Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej
Transkrypt
Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej
Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej 1 2 Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej 3 Wydane przez World Health Organization w 2003 r. pod tytułem ,,Basic Laboratory Procedures in Clinical Bacteriology’’, wydanie 2 World Health Organization 2003 Copyright for the Polish edition by Wydawnictwo Lekarskie PZWL, Warszawa 2005 Dyrektor Generalny World Health Organization udzielił praw na wydanie w je˛zyku polskim Wydawnictwu Lekarskiemu PZWL, które jest całkowicie odpowiedzialne za polskie wydanie. Wszelkie prawa zastrzeżone. Przedruk i reprodukcja w jakiejkolwiek postaci całości ba˛dź cze˛ści ksia˛żki bez pisemnej zgody wydawcy sa˛ zabronione. Redaktor ds. publikacji medycznych mgr Anna Plewa Redaktor mgr Alicja Pałkiewicz Redaktor techniczny Maria Karczewska Korekta Zespół Projekt okładki i stron tytułowych Jolanta Krafft-Przeździecka Dawkowanie leków Autorzy i Wydawnictwo dołożyli wszelkich starań, aby wybór i dawkowanie leków w tym opracowaniu były zgodne z aktualnymi wskazaniami i praktyka˛ kliniczna˛. Mimo to, ze wzgle˛du na stan wiedzy, zmiany regulacji prawnych i nieprzerwany napływ nowych wyników badań dotycza˛cych podstawowych i niepoża˛danych działań leków, Czytelnik musi brać pod uwage˛ informacje zawarte w ulotce doła˛czonej do każdego opakowania, aby nie przeoczyć ewentualnych zmian we wskazaniach i dawkowaniu. Dotyczy to także specjalnych ostrzeżeń i środów ostrożności. Należy o tym pamie˛tać, zwłaszcza w przypadku nowych lub rzadko stosowanych substancji. ISBN 83-200-3133-8 Wydanie I Wydawnictwo Lekarskie PZWL 00-251 Warszawa, ul. Miodowa 10 tel. (0-prefiks-22) 695-40-33 Ksie˛garnia wysyłkowa: tel. (0-prefiks-22) 695-44-80 infolinia: 0 801-142-080 www.pzwl.pl e-mail: promocja 0pzwl.pl Skład i łamanie: EGRAF, Warszawa Druk i oprawa: Pabianickie Zakłady Graficzne S.A., Pabianice 4 Przedmowa do polskiego wydania Pierwszym, podstawowym celem diagnostyki mikrobiologicznej jest identyfikacja czynnika etiologicznego zakażenia. Wskazanie drobnoustroju odpowiedzialnego za infekcje˛ jest podstawa˛wyboru sposobu leczenia, poste˛powania zmierzaja˛cego do ograniczenia jego rozprzestrzeniania sie˛, a także oceny rokowania. Rozpoznanie danego mikroorganizmu może być dokonane przez bakterioskopowe badanie próbki od pacjenta, hodowle˛ i identyfikacje˛. Czynnik etiologiczny zakażenia można też identyfikować na podstawie obecności w próbkach antygenów, które wykrywa sie˛ za pomoca˛ serologicznych metod diagnostycznych. Jeszcze inna˛ droga˛ poste˛powania jest wykrywanie charakterystycznego dla drobnoustroju kwasu nukleinowego, do czego służa˛ wprowadzone w ostatnich latach techniki molekularne. Pośrednio czynnik etiologiczny zakażenia może być rozpoznany na podstawie swoistych przeciwciał wytworzonych w zakażonym organizmie. Odpowiednio dobrane antygeny i metody pozwalaja˛ na oznaczenie zarówno klas, jak i miana przeciwciał. Wybór metody diagnostycznej jest podyktowany wieloma wzgle˛dami, takimi jak: zdolność drobnoustrojów do wzrostu w warunkach in vitro i szybkość jego wzrostu, charakter zakażenia i jego przebieg, wyposażenie laboratorium, wykształcenie personelu, wreszcie możliwości finansowe. Prawidłowe wykonanie badania mikrobiologicznego, niezależnie od zastosowanej metody, wymaga poste˛powania według określonych szczegółowo procedur, które obejmuja˛: pobranie i transport próbek, metode˛ przeprowadzenia badania w pracowni mikrobiologicznej, sposób opracowania, wydania i interpretacji wyniku. Wydane pod patronatem WHO ,,Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej’’ (Basic Laboratory Procedures in Clinical Bacteriology) to publikacja podsumowuja˛ca aktualne wytyczne w zakresie doboru materiału w określonych zakażeniach i pobierania próbek, identyfikacji drobnoustrojów oraz oznaczania lekooporności. Informacje w niej zawarte maja˛ na celu ujednolicenie techniki badań mikrobiologicznych i podniesienie jakości usług laboratoryjnych w krajach rozwijaja˛cych sie˛ i tych, w których diagnostyka mikrobiologiczna nie jest dobrze zorganizowana lub doceniana, na co wskazuje wysokie zużycie antybiotyków i szybko wzrastaja˛ca liczba szczepów wieloopornych. Publikacji, która˛ maja˛ Państwo przed soba˛, nie można traktować jako zbioru obowia˛zuja˛cych procedur, może ona jednak pomóc w tworzeniu własnych procedur w laboratorium mikrobiologicznym, być cennym źródłem nauki metod diagnostycznych, szczególnie prostych i tanich, szczegółowo w podre˛czniku opisanych. Niektóre metody diagnostyczne dotycza˛ chorób w Polsce nie spotykanych, np. cholera, wrzód mie˛kki, mycetoma, jednak szybkie i cze˛ste przemieszczanie sie˛ ludzi ustawicznie grozi przemieszczaniem sie˛ drobnoustrojów, a łatwy doste˛p do mało popularnych w Polsce procedur diagnostycznych może pomóc w rozpoznaniu, a wie˛c w zapobieganiu i rozpowszechnieniu sie˛ niekonwencjonalnego zakażenia. Niniejsza publikacja be˛dzie z pewnościa˛ cennym podre˛cznikiem, szczególnie dla studentów analityki medycznej, wydziału lekarskiego i stomatologii, na rynku brak bowiem opracowania z zakresu diagnostyki mikrobiologicznej, której studenci ucza˛ sie˛ na ćwiczeniach. Opisane w publikacji procedury nie uwzgle˛dniaja˛ komercyjnych metod badawczych opartych na aparatach i podłożach do monitorowanego posiewu krwi i płynów ustrojowych, do przyspieszonej diagnostyki gruźlicy oraz gotowych 5 podłożach do przesiewowych półilościowych badań moczu. ,,Podstawowe procedury laboratoryjne w bakteriologii klinicznej’’ zawieraja˛ opis metod identyfikacji i oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów opieraja˛cych sie˛ na podłożach różnicuja˛cych i prostych testach wskaźnikowych, bez uwzgle˛dnienia metod półautomatycznych lub automatycznych. Metody oznaczania lekowrażliwości i identyfikacja nowych mechanizmów oporności, ze wzgle˛du na zmieniaja˛ca˛ sie˛ sytuacje˛ epidemiologiczna˛, wymagaja˛ cia˛głej modyfikacji i aktualizacji, sta˛d procedury opisane w podre˛czniku należy traktować jako ogólne, w praktyce opieraja˛c sie˛ przede wszystkim na rekomendacjach Krajowego Ośrodka Referencyjnego ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów. Podre˛cznik nie uwzgle˛dnia metod molekularnych i immunochemicznych w diagnozowaniu zakażeń. Zgodnie z tytułem przedstawione sa˛ rzeczywiście podstawowe procedury laboratoryjne i warto podkreślić, że korzyści dla mikrobiologa z takiego podejścia do diagnostyki sa˛ naprawde˛ duże. Szczególnie cenne jest przypomnienie, jak ważny jest i ile informacji może dostarczyć preparat bezpośredni: można nauczyć sie˛ oszcze˛dności, liczyć czas badania. Cenna˛cze˛ścia˛ podre˛cznika jest podkreślanie w każdym z rozdziałów konieczności kontroli wewna˛trz- i zewna˛trzlaboratoryjnych procedur oraz kontroli sprze˛tu i testów. Podsumowuja˛c, przedstawiona publikacja może być pomocna w opracowaniu i wdrożeniu tańszych, a jednocześnie rzetelnych metod diagnostyki mikrobiologicznej. Prof. dr hab. med. Anna Przondo-Mordarska 6 Spis treści Wste˛p ................................................ 10 Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Zapewnienie jakości badań bakteriologicznych . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 Wprowadzenie . . . . . . . . . . Definicje . . . . . . . . . . . . . . Wewne˛trzna kontrola jakości Zewne˛trzna kontrola jakości . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 12 16 27 CZE˛ŚĆ I. BADANIA BAKTERIOLOGICZNE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 Krew 30 ................................................. Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kiedy i u kogo może wysta˛pić bakteriemia Pobieranie próbek krwi . . . . . . . . . . . . . . Podłoża do posiewu krwi . . . . . . . . . . . . Prowadzenie hodowli z krwi . . . . . . . . . . . . . . . 30 30 31 32 33 Płyn mózgowo-rdzeniowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 Wprowadzenie . . . . . . . . . . . Pobieranie i transport próbek Ocena makroskopowa . . . . . Badanie mikroskopowe . . . . . Wste˛pna identyfikacja . . . . . . Oznaczanie lekowrażliwości . Mocz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kał . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 41 43 46 47 47 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Czynniki etiologiczne i objawy kliniczne . . . . . . . . . . . . . . Właściwe ukierunkowanie diagnostyki laboratoryjnej . . . . . Pobieranie i przesyłanie próbek kału . . . . . . . . . . . . . . . . Badanie wizualne próbek kału . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Podłoża transportowo-wzbogacaja˛ce i posiew próbek kału Podłoża do hodowli patogenów jelitowych . . . . . . . . . . . . Wste˛pna izolacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wste˛pna identyfikacja izolowanych szczepów . . . . . . . . . . Końcowa identyfikacja mikrobiologiczna . . . . . . . . . . . . . . Identyfikacja serologiczna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 . . . . . . . . . . . . . . . . . ................................................. . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 36 37 37 39 40 ...... ...... ...... moczu ...... ...... . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pobieranie materiału do badania . . . . . . . Hodowla i interpretacja . . . . . . . . . . . . . . Interpretacja wyników posiewu ilościowego Identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Oznaczanie lekowrażliwości . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 48 50 51 52 53 53 54 56 62 67 SPIS TREŚCI Zakażenia górnych dróg oddechowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . Flora fizjologiczna gardła . . . . . . . . Bakteryjne czynniki zapalenia gardła Pobieranie i przesyłanie próbek . . . . Mikroskopia bezpośrednia . . . . . . . Hodowla i identyfikacja . . . . . . . . . . Badanie lekowrażliwości . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73 73 74 75 76 76 78 Zakażenia dolnych dróg oddechowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . Najcze˛stsze postacie kliniczne zakażeń Pobieranie próbek plwociny . . . . . . . . Opracowanie plwociny w laboratorium (w zakażeniach niegruźliczych) . . . . Hodowla Mycobacterium tuberculosis . Interpretacja hodowli M. tuberculosis . . Podstawowe zasady bezpieczeństwa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73 ....................... ....................... ....................... 79 79 81 . . . . . . . . 81 85 88 88 Choroby przenoszone droga˛ kontaktów seksualnych . . . . . . . . . . . . 89 Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn . Próbki z żeńskich narza˛dów płciowych . Próbki z owrzodzeń narza˛dów płciowych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113 113 114 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Podział bakterii ze wzgle˛du na wymagania tlenowe . . . . . . . . . . . . . . Diagnostyka zakażeń bakteriami beztlenowymi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zakażenia bakteriami beztlenowymi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100 100 103 104 105 107 108 112 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Podstawowe zasady oznaczania lekowrażliwości . . . . . Kliniczna definicja terminów ,,oporny’’ i ,,wrażliwy’’ . . . . Wskazania do rutynowego oznaczania lekowrażliwości . Wybór leków do oznaczania lekowrażliwości w laboratoriach klinicznych . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zmodyfikowana metoda Kirby-Bauera . . . . . . . . . . . . . Bezpośrednie a pośrednie oznaczanie lekowrażliwości . Czynniki techniczne wpływaja˛ce na wielkość strefy zahamowania w metodzie dyfuzyjno-kra˛żkowej Kontrola jakości . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . . . . . . . . Ropne wydzieliny, rany i ropnie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 90 93 96 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postacie kliniczne i najcze˛stsze czynniki etiologiczne Pobieranie i transport próbek . . . . . . . . . . . . . . . . . Ocena makroskopowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Badanie mikroskopowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hodowla . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Identyfikacja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Badanie lekowrażliwości . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 119 120 122 ........... ........... ........... 123 125 133 ........... ........... 134 136 SPIS TREŚCI Badania serologiczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metody kontroli jakości . . . . . . . . . . . . . Reakcje serologiczne . . . . . . . . . . . . . . Odczyny serologiczne w diagnostyce kiły Wykrywanie aglutynin w gora˛czce . . . . . Odczyn ASO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Wykrywanie antygenów bakteryjnych . . . . . . . . . . 138 138 141 142 150 152 155 CZE˛ŚĆ II. NAJWAŻNIEJSZE PODŁOŻA I ODCZYNNIKI . . . . . . . . . . . 157 Wprowadzenie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158 Patogeny, podłoża i odczynniki diagnostyczne . . . . . . . . . . . . . . . . . 159 Krew . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Płyn mózgowo-rdzeniowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mocz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kał . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Górne drogi oddechowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dolne drogi oddechowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Próbki z układu moczowo-płciowego do diagnostyki chorób przenoszonych droga˛ kontaktów seksualnych . . . . . . . . . . . . . . . . . Ropa i wysie˛ki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lista rekomendowanych podłoży i odczynników diagnostycznych dla laboratoriów mikrobiologicznych o średnim poziomie referencyjności 160 161 161 162 164 165 Wybrana literatura uzupełniaja˛ca . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Skorowidz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 165 166 167 Wste˛p Choroby zakaźne sa˛ najcze˛stsza˛ przyczyna˛ zgonów w krajach rozwijaja˛cych sie˛, ich diagnozowanie i leczenie stanowi ważne wyzwanie dla służby zdrowia. Światowa Organizacja Zdrowia (WHO, World Health Organization) od wielu lat wspiera rozwój i wprowadzanie standardowych technik w diagnostyce laboratoryjnej. Pierwszy program pod patronatem WHO z 1960 roku dotyczył standaryzacji oznaczania lekowrażliwość patogenów bakteryjnych. W 1976 roku1 WHO Expert Committee on Biological Standardization wskazał na konieczność stosowania metody dyfuzyjno-kra˛żkowej w oznaczaniu wrażliwości na antybiotyki2. Równocześnie podje˛to działania w celu wprowadzenia kontroli jakości badań laboratoryjnych. W 1981 roku WHO ustanowiła Mie˛dzynarodowy Program Kontroli Jakości Badań Mikrobiologicznych. Laboratoria, które uczestnicza˛ w programie, moga˛ pełnić przewodnia˛ role˛ we wprowadzaniu kontroli jakości badań w skali kraju na wszystkich poziomach systemu usług medycznych. Publikacja, która˛ maja˛ Państwo przed soba˛, jest podsumowaniem aktualnych wytycznych WHO, dotycza˛cych pobierania próbek do badań laboratoryjnych, identyfikacji drobnoustrojów oraz oznaczania lekooporności. Wprowadzenie do praktyki laboratoryjnej informacji zawartych w podre˛czniku ma na celu ujednolicenie techniki badań mikrobiologicznych i oceny lekowrażliwości oraz podniesienie jakości usług laboratoryjnych, zarówno na poziomie centralnym, jak i średnim. Podre˛cznik koncentruje sie˛ raczej na procedurach niż na podstawowych technikach mikroskopowania i barwienia, które zostały opisane szczegółowo w innych publikacjach WHO3. 1 The public health aspects of antibiotics in feedstuffs. Report on a Working Group, Bremen, 1–5 October 1973. Copenhagen, WHO Regional Office for Europe, 1973 (document no. EURO 3604 (2)). 2 WHO Expert Committee on Biological Standardization. Twenty-eight report. Geneva, World Health Organization, 1977 (WHO Technical Report Series, No. 610). 3 Manual of basic techniques for a health laboratory, 2nd ed. Geneva, World Health Organization, 2003. 10 Wprowadzenie Koszty zwia˛zane z chorobami zakaźnymi wcia˛ż stanowia˛nieproporcjonalnie duże obcia˛żenie dla budżetu zdrowia w krajach rozwijaja˛cych sie˛. Według Światowego Raportu Zdrowia (The world health report)1 ostra biegunka jest przyczyna˛ 2,2 milionów zgonów rocznie. Ostre infekcje układu oddechowego (głównie zapalenie płuc) sa˛ kolejna˛ ważna˛ przyczyna˛ śmiertelności, odpowiedzialna˛ za około 4 miliony zgonów rocznie. Analiza doste˛pnych danych wskazuje, że w krajach rozwijaja˛cych sie˛ patogenami wywołuja˛cymi zapalenie płuc w dzieciństwie sa˛ cze˛ściej niż wirusy, takie bakterie, jak Haemophilus influenzae i Streptococcus pneumoniae. W różnych regionach świata pojawiły sie˛ szczepy H. influenzae wytwarzaja˛ce β-laktamazy i S. pneumoniae o zmniejszonej wrażliwości na benzylopenicyline˛, sprawiaja˛c, że nadzór nad tymi patogenami jest coraz bardziej istotny. Choroby przenoszone droga˛kontaktów seksualnych sa˛coraz cze˛stsze. W konsekwencji niewystarczaja˛cego nadzoru epidemiologicznego i niedostatecznych działań profilaktycznych aktualne sa˛ wcia˛ż zagrożenia epidemia˛ lub pandemia˛, wywołana˛ czynnikami bakteryjnymi lub wirusowymi. Dla skutecznej kontroli i profilaktyki chorób zakaźnych konieczny jest rozwój prostych narze˛dzi nadzoru epidemiologicznego i monitorowania choroby oraz prostych i czułych metod diagnostycznych. Aby sprostać wyzwaniom w wyżej opisanej sytuacji, system usług laboratoryjnych musi być oparty na współpracy sieci laboratoriów wykonuja˛cych diagnostyke˛ mikrobiologiczna˛ dla centrów medycznych, lekarzy klinicystów i epidemiologów. Złożoność zadań powinna wzrastać proporcjonalnie: od podstawowych, poprzez średnie, do centralnych laboratoriów (zależnie od poziomu referencyjności laboratorium — przyp. tłum.). Tylko w ten sposób możliwe be˛dzie dostatecznie szybkie zebranie istotnych informacji, które usprawnia˛ nadzór, umożliwia˛ wczesna˛ diagnostyke˛ epidemii lub nietypowych zakażeń oraz rozwój, zastosowanie i ocene˛ określonych środków interwencji. 1 The world health report 2000, Geneva, World Health Organization, 2000. 11 Zapewnienie jakości badań bakteriologicznych Wprowadzenie Programy zapewniania jakości sa˛ skutecznym sposobem zagwarantowania standardów usług diagnostyki laboratoryjnej i podnoszenia tych standardów, jeśli zachodzi potrzeba. W mikrobiologii poje˛cie jakości wykracza poza zagadnienia techniczne, dotycza˛c szybkości, kosztów oraz przydatności klinicznej testu. Testy laboratoryjne sa˛ stosunkowo drogie i wraz z poste˛pem medycyny proporcjonalnie zwie˛kszaja˛ obcia˛żenie budżetu służby zdrowia. Definicje Cecha˛ testu dobrej jakości jest jego wartość kliniczna, np.: w profilaktyce i leczeniu choroby. Inne cechy jakości testu, to: • Niezawodność: Czy wynik jest wiarygodny? • Powtarzalność: Czy otrzymamy taki sam wynik w powtórnym badaniu? • Szybkość: Czy test jest wystarczaja˛co szybki, aby był użyteczny dla lekarza zalecaja˛cego leczenie? • Współczynnik koszt–korzyść: Czy koszt badania jest proporcjonalny do korzyści dla pacjenta i społeczeństwa? Czynniki wpływaja˛ce na wiarygodność i powtarzalność wyników laboratoryjnych Przyczyny błe˛dów: • Personel. Wyniki pracy personelu laboratorium pozostaja˛ w ścisłym zwia˛zku ze stopniem edukacji i dokształcaniem, doświadczeniem oraz warunkami zatrudnienia. • Czynniki środowiskowe. Na wyniki moga˛ wpływać: warunki przestrzenne, oświetlenie, wentylacja, temperatura, nadmierny poziom hałasu, niebezpieczne warunki pracy. • Materiał do badań. Sposób i czas pobrania materiału do badań oraz pochodzenie próbki, cze˛sto pozostaja˛ce poza kontrola˛ laboratorium, maja˛ bezpośredni zwia˛zek z możliwościa˛ uzyskania wiarygodnych wyników. Czynnikami, wpływaja˛cymi na jakość wyników, które pozostaja˛ pod kontrola˛ laboratorium, sa˛: transport, przechowywanie, przygotowanie próbek do badania oraz identyfikacja. Laboratorium pełni funkcje˛ edukacyjna˛ wobec osób odpowiedzialnych za pobieranie i transport próbek. Pisemne instrukcje powinny być przygotowane w przyste˛pny sposób i regularnie omawiane z klinicystami i piele˛gniarkami. • Materiały laboratoryjne. Jakość odczynników, chemikaliów, szklanych naczyń, barwników, podłoży do hodowli oraz zwierza˛t laboratoryjnych wpływa na wiarygodność wyników badań. • Metody badań. Niektóre metody sa˛ bardziej wiarygodne niż inne. • Sprze˛t. Brak sprze˛tu, niewystarczaja˛ce lub niezgodne ze standardem wyposażenie sa˛ przyczyna˛ uzyskiwania niewiarygodnych wyników. 12 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ • Badanie i odczyt. Pospieszne odczytywanie wyników lub brak badania wystarczaja˛cej liczby pól mikroskopowych moga˛ być powodem błe˛dów. • Sprawozdanie. Błe˛dy w przepisywaniu lub niekompletne opisy wyników. Jakość interpretacji wyników badań W mikrobiologii szczególnie ważna jest interpretacja wyników. Na każdym etapie badania próbki rezultaty powinny być interpretowane w celu wyboru, do kolejnego etapu badania, testu optymalnego pod wzgle˛dem szybkości i wiarygodności. Zapewnienie jakości w laboratorium mikrobiologicznym Zapewnienie jakości jest suma˛ działań, w które zaangażowane jest laboratorium, aby zapewnić dobra˛ jakość wyników. Działania te musza˛ być: – kompletne: aby zapewnić kontrole˛ na każdym etapie procesu — od pobrania próbki do przedstawienia końcowego wyniku lekarzowi (ryc. 1); – racjonalne: aby skoncentrować sie˛ na najbardziej krytycznych etapach procesu; – regularne: aby zapewnić stała˛ kontrole˛ procedur; – cze˛ste: aby szybko wykryć i skorygować błe˛dy. DOBRA JAKOŚĆ BADAŃ LABORATORYJNYCH TO DOBRA JAKOŚĆ MEDYCYNY Zapewnienie jakości pozwala na możliwie oszcze˛dne stosowanie drogich testów; określa także zasadność i wartościowość nowych testów, podnosi jakość usług szpitalnych i pozaszpitalnych laboratoriów oraz zapewnia porównywalność otrzymanych wyników niezależnie od miejsca ich wykonania. Rodzaje gwarancji jakości Istnieja˛ dwa rodzaje gwarancji jakości: wewne˛trzna i zewne˛trzna. • Wewne˛trzna. Tak zwana KONTROLA JAKOŚCI. Każde laboratorium ma system sprawdzania jakości wykonywanych przez siebie testów. Na wewne˛trzna˛ kontrole˛ jakości składaja˛ sie˛: – cia˛gły monitoring jakości testów; – pełne sprawdzanie wszystkich etapów diagnostyki: od pobrania próbki do badania (jeśli jest to możliwe) do odesłania końcowego wyniku. Laboratoria maja˛ etyczna˛ odpowiedzialność wobec pacjenta za przedstawienie dokładnych i przydatnych wyników. WEWNE˛TRZNA KONTROLA JAKOŚCI JEST NIEZBE˛DNA DLA PRAWIDŁOWEGO FUNKCJONOWANIA PROCEDURY 13 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH PACJENT Z INFEKCJA˛ Pobieranie materiału 10 Transport, oznaczanie Przechowywanie ▲ ▼ Próbka, dane kliniczne ▼ ▼ ▼ WYNIK WSTE˛PNY przekazany lekarzowi ▼ Ocena makroskopowa, zapach WYNIK KOŃCOWY przekazany lekarzowi Mikroskopia, interpretacja ▼ Hodowla: wybór podłoża, temperatury, atmosfery ▼ ▼ Izolacja czystych kolonii, antybiogram ▼ Identyfikacja, interpretacja (zanieczyszczenie, komensal lub patogen) WHO 90960 Ryc. 1. Etapy diagnostyki mikrobiologicznej zakażenia u pacjenta. • Zewne˛trzna. Tak zwana OCENA JAKOŚCI. Wyniki działalności laboratorium kontrolowane sa˛przez zewne˛trzna˛ instytucje˛. W niektórych krajach podleganie zewne˛trznej ocenie jakości jest obowia˛zkowe (regulacje rza˛dowe) i wymagane do uzyskania licencji. Na zewne˛trzna˛ ocene˛ jakości składaja˛ sie˛: – okresowy monitoring jakości testów; – wybiórcza kontrola procesu identyfikacji i niekiedy technik izolacji. Kryteria jakości w mikrobiologii Przydatność kliniczna Ważnym kryterium jakości badania mikrobiologicznego jest jego przydatność w zapobieganiu i leczeniu chorób zakaźnych; jest to tak zwana przydatność kliniczna. Warunkiem koniecznym do uzyskania poża˛danego efektu klinicznego jest współpraca mie˛dzy lekarzem i laboratorium. Poniższe przykłady obrazuja˛ przydatność kliniczna˛: 1. Izolacja kilku kolonii Gram-ujemnych pałeczek z plwociny lub z wymazu z gardła hospitalizowanego pacjenta oraz identyfikacja drobnoustrojów z antybiogramem nie maja˛ żadnego znaczenia klinicznego, ponieważ żadna z tych procedur nie wpłynie na podje˛te leczenie. 2. W przypadku izolacji Streptococcus pyogenes wykonanie pełnego antybiogramu nie ma znaczenia klinicznego, ponieważ benzylopenicylina jest lekiem z wyboru, zawsze aktywnym in vitro. 3. W przypadku izolacji Escherichia coli u pacjenta z biegunka˛ bez domieszki krwi, identyfikacja serotypu nie jest klinicznie przydatna, jeśli nie można wykazać zwia˛zku mie˛dzy serotypem a chorobotwórczościa˛. 4. Rutynowa identyfikacja mieszanej flory beztlenowej widocznej w preparacie barwionym metoda˛ Grama nie ma znaczenia klinicznego. Jest czasochłonna, droga i nie wpłynie na leczenie pacjenta. 5. Jeśli z próbek pobranych z dróg oddechowych zostana˛ wyizolowane grzyby, celowe jest wykonanie testu identyfikuja˛cego Cryptococcus. Dalsza iden- 14 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ tyfikacja nie ma znaczenia klinicznego, ponieważ nie wpłynie na sposób leczenia pacjenta. Podsumowuja˛c, badanie dobrej jakości to takie, które jest dokładne i dostarcza informacji użytecznych w zapobieganiu i leczeniu chorób zakaźnych. Izolacja i identyfikacja wszystkich mikroorganizmów w próbce nie jest konieczna. Wiarygodność Dla badań ilościowych wiarygodność badania jest mierzona przez porównanie otrzymanych wyników z rzeczywista˛ wartościa˛. Poniżej przedstawiono przykłady badań tego typu: – określanie ste˛żenia antybiotyków w surowicy; – pomiar wartości minimalnego ste˛żenia hamuja˛cego (MIC) antybiotyków in vitro; – określanie miana przeciwciał w surowicy. Dla badań jakościowych wiarygodność badania określana jest przez ocene˛ zgodności wyniku ze stanem rzeczywistym. Poniżej przedstawiono przykłady opisanych badań: – identyfikacja patogenów; – oznaczanie wrażliwości izolatów na antybiotyki metoda˛ dyfuzji kra˛żkowej. Konieczne jest stosowanie standardowej terminologii. Zawsze należy używać mie˛dzynarodowych nazw drobnoustrojów, np.: Staphylococcus aureus, NIE ,,patogenne gronkowce’’; Streptococcus pyogenes, NIE: ,,paciorkowce hemolizuja˛ce’’. Niezbe˛dne jest stosowanie jednolitych, uznanych metod diagnostycznych. Oznaczanie lekowrażliwości metoda˛ dyfuzji kra˛żkowej powinno być wykonywane zgodnie z przyje˛tymi, mie˛dzynarodowymi standardami, na przykład zmodyfikowana˛ metoda˛ Kirby-Bauera (str. 125). Powtarzalność Powtarzalność i precyzja wykonywanych badań ograniczone sa˛ przez dwa czynniki: 1. Brak jednorodności. Pojedyncza próbka pochodza˛ca od pacjenta może zawierać wie˛cej niż jeden drobnoustrój. Powtarzanie hodowli może wie˛c prowadzić do izolacji różnych mikroorganizmów. 2. Brak stabilności. Wraz z upływem czasu mikroorganizmy w próbce w różnym stopniu namnażaja˛ sie˛ lub gina˛. Powtarzanie hodowli może prowadzić do izolacji różnych drobnoustrojów. W zwia˛zku z powyższym, w celu uzyskania wie˛kszej dokładności, badania powinny być przeprowadzane jak najszybciej po pobraniu próbek. Skuteczność Skuteczność badań mikrobiologicznych jest to możliwość uzyskania właściwej diagnozy dotycza˛cej patogenu lub stanu patologicznego. Powyższa wartość oceniana jest według dwóch kategorii: 15 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH 1. Czułość diagnostyczna. Czułość = ogólna liczba dodatnich wyników ogólna liczba zakażonych pacjentów Im wie˛ksza czułość testu, tym mniejsza liczba fałszywie ujemnych wyników. Na przykład czułość agaru MacConkeya jest zbyt niska w odniesieniu do izolacji Salmonella typhi z kału. Ten ważny patogen jelitowy może zostać przeoczony z powodu nadmiernego wzrostu niepatogennych bakterii jelitowych. 2. Swoistość diagnostyczna Swoistość = ogólna liczba ujemnych wyników ogólna liczba niezakażonych pacjentów Im wie˛ksza swoistość testu, tym mniejsza liczba fałszywie dodatnich wyników. Przykłady: • Barwienie preparatów z plwociny metoda˛ Ziehl-Neelsena jest wysoce swoiste w diagnostyce gruźlicy, ponieważ daje nieliczne fałszywie dodatnie wyniki. • Barwienie preparatów moczu metoda˛ Ziehl-Neelsena jest dużo mniej swoiste, ponieważ daje wiele fałszywie dodatnich wyników (z powodu obecności atypowych pra˛tków). • Test Widala ma bardzo niska˛ swoistość w diagnostyce duru brzusznego, ponieważ krzyżowo reaguja˛ce przeciwciała, powstałe w przebiegu infekcji wywołanych pokrewnymi serotypami Salmonella, daja˛ fałszywie dodatnie wyniki. Czułość i swoistość testu sa˛ ze soba˛ zwia˛zane. Czułość testu może być wyższa kosztem zmniejszenia jego swoistości i vice versa. Obydwie wartości pozostaja˛ także w zwia˛zku z cze˛stościa˛ wyste˛powania danej choroby w badanej populacji. Wewne˛trzna kontrola jakości Wymagania Program wewne˛trznej kontroli jakości powinien być praktyczny, realny i ekonomiczny. Program wewne˛trznej kontroli jakości nie powinien oceniać każdej procedury, odczynnika czy podłoża do hodowli każdego dnia pracy. Powinien oceniać procedure˛, odczynniki czy podłoże do hodowli zgodnie z praktycznym schematem, uwzgle˛dniaja˛cym wpływ każdego elementu na jakość badania. Procedury Wewne˛trzna kontrola jakości rozpoczyna sie˛ od właściwych działań laboratorium. 16 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Spis działań laboratoryjnych Każde laboratorium powinno mieć wykaz działań, który obejmuje: – sprza˛tanie miejsca pracy, – zasady higieny osobistej, – zasady bezpieczeństwa, – wyznaczone poza obszarem laboratorium strefy socjalne i dla pala˛cych, – poste˛powanie ze skażonym materiałem i jego usuwanie, – odpowiednie szczepienia personelu, np. przeciw wirusowemu zapaleniu wa˛troby typu B, – dbałość o sprze˛t, – pobieranie próbek na badania, – rejestracje˛ próbek, – eliminacje˛ nieodpowiednich próbek, – poste˛powanie z próbka˛, – zapis wyników, – wydawanie wyników. Zawarte w spisie działania powinny być dokładnie realizowane, regularnie oceniane i aktualizowane. Dbałość o sprze˛t Istotne znaczenie ma dbałość o wyposażenie laboratorium. Badania wysokiej jakości nie moga˛ być wykonywane sprze˛tem niskiej jakości lub niewłaściwie utrzymanym. W tabeli 1 przedstawiono wykaz rutynowych działań, maja˛cych zapewnić właściwa˛ dbałość o sprze˛t. Zakres temperatur działaja˛cego urza˛dzenia może być rejestrowany w formie przedstawionej na ryc. 2. Podłoża do hodowli Podłoża do hodowli moga˛ być przygotowywane ze składników podstawowych, z komercyjnie doste˛pnych podłoży sypkich lub zakupione w formie gotowej do użycia. Ze wzgle˛dów ekonomicznych, z uwagi na łatwość transportu i przechowywania oraz wyższa˛ jakość w porównaniu z podłożami przygotowanymi w laboratorium, rekomendowane sa˛ komercyjnie doste˛pne podłoża sypkie. Dla uzyskania najlepszych wyników konieczne jest uwzgle˛dnienie uwag uje˛tych w poniższych punktach. Wybór podłoża Sprawnie działaja˛ce laboratorium zaopatrzone jest w najmniejszy możliwy asortyment podłoży zgodnych z profilem wykonywanych badań. Dobrym przykładem jest podłoże agarowe, które może być użyte jako baza do przygotowania agaru z krwia˛, agaru czekoladowego oraz kilku innych selektywnych podłoży. Do izolacji patogennych Enterobacteriaceae z kału niezbe˛dne jest jedno wysoce selektywne podłoże (agar Salmonella-Shigella lub agar z cytry- 17 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH nianem deoksycholanu) oraz jedno mniej selektywne podłoże (agar MacConkeya). W celu identyfikacji Campylobacter spp. należy zastosować specjalne podłoże. Zamawianie i przechowywanie suchych podłoży 1. Należy zamawiać ilość, która zostanie zużyta w cia˛gu 6 miesie˛cy lub maksymalnie w cia˛gu roku. 2. Całość należy podzielić i umieścić w pojemnikach, których zawartość powinna zostać zużyta w cia˛gu 1–2 miesie˛cy. 3. Szczelnie domkna˛ć pokrywki pojemników. Suche podłoża absorbuja˛ wilgoć z otoczenia. W wilgotnym klimacie należy uszczelnić zamknie˛cie pojemnika, używaja˛c parafiny woskowej (wypełnić przestrzeń mie˛dzy pokrywka˛ i pojemnikiem roztopionym woskiem i poczekać do zastygnie˛cia). 4. Zapisać date˛ zamknie˛cia na każdym pojemniku. 5. Przechowywać w ciemnym, chłodnym, przewiewnym miejscu. 6. Odwracać pojemnik tak, aby najpierw został zużyty starszy materiał. Tabela 1. Kontrola jakości sprze˛tu Sprze˛t Podstawowe czynności Monitorowanie Przegla˛d techniczny i konserwacja Anaerostat Cotygodniowe czyszczenie wne˛trza po- Użycie paska wskaźnikowego z błe˛ki- Cotygodniowa jemników. tem metylenowym w każdym cyklu. kontrola uszczelek i szczelności Reaktywacja katalizatora po każdym cy- Odnotowanie czasu odbarwienia wskaklu (160°C, 2 h). źnika co tydzień zamknie˛cia Wymiana katalizatora co 3 miesia˛ce Autoklaw Co miesia˛c czyszczenie i wymiana wody Wirówka Przemywanie ścian wewne˛trznych środkiem dezynfekcyjnym co tydzień oraz po uszkodzeniu probówki lub rozlaniu zawartości Sterylizator szkła na Czyszczenie urza˛dzenia wewna˛trz co suche, gora˛ce pomiesia˛c wietrze Sprawdzenie poziomu i uzupełnienie Co 6 miesie˛cy wody przed każdym cyklem. Zapis czasu i temperatury lub ciśnienia każdego cyklu. Cotygodniowy zapis wyniku testu z użyciem przetrwalników (przyp. tłum.: testy biologiczne) Wymiana szczotek co rok Zapis czasu i temperatury każdego Co 6 miesie˛cy cyklu Cieplarka Czyszczenie ścianek i półek co miesia˛c Mikroskop Przecieranie soczewek szmatka˛ lub bi- Sprawdzenie ustawienia kondensatora Co rok buła˛ do soczewek po każdym dniu co miesia˛c pracy Umieszczenie w pokrowcu z mikroskoCzyszczenie i smarowanie mechanizmu pem naczynia z błe˛kitem krzemionstolika co tydzień kowym, w celu zapobiegania wzrosPrzykrycie pokrowcem nie używanego towi grzybów w wilgotnym środowisku urza˛dzenia Chłodziarka Czyszczenie i rozmrażanie co 2 miesia˛ce Zapis temperatury każdego dnia rano Co 6 miesie˛cy i po każdym przerwaniu zasilania pra˛(zakres temp.: 2 – 8°C) dem Łaźnia wodna Przecieranie ścian wewne˛trznych i wymiana wody co miesia˛c 18 wewne˛trznych Zapis temperatury na pocza˛tku każ- Co 6 miesie˛cy dego dnia pracy (zakres temp. 35 ± 1°C) Codzienne sprawdzanie poziomu wody Co 6 miesie˛cy Zapis temperatury pierwszego dnia każdego tygodnia (zakres temp.: 55 – 57°C) PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Temperatura Urza˛dzenie Pokój Odczytywać codziennie. Sprawdzić, czy odczytana wartość temperatury jest dopuszczalna. W przypadku nieprawidłowości zapisać temperature˛ w rubryce. X XI XII — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — IX — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — VIII — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — VII — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — VI — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — V — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — IV — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — III — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — II — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — I — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 1 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — Data Data 1 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 2 2 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 3 3 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 4 4 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 5 5 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 6 6 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 7 7 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 8 8 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 9 9 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 10 10 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 11 11 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 12 12 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 13 13 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 14 14 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 15 15 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 16 16 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 17 17 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 18 18 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 19 19 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 20 20 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 21 21 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 22 22 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 23 23 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 24 24 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 25 25 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 26 26 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 27 27 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 28 28 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 29 29 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 30 30 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 31 Ryc. 2. Zapisy temperatury działaja˛cych urza˛dzeń. 19 31 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH 7. Jeśli pojemnik został otwarty, zapisać date˛ jego otwarcia. 8. Wyrzucić wszystkie suche podłoża, które ściemniały lub w których powstały zlepione grudki. 9. Prowadzić rejestr przechowywanych podłoży. Przygotowanie podłoża 1. Należy ściśle przestrzegać zaleceń producenta. 2. Przygotować ilość, która zostanie zużyta przed upływem terminu przydatności (patrz poniżej). Tabela 2. Zestaw szczepów zalecanych w kontroli jakościa Bakterie beztlenowe Gram-dodatnie ziarenkowce Enterococcus faecalis (ATCC 29212 lub Bacteroides fragilis 33186) Clostridium perfringens Staphylococcus aureus (ATCC 25923) Enterobacteriaceae Staphylococcus epidermidis Citrobacter freundii Streptococcus agalactiae Enterobacter cloacae Streptococcus mitis Escherichia coli (ATCC 25922) Streptococcus pneumoniae Klebsiella pneumoniae Streptococcus pyogenes Proteus mirabilis Gram-ujemne kwasooporne bakterie Salmonella typhimurium Moraxella catarrhalis Serratia marcescens Haemophilus influenzae typ b Shigella flexneri β-laktamazoujemne Yersinia enterocolitica β-laktamazododatnie Inne Gram-ujemne pałeczki Haemophilus parainfluenzae Acinetobacter lwoffi Neisseria gonorrhoeae Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853) Neisseria meningitidis Vibrio cholerae (nie-01) Grzyby Candida albicans a Powinny zostać wybrane szczepy najbardziej odpowiadaja˛ce wymaganiom laboratorium. Przechowywanie gotowych podłoży 1. Ochrona przed światłem. 2. Ochrona przed ciepłem. Podłoża zawieraja˛ce krew, inne składniki organiczne lub antybiotyki powinny być przechowywane w chłodziarce. 3. Termin przydatności gotowego podłoża, które jest przechowywane w niskiej temperaturze, w ciemnym miejscu, zależy od jego składu. Przecie˛tne terminy użyteczności: – probówki z bawełnianym korkiem — 3 tygodnie; – probówki z nieszczelna˛ nakładka˛ — 2 tygodnie; – pojemniki z zakre˛tka˛ — 3 miesia˛ce; – płytki Petriego szczelnie zamknie˛te w plastikowych woreczkach — 4 tygodnie. Kontrola jakości przygotowanych podłoży 1. Oznaczenie pH. Wartość pH prawidłowo przygotowywanych sypkich podłoży nie musi być rutynowo sprawdzana. Podłoża przygotowywane ze składników 20 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Tabela 3. Testy kontrolne dla powszechnie stosowanych podłoży Podłoże Inkubacja Agar z żółcia˛ i eskulina˛ 24 h Agar z krwia˛ Agar czekoladowy Dekarboksylaza (pokryta olejem) – lizyny Organizm wskaźnikowy Oczekiwany wynik Enterococcus faecalis Streptococcus α-hemolizuja˛cy Wzrost i zaczernienie Brak wzrostu 24 h, CO2 Streptococcus pyogenes S. pneumoniae Wzrost i β-hemoliza Wzrost i α-hemoliza 24 h, CO2 Haemophilus influenzae Wzrost Shigella typhimurium Shigella flexneri S. typhimurium Klebsiella pneumoniae Dodatni Ujemny Dodatni Ujemny sterylnym 48 h – ornityny 48 h Dihydrolaza – argininy 48 h S. typhimurium Proteus mirabilis Dodatni Ujemny Żelatynaza (szybki test) 24 h Escherichia coli Serratia marcescens Ujemny Dodatni 24 h E. coli P. mirabilis E. faecalis Czerwone kolonie Bezbarwne kolonie (brak wzrostu mgławicowego) Brak wzrostu Agar Kliglera (patrz Trójcukrowy agar żelazowy) Agar MacConkeya z fioletem krystalicznym Bulion malonianowy 24 h E. coli K. pneumoniae Ujemny (kolor zielony) Dodatni (kolor niebieski) Agar z mannitolem 24 h Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis E. coli Żółte kolonie Różowe kolonie Brak wzrostu Czerwień metylowa/Voges-Proskauer 48 h E. coli K. pneumoniae Dodatni/ujemny Ujemny/dodatni Agar Mueller-Hintona 24 h E. coli ATCC 25922 Akceptowane rozmiary strefy zaS. aureus ATCC 25923 hamowania (tab. 24, str. 126) Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 Bulion azotanowy 24 h E. coli Acinetobacter lwofii Dodatni Ujemny Utlenianie/fermentacja dekstrozy (bez oleju) 24 h P. aeruginosa A. lwofii Utlenianie na powierzchni Brak reakcji Woda peptonowa (indol) 24 h Deaminaza fenyloalaniny/chlorek żelaza 24 h E. K. E. P. Dodatni Ujemny Ujemny Dodatni Salmonella-Shigella agar lub agar z cytrynianem deoksycholanu 24 h E. coli S. typhimurium Yersinia enterocolitica S. flexneri Bez wzrostu Bezbarwne kolonie Bezbarwne kolonie Bezbarwne kolonie Bulion seleninowy 24 h S. typhimurium E. coli Wzrost po przesianiu Brak wzrostu po przesianiu Agar cytrynianowy Simmonsa (inkubacja z luźna˛ zakre˛tka˛) 48 h E. coli K. pneumoniae Brak wzrostu Wzrost, kolor niebieski Agar z solami żółci i cytrynianem tiosiarczanowym 24 h Vibrio spp. (nieaglutynuja˛ce) Żółte kolonie Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae Staphylococcus spp. E. coli C. albicans Wzrost Wzrost Brak wzrostu Brak wzrostu Brak wzrostu Bacteroides fragilis Wzrost Agar Thayer-Martina 24 h, CO2 Bulion tioglikolanowy 24 h 21 coli pneumoniae coli mirabilis ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH Tabela 3 cd. Podłoże Inkubacja Organizm wskaźnikowy Oczekiwany wynik Trójcukrowy agar żelazowy (głe˛bokość co najmniej 2,5 cm; inkubacja z luźna˛ zakre˛tka˛) 24 h Citrobacter freundii S. typhimurium S. flexneri A. lwofii A/A gaza + H2S K/A gaza + H2S K/A gaza Brak reakcji Podłoże z mocznikiem 24 h E. coli P. mirabilis Ujemny Dodatni (różowy) Voges-Proskauer (patrz Czerwień metylowa/Voges-Proskauer) a A/A: punkt kwaśny; K/A: punkt zasadowy. podstawowych należy wcześniej schłodzić. W przypadku stałych podłoży do oznaczenia pH należy użyć powierzchniowej elektrody lub rozmie˛kczyć podłoże w wodzie destylowanej. Jeśli pH różni sie˛ od zalecanego wie˛cej niż o 0,2 jednostki, należy je skorygować kwasem lub zasada˛, lub przygotować nowa˛ partie˛. 2. Kontrola sterylności. Testy sterylności powinny być przeprowadzane rutynowo dla podłoży, do których po sterylizacji w autoklawie dodano krew lub inne składniki. 3–5% próbek należy poddać inkubacji w temperaturze 35°C przez 2 dni. Pozostałe schłodzić. Jeśli na płytce pojawia˛ sie˛ wie˛cej niż dwie kolonie, należy odrzucić cała˛ badana˛ partie˛. 3. Kontrola jakości. Laboratorium powinno mieć zapas zestawów szczepów wzorcowych do monitorowania jakości podłoży. Lista zalecanych szczepów wzorcowych została przedstawiona w tabeli 2. Szczepy te moga˛ być uzyskane w trakcie rutynowej pracy lub pochodzić z komercyjnych czy też oficjalnych źródeł. Rekomendacje dotycza˛ce utrzymania i wykorzystania szczepów wzorcowych opisane zostały na str. 24. Lista testów przeprowadzanych dla powszechnie używanych podłoży przedstawiona została w tabeli 3. Procedury poste˛powania przy ocenie jakości nowych partii podłoża: 1. Przygotować lekko me˛tna˛ zawiesine˛ szczepów kontrolnych, porównuja˛c ja˛ ze wzorcem standardowego roztworu siarczanu baru używanego w zmodyfikowanej metodzie Kirby-Bauera (McFarland 0,5) (patrz str. 125) i użyć jedno oczko ezy jako inoculum. 2. Inkubować przez rutynowo stosowany okres i odczytać zgodnie z przyje˛tymi zasadami. 3. Właściwie zapisać wyniki. Barwniki i odczynniki Zalecenia dotycza˛ce testowania niektórych odczynników przedstawiono w tabeli 4. Testy powinny być przeprowadzane: – za każdym razem przy przygotowywaniu nowej partii roztworu roboczego; – co tydzień (niezbe˛dne w przypadku zimnego barwnika Ziehl-Neelsena: klasyczny ma kilkumiesie˛czny termin przydatności). Odczynniki i barwniki powinny być dyskwalifikowane, jeśli: – termin ważności określony przez producenta jest przekroczony; – widoczne sa˛ oznaki psucia (zme˛tnienie, osad, zmiana barwy). 