Pełna lista publikacji
Transkrypt
Pełna lista publikacji
Anna Wypijewska Zakład Biofizyki IFD Wydział Fizyki, Uniwersytet Warszawski ul. Żwirki i Wigury 93, 02-089 Warszawa, Polska Tel. kom.: +48 507 145 822 E-mail: [email protected] Warszawa, 6.12.2012 Załącznik 1 - PUBLIKACJE RECENZOWANE PUBLIKACJE W CZASOPISMACH: 1. Wypijewska A., Bojarska E., Lukaszewicz M., Stepinski J., Jemielity J., Davis R.E., Darzynkiewicz E., 7-methylguanosine diphosphate (m7GDP) is not hydrolyzed but strongly bound by Decapping Scavenger (DcpS) enzymes and potently inhibits their activity. Biochemistry 51, 8003-8013 (2012) 2. Wypijewska A., Bojarska E., Stepinski J., Jankowska-Anyszka M., Jemielity J., Davis R.E., Darzynkiewicz E., Structural requirements for Caenorhabditis elegans DcpS substrates based on fluorescence and HPLC enzyme kinetic studies. FEBS J. 277, 3003-3013 (2010); cytowano 1 raz 3. Wypijewska A., Galazka-Friedman J., Bauminger E.R., Wszolek Z.K., Schweitzer K.J., Dickson D.W., Jaklewicz A., Elbaum D., Friedman A., Iron and reactive oxygen species activity in parkinsonian substantia nigra. Parkinsonism and Related Disorders 16, 329-333 (2010); cytowano 18 razy 4. Guranowski A., Wojdyla A.M., Zimny J., Wypijewska A., Kowalska J., Jemielity J., Davis R.E., Bieganowski P., Dual activity of certain HIT-proteins: A. thaliana Hint4 and C. elegans DcpS act on adenosine 5’-phosphosulfate as hydrolases (forming AMP) and as phosphorylases (forming ADP). FEBS Letters 584, 93-98 (2010); cytowano 5 razy 5. Guranowski A., Wojdyla A.M., Zimny J., Wypijewska A., Kowalska J., Lukaszewicz M., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Jagiello A., Bieganowski P., Recognition of different nucleotidyl-derivatives as substrates of reactions catalyzed by various HIT-proteins. New J. Chem. 34, 888-893 (2010); cytowano 6 razy PUBLIKACJE KONFERENCYJNE: 1. Wypijewska A., Bojarska E., Stepinski J., Jankowska-Anyszka M., Davis R.E., Darzynkiewicz E., Novel ribose modified dinucleotide cap analogue: synthesis and hydrolytic susceptibility to scavenger decapping enzyme. Collection Symposium Series 10, 457-460 (2008) KOMUNIKATY KONFERENCYJNE: 1. Wnek K., Nowicka A., Kowalska J., Wypijewska A., Darzynkiewicz Z.M., Darzynkiewicz E., Jemielity J., Analogi difosforanu 7-metyloguanozyny jako inhibitory ludzkiego enzymu DcpS. 55. Zjazd PTChem i SITPChem, Białystok, Polska, 16-20.09.2012. 2. Surleac M., Wypijewska A., Jemielity J., Bojarska E., Darzynkiewicz E., Petrescu A.-J., Milac A.-L., Molecular modeling and docking offer structural insights into mRNA cap binding by C. elegans DcpS scavenger decapping enzyme. Annual International Meeting of the Romanian Society of Biochemistry and Molecular Biology, Bukareszt, Rumunia, 13-14.09.2012. 3. Wypijewska A., Nowicka A., Wnek K., Kowalska J., Ziemniak M., Lukaszewicz M., Bojarska E., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Selective inactivation of Decapping Scavenger (DcpS) enzyme by the diastereoisomeric cap analog with a sulphur atom. International Conference: Multi-Pole Approach to Structural Biology, Warszawa, Polska, 16-19.11.2011. 4. Wypijewska A., Wnek K., Nowicka A., Kulis M., Rydzik A. M., Lukaszewicz M., Bojarska E., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Toward novel DcpS inhibitors of enhanced binding affinity based on chemically modified m7GpppG by NH group. International Conference: Multi-Pole Approach to Structural Biology, Warszawa, Polska, 16-19.11.2011. 5. Wypijewska A., Bojarska E., Lukaszewicz M., Stepinski J., Kowalska J., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Skilled cap analogs report on DcpS enzyme structure and function. International Conference: Multi-Pole Approach to Structural Biology, Warszawa, Polska, 16-19.11.2011. 6. Wypijewska A., Wnek K., Nowicka A., Kowalska J., Bojarska E., Darzynkiewicz E., Jemielity J., Podatność boranofosforanowych analogów kapu na hydrolizę enzymatyczną katalizowaną przez C. elegans DcpS. 54. Zjazd PTChem i SITPChem, Lublin, Polska, 18-22.09.2011. 