewnętrzna
S – entropia
H – entalpia (H = U + PV)
G – energia swobodna Gibbs’a (H – TS), w chemii ozn. F
A – energia swobodna Helmholtz’a (U - TS), w fizyce ozn. F
T – temperatura
W – praca wykonana nad układem, Q – dostarczone ciepło, V – objetość, P – ciśnienie
µ – potecjał chemiczny, N – liczba molekuł
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Przejście fazowe pierwszego rodzaju (rzędu), gdy nieciągła pierwsza pochodna
energii swobodnej (istnienie ciepła ukrytego !). Przejścia: ciało stałe / ciecz / gaz.
Przejście fazowe ciągłe (np.drugiego rodzaju) (rzędu), gdy nieciągła druga (3-cia,
4-ta pochodna) pochodna energii swobodnej (klasyfikacja Ehrenfesta, nie ma ciepła
ukrytego ! ). Przejścia: ferromagnetyczne i nadciekłe, występowanie punktów
krytycznych.
Przykłady ciągłych przejść fazowych :
A
ρ (ciecz) − ρ ( gaz ) = B(TC − T ) β
Przejścia fazowe nieskończonego rzędu, np. kwantowe przejścia fazowe w
dwuwymiarowym gazie elektronowym.
Np.
Cv – ciepło właściwe
H
1-wszego rzędu
Dla układu gaz – ciecz parametr gęstości zmienia się z charakterystyczną
temperaturą krytyczną:
Fluktuacje gęstości mogą być oszacowane ilościowo względem parametru
ściśliwości (κ):
ciągłe
H
κ =−
∆H
1 ⎛ ∂V ⎞
−ν
⎜
⎟ = E (T − Tc )
V ⎝ ∂P ⎠
dla T > Tc (E-stała)
CV ~ (T-Tc)-α
– zależy od rzędu
przejścia i symetrii
Tc
Cv
T
Tc
Cv
B
T
Napięcie powierzchniowe (γ) pomiędzy dwoma fazami ciekłymi dąży do zera
w punkcie krytycznym temperatury, chociaż szerokość interfejsu oddziaływania
rośnie nieskończenie:
⎛ T⎞
γ = γ 0 ⎜⎜1 − ⎟⎟
⎝ Tc ⎠
α = -0.013±0.003
dla nadciekłego przejścia
α ~ +0.110
dla ferromagnetycznego 3D
Tc
T
Tc
T
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Funkcja stanu F opisuje równowagę fazową przy niezależnie zmieniających się
parametrach.
Np. dla idealnego gazu zależy od czterech parametrów : F(V, n, P, T) = 0
Równanie to przyjmuje postać prawa Van der Waalsa (R- stała gazowa):
PV
−1 = 0
nRT
µ
γc – średnie napięcie powierzchniowe
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Parametr uporządkowania
0 dla układu nieuporządkowanego
Skończona wartość dla układu uporządkowanego
Zmiana parametru uporządkowania względem temperatury wskazuje na charakter
przejścia. W układach biologicznych, uwzględnia on gęstość próbki, objętość próbki,
stopień orientacji molekularnej.
Różne źródła ciągłych przejść fazowych:
Tylko trzy parametry niezależne są potrzebne do opisu gazu idealnego.
Reguła fazowa Gibbs’a (użyteczna dla wieloskładnikowych układów
koloidalnych):
- skończone rozmiary (małe micele lipidowe i ich koncemtracja krytyczna)
- układy nieejdnorodne (zanieczyszczenia poszerzają przejście fazowe)
- czasy równowagi są długie w porównaniu z czasem obserwacji (przejścia
w polimerach)
f+p=c+2
f – liczba niezależnych zmiennych
p – liczba współistniejących faz
c – liczba składowych
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Przejście helisa – łańcuch nieuporządkowany
(węglowodany, białka, kwasy nukleinowe)
Funkcja partycji (Z) dla przejścia helisa – łańcuch nieuporządkowany:
n
Z = 1 + ∑ Ω kσs k
Zmiany temperatury, roztworu, jego pH, itp.
k =1
Liczba permutacji Ωk wynosi: n - k+1
Model Zippera
k jednostek
s – stała równowagi dla tworzenia się nowej helisy na końcu już istniejącej
krok propagacji
h – sekwencja helisalna
c– sekwencja nieuporządkowana
σ – stała równowagi tworzenia się nowej helisy na ruchomym łańcuchu c
krok nukleacji
s=
...cchhhhcc...