22 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Antygeny i surowice odpornościowe do diagnostyki W celu otrzymania możliwie najlepszych wyników badań z użyciem antygenów i surowic odpornościowych należy: • Zawsze przestrzegać instrukcji producenta. • Przechowywać w zalecanej temperaturze. Niektóre odczynniki serologiczne nie toleruja˛ zamrażania. Tabela 4. Testy jakości powszechnie stosowanych odczynników Gatunek użyty do testowania Odczynnik lub barwnik Wzrost Brak wzrostu Podłoże Kra˛żek z bacytracyna˛ S. pyogenes (strefa zahamo- E. faecalis wania) Agar z krwia˛ Katalaza S. aureus E. faecalis Agar tryptozowo-sojowy Osocze do koagulazy β-Glukuronidaza (PGUA)a S. aureus E. coli S. epidermidis K. pneumoniae Agar tryptozowo-sojowy Agar tryptozowo-sojowy Barwienie metoda˛ Grama Staphylococcus spp. E. coli Preparaty z mieszanki szczepów ONPGb E. coli S. typhimurium Kra˛żek z optochina˛ S. pneumoniae (strefa zahamowania) Pseudomonas aeruginosa Streptococcus mitis Trójcukrowy agar żelazowy lub agar Kliglera Agar z krwia˛ E. coli Agar tryptozowo-sojowy Kra˛żek z tellurydem E. faecalis (brak strefy zahamowania) Streptococcus agalactiae (strefa zahamowania) Agar z krwia˛ Czynnik V (kra˛żek lub pasek) Czynnik XV (kra˛żek lub pasek) Haemophilus parainfluenzae Haemophilus influenzae H. influenzae Barwienie metoda˛ Ziehl-Neelsena Mycobacterium tuberculosis Oksydaza Agar tryptozowo-sojowy Agar tryptozowo-sojowy Mieszana, niekwasooporna Preparat z rozmazem flora z plwocinyc a Kwas 4-nitrofenylo-β-D-glukopiranozydouronowy (PGUA). o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd. c Przygotować wymazy od pacjentów zdrowych i chorych. Utrwalić w cieple, owina˛ć każdy papierem i przechowywać w chłodziarce. b • Unikać powtarzanych zamrożeń i rozmrożeń. Przed zamrożeniem podzielić surowice˛ na odpowiednie porcje, wystarczaja˛ce do wykonania kilku testów. • Wyrzucić, jeśli upłyna˛ł termin ważności podany przez producenta. • Do testu aglutynacji z surowicami odpornościowymi należy używać zawsze świeżych, czystych, zidentyfikowanych hodowli. • Zawsze, w każdej serii badań, wykonać test z surowica˛ kontrolna˛ o znanej reaktywności. Surowica może pochodzić od pacjenta lub z komercyjnego źródła. • Jeśli to możliwe, aktywność surowicy powinna być wyrażana w jednostkach mie˛dzynarodowych (International Units, IU) na mililitr. • Pary surowic, pobranych od jednego pacjenta w ostrej fazie choroby i w fazie zdrowienia, powinny być badane z użyciem odczynników z tej samej partii. • Diagnostyke˛ serologiczna˛ kiły prowadzić zgodnie z przyje˛tymi krajowymi i mie˛dzynarodowymi procedurami. • Każda partia testów serologicznych powinna zawierać: – surowice˛ ujemna˛ (kontrola swoistości); 23 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH – surowice˛ słabo dodatnia˛ (kontrola czułości); – surowice˛ silnie dodatnia˛ (kontrola miareczkowania), która powinna być przygotowana w rozcieńczeniu odpowiadaja˛cym jej mianu uzyskanemu w ostatnio wykonywanym teście. • Zawsze zapisywać wszystkie miana surowic kontrolnych. Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki Zalecane jest rutynowe stosowanie zmodyfikowanej metody Kirby-Bauera (str. 125). W celu uniknie˛cia błe˛dów, należy przestrzegać poniższych zasad: • Kra˛żki powinny mieć właściwa˛ średnice˛ (6,35 mm). • Kra˛żki powinny zawierać właściwe ste˛żenie antybiotyku (tabela 24, str. 126). • Zapas kra˛żków powinien być przechowywany w zamrażarce (–20°C). • Zestaw podre˛czny powinien być przechowywany nie dłużej niż 1 miesia˛c w chłodziarce (2 – 8°C). • Do przeprowadzania badania jakości należy używać tylko agaru Mueller-Hintona. • Właściwe pH (7,2 – 7,4) gotowego podłoża jest bardzo istotne w przypadku niektórych antybiotyków. • Ge˛stość inoculum powinna być standaryzowana, określona na podstawie wzorca zme˛tnienia (str. 127). • Pomiar wielkości strefy powinien być dokładny. • Uzyskana średnica strefy zahamowania wzrostu powinna być interpretowana według wartości granicznych podanych w tabeli. Średnica strefy dla szczepów kontrolnych powinna zgadzać sie˛ z zakresami podanymi w tabeli 24 (str. 126). • Trzy standardowe szczepy kontrolne, to1: – Staphylococcus aureus (ATCC 25923; NCTC 6571); – Escherichia coli (ATCC 25922; NCTC 10418); – Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853; NCTC 10622). • Badania kontrolne z wykorzystaniem wymienionych szczepów powinny być przeprowadzane: – dla każdej nowej partii kra˛żków; – dla każdej nowej partii podłoży; – raz w tygodniu, równolegle do antybiogramów wykonywanych rutynowo. • W celu zapisu i interpretacji wyników kontroli jakości, zalecane jest stosowanie wykresu przedstawionego na ryc. 16 (str. 137). Pozyskiwanie i przechowywanie szczepów kontrolnych Wybór szczepów i źródło ich pochodzenia Należy wybrać szczepy, których maksymalna liczba morfologicznych, metabolicznych i serologicznych cech może być identyfikowana możliwie najmniejsza˛ liczba˛ testów; zalecane szczepy kontrolne zebrano w tabeli 2. 1 Wymienione szczepy moga˛ być uzyskane z: American Type Culture Collection (ATCC), 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110, USA; lub National Collection of Type Cultures (NCTC), PHLS Central Public Health Laboratory, 61 Colindale Avenue, London NW9 5HT, England. 24 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Szczepy te można uzyskać z naste˛puja˛cych źródeł: – prawidłowo zidentyfikowane izolaty z próbek klinicznych; – oficjalne kolekcje szczepów; – komercyjni producenci; – referencyjne laboratoria; – inne źródła z zewne˛trzna˛ kontrola˛ jakości. Przechowywanie szczepów Długoterminowe przechowywanie szczepów Metody długoterminowego przechowywania szczepów pozwalaja˛ na kilkumiesie˛czne lub nawet kilkuletnie przerwy mie˛dzy przesiewami. Najlepszymi metodami sa˛: liofilizacja (suchy lód), przechowywanie w zamrażarce lub w ciekłym azocie, w temperaturze –70°C lub niższej. Metody alternatywne opisano poniżej. Glicerol w temperaturze –20°°C 1. 2. 3. 4. 5. Wzrost czystych hodowli na odpowiednim stałym podłożu. Wyrosłe kolonie zebrać eza˛. Zawiesić niewielka˛ ilość materiału w sterylnym neutralnym glicerolu. Umieścić 1 – 2 ml porcje w zakre˛canych pojemnikach lub w fiolkach. Przechowywać w temperaturze –20°C. Unikać powtarzania zamrożeń i rozmrożeń. Przesiewać co 12 – 18 miesie˛cy. Olej mineralny w temperaturze pokojowej1 1. Przygotować probówki ze skosem agarowym zawieraja˛cym wycia˛g z serca. Dla wymagaja˛cych mikroorganizmów dodać świeża˛ lub ogrzana˛ krew. 2. Wysterylizować olej mineralny (liquid petrolatum) w suchym gora˛cym powietrzu (170°C przez godzine˛). 3. Posiać szczep na skosy agarowe. 4. Jeśli widoczny jest wzrost hodowli, dodać sterylny olej mineralny na wysokość około 1 cm ponad poziom agaru. 5. Konieczne przesiewy uzyskuje sie˛ przez zebranie hodowli spod warstwy oleju. 6. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać co 6 – 12 miesie˛cy. Przechowywanie hodowli w temperaturze pokojowej (stosowane tylko dla niewymagaja˛cych bakterii, takich jak gronkowce i Enterobacteriaceae) 1. Przygotować probówki z wysokim słupkiem agaru, bez we˛glowodanu. Zalecany jest agar tryptozowo-sojowy (trawiony kazeina˛ agar sojowy). 2. Posiać szczepy wkłuwaja˛c je w agar. 3. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. 4. Zamkna˛ć probówke˛ zakre˛tka˛ lub korkiem. W celu uszczelnienia zanurzyć zakre˛tke˛ lub korek w płynnej parafinie. 5. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać raz w roku. 1 Morton H.E., Pulaski E.J.: The preservation of bacterial cultures. Journal of Bacteriology, 1938, 38: 163 – 183. 25 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH Przechowywanie szczepów na agarze cysteinowo-tryptozowym (CTA) (dla Neisseria i paciorkowców) Przygotować probówki zawieraja˛ce podstawowe podłoże CTA. Posiać wkłuwaja˛c bakterie w podłoże. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. Zamkna˛ć probówke˛ zakre˛tka˛ lub korkiem. W celu uszczelnienia zanurzyć zakre˛tke˛ lub korek w płynnej parafinie. 5. W przypadku Neisseria, przechowywać w temperaturze 35°C i przesiewać co 2 tygodnie. W przypadku paciorkowców, przechowywać w temperaturze pokojowej i przesiewać co miesia˛c. 1. 2. 3. 4. Podłoża z wycia˛giem mie˛snym dla bakterii beztlenowych 1. 2. 3. 4. Posiać szczepy. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. Zamkna˛ć probówke˛ zakre˛tka˛ lub korkiem. Przechowywać w temperaturze pokojowej i przesiewać co 2 miesia˛ce. Krótkoterminowe przechowywanie szczepów Hodowle szczepów kontrolnych, aktualnie wykorzystywane do badań rutynowych, moga˛ być przygotowywane w poniższy sposób. Szybko rosna˛ce mikroorganizmy 1. Posiać na skos agarowy tryptozowo-sojowy w zakre˛canych probówkach. 2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. 3. Przechowywać w chłodziarce. Przesiewać co 2 tygodnie. Paciorkowce 1. Posiać na skos agarowy z krwia˛ w zakre˛canych probówkach. 2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. 3. Przechowywać w chłodziarce. Przesiewać co 2 tygodnie. Meningokoki i Haemophilus 1. Posiać na skos lub płytke˛ z agarem czekoladowym. 2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. 3. Przechowywać w temperaturze pokojowej. Przesiewać 2 razy w tygodniu. Gonokoki 1. Posiać na agar czekoladowy. 2. Inkubować przez noc w temperaturze 35°C. Przesiewać co 2 dni. 3. Zaste˛pować szczepy kontrolne nowymi klinicznymi izolatami. 26 PODSTAWOWE PROCEDURY LABORATORYJNE W BAKTERIOLOGII KLINICZNEJ Rola referencyjnych laboratoriów Poniższe rodzaje materiałów do badań powinny być przesyłane do regionalnych lub centralnych laboratoriów referencyjnych: – materiały badane w kierunku rzadko izolowanych drobnoustrojów lub wymagaja˛ce zastosowania wysoko specjalistycznych testów (np.: wirusologia, diagnostyka serologiczna chorób pasożytniczych); – pojedyncze duplikaty materiałów do badań, w celu kontroli wydawanych przez laboratorium wyników; – materiały wymagaja˛ce w przyszłości badań potwierdzaja˛cych, różnicuja˛cych, oznaczania grup ba˛dź typów patogenów o dużym znaczeniu dla zdrowia publicznego (np.: Salmonella, Shigella, Vibrio cholerae, Brucella, meningokoki i pneumokoki). Referencyjne laboratoria powinny dostarczać zestawy szczepów kontrolnych oraz, na potrzeby szkoleń, standardowe surowice i odczynniki używane w laboratorium referencyjnym. Jeśli laboratorium nie jest obje˛te programem zewne˛trznej kontroli jakości, referencyjne laboratorium jest zobowia˛zane do przygotowywania ślepych, kodowanych próbek i hodowli, które służa˛ do kontroli jakości pracy laboratorium w zakresie izolacji i hodowli. Zewne˛trzna kontrola jakości W cze˛ści tej omówiono elementy podlegaja˛ce ocenie w programie zewne˛trznej kontroli jakości (określanym jako ,,program testowania biegłości’’). Cele Celem programu kontroli jakości jest: – zagwarantowanie lekarzom i społeczeństwu dobrej jakości diagnostyki laboratoryjnej; – ocena i porównanie wiarygodności wyników laboratoryjnych w skali kraju; – identyfikacja powszechnie popełnianych błe˛dów; – motywacja do przestrzegania ujednoliconych procedur; – motywacja do używania standardowych odczynników; – podje˛cie czynności administracyjnych (ła˛cznie z cofnie˛ciem licencji) wobec laboratoriów nie spełniaja˛cych standardów; – motywacja do wprowadzenia wewne˛trznych programów jakości. Zasady kontroli Zewne˛trzna kontrola jakości polega na wysyłaniu kodowanych próbek do uczestnicza˛cych w niej laboratoriów. Powyższe próbki powinny być wła˛czone do badań rutynowych, traktowane i badane dokładnie w ten sam sposób, jak próbki kliniczne. Kontrole˛ należy prowadzić zgodnie z poniższymi zaleceniami: – powinna być przeprowadzana co najmniej 4 razy w roku; – powinna obejmować co najmniej 3 próbki; – czas na przygotowanie sprawozdania powinien być krótki, np. 2 tygodnie od otrzymania materiału do badań; 27 ZAPEWNIENIE JAKOŚCI BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH – instrukcje i formularze dotycza˛ce sprawozdania powinny być doła˛czone do każdego zestawu próbek, a raport powinien być przygotowany w dwóch kopiach i przesłany w ściśle ustalonym terminie. Hodowle Hodowle powinny być wła˛czone do identyfikacji i oznaczania wrażliwości na określona˛ liczbe˛ antybiotyków; może to być czysta hodowla lub mieszanina dwóch lub wie˛cej szczepów. Hodowle powinny należeć do co najmniej 3 pierwszych z poniższych 6 grup: 1. Bakterie o dużym znaczeniu dla zdrowia publicznego, które sa˛ rzadko izolowane w rutynowej diagnostyce, np.: Corynebacterium diphtheriae, Salmonella paratyphi A. UWAGA: Brucella i Salmonella typhi nie powinny być wykorzystywane w programach kontroli jakości, ponieważ moga˛ wywoływać poważne, przypadkowe zakażenia. 2. Nietypowe biotypy, które sa˛ cze˛sto identyfikowane nieprawidłowo, np.: H2S-dodatnie Escherichia coli, laktozoujemne E. coli, ureazoujemne Proteus. 3. Nowe lub oportunistyczne patogeny, np.: Yersinia enterocolitica, Vibrio parahaemolyticus, Burkholderia, Pseudomonas cepacia. 4. Mieszane hodowle Shigella, Citrobacter, E. coli i Klebsiella moga˛ zostać wykorzystane w celu oceny zdolności laboratorium do izolacji patogenów spośród wielu mikroorganizmów komensalnych. 5. Mieszane hodowle niepatogennych mikroorganizmów moga˛zostać wykorzystane w celu oceny zdolności rozpoznawania próbek ujemnych. 6. Bakterie o specyficznym wzorze oporności, np.: metycylinooporny S. aureus (MRSA). Surowice Program kontroli jakości powinien obejmować także badania serologiczne stosowane w poniższych zakażeniach: – kiła, – różyczka, – bruceloza, – infekcje paciorkowcowe, – dur brzuszny. Ocena i przedstawienie wyników Gdy wszystkie obje˛te programem kontroli laboratoria dostarcza˛ swoje wyniki, należy przesłać im zestaw prawidłowych odpowiedzi. W cia˛gu miesia˛ca do laboratoriów powinny zostać wysłane sprawozdania z analiza˛ wyników. Każde laboratorium oceniane jest według punktacji. Laboratorium powinno mieć nadany, sobie tylko znany numer. W ten sposób może porównać własne rezultaty z wynikami innych laboratoriów, które pozostaja˛ anonimowe. 28 Cze˛ść I Badania bakteriologiczne 29 Krew Wprowadzenie Hodowle z krwi prowadzone sa˛ w celu izolacji i identyfikacji bakterii lub innych możliwych do wyhodowania mikroorganizmów (drożdże, grzyby nitkowate). Obecność powyższych drobnoustrojów we krwi określa sie˛ mianem bakteriemii lub fungemii, która zazwyczaj jest stanem patologicznym. U zdrowych osób krew jest jałowa. Istnieje jednak kilka wyja˛tków: okresowa bakteriemia, która pojawia sie˛ krótko po ekstrakcji ze˛ba lub po innych zabiegach stomatologicznych i chirurgicznych w obre˛bie zakażonych błon śluzowych, po bronchoskopii lub po cewnikowaniu pe˛cherza. Opisany typ bakteriemi dotyczy zwykle bakterii komensalnych i zazwyczaj przemija samoistnie dzie˛ki fagocytozie zachodza˛cej w wa˛trobie i śledzionie. Sepsa jest terminem klinicznym, określaja˛cym bakteriemie˛ z objawami klinicznymi cie˛żkiej infekcji, takimi jak: dreszcze, gora˛czka, złe samopoczucie i spadek ciśnienia te˛tniczego. Skrajna˛ postacia˛ sepsy jest wstrza˛s. Wstrza˛s może być wywołany toksynami produkowanymi przez Gram-ujemne pałeczki lub Gram-dodatnie ziarenkowce. Kiedy i u kogo może wysta˛pić bakteriemia Bakteriemia jest cecha˛ niektórych chorób zakaźnych, np.: brucelozy, leptospirozy i duru brzusznego. Przewlekła bakteriemia wyste˛puje w zakażeniach łożyska naczyniowego, np.: w zapaleniu wsierdzia (endocarditis), zakażonym te˛tniaku i w zakrzepowym zapaleniu żył (thrombophlebitis). Przejściowa bakteriemia cze˛sto towarzyszy zlokalizowanym infekcjom, takim jak: zapalenie stawów (arthritis), odleżyny, zapalenie pe˛cherzyka żółciowego (cholecystitis), zapalenie jelita cienkiego i okre˛żnicy (enterocolitis), zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych (meningitis), zapalenie szpiku (osteomyelitis), zapalenie otrzewnej (peritonitis), zapalenie płuc (pneumonia), odmiedniczkowe zapalenie nerek (pyelonephritis) oraz zakażenia ran pourazowych i chirurgicznych. Może pojawić sie˛ w wyniku różnych interwencji chirurgicznych, lecz u zdrowych osób zwykle uste˛puje samoistnie. Bakteriemia i fungemia moga˛ być pochodzenia jatrogennego i wysta˛pić w wyniku wprowadzenia mikroorganizmów droga˛ dożylna˛: przez skażony płyn podawany dożylnie, cewnik lub miejsce wkłucia. Obydwa typy infekcji moga˛ wysta˛pić u osób przyjmuja˛cych dożylnie narkotyki oraz u osób w immunosupresji, do których zalicza sie˛ pacjentów zakażonych ludzkim wirusem upośledzenia odporności — z zespołem nabytego upośledzenia odporności (HIV/AIDS). Sa˛one cze˛sto wynikiem zakażeń ,,oportunistycznymi’’ mikroorganizmami i moga˛ mieć poważne konsekwencje. W tabeli 5 przedstawiono najcze˛stsze przyczyny bakteriemii i fungemii. 30 CZE˛ŚĆ I Pobieranie próbek krwi Czas pobrania próbki Jeśli to możliwe, krew powinna zostać pobrana przed zastosowaniem antybiotyków. Najlepiej przed wysta˛pieniem dreszczy lub szczytu temperatury. Zaleca sie˛ pobranie dwu lub korzystniej trzech próbek krwi w około godzinnych odste˛pach (lub krótszych, jeśli nie można opóźniać rozpocze˛cia leczenia). Rzadko wskazane jest pobranie wie˛cej niż trzech próbek. Zalety powtarzanych hodowli z krwi, to: – zmniejszone prawdopodobieństwo przeoczenia przejściowej bakteriemii; – potwierdzenie patogennej roli ,,saprofitycznych izolatów (np.: Staphylococcus epidermidis) przez wykazanie ich obecności w próbkach z kilku wkłuć. Tabela 5. Cze˛ste przyczyny bakteriemii i fungemii Gram-ujemne mikroorganizmy Gram-dodatnie mikroorganizmy Escherichia coli Klebsiella spp. Enterobacter spp. Proteus spp. Salmonella typhi Salmonella spp., inne niż S. typhi Pseudomonas aeruginosa Neisseria meningitidis Haemophilus influenzae Bacteroides fragilis (beztlenowe) Brucella spp. Burkholderia (Pseudomonas) pseudomallei (w niektórych regionach) Staphylococcus aureus S. epidermidis α-Hemolizuja˛ce (zielenieja˛ce paciorkowce) Streptococcus pneumoniae E. faecalis (grupa D) S. pyogenes (grupa A) S. agalactiae (grupa B) Listeria monocytogenes Clostridium perfringens Peptostreptococcus spp. (beztlenowe) Candida albicans i inne drożdżopodobne grzyby (np. Cryptococcus neoformans) Ważne jest pobranie próbek krwi przed wprowadzeniem antybiotykoterapii empirycznej. Jeśli to konieczne, wybór antybiotyków może zostać zmodyfikowany po uzyskaniu wyników antybiogramu. Obje˛tość próbki krwi Ponieważ liczba bakterii w mililitrze krwi jest zwykle mała, ważne jest pobranie właściwej obje˛tości krwi: 10 ml z wkłucia u dorosłych; 2 – 5 ml moga˛ być wystarczaja˛ce u dzieci, u których zwykle bakteriemia osia˛ga wyższe wartości; u niemowla˛t i noworodków cze˛sto można uzyskać maksymalnie 1 – 2 ml. Każda próbka powinna być posiana do dwóch butelek: pierwszej do optymalnej hodowli ściśle tlenowych mikroorganizmów, drugiej dla szczepów beztlenowych. Dezynfekcja skóry Skóra w miejscu wkłucia powinna być starannie przygotowana, z użyciem bakteriobójczego preparatu dezynfekuja˛cego: 2% roztworu jodyny, 10% roztworu poliwidonu jodyny, 70% alkoholu lub 0,5% roztworu chlorheksydyny w 70% alkoholu. Przed pobraniem krwi środek dezynfekuja˛cy powinien odparować z powierzchni skóry. W celu uniknie˛cia ewentualnych podrażnień przy stosowaniu jodyny skóre˛ należy przetrzeć 70% alkoholem. 31 KREW Nawet po starannym przygotowaniu skóry niektóre bakterie moga˛ przetrwać w głe˛bszych warstwach i przedostać sie˛ do krwi, np.: S. epidermidis, Propionibacterium acnes, przetrwalniki Clostridium. Pseudobakteriemia (fałszywie dodatnie hodowle z krwi) może być efektem użycia skażonych roztworów dezynfekuja˛cych, strzykawek lub igieł. Powtarzalne izolacje nie wyste˛puja˛cych powszechnie mikroorganizmów (np.: Burkholderia (Pseudomonas) cepacia, Pantoea (Enterobacter) agglomerans lub Serratia spp.) z jednego szpitala wzbudzaja˛ podejrzenie zakażenia szpitalnego i wymagaja˛ szczegółowych badań. Inna˛ przyczyna˛ skażenia próbki jest kontakt igły z niesterylnymi probówkami (lub roztworami), jeśli ta sama strzykawka została wcześniej użyta do pobrania krwi do badań biochemicznych lub odczynu opadania krwinek czerwonych (OB — odczyn Biernackiego — przyp. tłum.). Antykoagulant Zalecane jest użycie jako środka przeciwkrzepliwego polianetosulfonianu sodu (sodium polyanethol sulfonate — SPS), ponieważ hamuje on jednocześnie aktywność przeciwbakteryjna˛ osocza i fagocytów. Jeśli natychmiast po pobraniu krew zostanie dodana do wystarczaja˛cej obje˛tości (50 ml) bulionu i dokładnie wymieszana w celu uniknie˛cia tworzenia sie˛ skrzepów, zastosowanie antykoagulantu nie jest konieczne. Każdy szpital i wie˛kszość ośrodków zdrowia powinna być wyposażona w butelki z podłożem do posiewu krwi. Jeśli płynne podłoże jest niedoste˛pne, krew należy przesłać do laboratorium w probówce zawieraja˛cej sterylny roztwór antykoagulantu (cytrynian, heparyna lub SPS). W laboratorium próbka krwi natychmiast po otrzymaniu powinna zostać w warunkach aseptycznych przeniesiona do butelki z podłożem. Jeśli krew pobrana jest bez antykoagulantu, skrzep w laboratorium może zostać w aseptycznych warunkach przeniesiony do bulionu, a surowica wykorzystana do wykonania niektórych testów serologicznych (np.: odczyn Widala). Podłoża do posiewu krwi Wybór podłoży płynnych Bulion do posiewu z krwi i bulion tryptozowo-sojowy (TSB) powinny umożliwić wzrost wszystkich bakterii o znaczeniu klinicznym. Obje˛tość bulionu Optymalnie krew powinna być wymieszana z bulionem w stosunku 1:10 (5 ml krwi w 50 ml podłoża), co zmniejsza ste˛żenie antybiotyku i redukuje aktywność przeciwbakteryjna˛ ludzkiego osocza. Butelki z podłożem do posiewu krwi Należy używać butelek z podłożem do posiewu krwi (125 ml), z podwójna˛ nakre˛tka˛, której druga˛ warstwe˛ stanowi gumowy kra˛żek. Po napełnieniu butelki 32 CZE˛ŚĆ I 50 ml podłoża odkre˛cić nakre˛tke˛ o pół obrotu. Nakryć zamknie˛cie kwadratowym fragmentem folii aluminiowej i umieścić butelke˛ w autoklawie w 120°C na 20 minut. Natychmiast po autoklawowaniu, gdy butelka i podłoże sa˛ jeszcze gora˛ce, delikatnie dokre˛cić nakre˛tke˛, bez usuwania folii aluminiowej (w innym przypadku nakre˛tka nie be˛dzie sterylna). Podczas stygnie˛cia podłoża wytwarza sie˛ cze˛ściowa próżnia, która ułatwi wprowadzenie próbki krwi przez gumowa˛ warstwe˛. Tuż przed wprowadzeniem materiału do butelki należy starannie zdezynfekować gumowa˛ cze˛ść nakre˛tki. Przed wydaniem gotowej butelki z podłożem i przed jej użyciem powinno sie˛ sprawdzić przejrzystość zawartości. Podłoże, które wykazuje zme˛tnienie, nie powinno zostać użyte. Jeśli podejrzewa sie˛ obecność bakterii tlenowych (Pseudomonas, Neisseria) lub drożdży, w laboratorium po otrzymaniu próbki należy zdezynfekować gumowa˛ cze˛ść nakre˛tki i przekłuć ja˛ sterylna˛ igła˛ z bawełniana˛ zatyczka˛. Igła może zostać usunie˛ta w chwili, gdy ciśnienie wewna˛trz butelki osia˛gnie wartość ciśnienia atmosferycznego. Komercyjne butelki do posiewu krwi zawieraja˛ dwutlenek we˛gla stymuluja˛cy wzrost. W krajach, gdzie powszechnie wyste˛puje bruceloza, zalecane jest stosowanie, umożliwiaja˛cego wzrost Brucella spp., dwufazowego podłoża, złożonego z bulionu oraz stałej warstwy agaru na jednej z gładkich powierzchni naczynia (Castaneda bottle). Do hodowli wie˛kszości szczepów B. abortus wymagana jest obecność dwutlenku we˛gla. Prowadzenie hodowli z krwi Czas inkubacji Butelki do posiewu krwi powinny być inkubowane w 35 – 37°C i kontrolowane dwukrotnie w cia˛gu dnia (co najmniej przez pierwsze 3 dni) w celu oceny cech mikrobiologicznych wzrostu. Jałowe posiewy zwykle zawieraja˛ warstwe˛ osadu krwi, pokryta˛ jasnożółtym przezroczystym bulionem. Dowodem wzrostu sa˛: – kłaczkowaty osad na powierzchni warstwy krwi, – jednolite lub podpowierzchniowe zme˛tnienie, – hemoliza, – koagulacja bulionu, – kożuszek na powierzchni, – wytwarzanie gazu, – białe ziarna na powierzchni lub w głe˛bszej warstwie krwi. Kiedy tylko pojawi sie˛ wzrost, butelke˛ należy otworzyć w warunkach aseptycznych, pobrać sterylna˛ eza˛ lub pipeta˛ Pasteura niewielka˛ ilość bulionu i przygotować rozmaz barwiony metoda˛ Grama w celu oceny obecności mikroorganizmów. Jednocześnie należy wykonać przesiew eza˛ na odpowiednie podłoża: – dla Gram-ujemnych pałeczek: agar MacConkeya, agar Kliglera, podłoże ruch-indol-ureaza (MIU), cytrynianowy agar Simmonsa; – dla małych Gram-ujemnych pałeczek: agar z krwia˛; – dla gronkowców: agar z krwia˛, agar z mannitolem; – dla paciorkowców: agar z krwia˛, z kra˛żkiem z optochina˛, bacytracyna˛ i telurynem, agar z krwia˛ barania˛ do testu CAMP, agar z żółcia˛ i eskulina˛. 33 KREW W rutynowych posiewach krwi inkubacja dłuższa niż 7 dni nie jest konieczna. W niektórych przypadkach inkubacja może być przedłużona o kolejne 7 dni, na przykład przy podejrzeniu zakażenia pałeczkami Brucella lub innymi mikroorganizmami o wysokich wymaganiach odżywczych, w przypadku zapalenia wsierdzia lub jeśli pacjent jest w trakcie antybiotykoterapii. Próbki krwi z niewidocznym wzrostem Niektóre mikroorganizmy moga˛ rosna˛ć bez zme˛tnienia lub widocznych zmian w podłożu. Inne, jak na przykład pneumokoki, wykazuja˛ tendencje˛ do autolizy i szybko gina˛. Z tego powodu niektóre laboratoria prowadza˛ rutynowe przesiewy na agar czekoladowy po 18 – 24 godzinach inkubacji. Próbki z niewidocznym wzrostem moga˛ być opracowywane w siódmym dniu inkubacji przez przeniesienie kilku kropel dobrze zmieszanej hodowli krwi (z użyciem sterylnych pipet Pasteura) do probówki z podłożem tioglikolanowym, która˛ inkubuje sie˛ i obserwuje przez kolejne 3 dni. Antybiogram Przy podejrzeniu obecności gronkowców lub Gram-ujemnych pałeczek można oszcze˛dzaja˛c czas wykonać bezpośredni, niestandaryzowany antybiogram, używaja˛c dodatnich próbek jako inoculum. Sterylna˛ wymazówke˛ należy zanurzyć we wstrza˛śnie˛tym podłożu i odsa˛czaja˛c nadmiar płynu, posiać na podłoże Mueller-Hintona jak w metodzie standardowej (patrz str. 126). Wste˛pny odczyt może być wykonany po 6 – 8 godzinach inkubacji. W 95% przypadków rezultaty uzyskane ta˛ metoda˛ sa˛ zgodne ze standaryzowanym testem. Zanieczyszczenia Zanieczyszczenia hodowli krwi można unikna˛ć przez staranne przygotowanie skóry i dokładne przestrzeganie procedur aseptycznych w czasie posiewu i przesiewów. Jednakże nawet w idealnych warunkach 3 – 5% posiewów krwi jest ,,skażonych’’ bakteriami ze skóry (S. epidermidis, P. acnes, Clostridium spp., dyfteroidy) lub ze środowiska (Acinetobacter spp., Bacillus spp.). Powyższe mikroorganizmy moga˛ być w niektórych sytuacjach patogenne, wywołuja˛c np. zapalenie wsierdzia. Rzeczywista˛ infekcje˛ należy podejrzewać w poniżej wymienionych sytuacjach: – jeżeli ten sam organizm wyhodowano z dwóch butelek tej samej próbki krwi; – jeżeli ten sam organizm rośnie w hodowli wie˛cej niż jednej próbki; – jeżeli wzrost jest szybki (w cia˛gu 48 godzin); – jeżeli różne izolaty jednego gatunku wykazuja˛ ten sam biotyp i wzór lekowrażliwości. Wszystkie wyniki hodowli powinny być przedstawiane lekarzowi ła˛cznie z wynikami próbek prawdopodobnie zanieczyszczonych. Jednakże dla tych ostatnich nie należy wykonywać antybiogramu, a jedynie umieścić na wyniku odpowiedni komentarz, np. Propionibacterium acnes (flora skóry), Staphylococcus epidermidis (prawdopodobnie zanieczyszczenie). Jest to istotne dla nawia˛zania dobrej współpracy mie˛dzy lekarzami a personelem laboratorium. 34 CZE˛ŚĆ I Identyfikacja dwóch lub wie˛cej drobnoustrojów z krwi prawdopodobnie wskazuje na wieloczynnikowa˛ bakteriemie˛, która może wyste˛pować u wyniszczonych pacjentów, ale może być również rezultatem skażenia próbki. ,,Beztlenowcowa’’ bakteriemia cze˛sto wywołana jest przez kilka patogenów, np. w cie˛żkiej, piorunuja˛cej bakteriemii, zwia˛zanej z poważnym urazem lub zabiegiem chirurgicznym na jelicie grubym, wyste˛puje jeden lub kilka patogenów beztlenowych z jednym lub kilkoma patogenami tlenowymi. 35 Płyn mózgowo-rdzeniowy Wprowadzenie Badanie płynu mózgowo-rdzeniowego jest ważne w diagnostyce bakteryjnego i grzybiczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych i musi być traktowane jako badanie nadrze˛dne, wymagaja˛ce właściwej uwagi personelu laboratoryjnego. Prawidłowy płyn mózgowo-rdzeniowy jest jałowy i przejrzysty, zwykle zawiera trzy lub mniej leukocytów w 1 mm3, nie zawiera erytrocytów. Jego chemiczny i cytologiczny skład zmienia sie˛ w stanach zapalnych opon mózgowo-rdzeniowych i mózgu, np. w zapaleniu mózgu (encephalitis) lub opon mózgowo-rdzeniowych (meningitis). W rozdziale omówione zostanie jedynie badanie mikrobiologiczne, choć ocena liczby białych krwinek w płynie mózgowo-rdzeniowym ma także istotne znaczenie. Najcze˛stsze, zależnie od wieku pacjenta, przyczyny zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, zostały wymienione w tabeli 6, należy jednak pamie˛tać, że czynniki te moga˛ współistnieć. Pobieranie i transport próbek Podczas wykonywania przez lekarza punkcji le˛dźwiowej lub komorowej do dwóch sterylnych probówek należy pobrać około 5 – 10 ml płynu mózgowo-rdzeniowego. Ze wzgle˛du na niebezpieczeństwo jatrogennego bakteryjnego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, konieczna jest dokładna dezynfekcja skóry. Cze˛ść próbki płynu mózgowo-rdzeniowego jest przeznaczona do przeprowadzenia badań biochemicznych i cytologicznych, pozostała˛ obje˛tość płynu wykorzystuje sie˛ do badań mikrobiologicznych. Ponieważ komórki szybko ulegaja˛ rozpadowi, próbka powinna zostać niezwłocznie dostarczona do laboratorium i opracowana. Każde opóźnienie może być przyczyna˛ nieprawidłowej oceny liczby komórek, nie odzwierciedlaja˛cej klinicznego stanu pacjenta. Tabela 6. Cze˛ste przyczyny bakteryjnego i grzybiczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych U niemowla˛t (do 2 miesia˛ca życia) Escherichia coli Inne Enterobacteriaceae: Salmonella spp., Citrobacter spp. Listeria monocytogenes Streptococcus agalactiae (grupa B) W innych grupach wiekowych Haemophilus influenzae (otoczkowy typ b)a Neisseria meningitidis Streptococcus pneumoniae Mycobacterium tuberculosis Listeria monocytogenes b Cryptococcus neoformans b Staphylococcus spp.c a Rzadko powyżej 5. roku życia. U pacjentów z niedoborem odporności (ła˛cznie z pacjentami z zespołem nabytego niedoboru odporności — AIDS). c Zwia˛zane z zabiegami neurochirurgicznymi i drenami pooperacyjnymi. b 36 CZE˛ŚĆ I Ocena makroskopowa Wygla˛d płynu mózgowo-rdzeniowego powinien być oceniony i opisany jako: klarowny, mglisty, me˛tny, ropny, żółty (zwia˛zany z hemoliza˛ lub żółtaczka˛ ja˛der podkorowych), z domieszka˛ krwi, z włóknami lub warstwa˛ fibryny. Badanie mikroskopowe Przygotowanie próbki Jeśli w ocenie makroskopowej stwierdza sie˛ ropny płyn mózgowo-rdzeniowy (bardzo me˛tny), to badanie można przeprowadzić bez odwirowania. W pozostałych przypadkach płyn mózgowo-rdzeniowy powinien zostać odwirowany w sterylnej probówce (najlepiej o obje˛tości 15 ml) w 10 000 g przez 5 – 10 minut. Usuna˛ć supernatant, używaja˛c sterylnej pipety Pasteura z dopasowanym gumowym kapturkiem, i przenieść do innej probówki do testów biochemicznych i/lub serologicznych. Osad użyć do wykonania dalszych testów mikrobiologicznych. Mikroskopia bezpośrednia Do badania mikroskopowego użyć kropli osadu umieszczonej mie˛dzy szkiełkiem podstawowym i nakrywkowym, oceniaja˛c obecność: – leukocytów (wieloja˛drzaste neutrofile lub limfocyty), – erytrocytów, – bakterii, – grzybów. Przy podejrzeniu obecności drożdżaków Cryptococcus neoformans na szkiełku podstawowym należy zmieszać pobrany eza˛ osad z tuszem chińskim, nakryć szkiełkiem nakrywkowym i ogla˛dać preparat, poszukuja˛c typowych, otoczkowych, sferycznych form grzybów. W regionach, w których wyste˛puje śpia˛czka afrykańska, konieczne jest uważne poszukiwanie aktywnego ruchu wyposażonych w witke˛ świdrowców z rodzaju Trypanosoma. Wolno żyja˛ce w wodzie ameby (Naegleria fowleri), które dostaja˛ sie˛ do ośrodkowego układu nerwowego przez nos, wywołuja˛ rzadkie i zazwyczaj śmiertelne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. Moga˛ być widoczne w preparacie bezpośrednim w postaci aktywnie poruszaja˛cych sie˛ ogranizmów, wielkościa˛ zbliżonych do neutrofilów. Barwienie preparatów metoda˛ Grama Czynniki wywołuja˛ce zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych sa˛ cze˛sto widoczne w preparatach barwionych metoda˛ Grama, sta˛d badanie to jest bardzo istotne. Preparaty należy wysuszyć na powietrzu, utrwalić łagodnie podgrzewaja˛c i wybarwić metoda˛ Grama. Ogla˛dać pod powie˛kszeniem ×1000 (w immersji) przez co najmniej 10 minut lub do chwili stwierdzenia obecności bakterii. W tabeli 7 przedstawiono ważne obserwacje diagnostyczne zwia˛zane z różnymi formami zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych. 37 PŁYN MÓZGOWO-RDZENIOWY Tabela 7. Cechy płynu mózgowo-rdzeniowego w zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych Typ zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych Badana cecha Bakteryjne Gruźlicze Segmentowe polimorficzne neutrofile Bardzo niskie: 0,28 – 1,1 mmol/l Monocyty (młode neutrofile) Niskie: 1,1 – 2,2 mmol/l Monocyty Monocyty Niskie: 1,1 – 2,2 mmol/l Prawidłowe: 3,6 – 3,9 mmol/l Ste˛żenie białka Podwyższone Podwyższone Podwyższone Nieco podwyższone we wczesnej fazie zakażenia Preparat barwiony Zwykle widoczne ba- Rzadko dodatni kterie (Gram) (kwasooporne) Zwykle dodatni (tusz chiński) Ujemny Leukocytoza Ste˛żenie glukozy Grzybicze Wirusowe (,,aseptyczne’’) Tabela 8. Wybór podłoża dla płynu mózgowo-rdzeniowego w zależności od wyników barwienia metoda˛ Gramaa Obserwacja Gram-ujemne pałeczki Noworodki a b Gram-dodatnie ziarenkowce Inne grupy Inne grupy Noworodki wiekowe wiekowe Agar z krwia˛b + + Agar z krwia˛ z S. aureusb Agar czekoladowy + + (+) Agar MacConkeya Bulion tryptozowo-sojowy + + + + + +z kra˛żkiem z optochina˛ Gramujemne ziarenkowce Gramdodatnie pałeczki Brak mikroorganizmów + + + + (+) (+) + + + + + + + + + + + = użyć; (+) = ewentualnie użyć. Inkubacja w atmosferze wzbogaconej CO2 (eksykator). Barwienie bakterii kwasoopornych (metoda Ziehl-Neelsena) Pomimo niskiej czułości metody, przy podejrzeniu gruźliczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, zalecane jest barwienie rozmazu z osadu metoda˛ Ziehl-Neelsena. Barwiony preparat należy starannie ogla˛dać przez co najmniej 15 minut. Jeśli wynik jest ujemny, naste˛pnego dnia powtórzyć badanie, wykonuja˛c naste˛pny preparat z próbki. Hodowle Po stwierdzeniu obecności bakterii w preparacie barwionym metoda˛ Grama należy wykonać posiew na odpowiednie podłoża (tabela 8). Jeśli nie wykazano obecności drobnoustrojów, należy wykonać posiew na podłoża o szerokim spektrum wzrostu, takie jak agar z krwia˛z posianym Staphylococcus aureus, który umożliwia wzrost H. influenzae. Płytki zawieraja˛ce agar z krwia˛ i agar czekoladowy powinny być inkubowane w 35°C w powietrzu atmosferycznym wzbogaconym w dwutlenek we˛gla. Wszystkie podłoża inkubować przez 3 dni i codziennie obserwować. Przy podejrzeniu gruźliczego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych należy wykonać posiew z osadu na co najmniej 3 podłoża Löwensteina-Jensena i inkubować przez 6 tygodni. Przez pierwsze 2 – 3 dni probówki powinny być inkubowane w pozycji poziomej z odkre˛cona˛ o pół obrotu nakre˛tka˛. Wzrost 38 CZE˛ŚĆ I oceniać w cotygodniowych odste˛pach. Po zaobserwowaniu jakiegokolwiek wzrostu, najlepiej w bakteriologicznie bezpiecznych komorach, należy przygotować preparat, wysuszyć, utrwalić ciepłem i wybarwić metoda˛ Ziehl-Neelsena. Obecność kwasoopornych pra˛tków jest równoznaczna z diagnoza˛ gruźlicy. Wszystkie izolaty powinny zostać przesłane do laboratorium referencyjnego w celu potwierdzenia diagnozy i określenia lekowrażliwości. Gdy na podstawie barwienia tuszem chińskim lub objawów klinicznych podejrzewa sie˛ zakażenie Cryptococcus neoformans, należy wykonać posiewy z osadu do dwóch probówek z agarem Sabouraud i inkubować w 35°C do miesia˛ca. C. neoformans rośnie także na płytkach zawieraja˛cych agar z krwia˛, które, jeśli to wskazane, powinny być inkubowane w 35°C przez tydzień. Wste˛pna identyfikacja Wzrost na agarze MacConkeya sugeruje obecność Enterobacteriaceae, która naste˛pnie powinna być potwierdzona z użyciem metod i podłoży zalecanych dla patogenów jelitowych. Kolonie Gram-dodatnich ziarenkowców ze strefa˛ brzeżnej hemolizy typu β moga˛ wskazywać na obecność S. agalactiae (paciorkowce grupy B), która powinna zostać potwierdzona w odwrotnym teście CAMP (str. 117). Płaskie kolonie z wkle˛sła˛ cze˛ścia˛ centralna˛ i niewielka˛ zielona˛ strefa˛ hemolizy typu α to prawdopodobnie S. pneumoniae. Dla potwierdzenia należy na agarze z krwia˛, zawieraja˛cym ge˛sto posiane czyste kolonie badanego szczepu, umieścić 6-milimetrowy kra˛żek z optochina˛. Po całonocnej inkubacji pneumokoki wykaża˛ 14-milimetrowa˛ lub wie˛ksza˛ strefe˛ zahamowania wzrostu wokół kra˛żka. Najlepsze rezultaty uzyskuje sie˛ po inkubacji na agarze zawieraja˛cym krew barania˛ w atmosferze wzbogaconej w dwutlenek we˛gla. Jeśli odczyt pierwszej hodowli na agarze z krwia˛ nie jest jednoznaczny, należy przesiać szczep i powtórzyć badanie. Kolonie H. influenzae rosna˛ tylko na agarze czekoladowym oraz jako kolonie satelitarne w pobliżu gronkowcowych posiewów na agarze z krwia˛. Dalsza identyfikacja może być przeprowadzona w teście aglutynacji szkiełkowej przy użyciu surowicy odpornościowej H. influenzae typ b. Gram-ujemne dwoinki rosna˛ce na agarze z krwia˛lub agarze czekoladowym, które daja˛ szybko dodatni test oksydazowy, moga˛ być uznane za meningokoki. Potwierdzenie i identyfikacja grup serologicznych N. meningitidis (A, B, C) sa˛ oparte na odczynie aglutynacji szkiełkowej z użyciem właściwych surowic odpornościowych. Ujemny odczyn aglutynacji nie wyklucza meningokoków, ponieważ istnieja˛ co najmniej cztery dodatkowe serogrupy. W tej sytuacji dla izolowanych szczepów należy określić zdolność do rozkładu we˛glowodanów, a hodowle przesłać do referencyjnego laboratorium centralnego. Wste˛pne wyniki powinny być przedstawiane lekarzowi na każdym etapie identyfikacji (barwienie metoda˛Grama, wzrost, aglutynacja itp.), z komentarzem, że zostanie przygotowany raport końcowy. Kolonie Gram-dodatnich pałeczek z brzeżna˛ strefa˛ β-hemolizy na agarze z krwia˛ moga˛ wskazywać na Listeria monocytogenes. Zalecane jest wykonanie naste˛puja˛cych testów potwierdzenia: dodatnia reakcja z katalaza˛, ruch w podłożu płynnym lub w MIU, wzrost i czarne przebarwienie na agarze z żółcia˛ i eskulina˛. 39 PŁYN MÓZGOWO-RDZENIOWY Oznaczanie lekowrażliwości W przypadku Gram-ujemnych pałeczek i gronkowców należy zastosować standardowa˛ metode˛ kra˛żkowa˛ (Kirby-Bauera). Niepotrzebne jest oznaczanie lekowrażliwości dla szczepów Listeria monocytogenes, S. agalactiae lub N. meningitidis, ponieważ w tej grupie oporność na ampicyline˛ i benzylopenicyline˛ jest wyja˛tkowo rzadka.Wszystkie szczepy pneumokoków powinny mieć oznaczona˛na agarze z krwia˛wrażliwość na chloramfenikol i benzylopenicyline˛. W ostatnim przypadku zalecany jest test kra˛żkowy z oksacylina˛ (1 µg) (patrz str. 84, ,,Zakażenia dolnych dróg oddechowych’’). Szczepy H. influenzae powinny mieć oznaczona˛ wrażliwość na chloramfenikol na agarze czekoladowym lub wzbogaconym krwia˛. Wie˛kszość ampicylinoopornych szczepów wytwarza β-laktamazy, których obecność można wykazać wykonuja˛c szybkie testy rekomendowane do badań skriningowych dla β-laktamazododatnich gonokoków (str. 92). 40 Mocz Wprowadzenie Mocz jest materiałem najcze˛ściej pobieranym do badań. Sprawia także najwie˛cej problemów, zwia˛zanych z właściwym pobraniem, wyborem metod hodowli i interpretacja˛ wyników. Podobnie jak w przypadku innych materiałów, uzupełniaja˛ce informacje dostarczone przez lekarza pozwalaja˛ laboratorium na uzyskanie możliwie najlepszych wyników posiewu. Najcze˛stsza˛ lokalizacja˛ zakażeń układu moczowego jest pe˛cherz moczowy (cystitis) i cewka moczowa. Sta˛d infekcja droga˛ wste˛puja˛ca˛ może dotrzeć do moczowodów (ureteritis), a naste˛pnie obja˛ć nerke˛ (pyelonephritis). Kobiety sa˛ bardziej predysponowane do zakażeń układu moczowego niż me˛żczyźni, trudniejsze w ich przypadku jest także prawidłowe pobranie próbki moczu. Zarówno u kobiet, jak i me˛żczyzn zakażenie układu moczowego może przebiegać bezobjawowo, ostro lub przewlekle. Bezobjawowe infekcje moga˛ być zdiagnozowane przez posiew. Ostre zakażenie obserwowane jest cze˛ściej u kobiet (w różnym wieku); pacjenci zwykle leczeni sa˛ ambulatoryjnie i rzadko poddawani hospitalizacji. Przewlekłe zakażenie u me˛żczyzn, podobnie jak i u kobiet w każdym wieku, zwykle skojarzone jest z choroba˛ podstawowa˛ (np.: odmiedniczkowe zapalenie nerek, choroba prostaty, wady wrodzone układu moczowo-płciowego) i wia˛że sie˛ z cze˛stsza˛hospitalizacja˛. Bezobjawowe, ostre i przewlekłe zakażenia układu moczowego to trzy różne jednostki chorobowe, dlatego wyniki badań laboratoryjnych cze˛sto wymagaja˛ różnej interpretacji. Bezobjawowe odmiedniczkowe zapalenie nerek u kobiet może pozostać nierozpoznane, cze˛sto diagnozowane jest dopiero po wykonaniu dokładnego ilościowego badania mikrobiologicznego moczu. Wyste˛puja˛ce powszechnie przewlekłe zapalenie prostaty cze˛sto jest przyczyna˛ nawracaja˛cych zakażeń układu moczowego. Niezależnie od typu najcze˛stszym czynnikiem etiologicznym zakażenia układu moczowego sa˛ bakterie jelitowe, w tym izolowana znacznie cze˛ściej niż inne patogeny Escherichia coli. U około 10% pacjentów moga˛ być obecne dwa patogeny jednocześnie odpowiedzialne za proces chorobowy. Obecność trzech i wie˛cej różnych drobnoustrojów w posiewie moczu zdecydowanie wskazuje na niewłaściwe pobranie materiału do badania lub zanieczyszczenie próbki. Obecność licznych patogenów obserwowana jest u pacjentów z założonym na stałe cewnikiem moczowym. Pobieranie materiału do badania W badaniu mikrobiologicznym moczu trudno przecenić znaczenie prawidłowego pobrania próbek moczu, transportu do laboratorium oraz badania wste˛pnego i posiewu. Laboratorium jest odpowiedzialne za dostarczenie lekarzowi sterylnych, szklanych lub plastikowych kubków, słoików czy innych odpowiednich pojemników o szerokim wlocie. Powinny one zostać wysterylizowane gora˛cym suchym powietrzem w autoklawie, naste˛pnie szczelnie zamknie˛te, a wieczka przykryte folia˛ aluminiowa˛. 41 MOCZ Próbka moczu może zostać pobrana z wykorzystaniem metod chirurgicznych, np.: przez nakłucie nadłonowe pe˛cherza moczowego, cystoskopie˛ lub cewnikowanie. W innym przypadku laboratorium powinno dopilnować, aby mocz został pobrany ze środkowego strumienia po dokładnym umyciu okolicy cewki moczowej, zwłaszcza u kobiet i dzieci. Ponieważ mocz sam jest dobra˛ pożywka˛ dla drobnoustrojów, posiew powinien zostać wykonany w cia˛gu 2 godzin od pobrania lub przechowywany w chłodziarce w 4°C do czasu dostarczenia do laboratorium i posiany nie później niż 18 godzin od pobrania. Jeśli to możliwe, do posiewu należy użyć moczu pobranego rano. Zaleca sie˛ poprosić pacjenta w przeddzień wieczorem o powstrzymanie sie˛ od oddania moczu do chwili pobrania próbki. Pacjentki powinny: 1. Umyć dokładnie re˛ce woda˛ z mydłem i wytrzeć w czysty re˛cznik. 2. Rozchylić wargi sromowe, łechtaczke˛ i wargi sromowe przemyć starannie sterylnym płatkiem gazy i ciepła˛ woda˛ z mydłem, w kierunku od przodu do tyłu. Nie powinno sie˛ używać środków do dezynfekcji. 3. Spłukać dokładnie łechtaczke˛ i wargi sromowe ciepła˛ woda˛ i osuszyć sterylnym płatkiem gazy. Podczas tej czynności wargi sromowe powinny pozostawać rozchylone, pacjentka nie powinna dotykać umytej powierzchni palcami. 4. Oddać niewielka˛ ilość moczu. Naste˛pnie zebrać wie˛kszość pozostałego moczu do sterylnego pojemnika, zamykaja˛c pokrywke˛ zaraz po pobraniu próbki. Jest to próbka ze środkowego strumienia moczu. 5. Zanieść do piele˛gniarek zamknie˛ty pojemnik, który powinien zostać niezwłocznie dostarczony do laboratorium. Pacjenci powinni: 1. Umyć dokładnie re˛ce woda˛ z mydłem i wytrzeć w czysty re˛cznik. 2. Odsuna˛ć napletek (jeśli pacjent nie jest obrzezany) i umyć żoła˛dź sterylnym płatkiem gazy i ciepła˛ woda˛ z mydłem. Nie powinno sie˛ używać środków do dezynfekcji. 3. Spłukać dokładnie żoła˛dź ciepła˛ woda˛ i osuszyć sterylnym płatkiem gazy. Podczas tej czynności pacjent nie powinien dotykać palcami umytej powierzchni. 4. Nasuna˛ć napletek i oddać niewielka˛ ilość moczu. Trzymaja˛c nasunie˛ty napletek pacjent powinien zebrać wie˛kszość pozostałego moczu do sterylnego pojemnika, zamykaja˛c pokrywke˛ zaraz po pobraniu. Jest to próbka ze środkowego strumienia moczu. 5. Zanieść do piele˛gniarek zamknie˛ty pojemnik, który powinien zostać niezwłocznie dostarczony do laboratorium. Dla pacjentów leża˛cych obowia˛zuje ta sama procedura, z wyja˛tkiem konieczności skorzystania z pomocy piele˛gniarki lub, jeśli to konieczne, wykonania przez nia˛ całej procedury przygotowania pacjenta przed oddaniem moczu. W obydwu sytuacjach powinny zostać podje˛te starania, aby właściwie pobrać mocz do sterylnego pojemnika oraz aby niezwłocznie przesłać do laboratorium próbke˛ wraz z informacjami o pacjencie, rozpoznaniem klinicznym, z zachowaniem wymaganych procedur. 42 CZE˛ŚĆ I Niemowle˛ta i dzieci Uzyskanie właściwie pobranej próbki moczu w przypadku chorych leża˛cych i nie współpracuja˛cych niemowla˛t oraz dzieci może stanowić problem. Należy podać dziecku wode˛ lub inny napój do wypicia. Umyć narza˛dy płciowe zewne˛trzne. Dziecko można posadzić na kolanach matki, piele˛gniarki lub innej osoby z personelu medycznego, która powinna zache˛cić dziecko do oddania jak najwie˛kszej ilości moczu do sterylnego pojemnika. Pojemnik należy zamkna˛ć i dostarczyć do laboratorium, gdzie niezwłocznie podje˛ta zostanie diagnostyka. Hodowla i interpretacja Wszystkie próbki moczu dostarczone do laboratorium medycznego powinny być od razu posiane lub umieszczone w chłodziarce w 4°C do momentu wykonania badania. Procedura badania obejmuje naste˛puja˛ce etapy: 1. Barwienie preparatów metoda˛ Grama. 2. Testy przesiewowe w kierunku znamiennej bakteriurii. 3. Hodowle próbek moczu, w których wykazano obecność drobnoustrojów w badaniach przesiewowych i wszystkich próbek uzyskanych podczas cystoskopii, przez nakłucie nadłonowe (suprapubic bladder puncture — SBP) i cewnikowanie. 