7. Wypijewska A., Nowicka A., Wnek K., Kowalska J., Kulis M., Bojarska E., Lukaszewicz M., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Searching for DcpS Enzyme Inhibitors Among Cap Analogs Modified In The Phosphate Chain. Workshop on Biomolecules and Nanostructures, Będlewo, Polska, 4-8.09.2011. 8. Wypijewska A., Bojarska E., Lukaszewicz M., Stepinski J., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Experimental physics’ resources for studying biological macromolecules; deep insight into DcpS enzymatic hydrolysis of short capped mRNAs. 8th European Biophysics Congress, EBSA, Budapeszt, Węgry, 2327.08.2011. 9. Wypijewska A., Bojarska E., Lukaszewicz M., Stepinski J., Jemielity J., Darzynkiewicz E., Fluorescence detection of enzyme-ligand interactions in the process of mRNA cap degradation by DcpS enzyme. Spectroscopy in the Biological Sciences of the XXI. Century - Intracellular Fluorescence Spectroscopy, Pecs, Węgry, 20-22.08.2011. 10. Wypijewska A., Bojarska E., Lukaszewicz M., Jemielity J., Bisaillon M., Darzynkiewicz E., HPLC facility upon identification of the enzymatic hydrolysis products. 40e Les Journees Scientifique de la Faculte de Medecine et des Sciences de la Sante, Uniwersytet Sherbrooke, Sherbrooke, Kanada, 22-23.03.2011. 11. Wypijewska A., Bojarska E., Zuberek J., Rydzik A. M., Jemielity J., JankowskaAnyszka M., Stepinski J., Davis R.E., Darzynkiewicz E., Widespread applications of dinucleoside triphosphates for biochemical and biophysical studies of mRNA cap interactions with DcpS enzyme. International Symposium on Therapeutic Nucleic Acids, Łódź, Polska, 14-16.10.2010. 12. Wypijewska A., Bojarska E., Rydzik A. M., Jemielity J., Darzynkiewicz E., DcpSproof synthetic mRNA cap analogs. Translational Control, Cold Spring Harbor Laboratory, Nowy Jork, USA, 13-17.09.2010. 13. Wypijewska A., Sikora B., Galazka-Friedman J., Bauminger E.R., Wszolek Z.K., Schweitzer K. J., Dickson D.W., Jaklewicz A., Baranowska-Korczyc A., Elbaum D., Friedman A., Extrinsic luminophores in neurodegenerative diseases examination. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Biofizycznego, Łódź, Polska, 28-30.09.2010. 14. Wypijewska A., Zuberek J., Bojarska E., Rydzik A.M, Jemielity J., Darzynkiewicz E., A biophysical view of mRNA cap binding by C. elegans DcpS. XIV Zjazd Polskiego Towarzystwa Biofizycznego, Łódź, Polska, 28-30.09.2010. 15. Wypijewska A., Bojarska E., Stepinski J., Jankowska-Anyszka M., Jemielity J., Davis R.E., Darzynkiewicz E., Fluorescence vs HPLC: Two complementary methods for analyzing DcpS degradation of the mRNA cap. The Complex Life of mRNA: From Synthesis to Decay, EMBL, Heidelberg, Niemcy, 18-20.03.2010. 16. Wypijewska A., Bojarska E., Stepinski J., Jankowska-Anyszka M., Jemielity J., Davis R.E., Darzynkiewicz E., Substrate specificity of C. elegans scavenger decapping enzyme DcpS for m7GpppG, m32,2,7GpppG and chemically modified dinucleotide cap analogues. EMBO Conference Series on Protein Synthesis and Translational Control, EMBL, Heidelberg, Niemcy, 9-13.09.2009. 17. Galazka-Friedman J., Wypijewska A., Jaklewicz A., Bauminger E.R., Wszolek Z.K., Friedman A., Only the labile iron pool is increased in parkinsonian substantia nigra. 13th International Congress of Parkinson’s Disease and Movement Disorders, Paryż, Francja, 7-11.06.2009. 18. Zuberek J., Jemielity J., Kowalska J., Lukaszewicz M., Rydzik A., Kulis M., Grudzien-Nogalska E., Wypijewska A., Darzynkiewicz Z.M., Bojarska E., Stepinski J., Stolarski R., Rhoads R.E., Davis R., Darzynkiewicz E., mRNA cap dinucleotides modified in 5’,5’ – oligophosphate. Search for „super caps”. RNA 2008 Thirteenth Annual Meeting of the RNA Society, Berlin, Niemcy, 28.07 – 3.08.2008. 19. Friedman A., Bauminger E.R., Dickson D., Wszolek Z., Galazka-Friedman J., Wypijewska A., Jaklewicz A., Elbaum D., Which Iron Is Involved In Parkinson’s Disease? 133rd Annual Meeting of the American Neurological Association, Salt Lake City, UT, USA, 21-24.09.2008. 20. Wypijewska A., Bojarska E., Stepinski J., Jankowska-Anyszka M., Darzynkiewicz E., Kinetic analysis of nematode DcpS catalyzed hydrolysis of mRNA cap analogues. XLIII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Olsztyn, Polska, 7-11.09.2008.