...cchhhccc...
σ=
...cchcc...
...ccccc...
n jednostek
Energia swobodna: F / kT = -lnZ
Prawdopodobieństwo znalezienia stanu o energii Ei:
Wartości średnie:
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Frakcja helikalna (θ):
Ωk – liczba sposobów pojawienia się
k - jednostek helisalnych
w łańcuchu n - jednostkowym
Ei = ∑ ρ ( Ei ) Ei =
∑e
Květoslava Burda, AGH WFiIS
θ=
Model Zipper’a przewiduje:
k
n
− Ei / kT
ρ ( Ei ) =
e − Ei / kT
Z
Ei
Z
Zimm-Bragg (Ising) model – uwzględnia fluktuacje długich łąńcuchów
białkowych
θ=
1 ∂ ln Z
n ∂ ln s
Dodatnia zmiana energii swobodnej (∆f) - preferowane fragmenty helisy
(uporządkowanie)
Zgodność modelu Zipper’a dla krótkich łąńcuchów polipeptydowych.
s ≡ exp(− ∆f / T )
σ ≡ exp(−2∆f s / T )
Uwaga:
Problem dla długich łańcuchów, kiedy
ważne są fluktuacje.
∆f – zmiana energii swobodnej przy zmianie kolejnej jednostki łańcucha na helisę
∆fs – zmiana energii swobodnej przy zmianie nowej jednostki łańcucha na helisę
W biopolimerach naturalnie występujących σ jest rzędu 10-3 – 10-4.
σ=1
- brak kooperatywności
σ << 1 – silna kooperatywność
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Zimm and Bragg(1959) J.Chem.Phys.31,526
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Model Zimma-Bragga uwzględnia wiązania wodorowe konieczne do tworzenia
struktur helikalnych i dobrze oddaje termodynamiczne zachowanie przejść fazowych.
Helikalność
θ
Diagram fazowy uporządkowania łańcucha helikalnego dla σ = 10-4.
∆s2
1
Wysoka kooperatywność
Niska kooperatywność
0
∆s1
s (prawdopodobieństwo
propagacji)
W pojedynczej nici homopolimeru przejście helisa – łańcuch nieuporzadkowany zachodzi
w bardzo wąskim zakresie temperatur. ∆T maleje wraz z parametrem kooperatywności σ.
Średnia długość helisy i łańcucha nieuporządkowanego jest stała niezależnie od długości polimeru.
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Zimm and Bragg(1959) J.Chem.Phys.31,526
Przejście globina - łańcuch nieuporządkowany
Teoria Landau’a przewiduje brak przejścia fazowego
helisa – łańcuch nieuporządkowany
w jednowymiarowym układzie ze względu na zbyt małą energię,
gdyż dominują efekty brzegowe (ruchliwość końców polimerów).
R0
R
Obniżenie temperatury,
własności roztworu,
wzrost ciśnienia
Nie ma termodynamicznych przejść fazowych w jednowymiarowych układach.
W przypadku podwójnej helisy rośnie kooperatywność przejścia fazowego,
ponieważ tremodynamicznie preferowane są krótkie pętle, będące przekrojem
podwójnej helisy. Obserwowane są prawdziwe przejścia fazowe.
Łańcuch
nieuporządkowany
Parametr powiększenia α = R / R0:
globina
α < 1 (zły rozpuszczalnik)
α > 1 (dobry rozpuszczalnik)
Model Zimma-Bragga dobrze opisuje też powstawanie β-helis przy uwzględnieniu
efektów ładunku.
F (α ) = U (α ) − TS (α )
Energia swobodna
przejścia fazowego
globina – łańcuch nieuporządkowany
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Energia
wewnętrzna
Wkład do energii
pochodzący z entropii
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Korzystając z przybliżenia Van der Waalsa dla gazu doskonałego, energię
Wewnętrzną można zapisać w funkcji potęgowej gęstości monomerów n:
Korzystając z zależności: R0 = l N1/2, gdzie l – długość monomeru,
N –liczba monomerów w łańcuchu:
U = VkT (n 2 B + n 3C + ...)