4. Badanie lekowrażliwości izolatów bakteryjnych o znaczeniu klinicznym. Przygotowanie preparatów i barwienie metoda˛ Grama jest ważnym elementem diagnostyki laboratoryjnej. Używaja˛c sterylnej pipety Pasteura (jedna dla jednej próbki) należy nanieść na szkiełko krople˛ wstrza˛śnie˛tego, nie odwirowanego moczu. Pozostawić krople˛ do wyschnie˛cia, bez rozmazywania, utrwalić przez podgrzanie i wybarwić. Ogla˛dać używaja˛c olejku immersyjnego (w powie˛kszeniu × 600 lub wie˛cej) — poszukiwać bakterii, polimorficznych leukocytów i komórek płaskonabłonkowych. Jedna lub wie˛cej komórek bakteryjnych w polu widzenia w olejku immersyjnym zwykle wskazuje na obecność 105 lub wie˛cej bakterii w mililitrze próbki. Obecność jednego lub wie˛cej leukocytów w polu widzenia w olejku immersyjnym jest kolejna˛ wskazówka˛ zakażenia układu moczowego. W niezakażonych próbkach moczu bakterie i leukocyty wyste˛puja˛w niewielkiej liczbie lub nie stwierdza sie˛ ich wcale. W próbkach pochodza˛cych od pacjentek wykazanie licznych komórek płaskonabłonkowych, bez lub z obecnościa˛ bakterii, wskazuje na zanieczyszczenie flora˛ pochwowa˛ i konieczność powtórnego badania z ocena˛ liczby bakterii w polu widzenia. Jeśli konieczny jest szybki wynik badania, lekarzowi powinna być dostarczona wste˛pna ocena barwionych preparatów z informacja˛ o prowadzonej hodowli. Metody badań przesiewowych Brak leukocytów i bakterii w preparatach moczu barwionych metoda˛ Grama, pochodza˛cych z próbek pobranych według powyżej opisanych zasad, wyklucza infekcje˛. ,,Ujemna’’ próbka moczu w starannie wykonanym badaniu mikroskopowym nie musi być poddana hodowli. Alternatywnym prostym i skutecznym testem przesiewowym jest test paskowy na obecność esterazy leukocytowej 43 MOCZ (redukcji azotanów). Paski zanurza sie˛ w próbce moczu zgodnie z instrukcja˛ zawarta˛ w ulotce. Różowe zabarwienie jest dodatnim wynikiem i wskazuje na obecność esterazy leukocytowej i/lub bakteriurie˛ rze˛du 105 w 1 ml. Próbki dodatnie w testach przesiewowych należy jak najszybciej poddać hodowli, aby zapobiec przerostowi przez nieznacza˛ce szczepy. Jeśli paski nie wykaża˛ różowego zabarwienia, badanie przesiewowe interpretowane jest jako ujemne i hodowla nie jest konieczna. Testy paskowe nie sa˛ wystarczaja˛co czułe, aby wykryć bakteriurie˛ mniejsza˛ niż 105 komórek w 1 ml moczu. Posiew ilościowy i wste˛pna identyfikacja Zalecane sa˛ dwie metody posiewu ilościowego i wste˛pnej identyfikacji: metoda z użyciem kalibrowanej ezy oraz metoda z użyciem zanurzonego papierowego filtra paskowego. Metoda z użyciem kalibrowanej ezy Zalecane jest użycie kalibrowanej plastikowej lub platynowej ezy, za pomoca˛ której należy przenieść 1 µl moczu na podłoże do hodowli (agar MacConkeya z fioletem krystalicznym i nieselektywny agar z krwia˛). 1. Wstrza˛sna˛ć delikatnie mocz, a naste˛pnie przechylić i 1-mikrolitrowa˛ eza˛ dotkna˛ć powierzchni w taki sposób, aby zawiesić w niej płyn. Nigdy nie zanurzać oczka ezy w moczu. 2. Umieścić 1 µl moczu na podłożu agarowym z krwia˛i rozmazać, tworza˛c prosta˛ linie˛ do środka płytki (1), naste˛pnie ge˛stym zygzakiem, pod ka˛tem w prawo, przez pocza˛tkowa˛ linie˛ (2) i na koniec skośnym zygzakiem, przecinaja˛cym dwa poprzednie pasma (3) (ryc. 3). 3. Posiać na podłoże MacConkeya w ten sam sposób. 4. Inkubować płytki przez noc w 35°C. Agar z krwia˛ i podłoże MacConkeya można zasta˛pić innymi nieselektwnymi podłożami (np.: CLED1, agar z fioletem krystalicznym i laktoza˛). Metoda pasków bibułowych Metoda pasków bibułowych Leigh&Williams 2 polega na absorpcji określonej ilości moczu, który naste˛pnie jest przenoszony na płytke˛ z właściwym podłożem agarowym. Paski o długości 7,5 cm i szerokości 0,6 cm moga˛ być przygotowane na miejscu z użyciem specjalnego typu bibuły (patrz ryc. 4). Sa˛ oznaczone ołówkiem z jednej strony — 1,2 cm od końca. Metoda pasków bibułowych przed wprowadzeniem do rutynowych badań powinna zostać porównana z metoda˛ z użyciem kalibrowanej ezy. Bibułowe paski należy przygotować w odpowiedniej ilości, umieścić we właściwym pojemniku i autoklawować. Sterylne paski sa˛ komercyjnie doste˛pne. 1 CLED: z niedoborem cystyny, laktozy i elektrolitów; Cystine-Lactose-Electrolyte Deficient. Leigh D.A., Williams J.D.: Metoda wykorzystywana do oznaczenia znamiennej bakteriurii w szerokiej grupie pacjentów. Journal of Clinical Pathology, 1964, 17: 498 – 503. 2 44 CZE˛ŚĆ I Ryc. 3. Posiew bakterii na płytki hodowlane. 1,2 cm 0,6 cm 6,3 cm WHO 91125 Ryc. 4. Bibułowy pasek stosowany w metodzie Leigh & Williamsa. CFU — colony-forming units (jednostki tworza˛ce kolonie) Ryc. 5. Odciski zanurzonych w moczu bibułowych pasków na płytce agarowej i przeliczenie liczby kolonii na liczbe˛ żywych komórek bakterii w 1 ml. Dla każdej badanej próbki moczu wyja˛ć z pojemnika sterylny pasek. Oznaczony koniec zanurzyć do wyznaczonej linii w dokładnie wstrza˛śnie˛tej próbce moczu. Pasek natychmiast wycia˛gna˛ć, nadmiar moczu zostanie wchłonie˛ty. Obszar poniżej oznaczenia, który zagina sie˛ na kształt litery ,,L’’, należy umieścić na 2 – 3 sekundy na płytce z agarem brolacynowym1 lub agarze z fioletem krystalicznym i laktoza˛. Na jednej płytce można posiać kilka pasków, dziela˛c powierzchnie˛ na maksymalnie 16 prostoka˛tów (ryc. 5). Należy zapewnić możliwość identyfikacji każdego prostoka˛ta na podstawie numeru lub nazwiska pacjenta. Wycia˛gna˛ć drugi pasek z pojemnika i dokładnie powtórzyć procedure˛, wykonuja˛c kolejne odciski identycznie jak pierwsze. Po naniesieniu duplikatu 1 Agar laktozowo-cystynowy z błe˛kitem bromotymolowym. 45 MOCZ odcisków płytke˛ inkubować w 35 – 37°C, a naste˛pnie zliczyć wyrosłe kolonie z powierzchni każdego odcisku paska. Posługuja˛c sie˛ ryc. 5, na podstawie średniej liczby kolonii każdej pary pasków, można określić liczbe˛ bakterii w 1 ml moczu. Natychmiast po wykonaniu powyższej procedury, używaja˛c sterylnej ezy, posiać próbki moczu na pół płytki agaru MacConkeya (z fioletem krystalicznym). Hodowla na agarze z krwia˛ ułatwia szybka˛ identyfikacje˛ Gram-dodatnich ziarenkowców. Płytki należy inkubować przez noc w temperaturze 35 – 37°C i naste˛pnego dnia ocenić wzrost. Do identyfikacji użyć izolowanych kolonii o podobnym wygla˛dzie. Jeśli istnieje taka potrzeba, inoculum konieczne do oznaczenia lekowrażliwości szczepu metoda˛ dyfuzyjno-kra˛żkowa˛ można przygotować z każdej z płytek (str. 112). W ten sposób naste˛pnego dnia doste˛pne be˛da˛ zarówno wyniki identyfikacji, jak i lekowrażliwości. Interpretacja wyników posiewu ilościowego moczu Przez wiele lat warunkiem rozpoznania zakażenia układu moczowego było wykazanie obecności co najmniej 105 jednostek tworza˛cych kolonie (CFU — colony-forming units) w 1 ml odpowiednio pobranego moczu ze środkowego strumienia. Założenie to zostało zakwestionowane; według niektórych ekspertów obecność 104 CFU lub mniej może świadczyć o infekcji. Inni twierdza˛, że obecność polimorficznych leukocytów odgrywa istotna˛ role˛ w patologii i klinicznej manifestacji zakażenia układu moczowego. Nie można zdefiniować precyzyjnie minimalnej liczby bakterii w 1 ml moczu, która jednoznacznie świadczy o ZUM. Ogólne zasady sporza˛dzania raportów przedstawiono poniżej. Kategoria 1: mniej niż 104 CFU w 1 ml. W raporcie prawdopodobnie brak ZUM. (Wyja˛tki: jeśli mniej niż 104 CFU w 1 ml moczu pobranego bezpośrednio z pe˛cherza moczowego przez nakłucie nadłonowe lub cystoskopie˛; u kobiet z objawami zakażenia lub leukocyturia˛ należy przeprowadzić identyfikacje˛ i wykonać antybiogram.) Kategoria 2: 104 – 105 CFU w 1 ml. Jeśli pacjent bez objawów, powtórzyć badanie moczu. Jeśli pacjent zgłasza objawy zakażenia układu moczowego, przeprowadzić identyfikacje˛ i wykonać antybiogram jednego lub dwu różnych obecnych w moczu typów kolonii bakteryjnych. Powyższa liczba bakterii przemawia za zakażeniem układu moczowego u pacjentów z objawami lub z leukocyturia˛. Jeśli liczba bakterii, jakość próbki moczu lub charakter zgłaszanych objawów wzbudzaja˛ wa˛tpliwości, należy powtórzyć badanie. Raport powinien zawierać wartość CFU. Kategoria 3: wie˛cej niż 105 CFU w 1 ml. Przedstawić wynik lekarzowi, przeprowadzić identyfikacje˛ i wykonać antybiogram jednego lub dwu różnych obecnych w moczu typów kolonii bakteryjnych. Powyższa liczba bakterii zdecydowanie wskazuje na zakażenie układu moczowego u wszystkich pacjentów, również u kobiet bez objawów zakażenia. Jeśli w próbkach moczu kategorii 2 lub 3 obecne sa˛ wie˛cej niż dwa różne typy bakterii, należy przedstawić wynik jako: ,,Prawdopodobnie materiał zanieczyszczony. Prosze˛ dostarczyć świeża˛ próbke˛ moczu ze środkowego strumienia’’. 46 CZE˛ŚĆ I Identyfikacja Identyfikacja powinna zostać przeprowadzona możliwie najszybciej. Jeśli masywna infekcja dróg moczowych wywołana jest przez E. coli, do identyfikacji czerwonych kolonii na podłożu agarowym MacConkeya należy użyć szybkiego testu. Test β -glukuronidazowy do szybkiej identyfikacji E. coli 1 Test określa zdolność drobnoustroju do wytwarzania enzymu β-glukuronidazy. Enzym hydrolizuje kwas 4-nitrofenylo-β-D-glukopyranozydouronowy (PGUA), produkt reakcji kwasu glukuronowego i p-nitrofenolu. Pojawienie sie˛ żółtego zabarwienia wskazuje na reakcje˛ dodatnia˛. Procedura 1. Przygotować ge˛sta˛ mleczna˛ zawiesine˛ bakterii w małej probówce zawieraja˛cej 0,25 ml fizjologicznego roztworu soli. Zawiesina powinna zostać przygotowana z kolonii rosna˛cych na podłożu agarowym MacConkeya. 2. Rozpuścić 300 mg kwasu 4-nitrofenylo-β-D-glukopyranozydouronowego (PGUA) i 100 mg wycia˛gu drożdży (Oxoid L21)2 w 20 ml buforu fosforanowego (bufor Tris, pH 8,5). Uzyskać pH 8,5 ± 0,1. Dodać 0,25 ml podłoża do każdej z przygotowanych sterylnych probówek. Zamkna˛ć probówki. Oznaczyć probówki jako PGUA i wpisać date˛. 3. Zawiesić w jednej z probówek z PGUA badana˛ ge˛sta˛ zawiesine˛ bakterii. Inkubować probówke˛ przez 4 godziny w 35°C. Pojawienie sie˛ żółtego zabarwienia wskazuje na obecność β-glukuronidazy (wynik dodatni); jeśli nie pojawia sie˛ zmiana zabarwienia, wynik jest ujemny. Obecność żółtego pigmentowania wskazuje na brak wiarygodności testu; w takich przypadkach test należy powtórzyć. Szczepy kontrolne: Escherichia coli dodatni (żółty) wynik Shigella flexneri ujemny (bezbarwny) wynik Tabletki PGUA sa˛ doste˛pne komercyjnie. Oznaczanie lekowrażliwości Antybiogram (str. 112) powinien być wykonany tylko dla istotnych, według przedstawionych powyżej kryteriów, czystych hodowli zawieraja˛cych kolonie o jednakowej morfologii. Oznaczanie wrażliwości ma zazwyczaj wie˛ksze znaczenie dla pacjentów hospitalizowanych lub z nawracaja˛cymi zakażeniami dróg moczowych w wywiadzie. Szczepy uzyskane w posiewach od pacjenta z ZUM wyste˛puja˛cym po raz pierwszy moga˛ nie wymagać wykonania antybiogramu. 1 Kilian M., Borrow P.: Rapid diagnosis of Enterobacteriaceae. 1. Detection of bacterial glycosidases. Acta Pathologica et Microbiologica Scandinavica, Section B, 1976, 84: 245 – 251. 2 Doste˛pny z Oxoid Ltd, Wade Road, Basingstoke, Hampshire, RG24 8PW, England. 47 Kał Wprowadzenie Zakażenia bakteriami jelitowymi, wywołuja˛cymi biegunke˛, czerwonke˛ i gora˛czki jelitowe, stanowia˛ ważny problem zdrowotny na świecie. Infekcje biegunkowe sa˛ druga˛ po chorobach sercowo-naczyniowych, a wśród dzieci najcze˛stsza˛ przyczyna˛ zgonu. W krajach rozwijaja˛cych sie˛ z powodu biegunek rocznie umiera 1,5 miliona dzieci w wieku od 1 roku do 4 lat. Ryzyko zgonu w tej grupie wiekowej jest 600-krotnie wyższe niż w krajach rozwinie˛tych. W niektórych krajach rozwijaja˛cych sie˛ biegunki wyste˛puja˛ u dzieci dziesie˛ć lub wie˛cej razy w cia˛gu roku. Dzieci ulegaja˛c zakażeniom licznymi patogenami, cze˛sto bez wysta˛pienia biegunki, wydalaja˛ z kałem potencjalnie chorobotwórcze szczepy. Prowadzone obserwacje wykazały, że aktywna immunizacja przez wielokrotna˛ ekspozycje˛ oraz przedłużony okres karmienia piersia˛ moga˛ zapobiegać zachorowaniom i zabezpieczać przed wysta˛pieniem biegunek. Na uwage˛ zasługuja˛ trudności w ustaleniu czynnika etiologicznego biegunki w hodowli z pojedynczej próbki kału. Ze wzgle˛du na wzrost cze˛stości zakażeń HIV/AIDS i stosowanie chemioterapii immunosupresyjnej, biegunka pojawiaja˛ca sie˛ u pacjentów z niedoborem odporności stanowi coraz poważniejsze wyzwanie. Zakażenia te wyste˛puja˛ w późniejszym okresie choroby, chorzy z HIV/AIDS sa˛ cze˛sto leczeni do końca życia, a uzyskanie poprawy jest trudne. Lista bakterii jelitowych wywołuja˛cych biegunke˛ u pacjentów z HIV/AIDS jest długa i obejmuje: Campylobacter, Salmonella, Shigella oraz mykobakterie. Ocenia sie˛, że salmonelozy u pacjentów z HIV/AIDS, w porównaniu do osób niezakażonych, wyste˛puja˛ 20-krotnie cze˛ściej, a 5-krotnie cze˛ściej dochodzi u nich do bakteriemii. W Zairze 40% pacjentów z HIV/AIDS zgłaszało przewlekła˛ biegunke˛, a u 84% pacjentów z biegunka˛ utrzymuja˛ca˛ sie˛ dłużej niż miesia˛c wykryto zakażenie HIV. Czynniki etiologiczne i objawy kliniczne Rodzaj Salmonella obejmuje ponad 2000 serotypów. Wiele z nich może wywoływać infekcje zarówno u ludzi, jak i u zwierza˛t domowych. U ludzi zakażenie prowadzi do rozwoju nieżytu żoła˛dka i jelit, duru brzusznego i bakteriemii z zaje˛ciem lub bez zaje˛cia innych narza˛dów. Nieżyt żoła˛dka i jelit wywołany przez Salmonella zaczyna sie˛ zwykle nudnościami, wymiotami, kolkowym bólem brzucha i biegunka˛ 8 – 48 godzin od spożycia skażonego pokarmu. Bez leczenia objawy utrzymuja˛ sie˛ zazwyczaj 3 – 5 dni. Leczenie przeciwbakteryjne nie przyspiesza usta˛pienia objawów klinicznych, a może przedłużyć okres rekonwalescencji i bezobjawowego stanu nosicielstwa. W niepowikłanych przypadkach zakażeń wykonanie antybiogramu i leczenie przeciwbakteryjne nie sa˛zalecane. Zastosowanie antybiotyków jest wskazane w przypadku wysta˛pienia bakteriemii. Niektórzy pacjenci staja˛c sie˛ bezobjawowymi nosicielami Salmonella spp. moga˛ wydalać bakterie z kałem i moczem przez rok lub dłużej. Dodatnie posiewy z kału uzyskuje sie˛ przez okres dłuższy niż rok u około 3% pacjentów z durem brzusznym i u 0,2 – 0,6% pacjentów z zakażeniem innym serotypem Salmonella. 48 CZE˛ŚĆ I Zakażenie Shigella spp. może przebiegać w różny sposób: od bezobjawowych infekcji przez biegunke˛ bez gora˛czki do czerwonki o cie˛żkim przebiegu. Objawy obejmuja˛ kolkowe bóle brzucha, nieefektywne i bolesne parcie (tenesmus) oraz cze˛ste oddawanie małej obje˛tości podbarwionych krwia˛stolców. Shigella spp. jest główna˛ przyczyna˛ czerwonki bakteryjnej, przed enteroinwazyjnymi i enterokrwotocznymi E. coli. Wiele przypadków choroby o średnim nasileniu nie wymaga leczenia przyczynowego. Jednakże w cie˛żkich zakażeniach lub gdy istnieje ryzyko rozwoju wtórnego rozsiewu w organizmie, wskazane jest zastosowanie antybiotykoterapii po wcześniejszym określeniu lekowrażliwości, koniecznym ze wzgle˛du na duża˛ w wielu krajach oporność na powszechnie stosowane antybiotyki. Znane sa˛ cztery grupy Shigella, obejmuja˛ce 39 serotypów i podtypów. Grupa A (S. dysenteriae), grupa B (S. flexneri), obejmuja˛ca liczne serotypy grupa C (S. boydii) oraz grupa D (S. sonnei), do której należy tylko jeden serotyp. Najcze˛ściej izolowanymi gatunkami Shigella w krajach rozwijaja˛cych sie˛ sa˛ S. dysenteriae i S. flexneri, podczas gdy w krajach rozwinie˛tych wyste˛puje głównie S. sonnei. Zidentyfikowano co najmniej sześć różnych klas Escherichia coli wywołuja˛cych biegunki: enteropatogenne E. coli (EPEC), enterotoksyczne E. coli (ETEC), enterokrwotoczne i produkuja˛ce werotoksyne˛ E. coli (EHEC lub VTEC), enteroinwazyjne E. coli (EIEC), enteroadhezyjne E. coli (EAEC) oraz enteroagregacyjne E. coli (EAggEC). Cztery z powyższych klas sa˛ cze˛sta˛ przyczyna˛ chorób biegunkowych w krajach rozwijaja˛cych sie˛. Jednakże identyfikacja szczepów wymaga przeprowadzenia testów serologicznych, testów toksyczności na hodowlach komórkowych, oceny patogeniczności na zwierze˛tach oraz zastosowania sond genetycznych, które pozostaja˛ poza zakresem możliwości laboratorium średniego stopnia referencyjności. Wste˛pna identyfikacja najcze˛ściej wyste˛puja˛cego serotypu O157:H7 szczepów VTEC możliwa jest na podstawie charakterystycznie ujemnego testu z sorbitolem. Test ten jednak jest ujemny także w przypadku E. fergusonii i E. hermanii. Sorbitoloujemne szczepy E. coli wymagaja˛ wie˛c dodatkowej identyfikacji przez serotypowanie z użyciem surowicy odpornościowej E. coli O157. Wykazanie wytwarzania werotoksyny wskazuje na szczep VTEC. Cholera jest typowym przykładem toksycznej infekcji. Wszystkie objawy sa˛ zwia˛zane z utrata˛ płynów, spowodowana˛ działaniem wytwarzanej w jelitach enterotoksyny Vibrio cholerae. Stolec jest obfity, wodnisty i nie zawiera komórek zapalnych. Głównym celem leczenia jest uzupełnianie utraty płynów, a leczenie przeciwbakteryjne ma znaczenie jedynie drugoplanowe. V. cholerae rozprzestrzenia sie˛ bardzo szybko. Na podstawie różnic w antygenach somatycznych O wyróżnia sie˛ kilka serotypów, a serotyp O1 wyste˛puje w dwóch odmianach, określanych jako ,,klasyczna’’ i ,,El Tor’’. Do 1992 roku uważano, że tylko serotyp O1 V. cholerae (klasyczny lub El Tor) może wywołać epidemie˛ cholery, a pozostałe serogrupy odpowiedzialne sa˛ za sporadyczne przypadki cholery i zakażenia pozajelitowe. W 1992 roku na wschodnim wybrzeżu Indii wybuchła epidemia, która szybko rozprzestrzeniła sie˛ na sa˛siednie kraje. Ta epidemia była wywołana V. cholerae należa˛cym do wcześniej nieznanej serogrupy O139 Bengal. V. cholerae O139 izolowano dotychczas w 10 krajach południowo-wschodniej Azji, ale serotyp ten wydaje sie˛ zanikać. V. parahaemolyticus i kilka innych gatunków Vibrio (V. fluvialis, V. hollisae, V. mimicus) i Aeromonas (A. hydrophila, A. sobria, A. caviae) wywołuja˛ zatrucia pokarmowe lub nieżyty żoła˛dkowo-jelitowe u osób spożywaja˛cych surowe lub niedogotowane owoce morza. 49 KAŁ W wie˛kszości regionów świata Campylobacter jejuni i C. coli okazały sie˛ głównymi patogenami jelitowymi, które sa˛ izolowane równie cze˛sto jak Salmonella i Shigella spp. Badania przeprowadzone wśród dzieci w Afryce i Azji wykazały, że cze˛stość zakażeń wynosi od 19 do 38%, a bezobjawowe nosicielstwo dotyczy od 9 do 40% badanych. Choroba może mieć różny przebieg, od samoograniczaja˛cego sie˛, krótkotrwałego zapalenia jelita cienkiego po piorunuja˛ce zapalenie jelita cienkiego i okre˛żnicy, z cie˛żka˛ biegunka˛, kolka˛ brzuszna˛, gora˛czka˛ i bólami mie˛śniowymi. Stolce sa˛ pocza˛tkowo śluzowe i płynne, a naste˛pnie moga˛ zmienić sie˛ w chlustaja˛ce, wodniste, zawieraja˛ce krew i rope˛. Objawy wycofuja˛ sie˛ zwykle po tygodniu. U około 25% pacjentów dochodzi do nawrotu, który zwykle ma łagodniejszy przebieg. Infekcja uste˛puje zazwyczaj samoistnie, bez antybiotykoterapii, sta˛d określanie lekowrażliwości izolowanych szczepów nie jest konieczne. Arcobacter butzleri, traktowane dotychczas jako rosna˛ce w niskiej temperaturze Campylobacter, zostały ostatnio uznane za przyczyne˛ biegunek wyste˛puja˛cych u dzieci w krajach rozwijaja˛cych sie˛. Wyste˛powanie u ludzi infekcji wywołanych Yersinia enterocolitica obserwowano głównie w północnej Europie, Japonii i Stanach Zjednoczonych. Wie˛kszość izolowanych patogenów pochodziła od dzieci ze sporadycznie wyste˛puja˛ca˛ biegunka˛. Clostridium difficile jest główna˛ przyczyna˛ biegunki poantybiotykowej. Może wywołać różne postacie choroby, od średnio nasilonej biegunki do potencjalnie śmiertelnego pseudobłoniastego zapalenia okre˛żnicy. Rozpoznanie rzekomo błoniastego colitis jest możliwe na podstawie badania kolonoskopowego, a potwierdzenie laboratoryjne w tym przypadku nie jest konieczne. W diagnostyce laboratoryjnej doste˛pne sa˛ komercyjne testy, w tym hodowla, test aglutynacji lateksowej wykrywaja˛cy białka komórkowe, testy ELISA wykrywaja˛ce cytotoksyny i/lub enterotoksyny, hodowle komórkowe do oceny toksyczności cytotoksyn. Wielu pacjentów szpitalnych, zwłaszcza leczonych antybiotykami o szerokim spektrum działania, wydala bakterie z kałem przy braku objawów. Dlatego też hodowla bez wykazania obecności toksyn ma ograniczona˛wartość diagnostyczna˛. Rotawirusy sa˛ jedynym niebakteryjnym czynnikiem opisanym w tym miejscu. Inne wirusy moga˛ także być przyczyna˛ biegunek, ale rotawirus wyste˛puje podobnie cze˛sto zarówno w krajach rozwijaja˛cych sie˛, jak i w krajach rozwinie˛tych. Infekcje zwykle pojawiaja˛ sie˛ u dzieci mie˛dzy 6. a 18. miesia˛cem życia, cze˛ściej w chłodnych miesia˛cach roku. Rozpoznanie może być potwierdzone laboratoryjnie na podstawie testu immunoenzymatycznego (ELISA) lub prostszego i bardziej praktycznego testu aglutynacji lateksowej. Odczynniki potrzebne do wykonania powyższych badań sa˛komercyjnie doste˛pne, lecz drogie. Właściwe ukierunkowanie diagnostyki laboratoryjnej Laboratorium ściśle współpracuja˛ce ze szpitalem lub klinika˛ w krajach rozwijaja˛cych sie˛ może szybko zostać obcia˛żone nadmierna˛ liczba˛ próbek do badań. W wie˛kszości przypadków czerwonki bakteryjnej i biegunek wykonanie posiewu nie jest konieczne do podje˛cia efektywnego leczenia, ponieważ pacjenci wymagaja˛ jedynie nawodnienia, a nie antybiotykoterapii. W niektórych przypadkach (np. 50 CZE˛ŚĆ I pacjenci z durem brzusznym) do podje˛cia właściwego leczenia wyniki hodowli sa˛ niezbe˛dne. Problem, jak najlepiej wykorzystać ograniczone możliwości (diagnostyki laboratoryjnej — przyp. tłum.) jest wcia˛ż rozważany. Cze˛sto najważniejsze staja˛ sie˛ aspekty zdrowia publicznego, sta˛d laboratorium jest zobligowane do dostarczania danych dotycza˛cych powszechnie wyste˛puja˛cych w danym regionie patogenów i ich wrażliwości na antybiotyki, a także powinno uczestniczyć w badaniu epidemiologicznym. Konieczna jest ścisła współpraca klinicystów z laboratorium. Utworzenie przez laboratorium wartościowej bazy danych jest możliwe na podstawie systematycznie przeprowadzanych, randomizowanych badań, szpitalnych lub klinicznych pacjentów z biegunka˛. Badanie proporcjonalnej cze˛ści pacjentów umożliwia ograniczenie liczby próbek, z jednoczesna˛pełna˛diagnostyka˛każdej z nich. Jeśli badania wykonuje sie˛ u określonych, pojedynczych chorych (np. u co dwudziestego pia˛tego), wyniki można wykorzystać do oszacowania cze˛stości wyste˛powania infekcji w całej populacji pacjentów. W szczególnych grupach pacjentów lub o szczególnej porze roku, w sytuacji pojawienia sie˛ typowego zespołu objawów, laboratorium może ukierunkować diagnostyke˛ na określony problem. Laboratorium podejmuje decyzje˛ o ewentualnym ograniczeniu diagnostyki do pewnych patogenów jelitowych. Yersinia enterocolitica wyste˛puje wyja˛tkowo rzadko w regionach tropikalnych. Jeśli nie obserwuje sie˛ wyste˛powania określonego patogenu w danym regionie, laboratorium może zrezygnować z wykonywania wykrywaja˛cych go testów. W wyniku laboratorium powinno uwzgle˛dnić fakt wykrywania tylko określonych patogenów. Jeśli wykonywane sa˛ badania jedynie w kierunku Salmonnella i Shigella, w wyniku nie można napisać ,,brak patogenów’’. Należy umieścić informacje˛: ,,nie wykazano obecności Salmonella i Shigella spp.’’ Pobieranie i przesyłanie próbek kału Próbki powinny być pobierane we wczesnym okresie biegunki, ponieważ w tym czasie liczba patogenów w kale jest najwyższa, oraz, jeśli to możliwe, przed rozpocze˛ciem ewentualnej antybiotykoterapii. Próbke˛ należy pobrać rano i dostarczyć ja˛ do laboratorium do południa, tak by można było wykonać badanie tego samego dnia. Uformowany stolec należy odrzucić. Najlepszym materiałem do badań jest świeży kał. Jeżeli jednak pobranie kału nie jest możliwe lub gdy transport materiału do laboratorium jest zbyt długi, można pobrać wymaz z odbytu. Procedura pobierania kału do badania Przygotować dla pacjenta dwie drewniane szpatułki i odpowiedniej wielkości pojemnik ze szczelnym zamknie˛ciem (np.: czysty szklany kubek, plastikowe lub pokryte warstwa˛ wosku tekturowe pudełko, specjalny pojemnik z łopatka˛ przymocowana˛ do wieczka). Nie wolno używać butelek po lekach. Poinstruować pacjenta, aby oddał stolec na papier toaletowy lub do basenu, a naste˛pnie przeniósł cze˛ść do pojemnika za pomoca˛ szpatułek. Próbka powinna zawierać co najmniej 5 g stolca i fragmenty z widoczna˛ krwia˛, śluzem lub ropa˛, jeśli sa˛ obecne w kale. Materiał nie powinien być zanieczyszczony moczem. Po umieszczeniu próbki pojemnik szczelnie zamkna˛ć. 51 KAŁ Pacjenta należy poinformować, aby dostarczył materiał do badania natychmiast po pobraniu. Jeśli dostarczenie próbki do laboratorium w cia˛gu 2 godzin nie jest możliwe, należy niewielka˛ ilość materiału (ła˛cznie ze śluzem, krwia˛ i pasmami nabłonka, jeśli sa˛ obecne) podzielić i umieścić w dwu lub trzech pojemnikach z podłożem transportowym (Cary-Blair, Stuart lub Amies) lub w 33 mmol/l buforu fosforanowo-glicerolowego. W przypadku cholery i zakażeń innymi Vibrio spp., doskonałym (i wzbogaconym) podłożem transportowym jest alkaliczna woda peptonowa. Patogeny moga˛ przetrwać w takich warunkach przez okres do tygodnia w temperaturze pokojowej, chociaż zalecane jest przechowywanie takich próbek w chłodziarce. Procedura pobierania wymazów z odbytu 1. Zwilżyć bawełniana˛ wymazówke˛ sterylna˛ woda˛. Umieścić za zwieraczem odbytu, obrócić i wyja˛ć. Sprawdzić, czy widoczna jest wystarczaja˛ca ilość materiału, jeśli nie, powtórzyć czynność. Liczba wymazów uzależniona jest od rodzaju prowadzonych badań. 2. Jeśli materiał zostanie zbadany w cia˛gu 1 – 2 godzin, umieścić wymazówke˛ w pustej, sterylnej probówce z zatyczka˛ z waty lub zakre˛tka˛. Jeśli wymazówka musi być przechowywana dłużej niż przez 2 godziny, należy umieścić ja˛ w podłożu transportowym. Badanie wizualne próbek kału 1. Obejrzeć próbke˛, zwracaja˛c uwage˛ na: – konsystencje˛ (uformowany, nieuformowany, płynny), – kolor (biały, żółty, bra˛zowy lub czarny), – obecność nietypowych elementów (np. śluz, krew). 2. Umieścić niewielka˛ ilość kału lub wymazu z odbytu razem ze śluzem (jeśli jest obecny) w kropli 0,05% roztworu błe˛kitu metylenowego na czystym szkiełku i dokładnie wymieszać. 3. Przykryć szkiełkiem nakrywkowym zabarwiona˛ zawiesine˛ uważaja˛c, aby nie powstały pe˛cherzyki powietrza. Poczekać 2 – 3 minuty. Ogla˛dać preparat pod mikroskopem w dużym powie˛kszeniu (obiektyw × 100). 4. Zwrócić uwage˛ na komórki jednoja˛drzaste lub o polimorficznych ja˛drach; pomina˛ć zdegenerowane komórki. Badanie wysie˛ku komórkowego biegunkowego kału może dostarczyć wskazówek pozwalaja˛cych na identyfikacje˛ czynników wywołuja˛cych: – zlepy leukocytów wieloja˛drzastych (> 50 komórek w polu widzenia), makrofagi i erytrocyty sa˛ typowe dla zakażeń pałeczkami Shigella; – mniejsza liczba wieloja˛drzastych leukocytów (< 20 komórek w polu widzenia) obecna jest w salmonelozach i w zakażeniach inwazyjnymi szczepami E. coli. W czerwonce pełzakowej wie˛kszość komórek jest zdegenerowana (cienie komórek). W około 50% przypadków biegunki wywołanej przez Campylobacter spp. obecne sa˛ leukocyty i erytrocyty; – w przypadku cholery, zakażeń wywołanych przez enterokrwotoczne i enteropatogenne E. coli oraz biegunek wirusowych obecne sa˛ nieliczne leukocyty (2 – 5 komórek w polu widzenia). 52 CZE˛ŚĆ I Podłoża transportowo-wzbogacaja˛ce i posiew próbek kału Podłoża transportowo-wzbogacaja˛ce sa˛ powszechnie stosowane do izolacji Salmonella spp. i Vibrio cholerae z kału. W przypadku Salmonella spp. zalecane sa˛ buliony zawieraja˛ce selenin F lub tetrationian, natomiast dla Vibrio cholerae stosowana jest alkaliczna woda peptonowa (APW, alkaline peptone water). Podłoża takie nie sa˛ zalecane w hodowli Shigella spp., Campylobacter spp., Yersinia enterocolitica i Clostridium difficile. Procedura posiewu na podłoża wzbogacaja˛ce 1. Przygotować zawiesine˛ kału zawieszaja˛c około 1 g próbki w probówce zawieraja˛cej 1 ml sterylnego fizjologicznego roztworu soli. Jeśli próbka jest płynna, nie trzeba dodawać roztworu soli. Wymazy z odbytu, świeże lub w podłożu Cary’ego-Blaira, wytrza˛sna˛ć w 1 ml fizjologicznego roztworu soli. Przed wyrzuceniem wymazówki odcisna˛ć reszte˛ płynu na ściance probówki. 2. Eza˛ dodać trzy lub wie˛cej oczek zawiesiny do odpowiedniego podłoża wzbogacaja˛cego. 3. Inkubować bulion z seleninem F przez 18 godzin, APW przez 6 – 8 godzin. W niektórych laboratoriach dwa lub trzy oczka zawiesiny pocza˛tkowej w APW sa˛ przesiewane do świeżego APW i inkubowane przez kolejne 6 – 8 godzin. 4. Przesiać hodowle z bulionu eza˛ na płytki z selektywnym i nieselektywnym podłożem. V. cholerae szybko rośnie w APW i przez 6 – 8 godzin przerasta inne mikroorganizmy. Po dłuższej inkubacji, powyżej 8 godzin, pozostałe bakterie moga˛ zdominować V. cholerae. Szczepy nie-V. cholerae O1 rosna˛ szybciej niż V. cholerae O1 i, jeśli obecne sa˛ jednocześnie dwa serotypy, moga˛ przerosna˛ć cała˛ płytke˛. Podłoża do hodowli patogenów jelitowych Dla Shigella spp., Salmonella spp. i Y. enterocolitica zalecane sa˛ podłoża stosowane do posiewu ogólnego o niskiej selektywności oraz podłoża o średniej lub wysokiej selektywności. Agar MacConkeya z fioletem krystalicznym jest zalecany jako podłoże podstawowe. W przypadku Y. enterocolitica agar MacConkeya należy inkubować przez dzień w 35°C, a naste˛pnie, przez kolejny dzień, w temperaturze pokojowej (22 – 29°C). Agar ksylozo-lizyno-deoksycholanowy (XLD) jest rekomendowany jako podłoże o średniej lub wysokiej selektywności do izolacji Shigella spp. i Salmonella spp. Agar deoksycholanowo-cytrynianowy (DCA), agar Hektoen dla pałeczek jelitowych (HEA) lub agar Salmonella-Shigella (SS agar) moga˛ być stosowane alternatywnie. Shigella dysenteriae typ 1, S. sonnei i enteroinwazyjne E. coli nie rosna˛ dobrze na agarze SS. Jednakże agar SS może być wykorzystany do izolacji Y. enterocolitica z zastosowaniem zasad izolacji opisanych dla agaru MacConkeya. Wiele laboratoriów do izolacji Salmonella typhi i innych gatunków Salmonella stosuje agar siarczanowo-bizmutowy. Dla Campylobacter spp. stosowanych jest kilka podłoży selektywnych (Blaser, Butzler, Skirrow), zawieraja˛cych różne dodatki antybakteryjne. Można również 53 KAŁ zastosować podstawowy agar z krwia˛ zawieraja˛cy 5 – 10% krwi baraniej z dodatkiem cefalosporyny (15 µg/ml), wankomycyny (10 µg/ml), amfoterycyny B (2 µg/ml) i 0,05% siarczanu żelaza–metadwusiarczanu sodu–pirogronianu sodu (FBF). Dla Vibrio spp. konieczne sa˛ selektywne podłoża, aczkolwiek wiele szczepów może rosna˛ć na agarze MacConkeya. Agar zawieraja˛cy cytrynian tiosiarczanowy, sole żółci i sacharoze˛ (TCBS) jest podłożem selektywnym dla V. cholerae O1 i nie-O1 oraz dla V. parahaemolyticus, ale drogim. Podłoże selektywne, zawieraja˛ce telluryn, taurocholan i żelatyne˛ (TTG), nie jest komercyjnie doste˛pne. Prostymi, niedrogimi podłożami, które moga˛ być przygotowywane we własnym zakresie i stosowane z bardzo dobrym efektem, sa˛: agar z zasadowym ekstraktem mie˛snym (MEA) i zasadowy agar z solami żółci (BSA). Izolacja Clostridium difficile przed wprowadzeniem agaru cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowego (CCFA) była trudna. W przypadku lecytynazo- i lipazoujemnych C. difficile zalecane jest stosowanie podłoży agarowych, zawieraja˛cych żółtko jaja; inne laseczki wyste˛puja˛ce w jelicie, takie jak C. perfringens, C. bifermentans i C. sordelli, sa˛ lecytynazododatnie. Wste˛pna izolacja Próbka powinna być badana i hodowana natychmiast po dostarczeniu do laboratorium, co daje najwyższy wskaźnik izolacji Shigella spp. i Campylobacter spp. Jeśli nie jest to możliwe, próbka powinna być przechowywana w temperaturze 4°C. Do posiewu na podłoża o wysokiej selektywności powinna być użyta ge˛sta zawiesina kału, a na podłoża o niskiej selektywności — mniej ge˛sta. W wielu laboratoriach wymaz z odbytu posiewany jest bezpośrednio na podłoża, należy jednak uważać, aby nie doszło do przerośnie˛cia płytki. Procedura posiewu na podłoża do wste˛pnej izolacji 1. Posiać eza˛ na wysoko selektywne podłoża trzy oczka zawiesiny kału, a jedno na podłoże o niskiej selektywności. Inoculum umieścić centralnie na płytce agarowej, a naste˛pnie rozprowadzić w góre˛, w dół i w poprzek płytki, jak zilustrowano na ryc. 6. Procedura ta umożliwia uzyskanie maksymalnej liczby pojedynczych kolonii. Drobne kolonie pojawia˛ sie˛ peryferycznie na płytce. 2. Po inokulacji inkubować płytki agarowe. W celu izolacji Salmonella, Shigella i Yersinia spp. oraz V. cholerae płytki inkubować w cieplarce w warunkach tlenowych (bez CO2) w 35°C, w przypadku Campylobacter spp. w 42°C w środowisku mikroaerofilnym z 10% CO2, a płytki z Clostridium difficile w 35°C w środowisku beztlenowym. Warunki inkubacji Campylobacter Płytki do izolacji Campylobacter spp. powinny być inkubowane w 42 – 43°C w środowisku mikroaerofilnym, zawieraja˛cym 5% O2, 10% CO2 i 85% N2. 54 CZE˛ŚĆ I Powyższa temperatura hamuje wzrost naturalnej flory jelitowej, nie wpływaja˛c na wzrost bakterii z rodzaju Campylobacter. Podczas izolacji gatunków nie toleruja˛cych podwyższonej temperatury, inkubacja powinna być prowadzona w 35 – 37°C. Ryc. 6. Posiew bakterii na płytke˛. • Odpowiednie warunki wzrostu dla Campylobacter spp. sa˛ uzyskiwane na kilka sposobów. Wybór metody zależy od zakresu i obcia˛żenia praca˛ danego laboratorium oraz relatywnych kosztów. • Eksykator zapewnia atmosfere˛ zawieraja˛ca˛ ok. 17 – 19% O2 i 2 – 3% CO2. Nie sa˛ to optymalne warunki wzrostu Campylobacter spp. i nie wszystkie szczepy w nich wyrosna˛. Według niektórych źródeł inkubacja w 42°C podłoży z dodatkiem FBP wpływa korzystnie na skuteczność izolacji. Dodatek FBP inaktywuja˛c nadtlenki i nadtlenek wodoru poprawia tolerancje˛ tlenu przez Campylobacter spp. Ujemna˛ strona˛metody jest dłuższa inkubacja i zahamowanie wzrostu niektórych wrażliwych na tlen Campylobacter spp. • Inna prosta i niedroga metoda wykorzystuje technike˛ wspólnych hodowli. Płytki z szybko rosna˛cymi fakultatywnie beztlenowymi bakteriami inkubowane sa˛ z płytkami do izolacji Campylobacter spp. w zamknie˛tym pojemniku lub plastikowym woreczku. Przy wzroście fakultatywnie beztlenowych bakterii zawartość tlenu maleje, a CO2 rośnie. Ujemna˛ strona˛ metody jest zwykle dłuższy czas inkubacji potrzebny do wzrostu Campylobacter spp. • Komercyjnie doste˛pna jest specjalnie przystosowana do izolacji Campylobacter spp. saszetka z generatorem wodoru i CO2 oraz katalizatorem. Saszetke˛ należy umieścić w anaerostacie używaja˛c każdorazowo przy otwarciu pojemnika nowej saszetki. Aby uzyskać maksymalna˛skuteczność izolacji, w słoju nie należy umieszczać wie˛cej niż sześciu płytek. • Zestaw do inkubacji w plastikowym woreczku jest także doste˛pny komercyjnie. W skład zestawu wchodzi plastikowy woreczek, za każdym razem opróżniany dwu- lub trzykrotnie re˛cznie ba˛dź za pomoca˛ próżniocia˛gu, a naste˛pnie każdorazowo wypełniany 5% O2, 10% CO2 i 85% N2. • System opróżnianego i wypełnianego anaerostatu bez katalizatora. Pojemnik jest dwukrotnie opróżniany do uzyskania ciśnienia 38 cm (15 mm Hg) i wypełniany za każdym razem mieszanina˛ 10% H2 i 90% N2. 55 KAŁ Wste˛pna identyfikacja izolowanych szczepów Identyfikacja odbywa sie˛ na podstawie testów zarówno biochemicznych, jak i serologicznych, których zakres zależy od możliwości laboratorium. Schemat identyfikacji ważnych bakterii jelitowych przedstawiony jest na ryc. 7a-c. Na płytce Petriego, zawieraja˛cej pierwszy posiew, należy oznaczyć na dnie dobrze odgraniczone kolonie o typowym wygla˛dzie. Wybrane kolonie zostana˛ poddane dalszej identyfikacji. Jeśli w posiewie widoczne sa˛ różne typy kolonii, należy przeprowadzić identyfikacje˛ każdej z nich. Małe i bezbarwne kolonie niefermentuja˛cych laktozy bakterii, takich jak Salmonella spp. i Shigella spp., rosna˛na podłożu agarowym MacConkeya, agarze SS i DCA. Kolonie Proteus spp. moga˛ być mylone z Salmonella spp. i Shigella spp., zwłaszcza na podłożu MacConkeya ze wzgle˛du na ich wygla˛d, typowy dla bakterii laktozoujemnych. Fermentuja˛ce laktoze˛ mikroorganizmy, takie jak E. coli i Enterobacter/Klebsiella spp., wytwarzaja˛ małe różowe i czerwone kolonie na podłożu agarowym MacConkeya, DCA i agarze SS. Na agarze XLD Salmonella spp. i Shigella spp. wytwarzaja˛ małe czerwone kolonie, z czarnym środkiem w przypadku wie˛kszości szczepów Salmonella. Kolonie z czarnym centrum moga˛ tworzyć na tym podłożu również niektóre szczepy Proteus spp. Na agarze bizmutowo-siarkowym Salmonella typhi wytwarzaja˛ czarne kolonie z metalicznym połyskiem, dobrze widocznym w przypadku odgraniczonych kolonii. Yersinia enterocolitica rośnie na agarze MacConkeya i agarze SS w postaci małych, bladych kolonii, najszybszy wzrost naste˛puje w temperaturze 22 – 29°C. Salmonella i Shigella spp. Do wste˛pnych badań szczepów Salmonella spp. i Shigella spp. zalecane sa˛ trzy różne podłoża: – bulion z mocznikiem, lekko buforowany (UREA), – podłoże ruch-indol-lizyna (MIL), – agar Kliglera (KIA). Procedura posiewu i odczytu UREA 1. Używaja˛c do posiewu ezy zebrać z płytki 2 – 3 nie fermentuja˛ce laktozy kolonie i przenieść do probówki zawieraja˛cej UREA. 2. Inkubować probówki przez 2 – 4 godziny w 35°C i obserwować ewentualna˛ zmiane˛ zabarwienia na różowe (ureazododatnie). Odrzucić ureazododatnie probówki. 3. Przesiać materiał z probówek zawieraja˛cych szczepy ureazoujemne na MIL i KIA (patrz poniżej) i inkubować wszystkie probówki, ła˛cznie z ureazoujemnymi, przez noc w 35°C, w warunkach tlenowych. Procedura posiewu i odczytu MIL i KIA 1. Posiać materiał do podłoża MIL przez nakłucie prosta˛ igła˛ (eza˛) na głe˛bokość 2 mm od dna probówki. Wyja˛ć igłe˛ w tej samej linii. 56 CZE˛ŚĆ I Gram-ujemne pałeczki wzgle˛dnie beztlenowe fermentuja˛ce cukry oksydazoujemne ▼ Laktoza + – ▼ ▼ Siarkowodór Siarkowodór + Citrobacter freundii + – + ▼ ▼ ▼ Lizyna Lizyna Fenyloalanina – + ▼ ▼ ▼ ▼ ▼ Ureaza Indol Indol Ornityna Lizyna + – – + – + – + – + – – ▼ Indol + – Citrobacter koseri Enterobacter aerogenes Indol + – Escherichia coli ▼ Klebsiella pneumoniae Klebsiella oxytoca + – ▼ Proteus vulgaris Enterobacter cloacae Proteus mirabilis ▼ Morganella morgani + Providencia stuartii + Indol + Edwardsiella tarda + ▼ Trehaloza – + – ▼ Yersinia enterocolitica + Ruch Mannitol – – ▼ Providencia rettgeri ▼ Ornityna Salmonella wie˛kszość serotypów Ureaza ▼ Sorbitol Salmonella typhi + – ▼ Arabinoza + Serratia liquifaciens – Salmonella paratyphi A Providencia alcalifaciens – ▼ Hafnia – alvei ▼ Ornityna Shigella sonnei Shigella serotyp A, B, C Serratia marcescens Ryc. 7a. Schemat wste˛pnej identyfikacji cze˛sto wyste˛puja˛cych Enterobacteriaceae. 2. Posiać materiał na podłoże KIA nakłuwaja˛c słupek agaru prosta˛ igła˛ i prowadza˛c zygzakiem po powierzchni skosu. 3. Opisać wszystkie probówki numerem próbki i inkubować przez noc w temperaturze 35°C. 4. Obserwować probówki UREA w kierunku opóźnionej reakcji rozkładu mocznika (patrz powyżej). Odrzucić hodowle z reakcja˛ ureazododatnia˛. 5. Obserwować podłoża MIL w kierunku obecności ruchu, reakcji rozkładu lizyny i wytwarzania indolu. Ruchliwe mikroorganizmy rozprzestrzenia˛ sie˛ w podłożu poza linie˛ nakłucia i widoczny be˛dzie rozsiany wzrost. Bakterie niezdolne do ruchu be˛da˛ rosły jedynie w kanale wkłucia. Na dodatnia˛ reakcje˛ lizynowa˛ wskazuje odczyn zasadowy (kolor fioletowy) na dnie podłoża, na reakcje˛ ujemna˛ odczyn kwaśny (kolor żółty) spowodowany jedynie fermentacja˛ glukozy. Aby wykazać obecność indolu, należy dodać do podłoża 3 – 4 krople odczynnika Kovacsa. Czerwony i różowy kolor wskazuja˛ na reakcje˛ dodatnia˛, natomiast kolor jasnożółty świadczy o ujemnym wyniku testu. 6. Obserwować podłoże KIA. Wszystkie Enterobacteriaceae fermentuja˛ glukoze˛ z wytworzeniem kwasu i gazu lub tylko kwasu, który jest odpowiedzialny za żółte zabarwienie podłoża. Powstaja˛cy gaz powoduje powstanie pe˛cherzyków i pe˛knie˛ć na powierzchni agaru, który, jeśli powstaje duża ilość gazu, może unieść sie˛ w probówce (np. w przypadku Enterobacter spp.). Jeśli równocześnie fermentacji ulega laktoza, zarówno słupek agarowy, jak i skos staja˛sie˛ żółte z powodu kwaśnego pH (np. w przypadku E. coli). Jeśli nie zachodzi fermentacja laktozy (np. Shigella spp. i Salmonella spp.), słupek agaru jest żółty, a skos pozostaje czerwony. Zaczernienie wzdłuż linii wkłucia lub w całym agarze wskazuje na obecność siarkowodoru. Należy zanotować rezultaty i przeprowadzić wste˛pna˛ identyfikacje˛ mikroorganizmu, wykorzystuja˛c schemat przedstawiony w tabeli 10 i 11. 57 KAŁ Gram-dodatnie tworza˛ce spory laseczki, niektóre gatunki nie tworza˛ce spor, wzgle˛dnie beztlenowe lub katalazoujemne + – Podwójna strefa hemolizy + Indol – Clostridium perfringens Indol + – Ureaza Ruch + – C. sordelli + Wzrost mgławicowy + – C. tetani + – Propionibacterium acnes + Redukcja azotanu – Małe (1 µm) przezroczyste kolonie ziarenko-pałeczek – Charakterystyczna Mannitol fluorescencja + – C. ramosum Laktoza C. clostridioforme – C. sphenoides + + Eubacterium lentum C. bifermentans + – C. difficili + Laktoza Katalaza 15% H2O2 + Wzrost mgławicowy – Redukcja azotanu – + Wzrost mgławicowy Actinomyces viscosus + – + – C. septicum C. tertium C. sporogenes C. novyi typ A ,,Beztlenowe pałeczki Gram-dodatnie nie tworza˛ce spor, niemożliwe do zidentyfikowania’’ (obejmuje Lactobacillus, Bifidobacterium i inne – gatunki Eubacterium) – Actinomyces species (kolonie ,,ze˛bów trzonowych’’) Propionibacterium species Ryc. 7b. Schemat wste˛pnej identyfikacji Gram-dodatnich pałeczek beztlenowych. Szczepy Salmonella sa˛ oksydazoujemne, ruchliwe i indoloujemne. Nie hydrolizuja˛ mocznika i — z wyja˛tkiem S. paratyphi A — wytwarzaja˛ dekarboksylaze˛ lizyny. Na agarze KIA obserwowany jest żółty słupek, czerwony skos, H2S i gaz, z wyja˛tkiem S. typhi, która nie wytwarza gazu, i wie˛kszości szczepów S. paratyphi A, które sa˛ H2S-ujemne. Jeśli powyższe kryteria sa˛ spełnione, zanotować: ,,izolacja Salmonella (identyfikacja wste˛pna)’’. Szczepy Shigella sa˛ oksydazoujemne, nieruchliwe, nie wytwarzaja˛ dekarboksylazy lizyny i nie hydrolizuja˛ mocznika. Na KIA obserwowany jest zasadowy (czerwony) skos i kwaśny (żółty) słupek, bez H2S i bez gazu, z wyja˛tkiem S. flexnerii serotyp 6 (warianty Newcastle i Manchester) i S. boydii serotyp 14, które wytwarzaja˛ gaz. Z wyja˛tkiem S. dysenteriae serotyp 1 bakterie wytwarzaja˛ katalaze˛. Jeśli powyższe kryteria sa˛ spełnione, zanotować: ,,izolacja Shigella (wste˛pna identyfikacja)’’. Yersinia enterocolitica Wzrost małych, bladych, czy też bezbarwnych koloni na podłożu MacConkeya lub agarze SS po całonocnej inkubacji może wskazywać na obecność Yersinia enterocolitica. Typowe kolonie należy posiać na KIA i inkubować w temperaturze 25°C przez noc. Inne kolonie, prawdopodobnie chorobotwórczych szczepów, posiać na dwa podłoża UREA i dwa podłoża MIL, inkubować równolegle po jednej z probówek w temperaturze 25°C i w temperaturze 35°C. Typowe szczepy Yersinia enterocolitica na podłożu KIA zakwaszaja˛ słupek, nie ma gazu i H2S. 58 CZE˛ŚĆ I Wzrost na agarze z żółcia˛ i eskulina˛ – ▼ Wrażliwe na kanamycyne˛ (Km) i wankomycyne˛ (Vm) Wrażliwe na kanamycyne˛ (Km) i wankomycyne˛ (Vm) Km-oporne Vm-oporne Porphyromonas Prevotella ▼ ▼ ▼ ▼ Km-oporne Vm-wrażliwe ▼ + ▼ Km-wrażliwe Vm-oporne Km-oporne Vm-oporne Km-oporne Vm-oporne ▼ Grupa Bacteroides fragilis Grupa Fusobacterium mortiferum/varium Kolonie z pigmentem lub fluoryzuja˛ce na czerwono + – Prevotella Ureaza ▼ + – ▼ ▼ Katalaza Indol + – + – Fusobacterium nucleatum F. necrophorum inne gatunki Fusobacterium Kolonie, bardzo małe przezroczyste ▼ Bilophila wadsworthia Bacteroides ureolyticus ▼ + – ▼ ▼ Nierozpuszczalne w żółci Fusobacterium species + – ▼ ▼ Katalaza Campylobacter species + – ▼ ▼ Bilophila wadsworthia Suterella wadsworthensis WHO 01.50 Ryc. 7c. Schemat wste˛pnej identyfikacji Gram-ujemnych pałeczek beztlenowych. Jeśli szczep jest ruchliwy i ureazododatni w temperaturze 25°C oraz nieruchliwy i słabo ureazododatni lub ureazoujemny w temperaturze 35°C, zanotować: ,,izolacja Yersinia (wste˛pna identyfikacja)’’. Vibrio cholerae i V. parahaemolyticus Szczepy Vibrio rosna˛ na agarze MacConkeya w postaci bladych, nie fermentuja˛cych laktozy kolonii. Na agarze TCBS V. cholerae tworza˛ średniej wielkości, wypukłe, gładkie, żółte kolonie, w odróżnieniu od V. parahaemolyticus, których kolonie sa˛ duże, płaskie i niebieskozielone. Niektóre szczepy V. cholerae, z powodu opóźnionej fermentacji sacharozy, moga˛ również na podłożu TCBS tworzyć zielone lub bezbarwne kolonie. Na podłożu TTGA kolonie sa˛ ciemne w centrum, z powodu redukcji tellurynu, oraz otoczone strefa˛ zme˛tnienia, zwia˛zana˛ z aktywnościa˛ żelatynazy. Na podłożu BSA i MEA kolonie V. cholerae sa˛ bezbarwne, zwykle płaskie i dobrze odgraniczone; zazwyczaj łatwo je odróżnić od kolonii Enterobacteriaceae w ukośnym oświetleniu lub podczas badania w świetle dziennym padaja˛cym pod ka˛tem. Dla podejrzanych kolonii należy wykonać test na obecność oksydazy i test śluzowy. 