⎡ BN 1/ 2
C ⎤
U (α ) ≈ kT ⎢ 3 3 + 6 6 ⎥
α l ⎦
⎣α l
B i C – stałe związane z siłą oddziaływań dwu- i trzy- ciałowych odpowiednio
B < 0, oddziaływania przyciągające
B > 0, oddziaływania odpychające
Gęstość monomeru n jest rzędu stopnia polimeryzacji łąńcucha N podzielonego
przez jego rozmiar R: n = N / R3
3
⎡ ⎛ N ⎞2
⎛N ⎞ ⎤
U ≈ R kT ⎢ B⎜ 3 ⎟ + C ⎜ 3 ⎟ ⎥
⎝ R ⎠ ⎦⎥
⎣⎢ ⎝ R ⎠
3
Wkład entropii do energii swobodnej:
Fentr (α ) ≈ kT (α 2 + α −2 )
Minimalizując energię swobodną wyrażoną:
F (α ) = Fentr (α ) + U (α )
otrzymujemy diagram fazowy dla łąncuchów polimerowych.
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Zależność energii swobodnej ruchliwego polimeru w funkcji stopnia rozwinięcia
łańcucha (parametru powiększenia).
Energia
swobodna
Rozciągający się
łańcuch
Parametr
powiększenia
Ruchliwy łańcuch
(przejście drugiego rzędu)
α
Sztywny łańcuch
(przejście 1-wszego rzędu
Zwinięta
globina
0
α
Obniżona
temperatura
1
Duże neutralne globiny składają się z gęstego rdzenia i cienkiej, mniej gęstej
powierzchni. W stanie równowagi, ciśnienie osmotyczne wewnątrz jądra globiny
wynosi 0.
Szerokość przejścia fazowego globina – łańcuch nieuporządkowany składający się
z N monomerów wynosi N-1/2 i staje się nieskończenie wąska dla N dążącego do
nieskończoności.
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Globiny o znacznej sztywności i umiarkowanej długości mogą tworzyć oddzielne
struktury.
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Krystalizacja
Zmiana entropii przy stałym ciśnieniu:
∆H
⎛ ∂G ⎞ ⎛ ∂G ⎞
∆S m = ⎜ s ⎟ − ⎜ l ⎟ =
⎝ ∂T ⎠ p ⎝ ∂T ⎠ p Tm
Przejście fazowe ciecz – ciało stałe jest znacznie bardziej skomplikowane niż
ciecz – ciecz. Jest to zawsze przejście pierwszego rzędu.
Temperaturę należy obniżyć, a w przypadku braku zanieczyszczenia próbka musi
być przechłodzona.
Energia swobodna nukleizacji:
Energia swobodna
Gibbsa
4
∆G (r ) = πr 3 ∆Gb + 4πr 2γ sl
3
∆Gb
Energia swobodna objętościowa
γ sl
Energia swobodna powierzchniowa
∆Gb
Zmiana energii swobodnej
fazy stałej
Udział składowej objętościowej:
r* =
Temperatura
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Bariera energii swobodnej jest związana z formowaniem się stabilnego jądra
i zależy od energii powierzchniowej:
16π 3 ⎛ Tm ⎞ 1
⎟⎟
γ sl ⎜⎜
2
3
⎝ ∆H m ⎠ ∆T
2
∆G* =
∆Gb ≈ −
∆H m
∆T
Tm
Minimalizując G(r) ze względu na promień kryształu r, otrzymujemy
promień krytyczny r*, dla którego przymuje energia swobodna maksimum:
∆T
Tm
(temperatura topnienia)
Zmiana energii swobodnej
fazy ciekłej
2γ slTm
∆H m ∆T
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Separacja faz ciecz-ciecz
(produkty żelowe, agregacja białek w soczewce oka,
separacja związków jonowych w błonach, morfologia błon biologicznych)
A
B
A+B
Zależność zmiany energii swobodnej od promienia krystalitu
∆G
powierzchniowa
całkowita
objętościowa
r*
Krystalizacja następuje
spontanicznie dla
krystalitów o promieniu
> r*.
Separacja faz stosowalna w przypadku: kolidów, polimerów, surfaktantów.