59 KAŁ Tabela 9. Morfologia kolonii powszechnie wyste˛puja˛cych bakterii jelitowych na różnicuja˛cych i selektywnych podłożach Gatunki Agar MacConkeya z fioletem krystalicznym Agar XLD Agar SS Escherichia coli Różowoczerwone Duże, płaskie, żółte, nieprzejrzyste Różowoczerwone zahamowanie wzrostu Shigella spp. Bezbarwne Czerwone Bezbarwne Salmonella spp. Bezbarwne DCA HEA Różowe, otoczone Duże, łososioworóstrefa˛ precypitacji żowe lub pomarańczowe, otoczone strefa˛ precypitacji Bezbarwne lub jasnobra˛zowe Bezbarwne z czar- Bezbarwne lub jasnonym centrum bra˛zowe z czarnym lub bez centrum lub bez Różowe, zahamo- Duże, blade, śluzowanie wzrostu we, z różowym centrum Bezbarwne, z sza- Duże, bezbarwne lub roczarnym cenjasnobra˛zowe z trum lub bez czarnym centrum lub bez Zielone, wilgotne, wypukłe Niebieskozielone z czarnym centrum lub bez Duże, łososiowopomarańczowe Enterobacter/ /Klebsiella spp. Czerwone z czarnym centrum lub bez Różowe, śluzo- Żółte, śluzowe we Proteus/ /Providencia spp. Bezbarwne, zahamowane pełzanie Czerwone, niektóre Proteus spp. maja˛ czarne centrum Yersinia enterocolitica Bezbarwne Żółte, nieregular- Bezbarwne ne Bezbarwne Łososiowe Brak lub wzrost Brak lub słaby wzrost Brak lub słaby wzrost Enterococcus spp. Brak wzrostu słaby Brak wzrostu Niebieskozielone lub łososiowe z czarnym centrum lub bez XLD: deoksycholan ksylozo-lizynowy; DCA: cytrynian deoksycholowy; SS: Salmonella-Shigella; HEA: hektoen jelitowy. Tabela 10. Interpretacja reakcji pałeczek Enterobacteriaceae na agarze żelazowym Kliglera (KIA) Reakcja Słupek kwaśny (żółty) i skos zasadowy (czerwony) Kwaśne całe podłoże (słupek i skos żółte) Zasadowe całe podłoże (słupek i skos czerwone) Pe˛cherzyki gazu w słupku lub pe˛knie˛cia w podłożu Zaczernienie w słupku Interpretacja Tylko fermentacja glukozy Fermentacja glukozy i laktozy Brak fermentacji glukozy i laktozy Bakterie wytwarzaja˛ce gaz Wytwarzanie siarkowodoru (H2S) Procedura testu na oksydaze˛ 1. Na papierowym filtrze w szalce Petriego umieścić 2 – 3 krople odczynnika do testu na oksydaze˛ (1% tetrametylo-parafenylenodiamina). 2. Platynowa˛ (nie niklowo-chromowa˛) eza˛, czysta˛ drewniana˛ szpatułka˛ lub wykałaczka˛ zebrać niewielka˛ liczbe˛ świeżych kolonii z agaru MacConkeya. Rozprowadzić bakterie na nawilżonej cze˛ści papierowego filtra. 3. O reakcji dodatniej świadczy ciemnofioletowe zabarwienie papierka w cia˛gu 10 sekund. Spośród Gram-ujemnych pałeczek oksydazododatnie sa˛ Vibrio, Aeromonas, Plesiomonas, Pseudomonas i Alcaligenes; wszystkie Enterobacteriaceae sa˛ oksydazoujemne. Odczynnik do testu na oksydaze˛ powinien być regularnie testowany za pomoca˛ dodatnich i ujemnych szczepów kontrolnych. 60 CZE˛ŚĆ I Tabela 11. Wzory typowych reakcji pałeczek Enterobacteriaceae na agarze Kliglera (KIA) Reakcja Fermentacja cukru(ów) Gatunek bakterii Kwaśny słupek1 Kwaśny skos1 Gaz w słupku Brak H2S Glukoza: kwas i gaz Laktoza: kwas i gaz Escherichia coli Klebsiella Enterobacter Citrobacter diversus Serratia liquefaciens Kwaśny słupek Zasadowy skos2 Gaz w słupku Wytwarzanie H2S Glukoza: kwas i gaz Laktoza: brak fermentacji Salmonella Proteus Citrobacter freundii* Kwaśny słupek Zasadowy skos Brak gazu w słupku Brak H2S Glukoza: tylko kwas Laktoza: brak fermentacji Shigella Yersinia Serratia marcescens* Providencia stuartii Providencia rettgeri* Kwaśny słupek Zasadowy skos Gaz w słupku Brak H2S Glukoza: kwas i gaz Laktoza: brak fermentacji Salmonella paratyphi A Hafnia alvei Serratia marcescens* Morganella morgani Oboje˛tny/zasadowy słupek2 Zasadowy skos Brak gazu Brak H2S Brak fermentacji cukrów Alcaligenes Pseudomonas Acinetobacter 1 Kwaśne pH powstałe w wyniku rozkładu cukru, obserwowane na podstawie żółtego zabarwienia podłoża (przyp. tłum.). 2 Zasadowe lub oboje˛tne pH w wyniku braku rozkładu cukru, obserwowane na podstawie niezmienionego, różowego koloru podłoża (przyp. tłum.). * Reakcje atypowe. Procedura testu śluzowego 1. Umieścić na szkiełku krople˛ 0,5% roztworu dezoksycholanu sodu i wymieszać z mała˛ liczba˛ kolonii pobranych z podłoża MacConkeya. 2. Wskaźnikiem dodatniej reakcji jest zmiana charakteru zawiesiny w cia˛gu 60 sekund: z me˛tnej w śluzowata˛; obecność śluzowych włókien może być wykazana za pomoca˛ ezy, która˛zanurza sie˛ w zawiesinie i odsuwa od szkiełka. Niektóre szczepy Aeromonas moga˛ wykazywać słaba˛ i opóźniona˛ o około 60 sekund reakcje˛. Jeśli powyższe testy sa˛ dodatnie, przenieść cze˛ść kolonii na KIA i po całonocnej inkubacji obserwować w kierunku obecności żółtego zabarwienia słupka, zasadowego skosu, braku wytwarzania gazu i H2S. Jeśli wysta˛pia˛ ww. cechy, zanotować: ,,izolacja Vibrio cholerae (wste˛pna identyfikacja)’’. Campylobacter jejuni i Campylobacter coli Płytki Campylobacter należy ogla˛dać po 48 – 72 godzinach inkubacji. Zalecane jest wykonanie testu na oksydaze˛, ogla˛danie preparatu natywnego w ciemnym polu widzenia lub w mikroskopie fazowo-kontrastowym oraz preparatu barwionego metoda˛ Grama. Jeśli mikroskop z ciemnym polem widzenia lub fazowo-kontrastowy nie jest doste˛pny, morfologie˛ komórek można określić na podstawie preparatu barwionego metoda˛ Grama, używaja˛c obok fioletu krystalicznego 0,3% fuksyny karbolowej. Campylobacter spp. sa˛ oksydazododatnie, 61 KAŁ wykazuja˛ruch, w preparacie widoczne sa˛jako lekko lub spiralnie zagie˛te pałeczki (kształt skrzydeł mewy lub ,,S’’). Jeśli wysta˛pia˛ ww. cechy, zanotować: ,,izolacja Campylobacter (wste˛pna identyfikacja)’’. Clostridium difficile Kolonie C. difficile na podłożu CCFA sa˛ duże, żółte, ze szklista˛ podstawa˛. Na agarze z krwia˛ w środowisku beztlenowym kolonie moga˛ wykazywać różna˛ morfologie˛, dlatego niezbe˛dna jest identyfikacja bakterii na podstawie innych cech. Typowe kolonie na tym podłożu sa˛ szare, nieprzejrzyste, bez cech hemolizy po 24 – 48 godzinach, tylko niekiedy zielononiebieskie z powodu α-hemolizy. Po 48 – 72 godzinach inkubacji może pojawić sie˛ wyraźne szare zabarwienie z białym centrum. Z doświadczenia wynika jednak, że mimo różnic w morfologii kolonii C. difficile jest łatwo rozpoznawany na podstawie charakterystycznego zapachu, przypominaja˛cego odchody końskie. Jeśli kolonie sa˛ lecytynazoi lipazoujemne, a ponadto wykazuja˛ żółtozielona˛ fluorescencje˛ w świetle lampy Wooda, należy zanotować: ,,izolacja Clostridium difficile (wste˛pna identyfikacja)’’. Końcowa identyfikacja mikrobiologiczna Przed wydaniem wyniku należy sprawdzić czystość hodowli i potwierdzić identyfikacje˛ za pomoca˛ dodatkowych testów biochemicznych. 1. Pobrać z płytki dobrze odgraniczone od innych kolonie i przesiać na bulion odżywczy w celu wykonania testów biochemicznych, na skos agarowy do testów serologicznych oraz na płytke˛ MacConkeya w celu potwierdzenia czystości hodowli. 2. Wykonać dodatkowe testy biochemiczne zgodnie z tabelami. Wyniki odczytać po całonocnej inkubacji i zidentyfikować izolowane szczepy. Identyfikacja Shigella i Salmonella może niekiedy stanowić problem, ponieważ niektóre szczepy różnia˛ sie˛ wynikami reakcji biochemicznych, a także moga˛ wykazywać obecność antygenów wspólnych z innymi Gram-ujemnymi bakteriami. Nieruchliwe, laktozoujemne, nie wytwarzaja˛ce gazu szczepy E. coli sa˛ cze˛sto trudne do odróżnienia od szczepów Shigella, a ponadto identyfikacja może być skomplikowana w zwia˛zku z faktem wywoływania czerwonki bakteryjnej przez niektóre z tych szczepów. Salmonella Jeśli wyniki wste˛pnych testów wskazuja˛ na obecność szczepów Salmonella, należy posiać szczepy na podłoże z ornityna˛, podłoże Simmonsa z cytrynianem, ONPG i wode˛ peptydowa˛ wzbogacona˛ mannitolem, ramnoza˛, trehaloza˛ lub ksyloza˛. Obserwować reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować szczepy według schematu przedstawionego w tabeli 12. Jeśli wyniki wskazuja˛ na hodowle˛ Salmonella, przeprowadzić identyfikacje˛ serologiczna˛. 62 CZE˛ŚĆ I H2S KIA Indol Lizyna Ornityna Cytrynian ONPG Ureaza Mannitol Trehaloza Ramnoza Ksyloza Salmonella (wie˛kszość serotypów) S. choleraesuis S. arizonae S. typhi S. paratyphi A Edwardsiella tarda Citrobacter freundii Proteus spp. Ruch mgławicowy Tabela 12. Biochemiczne reakcje biotypów Salmonella i innych pałeczek – – – + + + – – + + + + – – – – – – + d + +w d– + + + – – – – + – –/+ + + + – + – – + + – + + – +/– d + – – – + v – + – – – + – – – – – – d + + + + + – + – – + + + – + + + + – + – + – + + + – – + + Skróty: +: > 95% dodatnich; d: 26 – 74% dodatnich; d–: 5 – 25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: zmienne wyniki; w: słaba reakcja. H2S/KIA: wytwarzanie siarkowodoru na agarze Kliglera; Lizyna: dekarboksylaza lizyny; Ornityna: dekarboksylaza ornityny; Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa; ONPG: β-galaktozydaza. Ruch Indol Lizyna Ureaza VP Cytrynian Ornityna Fenyloalanina ONPG Sacharoza Ksyloza Shigella sonnei Shigella, inne gatunki E. coli, nieaktywne szczepy Providencia Morganella Hafnia alvei Serratia marcescens Salmonella paratyphi A Plesiomonas shigelloides Oksydaza Tabela 13. Biochemiczne reakcje biotypów Shigella i innych pałeczek – – – – – – – – + – – – + d+ + + + + – d d+ + + – – – + – – d – – + + – + – – – v + – d– – – – – – – – d+ + – – – – – + – d– + – – + – d– – + + + + + – – – + d+ – – – – d+ – d d– d– + + – + – – d– d – d– + – – – – d – – + – – – Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 – 95% dodatnich; d: 26 – 74% dodatnich; d–: 5 – 25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; Lizyna: dekarboksylaza lizyny; VP: Voges-Proskauera; Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa; Ornityna: dekarboksylaza ornityny; Fenyloalanina: deaminaza fenyloalaniny; ONPG: β-galaktozydaza. Tabela 14. Biochemiczne reakcje gatunków i serotypów Shigella Dekarboksylaza ornityny Fermentacja: laktoza/sacharoza Fermentacja: mannitol Katalaza Glukoza: gaz Shigella dysenteriae Serotyp 1 (shigae) Serotyp 2 (schmitzii) Serotypy 3 – 10 – – – – – – – – – – + + – – – Shigella flexneri Serotyp 1 – 5, X i Y Serotyp 6 Newcastle Serotyp 6 Manchester Serotyp 6 Boyd 88 – – – – – – – – + – + + + + + + – + + – Shigella boydii Serotyp 1 – 13, 15 Serotyp 14 – – – – – – – – – + Shigella sonnei + + (opóźniona) + + – 63 KAŁ Shigella Jeśli wyniki wste˛pnych testów wskazuja˛ na pałeczki Shigella, należy posiać badany szczep na podłoża z ornityna˛, fenyloalanina˛i ONPG oraz wode˛ peptonowa˛ z sacharoza˛ i ksyloza˛. Obserwować reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować izolaty według schematu przedstawionego w tabeli 13. Jeśli wyniki wskazuja˛ na hodowle˛ Shigella, przeprowadzić identyfikacje˛ serologiczna˛. Do rodzaju Shigella należa˛ cztery gatunki: S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii i S. sonnei. Zwykle oznaczane sa˛ jako podgrupy, odpowiednio A, B, C i D. Niektóre serotypy można wste˛pnie zidentyfikować i podzielić na biotypy na podstawie reakcji biochemicznych. Wśród S. dysenteriae (podgrupa A) wyróżnia sie˛ 10 serotypów. Serotyp 1 jest katalazoujemny i wytwarza toksyne˛ Shiga. Pozostałe serotypy sa˛ katalazododatnie. Wie˛kszość szczepów nie fermentuje mannitolu i laktozy. Wśród S. flexneri (podgrupa B) wyróżnia sie˛ 8 serotypów. Wie˛kszość szczepów fermentuje mannitol, nie fermentuje sacharozy ani laktozy. Należa˛cy do serotypu 6 szczep Newcastle nie fermentuje mannitolu, ale wytwarza gaz z glukozy; szczep Manchester wytwarza kwas i gaz z glukozy oraz mannitolu; szczep Boyd 88 rozkłada glukoze˛ i mannitol do kwasu, bez wytwarzania gazu. Wśród S. boydii (podgrupa C) wyróżnia sie˛ 15 serotypów. Fermentuja˛ one mannitol, nie fermentuja˛ laktozy. Wśród S. sonnei (podgrupa D) wyróżnia sie˛ jeden serotyp, wykazuja˛cy dwie fazy reakcji: I i II. Fermentuje mannitol. Wykazuje dodatnia˛ reakcje˛ ONPG, ale fermentacja laktozy i sacharozy zachodzi później niż po 24 godzinach (patrz tabela 14). Yersinia enterocolitica Jeśli wyniki wste˛pnych testów wskazuja˛ na obecność szczepów Yersinia, należy posiać szczep na podłoża z ornityna˛, Voges-Proskauera, ONPG, cytrynianowe podłoże Simmonsa oraz wode˛ peptonowa˛ wzbogacona˛ sacharoza˛, ramnoza˛, melibioza˛, sorbitolem lub celobioza˛. Obserwować reakcje po jednodniowej inkubacji i zidentyfikować izolaty według schematu przedstawionego w tabeli 15. Jeśli wyniki wskazuja˛ na hodowle˛ Y. enterocolitica, wydać wynik: ,,Yersinia enterocolitica’’. Ornityna VP 25°C Cytrynian Sacharoza Ramnoza Melibioza Sorbitol Celobioza enterocolitica frederiksenii intermedia kristensenii pseudotuberculosis Ureaza Y. Y. Y. Y. Y. MIL Tabela 15. Biochemiczne reakcje Yersinia enterocolitica i innych niepatogennych gatunków Yersinia +/v/– +/+/– +/+/– +/d/– +/–/– + + + + + + + + + – v + + – – – d + – – v + + – – – + + – + – – + – + +* + + + – + + + + – Skróty: +: > 95% dodatnich; d: 26 – 74% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: zmienny wynik; MIL: podłoże ruch-indol-lizyna; VP 25°C: inkubacja w 25°C na agarze Voges-Proskauera; Cytrynian: agar cytrynianowy Simmonsa. * Z wyja˛tkiem biotypu 5. 64 CZE˛ŚĆ I Vibrio cholerae Jeśli wyniki wste˛pnych testów wskazuja˛ na obecność szczepów Vibrio, należy wykonać posiew na podłoże z ornityna˛, agar cytrynianowy Simmonsa oraz wode˛ peptonowa˛z sacharoza˛ i inkubować przez noc. Jeśli jedna z opisanych reakcji jest ujemna, wykonać posiew na podłoże Voges-Proskauera i przeprowadzić test na hydrolize˛ eskuliny, fermentacje˛ mannitolu, arabinozy i arbutyny. Obserwować reakcje po całonocnej inkubacji i zidentyfikować izolaty według schematu przedstawionego w tabeli 16. V. parahaemolyticus + K/A +/+/+ + V. fluvialis V. furnissii + + K/A K/AG +/d/– +/–/– – – V. hollisae Aeromonas hydrophila + + K/A A/AG +/+/– +/+/+ – – – d + + + – + + – – – – – – + d+ – + + + + + + + + – – – + – + + + – + Komentarz + + Eskulina +/+/+ +/+/+ Arabinoza Ornityna K/A v/A Mannitol MIL + + Sacharoza KIA słupek/skos Vibrio cholerae V. mimicus Cytrynian Oksydaza Tabela 16. Reakcje biochemiczne przecinkowców wyste˛puja˛cych w kale słaby wzrost Arb+/VP+ A. caviae + A/A +/+/– – + + + + d Arb–/VP– A. veronii biotyp sobria Plesiomonas shigelloides + + A/AG K/A +/+/+ +/+/+ – + + – + – + – – – – + Arb–/VP+ Arb–/VP– Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 – 95% dodatnich; d: 26 – 74% dodatnich; –: < 5% dodatnich; KIA: agar Kliglera; MIL: podłoże ruch-indol-lizyna; Ornityna: dekarboksylaza ornityny; Eskulina: hydroliza eskuliny; K: odczyn zasadowy; A: odczyn kwaśny; G: gaz; Arb: fermentacja arbutyny; VP: Voges-Proskauer. Jeśli doste˛pna jest swoista surowica anty-Vibrio cholerae serogrupy O1, należy wykonać szybki test aglutynacji szkiełkowej. W przypadku makroskopowej aglutynacji, opisać: ,,Vibrio cholerae O1’’. Jeśli surowica nie jest doste˛pna lub identyfikacja nie jest pewna, przesłać szczep do referencyjnego laboratorium. Różnicowanie V. cholerae O1 na biotypy klasyczny i El Tor nie jest niezbe˛dne do leczenia lub monitorowania, powinno jednak zostać przeprowadzone dla niektórych izolatów (tabela 17). Tabela 17. Różnice biotypów Vibrio cholerae Biotyp Klasyczny Hemaglutynacja Polimyksyna B (50 j.) Voges-Proskauer Hemoliza Reakcja ujemna, brak wzrostu* Wrażliwy Reakcja ujemna, brak wzrostu* Reakcja ujemna, brak wzrostu * Moga˛ wysta˛pić odchylenia od normy. 65 El Tor Reakcja dodatnia, wzrost* Oporny Reakcja dodatnia, wzrost* Zmienne KAŁ Test hemaglutynacji pośredniej 1. Przez wielokrotne odwirowanie przygotować w fizjologicznym roztworze soli 2,5% zawiesine˛ kurzych lub bydle˛cych krwinek czerwonych. 2. Na szkiełku zaznaczyć ołówkiem kilka pól i eza˛ nanieść na każde z nich oczko (3 mm) zawiesiny krwinek czerwonych. 3. W każdej z przygotowanych zawiesin krwinek umieścić niewielka˛ liczbe˛ bakterii pobranych z agaru lub skosu KIA, dobrze wymieszać. W przypadku szczepów biotypu El Tor, aglutynacja pojawia sie˛ w cia˛gu 30 – 60 sekund. Znane szczepy hemaglutynuja˛ce (El Tor) i nie hemaglutynuja˛ce powinny być użyte jako kontrola dla każdej z nowo przygotowanych zawiesin krwinek. Świeżo izolowane szczepy klasycznych biotypów daja˛ zwykle ujemny wynik testu, jednak w przypadku starych szczepów laboratoryjnych wynik ten nie zawsze jest ujemny. Test wrażliwości na polimiksyne˛ B 1. Na podłożu Mueller-Hintona lub na agarze z wycia˛giem mie˛snym rozprowadzić oczko hodowli szczepów inkubowanej przez noc w wodzie peptonowej. 2. Umieścić kra˛żek zawieraja˛cy 50 jednostek polimiksyny B w centrum hodowli. 3. Umieścić płytke˛ w chłodziarce na 1 godzine˛. 4. Inkubować płytke˛ przez noc w temperaturze 36°C. Zidentyfikowane szczepy biotypu klasycznego i El Tor powinny być zawsze wła˛czane do grupy szczepów kontrolnych. Klasyczne szczepy sa˛ wrażliwe na polimiksyne˛ B, dlatego zawsze obserwuje sie˛ wyraźna˛ strefe˛ zahamowania wzrostu wokół kra˛żka. Szczepy El Tor sa˛ niewrażliwe i strefa zahamowania nie jest widoczna. Campylobacter jejuni i Campylobacter coli W laboratoriach klinicznych doste˛pnych jest tylko kilka testów do identyfikacji gatunków i podgatunków Campylobacter. Ze wzgle˛du na temperature˛ wzrostu Campylobacter spp. można podzielić na dwie grupy: gatunki ciepłolubne, które rosna˛ w temperaturze 42 – 43°C, i gatunki nieciepłolubne, które rosna˛ w temperaturze 15 – 25°C. Do gatunków ciepłolubnych należa˛: Campylobacter jejuni podgatunek jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis i niektóre szczepy C. hyointestinalis. C. lari i C. hyointestinalis sa˛ oporne, natomiast C. jejuni, C. coli i C. upsaliensis sa˛ wrażliwe na kwas nalidyksowy; C. jejuni podgatunek jejuni, C. coli, C. lari sa˛ oporne, natomiast C. hyointestinalis i C. upsaliensis sa˛ wrażliwe na cefalotyne˛. Różnicowanie mie˛dzy tymi grupami odbywa sie˛ na podstawie zdolności do hydrolizy hipuranu i wytwarzania siarkowodoru na agarze Kliglera. Do gatunków nieciepłolubnych należa˛: C. jejuni podgatunek doylei, C. fetus i Arcobacter butzleri. C. jejuni podgatunek doylei nie rośnie w temperaturze 15°C ani w temperaturze 25°C; C. fetus rośnie dobrze w 25°C, ale nie rośnie w 15°C; A. butzleri rośnie w obydwu temperaturach. A. butzleri jest oporny na cefalotyne˛, a C. jejuni podgatunek doylei i C. fetus sa˛ na nia˛ wrażliwe (tabela 18). 66 CZE˛ŚĆ I Tabela 18. Identyfikacja biochemiczna gatunków Campylobacter izolowanych z kału Wzrost w temperaturze Campylobacter jejuni subsp. jejuni C. jejuni subsp. doylei C. coli C. lari C. upsaliensis C. fetus subsp. fetus C. hyointestinalis Arcobacter butzleri d H2S/KIA Hydroliza hipuranua Redukcja azotanu Wrażliwość Kwas Cefalotynac nalidyksowyb 15°C 25°C 42°C – – + – + + S R – – – – – – + – – – – + + + – + + + – v – – + – – – + – d – – – – – – – + + + + + + S S R S R R v S R R S S S R Skróty: +: > 95% dodatnich; d+: 75 – 95% dodatnich; d: 26 –7 4% dodatnich d–: 5 – 25% dodatnich; –: < 5% dodatnich; v: reakcja zmienna; S: wrażliwy; R: oporny; H2S/KIA: agar Kliglera. a Jedynie kolor ciemnej purpury jest dowodem na reakcje dodatnia˛. b Kra˛żek zawieraja˛cy 30 µg kwasu nalidyksowego. c Kra˛żek zawieraja˛cy 30 µg cefalotyny. d Katalazoujemne lub słabo dodatnie; agar Kliglera. Identyfikacja serologiczna Salmonella Nazewnictwo i klasyfikacja pałeczek Salmonella kilkakrotnie ulegały zmianom i nadal poddawane sa˛pod dyskusje˛. Zgodnie z obecnym nazewnictwem wszystkie serotypy Salmonella należa˛ do jednego gatunku, który podzielony jest na sześć podgrup (zwanych także podgatunkami), do których zaliczany jest dawny rodzaj Arizona. Podgrupa 1 odpowiada typowym pałeczkom Salmonella i obejmuje m.in.: Salmonella typhi, S. paratyphi A, S. enteritidis, S. typhimurium, S. choleraesuis. Podgrupa ta obejmuje około 2000 serotypów, które moga˛ być różnicowane na podstawie wzoru antygenów (antygeny O, H, Vi). Serotypy należa˛ce do podgrupy 1 sa˛nazywane w sposób sugeruja˛cy przynależność do rzeczywistych gatunków: Salmonella podgrupa 1 serotyp typhimurium jest nazywana po prostu S. typhimurium. Ponad 99% izolowanych od ludzi pałeczek Salmonella należy do podgrupy 1. Ważnymi antygenami w serotypowaniu Salmonella sa˛ antygeny somatyczne O i antygeny rze˛skowe H. Antygeny O wyste˛puja˛ zarówno u ruchliwych, jak i u nieruchliwych szczepów, sa˛ odporne na gotowanie; antygeny H wyste˛puja˛ jedynie u ruchliwych pałeczek i sa˛ wrażliwe na gotowanie. Wie˛kszość gatunków Salmonella wykazuje dwufazowa˛ ruchliwość i może wytwarzać dwie formy antygenów określanych jako antygeny fazy I i II. W obu fazach szczepy maja˛ ten sam antygen O, lecz różnia˛ sie˛ forma˛ antygenu H. Do identyfikacji serotypu konieczne jest określenie specyficzności antygenu H obu faz. Nie zawsze jest to możliwe, dlatego niekiedy, dla potwierdzenia obecności fazy latencji, konieczne jest jej zahamowanie. Antygeny O oznaczone sa˛ cyframi arabskimi. Antygeny H fazy I oznaczone sa˛ małymi literami rzymskimi, a antygeny H fazy II cyframi arabskimi. Na przykład, wzór antygenowy S. typhimurium to 1,4,[5],12:i:1,2, gdzie antygeny O to 1,4,5 i 12; antygeny H fazy I to ,,i’’, a fazy II to 1 i 2. Nawiasy oznaczaja˛, że antygen może być nieobecny, a podkreślenie wskazuje, że antygen zwia˛zany jest z lizogenna˛ konwersja˛ wywołana˛ przez bakteriofagi. Taka zmiana we wzorze 67 KAŁ antygenów możliwa jest jedynie w obecności bakteriofaga i może stanowić jedyna˛ różnice˛ mie˛dzy niektórymi serotypami. Gatunki Salmonella podzielono na grupy na podstawie obecności określonych antygenów O. Wspomniany podział jest także określany jako schemat Kauffmanna-White’a. Duże litery rzymskie określaja˛ grupy O. W oryginalnym schemacie grupy oznaczone były literami A, B, C, D i E; stopniowo poszerzono zakres grup od A do Z, z czterema podgrupami C, trzema D, czterema E i dwiema G. Grupy O określane sa˛ na podstawie obecności naste˛puja˛cych antygenów O: Grupa: Antygen: A 2 Ba C1 C2 4;5 6;7 6;8 D E1 F 9 3;10 11 Istnieja˛ inne różnice w strukturze antygenowej: zmiana w wygla˛dzie kolonii od gładkich do szorstkich w zależności od obecności lub braku antygenu Vi. Obecność antygenu Vi hamuje aglutynacje˛ w swoistej surowicy anty-O. Antygen Vi jest zwykle wykrywany w świeżo izolowanych szczepach i szybko tracony podczas ich przechowywania. Antygen ten jest ważny w identyfikacji szczepów S. typhi, cze˛sto nie ulegaja˛cych aglutynacji w heterogennej surowicy anty-H. Procedura identyfikacji antygenu somatycznego O Bezpośredni test aglutynacji szkiełkowej 1. Przed rozpocze˛ciem badania umieścić roztwór soli i odczynniki w temperaturze pokojowej. 2. Umieścić krople˛ roztworu soli na czystym szkiełku mikroskopowym. 3. Za pomoca˛ sterylnej ezy pobrać niewielka˛ ilość materiału z hodowli na skosie agarowym i rozprowadzić w kropli soli uzyskuja˛c jednolita˛, me˛tna˛ zawiesine˛. 4. Pod lupa˛ lub pod mikroskopem w niewielkim powie˛kszeniu (× 10) obejrzeć zawiesine˛ bakterii, aby wykluczyć autoaglutynacje˛ zawiesiny w soli. 5. Pobrać eza˛ 10 µl poliwalentnej surowicy odpornościowej O Salmonella (A-I i Vi) i umieścić ja˛ na szkiełku tuż obok zawiesiny bakterii. 6. Wymieszać surowice˛ z zawiesina˛ bakterii i przechylać szkiełko do przodu i do tyłu przez 1 minute˛. Obserwować tworzenie sie˛ grudek ogla˛daja˛c szkiełko w dobrym świetle. Pojawienie sie˛ w tym czasie wyraźnych grudek jest wynikiem dodatnim. 7. Jeśli wynik jest dodatni, powtórzyć badanie z monowalentna˛ surowica˛ odpornościowa˛. Niektóre pałeczki Salmonella maja˛ antygen powierzchniowy Vi i żywe lub nieinaktywowane termicznie nie ulegaja˛ aglutynacji z surowica˛ odpornościowa˛ grupy C1 (O:6,7) lub grupy D (O:9). Aby zapobiec otrzymaniu nieprawidłowego wyniku, w celu usunie˛cia antygenu Vi, zawiesine˛ należy podgrzać w gotuja˛cej sie˛ wodzie, schłodzić, oddzielić bakterie przez wirowanie, ponownie zawiesić w świeżym fizjologicznym roztworze soli i przeprowadzić test z ta˛ sama˛ surowica˛. a Wszystkie szczepy Salmonella podgrupy B zawieraja˛ antygen 4, tylko niektóre antygen 5. 68 69 Salmonella paratyphi B ujemny Salmonella serotyp paratyphi B dodatni D-winian Salmonella species dodatni H:1,2 dodatni Salmonella species H:1,2 ujemny Test z anty-H:1,2 Agar do oceny ruchu z anty-H:i Salmonella typhimurium H:i dodatni H:1,2 dodatni anty-H:b Test z anty-H:i Test z anty-H:1,2 Agar do oceny ruchu z anty-H:1,2 Agar do oceny ruchu z anty-H:b H:i dodatni wszystkie ujemne Salmonella enteritidis dodatni anty-H:m dodatni anty-grupa D Salmonella species ujemny ujemny Salmonella typhi dodatni anty-H:d Salmonella species Ryc. 8. Identyfikacja serologiczna gatunku Salmonella. Salmonella paratyphi A dodatni anty-H:a dodatni anty-grupa A dodatni WHO 01.51 Salmonella species ujemny ujemny Test z poliwalentna˛ surowica˛ anty-Salmonella A-I + Vi Biochemiczna identyfikacja: Salmonella paratyphi A obydwa jeden lub dodatnie obydwa ujemne anty-grupa D + anty-Vi* dodatni * Jeśli reakcja aglutynacji zachodzi jedynie z surowica˛ anty-Vi, należy zagotować zawiesine˛ bakterii i powtórzyć badanie z surowica˛ O:D. Salmonella species H:1,2 ujemny H:1,2 dodatni H:b dodatni Test z anty-H:b; anty-H:1,2; H:i dodatni anty-grupa B ujemny Test z poliwalentna˛ surowica˛ anty-Salmonella A-I + Vi Test z poliwalentna˛ surowica˛ anty-Salmonella A-I + Vi dodatni Biochemiczna identyfikacja: Salmonella typhi Biochemiczna identyfikacja: gatunek Salmonella CZE˛ŚĆ I KAŁ Procedura identyfikacji antygenu H Wste˛pna identyfikacja antygenu rze˛skowego H może być przeprowadzona w teście bezpośredniej aglutynacji, jak opisano powyżej dla antygenu somatycznego O. Niekiedy konieczne jest zwie˛kszenie ekspresji ruchu badanych szczepów przez kilkakrotne kolejne przesiewy na półpłynne podłoża odżywcze (,,swarm agar’’, patrz niżej). Surowice odpornościowe do wykonania testu z tymi antygenami sa˛ doste˛pne komercyjnie. Mimo to, jeśli identyfikacja obu faz rze˛skowych jest niezbe˛dna do klasyfikacji, wymagana jest faza zahamowania. Cze˛sto konieczna jest także inwersja faz z użyciem przeznaczonych do tego celu surowic1. 1. Przygotować półpłynne podłoża odżywcze zawieraja˛ce 0,2 – 0,4% agaru. Umieścić po 1 ml podłoża w probówkach. 2. Zasta˛pić korki probówek korkami z waty. 3. Upłynnić agar w gotuja˛cej sie˛ wodzie i umieścić probówki z płynnym agarem w łaźni wodnej w temperaturze 45°C na 30 minut. 4. Opisać każda˛probówke˛ numerem próbki i surowicy anty-H (H:b, H:i i H:1,2). Również probówke˛ kontrolna˛. 5. Dodać 10 µl heterogennej surowicy H każdej fazy inwersji do odpowiednich agarów, delikatnie wstrza˛sna˛ć probówki i pozostawić agar do skrzepnie˛cia w skosie. 6. Sporza˛dzić ge˛sta˛ zawiesine˛ izolowanych kolonii w roztworze fizjologicznym soli, posiać eza˛, nakłuwaja˛c skos, i inkubować przez noc. 7. Z hodowli uzyskanej na skosie pobrać eza˛ materiał i rozprowadzić równomiernie w kropli roztworu fizjologicznego soli. 8. Eza˛ o obje˛tości 10 µl pobrać krople˛ jednej z heterogennych surowic odpornościowych H i umieścić ja˛ na szkiełku, tuż obok zawiesiny bakterii. 9. Wymieszać surowice˛ z zawiesina˛ bakterii, przechylaja˛c szkiełko do przodu i do tyłu przez 1 minute˛. Obserwować tworzenie sie˛ grudek, ogla˛daja˛c szkiełko w dobrym świetle. Pojawienie sie˛ w tym czasie wyraźnych grudek świadczy o dodatnim wyniku. 10. Jeśli to konieczne, należy powtórzyć test aglutynacji z innymi heterogennymi surowicami i zidentyfikować serotyp, wykorzystuja˛c schemat przedstawiony na str. 69. Salmonella typhi Dla potwierdzenia identyfikacji biochemicznej należy przeprowadzić testy z surowicami odpornościowymi Vi, O grupy D (O:D) i H:d. Z powodu obecności antygenu Vi hodowle aglutynuja˛ce w surowicy Vi moga˛ nie aglutynować w surowicy O:D. Należy usuna˛ć antygen Vi, podgrzewaja˛c zawiesine˛ w temperaturze 100°C przez 20 minut, i powtórnie przeprowadzić test z surowica˛ O:D. Po uzyskaniu aglutynacji w surowicach Vi, O:D i H:d zanotować: ,,Salmonella typhi’’. Jeśli wynik jest dodatni jedynie w surowicy O:D, zanotować: ,,Salmonella, grupa D’’. 1 Doste˛pne w Statens Serum Institut, 5 Artillerivej, 2300 Copenhagen S, Denmark. 70 CZE˛ŚĆ I Salmonella paratyphi A Dla potwierdzenia identyfikacji biochemicznej należy przeprowadzić test z surowica˛odpornościowa˛Salmonella grupy A. Jeśli wynik jest dodatni, przeprowadzić test z surowica˛ H:a i w przypadku uzyskania dodatniego wyniku zanotować: ,,Salmonella paratyphi A’’. Jeśli wynik z surowica˛ H:a jest ujemny, zanotować: ,,Salmonella grupa A’’. Jeśli nie wykazano ruchu, można rozważyć obecność S. flexneri typ 6 lub S. boydii typ 13 lub 14 i przeprowadzić test z surowica˛ odpornościowa˛ Shigella B i D. Inne serotypy Salmonella Jeśli wyniki powyżej opisanych testów wskazuja˛ na obecność typowych pałeczek Salmonella, należy przeprowadzić testy z surowicami odpornościowymi Salmonella O grup A, B, C, D i E. • Jeśli dodatni wynik wskazuje na grupe˛ B, wykonać test z surowica˛ H:b, H:i i H:1,2. Jeśli uzyskamy wynik dodatni z surowica˛ H:b, identyfikowanym mikroorganizmem może być S. wien lub S. paratyphi B. S. wien można odróżnić od S. paratyphii B w odczynie alutynacji z surowica˛ H:1,w i H:2 (jeśli sa˛ doste˛pne). S. wien aglutynuje w surowicy H:1,w, a S. paratyphi w H:2. • Jeśli wynik z surowica˛ H:i lub H:1,2 jest dodatni, wywołać inwersje˛ fazy i przeprowadzić test z heterogenna˛ surowica˛ H. Jeśli wynik jest dodatni, zanotować: ,,S. typhimurium’’. Jeśli wynik jest ujemny, zanotować: ,,Salmonella grupa B’’. • Jeśli wynik z surowica˛ C jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella grupa C’’. • Jeśli wynik z surowica˛D jest dodatni, przeprowadzić testy z surowicami Vi, H:d i H:m. Jeśli wynik z surowica˛ Vi lub H:d jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella typhi’’. Jeśli wynik z surowica˛ H:m jest dodatni, zanotować: ,,Salmonella enteritidis’’. Jeśli testy z surowicami Vi, H:d i H:m sa˛ ujemne, zanotować: ,,Salmonella grupa D’’. • Jeśli identyfikacja biochemiczna wskazuje na szczep Salmonella, ale testy ze wszystkimi surowicami grup O sa˛ ujemne, zanotować: ,,Prawdopodobnie gatunek Salmonella’’ i przesłać do Centralnego Laboratorium Referencyjnego. Shigella Pałeczki Shigella można podzielić na serogrupy i serotypy na podstawie szkiełkowych i probówkowych odczynów aglutynacji ze swoistymi surowicami odpornościowymi O. Odczyn aglutynacji szkiełkowej zwykle wystarcza, jeśli wynik badania jest jednoznaczny. Zawiesina antygenu powinna być przygotowana z nieselektywnego podłoża, np. z agaru odżywczego lub KIA, i uważnie obserwowana w celu wykluczenia autoaglutynacji przed dodaniem surowicy. Testy z surowicami odpornościowymi Shigella grupy A, B, C i D • Jeśli pojawi sie˛ aglutynacja z surowica˛ grupy A, zanotować: ,,Shigella dysenteriae’’. Przeprowadzić test z surowica˛ S. dysenteriae typ 1. Jeśli jest dodatni, zanotować: ,,S. dysenteriae typ 1’’. 71 KAŁ • Jeśli pojawi sie˛ aglutynacja z surowica˛ grupy B, zanotować: ,,Shigella flexneri’’. • Jeśli pojawi sie˛ aglutynacja z surowica˛ grupy C, zanotować: ,,Shigella boydii’’. • Jeśli pojawi sie˛ aglutynacja z surowica˛ grupy D, zanotować: ,,Shigella sonnei’’. Czasami szczepy Shigella z powodu obecności antygenu K moga˛ nie ulegać aglutynacji w homologicznych surowicach. Podgrzanie zawiesiny szczepów w roztworze fizjologicznym soli w łaźni wodnej przez 20 minut i ponowne przeprowadzenie testu może znieść hamuja˛cy wpływ antygenu K. Niektóre Gram-ujemne mikroorganizmy moga˛ mieć antygeny wspólne ze szczepami Shigella i dawać fałszywie dodatnie wyniki aglutynacji z surowicami do typowania Shigella. Dobrze znanym przykładem bakterii daja˛cych krzyżowa˛ reakcje˛ sa˛ szczepy Plesiomonas shigelloides i Shigella sonnei fazy I oraz Hafnia i Shigella flexneri serotyp 4a; najważniejsza jest jednak krzyżowa reakcja z niektórymi odpowiedzialnymi za biegunke˛ szczepami E. coli. Yersinia enterocolitica Y. enterocolitica ma kilka antygenów somatycznych O, które zostały wykorzystane do podziału gatunku na 17 serogrup. Wie˛kszość zakażeń u ludzi w Kanadzie, Europie i Japonii wywołana jest przez serotyp O3. Infekcje wywołane przez serotyp O9 opisywano głównie w Skandynawii, infekcje wywołane przez serotyp O8 wyste˛puja˛ prawie wyła˛cznie w USA. Istnieje krzyżowa reakcja serologiczna mie˛dzy Y. enterocolitica O9 i Brucella spp. 72 Zakażenia górnych dróg oddechowych Wprowadzenie Górne drogi oddechowe obejmuja˛ obszar od krtani do nozdrzy, w skład którego wchodza˛: jama ustna, gardło i jama nosowo-gardłowa oraz przylegaja˛ce jamy zatok i ucho środkowe. Zakażenia wyste˛puja˛ce w górnych drogach oddechowych, to: – zapalenie gardła, niekiedy z zapaleniem migdałków, prowadza˛ce do ,,bolesnego gardła’’, – zapalenie jamy nosowo-gardłowej, – zapalenie ucha środkowego, – zapalenie zatok, – zapalenie nagłośni. Spośród wymienionych infekcji zdecydowanie najcze˛ściej wyste˛puje zapalenie gardła; nie leczone zakażenia moga˛ mieć poważne konsekwencje. W niniejszym opracowaniu zostanie omówione tylko zapalenie gardła. Wie˛kszość przypadków zapalenia gardła ma etiologie˛ wirusowa˛i samoograniczaja˛cy sie˛ przebieg. Jednakże około 20% infekcji wywołanych jest przez bakterie i zwykle wymaga leczenia odpowiednimi antybiotykami. Lekarz opieraja˛c sie˛ tylko na badaniu fizykalnym rzadko może rozróżnić zakażenie wirusowe i bakteryjne, dlatego najlepiej, jeśli leczenie jest oparte na wyniku badania mikrobiologicznego. Diagnostyka bakteriologiczna zapalenia gardła jest skomplikowana ze wzgle˛du na obecność licznej, mieszanej flory fizjologicznej złożonej z tlenowych i beztlenowych bakterii. Flora naturalna przewyższa zwykle liczebnie patogenna˛, rola mikrobiologa polega wie˛c na rozróżnieniu komensali od patogenów. Jeśli to możliwe, w wyniku badania należy uwzgle˛dnić tylko bakterie patogenne. Flora fizjologiczna gardła W skład naturalnej flory gardła wchodzi tak duża liczba gatunków, że pełna identyfikacja i uwzgle˛dnienie wszystkich w wyniku nie jest konieczne, zwłaszcza gdy w posiewie zaobserwowano: • paciorkowce zielenieja˛ce (α-hemolizuja˛ce) i pneumokoki, • niepatogenne Neisseria spp., • Moraxella (wcześniej Branhamella) catarrhalis (może być również patogenem układu oddechowego), • gronkowce (S. aureus, S. epidermidis), • dyfteroidy (z wyja˛tkiem C. diphtheriae), • Haemophilus spp., • drożdże (Candida spp.) w ograniczonej liczbie, • różne bezwzgle˛dnie beztlenowe ziarenkowce Gram-dodatnie, pałeczki Gram-ujemne, kre˛tki i formy nitkowate. 73 ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH U osób starszych, o obniżonej odporności lub niedożywionych, zwłaszcza po antybiotykoterapii, gardło może być skolonizowane przez pałeczki Enterobacteriaceae (Escherichia coli, Klebsiella spp. i in.) oraz Gram-ujemne pałeczki niefermentuja˛ce (Acinetobacter spp. i Pseudomonas spp.). Równie cze˛sto u takich pacjentów dochodzi do namnażania sie˛ w gardle szczepów S. aureus lub Candida spp. i innych gatunków drożdżopodobnych grzybów. Wymienione mikroorganizmy moga˛ wywoływać zapalenie gardła jedynie u pacjentów w okresie granulocytopenii, zaleca sie˛ jednak uwzgle˛dnienie w wyniku informacji o izolacji takich szczepów, ponieważ ich obecność może wskazywać na infekcje˛ (czy też ryzyko infekcji) dolnych dróg oddechowych (np.: zapalenie płuc) lub bakteriemie˛. Dla kolonizuja˛cych gardło mikroorganizmów zwykle nie nastawia sie˛ antybiogramu. Bakteryjne czynniki zapalenia gardła Streptococcus pyogenes (grupa A wg Lancefielda) jest z pewnościa˛ najcze˛stsza˛ przyczyna˛ bakteryjnego zapalenia gardła i migdałków. Zakażenie wyste˛puje najcze˛ściej u małych dzieci (5 – 12 lat). Jeśli zapaleniu gardła towarzyszy charakterystyczna wysypka, chorobe˛ określa sie˛ mianem gora˛czki płoniczej. U dzieci podczas paciorkowcowej infekcji gardła może dojść do zaje˛cia jamy nosowo-gardłowej z towarzysza˛ca˛ ropna˛ wydzielina˛ z nosa. Nie należa˛ce do grupy A β-hemolizuja˛ce paciorkowce (np. grupa B, C i G) rzadko sa˛ przyczyna˛ bakteryjnego zapalenia gardła i ich izolacje˛ należy odnotować w wyniku. Nieodpowiednio leczone infekcje gardła wywołane przez S. pyogenes moga˛ mieć konsekwencje w postaci gora˛czki reumatycznej i — rzadziej — kłe˛buszkowego zapalenia nerek. Dokładna identyfikacja i ukierunkowane leczenie przeciw S. pyogenes maja˛ na celu zapobieganie pojawieniu sie˛ gora˛czki reumatycznej. Corynebacterium diphtheriae wywołuje błonice˛, chorobe˛ wyste˛puja˛ca˛ endemicznie w wielu krajach. Tam, gdzie przerwano realizacje˛ programów szczepień, choroba może przyja˛ć rozmiary epidemii. Typowy dla C. diphtheriae przebieg infekcji (z kilkoma wyja˛tkami) charakteryzuje sie˛ obecnościa˛ szarawobiałych nalotów w miejscu zakażenia (gardło, migdałki, nos lub krtań). Błonica jest cie˛żka˛ choroba˛, w której diagnoza stawiana jest na podstawie objawów. Lekarz może zlecić dodatkowo wykonanie posiewu w kierunku maczugowców błonicy. W niektórych krajach coraz cze˛ściej rozpoznawane jest gonokokowe zapalenie gardła, którego cze˛stość wyste˛powania staje sie˛ porównywalna do rzeża˛czkowego zapalenia szyjki macicy i cewki moczowej. Posiew wymazów z gardła powinien być wykonywany na wyraźne polecenie lekarza z użyciem właściwego podłoża selektywnego (zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina). Martwicze, wrzodzieja˛ce zapalenie gardła (angina Vincenta) jest rzadkim stanem, charakteryzuja˛cym sie˛ wyste˛powaniem martwiczych owrzodzeń gardła z tworzeniem błon rzekomych lub bez błon rzekomych. W miejscu infekcji obecna jest liczna, bezwzgle˛dnie beztlenowa flora mieszana z przewaga˛ Gram-ujemnych bakterii nitkowatych i spiralnych, należa˛cych głównie do Fusobacterium spp. i Treponema vincenti. Bakterie te należa˛ do fizjologicznej flory jamy ustnej, jednak ich duża liczba widoczna w barwionym metoda˛ Grama preparacie 74 CZE˛ŚĆ I z wrzodzieja˛cych zmian powinna zostać odnotowana jako ,,kompleks wrzecionowcowo-kre˛tkowy’’. Rozpoznanie mikroskopowe nie wymaga potwierdzenia w hodowli beztlenowej, która jest trudna i czasochłonna. Obecność kompleksu nie wyklucza potrzeby poszukiwania innych patogenów, zwłaszcza S. pyogenes. C. albicans i inne gatunki Candida obecne w niewielkiej liczbie uznawane sa˛ za element flory fizjologicznej jamy ustnej, jednak w pewnych stanach chorobowych, np. u niedożywionych wcześniaków, u dorosłych z niedoborami odporności (np. pacjenci z HIV/AIDS) lub u pacjentów otrzymuja˛cych antybiotykoterapie˛, ich liczba wzrasta, prowadza˛c do wysta˛pienia kandydozy jamy ustnej. Zakażone powierzchnie — je˛zyk, migdałki, gardło i błona śluzowa policzków — moga˛ być intensywnie czerwone, pokryte białymi plamkami lub zlewaja˛ca˛ sie˛ szarobiała˛ błona˛ (pleśniawka). Potwierdzeniem kandydozy jest obecność w preparacie bezpośrednim barwionym metoda˛ Grama licznych, drożdżopodobnych grzybów, tworza˛cych niekiedy długie, przypominaja˛ce grzybnie˛ nici. Posiewy z górnych dróg oddechowych moga˛ być przesyłane do laboratorium nie tylko w celu zdiagnozowania infekcji, ale także w celu wykrycia obecności potencjalnie patogennych szczepów u zdrowych ludzi — ,,nosicieli’’. Takie badania powinny być wykonywane w ramach dobrze prowadzonego nadzoru epidemiologicznego. W górnych drogach oddechowych wyste˛puje nosicielstwo: • Staphylococcus aureus. Badania wymazów z nosa pacjentów i personelu szpitalnego w kierunku nosicielstwa jest zalecane podczas ustalania źródła zakażenia metycylinoopornym S. aureus (MRSA). • Neisseria meningitidis. Nawet poza okresem epidemii nosicielstwo meningokoków może być bardzo cze˛ste (20% i wie˛cej). Identyfikacja nosicieli rzadko jest konieczna i nie ma potrzeby wykonywania badań w tym kierunku przed zaleceniem profilaktyki antybiotykowej u rodziny i u osób z bliskiego kontaktu pacjenta z zapaleniem opon mózgowo-rdzeniowych. • Streptococcus pyogenes. Nosicielstwo niewielkiej liczby tych bakterii może być powszechne, zwłaszcza wśród dzieci szkolnych (20 – 30%). • Corynebacterium diphtheriae. Wysoki odsetek nosicielstwa wyste˛puje w populacjach nie szczepionych. W takich społecznościach uzasadnione może być wykonywanie identyfikacji i leczenie nosicielstwa u osób z otoczenia pacjenta z potwierdzona˛ błonica˛. Nosicielstwo jest rzadkie w krajach, w których właściwie realizowany jest program szczepień. Pobieranie i przesyłanie próbek Najlepiej, jeśli materiał pobierany jest przez lekarza lub przez inna˛ osobe˛ wykwalifikowana˛. Pacjent powinien siedzieć twarza˛ do źródła światła. Należy przytrzymać je˛zyk szpatułka˛ i sterylna˛ wymazówka˛ energicznie pobrać wymaz z każdego migdałka, z tylnej ściany gardła i z innych zmienionych zapalnie miejsc (wymazówke˛ należy wcześniej zwilżyć jałowym fizjologicznym roztworem soli — przyp. tłum.). Należy uważać, aby nie dotkna˛ć je˛zyka lub błony śluzowej policzków. Najlepiej, jeśli zostana˛ pobrane po dwa wymazy z każdego miejsca. Jeden może być wykorzystany do przygotowania preparatu bezpośredniego, a drugi należy umieścić w szklanej lub plastikowej probówce i przesłać do laboratorium. Można także obydwa wymazy przesłać do laboratorium. Jeśli posiew pobranego materiału nie może być wykonany w cia˛gu 4 godzin, wymazówki należy umieścić w podłożu transportowym (np. Amies lub Stuart). 75 ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Mikroskopia bezpośrednia Charakterystyczny dla wrzodzieja˛cego zapalenia gardła (angina Vincenta) kompleks wrzecionowcowo-kre˛tkowy oraz grzyby Candida sa˛ najlepiej widoczne w preparacie barwionym metoda˛ Grama, który powinien być wykonany na zlecenie lekarza. Barwienie metoda˛ Grama jest nieprzydatne w wykrywaniu paciorkowców czy Neisseria spp. Preparat bezpośredni jest także niewystarczaja˛co specyficzny i czuły w wykrywaniu maczugowca błonicy, chyba że materiał został pobrany bardzo starannie i zbadany przez doświadczonego mikrobiologa. Przy braku wskazań klinicznych lub bez zlecenia lekarza nie ma potrzeby wykonywania preparatów bezpośrednich z gardła. Hodowla i identyfikacja Hodowla Streptococcus pyogenes Natychmiast po dostarczeniu do laboratorium materiał musi zostać posiany wymazówka˛ na jedna˛ czwarta˛ płytki agarowej z krwia˛ i rozsiany eza˛ na pozostała˛ cze˛ść płytki. Agar z krwia˛ powinien być przygotowany z podstawowego podłoża agarowego bez glukozy (lub z mała˛zawartościa˛ glukozy), np. z agaru tryptozowo-sojowego (TSA). Kwaśny rozkład glukozy przez S. pyogenes hamuje wytwarzanie hemolizyn. Do przygotowania podłoży można wykorzystać krew każdego gatunku (świeżo pobrana˛) w ste˛żeniu 5%. Płytki należy wypełnić 4 – 5 mm warstwa˛ podłoża. Preferowana jest krew wołowa, ponieważ ulega hemolizie pod wpływem pewnych komensalnych pałeczek Haemophilus spp. i nie daje hemolizy w obecności zymogennego wariantu Enterococcus faecalis. Można poprawić rozpoznawanie β-hemolizuja˛cych kolonii i przyspieszyć ich wste˛pna˛ identyfikacje˛, umieszczaja˛c na płytce w strefie pierwszego posiewu kra˛żek z kotrimoksazolem (taki, jakiego używa sie˛ podczas określania lekowrażliwości) i specjalny kra˛żek o niskiej zawartości bacytracyny. Ponieważ S. pyogenes w odróżnieniu od wielu innych bakterii jest oporny na kotrimoksazol, kra˛żek ułatwia obserwacje˛ β-hemolizy. Inkubacja w eksykatorze pozwala na wykrycie wie˛kszości β-hemolizuja˛cych paciorkowców. Prostym sposobem nasilaja˛cym hemolize˛ jest głe˛bokie, pionowe nakłucie agaru eza˛, które przyspiesza wzrost kolonii pod powierzchnia˛. Po 18 godzinach i ponownie po 48 godzinach inkubacji w 35 – 37°C odczytać płytki z krwia˛, poszukuja˛c małych (0,5 – 2 mm) kolonii, otoczonych stosunkowo duża˛ strefa˛ wyraźnej hemolizy. Po wykonaniu preparatu barwionego metoda˛ Grama i potwierdzeniu obecności Gram-dodatnich ziarenkowców bakterie należy identyfikować w kierunku S. pyogenes. Dla potrzeb klinicznych wste˛pna identyfikacja oparta jest na ocenie wrażliwości na niskie ste˛żenie bacytracyny. W tym celu wykorzystuje sie˛ specjalnie przygotowane kra˛żki różnicuja˛ce, zawieraja˛ce 0,02 – 0,05 IU bacytracyny. Zwykłe kra˛żki wykorzystywane do antybiogramów zawieraja˛ 10 IU i sa˛ nieprzydatne do identyfikacji. Obecność β-hemolizuja˛cych paciorkowców ze strefa˛ zahamowania wzrostu wokół kra˛żka świadczy o izolacji S. pyogenes. Jeśli w pierwszym posiewie hemolizuja˛ce kolonie sa˛ liczne, obecność lub brak strefy zahamowania wzrostu sa˛ wyraźnie widoczne już na pierwszej posianej płytce zawieraja˛cej agar z krwia˛. Jeśli kolonie sa˛ mniej liczne, należy z pierwszej płytki pobrać jedna˛ lub dwie kolonie, posiać je na 1/5 kolejnej płytki w celu uzyskania cia˛głego wzrostu i na każdym posianym polu umieścić kra˛żek z bacytracyna˛. Strefy zahamowania wzrostu należy odczytać po całonocnej inkubacji. 76 CZE˛ŚĆ I W niektórych laboratoriach wste˛pna identyfikacja potwierdzana jest serologicznie przez wykazanie obecności specyficznych polisacharydów ściany komórkowej. Test może być przeprowadzony z użyciem klasycznej metody precypitacji lub — szybciej — z użyciem komercyjnych przeciwciał w teście szybkiej koaglutynacji szkiełkowej lub w teście aglutynacji lateksowej. Jeśli istnieje taka potrzeba, β-hemolizuja˛ce paciorkowce oporne na bacytracyne˛ można identyfikować wykorzystuja˛c do tego celu proste testy (patrz tabela 19). Obecność S. pyogenes w posiewie z gardła powinna zostać określona w wyniku w sposób półilościowy (nieliczne, +, ++ lub +++). Masywny wzrost S. pyogenes na całej powierzchni płytki jest charakterystyczny dla materiałów pobranych od pacjentów z paciorkowcowym zapaleniem gardła. Hodowle od nosicieli wykazuja˛ zwykle wzrost mniej niż 20 kolonii na płytce. Obecność nawet nielicznych kolonii β-hemolizuja˛cych paciorkowców powinna zostać potwierdzona i zanotowana. Tabela 19. Różnicowanie β -hemolizuja˛cych paciorkowców S. pyogenes S. agalactiae E. faecalis var. zymogenesa Inne Grupa Lancefield A B D C, G, F Hemoliza Strefa wokół różnicuja˛cego kra˛żka z bacytracyna˛ Agar z żółcia˛ i z eskulina˛ (wzrost i zaczernienie) Odwrotny test CAMP Wrażliwość na kotrimoksazole Test PYRf β + b β 0c β 0c β 0d 0 0 + 0 0 0 + 0 0 0 0 + + 0 + 0 Gatunki a b c d e f E. faecalis var. zymogenes wykazuja˛ce β-hemolize˛ tylko na agarze z krwia˛ końska˛. 5% niehemolizuja˛cych. 5% dodatnich. 10% dodatnich. Kra˛żek jak w teście Kirby-Bauera. PYR: pirolidonylo-β-naftylamid. Hodowla Corynebacterium diphtheriae Mimo że maczugowiec błonicy dobrze rośnie na zwykłym agarze z krwia˛, lepszy wzrost uzyskuje sie˛ przy posiewie na jedno z dwóch specjalnych podłoży: • Skoagulowana surowica Löfflera lub podłoże jajeczne Dorseta. Jakkolwiek nieselektywne, obydwa te podłoża umożliwiaja˛ obfity wzrost maczugowca błonicy po jednodniowej inkubacji. Ponadto morfologia komórek jest bardziej ,,typowa’’: nieregularnie wybarwione, krótkie lub długie, lekko zakrzywione pałeczki wykazuja˛ce metachromatyczne ziarnistości i ułożone w kształt V lub równoległych palisad. Metachromatyczne ziarnistości sa˛ wyraźniej widoczne po wybarwieniu błe˛kitem metylenowym lub barwieniu Alberta niż po zabarwieniu metoda˛ Grama. • Selektywny agar tellurynowy z krwia˛. Podłoże to ułatwia izolacje˛, jeśli maczugowce sa˛ nieliczne, jak np. w przypadku nosicieli. Na tym podłożu kolonie maczugowców błonicy sa˛ szarawe lub czarne, a pełny wzrost pojawia sie˛ po 48 godzinach. Charakterystyczne kolonie, zawieraja˛ce w preparacie barwionym metoda˛ Grama pałeczki o morfologii podobnej do maczugowców, należy przesiać na płytke˛ z agarem z krwia˛ i określić ich czystość oraz 77 ZAKAŻENIA GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH ,,typowa˛’’ morfologie˛. Należy pamie˛tać, że kolonie C. diphtheriae najcze˛ściej wyste˛puja˛cego biotypu mitis, wytwarzaja˛ na agarze z krwia˛ wyraźna˛ strefe˛ β-hemolizy. Wste˛pny wynik identyfikacji C. diphtheriae może zostać wydany już na tym etapie. Wynik ten powinien zostać potwierdzony lub wykluczony za pomoca˛ prostych testów biochemicznych oraz przez wykazanie zdolności szczepu do wytwarzania toksyn. Badanie immunogenności jest wykonywane na świnkach morskich lub za pomoca˛ testu toksygenności in vitro (próba Eleka) i powinno być przeprowadzane w centralnych laboratoriach, w pozostałych identyfikacja jest oparta na szybkich testach biochemicznych. C. diphtheriae jest katalazoi azotanododatni. Nie hydrolizuje mocznika. Z glukozy i maltozy, ogólnie nie z sacharozy, wytwarza kwas bez gazu. Test fermentacji glukozy może być przeprowadzony na podłożu Kliglera. Aktywność ureazy można wykryć na podłożu MIU, a redukcje˛ azotanu na bulionie azotanowym, w ten sam sposób, jak dla Enterobacteriaceae. Do oceny fermentacji maltozy i sacharozy można użyć jako bazy wody peptonowej Andrade’a z końcowym 1% ste˛żeniem każdego wodorowe˛glanu. Wyniki zwykle odczytuje sie˛ po 24 godzinach, choć konieczna może okazać sie˛ reinkubacja przez noc. Należy podkreślić, że diagnostyka laboratoryjna ma na celu potwierdzenie klinicznie rozpoznanej błonicy. Nie należy zwlekać z rozpocze˛ciem terapii do czasu otrzymania wyników z laboratorium. Wie˛cej informacji na temat izolacji i identyfikacji C. diphtheriae znaleźć można w podre˛czniku Guidelines for laboratory diagnosis of diphtheria1. Badanie lekowrażliwości Rutynowe badanie lekowrażliwości szczepów izolowanych z gardła zazwyczaj nie jest wymagane, a nawet może okazać sie˛ myla˛ce. W wie˛kszości bakteryjnych zakażeń gardła czynnikami etiologicznymi sa˛ S. pyogenes i C. diphtheriae, a lekiem z wyboru w antybiotykoterapii sa˛ benzylopenicylina i erytromycyna. W przypadku błonicy wskazane jest również leczenie antytoksyna˛. 1 Begg N.: Manual for the menagement and control of diphtheria in the European region. Copenhagen, WHO Regional Office for Europe, 1994. 78 Zakażenia dolnych dróg oddechowych Wprowadzenie Zakażenia dolnych dróg oddechowych wyste˛puja˛ poniżej poziomu krtani, np. w tchawicy, oskrzelach lub tkance płucnej (zapalenie tchawicy, zapalenie oskrzeli, ropień płuca, zapalenie płuc). Czasami w zapaleniu płuc zakażeniem obje˛ta jest przyległa błona pokrywaja˛ca płuca, w konsekwencji pojawia sie˛ zgrubienie opłucnej (zapalenie opłucnej) i płyn w jamie opłucnej (wysie˛k opłucnej). Specyficzna˛ forma˛ zakażenia dolnych dróg oddechowych jest gruźlica płucna, która wyste˛puje powszechnie w wielu krajach. Pacjent kaszla˛c może uwalniać aerozol zawieraja˛cy pra˛tki gruźlicy (Mycobacterium tuberculosis), które moga˛ zostać zainhalowane przez innych ludzi. Taka forma choroby (,,czynna’’ gruźlica) szybko szerzy sie˛ z osoby na osobe˛ i dlatego zaliczana jest do niebezpiecznych chorób zakaźnych. Wielu pacjentów z zakażeniem dolnych dróg oddechowych odkrztusza ropna˛ (zawieraja˛ca˛ rope˛) wydzieline˛, która zwykle ma zielony lub żółtawy kolor; taka plwocina może być posiewana, badana makroskopowo i mikroskopowo. W niektórych zakażeniach plwociny jest bardzo niewiele lub nie obserwuje sie˛ jej wcale: choroba legionistów (wywołana przez Legionella pneumophila), zapalenie płuc wywołane przez Mycoplasma pneumoniae (,,pierwotne atypowe zapalenie płuc’’) i zapalenie płuc wywołane przez chlamydie. Choroby te wymagaja˛ specjalnych metod diagnostycznych (serologia, izolacja na specjalnych podłożach) i nie be˛da˛ omawiane w niniejszym opracowaniu. Poza gruźlica˛ płuc (patrz poniżej) wie˛kszość badań mikrobiologicznych plwociny dotyczy pacjentów z infekcjami dróg oddechowych, u których wyste˛puje ropna plwocina. Najcze˛stsze postacie kliniczne zakażeń Ostre i przewlekłe zapalenie oskrzeli U pacjentów z ostrym zapaleniem oskrzeli (rozwijaja˛cym sie˛ najcze˛ściej po ostrej infekcji wirusowej, takiej jak typowe przezie˛bienie czy grypa) zwykle nie wykonuje sie˛ posiewu plwociny, chyba że stan kliniczny pacjenta sie˛ nie poprawia. Przewlekłe zapalenie oskrzeli jest długotrwaja˛ca˛ choroba˛ upośledzaja˛ca˛ funkcje˛ układu oddechowego, która przebiega z okresowymi zaostrzeniami. Wie˛kszość pacjentów codziennie wykrztusza szara˛, śluzowa˛ plwocine˛; w trakcie choroby wyste˛puja˛ epizody pogorszenia stanu pacjenta i wykrztuszania wyraźnie ropnej plwociny. Jest to tak zwane zaostrzenie przewlekłego zapalenia oskrzeli. W próbkach plwociny cze˛sto obecne sa˛ typowe patogeny układu oddechowego (Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae lub — rzadziej — Moraxella (Branhamella) catarrhalis). 79 ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Ropień płuca Ropień płuca może uformować sie˛ w naste˛pstwie aspiracji ciała obcego, zawartości żoła˛dka lub wydzieliny górnych dróg oddechowych (jama ustna lub gardło). Ten stan niekiedy jest określany terminem ,,aspiracyjnego zapalenia płuc’’. Można podja˛ć próbe˛ hodowli z odkrztuszonej plwociny (która zwykle ma wyja˛tkowo brzydki zapach), lecz — jeśli obecny jest ropień (uwidoczniony w badaniu radiologicznym) — materiałem do badań powinna być zawarta w nim ropa, która˛ należy wykorzystać do badania mikroskopowego i posiewu. Niestety brak jest wytycznych dotycza˛cych sposobu jej uzyskania, choć jedna˛z możliwości jest bezpośrednia biopsja i usunie˛cie ropy. Cze˛stym i ważnym czynnikiem etiologicznym sa˛ bakterie beztlenowe, takie jak Prevotella melaninogenica (wcześniej Bacteroides melaninogenicus) i Peptostreptococcus spp., pochodza˛ce z flory jamy ustnej i gardła. Należy pobrać rope˛, dostarczyć do laboratorium i opracować zgodnie ze standardowymi metodami hodowli bakterii beztlenowych z ropy (patrz str. 104 i str. 117). Zapalenie płuc oraz zapalenie oskrzeli i płuc Ostre płatowe zapalenie płuc zwykle dotyczy pojedynczego płata płuca. Prawie zawsze wywoływane jest przez S. pneumoniae. Ta postać zapalenia pojawia sie˛ epidemicznie. Przyczyna˛ rzadziej wyste˛puja˛cej podobnej formy zapalenia płuc jest Klebsiella pneumoniae. Klasyczna postać zapalenia płuc rozwija sie˛ u niewielu pacjentów zakażonych S. pneumoniae lub K. pneumoniae, cze˛stsza˛ forma˛ choroby jest zapalenie oskrzeli i płuc z plamkami naciekowymi i zapalnymi (określanymi jako ,,konsolidacja’’), rozproszonymi w jednym lub cze˛ściej w obu płucach. Z zapaleniem oskrzeli i płuc zwia˛zanych jest wiele różnych czynników wirusowych i bakteryjnych. Poza S. pneumoniae i niekiedy H. influenzae, przyczyna˛ zapalenia oskrzeli i płuc, zwłaszcza podczas epidemii grypy lub odry, jest Staphylococcus aureus. Cze˛sto także stwierdza sie˛ obecność Gram-ujemnych pałeczek (szczególnie E. coli i K. pneumoniae) oraz Pseudomonas aeruginosa. Zakażenia te wyste˛puja˛ powszechnie na oddziałach intensywnej terapii, zwłaszcza w trakcie stosowania antybiotyków o szerokim spektrum działania lub przy prowadzeniu wentylacji mechanicznej i sa˛ efektem nadmiernego zużycia antybiotyków oraz niewłaściwego monitorowania wczesnych objawów infekcji u pacjentów. W przypadku wysta˛pienia wysie˛ku w jamie opłucnej płyn należy zbadać mikroskopowo i wykonać posiew zgodnie z procedura˛ opisana˛ dla ropy i wysie˛ków. Gruźlica płuc Plwocina pacjentów z gruźlica˛ płuc zwykle nie jest wyraźnie ropna, niemniej ropny charakter nie jest przeciwwskazaniem do jej wykorzystania w diagnostyce gruźlicy. Wybarwione preparaty (metoda˛ Ziehl-Neelsena) należy obejrzeć w mikroskopie w celu szybkiej identyfikacji pacjentów z obecnościa˛ kwasoopornych 80 CZE˛ŚĆ I bakterii w plwocinie1. Po wykonaniu preparatu plwocina powinna zostać poddana procedurze dekontaminacji (patrz str. 85) w celu zniszczenia możliwie najwie˛kszej liczby niepra˛tkowych drobnoustrojów i zachowania żywych pra˛tków gruźlicy do posiewu na podłoże Löwensteina-Jensena. Ponieważ procedury bakteriologicznej diagnostyki ropnych infekcji dróg oddechowych, takich jak zapalenie oskrzeli i zapalenia płuc, zasadniczo różnia˛ sie˛ od procedur stosowanych w gruźlicy, zostana˛ one omówione oddzielnie. Lekarz w skierowaniu do laboratorium musi jasno określić kierunek badań: • bakterie ropotwórcze (H. influenzae, S. pneumoniae i in.), • pra˛tki gruźlicy (M. tuberculosis), • obydwa typy bakterii. Pobieranie próbek plwociny Pobieranie odpowiednich próbek plwociny jest sztuka˛ sama˛ w sobie i zostało opisane w innych opracowaniach2. Badanie źle pobranej próbki plwociny może dać fałszywe wyniki z powodu zanieczyszczenia próbki bakteriami wchodza˛cymi w skład naturalnej flory jamy ustnej i gardła; ,,plwocina’’ zawieraja˛ca śline˛ i cza˛stki pożywienia nie powinna być badana. Próbke˛ plwociny należy pobrać do sterylnego pojemnika z szerokim wlotem oraz z bezpiecznym, szczelnym zamknie˛ciem i niezwłocznie przesłać do laboratorium. Opóźnione przesłanie plwociny po pobraniu może spowodować przerost próbki zanieczyszczaja˛cymi ja˛ bakteriami i prowadzi do otrzymania myla˛cych wyników barwienia i hodowli. Z tego powodu nie zaleca sie˛ przesyłania próbek do laboratorium poczta˛. Wyja˛tek stanowia˛ próbki pobrane do badań w kierunku gruźlicy, które moga˛ być przesyłane do lokalnych lub regionalnych laboratoriów. Należy ściśle przestrzegać lokalnych i państwowych przepisów, dotycza˛cych przesyłania zakaźnego (patogennego) materiału. Opracowanie plwociny w laboratorium (w zakażeniach niegruźliczych) Po pobraniu plwocina musi zostać natychmiast opracowana lub umieszczona w chłodziarce. Ocena makroskopowa Należy odnotować ocene˛ makroskopowa˛ plwociny. Możliwe opisy obejmuja˛: ropna, zielona ropna, żółta śluzowo-ropna (tj. cze˛ściowo śluzowa i cze˛ściowo ropna) 1 Patrz Manual of basic techniques for a health laboratory, 2nd ed. Geneva, World Health Organization, 2003. 2 Specimen collection and transport for microbiological investigation. Alexandria, WHO Regional Office for the Eastern Mediterranean, 1995 (WHO Regional Publicatinos, Eastern Mediterranean Series 8). Manual of basic techniques for a health laboratory, 2nd ed. Geneva World Health Organization, 2003. Technical guide for sputum examination for tuberculosis by direct microscopy. Bulletin of the International Union Against Tuberculosis and Lung Disease, 4th ed. 1996. 81 ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH podbarwiona krwia˛ podbarwiona krwia˛, z zielonymi kłaczkami *szara, śluzowa *szara, spieniona *biała, śluzowa *biała, spieniona *biała, śluzowa z cza˛stkami pożywienia *wodnista (tj. obecna tylko ślina) *wodnista z cza˛stkami pożywienia Próbki oznaczone gwiazdkami nie powinny być badane w kierunku zakażeń niegruźliczych. Badanie mikroskopowe Preparat barwiony metoda˛ Grama należy przygotować z próbki ropnej lub śluzowo-ropnej plwociny. Jeśli nie obserwuje sie˛ śladów ropy (np. w próbce szarej, śluzowej plwociny), barwienie metoda˛ Grama może wykazać jedynie obecność dużych komórek nabłonka płaskiego, cze˛sto pokrytych masa˛ przylegaja˛cych bakterii. Jest to wskazówka, że próbka zawiera głównie wydzieline˛ jamy ustnej lub gardła i nie powinno sie˛ prowadzić hodowli, której wyniki be˛da˛niewiarygodne czy też bardzo myla˛ce. Zaleca sie˛ rezygnacje˛ z hodowli w przypadku, gdy próbka zawiera mniej niż 10 neutrofilów wieloja˛drzastych na 1 komórke˛ nabłonka1. U wielu pacjentów z ostra˛ infekcja˛ oddechowa˛ (np. zapalenie płuc) i ropna˛ plwocina˛ natychmiastowe wykonanie preparatu barwionego metoda˛ Grama może pomóc klinicyście w wyborze antybiotykoterapii. Możliwe wyniki to: • Gram-dodatnie dwoinki otoczone pusta˛ przestrzenia˛ z powodu niezabarwionych otoczek (podejrzenie S. pneumoniae); • małe Gram-ujemne krótkie pałeczki (prawdopodobnie H. influenzae); • Gram-ujemne dwoinki, widoczne wewna˛trz- i zewna˛trzkomórkowo (podejrzenie Moraxella catarrhalis); • Gram-dodatnie ziarenkowce w skupiskach, przypominaja˛cych grona (podejrzenie S. aureus); • Gram-ujemne pałeczki (podejrzenie obecności Enterobacteriaceae lub Pseudomonas spp.); • duże Gram-dodatnie drożdżopodobne komórki cze˛sto z grzybnia˛ (wskazuja˛ na obecność Candida spp.). Procedury hodowli i interpretacja Jeśli mikroskopowo próbka przedstawia akceptowalna˛ jakość plwociny, wybrać fragment ropnego materiału (lub najbardziej przypominaja˛cego ropny) używaja˛c sterylnej wymazówki lub ezy i posiać na różne podłoża hodowlane. 1 Heinemann H.S., Radano R.R.: Acceptability and cost savings of selective sputum microbiology in a community teaching hospital. Journal of Clinical Microbiology, 1979, 10: 567 – 573. 82 CZE˛ŚĆ I Sugerowany zestaw podłoży obejmuje: • agar z krwia˛ z rozmazem S. aureus, ułatwiaja˛cym satelitarny wzrost H. influenzae i z kra˛żkiem zawieraja˛cym optochine˛, umieszczonym w centrum rozsiewu, • agar czekoladowy, • agar MacConkeya. Płytki z agarem z krwia˛ i z agarem czekoladowym należy inkubować w 35 – 36°C w atmosferze wzbogaconej dwutlenkiem we˛gla (np. eksykator), a płytke˛ MacConkeya w powietrzu atmosferycznym. Jeśli w barwionym preparacie obecne sa˛ skupiska Gram-dodatnich ziarenkowców, przypominaja˛ce kształtem winogrona, zaleca sie˛ wykorzystanie dodatkowo płytki agarowej z mannitolem (MSA). Obecność Gram-dodatnich drożdżopodobnych struktur może być wskazaniem do posiewu na podłoże Sabouraud (dla którego konieczna jest inkubacja przez co najmniej 3 dni w 35 – 37°C). Posiew na podłoża MSA i Sabouraud nie musi być wykonywany rutynowo dla wszystkich próbek plwociny. Posiewy powinny być odczytywane po całonocnej inkubacji (18 godzin), a reinkubacja przez dodatkowe 24 godziny jest wskazana, jeśli wzrost jest słabszy niż oczekiwany na podstawie obserwacji mikroskopowych lub gdy obecne sa˛ bardzo drobne kolonie. Typowe wyniki obserwacji przedstawiono poniżej: • Płaskie, jasne kolonie z wgłe˛bionymi środkami i strefa˛ zielonej (α-) hemolizy oraz strefa˛ zahamowania wzrostu wokół kra˛żka z optochina˛ moga˛ wskazywać na S. pneumoniae. Jeśli odczyt testu z kra˛żkiem z optochina˛ w pierwszym posiewie nie jest rozstrzygaja˛cy, należy powtórzyć test na przesiewie. Nie można zapominać, że w fizjologicznej florze jamy ustnej i gardła wyste˛puja˛ inne α-hemolizuja˛ce szczepy (wspólnie nazywane paciorkowcami zielenieja˛cymi). • Drobne, kropelkowe kolonie rosna˛ce na płytce agarowej z krwia˛ w postaci niehemolizuja˛cych kolonii satelitarnych i znacznie wie˛ksze kolonie na płytce agaru czekoladowego lub agaru z krwia˛ sugeruja˛ obecność H. influenzae. Kolonie te najcze˛ściej sa˛ liczne, zwykle ponad 20 na płytce. Niektóre laboratoria dla potwierdzenia identyfikacji wykonuja˛ testy z czynnikami wzrostu X i V, które jednak wymagaja˛ uważnej kontroli. Serologiczne typowanie szczepów izolowanych z układu oddechowego najcze˛ściej nie jest przydatne, ponieważ wie˛kszość z nich jest ,,szorstka’’ i nie podlega typowaniu. • Kruche, suche, szarobiałe kolonie na płytkach agaru z krwia˛ lub agaru czekoladowego, które można przesuwać w całości za pomoca˛ ezy, moga˛ wskazywać na M. catarrhalis. Jeśli istnieje potrzeba, można przeprowadzić testy rozkładu cukrów (wszystkie wyniki testów ujemne), ale wie˛kszość laboratoriów ich nie wykonuje. Drobnoustroje Moraxella sa˛silnie oksydazododatnie, a wygla˛d ich kolonii i obraz mikroskopowy sa˛bardzo charakterystyczne. Jakkolwiek morfologicznie Moraxella przypomina Neisseria spp., do różnicowania można użyć testu z trójmaślanem glicerolu, który jest hydrolizowany przez Moraxella. • Średniej wielkości, złotoszare kolonie tworzone sa˛ przez S. aureus. Testy koagulazowy i test fermentacji mannitolu sa˛ dodatnie, choć szkiełkowy odczyn koagulacji (odczyn ,,zwia˛zanej’’ koagulazy) jest czasami ujemny. Jeśli istnieje sprzeczność mie˛dzy wygla˛dem kolonii i testem szkiełkowym, należy przeprowadzić probówkowy test koagulazy (,,wolna’’ koagulaza). 83 ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH • Kolonie na agarze MacConkeya sugeruja˛ obecność Enterobacteriaceae lub Pseudomonas spp. lub Acinetobacter spp. • Białawe, okra˛głe, matowe kolonie na agarze z krwia˛ i agarze czekoladowym moga˛ wskazywać na Candida albicans, który be˛dzie również rosna˛ć po 3 – 4 dniach na podłożu Sabouraud. Warto podkreślić, że pojedyncze kolonie każdego z powyższych organizmów pochodza˛z flory naturalnej układu oddechowego lub sa˛wynikiem kolonizacji (np. bakterie jelitowe, grzyby). Ponieważ nie maja˛ wpływu na poste˛powanie z pacjentem, nie należy uwzgle˛dniać ich w wyniku lub, jeżeli zostana˛ uwzgle˛dnione, zaznaczyć, że jest to flora kolonizuja˛ca. Badanie lekowrażliwości Badanie lekowrażliwości należy wykonywać tylko dla drobnoustrojów dominuja˛cych w hodowli, natomiast nie ma takiej potrzeby w przypadku szczepów obecnych w posiewie jedynie w niewielkiej liczbie. Interpretacje˛ niektórych uzyskiwanych wyników przedstawiono w tabeli 20. Tabela 20. Interpretacja wyników testów wrażliwości dla bakterii o wyższych wymaganiach odżywczycha Średnica strefy (mm) Oporny Średnio wrażliwy Wrażliwy 2 19b — 1 20 Tetracyklina (30 µg) 2 18 19 – 22 1 22 Erytromycyna (15 µg) 2 15 16 – 20 1 21 Chloramfenikol (30 µg) 2 20 — 1 21 Kotrimoksazol (25 µg) 2 15 16 – 18 1 19 Tetracyklina (30 µg) 2 14 15 – 18 1 19 Erytromycyna (15 µg) Kotrimoksazol (25 µg) 2 13 2 10 14 – 22 11 – 15 1 23 1 16 S. pneumoniae (podłoże Mueller-Hintona z 5% krwi baraniej, inkubacja w 5% CO2) Oksacylina (1 µg) (dla benzylopenicyliny) M. catarrhalis (podłoże Mueller-Hintona) a b National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. M100-S8. Vol 18, 1998. Oporny lub średnio wrażliwy. W badaniu lekowrażliwości pałeczek Enterobacteriaceae i gronkowców należy wykorzystać standaryzowana˛ metode˛ dyfuzyjno-kra˛żkowa˛ (Kirby-Bauera). Wrażliwość szczepów S. pneumoniae na tetracykline˛, chloramfenikol, erytromycyne˛ i benzylopenicyline˛ powinna być oceniana na agarze Mueller-Hintona, wzbogaconym 5% krwia˛ bydle˛ca˛. Można również użyć zwykłego agaru z krwia˛. Wrażliwość na benzylopenicyline˛ lepiej oznaczyć używaja˛c kra˛żka zawieraja˛cego 1 µg oksacyliny, który wykazuje wie˛ksza˛ zgodność z wartościami MIC dla benzylopenicylin; jest również bardziej stabilny. Kra˛żki zawieraja˛ce benzylopenicyline˛ moga˛ szybko ulegać dezaktywacji w wyższych temperaturach, co powoduje uzyskanie niewiarygodnych wyników. 84 CZE˛ŚĆ I Dla szczepów H. influenzae należy określić zdolność wytwarzania β-laktamaz, np. za pomoca˛ testu z nitrocefina˛. Nie wytwarzaja˛ce β-laktamaz H. influenzae rzadko wykazuja˛ oporność na ampicyline˛. W zwia˛zku z powyższym nie zaleca sie˛ oznaczania wrażliwości metoda˛ dyfuzyjno-kra˛żkowa˛. Izolaty M. catarrhalis powinny być badane w kierunku wytwarzania β-laktamaz. Dodatkowo można oznaczyć wrażliwość na tetracykline˛ i erytromycyne˛. Dla Candida albicans należy ocenić wrażliwość na wszystkie leki przeciwgrzybicze. Wie˛kszość laboratoriów przedstawia półilościowe wyniki hodowli bakteryjnych na podłożach stałych, które można określić jako: (+) = kilka kolonii + = słaby wzrost ++ = średnio intensywny wzrost +++ = intensywny wzrost. Hodowla Mycobacterium tuberculosis Poza przygotowaniem preparatu bezpośredniego barwionego metoda˛ dla bakterii kwasoopornych, zawsze gdy istnieje kliniczne podejrzenie choroby, materiał (zwykle, choć nie zawsze, plwocina) należy posiać w kierunku M. tuberculosis. Niektórzy pacjenci z podejrzeniem gruźlicy płuc moga˛ nie odkrztuszać plwociny. Wytwarzana przez nich niewielka ilość plwociny jest natychmiast połykana. W takiej sytuacji lekarz powinien pobrać próbke˛ soku żoła˛dkowego na czczo (zwykle wcześnie rano) i zneutralizowana˛ wodorowe˛glanem sodu (100 mg) przesłać do laboratorium. Sok żoła˛dkowy należy traktować w ten sam sposób jak plwocine˛. Wykonywanie posiewów w kierunku pra˛tków gruźlicy wszystkich pobranych próbek plwociny jest drogie i (chociaż pozwala zdiagnozować pacjentów bez podejrzenia gruźlicy) nie zalecane rutynowo. Procedura przygotowania próbki do badania Plwocina pochodza˛ca od pacjentów z infekcja˛ gruźlicza˛ cze˛sto zawiera fragmenty tkanki płucnej, które, jeśli sa˛obecne, należy pobrać na posiew. Plwocina gruźlicza wykrztuszana jest przez jame˛ ustna˛i gardło, dlatego zanieczyszczenie próbki flora˛ fizjologiczna˛ gardła jest nieuniknione. Bakterie zanieczyszczaja˛ce próbke˛ musza˛ zostać zniszczone, aby nie doszło do przerostu podłoża Löwensteina-Jensena. Procedura przygotowania próbki (zage˛szczenie–trawienie–dekontaminacja) obowia˛zuje w przypadku każdej próbki pobranej z miejsca wyste˛powania flory fizjologicznej. Szeroko stosowane sa˛ trzy procedury z użyciem: – wodorotlenku sodu (NaOH) (Petroff); – wodorotlenku sodu N-acetyl-L-cysteiny (NALC-NaOH); – Zephiranu i fosforanu trójsodowego. Procedura z użyciem wodorotlenku sodu (Petroff) Procedura ta pozwala na eliminacje˛ zanieczyszczaja˛cych mikroorganizmów, a ponadto umożliwia upłynnienie niekiedy śluzowej plwociny. Wodorotlenek 85 ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH sodu jest toksyczny również dla pra˛tków, dlatego w trakcie wykonywania metody należy upewnić sie˛, że: – końcowe ste˛żenie NaOH nie przekracza 2%; – pra˛tki gruźlicze nie sa˛ eksponowane na wodorotlenek sodu dłużej niż przez 30 minut, wliczaja˛c czas wirowania. 1. Wymieszać równe obje˛tości plwociny i 4% wodorotlenku sodu 40 g/l (uprzednio poddanego sterylizacji w autoklawie) w sterylnej, szczelnej, 50-mililitrowej szklanej butelce lub plastikowej stożkowatej probówce wirówkowej. 2. Inkubować w temperaturze pokojowej (25 – 30°C) przez 15 minut, delikatnie wstrza˛sać mieszanine˛ w mechanicznym mieszadle przez 5 minut. W gora˛cym klimacie potrzebne może być schłodzenie lub skrócenie czasu reakcji do 10 – 15 minut. 3. Odwirować lub uzupełnić mieszanine˛ do 50 ml destylowana˛woda˛lub buforem fosforanowym (pH 6,8), hamuja˛c działanie NaOH. 4. Po 15 minutach odwirować w 3000 g przez 15 minut. Ostrożnie zlać supernatant do pojemnika wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekuja˛cym (na bazie fenolu lub aldehydu glutarowego). Zneutralizować osad wkraplaja˛c 2 mol/l roztworu HCl zawieraja˛cego 2% czerwień fenolowa˛, poła˛czyć, wstrza˛saja˛c do chwili, gdy kolor zmieni sie˛ trwale z czerwonego na żółty. Alternatywnie: dodać krople˛ roztworu wskaźnikowego, a naste˛pnie dodawać po kropli HCl cia˛gle mieszaja˛c. 5. Jeśli posiew na podłoże be˛dzie wykonywany natychmiast, zawiesić zneutralizowany osad w 1 – 2 ml sterylnego 0,85% NaCl lub sterylnej wody destylowanej. W innym przypadku zawiesić osad w 1 – 2 ml sterylnej frakcji V albumin bydle˛cych. Procedura z użyciem wodorotlenku sodu N-acetyl-L-cysteiny Niższe ste˛żenie NaOH w obecności czynników mukolitycznych, takich jak N-acetyl-L-cysteina (NALC), jest mniej agresywne wobec pra˛tków gruźlicy. Zarówno czas inkubacji, jak i temperatura nie maja˛tak kluczowego znaczenia, jak w przypadku procedury z NaOH. Krótki, nie przekraczaja˛cy 24 godzin, czas przechowywania aktywnego roztworu NALC-NaOH wymaga przeprowadzenia procedury w cia˛gu jednego dnia. 1. Poła˛czyć równe obje˛tości roztworu cytrynianu sodu (29 g dwuwodzianu cytrynianu sodu na litr wody destylowanej) oraz 4% wodorotlenku sodu (40 g/l) i autoklawować mieszanine˛. Roztwór może być przechowywany w temperaturze pokojowej. 2. Tuż przed użyciem dodać 0,5 g NALC do 100 ml roztworu zawieraja˛cego NaOH i cytrynian sodu. 3. W zależności od liczby próbek przeznaczonych do dekontaminacji przygotować 2,5 g NALC w 500 ml roztworu NaOH i cytrynianu sodu lub 5 g NALC w 1000 ml roztworu NaOH i cytrynianu sodu. Odczynniki sa˛ przydatne do badania przez 24 godziny. 4. Do próbki umieszczonej w sterylnej, szczelnej, 50-mililitrowej szklanej butelce lub plastikowej stożkowej probówce wirówkowej dodać równa˛ obje˛tość aktywnego roztworu NALC-NaOH. Ostrożnie dokre˛cić 86 CZE˛ŚĆ I zakre˛tke˛, odwrócić probówke˛ i wstrza˛sać delikatnie, nie dłużej niż 30 sekund. 5. Pozostawić na 15 minut w temperaturze pokojowej (20 – 25°C). 6. Uzupełnić mieszanine˛ do 50 ml woda˛ destylowana˛ lub 67 mmol/l buforem fosforanowym (pH 6,8) w celu zahamowania działania NaOH. Ostrożnie zlać supernatant do pojemnika wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekuja˛cym (na bazie fenolu lub aldehydu glutarowego). 7. Jeśli posiew na podłoże be˛dzie wykonywany natychmiast, zawiesić osad w 1 – 2 ml sterylnego 0,85% NaCl lub sterylnej wody destylowanej. W innym przypadku zawiesić osad w 1 – 2 ml sterylnej frakcji V albumin bydle˛cych. Procedura z użyciem fosforanu trójsodowego Pra˛tki moga˛ przeżyć mimo przedłużonego poddawania ich tej łagodnej procedurze. Dlatego czas inkubacji i temperatura nie sa˛ restrykcyjne. 1. Przygotować roztwór 1 kg trójfosforanu sodu (Na3 PO4 ·12H 2O) w 4 litrach gora˛cej wody destylowanej, dodać 7,5 ml 17% chlorku benzylidenu (Zephiran), dobrze wymieszać i przechowywać w temperaturze pokojowej. 2. Wymieszać równe obje˛tości plwociny (do 10 ml) z roztworem Zephiranu i fosforanu trójsodowego w 50-mililitrowej, sterylnej, szczelnej, szklanej probówce wirówkowej. Dokre˛cić zakre˛tke˛ i wytrza˛sać energicznie przez 30 minut. 3. Odstawić mieszanine˛ na dodatkowe 30 minut. 4. Odwirować w 3000 g przez 15 minut. Ostrożnie zlać supernatant do pojemnika wypełnionego odpowiednim środkiem dezynfekuja˛cym (na bazie fenolu lub aldehydu glutarowego) i ponownie zawiesić osad w 20 ml neutralizuja˛cego buforu fosforanowego, pH 6,61. 5. Odwirować ponownie w 3000 g przez 15 minut. Zlać supernatant, a osad posiać na podłoże. Hodowla 1. Posiać 3 krople (około 0,1 ml) osadu na co najmniej trzy probówki z podłożem Löwensteina-Jensena lub inne. 2. Sprawdzać regularnie wskaźnik zanieczyszczenia inkubowanych podłoży i notować liczbe˛ zanieczyszczonych płytek. Wskaźnik zanieczyszczenia powinien wynosić 3 – 5%. Wyższy wskaźnik (ponad 5%) zanieczyszczonych hodowli na podłożu Löwensteina-Jensena zwykle wskazuje na niewystarczaja˛ca˛ skuteczność procedury dekontaminacji. Wskaźnik zanieczyszczenia < 3% sugeruje, że procedura dekontaminacji została przeprowadzona zbyt intensywnie i obecne w próbce pra˛tki moga˛ nie wyrosna˛ć. 1 Przygotowanie neutralizuja˛cego buforu fosforanowego 67 mmol/l. Roztwór podstawowy: A. Rozpuścić 9,47 g nieuwodnionego fosforanu sodu w 1 litrze wody destylowanej. B. Rozpuścić 9,07 g nieuwodnionego fosforanu potasu w 1 litrze wody destylowanej. Dla buforu o pH 6,8: zmieszać 50 ml roztworu podstawowego A z 50 ml roztworu podstawowego B. Dla buforu o pH 6,6: zmieszać 37,5 ml roztworu podstawowego A z 62,5 ml roztworu podstawowego B. Sprawdzić pH. Jeśli potrzeba, dodać roztworu A, aby podnieść pH, lub roztworu B, aby obniżyć pH. 87 ZAKAŻENIA DOLNYCH DRÓG ODDECHOWYCH Interpretacja hodowli M. tuberculosis Probówki z podłożem Löwensteina-Jensena powinny być inkubowane przez 2 – 3 dni w 35 – 37°C w pozycji poziomej, z odkre˛cona˛ o pół obrotu nakre˛tka˛. Naste˛pnie hodowle należy inkubować w temperaturze 37°C przez 6 tygodni i obserwować wzrost w cotygodniowych odste˛pach czasu. Podczas tej kilkutygodniowej obserwacji każdy pojawiaja˛cy sie˛ wzrost bakterii powinien zostać odnotowany. Przygotować preparat barwiony metoda˛ Ziehl-Neelsena. Jeśli mikroorganizmy nie sa˛ kwasoopornymi bakteriami, hodowle˛ można uznać za zanieczyszczona˛. Typowe ludzkie szczepy Mycobacterium tuberculosis maja˛ ,,szorstkie, twarde i płowożółte’’ kolonie, czasem widoczne już po 2 – 3 tygodniach inkubacji (rzadko wcześniej). Kolonie szczepów bydle˛cych (M. bovis) sa˛ zwykle gładkie i białawokremowe. Inne, zwykle niepatogenne gatunki mykobakterii moga˛rosna˛ć szybciej (niekiedy już po kilku dniach), wytwarzaja˛c — lub nie — pigmenty (czerwony, żółty lub pomarańczowy). Jeśli szczep tworzy kolonie o typowym wygla˛dzie i barwienie Ziehl-Neelsena preparatu z hodowli potwierdza obecność kwasoopornych pra˛tków, w wyniku należy podać: ,,Mycobacterium spp., prawdopodobnie M. tuberculosis’’; izolaty należy przesłać do referencyjnego laboratorium krajowego lub lokalnego w celu potwierdzenia identyfikacji i oznaczenia lekowrażliwości izolowanych szczepów. Podstawowe zasady bezpieczeństwa Z plwocina˛ należy zawsze poste˛pować bardzo uważnie i używać szczelnych pojemników na próbki. Jest to bardzo ważne, zwłaszcza gdy konieczne jest przesłanie próbek poczta˛. Zaleca sie˛, aby wszystkie procedury poste˛powania z plwocina˛ (nawet jeśli na skierowaniu nie ma informacji o gruźlicy) były przeprowadzane w bakteriologicznie bezpiecznych warunkach. Zaleca sie˛, aby laboratorium przeprowadzaja˛ce badania próbek prawdopodobnie zawieraja˛cych pra˛tki gruźlicy spełniało wymagania bezpieczeństwa biologicznego przynajmniej na poziomie 21. Szczególna˛ uwage˛ należy zachować podczas otwierania, zamykania i wstrza˛sania butelek oraz podczas wirowania materiału. Tworzenie skażonego aerozolu może być niebezpieczne dla personelu, dlatego należy przestrzegać właściwych procedur medycyny pracy2. Pocztowy transport hodowli M. tuberculosis do referencyjnego laboratorium krajowego wymaga szczególnej ostrożności z powodu ryzyka ewentualnego wypadku lub uszkodzenia pojemnika. Należy używać jedynie pojemników i materiałów wysyłkowych uznanych za bezpieczne i dostosowanych do wymagań poczty. 1 Manual of basic techniques for a health laboratory, 2nd ed. Geneva, World Health Organization, 2003. 2 Laboratory services in tuberculosis control Part I: Organization and management. Geneva, World Health Organization, 1998 (niepublikowane dokumenty WHO/TB/98.258). 88 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH Choroby przenoszone droga˛ kontaktów seksualnych Wprowadzenie W cia˛gu ostatnich dwudziestu lat ogromnie wzrosła liczba drobnoustrojów przenoszonych droga˛ kontaktów seksualnych oraz zwia˛zanych z nimi objawów klinicznych. W tabeli 21 wymienione zostały wybrane mikroorganizmy przenoszone droga˛ płciowa˛ i wywoływane przez nie choroby. Diagnostyka niektórych z nich stanowi ważne wyzwanie dla klinicznego laboratorium mikrobiologicznego. Diagnostyka laboratoryjna jest istotnym elementem w poste˛powaniu z pacjentem, w kontroli takich chorób, jak rzeża˛czka czy kiła, i ma znaczenie nie tylko dla pacjenta, ale także dla jego partnera seksualnego. W rozdziale zostanie krótko przedstawiona identyfikacja najcze˛ściej pojawiaja˛cych sie˛ mikroorganizmów przenoszonych droga˛ seksualna˛, wyste˛puja˛cych Tabela 21. Wybrane mikroorganizmy przenoszone droga˛ płciowa˛ i towarzysza˛ce im objawy Czynnik etiologiczny Neisseria gonorrhoeae Objaw Zapalenie gruczołu przedsionkowego wie˛kszego (Bartholina), zapalenie szyjki macicy, zapalenie kosmówkowo-owodniowe, zapalenie spojówek, uogólniona infekcja gonokokowa (zapalenie stawów, skóry, pochewek ście˛gnistych), zapalenie endometrium, zapalenie naja˛drzy, bezpłodność, zapalenie gardła, przedpokwitaniowe zapalenie pochwy, zapalenie torebki wa˛troby, zapalenie odbytu, zapalenie prostaty, zapalenie jajowodów, zapalenie cewki moczowej Chlamydia trachomatis Zapalenie gruczołu przedsionkowego wie˛kszego (Bartholina), (serotypy D – K) zapalenie szyjki macicy, zapalenie spojówek u noworodków, zapalenie endometrium, zapalenie naja˛drzy, zapalenie płuc u noworodków, bezpłodność, zapalenie ucha środkowego u niemowla˛t, zapalenie narza˛dów miednicy, zapalenie torebki wa˛troby, przedpokwitaniowe zapalenie pochwy, zapalenie odbytu, zespół Reitera, zapalenie jajowodów, zapalenie cewki moczowej Chlamydia trachomatis Ziarniniak weneryczny (serotypy L1, L2, L3) Treponema pallidum Kiła Haemophilus ducreyi Wrzód mie˛kki Calymmatobacterium granulomatis Ziarniniak pachwinowy (donovanosis) Mobiluncus spp. Bakteryjna waginoza Ludzki (alfa) wirus opryszczki (HSV1 i HSV2) Opryszczka narza˛dów płciowych oraz warg i jamy ustnej, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, opryszczka noworodków, zapalenie odbytu Wirus cytomegalii (CMV) Zakażenie wrodzone Ludzki Papillomavirus Rak szyjki macicy, kłykciny wirusowe (HPV) Ludzki wirus nabytego Zespół nabytego niedoboru odporności (AIDS) oraz choroby niedoboru odporności towarzysza˛ce AIDS (HIV) Wirus zapalenia wa˛troby typu B (HBV) Wirusowe zapalenie wa˛troby typu B Gardnerella vaginalis Zapalenie cewki moczowej, zapalenie pochwy Candida albicans Zapalenie żołe˛dzi i napletka, zapalenie sromu i pochwy 89 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH w próbkach pochodza˛cych z żeńskich i me˛skich dróg moczowo-płciowych. Czynniki wirusowe i bakteryjne, takie jak: Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis i Mobiluncus spp., nie zostana˛ tu omówione. W celu uzyskania bardziej szczegółowych informacji, odsyłamy czytelnika do odnośnych publikacji WHO1. Zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn Zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn klinicznie charakteryzuje sie˛ wydzielina˛ z cewki i/lub zaburzeniami w oddawaniu moczu, cze˛sto jednak wyste˛puja˛ bezobjawowe infekcje wywołane przez Neisseria gonorrhoeae lub Chlamydia trachomatis. Nieleczone gonokokowe lub chlamydialne zapalenie cewki moczowej może rozwina˛ć sie˛ w zapalenie naja˛drzy. U homoseksualnych me˛żczyzn moga˛ wyste˛pować infekcje odbytu i jamy ustnej wywołane przez N. gonorrhoeae i C. trachomatis. W celu ustalenia poste˛powania z pacjentem zapalenia cewki moczowej powinny być podzielone na gonokokowe i niegonokokowe (NGU). Blisko połowa przypadków NGU wywołana jest przez C. trachomatis, jednak etiologia wie˛kszości nawracaja˛cych zakażeń nie została w pełni wyjaśniona. Zgodnie z badaniami przyczyna˛ zapalenia cewki moczowej może być zakażenie Ureaplasma urealyticum, a w 1 – 3% przypadków NGU Trichomonas vaginalis. Notowano również infekcje wywołane przez ludzki Herpesvirus. Czynniki bakteryjne, takie jak: gronkowce, pałeczki Enterobacteriaceae, Acinetobacter spp. i Pseudomonas spp., moga˛ być izolowane z cewki zdrowych me˛żczyzn, lecz nie udowodniono ich udziału w zapaleniu cewki moczowej. Badanie próbki w kierunku obecności C. trachomatis nie jest przedmiotem niniejszego opracowania. Poza izolacja˛ na hodowlach komórkowych bardziej doste˛pne stały sie˛ ostatnio niehodowlane metody wykrywania chlamydii za pomoca˛ testów immunoenzymatycznych, immunofluorescencji i amplifikacji kwasu nukleinowego (PCR). Powyższe metody nadal sa˛ zbyt drogie. Pobieranie i transport próbek W celu pobrania do badania wydzieliny z cewki moczowej należy wprowadzić do cewki wymazówke˛ o małej średnicy lub sterylna˛ eze˛ bakteryjna˛ i przed jej wycia˛gnie˛ciem delikatnie przekre˛cić. Ropna˛ wydzieline˛ można pobrać bezpośrednio na wymazówke˛ lub eze˛ do posiewu. Ważny jest rodzaj użytej wymazówki. Do hodowli N. gonorrhoeae zalecana jest wymazówka bawełniana z we˛glem aktywnym lub z alginianem wapnia, a także wymazówka z dakronu. Jeśli do pobierania materiału te specjalne, przygotowywane komercyjnie, wymazówki nie sa˛ doste˛pne i użyto zwykłych wymazówek z waty, próbke˛ należy natychmiast posiać. W przypadku zapalenia cewki moczowej masaż prostaty nie zwie˛ksza odstetka izolacji gonokoków lub chlamydii. Wymazy odbytnicze należy pobrać wymazówka˛ wprowadzaja˛c ja˛ do kanału odbytu na głe˛bokość 4 – 5 cm. Próbki z tylnej ściany gardła i krypt migdałków należy pobrać wymazówka˛ i natychmiast posiać. 1 Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Laboratory diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva, World Health Organization, 1999. 90 CZE˛ŚĆ I Najlepiej, jeśli próbki w kierunku obecności N. gonorrhoeae posiewane sa˛ na podłoże hodowlane bezpośrednio po pobraniu. Posiane płytki należy umieścić w eksykatorze lub w atmosferze zawieraja˛cej 5 – 10% dwutlenku we˛gla, o wysokiej wilgotności. Jeśli natychmiastowy posiew i inkubacja sa˛ niemożliwe, należy użyć podłoża transportowego, takiego jak Amies lub Stuart. Czas transportu powinien być możliwie najkrótszy, maksymalnie do 12 godzin, w temperaturze otoczenia do 30°C. Należy unikać schłodzenia. Badanie bezpośrednie i interpretacja W wie˛kszości badań wykazano, że obecność czterech lub wie˛cej wieloja˛drzastych (PMN) leukocytów w polu widzenia w immersji olejowej zdecydowanie wskazuje na zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn. Opisane kryterium jest szczególnie użyteczne dla lekarza, który musi podja˛ć decyzje˛ o rozpocze˛ciu leczenia pacjenta ze słabo nasilonymi objawami. W wie˛kszości przypadków rzeża˛czki u kobiet wydzielina jest ropna, a w rozmazie z cewki moczowej widoczne sa˛ liczne wieloja˛drzaste leukocyty (> 10 w polu widzenia w immersji olejowej). Jakkolwiek nie zawsze jest tak w przypadku NGU, które daje mniej nasilona˛ reakcje˛ zapalna˛. Rozmazy z wie˛cej niż 4 PMN leukocytami w polu widzenia i bez wewna˛trzkomórkowych Gram-ujemnych dwoinek wskazuja˛ na NGU. Cienka˛ warstwe˛ materiału należy nanieść wymazówka˛ na szkiełko podstawowe, preparat utrwalić temperatura˛ i wybarwić błe˛kitem metylenowym lub metoda˛ Grama. Obecność Gram-ujemnych wewna˛trzkomórkowych dwoinek w wieloja˛drzastych leukocytach w preparacie bezpośrednim z cewki moczowej wskazuje na rzeża˛czke˛. Nie zaleca sie˛ wykonywania barwionych metoda˛ Grama preparatów z próbek pobranych z cewki moczowej u kobiet bez objawów zakażenia, ze ślepych wymazów odbytniczych lub z próbek z jamy ustnej. Jednakże badanie mikroskopowe ropnego materiału otrzymanego w anoskopii ma wysoka˛ wartość diagnostyczna˛. Hodowla Neisseria gonorrhoeae Posiane płytki z modyfikowanym podłożem agarowym Thayer-Martina (MTM)1 (lub agarem New York City (NYC))2 należy inkubować w 35°C w wilgotnej 1 Modyfikowany agar Thayer-Martina przygotowuje sie˛ przez dodanie w 50°C mieszaniny antybiotyków i IsoVitaleX lub równoważnego suplementu do agaru czekoladowego przygotowanego z agaru GC lub agaru Columbia, stanowia˛cego podstawowe podłoże. Komercyjnie doste˛pna z wielu źródeł jest mieszanina zawieraja˛ca 3 lub 4 antybiotyki; mieszanina VCN zawiera wankomycyne˛, kolistyne˛ i nystatyne˛: VCNT zawiera również trimetoprim. Końcowe ste˛żenie antybiotyków w przygotowanym podłożu: – wankomycyna: 3 µg/ml – nystatyna: 12,5 IU/ml – kolistyna: 7,5 µg/ml – mleczan trimetoprimu: 5 µg/ml 2 Modyfikowane podłoże New York City przygotowuje sie˛ przez dodanie do 500 ml bazowego sterylnego agaru GC schłodzonego do 50°C naste˛puja˛cych dodatków: – 50 ml krwi końskiej lizowanej przez dodanie 5 ml/l saponiny, – sterylny autolizat drożdżowy, – zestaw antybiotyków zawieraja˛cy: wankomycyne˛, kolistyne˛, amfoterycyne˛ i trimetoprim. Składniki doste˛pne sa˛ komercyjnie z Oxoid Ltd. Wade Rd, Basingstoke, Hants RG24 8PW, England. 91 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH atmosferze wzbogaconej dwutlenkiem we˛gla (eksykator) i obserwować codziennie przez dwa dni. Laboratoria przeprowadzaja˛ce duża˛ liczbe˛ badań próbek w kierunku N. gonorrhoeae, poza selektywnym MTM, stosuja˛ cze˛sto nieselektywny agar czekoladowy wzbogacony dodatkiem IsoVitaleX lub innym, ponieważ 3 – 10% gonokoków może wykazywać wrażliwość na ste˛żenia wankomycyny użyte w podłożu selektywnym. Kolonie gonokoków po 24 godzinach moga˛ być jeszcze niewidoczne. Pojawiaja˛ sie˛ po 48 godzinach jako szare lub białe, nieprzezroczyste, uniesione i opalizuja˛ce kolonie różnych rozmiarów i morfologii. Identyfikacja Neisseria gonorrhoeae Wste˛pna identyfikacja N. gonorrhoeae izolowanych z materiałów pobranych z dróg moczowo-płciowych oparta jest na dodatniej reakcji oksydazowej i obecności Gram-ujemnych dwoinek widocznych w preparacie barwionym metoda˛ Grama. W celu potwierdzenia identyfikacji można przeprowadzić testy rozkładu we˛glowodanów lub inne, stosuja˛c metody i podłoża omówione szczegółowo w innych opracowaniach1. Badanie wrażliwości na antybiotyki Istnieje geograficzne zróżnicowanie wrażliwości N. gonorrhoeae na benzylopenicyline˛. W niektórych regionach, takich jak Afryka podsaharyjska czy południowo-wschodnia Azja, wie˛kszość szczepów gonokokowych wykazuje zdolność do produkcji β-laktamaz. Przenoszona chromosomalnie, niezwia˛zana z wytwarzaniem β-laktamaz oporność na benzylopenicyline˛ staje sie˛ coraz cze˛stsza w wielu krajach. Metoda dyfuzji kra˛żkowej nie jest jednak przydatna do wykrywania takich szczepów. Na obszarach, gdzie w zakażeniach gonokokowych stosowane sa˛ benzylopenicylina, ampicylina i amoksycylina, szczepy N. gonorrhoeae (szczególnie w razie niepowodzenia terapii) powinny być rutynowo badane w kierunku wytwarzania β-laktamaz jednym z zalecanych testów, takich jak test z nitrocefina˛2. Do testu z nitrocefina˛ należy w małej probówce przygotować ge˛sta˛ zawiesine˛ z kilku kolonii i 0,2 ml fizjologicznego roztworu soli; naste˛pnie do zawiesiny dodać 0,025 ml nitrocefiny, mieszać przez minute˛. Szybka zmiana koloru z żółtego na różowy lub czerwony jest dowodem na wytwarzanie β-laktamazy przez badany szczep. Rutynowe badanie wrażliwości N. gonorrhoeae na antybiotyki metoda˛dyfuzyjno-kra˛żkowa˛ nie jest zalecane. 1 Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Laboratory diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva, World Health Organization, 1999. 2 Odczynnik Nitrocefin jest doste˛pny w firmie Oxoid Ltd, Wade Road, Basingstoke, Hants RG24 8PW, England; zawiera 1 mg nitrocefiny (SR112) i fiolke˛ rozpuszczalnika (SR112A). Test probówkowy może być zasta˛piony testem kra˛żkowym z użyciem kra˛żka nasyconego nitrocefina˛ (kra˛żek cefinazowy doste˛pny z BD Diagnostic Systems, 7 Loveton Circle, Sparks, MD 21152, USA). 92 CZE˛ŚĆ I Próbki z żeńskich narza˛dów płciowych Flora pochwy kobiety przed menopauza˛ składa sie˛ głównie z laseczek kwasu mlekowego i różnych fakultatywnie tlenowych i beztlenowych bakterii. Nieprawidłowa wydzielina z pochwy może być wynikiem: – zapalenia pochwy: Gardnerella vaginalis, Candida albicans; – bakteryjnej waginozy: przerost bakterii beztlenowych i Mobiluncus spp.; – zapalenia szyjki macicy: Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis. Inne bakterie, takie jak Enterobacteriaceae, nie sa˛ udowodniona˛ przyczyna˛ zapalenia pochwy. Zapalenie pochwy u dziewczynek przed okresem pokwitania może być wywołane przez N. gonorrhoeae lub C. trachomatis. Bakteryjna waginoza (niespecyficzne zapalenie pochwy) jest stanem charakteryzuja˛cym sie˛ obfita˛, brzydko pachna˛ca˛ wydzielina˛, z towarzysza˛cym znacza˛cym wzrostem Mobiluncus spp. i różnych bezwzgle˛dnych beztlenowców oraz spadkiem liczby pochwowych laseczek kwasu mlekowego. Minimalnym warunkiem rozpoznania bakteryjnej waginozy jest obecność co najmniej trzech z naste˛puja˛cych objawów: nieprawidłowa wydzielina z pochwy, pH pochwy > 4,5, komórki wskaźnikowe (komórki nabłonkowe z tak licznie przylegaja˛cymi bakteriami, że niewidoczne staja˛ sie˛ obrysy komórki) i rybi, aminopodobny zapach po dodaniu do wydzieliny pochwowej kropli 10% wodorotlenku potasu. Zapalenie cewki moczowej może być wywołane także przez N. gonorrhoeae i C. trachomatis. Zakażenia wste˛puja˛ce N. gonorrhoeae, C. trachomatis, beztlenowymi i wzgle˛dnie beztlenowymi bakteriami moga˛ powodować zapalenie narza˛dów miednicy (pelvic inflammatory disease — PID) i w konsekwencji niemożność donoszenia cia˛ży lub cia˛że˛ pozamaciczna˛. Bakteryjne zakażenia narza˛dów płciowych podczas cia˛ży, w tym zakażenia N. gonorrhoeae i C. trachomatis, moga˛ być przyczyna˛ powikłań, takich jak: przedwczesny poród, przedwczesne pe˛knie˛cie pe˛cherza płodowego, zapalenie błon płodowych, poporodowe zapalenie błony śluzowej macicy u matki i zapalenie spojówek, zapalenie płuc oraz zespół zakażenia owodni u noworodka. Na specjalne zlecenie materiały pobrane z szyjki macicy i pochwy można posiewać w kierunku S. aureus (zespół szoku toksycznego), S. agalactiae (paciorkowiec grupy B, zakażenia noworodków), Listeria monocytogenes (zakażenia noworodków) i Clostridium spp. (poronienie septyczne). Jakkolwiek infekcje C. trachomatis i ludzkim Herpesvirus sa˛ powszechne, ich diagnostyka laboratoryjna wymaga drogiego sprze˛tu oraz odczynników i nie be˛dzie tutaj omawiana. Pobieranie i transport próbek Wszystkie próbki powinny być pobierane podczas badania we wziernikach. Wziernik przed użyciem można zwilżyć ciepła˛ jałowa˛woda˛, nie można natomiast używać antyseptyków i kremów do badania ginekologicznego, ponieważ moga˛ one działać letalnie na gonokoki. 