Zmiany energii swobodnej dla dwóch cieczy A i B:
Fmix = FA+ B − ( FA + FB )
promień
przed separacją faz
Prawdopodobieństwo kinetyki krystalizacji podlega
prawu Arrheniusa: jest proporcjonalne do exp(-∆G*/kT)
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS
po separacji faz
Prawo rozkładu Bolzmanna nazywane jest często prawem rozkładu Maxwella-Boltzmanna:
S = k ln W
-wewnętrzne stopnie swobody zaniedbane
-cząstki A i B oddziałują parami addytywnie (tylko energie najbliższych sąsiadów
są brane pod uwagę); energie oddziaływania: εAA, εBB, εAB
S - entropia makrostanu układu,
W - liczba mikrostanów, na jaką można zrealizować ten makrostan,
k - stała Boltzmanna.
-φA(B) frakcja objętościowa cząstek A lub B odpowiednio
S = −k ∑ pi ln pi
-fluktuacje koncentracji zaniedbane (przybliżenie średniego pola)
i
pi – prawdopodobieństwo obsadzenia stanu i przez molekułę A
Energia swobodna mieszania cieczy A i B w funkcji objętości frakcji
Energia
swobodna
mieszania
na jednostkę
sieci na kT
χ – parametr interakcji
χ = 2.5
Energia oddziaływania na miejsce sieciowe o zφA sąsiadach A i zφB sąsiadach B:
:
2
2
z⎛
+ φ ε BB + 2φ φ ε AB ⎞⎟
⎜φ
B
A
B
⎠
2 ⎝ A ε AA
Energia stanów rozdzielonych:
z⎛
+ φ ε BB ⎞⎟
⎜φ
B
⎠
2 ⎝ A ε AA
Dla χ = 0, χ = 1 fazy mieszają się
χ = 2.5 następuje separacja faz
χ=0
χ = 1.0
Różnica energetyczna związana z procesem mieszania:
U mix =
Objętość frakcji
Květoslava Burda, AGH WFiIS
φ +φ =1
Jeśli wszystkie stany są obsadzone:
A
2
z⎡ 2
⎤
+ (φ −φ )ε
φ
(
ε
−
)
φ
⎢
B
A
A AA
B BB + 2φ Aφ Bε AB ⎥⎦
2⎣
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Gdy faza mieszana ulega separacji na dwie współistniejące fazy:
B
Fsep =
i wprowadzajac parametr oddziaływania χ:
χ=
Założenia:
z
(2εAB − εAA − εBB )
2kT
energia mieszania wyraża się wzorem:
U mix = χφ AφB
Układy φ1 i φ2 współistnieją, gdy Fsep < F0,
F0- energia swobodna dla układu jednorodnej mieszaniny.
Np. Czysto odpychające oddziaływania prowadzą do powstania uporządkowanej fazy
W układach koloidalnych sztywnych sfer.
Korzystając z funkcji termodynamicznej F = U – TS znajdujemy wyrażenie na
całkowitą energię swobodną na separację faz mieszaniny:
Energia
swobodna
F0
Fmix
= φ A ln φ A + φB ln φB + χφ AφB
kT
Květoslava Burda, AGH WFiIS
φ0 − φ 2
φ −φ
Fmix (φ1 ) + 1 0 Fmix (φ2 )
φ1 − φ2
φ1 − φ2
Fsep
φ1
Květoslava Burda, AGH WFiIS
φ0
φ2
Objętość frakcji
Wielkość d2F / dφ2 wskazuje na stabilność układu rozdzielonych faz.
Definiuje linie spinoidalną dla procesu separacji faz.
Parametr
oddziaływania
niestabilna
metastabilna
stabilna
Kompozycja faz
Frakcja objętościowa dla mieszaniny
dwuskładnikowej
Np. przejście fazowe ciągłe dla procesu
separacji białek i wody w oku – powstawanie katarakty
Np.
Neutralne polimery
słabo mieszają się
w roztworach.
Wprowadzenie słabych
oddziaływań odpychających
prowadzi do efektów
obserwowalnych makroskopowo, wzmacnianych wysokim
stopniem polimeryzacji
łąńcucha.
Wysoki stopień dynamicznej
asymetrii prowadzi do obrazów morfologicznych zmieniających się z czasem.
W różnicowaniu tkankowym
te procesy są ważne.
Rolę parametru oddziaływania
przejmuje energia adhezji między
komórkami.
Kompatybilność poprawia się np.
ze wzrostem ładunku.
Tanaka, J Phys. Condensed Matter (2000) 12, R207-264
Květoslava Burda, AGH WFiIS
Květoslava Burda, AGH WFiIS

Podobne dokumenty