93 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH Do badania w kierunku obecności drożdży, G. vaginalis i bakteryjnej waginozy próbki wydzieliny pochwowej można pobrać wymazówka˛ z tylnego sklepienia pochwy. Próbki do hodowli gonokoków i chlamydii powinny być pobrane z błony śluzowej szyjki macicy. Po założeniu wzierników bawełniana˛wymazówka˛należy usuna˛ć czop śluzowy. Wymazówke˛ do pobierania materiału (patrz str. 90) należy wprowadzić do kanału szyki macicy i obracać przez co najmniej 10 sekund przed wycia˛gnie˛ciem. Próbki z cewki moczowej, odbytu i z jamy ustnej pobiera sie˛ w podobny sposób jak u me˛żczyzn. W każdym przypadku zapalenia narza˛dów miednicy (PID) należy pobrać przynajmniej próbki z szyjki macicy w kierunku N. gonorrhoeae. Pobieranie materiału z jajowodu jest bardziej wiarygodne, ale w wie˛kszości regionów najlepsza˛ doste˛pna˛ próbka˛ jest aspirat z zagłe˛bienia odbytniczo-macicznego (jamy Douglasa). U dzieci z cie˛żkim noworodkowym zapaleniem spojówek należy wymazówka˛lub eza˛ pobrać wydzieline˛ z worka spojówkowego. Z wyja˛tkiem próbek badanych w kierunku C. trachomatis, do transportu wymazów z szyjki i pochwy najbardziej odpowiednie sa˛ podłoża transportowe Amies i Stuart. Badanie bezpośrednie i interpretacja Bezpośrednie badanie wydzieliny z pochwy jest metoda˛ z wyboru w diagnostyce zapalenia pochwy, lecz mniej przydatna˛ w diagnostyce zapalenia szyjki macicy. Preparat bezpośredni przygotowywany jest na szkiełku podstawowym, na którym w fizjologicznym roztworze soli umieszcza sie˛ próbke˛ materiału pobranego z pochwy, a naste˛pnie nakrywa szkiełkiem nakrywkowym. Zapewnia to rozdzielenie komórek, które w innym przypadku moga˛ sklejać sie˛ w grudki. Preparat należy ogla˛dać pod powie˛kszeniem × 400 poszukuja˛c typowych ruchliwych T. vaginalis, pa˛czkuja˛cych drożdży i komórek wskaźnikowych (,,clue cells’’). C. albicans może tworzyć pseudogrzybnie, obserwowane niekiedy w materiale z pochwy. Komórki wskaźnikowe sa˛ obecne u wie˛kszości kobiet z bakteryjna˛ waginoza˛. Ziarnisty lub brudny wygla˛d cytoplazmy komórek nabłonkowych jest mniej obiektywnym kryterium niż utrata granic komórki. Badanie mikroskopowe preparatów bezpośrednich z szyjki macicy nie jest zalecane. W diagnostyce bakteryjnej waginozy metoda˛ z wyboru jest przygotowanie preparatów barwionych metoda˛ Grama. Preparat należy wykonać delikatnie przetaczaja˛c wymazówke˛ po szkiełku podstawowym. Prawidłowy rozmaz z pochwy zawiera głównie laseczki kwasu mlekowego (duże, Gram-dodatnie) oraz mniej niż 5 leukocytów w polu widzenia. W rozmazach pochodza˛cych od kobiet z waginoza˛ bakteryjna˛ obserwuje sie˛ pokryte małymi Gram-ujemnymi pałeczkami komórki wskaźnikowe (,,clue cells’’) oraz mieszana˛ flore˛: liczne małe Gram-ujemne i Gram-zmienne pałeczki, ziarenko-pałeczki, cze˛sto także Gram-ujemne zakrzywione pałeczki, nie stwierdza sie˛ natomiast wie˛kszych, Gram-dodatnich laseczek. W polu widzenia widoczne sa˛ jedynie nieliczne (< 5) leukocyty. Obraz ten jest czułym i swoistym wskaźnikiem bakteryjnej waginozy. 94 CZE˛ŚĆ I Duża liczba leukocytów (> 10 komórek w polu widzenia) w bezpośrednim preparacie z pochwy barwionym metoda˛ Grama wskazuje na rze˛sistkowice˛ lub zapalenie szyjki macicy. Barwienie Grama nie jest szczególnie przydatne w diagnostyce zakażeń gonokokowych u kobiet. Badanie oparte na poszukiwaniu Gram-ujemnych wewna˛trzkomórkowo zlokalizowanych dwoinek w barwionych metoda˛ Grama preparatach bezpośrednich z szyjki macicy ma czułość 50 – 70% i swoistość 50 – 90%, co wskazuje na niewielka˛ wartość tej metody diagnostycznej w populacji o niskiej cze˛stości wyste˛powania rzeża˛czki. Obecność Gram-ujemnych wewna˛trzkomórkowych dwoinek widocznych w preparatach z szyjki macicy powinna zostać odnotowana bez określenia, że sa˛ to N. gonorrhoeae lub gonokoki. Można w ten sposób unikna˛ć nadinterpretacji rozmazów z szyjki macicy, które cze˛sto zawieraja˛ Gram-ujemne ziarenko-pałeczki oraz dwubiegunowo zabarwione pałeczki. Głównym celem wykonywania preparatów bezpośrednich z szyjki macicy jest potwierdzenie rozpoznania śluzowo-ropnego zapalenia szyjki macicy: obecność wie˛cej niż 10 wieloja˛drzastych leukocytów w polu widzenia wskazuje na rozpoznanie zakażenia, wywołanego zwykle przez N. gonorrhoeae i/lub C. trachomatis. Badanie preparatów bezpośrednich ze spojówek barwionych metoda˛ Grama jest czuła˛ i swoista metoda˛ diagnostyczna˛ rzeża˛czkowego zapalenia spojówek. Obecność wewna˛trzkomórkowych Gram-ujemnych dwoinek potwierdza rozpoznanie. Hodowla Próbki z szyjki macicy, odbytu, cewki moczowej, spojówek i z zagłe˛bienia odbytniczo-macicznego moga˛ być posiewane w kierunku N. gonorrhoeae metoda˛ opisana˛ na str. 91, 92. Badanie próbek należy rozpocza˛ć natychmiast po ich dostarczeniu do laboratorium lub — korzystniej — jeszcze w klinice. U kobiet, w odróżnieniu od me˛żczyzn, posiewy maja˛ kluczowe znaczenie w diagnostyce infekcji gonokokowych. Czułość pojedynczego posiewu u kobiet wynosi 80 – 90%. Jest mniejsza w przypadku próbek pobranych w okresie okołoporodowym. W diagnostyce bakteryjnej waginozy nie zaleca sie˛ prowadzenia hodowli w kierunku G. vaginalis lub beztlenowców, ponieważ sa˛ one wykrywane u 20 – 40% kobiet bez infekcji pochwy. Obecność G. vaginalis w wydzielinie z pochwy nie jest wystarczaja˛cym wskazaniem do leczenia; leczone powinny być tylko pacjentki spełniaja˛ce wszystkie kryteria diagnostyczne bakteryjnej waginozy. W porównaniu z badaniem mikroskopowym hodowla zwie˛ksza wykrywalność C. albicans o 50 – 100%. Ponieważ posiew w kierunku Candida jest dodatni nawet przy niewielkiej liczbie grzybów, która może wyste˛pować u 10 – 30% kobiet bez objawów zapalenia pochwy, tylko obfity wzrost C. albicans stanowi dowód kandydiazy pochwy. W zwia˛zku z tym nie zaleca sie˛ rutynowego prowadzenia hodowli. Podobnie, poza preparatem bezpośrednim nie zaleca sie˛ posiewu w kierunku G. vaginalis, który najcze˛ściej wykrywa jedynie bezobjawowe nosicielstwo. 95 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH Próbki z owrzodzeń narza˛dów płciowych Owrzodzenia narza˛dów płciowych sa˛ cze˛stym problemem w wielu rozwijaja˛cych sie˛ krajach. Ich diagnostyka i leczenie sa˛ wyzwaniem zarówno dla lekarzy, jak i dla laboratorium. Powszechne sa˛ infekcje mieszane. Zmiany owrzodzeniowe narza˛dów płciowych moga˛ być wywołane przez różne czynniki przenoszone droga˛ kontaktów seksualnych: – ludzki Herpesvirus, – Treponema pallidum, – Haemophilus ducreyi, – Calymmatobacterium granulomatis, wywołuja˛cy ziarniniaka pachwiny (donovanosis), – Chlamydia trachomatis serotypy L1, L2, L3. W wielu rozwijaja˛cych sie˛ krajach wirus opryszczki jest najcze˛stsza˛ przyczyna˛ owrzodzeń narza˛dów płciowych i zagrażaja˛cych życiu powikłań u pacjentów z niedoborami odpornościowymi oraz u noworodków kobiet z infekcja˛. Diagnostyka laboratoryjna zakażenia nie be˛dzie tu omawiana. Kiła jest wcia˛ż najpoważniejsza˛ choroba˛ weneryczna˛, która może prowadzić do cie˛żkich późnych naste˛pstw oraz kiły wrodzonej. Mimo że testy serologiczne odgrywaja˛ ważna˛ role˛ w diagnostyce wszystkich stadiów kiły, w tym miejscu zostanie omówione tylko badanie w ciemnym polu widzenia. Techniki i interpretacja testów serologicznych w diagnostyce kiły zostały szczegółowo przedstawione w innych opracowaniach1. Wrzód mie˛kki jest główna˛ postacia˛ owrzodzeń narza˛dów płciowych w wielu rozwijaja˛cych sie˛ regionach. Objawy kliniczne obejmuja˛ bolesne, ropne owrzodzenie(a), z towarzysza˛cym bolesnym, cze˛sto ropnym, zapalnym obrze˛kiem pachwinowych we˛złów chłonnych. Nie obserwowano wyste˛powania późnych konsekwencji zakażenia. Kliniczne różnicowanie z innymi owrzodzeniami narza˛dów płciowych jest trudne. Wrzód mie˛kki zwie˛ksza ryzyko zakażenia HIV. Ziarniniak pachwiny charakteryzuje sie˛ żywoczerwonym, ziarniniakowym owrzodzeniem narza˛dów płciowych. Obrze˛k zapalny we˛złów chłonnych jest rzadki. Chlamydiowy ziarniniak limfatyczny charakteryzuje sie˛ pachwinowa˛i/lub udowa˛ limfadenopatia˛ i rzadziej obecnościa˛ małych, samoistnie goja˛cych sie˛ owrzodzeń. Diagnostyka oparta jest na testach serologicznych i izolacji C. trachomatis serotypów L1, L2, L3. Pobieranie próbek Treponema pallidum: Nałożyć re˛kawiczki chirurgiczne. Ścisna˛ć owrzodzenie mie˛dzy dwoma palcami i, używaja˛c gazików, oczyścić powierzchnie˛ zmiany roztworem fizjologicznym soli. Obecne strupki usuna˛ć. Zetrzeć pierwsze krople krwi (jeśli sie˛ pojawia˛) i dotykaja˛c czystym szkiełkiem podstawowym powierzchni zmiany pobrać próbke˛ surowiczego wysie˛ku. Natychmiast nałożyć na krople˛ 1 Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Laboratory diagnosis of sexually transmitted disease. Geneva, World Health Organization, 1999. 96 CZE˛ŚĆ I wysie˛ku czyste szkiełko nakrywkowe. Alternatywnie próbka może być pobrana ze zmiany lub powie˛kszonego we˛zła chłonnego za pomoca˛ sterylnej igły i strzykawki. Preparat powinien być niezwłocznie odczytany w ciemnym polu widzenia przez doświadczonego mikrobiologa. Haemophilus ducreyi: Próbke˛ należy pobrać wymazówka˛ z podstawy owrzodzenia i posiać bezpośrednio na podłoże. Materiał można również uzyskać z powie˛kszonych zapalnie we˛złów chłonnych pachwinowych, lecz wyhodowanie H. ducreyi z takiego materiału jest mniej prawdopodobne. Przydatność podłoży transportowych dla H. ducreyi nie została dostatecznie oceniona. Przy podejrzeniu ziarniniaka pachwiny należy wykonać biopsje˛ tkanki leża˛cej pod powierzchnia˛ aktywnie ziarninuja˛cej zmiany. Przygotować świeże preparaty ze zmiażdżonych fragmentów materiału biopsyjnego. Alternatywnie jeden z preparatów może zawierać zeskrobiny z powierzchni zmiany. Badanie bezpośrednie Wykazanie kre˛tków w materiale ze zmiany jest metoda˛ z wyboru w diagnostyce kiły pierwotnej. Mimo iż T. pallidum można wybarwić (np. azotanem srebra), ze wzgle˛du na wie˛ksza˛ czułość i swoistość zalecana jest mikroskopia w ciemnym polu widzenia. Do badania potrzebny jest mikroskop wyposażony w dobre źródło światła i kondensor. Kondensor ciemnego pola widzenia przesłania padaja˛ce prosto promienie światła, przepuszczaja˛c jedynie promienie peryferyczne (odbijane przez takie obiekty, jak kre˛tki). Należy umieścić kilka kropel olejku immersyjnego na kondensorze mikroskopu z ciemnym polem widzenia. Obniżyć nieco kondensor, tak by poziom olejku był poniżej podstawy. Umieścić szkiełko pod mikroskopem i podnosić kondensor do chwili uzyskania dobrego kontaktu mie˛dzy olejkiem i spodem szkiełka. Unikać utworzenia sie˛ pe˛cherzyków powietrza w olejku. Ryc. 9. Obraz T. pallidum pod mikroskopem w ciemnym polu widzenia. 97 CHOROBY PRZENOSZONE DROGA˛ KONTAKTÓW SEKSUALNYCH Do uzyskania obrazu użyć obiektywu o najmniejszym powie˛kszeniu (× 10). Reguluja˛c pokre˛tłem kondensora, skierować światło centralnie na pole i ustawić ostrość podnosza˛c i obniżaja˛c kondensor do momentu uzyskania najmniejszej średnicy światła. Jeśli to konieczne, ponownie ustawić światło w centrum. Naste˛pnie, używaja˛c obiektywu × 40, ustawić ostrość i uważnie ogla˛dać preparat. Kontrast be˛dzie lepszy przy mikroskopowaniu w ciemności. Unikać jasnego światła dziennego. T. pallidum jest biały, świeca˛cy na ciemnym tle (ryc. 9). Jego identyfikacji dokonuje sie˛ na podstawie typowej morfologii, rozmiaru i ruchliwości. Jest cienkim (0,25 – 0,3 µm) mikroorganizmem, długości 6 – 16 µm, z 8 – 14 regularnymi, ściśle skre˛conymi, wyraźnymi spiralami. Wykazuje szybkie, raczej gwałtowne ruchy. Stosunkowo wolno obraca sie˛ wzdłuż długiej osi (jak korkocia˛g). Rotacji towarzyszy intensywne zginanie (skre˛canie). Można zaobserwować wydłużanie i skracanie komórki (przypominaja˛cej elastyczna˛, rozpre˛żaja˛ca˛ sie˛ spirale˛). W skomplikowanych skre˛tach moga˛ pojawiać sie˛ zniekształcenia. Jeżeli mikroorganizm przylega lub jest otoczony przez cie˛ższy obiekt, w wyniku nasilonych ruchów dochodzi do odkształcenia zwojów. Inne niekiłowe kre˛tki moga˛ być luźno skre˛cone, cienkie i nieregularne; poruszaja˛ sie˛ inaczej (nie jak korkocia˛g), ruchem bardziej wija˛cym, z zaznaczonym zgie˛ciem i cze˛sta˛relaksacja˛ skre˛tów. Wykazanie kre˛tków z charakterystyczna˛ dla T. pallidum morfologia˛ i ruchem stanowi potwierdzenie rozpoznania pierwszo- i drugorze˛dowej kiły. Pacjenci z pierwotna˛ zmiana˛ kiłowa˛, z dodatnim wynikiem badania w ciemnym polu widzenia moga˛ być seronegatywni. Zwykle do serokonwersji dochodzi w cia˛gu kilku tygodni. Niepowodzenie w wykazaniu drobnoustrojów nie wyklucza kiły. Ujemne wyniki moga˛ świadczyć o tym, że: • Obecna była niewystarczaja˛ca liczba drobnoustrojów (pojedyncze badanie w ciemnym polu widzenia ma czułość nie wie˛ksza˛ niż 50%). • Pacjent otrzymał już antybiotyki. • Zmiana ulega naturalnemu wygojeniu. • Zmiana nie była owrzodzeniem kiłowym. Niezależnie od wyników badania w ciemnym polu widzenia zawsze należy pobrać krew do badań serologicznych. W diagnostyce ziarniniaka pachwiny w utrwalonych acetonem preparatach wybarwionych metoda˛ Giemsy wewna˛trz histiocytów widoczne sa˛ typowe, otoczkowe laseczki. Diagnostyka tej choroby opisana jest szczegółowo w innych źródłach1. W diagnostyce wrzodu mie˛kkiego nie zaleca sie˛ barwienia rozmazów metoda˛ Grama, ponieważ zarówno czułość, jak i specyficzność wynosza˛ mniej niż 50%. W diagnostyce chlamydiowego ziarniniaka limfatycznego nie zaleca sie˛ stosowania barwienia metoda˛Giemsy. Materiał z owrzodzenia powinien być także badany w ciemnym polu widzenia w kierunku T. pallidum. 1 Van Dyck E., Meheus A.Z., Piot P.: Laboratory diagnosis of sexually transmitted diseases. Geneva, World Health Organization, 1999. 98 CZE˛ŚĆ I Hodowla Z owrzodzeń narza˛dów płciowych niekiedy izolowane sa˛ gonokoki, ale ich znaczenie w takich próbkach jest niejasne. Poza H. ducreyi nie udowodniono, aby inny gatunek bakterii — zarówno wzgle˛dnie tlenowy, jak i bezwzgle˛dnie beztlenowy — wywoływał owrzodzenia narza˛dów płciowych. Próbki, które maja˛ zostać zbadane w kierunku H. ducrei, należy posiać bezpośrednio na wybiórcze, wzbogacone podłoże agarowe1. Podłoże użyte do posiewu musi być świeże (do tygodnia od przygotowania). Płytki należy inkubować w 33 – 35°C w eksykatorze ze zwilżona˛ lignina˛ na dnie. Po 48 – 72 godzinach inkubacji pojawiaja˛ sie˛ małe, nieśluzowe, żółtoszare, półprzezroczyste lub przezroczyste kolonie, które nienaruszone można przesuwać po powierzchni płytki. Czułość pojedynczej hodowli w izolacji H. ducreyi wynosi 70 – 80%. Wste˛pna diagnoza H. ducreyi może być przeprowadzona na podstawie morfologii kolonii na podłożu selektywnym i wykazania małych, Gram-ujemnych pleomorficznych ziarenko-pałeczek, cze˛sto w pojedynczych łańcuchach (paciorki), równoległych łańcuchach (,,ławica ryb’’) lub w skupiskach. Mimo że wzrost H. ducreyi jest zależny od heminy, wie˛kszość klinicznych izolatów nie rośnie na podłożach wykrywaja˛cych zależność wzrostu od czynników X i V. Obecnie prawie wszystkie szczepy izolowane w krajach rozwijaja˛cych sie˛ wytwarzaja˛ β-laktamazy. 1 Agar Mueller-Hintona wzbogacony 5% sterylna˛ krwia˛ końska˛ podgrzana˛ do 75°C, 1% IsoVitaleX i 3 g/ml wankomycyny. 99 Ropne wydzieliny, rany i ropnie Wprowadzenie Jednym z najcze˛ściej obserwowanych objawów chorób zakaźnych jest wytwarzanie ropnej (czasami surowiczo-ropnej) wydzieliny powstaja˛cej w wyniku inwazji bakterii do tkanki, narza˛du lub jamy ciała. Zakażenia te moga˛ być stosunkowo łagodne (nieszkodliwy ,,pryszcz’’) lub wywoływać liczne ropnie zlokalizowane w jednym lub wielu miejscach. Wysie˛k składa sie˛ z białych krwinek, głównie wieloja˛drzastych leukocytów, zakażaja˛cych drobnoustrojów oraz mieszaniny płynu ustrojowego i fibryny. W niektórych sytuacjach wysie˛k może być widoczny jako warstwa na powierzchni narza˛du, na przykład na powierzchni mózgu w bakteryjnym zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych. W innych przypadkach wysie˛k może być otoczony warstwa˛ włóknika i siecia˛ komórek tkanki (np. czyrak mnogi lub podskórny ,,czyrak’’), a niekiedy zwia˛zany jest z otwarta˛ rana˛, z której wycieka ge˛sty płyn lub ropa. Zarówno anatomiczna lokalizacja wysie˛ku, jak i mikroorganizmy zwia˛zane z wymienionymi infekcjami moga˛ sie˛ znacznie różnić. Wpływ na tworzenie wysie˛ku moga˛ mieć wszystkie bakterie wchodza˛ce w skład flory fizjologicznej, a także grzyby, szczególnie te, które maja˛ zdolność namnażania sie˛ w tkankach. W infekcjach wirusowych rzadko dochodzi do powstania ropnej wydzieliny. Mikrobiolog powinien, uwzgle˛dniaja˛c różnorodna˛ lokalizacje˛ i etiologie˛ ropnych zakażeń, przeprowadzić właściwe badania makroskopowe i mikroskopowe z posiewem na odpowiednie podłoża, które umożliwia˛ izolacje˛ najważniejszych patogennych drobnoustrojów. Możliwie najszybciej po uzyskaniu czystych hodowli należy przeprowadzić identyfikacje˛ oraz określić wrażliwość na antybiotyki. Współpraca mie˛dzy klinicysta˛ i mikrobiologiem ma zasadnicze znaczenie w diagnostyce i leczeniu pacjentów z ropnymi zakażeniami. Mikrobiolog musi współpracować z lekarzem, zapewniaja˛c właściwe pobieranie próbek i szybki transport do laboratorium w celu natychmiastowego i właściwego prowadzenia badań. Postacie kliniczne i najcze˛stsze czynniki etiologiczne Próbki chirurgiczne Próbki chirurgiczne moga˛ być uzyskane przez nakłucie zlokalizowanego ropnia lub w innej procedurze chirurgicznej. Chirurg powinien pobrać kilka małych reprezentatywnych próbek z tkanki i każdego ropnego wysie˛ku. Jeśli to możliwe, należy unikać wymazów. Materiał powinien być pobrany za pomoca˛ igły i strzykawki. Jeśli konieczne jest użycie wymazówki, należy pobrać możliwie dużo wysie˛ku i w odpowiednich pojemnikach przesłać do laboratorium. W chwili otrzymania próbki laboratorium musi, uwzgle˛dniaja˛c dostarczone informacje, zaplanować hodowle˛ drobnoustrojów prawdopodobnie obecnych w danej próbce. 100 CZE˛ŚĆ I Poniżej przedstawiono kilka przykładów stanów klinicznych i drobnoustrojów obecnych w różnych typach próbek chirurgicznych: • Jama otrzewnej zawiera prawdopodobnie Gram-ujemne bakterie jelitowe, Gram-ujemne pałeczki beztlenowe (Bacteroides fragilis) i laseczki. • Otorbiony ropień może zawierać każdy typ drobnoustrojów, jeden lub kilka gatunków: Gram-dodatnie ziarenkowce i Gram-ujemne laseczki sa˛ izolowane najcze˛ściej. W zależności od lokalizacji należy również uwzgle˛dnić bakterie beztlenowe i pełzaki. • We˛zły chłonne cze˛sto wła˛czone sa˛ w infekcje układowe. Sa˛ powie˛kszone, cze˛sto dość twarde i gromadza˛ ropny wysie˛k. Jeśli we˛zeł jest chełbocza˛cy, zawarty płyn może zostać zaaspirowany przez lekarza. Biopsje we˛złów chłonnych i aspiraty pobrane od dzieci należy hodować w kierunku Mycobacterium tuberculosis i innych pra˛tków. Poza hodowla˛ w kierunku gronkowców, ziarenkowców i Gram-ujemnych bakterii jelitowych we˛zły chłonne stanowia˛ dobry materiał do diagnostyki układowych i podskórnych grzybic (histoplazmoza, sporotrychoza). • Skóra i tkanka podskórna sa˛ pierwotnym miejscem powstawania ropni i zakażeń ran. Zgodnie z ogólna˛zasada˛, ropnie podskórne wywoływane sa˛przez gronkowce. Otwarte, sa˛cza˛ce sie˛ zmiany skórne cze˛sto wyste˛puja˛ w zakażeniach β-hemolizuja˛cymi paciorkowcami i/lub gronkowcami, jak np. w liszajcu. Innym rodzajem zmian skórnych, powstaja˛cych cze˛sto w wyniku zakażeń szpitalnych, wymagaja˛cych interwencji chirurgicznej, sa˛ owrzodzenia odleżynowe i odleżyny. Bakterie, które sa˛ komensalami skóry lub wchodza˛ w skład flory jelitowej, moga˛ namnażać sie˛ w zewne˛trznych warstwach owrzodzenia i sa˛odpowiedzialne za nieprzyjemny zapach i wygla˛d. Najcze˛ściej izolowanymi drobnoustrojami z biopsji tkanki sa˛ laseczki; można je również obserwować w posiewach z powierzchownego wysie˛ku. Nie zawsze możliwa jest ocena udziału tych drobnoustrojów w powstawaniu owrzodzenia odleżynowego, ale warunkiem zagojenia sie˛ rany jest utrzymywanie czystego i suchego owrzodzenia bez bakterii. Czasami drobnoustroje z odleżyny moga˛ przenikać do krwi, wywołuja˛c poważne powikłania. • Oparzenia, szczególnie drugiego i trzeciego stopnia, sprzyjaja˛ infekcjom wywołanym przez różne gatunki bakterii. Bardzo ważne jest dokładne chirurgiczne opracowanie rany przeprowadzone przed pobraniem materiału do hodowli. Najcze˛ściej izolowane bakterie to gronkowce i Pseudomonas aeruginosa. • Wysie˛ki. Czasami surowiczy lub ropny płyn może być pobrany z jamy ciała, która normalnie zawiera niewielka˛ ilość sterylnego płynu, np. worek osierdziowy, jama opłucnej, kaletka lub staw. Aspiracja igłowa w aseptycznych warunkach dostarczy laboratorium materiału, z którego można wyizolować i zidentyfikować zakażaja˛cy mikroorganizm. Zazwyczaj przyczyna˛ zakażenia sa˛ bakterie, moga˛ wyste˛pować również grzyby i wirusy. Infekcje wywołane sa˛ najcze˛ściej przez jeden gatunek, ale pojawiaja˛ sie˛ także mieszane tlenowo-beztlenowe zakażenia. Z aspiratów z jamy opłucnej można uzyskać pneumokoki, paciorkowce, H. influenzae, beztlenowe paciorkowce lub beztlenowe Gram-ujemne pałeczki (Prevotella i Porphyromonas) oraz M. tuberculosis. Rany penetruja˛ce Każde uszkodzenie spowodowane przedmiotem, który przebija skóre˛, zawiera prawdopodobnie mieszanine˛ mikroorganizmów; drobnoustroje należa˛ głównie do flory skóry lub naturalnej flory mikrobiologicznej gleby i wody. Rany penetruja˛ce 101 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE z uszkodzeniem jelit stanowia˛ jeszcze poważniejsze zagrożenie, ponieważ w infekcji może współuczestniczyć flora jelitowa. Rany penetruja˛ce i cie˛te moga˛ być spowodowane ostrymi i te˛pymi narze˛dziami. Powstaja˛ cze˛sto z użyciem metalu, szkła, drewna itp., w sposób przypadkowy lub umyślny (np. dźgnie˛cie nożem lub rany postrzałowe). Te˛żec rozwijaja˛cy sie˛ w wyniku rany penetruja˛cej jest dla nieszczepionych osób choroba˛ zagrażaja˛ca˛ życiu. Botulizm przyranny może pozostać nie rozpoznany, jeśli lekarz i mikrobiolog nie sa˛ świadomi takiej możliwości. Te˛żec i botulizm sa˛ rozpoznawane na podstawie objawów klinicznych, a laboratoryjne potwierdzenie powinno być przeprowadzone przez centralne laboratorium referencyjne. Ludzie pracuja˛cy ze zwierze˛tami lub produktami zwierze˛cymi sa˛ narażeni na zakażenie sporami Bacillus anthracis, które moga˛ wnikna˛ć przez małe rany lub uszkodzenia skóry, wytwarzaja˛c typowa˛ dla wa˛glika postać czarnej krosty. Wyste˛puja˛cy także w glebie Clostridium perfringens może wnikna˛ć do rany penetruja˛cej i wywołać zgorzel gazowa˛. Zadrapania i ugryzienia przez zwierze˛ta wyste˛puja˛ cze˛sto zarówno w obszarach miejskich, jak i wiejskich. Ugryzienia moga˛ pochodzić od domowych, hodowlanych lub dzikich zwierza˛t. W pierwszej kolejności i niezwłocznie należy rozpatrzyć wścieklizne˛. Po wykluczeniu tej możliwości należy rozważyć inne czynniki etiologiczne. Diagnostyka wścieklizny jest zbyt specjalistyczna, aby została omówiona w tym opracowaniu1. Jama ustna zwierza˛t zawiera heterogenna˛ flore˛, w skład której wchodza˛ tlenowe i beztlenowe bakterie, grzyby, pierwotniaki i wirusy. Infekcje z powodu ugryzienia lub zadrapania wywołane sa˛ zwykle przez bakterie. Klasycznym przykładem jest zakażenie Pasteurella multocida, które cze˛sto towarzyszy ugryzieniom przez psa lub kota, gdy rana nie została właściwie oczyszczona i leczona. Ugryzienia przez człowieka moga˛ niekiedy wywoływać poważne mieszane zakażenia tlenowymi i beztlenowymi bakteriami. Szpitalne zakażenia ran Jednym z głównych założeń w opiece i leczeniu hospitalizowanych pacjentów jest zasada nieszkodzenia (,,primum non nocere’’ — przyp. tłum.) w przebiegu diagnozowania i terapii. Niestety 5 – 10% hospitalizowanych pacjentów nabywa infekcje w szpitalu. Zakażenia szpitalne generuja˛ koszty, zwykle można ich unikna˛ć lub znacznie ograniczyć ich wyste˛powanie. Wiele nabytych w szpitalu infekcji pojawia sie˛ na oddziałach chirurgicznych. Współczynnik pooperacyjnych zakażeń ran różni sie˛ w zależności od szpitala, a w obre˛bie szpitala wydaje sie˛ wyższy u pacjentów poddanych operacjom jamy brzusznej, klatki piersiowej lub zabiegom ortopedycznym. Zakażenia ran chirurgicznych moga˛ pojawiać sie˛ krótko po zabiegu lub kilka dni później. Zakażenie może być ograniczone do miejsca przecie˛cia lub obejmować całe miejsce operowane. Głównym czynnikiem etiologicznym zakażeń jest Staphylococcus aureus (zwykle oporny na benzylopenicyline˛, a obecnie również metycylinooporny), przed E. coli i innymi bakteriami jelitowymi. Beztlenowe bakterie z jelita grubego pacjenta moga˛ zakazić operowane miejsca, wywołuja˛c cie˛żka˛ mieszana˛ infekcje˛, dość cze˛sto wyste˛puja˛ca˛ w szpitalach, w których opieka nad ranami pooperacyjnymi 1 Meslin F.-X., Kaplan M.M., Koprowski H. (eds.): Laboratory techniques in rabies, 4th ed. Geneva, World Health Organization, 1996. 102 CZE˛ŚĆ I i programy profilaktyki zakażeń sa˛ słabo rozwinie˛te. Bacteroides fragilis i rzadziej Clostridium perfringens moga˛ przenikna˛ć do krwi, staja˛c sie˛ przyczyna˛ uogólnionego, cze˛sto śmiertelnego zakażenia pooperacyjnego. Po zabiegu stomatologicznym lub chirurgicznym w obre˛bie jamy ustnej może rozwina˛ć sie˛ rzadka infekcja, w której kanał przetoki prowadzi od wewna˛trz na powierzchnie˛ skóry twarzy lub szyi, a wydzielina zawiera ,,siarkowe’’ ziarna promienicy. Pobieranie i transport próbek Nie jest możliwe w tym miejscu szczegółowe opisanie procedury pobierania próbek z każdego typu rany, ropnia itd. Wydaje sie˛ oczywiste, że to zadanie wymaga bliskiej współpracy mie˛dzy laboratorium i lekarzem. W wielu przypadkach istnieje tylko jedna możliwość pobrania próbki; zazwyczaj nie ma możliwości pobrania kolejnych. Z tego powodu pobieranie, transport i przechowywanie próbek maja˛ najwie˛ksze znaczenie i wymagaja˛ ścisłego przestrzegania zaleceń. Możliwie najszybciej po pobraniu próbke˛ należy przesłać do laboratorium, gdzie powinna zostać natychmiast opracowana. Po wste˛pnym badaniu i założeniu hodowli pozostała˛ cze˛ść materiału należy odpowiednio opisać i zachować w warunkach schłodzenia do chwili uzyskania pewności, że nie ma potrzeby wykonania dodatkowych testów laboratoryjnych. Ropień Jeśli zostanie wykryty ropień lub mnogie ropnie, lekarz prowadza˛cy lub chirurg i mikrobiolog powinni skonsultować sie˛ w sprawie dalszego poste˛powania. Technika pobierania ropy i fragmentów ściany ropnia jest procedura˛ chirurgiczna˛. Do pobrania możliwie najwie˛kszej obje˛tości materiału ropnego należy użyć igły i strzykawki, a naste˛pnie przenieść aseptycznie pobrany materiał do sterylnego pojemnika. Jeśli taki pojemnik nie jest doste˛pny, próbke˛ należy zatrzymać w strzykawce z zatknie˛ta˛ igła˛ i cała˛ strzykawke˛ przesłać do laboratorium (metoda ta nie jest obecnie polecana z powodu ryzyka ekspozycji na zakażenie — przyp. tłum.). Materiał powinien natychmiast zostać poddany obróbce w laboratorium; zarówno hodowle tlenowe jak i beztlenowe można założyć z jednej próbki. Ze wzgle˛du na potencjalna˛ konieczność śródoperacyjnego pobrania próbki w czasie zabiegów, w których przypadkowo stwierdza sie˛ obecność jednego lub wie˛cej otorbionych ropni w narza˛dach, klatce piersiowej, jamie brzusznej lub miednicy, w sterylnym chirurgicznym wyposażeniu powinny znaleźć sie˛ zestawy do pobierania materiału. Za dostarczenie odpowiednich zestawów odpowiedzialne jest laboratorium. W przypadku obecności obfitej ropy należy unikać pobierania próbek wymazówka˛. Użycie wymazówek uzasadnione jest do pobierania bardzo małych ilości ropy lub z miejsc wymagaja˛cych zachowania ostrożności, np. z oka. Gdy dostarczone zostana˛ fragmenty tkanek ze ścian ropnia, technik laboratoryjny powinien zmiażdżyć tkanke˛, używaja˛c jako rozpuszczalnika niewielkiej ilość sterylnego bulionu lub rozdrobnić tkanke˛ na bardzo małe kawałki używaja˛c sterylnych nożyczek. Należy przygotować hodowle tlenowe i beztlenowe w sposób opisany na str. 107. 103 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE Zakażone skaleczenia, rany dra˛ża˛ce, rany pooperacyjne, oparzenia i owrzodzenia odleżynowe Nie można sformułować standardowej procedury pobierania próbek. Należy jednak przestrzegać pewnych podstawowych zasad otrzymywania możliwie najlepszych próbek do badań laboratoryjnych. Po starannym oczyszczeniu miejsca chirurg powinien odnaleźć zbiornik ropy, martwicze tkanki, rozpoznać obecność gazu (trzeszczenie) lub inne nieprawidłowe objawy. Fragmenty zaje˛tych tkanek, które zostana˛ użyte do hodowli, powinny zostać pobrane na sterylna˛ gaze˛. Rope˛ lub inny wysie˛k należy pobrać starannie i umieścić w sterylnej probówce. W razie potrzeby można użyć wymazówek. Kanały przetoki lub rany drenuja˛ce we˛złów chłonnych Jeśli przetoki lub we˛zły chłonne wykazuja˛ objawy samoistnego drenowania, należy, używaja˛c sterylnej pipety Pasteura wyposażonej w gumowy balonik, starannie pobrać materiał i umieścić go w sterylnej probówce. Jeśli wydzielina nie jest widoczna, chirurg powinien pobrać ropny materiał za pomoca˛ strzykawki i igły. Wymazówki należy stosować tylko wtedy, gdy nie sa˛ doste˛pne pipety Pasteura. Wysie˛ki Nieprawidłowe zbieranie sie˛ płynu w jamie ciała, takiej jak jama opłucnej, staw lub przestrzeń otrzewnowa, wymaga interwencji chirurgicznej z aspiracja˛ nagromadzonego materiału do sterylnego pojemnika, a naste˛pnie dostarczenia go do laboratorium w celu wykonania badania mikrobiologicznego i cytologicznego. W przypadku cia˛głego gromadzenia sie˛ ropy należy założyć otwarty dren, konieczny do aseptycznego pobrania płynu, w celu wykonania posiewu i innych badań. Ocena makroskopowa Próbki ropy lub wydzieliny z rany pobrane na wymazówki sa˛ trudne do oceny makroskopowej, szczególnie gdy zostały zanurzone w podłożu transportowym. Kolor, konsystencja i zapach próbek ropy, otrzymanych w strzykawce lub w sterylnym pojemniku, powinny być oceniane uważnie przez doświadczonego mikrobiologa. Kolor Ropa może mieć kolor od zielonożółtego do bra˛zowoczerwonego. Czerwony kolor spowodowany jest domieszka˛ krwi lub hemoglobiny. Aspirat z pierwotnego ropnia wa˛troby wywołanego pełzakiem ma galaretowata˛ konsystencje˛ i barwe˛ od żółtobra˛zowej do ciemnobra˛zowej. Ropa z ran pooperacyjnych lub urazowych 104 CZE˛ŚĆ I (oparzeń) może mieć zabarwienie niebieskozielone z powodu obecności piocyjaniny, wytwarzanej przez Pseudomonas aeruginosa. Konsystencja Konsystencja może być różna: od me˛tnego do bardzo ge˛stego i lepkiego płynu. Wysie˛ki aspirowane ze stawów, jamy opłucnej lub worka osierdziowego sa˛ zwykle płynne, z możliwa˛ gradacja˛ od surowiczego wysie˛ku do typowej ropy. Ropa organizuja˛ca sie˛ w drenowanym kanale przetoki na szyi powinna zostać zbadana w kierunku obecności małych żółtych ziaren ,,siarkowych’’, które sa˛ skupiskami promieniowców Actinomyces israelii. Obecność siarkowych ziaren wskazuje na promienice˛ szyjno-twarzowa˛. Małe różnokolorowe ziarenka (białe, czarne, czerwone lub bra˛zowe) sa˛typowe dla mycetoma, ziarniniakowych guzów, które zwykle sa˛ zlokalizowane na kończynach dolnych (np. stopa madurska) i charakteryzuja˛ sie˛ licznymi ropniami i przetokami. Kolorowe ziarenka odpowiadaja˛ zarówno nitkowatym bakteriom, jak i grzybni. Ropa z gruźliczych ,,ropni zimnych’’ (ze ska˛pymi objawami zapalenia) porównywana jest z mie˛kkim serem i nazywana ,,serowacieja˛ca˛’’ lub ,,serowata˛ ropa˛’’. Zapach Nieprzyjemny zapach jest jedna˛z cech charakterystycznych dla beztlenowych lub mieszanych tlenowo-beztlenowych zakażeń, ale w pewnych okolicznościach może nie wyste˛pować. Wste˛pna ocena na podstawie zapachu i morfologii komórek w preparacie barwionym metoda˛ Grama powinna być niezwłocznie przedstawiona klinicyście w celu ułatwienia empirycznego wyboru właściwego antybiotyku. Jest ona także pomocna w podje˛ciu decyzji o konieczności hodowli beztlenowej. Badanie mikroskopowe Z każdej próbki należy wykonać i obejrzeć preparat barwiony metoda˛ Grama. W niektórych przypadkach lub na polecenie lekarza należy przygotować preparat bezpośredni barwiony metoda˛ Ziehl-Neelsena. Barwienie preparatów metoda˛ Grama Za pomoca˛ ezy nanieść na czyste szkiełko podstawowe najbardziej ropna˛ cze˛ść próbki. Jeśli doste˛pny jest tylko wymaz, szkiełko należy najpierw wysterylizować w ogniu nad palnikiem Bunsena i pozostawić do wystygnie˛cia. Bawełniana˛ wymazówke˛ należy delikatnie przetoczyć po powierzchni szkiełka, bez pocierania lub nadmiernego wyciskania. Pozostawić szkiełko do wyschnie˛cia na powietrzu lub umieścić w cieplarce. Utrwalić przez ogrzanie, wybarwić i ogla˛dać preparat w immersji (obiektyw × 100). Poszukiwać starannie i odnotować obecność i liczbe˛ (używaja˛c znaków +): – wieloja˛drzastych granulocytów (komórki ropy); 105 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE – Gram-dodatnich ziarenkowców ułożonych w skupiska, sugeruja˛cych gronkowce; – Gram-dodatnich ziarenkowców w łańcuchach, sugeruja˛cych paciorkowce lub enterokoki; – Gram-ujemnych pałeczek podobnych do pałeczki okre˛żnicy (Escherichia coli, Klebsiella etc.), innych Enterobacteriaceae (Proteus, Serratia etc.), niefermentuja˛cych pałeczek (Pseudomonas spp.) lub bezwzgle˛dnych beztlenowców (Bacteroides spp.); – dużych prostych Gram-dodatnich pałeczek z kwadratowymi biegunami, sugeruja˛cych Clostridium perfringens, główna˛ przyczyne˛ zgorzeli gazowej lub Bacillus anthracis, przyczyne˛ wa˛glika; – ge˛stej i wielokształtnej mieszaniny bakterii, zawieraja˛cej paciorkowce, Gram-dodatnie i Gram-ujemne pałeczki o różnym kształcie, również wrzecionowce; taki obraz sugeruje ,,mieszana˛ flore˛ beztlenowa˛’’, która˛ tak należy opisać; – Candida lub innych komórek grzybów, które widoczne sa˛ jako owalne, Gram-dodatnie, pa˛czkuja˛ce komórki, cze˛sto tworza˛ce rozgałe˛zione pseudogrzybnie. Ziarenka siarki z promienicy (aktynomykozy) i ziarenka grzybni należy rozdrobnić, wybarwić metoda˛ Grama i poszukiwać Gram-dodatnich cienkich rozgałe˛zień i fragmentów nici. Mikroskopia bezpośrednia Zgodnie z zaleceniem lub gdy prawdopodobne jest grzybicze lub pasożytnicze zakażenie, należy przygotować niebarwiony preparat. Jeśli ropa jest ge˛sta, oczko ezy zmieszać z fizjologicznym roztworem soli. Podczas badania w kierunku grzybów do rozjaśnienia próbki użyć kropli 10% wodorotlenku potasu. Nałożyć szkiełko nakrywkowe i w powie˛kszeniu obiektywu × 10 – × 40 poszukiwać zwłaszcza: – aktywnie ruchomych pełzaków w aspiracie z ropnia wa˛troby; – komórek grzybów drożdżopodobnych Histoplasma capsulatum (ła˛cznie z afrykańska˛ odmiana˛ var. duboisii), Blastomyces dermatitidis (w regionach endemicznych), Candida spp.; – grzybni i filamentacyjnych form bakterii w rozdrobnionych ziarenkach ze zmian w stopie madurskiej; – pasożytów, takich jak mikrofilarie, skoleksów i haczyków Echinococcus, jaj Schistosoma, Fasciola lub Paragonimus. Barwienie kwasooporne (Ziehl-Neelsena) Barwienie Ziehl-Neelsena powinno być wykonywane na zlecenie lekarza. Przygotowanie barwionego w ten sposób preparatu zaleca sie˛ także, gdy w ropie nie sa˛ widoczne bakterie lub gdy w barwieniu metoda˛ Grama obserwuje sie˛ ,,maczugowcowe’’, słabo Gram-dodatnie pałeczki. Obecność pra˛tków gruźlicy należy podejrzewać zwłaszcza w ropnym wysie˛ku z jamy opłucnej, stawów, ropni kości lub we˛złów chłonnych. Niegruźlicze (tak zwane atypowe) kwasooporne pra˛tki znajdowane sa˛ także w ropniach pośladków, w miejscu głe˛bokiej iniekcji domie˛śniowej. Takie ropnie wywołane sa˛ cze˛sto przez szybko rosna˛ce pra˛tki należa˛ce do grupy Mycobacterium fortuitum-chelonei. W tropikach wydzielina zeskrobana z podstawy martwiczego owrzodzenia skóry zlokalizowanego na nodze lub ramieniu może wykazywać obecność wolno rosna˛cych pra˛tków 106 CZE˛ŚĆ I kwasoopornych M. ulcerans (owrzodzenie Buruli). M. marinum jest innym gruźliczopodobnym pra˛tkiem, który może być izolowany z przewlekłych, wrzodzieja˛cych zmian guzkowych na re˛kach, ramionach i innych eksponowanych powierzchniach skóry u pływaków i rybaków. Hodowla Jeśli w badaniu mikroskopowym widoczne sa˛bakterie lub grzyby, materiał należy posiać na odpowiednie podłoża. Niezależnie od wyników badania mikroskopowego, wszystkie próbki ropy lub wysie˛ków powinny być posiewane na co najmniej trzy podłoża hodowlane: – agar z krwia˛ do izolacji gronkowców i paciorkowców; – agar MacConkeya do izolacji Gram-ujemnych pałeczek; – podłoże płynne, które może posłużyć jako podłoże wzbogacone zarówno dla tlenowców, jak i beztlenowców, np. podłoże tioglikolanowe lub bulion z wycia˛giem mie˛snym. Obje˛tość inoculum powinna być uzależniona od wyniku badania mikroskopowego i waha sie˛ od jednego oczka ezy do kilku kropel. Jeśli w barwieniu metoda˛ Grama widoczne sa˛ liczne mikroorganizmy, próbka powinna przed posianiem zostać rozcieńczona w małej ilości sterylnego podłoża płynnego. Jeśli do posiewu używana jest wymazówka, materiał należy nanieść na niewielki obszar płytki, a naste˛pnie rozsiać eza˛ na pozostałej powierzchni. Jeśli wymazówka jest sucha należy ja˛ najpierw zwilżyć mała˛ ilościa˛ sterylnego bulionu lub fizjologicznego roztworu soli. W każdym przypadku technika posiewu powinna umożliwić uzyskanie pojedynczych kolonii do identyfikacji i antybiogramu. Przed posiewem płytke˛ zawieraja˛ca˛ agar z krwia˛ należy suszyć w cieplarce przez 20 minut, minimalizuja˛c w ten sposób ryzyko przerośnie˛cia przez rozprzestrzeniaja˛cy sie˛ Proteus spp. Posiane płytki powinny być inkubowane w 35°C w eksykatorze. Rutynowo podłoża należy inkubować dwa dni i obserwować codziennie wzrost. Jeśli prowadzona jest hodowla mikroorganizmów o wysokich wymaganiach odżywczych, konieczna be˛dzie dłuższa inkubacja (1 – 2 tygodnie lub wie˛cej). Jeśli wzrost pojawia sie˛ na podłożu płynnym, należy wykonać preparat barwiony metoda˛ Grama i hodowle przesiać na odpowiednie podłoża. Na zlecenie lub jeśli na taka˛ konieczność wskazuje wynik badania mikroskopowego, można zastosować specjalne dodatkowe podłoża hodowlane: • Jeśli uwidoczniono gronkowce, pomocny w uzyskaniu czystego wzrostu i wste˛pnego rozróżnienia mie˛dzy S. aureus i innymi ziarenkowcami jest agar z mannitolem. • Jeśli zaobserwowano paciorkowce, ich identyfikacja może być przyspieszona przez umieszczenie na linii pierwszego posiewu różnicuja˛cego kra˛żka z bacytracyna˛. • Jeśli zaobserwowano drożdże lub grzyby, próbka powinna być także wsiana do dwóch probówek z agarem Sabouraud, jedna do inkubacji w 35°C, druga w temperaturze pokojowej, obydwie obserwowane przez miesia˛c (do izolacji Candida spp. wystarczy agar z krwia˛). • Jeśli w preparacie barwionym metoda˛ Ziehl-Neelsena uwidoczniono kwasooporne pra˛tki, materiał należy posiać do 3 probówek z podłożem Löwensteina-Jensena. Próbke˛ zawieraja˛ca˛ również niekwasooporne pra˛tki przed posiewem należy dekontaminować. Szybko rosna˛ce bakterie, takie jak M. fortuitum, moga˛ gina˛ć w procesie dekontaminacji; wyrastaja˛ one na agarze z krwia˛ i agarze MacConkeya w cia˛gu 3 – 7 dni. Rozgałe˛zione, nitkowate, cze˛ściowo 107 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE kwasooporne pałeczki w ropie z jamy opłucnej lub z ropnia mózgu, które wyrastaja˛ na agarze z krwia˛ w cia˛gu kilku dni, to prawdopodobnie Nocardia asteroides. • Ropa od pacjentów z zapaleniem stawów, zapaleniem opłucnej, zapaleniem kości lub tkanki podskórnej, zwłaszcza od dzieci do 5 roku życia, powinna być także posiana na płytke˛ z agarem czekoladowym w celu wykrycia H. influenzae. • Hodowla w ściśle beztlenowych warunkach jest istotna, gdy w preparacie barwionym metoda˛ Grama obecna jest mieszana flora beztlenowa lub gdy próbka charakteryzuje sie˛ typowym zgniłym zapachem. Hodowla na agarze z krwia˛ w warunkach beztlenowych jest konieczna do uzyskania wzrostu Actinomyces. Posiew w kierunku beztlenowców prowadzony jest również na zlecenie klinicysty, który podejrzewa zgorzel gazowa˛. Metody diagnostyki w zakażeniach bakteriami beztlenowymi opisano na str. 113 – 118. Identyfikacja Z wyja˛tkiem zanieczyszczeń ze środowiska lub ze skóry (takich jak Staphylococcus epidermidis) wszystkie drobnoustroje izolowane z ran, ropy lub wysie˛ków powinny być traktowane jako znacza˛ce i należy je zidentyfikować. Pełna identyfikacja nie zawsze jest konieczna, zwłaszcza w przypadku flory mieszanej. Bakterie i grzyby izolowane z ropy i wysie˛ków moga˛ należeć do prawie każdej grupy lub gatunku. Zostana˛ tu podane tylko zasady identyfikacji gronkowców, cze˛sto zwia˛zanych z procesami ropnymi (ropotwórczych) i dwóch innych patogenów, Pasteurella multocida i Bacillus anthracis, rzadko izolowanych z ran lub zakażeń skóry, ale bardzo istotnych ze wzgle˛du na sposób poste˛powania z pacjentem. W standardowych podre˛cznikach mikrobiologii klinicznej można znaleźć pełny opis metod identyfikacji. W każdym przypadku pierwszym etapem powinno być uważne badanie dobrze odgraniczonych kolonii, pobranie pojedynczej kolonii każdego typu, przygotowanie preparatu barwionego metoda˛ Grama i obserwacja mikroorganizmów pod mikroskopem. Gronkowce Gronkowce sa˛ bakteriami najcze˛ściej zwia˛zanymi z wytwarzaniem ropy. Rosna˛ dobrze w warunkach tlenowych na agarze z krwia˛ i po całonocnej inkubacji wytwarzaja˛nieprzezroczyste białe lub kremowe kolonie o średnicy 1 – 2 mm. Jako jedyne rosna˛ na podłożu z dużym ste˛żeniem soli, takim jak MSA. Moga˛ być różnicowane z paciorkowcami na podstawie morfologii i zdolności wytwarzania katalazy. Wytwarzanie katalazy można wykazać przez dodanie kropli 3% nadtlenku wodoru do kolonii umieszczonych na czystym szkiełku. Pojawienie sie˛ pe˛cherzyków tlenu jest wskaźnikiem produkcji katalazy. Dla potrzeb klinicznych gronkowce można podzielić na takie, które wytwarzaja˛ koagulaze˛, i takie, które jej nie wytwarzaja˛. Koagulazododatnie gronkowce należa˛ do S. aureus, gatunku o najwie˛kszym znaczeniu klinicznym. Spośród wielu koagulazoujemnych szczepów zostana˛ tu omówione tylko dwa — S. epidermidis i S. saprophyticus. Mimo że S. aureus należy do komensalnej flory mikrobiologicznej nosa (40% zdrowych dorosłych to nosiciele), skóry i przewodu pokarmowego, szczepy tego 108 CZE˛ŚĆ I gatunku sa˛ odpowiedzialne za liszajec, czyraki, ropnie, zakażenia ran, zakażenia owrzodzeń i oparzeń, zapalenie szpiku, zapalenie gruczołu sutkowego (ropień piersi), ropniak opłucnej, ropne zapalenie mie˛śnia, zespół szoku toksycznego i inne typy ropnych zakażeń. S. epidermidis jest również cze˛stym komensalem skóry, nosa i innych błon śluzowych, wykazuje niska˛ chorobotwórczość. Jednakże jego obecność w ropie nie zawsze powinna być lekceważona i uznawana za zanieczyszczenie ze skóry. Mimo niskiej infekcyjności S. epidermidis może wywoływać zakażenia skórne w miejscu wprowadzenia cewnika założonego na stałe, wenflonu lub innych ciał obcych. Zakażenia S. epidermidis, ucia˛żliwe zwłaszcza w kardiochirurgii i w chirurgii ortopedycznej, zwia˛zane sa˛ z wszczepianiem protez (sztuczne zastawki serca lub protezy bioder). S. saprophyticus jest cze˛sta˛ przyczyna˛ zakażeń dróg moczowych u młodych kobiet, zajmuja˛c w niektórych populacjach druga˛ pozycje˛ po E. coli. Cechy różnicuja˛ce trzy główne gatunki Staphylococcus podane sa˛ w tabeli 22. Schemat wste˛pnej identyfikacji gronkowców przedstawiono na rycinie 10. Gram-dodatnie ziarenkowce w nieregularnych skupiskach nie wykazuja˛ce ruchu, nie tworza˛ce spor, tlenowe lub wzgle˛dnie beztlenowe, katalazododatnie, zwykle oksydazoujemne, fermentuja˛ce cukry ▼ Koagulaza + – Staphylococcus aureus Agar z trehaloza˛, mannitolem i fosfataza˛ ▼ Kwas Bez kwasu ▼ Fosfataza alkaliczna Staphylococcus epidermidis + – Staphylococcus schleiferi Oporne na nowobiocyne˛ ▼ + – Staphylococcus saprophyticus Dekarboksylaza ornityny ▼ – + ▼ Ureaza Staphylococcus lugdunensis – + Hemoliza Staphylococcus warneri/hominis ▼ – + Staphylococcus koagulazoujemne Staphylococcus haemolyticus Ryc. 10. Schemat wste˛pnej identyfikacji gatunku Staphylococcus. 109 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE Tabela 22. Różnicowanie klinicznie ważnych szczepów Staphylococcus S. aureus Wytwarzanie koagulazy Rozkład mannitolu S. epidermidis S. saprophyticus Tak Kwaśny (żółty) Nie Nie Oboje˛tny (czerwo- Kwaśny (żółty) ny) Pigmentacja koloniia Szare, kremowe Białe Białe lub żółte Wrażliwość in vitro na nowo- Wrażliwy Wrażliwy Opornyb biocyne˛ Agar z DNaza˛ Tak Nie Nie a Wyste˛puja˛ wyja˛tki. Strefa zahamowania mniejsza niż 16 mm, w standaryzowanym teście dyfuzyjno-kra˛żkowym z 5-mikrogramowym kra˛żkiem. b Ze wzgle˛du na znaczenie testu koagulazowego w identyfikacji S. aureus, został on tutaj szczegółowo opisany. Koagulaza jest enzymem powoduja˛cym krzepnie˛cie osocza krwi. Gronkowcowa koagulaza wyste˛puje w dwóch formach: zwia˛zanej koagulazy lub inaczej czynnika aglutynuja˛cego (clumping factor), który wykrywany jest w teście szkiełkowym, oraz wolnej koagulazy, wykrywanej w teście probówkowym. • Test szkiełkowy. Na czystym szkiełku utworzyć zawiesine˛ z jednej lub kilku kolonii gronkowców i kropli fizjologicznego roztworu soli. Zawiesina powinna być dość ge˛sta. Zanurzyć czysta˛ eze˛ w osoczu i użyć jej do wymieszania osocza z zawiesina˛ bakterii. Obserwować tworzenie sie˛ kłaczków przez 10 sekund. Fałszywie ujemne wyniki testu szkiełkowego pojawiaja˛ sie˛ w przypadku około 10% szczepów S. aureus. Jeśli test szkiełkowy jest ujemny dla izolatu, który wydaje sie˛ patogenny na innej podstawie (pigment, informacje kliniczne), należy zbadać szczep w teście probówkowym. • Test probówkowy. Umieścić kilka kropel (0,5 ml) osocza w sterylnej probówce 12 × 75 mm i dodać dwie krople czystej hodowli w bulionie. Zawiesine˛ o porównywalnej ge˛stości można także przygotować bezpośrednio z kolonii pobranych z agaru z krwia˛. Inkubować probówki w 35°C przez 4 – 18 godzin, a naste˛pnie obserwować obecność skrzepu. Osocze używane w teście koagulazowym może być świeżym ludzkim lub króliczym osoczem z kwasem etylenodiaminotetraoctowym (EDTA). Powinno być przechowywane w niewielkich porcjach (1 ml) w chłodziarce, a jego przydatność należy kontrolować równolegle z hodowlami S. aureus i S. epidermidis. Pasteurella multocida Pasteurella multocida to Gram-ujemne pałeczki najcze˛ściej odpowiedzialne za cie˛żkie zakażenia u ludzi, wyste˛puja˛ce po ugryzieniach przez zwierze˛ta. Bakteria ta jest komensalem wchodza˛cym w skład normalnej flory jamy ustnej wielu zwierza˛t. Rany po ugryzieniach zakażone P. multocida moga˛ dawać objawy rozległego zapalenia tkanki podskórnej, które może przebiegać z zaje˛ciem stawów. Opisywano także zapalenia szpiku, bakteriemie, a nawet zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych. P. multocida powinna być poszukiwana zwłaszcza w wydzielinie z ran powstałych po ugryzieniu przez zwierze˛. Jest bardzo mała˛, Gram-ujemna˛, nieruchliwa˛ziarenko-pałeczka˛. Rośnie dobrze na agarze z krwia˛w 35°C, ale wzrost ulega całkowitemu zahamowaniu w obecności soli żółciowych, zawartych w podłożach 110 CZE˛ŚĆ I selektywnych do hodowli bakterii jelitowych, np. agar MacConkeya. Po całonocnej inkubacji kolonie na agarze z krwia˛ sa˛ małe, niehemolizuja˛ce, półprzezroczyste i śluzowe (dzie˛ki obecności otoczki w formie wirulentnej). Biochemiczna identyfikacja oparta jest na naste˛puja˛cych cechach: – fermentacja glukozy bez gazu; P. multocida rośnie na agarze Kliglera z zakwaszeniem słupka; – test oksydazowy jest słabo dodatni; – test na wytwarzanie katalazy dodatni; – redukcja azotanu do azotynu (0,1% azotan potasu w bulionie odżywczym); – test na wytwarzanie ureazy ujemny; – wytwarzanie indolu — test w bulionie tryptozowo-sojowym (TSB) lub MIU po 48 godzinach inkubacji; – wysoka wrażliwość na benzylopenicyline˛ w kra˛żkowym teście wrażliwości. Bacillus anthracis Do rodzaju Bacillus należa˛ liczne gatunki tlenowych, tworza˛cych spory, Gram-dodatnich laseczek, powszechnie wyste˛puja˛cych w glebie. Gatunek B. anthracis wywołuje ważne dla zdrowia publicznego zakażenia skóry. Inne gatunki izolowane z ran lub ropy sa˛ zwykle zanieczyszczeniem lub w wie˛kszości mikroorganizmami oportunistycznymi. B. anthracis jest znacza˛cym patogenem bydła, owiec, kóz i innych domowych zwierza˛t. Zakażenie wyste˛puje także u dzikich zwierza˛t. Wa˛glik może zakażać człowieka, a przypadki infekcji wyste˛puja˛ zwłaszcza w Afryce i Azji u osób pracuja˛cych i żyja˛cych w bliskim kontakcie z żywym inwentarzem. Do zakażenia ludzi może dojść również przez produkty odzwierze˛ce, zawieraja˛ce spory wa˛glika, takie jak: wełna, skóry, futro i kości. Najcze˛stsza˛postacia˛ zakażenia ludzi jest wa˛glik skórny, z którego może rozwina˛ć sie˛ sepsa i zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. Spory przechodza˛ przez uszkodzona˛ skóre˛ i wytwarzaja˛ zmiane˛ pe˛cherzykowa˛ z martwiczym centrum, otoczona˛ przez rozległy obrze˛k (,,czarna krosta’’). W preparatach sporza˛dzonych z płynu pe˛cherzykowego widoczne sa˛ duże Gram-dodatnie, kwadratowo zakończone, otoczkowe pałeczki bez spor. B. anthracis rośnie w warunkach tlenowych. Na agarze z krwia˛ wytwarza duże, płaskie, szarawe kolonie, do 5 mm średnicy, o nieregularnych brzegach i szorstkiej, przypominaja˛cej kłe˛bowisko nici strukturze powierzchni (głowa Meduzy). Na tym etapie ważne jest różnicowanie wysoce patogennych B. anthracis od ogólnie niechorobotwórczych gatunków saprofitycznych. Wste˛pne różnicowanie powinno być oparte na takich cechach, jak: brak hemolizy, wrażliwość na benzylopenicyline˛ oraz brak ruchu u B. anthracis. Saprofityczne gatunki Bacillus wykazuja˛ ruch i sa˛ silnie hemolityczne. Powyższe trzy cechy moga˛ stanowić podstawe˛ wste˛pnej identyfikacji. W celu przeprowadzenia ostatecznej identyfikacji czyste hodowle izolatów należy przesłać niezwłocznie do centralnego laboratorium weterynaryjnego lub innego referencyjnego ośrodka. B. anthracis jest wysoce zakaźnym drobnoustrojem, z tego wzgle˛du próbki i hodowle powinny być przesyłane ze szczególnym zachowaniem zasad ostrożności, aby unikna˛ć skażenia środowiska i zakażeń personelu laboratoryjnego. 111 ROPNE WYDZIELINY, RANY I ROPNIE Badanie lekowrażliwości Zastosowanie antybiotyków w leczeniu pacjentów z ranami, ropniami lub wysie˛kami nie zawsze jest konieczne. Odpowiednie chirurgiczne nacie˛cie, drenaż i opracowanie rany sa˛ najcze˛ściej ważniejsze niż antybiotykoterapia. Wynik antybiogramu powinien być doste˛pny w cia˛gu 48 godzin od otrzymania próbki. Rutynowo badanie lekowrażliwości nie powinno być wykonywane dla bakterii o znanej wrażliwości, takich jak paciorkowce, Pasteurella i Actinomyces, które w wie˛kszości sa˛ wrażliwe na benzylopenicyliny. W przypadku Enterobacteriaceae, niefermentuja˛cych Gram-ujemnych pałeczek i gronkowców, lekowrażliwość należy określić z zastosowaniem testu dyfuzyjno-kra˛żkowego dla aktualnie zalecanych antybiotyków. Wrażliwość na nowe i drogie antybiotyki powinna być oznaczana (lub raportowana) tylko na specjalne zlecenie lub gdy szczep wykazuje oporność na inne leki przeciwbakteryjne. Problem stanowi lekooporność, zarówno S. aureus, jak i S. epidermidis. Ponad 80% szczepów, także pozaszpitalnych, wytwarza β-laktamazy i wykazuje oporność na benzylopenicyline˛ i ampicyline˛. Zakażenia wywołane przez szczepy oporne na benzylopenicyline˛ sa˛ cze˛sto leczone stabilnymi wobec β-laktamaz penicylinami z grupy metycyliny (oksacylina, kloksacylina itp.). W antybiogramie zalecane jest użycie kra˛żka z oksacylina˛ (1 µg). Kra˛żki z oksacylina˛ sa˛ stabilne i skutecznie wykrywaja˛ oporność na cała˛ grupe˛ (szczepy oporne na wszystkie antybiotyki β-laktamowe określane sa˛jako oksacylino- lub metycylinooporne, tzw. MR — przyp. tłum.). Oporność ma cze˛sto charakter heterogenny, np. obejmuje tylko cze˛ść populacji bakterii. Niejednorodna oporność gronkowców jest łatwiej identyfikowana w niskich temperaturach, z tego powodu temperatura inkubacji nie powinna przekraczać 35°C. Szczepy o heterogennej oporności w strefie zahamowania wzrostu wokół kra˛żka, wykazuja˛ mgławicowy wzrost lub tworza˛ liczne drobne kolonie, które cze˛sto bywaja˛ traktowane jako zanieczyszczenie. Jeśli pojawia sie˛ taki wzrost, konieczne jest przygotowanie preparatu barwionego metoda˛ Grama w celu wykluczenia zanieczyszczenia. Heterooporne szczepy sa˛ klinicznie oporne na wszystkie antybiotyki β-laktamowe, w tym penicyliny, cefalosporyny i karbapenemy. Z tego powodu dla gronkowców nie należy oznaczać wrażliwości na cefalosporyny. Istnieje także pełna krzyżowa oporność mie˛dzy benzylopenicylina˛ i ampicylina˛. Nie należy wie˛c określać wrażliwości gronkowców na ampicyline˛. 112 Zakażenia bakteriami beztlenowymi Wprowadzenie W niniejszym opracowaniu opisane sa˛ bakterie beztlenowe i najcze˛ściej wywoływane przez nie infekcje. Zakażenia beztlenowcami moga˛ dotyczyć praktycznie każdej tkanki i moga˛ być zlokalizowane w każdym miejscu, jeśli zaistnieja˛ odpowiednie warunki. Wie˛kszość zakażeń bakteriami beztlenowymi wywołana jest przez endogenne szczepy, które w stanie zdrowia wchodza˛ w skład normalnej flory ciała, wywołuja˛c infekcje w przypadku zakłócenia równowagi w ilościowym składzie flory fizjologicznej lub w wyniku przemieszczenia sie˛ bakterii do innego regionu anatomicznego. Egzogenne bakterie beztlenowe, najcze˛ściej Clostridium tetani, C. botulinum, rzadziej C. perfringens oraz inne gatunki laseczek, moga˛ zakażać rany i sa˛ przyczyna˛ odpowiednio te˛żca, botulizmu przyrannego lub zgorzeli gazowej. Ropień, który może być zlokalizowany praktycznie w każdym narza˛dzie, bakteriemia, zapalenie jamy otrzewnej, ropniak opłucnej, zapalenie tkanki podskórnej i zapalenie wyrostka robaczkowego to tylko kilka przykładów chorób, w których bardzo ważna˛ role˛ odgrywaja˛ bakterie beztlenowe. W zwia˛zku z powyższym, ważne jest, aby mikrobiolog wiedział, kiedy i jak należy prowadzić hodowle w kierunku bakterii beztlenowych z określonej próbki klinicznej. Podział bakterii ze wzgle˛du na wymagania tlenowe Być może zbyt uproszczony, lecz dobrze funkcjonuja˛cy podział bakterii o znaczeniu klinicznym oparty jest na wymaganiach tlenowych i wyróżnia: • Bezwzgle˛dnie tlenowe bakterie wymagaja˛ce do uzyskania energii tlenu gazowego; nie rosna˛ przy braku tlenu. Przykładami bezwzgle˛dnych tlenowców sa˛: Micrococcus spp. i Nocardia asteroides. • Bezwzgle˛dnie beztlenowe bakterie prowadza˛ce przemiany metaboliczne bez udziału tlenu, który dla wielu z nich jest toksyczny. Energie˛ uzyskuja˛ w reakcjach fermentacji, z wytworzeniem cuchna˛cych produktów końcowych. Przykładami mikroorganizmów należa˛cych do tej grupy sa˛ takie bakterie beztlenowe, jak Bacteroides fragilis i Peptostreptococcus magnus. • Wzgle˛dnie beztlenowe bakterie, które do wzrostu i wytwarzania energii nie wymagaja˛ bezwzgle˛dnie tlenu; moga˛ zarówno wykorzystywać tlen, jak i rosna˛ć w warunkach beztlenowych. Sa˛najbardziej rozpowszechnione, zwykle adaptuja˛ sie˛ do środowiska, uzyskuja˛c energie˛ potrzebna˛ do wzrostu i namnażania najbardziej efektywnym sposobem. Przykładami wzgle˛dnie beztlenowych bakterii sa˛ E. coli i S. aureus. Oprócz wyżej wymienionych istnieja˛ bakterie mikroaerofilne, które najlepiej rosna˛ w atmosferze z obniżonym ste˛żeniem tlenu. Przykładem bakterii mikroaerofilnej jest Campylobacter jejuni. 113 ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI Diagnostyka zakażeń bakteriami beztlenowymi Za blisko 80% diagnozowanych zakażeń beztlenowych odpowiedzialne sa˛ cztery najwie˛ksze grupy beztlenowców. Należa˛ do nich: Bacteroides, Prevotella i Porphyromonas spp., Peptostreptococcus spp. oraz Clostridium spp. Najcze˛ściej spotykane gatunki z każdego rodzaju to: Bacteroides fragilis, Peptostreptococcus magnus i Clostridium perfringens. Specyficzne metody izolacji i identyfikacji tych trzech rodzajów i gatunków powinny służyć jako model izolacji i wste˛pnej identyfikacji innych klinicznie ważnych bakterii beztlenowych. Pobieranie próbek i transport do laboratorium Procedury pobierania materiału zostały opisane we wcześniejszych rozdziałach. Ponieważ beztlenowce sa˛ bardzo wrażliwe na tlen atmosferyczny i wysychanie, przy pobieraniu próbek należy unikać stosowania zwykłych wymazówek. Próbki do hodowli beztlenowców należy uważnie pobierać z miejsca aktywnej infekcji. W niektórych przypadkach może być konieczna pomoc chirurga. Dotyczy to szczególnie aspiracji ropy, pobierania tkanek i/lub próbek ropy z zakażonych ran, ropniaków lub dra˛ża˛cych ropni. Próbke˛ należy umieścić w sterylnym, szczelnie zamknie˛tym pojemniku lub, jeśli to niemożliwe, niezwłocznie przesłać do laboratorium cały zaaspirowany materiał w strzykawce, z igła˛ osłonie˛ta˛ zatyczka˛ lub gumowym korkiem. Przygotowanie warunków beztlenowych do inkubacji hodowli Istnieja˛różne metody wytwarzania środowiska beztlenowego. Jedna˛z nich, prosta˛ i niedroga˛, jest użycie anaerostatu z cienkiego szkła lub poliwe˛glanu o obje˛tości 2,5 – 3,5 litrów, wyposażonego w nieprzepuszczaja˛ca˛ powietrza pokrywe˛, która˛ można łatwo usuna˛ć czy wymienić. Po włożeniu płytek Petriego w anaerostacie należy umieścić komercyjnie doste˛pne, jednorazowe saszetki wytwarzaja˛ce beztlenowa˛ atmosfere˛ i zamkna˛ć pokrywe˛. Jednorazowe saszetki wytwarzaja˛ce warunki beztlenowe maja˛ forme˛ płaskich, zapiecze˛towanych kopert, które po dodaniu wody (lub bez — przyp. tłum.) uwalniaja˛ wodór i dwutlenek we˛gla. Opisane zestawy wymagaja˛ katalizatora palladowego przytwierdzonego do spodu pokrywy słoja. Podczas używania katalizator ulega inaktywacji i wymaga wymiany w regularnych, zalecanych przez producenta odste˛pach czasu. Jednorazowe paski wskaźnikowe redox, które w warunkach beztlenowych zmieniaja˛ kolor z niebieskiego (lub czerwonego) na bezbarwny, sa˛ szeroko doste˛pne komercyjnie. Probówki z płynnym podłożem do hodowli bakterii beztlenowych, takim jak podłoże tioglikolanowe lub bulion z wycia˛giem mie˛snym, nie musza˛ być inkubowane w beztlenowych warunkach, ponieważ wchodza˛ce w ich skład substancje wytwarzaja˛ środowisko beztlenowe. Jeśli obje˛tość podłoża jest wystarczaja˛ca (10 – 12 ml w probówce o standardowej średnicy 15 mm) i jest ono świeżo przygotowane, warunki beztlenowe uzyskuje sie˛ w dolnej cze˛ści probówki. Nie zużyte w dniu przygotowania podłoża powinny być zregenerowane przez 114 CZE˛ŚĆ I 15-minutowe ogrzewanie w łaźni wodnej probówek z poluzowana˛ zakre˛tka˛, w celu wyeliminowania rozpuszczonego tlenu; po ogrzaniu należy dokre˛cić nakre˛tke˛ i pozostawić do wystygnie˛cia. Podłoża do hodowli bakterii beztlenowych Hodowle w kierunku bakterii beztlenowych powinny być prowadzone na zlecenie lekarza, jeśli próbka ma cuchna˛cy zapach lub jeśli wyniki barwienia metoda˛ Grama sugeruja˛ obecność beztlenowych mikroorganizmów, np.: obecność mieszanej, polimorficznej flory Gram-dodatnich oraz Gram-ujemnych pałeczek i ziarenkowców, obecność Gram-ujemnych wrzecionowców lub kwadratowo zakończonych cienkich Gram-dodatnich laseczek, które moga˛ wskazywać na Clostridium. Badań w kierunku bakterii beztlenowych rutynowo nie należy wykonywać w przypadku próbek moczu, wydzielin z narza˛dów płciowych, kału lub odkrztuszonej plwociny. Obecność bakterii beztlenowych w tych próbkach wskazuje na zanieczyszczenie komensalna˛ flora˛ fizjologiczna˛, właściwa˛ dla miejsca pochodzenia próbki. Klinicyści powinni zostać poinformowani, że próbki zawieraja˛ce flore˛ fizjologiczna˛ nie nadaja˛ sie˛ do hodowli beztlenowych, z wyja˛tkiem ważnych wskazań klinicznych. Zwykły agar z krwia˛ jest dobrym podłożem stałym do izolacji najważniejszych patogenów beztlenowych. Dla bardziej wymagaja˛cych gatunków zalecany jest agar z krwia˛wzbogacony w czynniki wzrostu (hemina i menadion). Takie podłoża sa˛ komercyjnie doste˛pne jako agar beztlenowy Wilkins-Chalgrena. Bakterie beztlenowe cze˛sto sa˛ cze˛ścia˛ złożonej mikroflory zawieraja˛cej także drobnoustroje tlenowe, sta˛d należy przygotować selektywny agar do hodowli beztlenowców, dodaja˛c jeden lub wie˛cej specyficznych czynników hamuja˛cych wzrost bakterii tlenowych. Na przykład dodanie aminoglikozydu (neomycyna, kanamycyna) w końcowym ste˛żeniu 50 µg/ml hamuje wzrost wie˛kszości tlenowych i wzgle˛dnie beztlenowych bakterii. Roztwór aminoglikozydu przygotowywany jest przez rozpuszczenie 500 mg w 100 ml wody destylowanej. Na 100 ml podłoża agarowego do hodowli beztlenowców, po ostudzeniu do 56°C, należy dodać aseptycznie 5 ml odwłóknionej krwi i 1 ml roztworu antybiotyku. Dobrze wymieszać i rozlać po 15 – 18 ml do sterylnych płytek Petriego. Płytki powinny zostać jak najszybciej zużyte lub przechowywane w chłodziarce, najlepiej w plastikowym woreczku lub re˛kawie. Procedury posiewu i izolacji Przy podejrzeniu zakażenia bakteriami beztlenowymi próbki należy niezwłocznie posiać na jedno z poniższych podłoży: – agar do hodowli beztlenowców do inkubacji w anaerostacie; – agar do hodowli beztlenowców do inkubacji w eksykatorze; – agar MacConkeya; – podłoże płynne do hodowli beztlenowców (z tioglikolanem lub wycia˛giem mie˛snym). Hodowle w kierunku bakterii tlenowych należy zakładać zgodnie z obowia˛zuja˛ca˛ procedura˛, a równoległe posiewy tlenowe materiału przegla˛dać po 24 i 48 godzi- 115 ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI nach inkubacji. Na niewielka˛ powierzchnie˛ płytki z podłożem dla bakterii beztlenowych nałożyć badany materiał i rozsiać go za pomoca˛ ezy. Płytki należy umieścić w anaerostacie i odczytać po 48 godzinach inkubacji. Jeśli wzrost nie jest wystarczaja˛cy, konieczna jest dalsza inkubacja przez 24 – 48 godzin. Hodowle na podłożach płynnych należy zakładać posiewaja˛c duża˛ obje˛tość materiału za pomoca˛ pipety Pasteura, tak by rozprowadzić inoculum w całym podłożu. Po 48 godzinach należy skontrolować wzrost na agarze z krwia˛ do hodowli beztlenowców i porównać ze wzrostem obserwowanym na podłożach do hodowli tlenowych. Z każdego typu kolonii należy wykonać preparat barwiony metoda˛ Grama. Obserwowane w preparacie bakterie o tej samej morfologii, które rosna˛ zarówno na agarze tlenowym, jak i beztlenowym, to prawdopodobnie wzgle˛dne beztlenowce. Kolonie, które pojawiaja˛ sie˛ na agarze tylko w warunkach beztlenowych, to przypuszczalnie beztlenowce, które należy przesiać na dwa podłoża agarowe z krwia˛, jedno do inkubacji w anaerostacie, drugie w eksykatorze. Jeżeli wzrost pojawi sie˛ tylko na podłożu inkubowanym w anaerostacie, prowadzić identyfikacje˛ czystej kolonii w kierunku bakterii beztlenowych. Jeśli obserwuje sie˛ wzrost w głe˛bokich warstwach podłoża płynnego do hodowli beztlenowców, konieczny jest posiew na podłoża agarowe dla bakterii tlenowych i beztlenowych, z którymi należy poste˛pować podobnie, jak w przypadku pierwszego posiewu. Jeżeli do podłoża płynnego wsiano duża˛ obje˛tość ropy, wynik hodowli może być dodatni, przy jednoczesnym ujemnym wyniku posiewu na podłożach stałych. Identyfikacja klinicznie ważnych beztlenowców Grupa Bacteroides fragilis Grupa obejmuje kilka spokrewnionych gatunków należa˛cych do fizjologicznej flory jelit i pochwy. Cze˛sto sa˛ one odpowiedzialne za mieszane zakażenia w obre˛bie jamy brzusznej i miednicy, moga˛ również wywoływać bakteriemie˛. B. fragilis jest nieruchliwa˛ Gram-ujemna˛ pałeczka˛, cze˛sto wykazuja˛ca˛ polimorfizm, która rośnie szybko na agarze do hodowli beztlenowców. Po 48 godzinach pojawiaja˛sie˛ średniej wielkości (do 3 mm średnicy), półprzezroczyste, szarobiałe, niehemolizuja˛ce kolonie. Szybkiej identyfikacji można dokonać na podstawie testu z żółcia˛. Czysta kolonia badanego drobnoustroju posiewana jest głe˛boko do dwóch probówek z płynnym podłożem tioglikolanowym, z których jedna zawiera 20% (2 ml w 10 ml) sterylnej żółci wołowej. Po 24 godzinach należy porównać wzrost w obu probówkach: wzrost B. fragilis jest wyraźnie stymulowany w bulionie z dodatkiem żółci. Clostridium perfringens Rodzaj Clostridium obejmuje wiele gatunków Gram-dodatnich, wytwarzaja˛cych spory laseczek; niektóre z nich należa˛ do normalnej flory przewodu pokarmowego, inne wyste˛puja˛ w kurzu i glebie. Gatunkiem o najwie˛kszym znaczeniu klinicznym jest C. perfringens. Bakteria ta zwia˛zana jest ze zgorzela˛ gazowa˛, może również wywoływać bakteriemie˛ lub inne poważne infekcje. W przeciwieństwie do pozostałych gatunków C. perfringens nie wykazuje zdolności ruchu i nie wytwarza spor w zakażonych tkankach lub młodych hodowlach. 116 CZE˛ŚĆ I C. perfringens rośnie szybko na płynnym podłożu do hodowli beztlenowców, wytwarzaja˛c duże ilości gazu. Na agarze beztlenowym po 48 godzinach obserwowane sa˛ średniej wielkości (2 – 3 mm) kolonie. Wie˛kszość szczepów wytwarza podwójna˛ strefe˛ hemolizy: wewne˛trzna˛ strefe˛ całkowitej hemolizy i zewne˛trzna˛ strefe˛ hemolizy cze˛ściowej. Szybka identyfikacja jest możliwa na podstawie wyniku odwrotnego testu CAMP1, który przeprowadza sie˛ w poniżej opisany sposób (patrz ryc. 11)2: 1. Przygotować płytke˛ z podłożem agarowym z dodatkiem 5% przepłukanej trisem krwi baraniej. 2. Nałożyć czysta˛ hodowle˛ Streptococcus agalactiae wzdłuż średnicy płytki. Posiać badana˛hodowle˛ Clostridium prostopadle do linii posiewu S. agalactiae, nie dotykaja˛c jej. 3. Inkubować w anaerostacie przez 24 godziny. C. perfringens tworzy w miejscu skrzyżowania posiewów strefe˛ widocznej hemolizy, kształtem przypominaja˛ca˛ strzałe˛. Laseczki ujemne w odwrotnym teście CAMP moga˛ zostać opisane jako ,,Clostridium spp. nie-C. perfringens’’. Ryc. 11. Odwrotny test CAMP. Peptostreptococcus Niektóre gatunki bezwzgle˛dnie beztlenowych Gram-dodatnich ziarenkowców należa˛ do komensalnej flory układu oddechowego, pokarmowego i moczowo-płciowego. Wywołuja˛, zwykle wraz z innymi tlenowymi i beztlenowymi bakteriami, ropnie, zakażenia ran, a nawet bakteriemie˛. Wzrost beztlenowych 1 Odwrotny test CAMP: nazwa pochodzi od nazwisk Christy, Adkins i Munch-Peterson, którzy pierwsi opisali te˛ reakcje˛ u paciorkowców grupy B. 2 Hansen M.V., Elliot L.P.: New presumptive identification test for Clostridium perfringens: reverse CAMP test. Journal of Clinical Microbiology, 1980, 12: 617 – 619. 117 ZAKAŻENIA BAKTERIAMI BEZTLENOWYMI ziarenkowców na podłożach laboratoryjnych zwykle jest wolniejszy niż wzrost Bacteroides i Clostridium, a kolonie na agarze z krwia˛pojawiaja˛ sie˛ nie wcześniej niż po 48 godzinach inkubacji. W rutynowej diagnostyce zakażeń beztlenowcami identyfikacja gatunków nie jest konieczna. Gram-dodatnie ziarenkowce, które nie rosna˛ w warunkach tlenowych, a na agarze z krwia˛ dla bakterii beztlenowych wytwarzaja˛ niewielkie, wypukłe, białe kolonie, moga˛ być z dużym prawdopodobieństwem uznane za Peptostreptococcus spp. Badanie wrażliwości na antybiotyki Antybiogram dla bakterii beztlenowych nie powinien być wykonywany rutynowo, ze wzgle˛du na brak wiarygodności metody dyfuzyjno-kra˛żkowej. Wie˛kszość zakażeń wywołana jest przez wrażliwe na penicyline˛ bakterie, z wyja˛tkiem infekcji wywodza˛cych sie˛ z przewodu pokarmowego lub pochwy. W zakażeniach takich zazwyczaj obecne sa˛ Bacteroides fragilis, które wytwarzaja˛c β-laktamazy sa˛ oporne na penicyliny i wie˛kszość cefalosporyn. Lekiem z wyboru w tych infekcjach jest klindamycyna, metronidazol lub chloramfenikol. Aminoglikozydy i chinolony nie wykazuja˛aktywności wobec beztlenowców, lecz moga˛ być stosowane z powodu aktywności wobec bakterii tlenowych, które cze˛sto wyste˛puja˛ w zakażeniach mieszanych. 118 Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki Wprowadzenie W Genewie podczas spotkania zorganizowanego w 1977 r. przez WHO1 wyrażono niepokój dotycza˛cy obserwowanego na świecie narastania oporności na antybiotyki, zwia˛zanej z cze˛sto nieograniczonym wzrostem stosowania antybiotyków zarówno u ludzi, jak i zwierza˛t. W ostatnich latach lekooporne bakterie były przyczyna˛ kilku poważnych epidemii zakażeń o dużej śmiertelności. Doprowadziło to do potrzeby wprowadzenia krajowych i mie˛dzynarodowych programów kontroli monitoruja˛cych antybiotykooporność bakterii na podstawie oceny lekowrażliwości z zastosowaniem wiarygodnych metod, które pozwoliłyby uzyskać porównywalne dane. Doste˛pność mikrobiologicznych i epidemiologicznych danych ułatwi klinicyście wybór możliwie najlepszego preparatu przeciwbakteryjnego w leczeniu zakażeń. Aby założenia te były skuteczne, należy odpowiednia˛, powtarzalna˛ metoda˛ przeprowadzić oznaczenia lekowrażliwości, której wyniki powinny mieć bezpośrednie zastosowanie kliniczne. Najwyższym kryterium wiarygodności każdej metody oznaczania wrażliwości jest korelacja wyniku z odpowiedzia˛ pacjenta na leczenie przeciwbakteryjne. Na spotkaniu WHO ustalono, że ze wzgle˛du na prostote˛ i powtarzalność, zarówno dla celów klinicznych, jak i w monitorowaniu, zalecana jest zmodyfikowana metoda dyfuzyjno-kra˛żkowa Kirby-Bauera2, dla której wymagania zostały ustalone przez WHO w 1976 r. Metoda jest szczególnie zalecana dla bakterii należa˛cych do rodziny Enterobacteriaceae, lecz może być stosowana również w przypadku wszystkich szybko rosna˛cych patogenów. Metoda ta została także przystosowana dla najważniejszych klinicznie bakterii o wyższych wymaganiach odżywczych, z wyja˛tkiem ścisłych beztlenowców i mykobakterii. Jest rekomendowana, ponieważ poszczególne elementy testu sa˛ możliwe do wykonania przez pracowników laboratorium3. Podstawowe zasady oznaczania lekowrażliwości Testy wrażliwości na antybiotyki określaja˛ zdolność czynnika przeciwbakteryjnego do zahamowania wzrostu bakterii in vitro. Zdolność te˛ można oznaczyć zarówno metoda˛ rozcieńczeń, jak i metoda˛ dyfuzyjna˛. 1 Surveillance for the prevention and control of health hazards due to antibiotic-resistant enterobacteria. Geneva, World Health Organization, 1978 (WHO Technical Report Series, No. 624). 2 WHO Expert Committee on Biological Standardization. Twenty-eighth report. Geneva, World Health Organization, 1977 (WHO Technical Report Series, No. 610). 3 Metoda˛ porównywalna˛ do metody Kirby-Bauera, oparta˛ na tych samych zasadach i wymaganiach kontroli jakości, jest metoda NEO-SENSITABS, produced ROSCO Diagnostica, Taastrup, Dania. W metodzie zamiast bibułowych kra˛żków stosowane sa˛ 9-milimetrowe oznaczone kolorem tabletki przeciwbakteryjne. Forma tabletek gwarantuje wyja˛tkowa˛ stabilność antybiotyku z okresem przechowywania do czterech lat, nawet w temperaturze pokojowej. Zwie˛kszona stabilność jest bardzo ważna dla laboratoriów w krajach tropikalnych. 119 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Test rozcieńczeń Rozcieńczenia antybiotyku do ilościowej oceny aktywności przeciwbakteryjnej można przygotować w bulionie lub podłożu agarowym, które naste˛pnie inkubuje sie˛ z badanym mikroorganizmem. Najniższe ste˛żenie preparatu, które po całonocnej inkubacji hamuje wzrost szczepu, określa sie˛ jako minimalne ste˛żenie hamuja˛ce (MIC — minimum inhibitory concentration). Wartość MIC porównuje sie˛ naste˛pnie ze znanym ste˛żeniem leku, jakie osia˛gane jest w surowicy i innych płynach ustrojowych, aby ocenić przypuszczalna˛ odpowiedź kliniczna˛. Test dyfuzji Bibułowe kra˛żki nasa˛czone określona˛ ilościa˛ antybiotyku umieszcza sie˛ na podłożu agarowym z równomiernie posianym badanym drobnoustrojem. Gradient ste˛żenia antybiotyku tworzy sie˛ przez dyfuzje˛ z kra˛żka, a powstała strefa zahamowania wokół kra˛żka koreluje, wśród innych czynników, z wrażliwościa˛ szczepu. Istnieje prawie liniowa zależność pomie˛dzy log MIC, mierzonym w teście rozcieńczeń, i średnica˛ strefy zahamowania w teście dyfuzyjnym. Linie˛ regresji wyrażaja˛ca˛ te˛ zależność można uzyskać badaja˛c duża˛ liczbe˛ szczepów równocześnie dwoma metodami (patrz ryc. 12 i 13). Kliniczna definicja terminów ,,oporny’’ i ,,wrażliwy’’ Wynik badania wrażliwości w formie przedstawianej lekarzowi kwalifikuje mikroorganizm do jednej z dwóch lub wie˛cej kategorii wrażliwości. Najprostszy system składa sie˛ jedynie z dwóch kategorii: wrażliwy i oporny. Klasyfikacja, 35 30 • • • • • • • • • • • 25 20 • 15 • • • • • 10 • • 6 0,03 0,06 0,12 0,25 0,5 1 2 4 8 16 32 •• 64 MIC (µg/ml) WHO 90961 Ryc. 12. Graficzna prezentacja korelacji mie˛dzy wartościa˛ log2MIC i strefa˛ zahamowania wzrostu uzyskiwana˛ w metodzie dyfuzyjnej z użyciem kra˛żków zawieraja˛cych jedno, określone ste˛żenie antybiotyku. 120 CZE˛ŚĆ I mimo że ze wzgle˛dów statystycznych i epidemiologicznych posiada wiele zalet, jest zbyt sztywna dla klinicysty. Dlatego cze˛sto przyjmuje sie˛ klasyfikacje˛ trzech kategorii. Metoda Kirby-Bauera i jej modyfikacja uwzgle˛dniaja˛ trzy kategorie wrażliwości i ważne jest, aby zarówno lekarz, jak i pracownik laboratorium rozumieli ich dokładne definicje i znaczenie kliniczne. 35 S Średnica strefy (mm) Średnice graniczne I 25 20 ● 1 14 R — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — ● 1 27 15 — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — — 10 6 0,03 0,06 0,12 0,25 0,5 S ▲ 1 2 I 4 — — — — — — — S – susceptible/wrażliwy I – intermediate/średnio wrażliwy R – resistant/oporny 30 8 ▲ 16 R 32 64 MIC (µg/ml) WHO 90962 Ryc. 13. Interpretacja wielkości stref (wrażliwy, średnio wrażliwy, oporny) w odniesieniu do wartości MIC. • Wrażliwy. Mikroorganizm określany jest jako ,,wrażliwy’’ na antybiotyk, jeśli odpowiedź kliniczna na leczenie danym antybiotykiem, stosowanym w zalecanych dawkach, jest prawdopodobna. • Średnio wrażliwy dotyczy dwóch sytuacji. Określa szczepy o ,,umiarkowanej wrażliwości’’ na antybiotyk, który może być zastosowany w leczeniu w wie˛kszej dawce (np. β-laktam) z powodu niskiej toksyczności lub koncentracji w ognisku zakażenia (np. mocz). Klasyfikacja odnosi sie˛ również do szczepów wykazuja˛cych ,,średnia˛ wrażliwość’’ na bardziej toksyczne antybiotyki (np. aminoglikozydy), które nie moga˛być zastosowane w wyższych dawkach. W tej sytuacji pośrednia kategoria stanowi strefe˛ buforowa˛ mie˛dzy wrażliwościa˛ i opornościa˛. Podobnie jak wie˛kszość klinicystów nie jest świadoma, mimo klinicznego znaczenia, subtelnej różnicy mie˛dzy średnia˛ i umiarkowana˛ wrażliwościa˛, wiele laboratoriów w obydwu sytuacjach używa określenia ,,średnia’’. • Oporny. Ten termin wskazuje, że niezależnie od zastosowanej dawki i lokalizacji infekcji, oczekiwany jest brak odpowiedzi klinicznej na dany antybiotyk. W pewnych sytuacjach, na przykład w badaniu odpowiedzi gronkowców na benzylopenicyline˛, istnieja˛tylko kategorie ,,wrażliwy’’ i ,,oporny’’ (odpowiadaja˛ce zdolności do wytwarzania β-laktamaz). Najlepsza decyzja o użyciu określonego antybiotyku i stosowanego dawkowania zależy nie tylko od wyników antybiogramu, ale również od jego interpretacji przez lekarza. Należy wzia˛ć pod uwage˛ także inne czynniki, takie jak właściwości chorobotwórcze mikroorganizmu, działania uboczne i farmakokinetyczne właściwości leku, jego przenikanie do różnych obszarów ciała oraz status immunologiczny pacjenta. 121 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Wskazania do rutynowego oznaczania lekowrażliwości Antybiogram w laboratorium klinicznym może zostać wykonany w dwóch celach: • aby ukierunkować lekarza w wyborze najlepszego leku przeciwbakteryjnego indywidualnie dla pacjenta; • aby gromadzić informacje epidemiologiczne o oporności mikroorganizmów o istotnym znaczeniu dla zdrowia publicznego. Antybiogram jako wskazówka do leczenia Antybiogramy nigdy nie powinny być wykonywane dla zanieczyszczaja˛cych próbke˛ lub komensalnych mikroorganizmów, należa˛cych do flory fizjologicznej, oraz innych, nie maja˛cych zwia˛zku z procesem zakażenia. Na przykład obecność Escherichia coli w moczu w liczbie mniejszej od znacza˛cej nie jest uważana za przyczyne˛ infekcji i wykonanie antybiogramu byłoby bezcelowe lub wre˛cz myla˛ce. Antybiogramy powinny być wykonywane tylko z czystych hodowli mikroorganizmów prawdopodobnie wywołuja˛cych zakażenie. Rutynowe badanie wrażliwości nie jest wskazane w naste˛puja˛cych sytuacjach: • Jeśli drobnoustrój należy do gatunku z przewidywalna˛ wrażliwościa˛ na określony lek. Tak jest w przypadku Streptococcus pyogenes i Neisseria meningitidis, które nadal wykazuja˛ wrażliwość na benzylopenicyline˛. (Jakkolwiek ostatnio przedstawiono w raportach sporadyczne pojawianie sie˛ benzylopenicylinoopornych meningokoków.) Podobnie jest w przypadku paciorkowców kałowych (enterokoków), które poza kilkoma wyja˛tkami (Enterococcus faecium — przyp. tłum.) sa˛wrażliwe na ampicyline˛. Jeśli na podstawie cech klinicznych podejrzewa sie˛ oporność tych mikroorganizmów, szczepy należy przesłać do referencyjnego laboratorium. • Jeśli drobnoustrój wymaga wzbogaconego podłoża, np. Haemophilus influenzae i Neisseria gonorrhoeae. Przy braku ścisłego przestrzegania właściwej techniki wykonania antybiogramu test dyfuzyjno-kra˛żkowy może dawać niewiarygodne rezultaty. Pojawienie sie˛ wytwarzaja˛cych β-laktamazy wariantów wyżej wymienionych szczepów spowodowało konieczność wprowadzenia specjalnych testów, takich jak wykrywaja˛cy β-laktamazy in vitro test opisany na stronie 92. Za monitorowanie wrażliwości pneumokoków, gonokoków i Haemophilus odpowiadaja˛ regionalne i centralne laboratoria. W razie wysta˛pienia problemu oporności szczepów należy ostrzec lokalne laboratoria i dostarczyć instrukcje dotycza˛ce właściwych w tej sytuacji metod badania lekowrażliwości i alternatywnych schematów leczenia. • Niepowikłane zakażenia wywołane przez Salmonella (inne niż S. typhi lub S. paratyphi). Leczenie przeciwbakteryjne takich infekcji nie jest uzasadnione, nawet z zastosowaniem antybiotyków wykazuja˛cych aktywność in vitro. Istnieje wiele dowodów przemawiaja˛cych za brakiem klinicznych korzyści leczenia niepowikłanego zapalenia żoła˛dkowo-jelitowego wywołanego przez pałeczki Salmonella (a w praktyce wie˛kszości chorób biegunkowych o niejasnej etiologii). Paradoksalnie, stosowanie antybiotyków może wydłużyć wydalanie i rozprzestrzenianie sie˛ tych bakterii, a także prowadzić do selekcji szczepów opornych. 122 CZE˛ŚĆ I Antybiogram jako narze˛dzie badań epidemiologicznych Rutynowe określanie wrażliwości wie˛kszości patogenów (S. typhi, pałeczki Shigella) jest istotnym elementem programu kontroli zakażeń układu pokarmowego. Badania te dostarczaja˛ lekarzowi informacji o pojawieniu sie˛ opornych szczepów (S. typhi oporna na chloramfenikol, pałeczki Shigella oporne na kotrimoksazol i ampicyline˛) oraz o ewentualnej potrzebie modyfikacji schematu standardowego leczenia. Mimo że antybiogramy dla niedurowych serotypów pałeczek Salmonella, odpowiedzialnych za zakażenia jelitowe, nie maja˛ znaczenia w leczeniu pacjenta, pojawienie sie˛ wielolekoopornych szczepów jest ostrzeżeniem dla lekarzy przed nadmiernym lub niewłaściwym stosowaniem leków przeciwbakteryjnych. Stała kontrola i analiza antybiogramów jest doskonałym źródłem informacji o wyste˛powaniu opornych gronkowców i Gram-ujemnych pałeczek, które moga˛ być odpowiedzialne za krzyżowe zakażenia szpitalne. Okresowe raportowanie wzorów oporności izolowanych szczepów stanowi nieoceniona˛ pomoc w prowadzeniu właściwej polityki antybiotykowej w szpitalu, opartej na ograniczeniu i/lub rotacji ratuja˛cych życie leków, takich jak aminoglikozydy i cefalosporyny. Wybór leków do oznaczania lekowrażliwości w laboratoriach klinicznych Wybór leków używanych w rutynowym antybiogramie dokonywany jest na podstawie spektrum przeciwbakteryjnego leku, jego właściwości farmakokinetycznych, toksyczności, skuteczności i doste˛pności, a także kosztów zarówno dla pacjenta, jak i dla społeczeństwa. Spośród wielu preparatów przeciwbakteryjnych stosowanych w leczeniu jedynie niewielka cze˛ść starannie dobranych leków powinna być wykorzystywana w oznaczaniu wrażliwości. W tabeli 23 wymienione zostały antybiotyki stosowane w różnych sytuacjach klinicznych. Leki podzielono na dwie grupy. Grupa pierwsza to leki doste˛pne w wie˛kszości szpitali, które powinny być uwzgle˛dnione w antybiogramie dla Tabela 23. Podstawowe zestawy antybiotyków do rutynowego oznaczania wrażliwościa Enterobacteriaceae a b Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus Układ pokarmowy Grupa 1 Leki pierwszego rzutu Benzylopenicylina Oksacylina Erytromycyna Tetracyklina Chloramfenikol Ampicylina Chloramfenikol Kotrimoksazol Kwas nalidyksowy Tetracyklina Sulfonamid Trimetoprim Kotrimoksazol Ampicylina Nitrofurantoina Kwas nalidyksowy Tetracyklina Ampicylina Piperacylina Chloramfenikol Gentamycyna Kotrimoksazol Tobramycyna Tetracyklina Cefalotyna Gentamycyna Amoksycylina/ /kwas klawulanowy b Grupa 2 Leki uzupełniaja˛ce Gentamycyna Amikacyna Kotrimoksazol Klindamycyna Nitrofurantoina Norfloksacyna Norfloksacyna Chloramfenikol Gentamycyna Amoksycylina/ /kwas klawulanowy b Cefuroksym Ceftriakson Ciprofloksacyna Piperacylina Amikacyna Mocz Informacje o poszczególnych antybiotykach sa˛ umieszczone w tekście. Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibitor β-laktamaz). 123 Krew i tkanki Amikacyna Ciprofloksacyna Ceftazydym OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI każdego izolowanego szczepu1. Testy dla leków z drugiej grupy powinny być wykonywane jedynie na specjalne zlecenie lekarza, gdy izolowany patogen jest oporny na leki pierwszego rzutu lub gdy inne powody (alergia na lek lub jego niedoste˛pność) uzasadniaja˛ takie badanie. Wiele antybiotyków o dobrej aktywności klinicznej zostało pominie˛tych w tabeli, lecz należy podkreślić, że ich zastosowanie jest rzadko konieczne w leczeniu zakażonych pacjentów. Wyja˛tkowo, jeśli istnieja˛ szczególne wskazania znane lekarzowi lub jeśli doste˛pne sa˛ nowe i lepsze leki, do leczenia można wła˛czyć jeden lub wie˛cej leków dodatkowych. Wskazana jest aktualizacja informacji zawartych w tabeli we współpracy z personelem klinicznym. W antybiogramach wykorzystuje sie˛ niekiedy tylko jeden lek reprezentuja˛cy cała˛ grupe˛, co może być przyczyna˛ nieporozumień w sytuacji, gdy klinicyści nie sa˛ tego świadomi. Wynik antybiogramu dla reprezentatywnego antybiotyku można odnieść do wszystkich lub do wie˛kszości przedstawicieli danej grupy. W niektórych krajach poważne utrudnienia wynikaja˛ z faktu, że lekarze znaja˛ tylko handlowe nazwy leków, bez nazw mie˛dzynarodowych. Należy położyć nacisk na informowanie personelu medycznego o nazwach niehandlowych antybiotyków i zache˛cać do ich stosowania2. 1. Kra˛żek z benzylopenicylina˛ stosowany jest do określania wrażliwości na wszystkie β-laktamazowrażliwe penicyliny (takie jak doustna fenoksymetylopenicylina i fenetycylina). W zakażeniach wywołanych przez gronkowce wytwarzaja˛ce β-laktamazy powinno sie˛ stosować β-laktamazooporne penicyliny lub inny antybiotyk, np. erytromycyne˛. 2. Kra˛żek z oksacylina˛ jest reprezentatywny dla całej grupy β-laktamazoopornych penicylin (wliczaja˛c metycyline˛, nafcyline˛, kloksacyline˛, dikloksacyline˛ i flukloksacyline˛). Istnieja˛ dowody kliniczne na krzyżowa˛ oporność mie˛dzy metycylina˛ i grupa˛ cefalosporyn. Dlatego niepotrzebne i myla˛ce jest wła˛czenie cefalotyny do antybiogramu dla gronkowców. Oporność na metycyline˛ i pozostałe leki tej grupy ma cze˛sto heterogenny charakter, np. wie˛kszość komórek może być w pełni wrażliwa i tworzyć szeroka˛ strefe˛ zahamowania, podczas gdy cze˛ść populacji rośnie w strefie zahamowania w postaci drobnych kolonii. Ten typ oporności jest lepiej wykrywany w temperaturze 35°C3 lub przy przedłużonym czasie inkubacji. Poważna˛ wada˛ metycyliny, jako antybiotyku reprezentatywnego dla całej grupy, jest jej duża niestabilność, nawet w prawidłowych warunkach przechowywania. W standardowej metodzie dyfuzyjnej preferuje sie˛ stosowanie kra˛żka z oksacylina˛, która jest bardziej trwała. Kra˛żki z kloksacylina˛i dikloksacylina˛ nie sa˛ stosowane, ponieważ moga˛ nie wykrywać heteroopornych szczepów. 3. Wynik badania wrażliwości na tetracykline˛ można odnieść do chlorotetracykliny, oksytetracykliny oraz innych przedstawicieli tej grupy. Jednak wie˛kszość opornych na tetracykline˛ gronkowców zachowuje wrażliwość na minocykline˛. Kra˛żki z minocyklina˛ moga˛ wie˛c być przydatne w oznaczaniu wrażliwości wieloopornych szczepów gronkowców. 4. Wynik badania wrażliwości na chloramfenikol można odnieść do tiamfenikolu, pochodnego leku o porównywalnym spektrum przeciwbakteryjnym, ale bez znanego ryzyka niedokrwistości aplastycznej. 1 W Polsce dobór kra˛żków do wykonania antybiogramu powinien być oparty na rekomendacjach opracowanych przez Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów (przyp. tłum.). 2 International Nonproprietary Names (INN) for Pharmaceutical Substances. Cumulative list No. 9. Geneva, World Health Organization, 1996. 3 Sahm D.F. et al.: Current concepts and approaches to antimicrobial agent susceptibility testing. In: Cumitech 25, Washington, DC, American Society for Microbiology, 1988. 124 CZE˛ŚĆ I 5. W antybiogramie stosowany jest tylko jeden przedstawiciel sulfonamidów (sulfafurazol). 6. Kra˛żek z kotrimoksazolem zawiera kombinacje˛ trimetoprimu i sulfonamidu (sulfametoksazol). Dwa składniki tego synergistycznego poła˛czenia maja˛ podobne właściwości farmakokinetyczne i generalnie działaja˛ jak jeden lek. 7. Ampicylina jest przedstawicielem grupy penicylin o szerokim spektrum działania, wykazuja˛cych aktywność wobec wielu Gram-ujemnych bakterii. Ponieważ jest wrażliwa na β-laktamazy, nie powinna być stosowana w określaniu lekowrażliwości gronkowców. Ogólnie, wynik wrażliwości na ampicyline˛ odnosi sie˛ również do innych przedstawicieli grupy: amoksycyliny, piwampicyliny, talampicyliny itp. (choć amoksycylina jest dwukrotnie bardziej aktywna wobec pałeczek Salmonella i o połowe˛ mniej aktywna wobec pałeczek Shigella i H. influenzea). 8. Rutynowo należy określać wrażliwość jedynie na cefalotyne˛, ponieważ wynik jest reprezentatywny dla innych cefalosporyn pierwszej generacji (cefaleksyna, cefradyna, cefalorydyna, cefazolina, cefapiryna). Ze wzgle˛du na doste˛pność cefalosporyn drugiej i trzeciej generacji oraz ich pochodnych (cefamycyny) o rozszerzonym spektrum, w wybranych przypadkach może być uzasadnione użycie kra˛żków z antybiotykami tej grupy (cefoksytyna, cefamandol, cefuroksym, cefotaksym, ceftriakson). Wrażliwość na cefalosporyny stosowane w cie˛żkich zakażeniach gronkowcowych można określić na podstawie wyników badania wrażliwości na oksacyline˛, o czym wspomniano już powyżej w punkcie 2. 9. Erytromycyna jest wykorzystywana do oceny wrażliwości także na inne makrolidy (oleandomycyna, spiramycyna). 10. Aminoglikozydy tworza˛ grupe˛ chemicznie podobnych leków obejmuja˛cych streptomycyne˛, gentamycyne˛, kanamycyne˛, netylmycyne˛ i tobramycyne˛. Ich spektra przeciwbakteryjne nie zawsze sa˛ na tyle podobne, aby można było założyć istnienie krzyżowej oporności, ale wobec wrażliwych patogenów leki te wykazuja˛ identyczna˛ skuteczność. W licznych badaniach porównywano nefrotoksyczność i ototoksyczność gentamycyny, netylmycyny i tobramycyny, ale nie uzyskano ostatecznych dowodów, świadcza˛cych o mniejszej toksyczności którejkolwiek z nich. Zaleca sie˛, aby każde laboratorium wybrało jeden lek do podstawowego antybiogramu. Pozostałe antybiotyki należy zachować w rezerwie do leczenia pacjentów z zakażeniami wywołanymi przez oporne drobnoustroje. 11. Stosowanie nitrofurantoiny ograniczone jest do leczenia zakażeń układu moczowego i wrażliwość na ten lek nie powinna być oznaczana dla szczepów pochodza˛cych z innych materiałów niż mocz. Tabela 24 zawiera wartości graniczne średnic stref zahamowania wzrostu dla szczepów kontrolnych. Zmodyfikowana metoda Kirby-Bauera Metoda dyfuzyjno-kra˛żkowa, po raz pierwszy opisana w 1966 r.1, jest dobrze wystandaryzowana˛ i wysoko ceniona˛ metoda˛. Oficjalne instytucje zaleciły ja˛, z niewielkimi modyfikacjami, jako referencyjna˛ metode˛, która może być rutynowo stosowana w laboratoriach klinicznych. 1 Bauer A.W. et al.: Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disc method. American Journal of Clinical Pathology, 1966; 45: 493 – 496. 125 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Tabela 24. Strefy zahamowania wzrostu dla szczepów kontrolnycha Antybiotyk Amikacyna Amoksycylina/kwas klawulanowyb Ampicylina Benzylopenicylina Cefalotyna Cefalozyna Ceftazydym Cefotaksym Ceftriakson Cefuroksym Chloramfenikol Ciprofloksacyna Klindamycyna Kotrimoksazol Erytromycyna Gentamycyna Kwas nalidyksowy Nitrofurantoina Norfloksacyna Oksacylina Piperacylina Sulfonamidc Tetracyklina Tobramycyna Trimetoprim Wankomycyna a b c Zawartość w kra˛żku Średnica strefy zahamowania (mm) S. aureus (ATCC 25923) E. coli (ATCC 25922) P. aeruginosa (ATCC 27853) 30 µg 20/10 µg 20 – 26 28 – 36 19 – 26 19 – 25 18 –26 — 10 µg 10 µg 30 µg 30 µg 30 µg 30 µg 30 µg 30 µg 30 µg 5 µg 2 µg 25 µg 15 µg 10 µg 30 µg 300 µg 10 µg 1 µg 100 µg 300 µg 30 µg 10 µg 5 µg 30 µg 27 – 35 26 – 37 29 – 37 29 – 35 16 – 20 25 – 31 22 – 28 27 – 35 19 – 26 22 – 30 24 – 30 24 – 32 22 – 30 19 – 27 — 18 – 22 17 – 28 18 – 24 — 24 – 34 24 – 30 19 – 29 19 – 26 17 – 21 16 – 22 — 15 – 21 23 – 29 25 – 32 29 – 35 29 – 35 20 – 26 21 – 27 30 – 40 — 24 – 32 — 19 – 26 22 – 28 20 – 25 28 – 35 — 24 – 30 15 – 23 18 – 25 18 – 26 21 – 28 — — — — — 22 –29 18 –22 17 –23 — — 25 –33 — — — 16 –21 — — 22 –29 — 25 –33 — — 19 –25 — — National Committee for Clinical Laboratory Standards. Performance standards for antimicrobial disc susceptibility tests. 6th ed. Vol. 21 No 1 (M2-A7 i M7-A5) i 11th informational supplement 2001 (M100-S11). Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibitor β-laktamaz). Sulfizoksazol. Odczynniki Agar Mueller-Hintona 1. Przygotować agar Mueller-Hintona z postaci sproszkowanej, zgodnie z zaleceniem producenta. Podłoża powinny być przygotowane w sposób, który umożliwi uzyskanie odpowiednich stref zahamowania dla szczepów kontrolnych (patrz tabela 24). Ważne jest, aby nie przegrzać podłoża. 2. Schłodzić podłoże do 45 – 50°C i rozlać na płytki. Wypełnić do poziomu około 4 mm. Płytka o średnicy 9 cm zawiera około 25 ml podłoża. 3. Gdy agar ste˛żeje, płytki do natychmiastowego użycia suszyć przez 10 – 30 minut w 35°C, umieszczaja˛c je w cieplarce do góry dnem, z uchylonymi wieczkami. 4. Nie wykorzystane płytki można przechowywać w chłodziarce, w szczelnie zamknie˛tych plastikowych woreczkach. Płytki moga˛ być przechowywane w ten sposób przez 2 tygodnie. W celu uzyskania wiarygodnych stref zahamowania wzrostu, do badania lekowrażliwości na sulfonamidy i kotrimoksazol należy użyć agaru Mueller-Hintona, zawieraja˛cego niskie ste˛żenia inhibitorów tymidyny i tyminy. Z tego wzgle˛du każda nowa partia agaru Mueller-Hintona musi zostać przetestowana z użyciem 126 CZE˛ŚĆ I szczepu kontrolnego Enterococcus faecalis (ATCC 29212 lub 33186) oraz kra˛żka z kotrimoksazolem. O odpowiedniej jakości podłoży świadczy wyraźna, 20-milimetrowa lub wie˛ksza, strefa zahamowania, co ważne — bez mglistego wzrostu i drobnych kolonii. Kra˛żki z antybiotykami Można używać wszystkich doste˛pnych komercyjnie kra˛żków o właściwej średnicy i ste˛żeniu leku. Zapasy kra˛żków należy przechowywać w –20°C; odpowiednia jest także zamrażarka chłodziarki. Mały podre˛czny zestaw kra˛żków można przechowywać w chłodziarce do miesia˛ca. Po wyje˛ciu z chłodziarki pojemniki należy pozostawić w temperaturze pokojowej na około 1 godziny (do wyrównania temperatur). Taka procedura zmniejsza skraplanie pary, pojawiaja˛cej sie˛ w wyniku kontaktu ciepłego powietrza z powierzchnia˛ zimnego pojemnika. Jeśli używa sie˛ dyspensera kra˛żków, należy przechowywać go w chłodziarce ze szczelnie domknie˛ta˛ pokrywa˛. Przed otwarciem dyspenser również powinien zostać ogrzany do temperatury pokojowej. Wzorzec zme˛tnienia Przygotować wzorzec zme˛tnienia (ge˛stości zawiesiny — przyp. tłum.) wlewaja˛c 0,6 ml 1% (10 g/l) roztworu dwuwodzianu chlorku baru do 100-mililitrowego kalibrowanego cylindra i wypełnić do 100 ml 1% (10 ml/l) kwasem siarkowym. Roztwór wzorcowego zme˛tnienia należy umieścić w identycznej probówce, jak probówki z bulionem. Wzorzec może być przechowywany w ciemności, w temperaturze pokojowej przez 6 miesie˛cy, pod warunkiem, że jest zamknie˛ty w sposób uniemożliwiaja˛cy parowanie. Wymazówki Przygotowuje sie˛ zapas bawełnianych wymazówek na drewnianych patyczkach. Wymazówki sterylizuje sie˛ w autoklawie lub w sterylizatorach na suche gora˛ce powietrze, umieszczaja˛c je w puszkach, probówkach lub opakowane w papier. Procedura Aby przygotować inoculum z hodowli na podłożu stałym, należy zebrać eza˛ 3 – 5 kolonii badanego mikroorganizmu o tym samym wygla˛dzie. 127 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Przenieść do probówki z fizjologicznym roztworem soli. Jeśli inoculum przygotowywane jest z czystej hodowli, należy w ten sam sposób w roztworze fizjologicznym soli zawiesić eza˛ materiał pobrany ze zlewnego wzrostu. Porównać probówke˛ ze wzorcem zme˛tnienia i dostosować ge˛stość badanej zawiesiny do wzorca, dodaja˛c wie˛cej bakterii lub wie˛cej fizjologicznego roztworu soli. Właściwa ge˛stość inoculum jest konieczna do uzyskania zlewnej lub prawie zlewnej murawy wzrostu. Badany szczep posiać na płytki, zanurzaja˛c sterylna˛ wymazówke˛ w inoculum. Usuna˛ć nadmiar zawiesiny, obracaja˛c i przyciskaja˛c wymazówke˛ mocno do ścianki probówki powyżej poziomu płynu. 128 CZE˛ŚĆ I Zawiesine˛ trzykrotnie rozprowadzić dokładnie na całej powierzchni podłoża, przekre˛caja˛c płytke˛ za każdym razem o 60°. Na koniec przesuna˛ć wymazówke˛ wzdłuż brzegów powierzchni agaru. Pozostawić na kilka minut do wyschnie˛cia w temperaturze pokojowej, z zamknie˛tym wieczkiem. Kra˛żki z antybiotykami można umieścić na posianej płytce za pomoca˛ sterylnej pe˛sety. Zastosowanie szablonu (ryc. 15) ułatwia równomierne rozmieszczenie kra˛żków. Do umieszczenia kra˛żków z antybiotykami na posianej płytce można również użyć sterylnej igły z zatyczka˛. 129 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Alternatywnie, do nałożenia na posiana˛ płytke˛ kra˛żków z antybiotykami można użyć dyspensera. Maksymalnie na płytce o średnicy 9 – 10 cm można umieścić siedem kra˛żków. Sześć kra˛żków można rozmieścić równomiernie w jednakowej odległości, około 15 mm od brzegu płytki, a jeden kra˛żek nałożyć w centrum płytki. Każdy kra˛żek należy delikatnie przycisna˛ć, zapewniaja˛c równomierny kontakt z podłożem. Płytki powinny być w cia˛gu 30 minut umieszczone w cieplarce w 35°C. Temperatura powyżej 35°C zaburza wyniki wrażliwości na oksacyline˛/metycyline˛. Nie inkubować w atmosferze dwutlenku we˛gla. Po całonocnej inkubacji należy zmierzyć średnice˛ każdej strefy (wliczaja˛c średnice˛ kra˛żka) i zanotować odczyt (w mm). Interpretować wyniki zgodnie z wartościami przedstawionymi w tabeli 25. Pomiar stref może być wykonany za pomoca˛linijki przyłożonej do dna płytki, bez jej otwierania. 130 CZE˛ŚĆ I Jeśli płytka nie jest przezroczysta, pomiaru można dokonać za pomoca˛suwmiarki. Wyniki badania lekowrażliwości można odczytać posługuja˛c sie˛ szablonem (ryc. 14). 131 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Tabela 25. Interpretacja stref zahamowania wzrostu w zmodyfikowanej metodzie Kirby-Baueraa dla bakterii szybko rosna˛cych Średnica strefy zahamowania (mm) Antybiotyk Zawartość w kra˛żku Oporny Średnio wrażliwy Wrażliwy 30 µg < 14 15 – 16 > 17 20/10 µg < 13 14 – 17 > 18 10 µg 10 µg < 13 < 16 14 – 16 — > 17 > 17 10 IU 10 IU < 28 < 14 — — > 29 > 15 Cefalotyna 30 µg < 14 15 – 17 > 18 Cefalozyna 30 µg < 14 15 – 17 > 18 Cefotaksym 30 µg < 14 15 – 22 > 23 Ceftazydym 30 µg < 14 15 – 17 > 18 Ceftriakson 30 µg < 13 14 – 20 > 21 Cefuroksym sodium, cefamandol 30 µg < 14 15 – 17 > 18 Chloramfenikol 30 µg < 12 13 – 17 > 18 Ciprofloksacyna 5 µg < 15 16 – 20 > 21 Klindamycyna 2 µg < 14 15 – 20 1 21 Amikacyna Amoksycylina/kwas klawulanowyb Ampicylina dla: – Enterobacteriaceae – enterokoki Benzylopenicylina dla: – gronkowce – enterokoki Kotrimoksazol 25 µg < 10 11 – 15 1 16 Erytromycyna 15 µg < 13 14 – 22 > 23 Gentamycyna 10 µg < 12 13 – 14 > 15 Kwas nalidyksowyc 30 µg < 13 14 – 18 1 19 Nitrofurantoinac 300 µg < 14 15 – 16 > 17 Norfloksacynac 10 µg < 12 13 – 16 > 17 1 µg < 10 10 – 12 > 13 100 µg 100 µg < 17 < 17 — 18 – 20 > 18 > 21 Oksacylina Piperacylina dla: – P. aeruginosa – inne pałeczki Gram-ujemne 300 µg < 12 13 – 16 > 17 Tetracyklina 30 µg < 14 15 – 18 > 19 Tobramycyna 10 µg < 12 13 – 14 > 15 Trimetoprimc 5 µg < 10 11 – 15 1 16 30 µg 30 µg — < 14 — 15 – 16 > 15 > 17 Sulfonamidc, d Wankomycyna dla: – gronkowce – enterokoki a National Committee for Clinical Laboratory Standards. Performance standards for antimicrobial disc susceptibility tests. 6th ed., Vol. 21, No 1 (M2-A7 i M7-A5) Wayne, PA, NCCLS i 11th informational supplement 2001 (M100-S11). b Amoksycylina z kwasem klawulanowym (inhibitor β-laktamaz). c Używane tylko do badania patogenów wyizolowanych z dróg moczowych i niektórych szczepów jelitowych. d Sulfizoksazol. 132 CZE˛ŚĆ I Kra˛żek z antybiotykiem Strefa wewne˛trzna: szczep oporny ▲ ▲ ▲ ▼ Strefa czarna: średnia wrażliwość Strefa zewne˛trzna: szczep wrażliwy WHO 91127 Ryc. 14. Szablon do określania wrażliwości. Granice˛ strefy zahamowania ustala sie˛ gołym okiem w miejscu, gdzie rozpoczyna sie˛ widoczny wzrost; istnieja˛ jednak trzy wyja˛tki: • W przypadku sulfonamidów i kotrimoksazolu w strefie zahamowania pojawia sie˛ słaby wzrost; nie należy go brać pod uwage˛. • W przypadku określania wrażliwości β-laktamazododatnich gronkowców na benzylopenicyliny brzegi strefy zahamowania sa˛ wyraźnie widoczne i uniesione; łatwo uznać je za dodatni wynik testu, podczas gdy niezależnie od rozmiaru strefy zahamowania szczep należy opisać jako oporny. • Pewne gatunki Proteus moga˛ wokół niektórych kra˛żków z antybiotykami wytwarzać, w wyraźnie ograniczonej strefie zahamowania, cienka˛ warstwe˛ wzrostu mgławicowego, którego nie należy brać pod uwage˛. Interpretacja wielkości stref zahamowania Stosowanie wzornika. Dla każdego antybiotyku należy przygotować oddzielny wzornik (patrz ryc. 14). Wynik można odczytać z jednoczesna˛ interpretacja˛ — wrażliwy, oporny lub średnio wrażliwy: ,,wrażliwy’’, jeśli granica strefy wykracza poza czarny pierścień; ,,oporny’’, jeśli nie obserwuje sie˛ strefy lub gdy jej granica mieści sie˛ w polu białego pierścienia; ,,średnio wrażliwy’’, jeśli granica strefy zahamowania leży w obre˛bie czarnego pierścienia. Stosowanie linijki. Wyniki pomiarów stref zahamowania w mm należy interpretować zgodnie z granicznymi średnicami przedstawionymi w tabeli 25. Bezpośrednie a pośrednie oznaczanie lekowrażliwości W opisanej powyżej metodzie inoculum przygotowywane jest z pierwotnej płytki hodowlanej lub z czystych hodowli. Jest to tak zwany pośredni test lekowrażliwości. W przypadkach, gdy niezbe˛dny jest szybki wynik, zamiast standardowego inoculum można wykorzystać badany materiał, np. mocz, dodatnie posiewy z krwi lub wymazy ropy. W przypadku moczu należy najpierw zbadać pod mikroskopem osad, oceniaja˛c obecność dowodów infekcji, np. obecność granulocytów i/lub drobnoustrojów. Naste˛pnie można wykorzystać mocz jako inoculum w metodzie standardowej. Jeśli barwienie Grama inkubowanych hodowli z krwi, wykazuja˛cych wzrost bakterii, lub wymazów z ropy potwierdzi obecność dużej liczby mikroorganizmów jednego typu, materiały te moga˛ zostać użyte jako bezpośrednie inoculum. Jest to tzw. bezpośredni test lekowrażliwości; zaleta˛ testu bezpośredniego jest szybsze o 24 godziny uzyskanie wyniku. Główna˛ wade˛ stanowi brak właściwego przygotowania inoculum. Jeśli na płytkach pojawi sie˛ zbyt słaby lub zbyt intensywny wzrost lub gdy obecne sa˛ mieszane hodowle, należy bardzo uważnie interpretować wyniki i powtórzyć test używaja˛c czystych hodowli. 133 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Czynniki techniczne wpływaja˛ce na wielkość strefy zahamowania w metodzie dyfuzyjno-kra˛żkowej Ge˛stość inoculum W przypadku zbyt małej ge˛stości inoculum uzyskana strefa zahamowania, niezależnie od wrażliwości mikroorganizmu, be˛dzie wie˛ksza. Z tego powodu oporne szczepy moga˛ zostać opisane jako wrażliwe. W odwrotnej sytuacji, zbyt dużej ge˛stości inoculum, wielkość uzyskanej strefy be˛dzie mniejsza i szczepy wrażliwe moga˛zostać opisane jako oporne. Zwykle najlepsze wyniki uzyskuje sie˛ przygotowuja˛c inoculum warunkuja˛ce prawie zlewny wzrost. Czas nałożenia kra˛żków Na posianych płytkach, pozostawionych w temperaturze pokojowej dłużej niż podano w procedurze, przed nałożeniem kra˛żków dochodzi do namnażania szczepów. W rezultacie średnica strefy zahamowania jest mniejsza i szczepy wrażliwe moga˛ zostać opisane jako oporne. Temperatura inkubacji W celu otrzymania optymalnego wzrostu podłoża z antybiogramem należy inkubować w 35°C. Jeśli temperatura jest niższa, wydłuża sie˛ czas inkubacji, a uzyskane strefy sa˛ wie˛ksze. W przypadku badania wrażliwości heterogennie opornych szczepów Staphylococcus aureus na metycyline˛ (oksacyline˛) cze˛ść oporna˛ populacji wykrywa sie˛ w 35°C. W wyższych temperaturach cała hodowla wykazuje wrażliwość. W temperaturze 35°C i niższej w strefie zahamowania rosna˛ oporne kolonie. Opisane kolonie sa˛ lepiej widoczne, jeśli przed odczytem płytke˛ pozostawi sie˛ na kilka godzin w temperaturze pokojowej. Należy zawsze zidentyfikować ten typ kolonii, wykluczaja˛c zanieczyszczenie. Czas inkubacji Wie˛kszość metod uwzgle˛dnia 16 – 18-godzinny okres inkubacji. Jakkolwiek w wyja˛tkowych sytuacjach wste˛pny wynik może zostać przygotowany po 6 godzinach. Nie jest to metoda zalecana i w każdym przypadku wyniki należy potwierdzić po odpowiednim czasie inkubacji. Rozmiar płytek, grubość warstwy podłoża agarowego i rozmieszczenie kra˛żków z antybiotykami Testy wrażliwości przeprowadza sie˛ zwykle na płytkach o średnicy 9 – 10 cm, umieszczaja˛c nie wie˛cej niż 6 – 7 kra˛żków na każdej z nich. W przypadku badania wrażliwości na wie˛ksza˛ liczbe˛ antybiotyków zaleca sie˛ użycie dwóch płytek lub 134 CZE˛ŚĆ I jednej o średnicy 14 cm. Na bardzo cienkich podłożach może wytwarzać sie˛ wie˛ksza strefa zahamowania; odwrotnie dzieje sie˛ w przypadku zbyt grubych podłoży. Właściwe rozmieszczenie kra˛żków zapobiega nakładaniu sie˛ stref zahamowania lub powstawaniu zniekształceń przy brzegach płytki (patrz ryc. 15). WHO 86961 Ryc. 15. Szablon do równomiernego nakładania kra˛żków na płytke˛ średnicy 90 mm. Ste˛żenie antybiotyków w kra˛żkach Średnica strefy zahamowania zależy od zawartości antybiotyku w kra˛żku. Zmniejszeniu aktywności leku w źle przechowywanym kra˛żku towarzyszy odpowiednie zmniejszenie wielkości strefy zahamowania. Skład podłoża Podłoże wpływa na wielkość strefy, decyduja˛c o stopniu wzrostu, współczynniku dyfuzji i aktywności leku. Ważne jest stosowanie podłoży odpowiednich dla danej metody. Możliwość uzyskania różnych warunków badania lekowrażliwości, wpływaja˛cych na średnice˛ strefy, jasno przemawia za potrzeba˛ standaryzacji metody dyfuzyjno-kra˛żkowej. Jedynie przestrzeganie ustalonych parametrów metody umożliwia uzyskanie wartościowych wyników. Nieprawidłowości zaburzaja˛ce przebieg badania moga˛ prowadzić do przedstawienia lekarzowi raża˛co błe˛dnych wyników. Precyzja i dokładność metody powinny być monitorowane za pomoca˛ustalonego, opisanego poniżej programu kontroli jakości. W ten sposób możliwa jest szybka identyfikacja i korekta błe˛dów. 135 OZNACZANIE WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI Kontrola jakości Potrzeba kontroli jakości testu lekowrażliwości Na końcowy wynik testu dyfuzyjno-kra˛żkowego wpływa duża liczba zmiennych. Niektóre z nich, takie jak ge˛stość inoculum i temperatura inkubacji, łatwo kontrolować, jednak laboratorium rzadko znany jest dokładny skład podłoża komercyjnego lub różnice w jakości kolejnych serii. Laboratorium nie może również odpowiadać za zawartość antybiotyków w kra˛żkach. Wyniki testów musza˛ być cia˛gle monitorowane w programie kontroli jakości, który należy traktować jako element procedury. Precyzja i dokładność metody powinny być kontrolowane przez równoległe wykonywanie testów dla szczepu kontrolnego o znanej lekowrażliwości. Szczepy kontrolne i badane drobnoustroje podlegaja˛ tej samej procedurze. Uzyskane dla mikroorganizmów kontrolnych wielkości stref powinny odpowiadać wartościom przedstawionym w tabeli 24. Powtarzaja˛ce sie˛ uzyskiwanie wyników, które nie mieszcza˛ sie˛ w określonym zakresie, jest przypuszczalnie efektem błe˛du technicznego lub użycia niewłaściwych odczynników. Należy sprawdzić każdy odczynnik i etap testu, odnaleźć i wyeliminować bła˛d. Standardowa procedura kontroli jakości Program kontroli jakości polega na równoległym prowadzeniu oznaczania wrażliwości dla szczepów kontrolnych i badanych. Kontrole należy przeprowadzać co tydzień lub dla co pia˛tej serii badań i — dodatkowo — przy każdej nowej partii agaru Mueller-Hintona lub kra˛żków. Standardowe szczepy do kontroli jakości Staphylococcus aureus (ATCC 25923) Escherichia coli (ATCC 25922) Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853) Powyższe szczepy można uzyskać z państwowych kolekcji szczepów. Sa˛ także doste˛pne komercyjnie w formie liofilizowanej uzyskanej z czystych hodowli. Hodowle szczepów wzorcowych do codziennego użytku powinny być prowadzone na skosach lub agarze odżywczym (zalecany jest agar tryptozowo-sojowy) i przechowywane w chłodziarce. Co 2 tygodnie należy przesiewać hodowle na świeże skosy. Przygotowanie inoculum Hodowle można zakładać na każdym podłożu płynnym i inkubować do chwili zme˛tnienia bulionu. Z każdego podłoża płynnego należy przesiać szczep na płytke˛ agarowa˛ i inkubować przez noc. Naste˛pnie pobrać pojedyncze kolonie i przeprowadzić badanie wrażliwości w sposób opisany na stronach 127 – 130. 136 ▲ średnica 25 24 23 22 21 20 19 X 18 X X X X 17 X 16 X 15 14 X 13 12 11 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 Data Akceptowalna CZE˛ŚĆ I ▼ WHO 91093 Ryc. 16. Karta kontroli jakości antybiogramów. Nakładanie kra˛żków z antybiotykami Po posianiu inoculum na płytki, w sposób opisany na str. 129, nałożyć odpowiednie kra˛żki na płytke˛. Wybrane kra˛żki dla każdego szczepu kontrolnego zostały wymienione w tabeli 24. Odczytywanie wyników Po 16 – 18 godzinach inkubacji należy zmierzyć linijka˛ średnice stref zahamowania i zapisać, ła˛cznie z data˛ badania, na specjalnej karcie kontroli jakości. Zapis powinien być prowadzony dla każdej kombinacji szczep-kra˛żek. Karta zawiera diagram wielkości stref w milimetrach, z zaznaczonym zakresem wartości prawidłowych. Przykład takiej karty przedstawiono na ryc. 16. Jeśli wyniki systematycznie wykraczaja˛ poza dopuszczalne granice, należy podja˛ć działania, które poprawia˛ jakość badania. Istotne odchylenia wyników, których nie można wyjaśnić technicznymi błe˛dami w procedurze, moga˛ wskazywać na zanieczyszczenie, nagła˛ zmiane˛ wrażliwości lub zmiane˛ właściwości szczepu kontrolnego. Należy wówczas uzyskać z wiarygodnego źródła świeży szczep wzorcowy. 137 Badania serologiczne Wprowadzenie Odczyny serologicznie, w przeciwieństwie do posiewów i badań mikrobiologicznych, wykrywaja˛c w próbkach klinicznych antygeny bakteryjne lub przeciwciała powstałe w odpowiedzi na nie, dostarczaja˛ jedynie pośrednich dowodów zakażenia. Testy te, ze wzgle˛du na wysoka˛swoistość i czułość, sa˛obecnie szeroko stosowane w mikrobiologii. W odpowiedzi na pierwotne zakażenie patogennym drobnoustrojem wie˛kszość pacjentów wytwarza zarówno przeciwciała IgM, jak i IgG. Po kilku tygodniach dominuja˛ca˛ klasa˛ przeciwciał staja˛ sie˛ IgG i w konsekwencji tylko IgG pozostaja˛ w surowicy pacjenta. Kolejna infekcja wywołana przez ten sam patogen wywołuje odpowiedź z wytworzeniem przeciwciał IgG. Ponieważ komórki wytwarzaja˛ce przeciwciała zachowuja˛ pamie˛ć immunologiczna˛, odpowiedź taka, w porównaniu z odpowiedzia˛pierwotna˛, jest zwykle szybsza i bardziej nasilona; jest to tak zwana odpowiedź wtórna. Poziom przeciwciał najcze˛ściej oznaczany jest przez ,,miareczkowanie’’. Diagnostyczne miano jest najwie˛kszym rozcieńczeniem surowicy pacjenta, przy którym wykrywalne sa˛ jeszcze przeciwciała. Na przykład, jeśli przeciwciała wykrywane sa˛ w rozcieńczeniu 1:1024 i nie wyższym, miano surowicy wynosi 1024. Surowica pobrana w ostrym okresie infekcji, przy podejrzeniu pierwotnego zakażenia, nosi nazwe˛ surowicy fazy ostrej; surowica pobrana w czasie rekonwalescencji, zwykle 2 tygodnie później, nosi nazwe˛ surowicy ozdrowieńca. Reakcja na antygen pojawia sie˛ niezależnie od okresu zakażenia, choć jej typ może być różny. Obecność przeciwciał IgG w pojedynczej próbce surowicy może wskazywać na ekspozycje˛ w przeszłości, nie pozwala wie˛c na rozpoznanie świeżej infekcji. Niekiedy antygen stymuluje również powstawanie przeciwciał reaguja˛cych krzyżowo z innymi antygenami. Ze wzgle˛du na brak swoistości takich przeciwciał, badanie jednej próbki surowicy może prowadzić do niewłaściwej interpretacji wyników. W wie˛kszości testów serologicznych należy wykonać, najlepiej jednocześnie, badanie surowicy pobranej w ostrym okresie choroby i surowicy ozdrowieńca; zapobiega to ewentualnym różnicom wynikaja˛cym z warunków przeprowadzania badania. Wzrost miana przeciwciał o dwa dwukrotne rozcieńczenia (np. z rozcieńczenia 1:8 do 1:32) świadczy zwykle o świeżym zakażeniu. Jest to tak zwany czterokrotny wzrost miana. Badanie pojedynczej próbki surowicy może być przydatne tylko w niektórych przypadkach, np. w diagnostyce zakażenia Mycoplasma pneumoniae, gdy wysokie miana lub obecność przeciwciał IgM wskazuja˛ na świeża˛ infekcje˛. Typ reakcji antygen-przeciwciało zależy od rodzaju antygenu. Metody kontroli jakości Wiarygodność i spójność wyników badań serologicznych całkowicie zależa˛ od metod kontroli jakości, przeprowadzanej przed, podczas i po każdym teście. Środki kontroli jakości sa˛ niezmiernie istotne ze wzgle˛du na fałszywie dodatnie i fałszywie ujemne wyniki, które moga˛ istotnie wpływać na decyzje lekarza, dotycza˛ce leczenia pacjenta. Na jakość badań serologicznych wpływa wiele 138 CZE˛ŚĆ I czynników, do których zaliczane sa˛: doświadczenie personelu laboratoryjnego, jakość zestawów i wyposażenie, jakość próbek, kontrole stosowane w testach oraz interpretacja i wydawanie wyników. Po wykonaniu testu, należy wyrzucić zużyte materiały do pojemnika wypełnionego środkiem dezynfekuja˛cym, umyć i zdezynfekować re˛ce oraz powierzchnie˛ blatu. Wyposażenie Do wyposażenia laboratorium serologicznego należa˛: łaźnie wodne, cieplarki, chłodziarki, zamrażarki, pH-metry, wagi, wirówki, mikroskopy i wytrza˛sarki. Monitoring i rutynowe przegla˛dy sprze˛tu sa˛ istotnym elementem programu zapewnienia jakości. Należy przestrzegać stałego serwisowania sprze˛tu z okresowymi przegla˛dami i ewentualna˛ kalibracja˛ lub naprawa˛. Dla każdego urza˛dzenia należy prowadzić zapis dat przegla˛du, serwisu i naprawy. Łaźnia wodna poza czasem jej wykorzystania powinna być pozostawiana pusta, co miesia˛c suszona i czyszczona. Temperature˛ łaźni wodnej należy starannie kontrolować, nie dopuszczaja˛c do zmian wie˛kszych niż ± 1°C; konieczny jest codzienny pomiar i zapis temperatury, również w trakcie działania. Wskazane jest stosowanie pokrywy, która zapobiega chłodzeniu powierzchni wody. Mieszanine˛ antygenu i przeciwciał można inkubować dopiero po uzyskaniu wymaganej temperatury i utrzymaniu jej co najmniej przez godzine˛. Poziom wody powinien odpowiadać poziomowi płynu w umieszczonych w łaźni probówkach lub kolbach. Mikroskopy maja˛ najwie˛ksze znaczenie przy wykonywaniu testu VDRL (Venereal Disease Research Laboratory, VDRL) oraz testu immunofluorescencji kre˛tków w modyfikacji absorpcyjnej (FTA-Abs) i musza˛ być utrzymywane w możliwie najlepszym stanie. Po użyciu okular, obiektyw i kondensator mikroskopu należy przetrzeć mie˛kka˛szmatka˛, usuwaja˛c resztki olejku i zanieczyszczenia. Nieużywany mikroskop przechowuje sie˛ pod przykryciem, zabezpieczony przed wilgocia˛. Intensywność lampy rte˛ciowej w mikroskopie fluorescencyjnym należy sprawdzać regularnie z użyciem światłomierza. Należy kontrolować działanie wytrza˛sarek do testów VDRL oraz szybkiego testu do wykrywania reagin w osoczu (RPR) i korygować wszelkie zmiany, które moga˛ mieć niekorzystny wpływ na reakcje˛ aglutynacji. Mechaniczna wytrza˛sarka powinna być regularnie oliwiona. Materiały Szklane naczynia i igły używane w testach serologicznych musza˛ spełniać określone parametry. Nie należy korzystać z uszczerbionych lub porysowanych naczyń, płytek i szkiełek. Użycie brudnych lub niewłaściwie oczyszczonych szklanych naczyń, które moga˛ zawierać organiczne zanieczyszczenia, jest główna˛ przyczyna˛ fałszywych wyników. Przy stanowisku przeznaczonym do mycia należy umieścić pisemne instrukcje. Główne etapy mycia powinny obejmować: wste˛pne płukanie, mycie właściwym detergentem laboratoryjnym, płukanie woda˛ z kranu, a naste˛pnie woda˛destylowana˛, suszenie; należy upewnić sie˛, że detergent został usunie˛ty. 139 BADANIA SEROLOGICZNE Wszystkie pipety należy zanurzyć w detergencie tak, aby roztwór wnikna˛ł do wewna˛trz. Płukać pod bieża˛ca˛ woda˛ co najmniej 30 minut, a naste˛pnie w wodzie destylowanej. Szklane płytki używane do odczynów VDRL musza˛ zostać starannie oczyszczone z pozostałości detergentu i resztek olejku. Należy unikać przedłużonego moczenia w detergencie ze wzgle˛du na możliwość uszkodzenia pierścieni ceramicznych na płytkach. Szklane płytki z pierścieniami z parafiny powinny być czyszczone z użyciem właściwych rozpuszczalników organicznych (np. benzyny). W odczynie RPR i VDRL do przygotowywania i rozcieńczania antygenu wykorzystuje sie˛ igły kalibrowane. W zestawie do odczynu RPR znajduje sie˛ igła, która˛ należy sprawdzić przed użyciem, określaja˛c liczbe˛ kropli/ml. Prawidłowo funkcjonuja˛ca 20-podziałkowa igła powinna dozować 90 kropli/ml. Nie należy stosować igieł działaja˛cych niewłaściwie. Po użyciu umyć woda˛ destylowana˛. Do testu VDRL przygotować dwie igły, odłamuja˛c czubki za pomoca˛ szczypiec. Sprawdzić igłe˛ określaja˛c liczbe˛ kropli/ml: 18-podziałkowa igła powinna dozować 60 kropli/ml, a 21 – 22-podziałkowa 100 kropli/ml. Każda˛ nieprawidłowo działaja˛ca˛ igłe˛ należy odrzucić lub wyregulować, dociskaja˛c lub zwalniaja˛c koniec. Po użyciu umyć w wodzie destylowanej, 70% etanolu i acetonie. Odczynniki Zwia˛zki chemiczne stosowane w serologii musza˛ mieć jakość odczynników i spełniać kryteria określonej procedury. Musza˛ być przechowywane zgodnie z zaleceniami producenta. Do przygotowania odczynników powinna być używana wysokiej jakości woda destylowana o pH 7,0. Należy przechowywać ja˛ w odpowiednio opisanym z data˛, ciepłoodpornym szklanym naczyniu lub plastikowej butli ze szczelnie domknie˛ta˛ zakre˛tka˛. Fizjologiczny roztwór soli jest używany sam lub jako roztwór buforowany, na przykład buforem fosforanowym. W wilgotnym klimacie, w celu usunie˛cia wody, chlorek sodu należy suszyć gora˛cym powietrzem w 160 – 180°C przez 30 minut. Sól rozpuścić w wodzie destylowanej lub demineralizowanej i przechowywać w ciepłoodpornym, odpowiednio opisanym z data˛ szklanym naczyniu lub plastikowej butli, ze szczelnie zamknie˛ta˛ zakre˛tka˛. Przed użyciem buforu oznaczyć jego pH. Surowice zawieraja˛ce makroskopowo widoczne cza˛steczki należy odwirować w 3000 g przez 10 minut i do testów użyć supernatantu. Osocze z hemoliza˛ lub zanieczyszczone nie powinno być użyte. Inaktywowana˛ surowice˛ do testów należy przygotować, ogrzewaja˛c w 56°C przez 30 minut. Jeśli nie zostanie zużyta w cia˛gu 4 godzin od inaktywacji, należy ja˛ ponownie inaktywować, ogrzewaja˛c w 56°C przez 10 minut. Wszystkie surowice przed użyciem pozostawić w temperaturze pokojowej. W rozdziale zostana˛ szczegółowo omówione niektóre testy serologiczne najcze˛ściej wykonywane w laboratoriach medycznych. Należa˛ do nich testy do diagnostyki kiły, test Wrighta do diagnostyki brucelozy i test wykrywaja˛cy antystreptolizyne˛ O do diagnostyki późnych powikłań po zakażeniach paciorkowcowych. 140 CZE˛ŚĆ I Każdy opis procedury odnosi sie˛ do badań wykonywanych z użyciem komercyjnych zestawów do przeprowadzania testów. Gotowe zestawy sa˛wytwarzane przez wielu producentów, zawieraja˛ w opakowaniu szczegółowe instrukcje, które przed użyciem należy uważnie przeczytać. Reakcje serologiczne Odczyn kłaczkuja˛cy i precypitacji W odczynie kłaczkuja˛cym, w wyniku reakcji rozpuszczonego antygenu z przeciwciałami, powstaje precypitat, który można ogla˛dać zarówno pod mikroskopem, jak i gołym okiem. Po zmieszaniu odczynników prawie natychmiast pojawia sie˛ wste˛pne wia˛zanie antygenu przez przeciwciała. Dalsze formowanie wie˛kszych, widocznych kłaczków wymaga godziny lub dłuższego czasu i jest zależne od temperatury. Reakcja zachodzi szybciej w strefie ,,równoważnej’’, optymalnego stosunku antygen-przeciwciało. Probówka z najszybciej tworza˛cym sie˛ precypitatem jest dobrym wskaźnikiem równoważności. Najszerzej stosowanymi odczynami kłaczkuja˛cymi sa˛ testy VDRL i RPR. Obydwa wykorzystywane w diagnostyce kiły (wywołanej przez Treponema pallidum) i innych zakażeń kre˛tkowych. Odczyn kłaczkuja˛cy dostarcza jakościowego dowodu reakcji antygen-przeciwciało, ale nie wskazuje, czy obecna jest jedna, czy kilka reakcji antygen-przeciwciało. Jeśli jednak test przeprowadzany jest na półpłynnym żelu, ze wzgle˛du na różna˛ zdolność do dyfuzji i współczynniki migracji antygenów, można reakcje te rozróżnić. Odczyn aglutynacji W odczynie aglutynacji reagent, którym może być antygen lub przeciwciało, jest osadzony lub zaabsorbowany na mikrocza˛steczce. Nośnikami reagentów moga˛ być różne cza˛steczki, np. lateks, żelatyna, mikrogranulki, bakterie lub krwinki czerwone. Technika ta nosi również nazwe˛ biernej aglutynacji. Jeśli nośnikiem sa˛ erytrocyty, technike˛ określa sie˛ mianem hemaglutynacji biernej, jeżeli sa˛ to komórki gronkowca, technika nosi nazwe˛ koaglutynacji. Po dodaniu swoistej surowicy odpornościowej komórki lub inne cza˛stki tworza˛ sieć poła˛czeń i w rezultacie aglutynat z wyraźnym supernatantem. Używaja˛c surowicy o znanej swoistości można przeprowadzać identyfikacje˛ nieznanych mikroorganizmów lub ich antygenów. Test można wykonać na szkiełku i odczytać wynik makroskopowo lub pod mikroskopem w małym powie˛kszeniu. Odczyn aglutynacji wykorzystuje sie˛ także do oceny miana aglutynin przeciwbakteryjnych w surowicy pacjentów z nieznana˛ choroba˛. Wzrost miana podczas trwania choroby przemawia jednoznacznie za zwia˛zkiem przyczynowo-skutkowym. Aglutynacja szybciej zachodzi w wyższych temperaturach (35 – 56°C) i przy ruchu (np. wstrza˛sanie, mieszanie lub wirowanie), które ułatwiaja˛ kontakt mie˛dzy antygenem i przeciwciałem. Proces aglutynacji wymaga obecności soli. Potencjalnie poważny problem stanowi prozona: zahamowanie reakcji serologicznej wskutek nadmiaru antygenu lub przeciwciał. Prozona daje fałszywie ujemny wynik testu; tego błe˛du można jednak unikna˛ć badaja˛c seryjne rozcieńczenia surowicy. 141 BADANIA SEROLOGICZNE Powszechnie stosowany test aglutynacji wykorzystuje Staphylococcus aureus, zawieraja˛cy na swojej powierzchni białko A. Jest to białko wia˛ża˛ce fragment Fc przeciwciał IgG. Gronkowce opłaszczone przeciwciałami IgG w obecności swoistego antygenu daja˛ wyraźnie widoczna˛ aglutynacje˛. Odczyn stosowany jest głównie do identyfikacji drobnoustrojów hodowanych z próbek klinicznych lub do wykrywania antygenów bakteryjnych w płynach ustrojowych zakażonych pacjentów (płyn mózgowo-rdzeniowy w przypadku zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych). Odczyny aglutynacji wykorzystywane sa˛ do wykrywania wirusa Epsteina-Barr (mononukleoza zakaźna), rotawirusów, różyczki oraz antygenów bakteryjnych (m.in. Haemophilus i Streptococcus A i B). Odczyn immunofluorescencji W odczynach immunofluorescencji immunoreagent (antygen lub przeciwciało) znakowany jest barwnikiem fluorescencyjnym, na przykład fluoresceina˛ lub rodamina˛, a reakcja antygenu z przeciwciałem wykrywana jest w mikroskopie fluorescencyjnym. W odczynie immunofluorescencji bezpośredniej do wykrycia obecności specyficznego antygenu wykorzystuje sie˛ znaczone fluoresceina˛ przeciwciała. Odczyny sa˛ przydatne w szybkiej identyfikacji Chlamydia trachomatis, C. psittaci, Rickettsia spp., Streptococcus pyogenes, Bordetella pertussis, Corynebacterium diphtheriae, Legionella pneumophila i innych drobnoustrojów izolowanych z próbek klinicznych. W odczynie immunofluorescencji pośredniej (indirect fluorescent antibody — IFA) wykonuje sie˛ badania seryjnych rozcieńczeń surowicy pacjenta ze specyficznym antygenem, a dla uwidocznienia reakcji dodaje sie˛ znakowane fluoresceina˛ przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom IgG lub IgM. Na przykład, w serodiagnostyce kiły, szkiełko z adsorbowanym antygenem Treponema pallidum zanurza sie˛ w surowicy pacjenta i spłukuje. Naste˛pnie na szkiełku umieszcza sie˛ znakowane fluoresceina˛ przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom, spłukuje i preparat ogla˛da sie˛ w mikroskopie fluorescencyjnym. Jeśli surowica pacjenta zawiera specyficzne przeciwciała przeciw Treponema pallidum, widoczne sa˛ jasno fluoryzuja˛ce kre˛tki. Przy braku specyficznych przeciwciał przeciwkre˛tkowych w surowicy pacjenta kre˛tki nie świeca˛. Test IFA może być również wykorzystywany do identyfikacji innych bakterii, na przykład pra˛tków gruźlicy, a z powodu wie˛kszej liczby znakowanych fluoresceina˛ przeciwciał ła˛cza˛cych sie˛ z antygenem stanowi cze˛sto czulsza˛ metode˛ niż test immunofluorescencji bezpośredniej. Odczyny serologiczne w diagnostyce kiły Odczyny serologiczne wykonywane w diagnostyce kiły to testy kre˛tkowe i niekre˛tkowe. Do odczynów niekre˛tkowych należa˛: VDRL i RPR. Użyty w nich antygen przygotowywany jest z antygenów niekre˛tkowych, takich jak kardiolipina-lecytyna i wykrywa podobne do przeciwciał reaginy, które sa˛ obecne w surowicy wielu pacjentów z kiła˛, ale moga˛ także wyste˛pować w surowicy pacjentów z innymi ostrymi i przewlekłymi schorzeniami. Testy sa˛ praktyczne, niedrogie i powtarzalne, mimo że nie całkiem swoiste. Moga˛ potwierdzać rozpoznanie wczesno- lub późnoobjawowej kiły lub być podstawa˛ rozpoznania 142 CZE˛ŚĆ I kiły późnej. Sa˛ lepsze niż odczyny kre˛tkowe w monitorowaniu pacjentów po leczeniu. VDRL jest skutecznym narze˛dziem w badaniach epidemiologicznych kiły i innych chorób kre˛tkowych. Odczyny z antygenami Treponema pallidum wykrywaja˛ swoiste przeciwciała, powstaja˛ce w odpowiedzi na zakażenie kiła˛. Sa˛ wykorzystywane do potwierdzenia dodatnich wyników testów niekre˛tkowych. Odczyn immunofluorescencji kre˛tków w modyfikacji absorpcyjnej (FTA-Abs) i odczyn hemaglutynacji Treponema pallidum (TPHA) sa˛ wysoce swoiste i czułe, ale nie różnicuja˛ przebytych i aktywnych zakażeń kiły; nie można ich stosować w ocenie wyników leczenia. Odczyn VDRL W odczynie wykorzystuje sie˛ cza˛steczki cholesterolu opłaszczone kompleksem kardiolipina-lecytyna. Inaktywowana˛ surowice˛ lub płyn mózgowo-rdzeniowy wytrza˛sa sie˛ na wytrza˛sarce z zawiesina˛antygenu VDRL przez podany okres. Jeśli reaginy sa˛ obecne w badanym płynie, obserwuje sie˛ mikroflokulacje˛. Odczyn VDRL jest wysoko dodatni we wczesnej kile. Po skutecznym leczeniu miano stopniowa spada i zwykle w cia˛gu 1 – 2 lat odczyn staje sie˛ ujemny. W późnej fazie choroby przez wiele lat, nawet po skutecznym leczeniu, surowica może wykazywać dodatnie reakcje o niskim mianie (np. 1:8 lub mniejszym). Reaktywność może spontanicznie zanikać u 20 – 30% nieleczonych pacjentów w fazie latentnej choroby, a nawet cze˛ściej w późnej fazie kiły. Fałszywie dodatnie wyniki obserwuje sie˛ z powodu podobieństwa antygenu VDRL do tkanek gospodarza. Fałszywe wyniki moga˛ wyste˛pować u osób zdrowych, jakkolwiek cze˛sto zwia˛zane sa˛ z określonymi chorobami lub przebytym szczepieniem. Fałszywie dodatnie reakcje, najcze˛ściej o niskim mianie (1:8 lub mniej), obserwowane sa˛ u osób z wirusowymi i bakteryjnymi zakażeniami (atypowe zapalenie płuc, choroba papuzia, mononukleoza zakaźna i zapalenie wa˛troby), podczas cia˛ży lub po niedawnym szczepieniu. Utrzymuja˛ce sie˛ fałszywie dodatnie wyniki, zwykle o dużym mianie, zwia˛zane sa˛ z obecnościa˛ autoprzeciwciał (czynnik reumatoidalny), wyste˛puja˛ u pacjentów z tra˛dem, gruźlica˛, zaburzeniami odporności (np. toczeń rumieniowaty, kolagenozy, choroby reumatyczne, zespół Sjögrena, dysgammaglobulinemia), rzadziej u osób z malaria˛ lub uzależnionych od heroiny. Dodatni i słabo dodatni wynik odczynu VDRL nie powinien być traktowany jako ostateczny dowód kiły, podobnie jak pojedynczy ujemny wynik nie wyklucza rozpoznania. Dla każdej słabo dodatniej i dodatniej próbki, przy braku klinicznych objawów kiły, należy wykonać badania z użyciem odczynów kre˛tkowych FTA-Abs lub TPHA. Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do odczynu VDRL Buforowany fizjologiczny roztwór soli Zestaw kontrolnych surowic (ujemna, słabo dodatnia, dodatnia) Antygen VDRL 143 BADANIA SEROLOGICZNE Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do odczynu VDRL Alkohol absolutny i aceton Szkiełko do aglutynacji o wymiarach około 5 × 7,5 cm z zagłe˛bieniami o średnicy 16 mm i głe˛bokości 1,75 mm do badania płynu mózgowo-rdzeniowego Odpowiednia liczba fiolek Woda destylowana lub dejonizowana Szklane płytki z 12 parafinowymi lub ceramicznymi pierścieniami o średnicy około 14 mm do badania surowicy Komora wilgotna Igły podskórne bez skosu: 18-podziałkowe do badań surowicy i 21- lub 22-podziałkowe do badań płynu mózgowo-rdzeniowego Stoper Mikroskop świetlny o powie˛kszeniu × 10 okular i × 10 obiektyw Wytrza˛sarka o ruchu kolistym o średnicy 2 cm, szybkości 180 obr./min, w ustawieniu poziomym, z automatycznym pomiarem czasu pH-metr Pipety serologiczne: 5,0 ml, 1,0 ml i 0,2 ml Sterylne roztwory soli (0,85% i 10%) Strzykawka typu Luer, 1 lub 2 ml Butelka z zawiesina˛ antygenu VDRL, 30-ml, okra˛gła, zamykana szklanym korkiem, z wa˛skim wlotem, o średnicy około 35 mm, z płaskim dnem Łaźnia wodna (56°C) Przygotowanie antygenu VDRL i surowicy kontrolnej Antygen VDRL jest alkoholowym roztworem lipidów (kardiolipiny i lecytyny) i cholesterolu. Sa˛ to substancje nierozpuszczalne w wodzie. Przygotować świeża˛ zawiesine˛ w dniu użycia, ponieważ antygen VDRL jest niestabilny. Zawartość ampułki z antygenem rozlać do fiolek do przechowywania. Upewnić sie˛, że fiolki sa˛ szczelnie zamknie˛te i przechowywać w ciemności w 15 – 30°C. Wyjmować antygen według potrzeb. Po otwarciu butelke˛ z buforowanym roztworem soli przechowywać w chłodziarce. Nie używać, jeśli pojawi sie˛ zme˛tnienie. Do kontrolnej surowicy dolać 3 ml destylowanej lub dejonizowanej wody. Nadwyżke˛ przygotowanych na dany dzień rozpuszczonych surowic podzielić na odpowiednia˛ liczbe˛ porcji (dzienne zapotrzebowanie) i przechowywać w temperaturze –20°C do miesia˛ca. Nie zamrażać ponownie po rozmrożeniu. Surowice, przeznaczone do wykorzystania w cia˛gu dnia, przechowywać w chłodziarce w 2 – 8°C. Przygotowanie zawiesiny antygenu VDRL 1. Ogrzać antygen i buforowany roztwór soli do temperatury pokojowej. Sprawdzić pH buforowanego roztworu soli, wartość nie powinna przekraczać pH 6,0 ± 0,1. 2. Do butelki z zawiesina˛ antygenu dodać pipeta˛ 0,4 ml buforowanego roztworu soli i delikatnie przechylić naczynie, rozprowadzaja˛c warstwe˛ płynu na dnie. 144 CZE˛ŚĆ I 3. Za pomoca˛ 1-mililitrowej kalibrowanej pipety odmierzyć 0,5 ml roztworu antygenu i dodać w opisany poniżej sposób: • Trzymać pipete˛ w 1/3 wysokości butelki. Nie dotykać roztworu soli. • Mieszaja˛c re˛cznie ruchem kolistym o średnicy około 5 cm, dodawać po kropli antygenu. • Wkraplać antygen w ten sposób przez około 6 sekund, a naste˛pnie dodać pozostały antygen z pipety. • Mieszać jeszcze przez 10 sekund. 4. Dodać 4,1 ml buforowanego roztworu soli, wlewaja˛c go po ściankach butelki. 5. Zamkna˛ć butelke˛ szklanym korkiem i wstrza˛sać w góre˛ i w dół około 30 razy przez 10 sekund. 6. Pozostawić zawiesine˛ antygenu na co najmniej 10 minut. Wstrza˛sna˛ć delikatnie przed użyciem. Zawiesine˛ należy wykorzystać w cia˛gu 8 godzin. 7. W przypadku badania płynu mózgowo-rdzeniowego rozcieńczyć antygen 10% roztworem soli w stosunku 1:2. Wstrza˛sać butelke˛ delikatnie przez 10 sekund, pozostawić na co najmniej 5 minut i użyć najpóźniej w cia˛gu 2 godzin. Jakościowy odczyn VDRL 1. Za pomoca˛ 1,0-mililitrowej pipety kilkakrotnie wymieszać, a naste˛pnie umieścić 0,05 ml inaktywowanej surowicy we wgłe˛bieniu szklanej płytki VDRL. 2. Rozprowadzić surowice˛ okre˛żnymi ruchami końcówki pipety, tak by pokryła cała˛ wewne˛trzna˛ powierzchnie˛ parafinowego lub ceramicznego wgłe˛bienia. Jedynie użycie czystych płytek umożliwia równomierne rozprowadzenie surowicy. 3. Trzymaja˛c poziomo strzykawke˛ z 18-podziałkowa˛ igła˛, do surowicy dodać uważnie 1 krople˛ antygenu (1/60 ml). Nie dotykać surowicy igła˛. 4. Płytki w komorze wilgotnej wstawić na 4 minuty do wytrza˛sarki. Jeśli wytrza˛sarka nie jest doste˛pna, płytki kołysać re˛cznie, cia˛głym ruchem kolistym przez 4 minuty. 5. Natychmiast po wymieszaniu ocenić preparat pod mikroskopem w powie˛kszeniu × 10 okular i × 10 obiektyw. 6. Odczytać reakcje w poniższy sposób: Średnie i duże grudki R — Reactive/Dodatnia Drobne grudki W — Weakly reactive/Słabo dodatnia Brak grudek lub bardzo słaby ślad N — Non-reactive/Ujemna Surowica słabo dodatnia lub wykazuja˛ca śladowy odczyn, ze wzgle˛du na obserwowane niekiedy reakcje prozony, powinna zostać powtórnie zbadana w teście półilościowym. Półilościowy odczyn VDRL 1. Przygotować serie podwójnych rozcieńczeń inaktywowanej surowicy w 0,85% NaCl (1:2, 1:4, 1:8, 1:16, 1:32). 2. Dla każdego rozcieńczenia surowicy przeprowadzić badanie jakościowe. 3. Zapisać wyniki i zgodnie z poniższymi przykładami określić najwyższe dodatnie rozcieńczenie surowicy (nie słabo dodatnie): 4. W przypadku dodatnich wyników obserwowanych w rozcieńczeniu 1:32 przygotować kolejne podwójne rozcieńczenia w 0,85% NaCl (1:64, 1:128 i 1:256) i przeprowadzić ponownie badanie jakościowe. 145 BADANIA SEROLOGICZNE Rozcieńczenie Surowica nierozcieńczona 1:2 1:4 1:8 W R R R W N (szorstki) N W R R W W N N W R R R N N N W R R Wynik 1:16 1:32 N N N N W R N N N N N N Słabo dodatni, bez rozcieńczenia Dodatni, bez rozcieńczenia Dodatni, rozcieńczenie 1:2 Dodatni, rozcieńczenie 1:4 Dodatni, rozcieńczenie 1:8 Dodatni, rozcieńczenie 1:16 W — Weakly reactive/reakcja słabo dodatnia R — Reactive/reakcja dodatnia N — Non-reactive/reakcja ujemna Odczyn RPR Zawiesina antygenu w teście RPR zawiera cza˛steczki we˛gla pozwalaja˛ce na makroskopowe uwidocznienie odczynu kłaczkuja˛cego. Główne różnice w stosunku do odczynu VDRL dotycza˛ użycia utrwalonego antygenu, kartoników zamiast płytek, możliwości wykonania badania zarówno z surowica˛, jak i z osoczem, bez konieczności inaktywacji surowicy. Potrzebna jest niewielka ilość próbki, można użyć również osocza z krwi włośniczkowej. Testu RPR nie stosuje sie˛ do badania płynu mózgowo-rdzeniowego. W odczynie RPR antygen jest gotowy do użycia. Nie wymaga wcześniejszego przygotowania czy rozcieńczenia. Termin ważności nieotwartego, przechowywanego w chłodziarce antygenu, wynosi jeden rok. Otwarty, przechowywany w chłodziarce w plastikowym dozowniku, utrzymuje swoja˛ aktywność przez 3 miesia˛ce. Test RPR jest nieco bardziej czuły, prostszy i szybszy niż test VDRL. Fałszywie dodatnie wyniki uzyskuje sie˛ nieznacznie cze˛ściej niż w odczynie VDRL. Niektóre zestawy do testów wymagaja˛ użycia wytrza˛sarki do wymieszania reagentów, podczas gdy w innych można wymieszać je re˛cznie. Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do odczynu RPR Igła dozuja˛ca 60 kropli/ml zawiesiny antygenu Surowice kontrolne, dodatnia i ujemna Jednorazowe zakraplacze do odmierzenia 50 µl surowicy lub osocza Kartoniki RPR pokryte warstwa˛ plastiku, każdy z dwoma rze˛dami po pie˛ć dołeczków Gotowa zawiesina antygenu RPR Mieszadełka Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do odczynu RPR Jednorazowy zakraplacz Dermatograf Komora wilgotna Wytrza˛sarka o ruchach kolistych o średnicy 2 cm, szybkości 180 obr./min, w ustawieniu poziomym, z automatycznym pomiarem czasu Sterylny roztwór NaCl (0,85%) 146 CZE˛ŚĆ I Jakościowy odczyn RPR 1. Wyja˛ć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do temperatury pokojowej. 2. Przygotować surowice˛ kontrolna˛, dodaja˛c wskazana˛ obje˛tość wody destylowanej. 3. Opisać każdy dołeczek na kartoniku RPR laboratoryjnym numerem badania, pozostawiaja˛c miejsce dla dodatniej, słabo dodatniej i ujemnej surowicy kontrolnej. 4. Za pomoca˛ jednorazowego zakraplacza umieścić 50 µl surowicy lub osocza w odpowiednim dołeczku. Dla każdej próbki użyć nowego zakraplacza. 5. Delikatnie wstrza˛sna˛ć zawiesina˛ antygenu i do każdego dołeczka, dozuja˛ca˛ igła˛ z zestawu, dodać bezkontaktowo krople˛ antygenu. Ostrożnie wymieszać zawiesine˛ antygenu z surowica˛. Dla każdej próbki użyć nowego mieszadełka. Dokładnie rozprowadzić. 6. Kartoniki w komorze wilgotnej wstawić na 8 minut na wytrza˛sarke˛. Jeśli wytrza˛sarka nie jest doste˛pna, kartoniki kołysać re˛cznie, cia˛głym ruchem kolistym przez 2 minuty, naste˛pnie umieścić na 6 minut w wilgotnej komorze zawieraja˛cej zwilżona˛bibułe˛ lub inny materiał. Wyja˛ć kartonik i obracać przez chwile˛, do uzyskania końcowego wyniku. Uważać, aby nie zmieszać próbek ze soba˛. 7. Po zdje˛ciu z wytrza˛sarki obejrzeć kartoniki w dobrym świetle. Dodatnia surowica kontrolna powinna wykazywać wyraźnie widoczna˛ reakcje˛. Ujemna surowica kontrolna nie wykazuje reakcji. Krótkie obracanie i przechylanie kartonika w re˛kach może pomóc w zróżnicowaniu słabo dodatnich i ujemnych próbek. 8. Zapisać wynik badania: • Małe lub duże kłaczkowate skupiska: dodatni. • Jednolite zme˛tnienie zawiesiny cza˛steczek: ujemny. 9. Przygotować seryjne rozcieńczenia każdej dodatniej surowicy w celu oznaczenia miana. Półilościowy odczyn RPR 1. Wyja˛ć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do temperatury pokojowej. 2. Opisać rza˛d 5 dołeczków na kartoniku RPR laboratoryjnym numerem badania. 3. Za pomoca˛ jednorazowego zakraplacza dodać do każdego dołeczka po 1 kropli roztworu NaCl (0,85%). Nie rozprowadzać. 4. Za pomoca˛ nowego zakraplacza nanieść 1 krople˛ próbki surowicy do pierwszego dołeczka. Wymieszać zakraplaczem (zacia˛gaja˛c i wypuszczaja˛c zawartość 5 – 6-krotnie; unikać tworzenia sie˛ pe˛cherzyków). 5. Przenieść 50 µl mieszaniny (rozcieńczenie 1:2) do naste˛pnego dołeczka. Wymieszać. Powtórzyć cała˛czynność do pia˛tego dołeczka wła˛cznie (rozcieńczenie 1:32). Usuna˛ć 50 µl mieszaniny z ostatniego rozcieńczenia. 6. Rozprowadzić przygotowane próbki w dołeczkach, rozpoczynaja˛c od najwyższego rozcieńczenia. Dla każdej próbki użyć nowego mieszadełka. 7. Za pomoca˛ dozuja˛cej igły dodać bezkontaktowo do każdego dołeczka 1 krople˛ delikatnie wstrza˛śnie˛tego antygenu. Ostrożnie wymieszać zawiesine˛ antygenu z surowica˛. Dokładnie rozprowadzić. Do każdej próbki użyć nowego mieszadełka. 147 BADANIA SEROLOGICZNE 8. Kartoniki w komorze wilgotnej wstawić na 8 minut na wytrza˛sarke˛. Jeśli wytrza˛sarka nie jest doste˛pna, kartoniki kołysać re˛cznie, cia˛głym ruchem kolistym przez 2 minuty, naste˛pnie umieścić na 6 minut w wilgotnej komorze zawieraja˛cej mokra˛bibułke˛ lub inny materiał. Wyja˛ć kartonik i obracać przez chwile˛, do uzyskania końcowego wyniku. Uważać, aby nie zmieszać próbek ze soba˛. 9. Po zdje˛ciu z wytrza˛sarki obejrzeć kartoniki w dobrym świetle. Najwyższe rozcieńczenie z widoczna˛ makroskopowo reakcja˛ jest mianem próbki. 10. Jeśli próbka jest dodatnia przy 1:32, należy wykonać dodatkowe serie rozcieńczeń. Przygotować roztwór 1:16 z NaCl (0,85%), a naste˛pnie w opisany wyżej sposób rozcieńczyć surowice˛. Odczyn immunofluorescencji kre˛tków w modyfikacji absorpcyjnej (FTA-Abs) W teście FTA-Abs wykorzystuje sie˛ utrwalony acetonem na szkiełku antygen Treponema pallidum (szczep Nicholsa). Można również użyć zawieszonych w roztworze soli liofilizowanych komórek T. pallidum. Inaktywowana˛ surowice˛ pacjenta inkubuje sie˛ z kre˛tkami Reitera, wia˛ża˛cymi niespecyficzne przeciwciała kre˛tkowe. Po absorpcji surowice˛ umieszcza sie˛ na szkiełku. Specyficzne przeciwciała z surowicy wia˛ża˛sie˛ na powierzchni komórek kre˛tków. Po spłukaniu dodaje sie˛ koniugatu znakowanych fluorescencyjnie (izotiocyjanian fluoresceiny) przeciwciał przeciw ludzkim immunoglobulinom. Koniugat zostanie zwia˛zany przez przeciwciała obecne na powierzchni kre˛tków i uwidoczniony w mikroskopie fluorescencyjnym. Dodatni odczyn pojawia sie˛ trzy tygodnie po zakażeniu i utrzymuje sie˛ u nieleczonych pacjentów Może być także obserwowany kilka lat po skutecznym leczeniu we wczesnej fazie i przetrwać u chorych, u których terapie˛ wprowadzono dopiero w późnej fazie choroby. Dodatni wynik testu z dużym prawdopodobieństwem wskazuje na zakażenie kiła˛. Fałszywie ujemne wyniki uzyskuje sie˛ wyja˛tkowo rzadko i zwia˛zane sa˛ prawdopodobnie ze zła˛ jakościa˛ antygenu. Fałszywie dodatnie wyniki moga˛ być efektem obniżonej jakości odczynników, a w rezultacie niedostatecznej eliminacji nieswoistych przeciwciał w procesie absorpcji. Fałszywie dodatnie wyniki obserwowano również u pacjentów z marskościa˛ wa˛troby, zapaleniem żołe˛dzi, kolagenoza˛, opryszczka˛ narza˛dów płciowych, toczniem rumieniowatym i bardzo rzadko u kobiet w cia˛ży oraz u zdrowych osób z nieznanych przyczyn. Wykazano krzyżowa˛ reakcje˛ mie˛dzy T. pallidum i Borrelia burgdorferi (choroba z Lyme). Próbki z nieproporcjonalnie wysokim mianem w teście FTA-Abs, w porównaniu z innymi serologicznymi testami kiłowymi, powinny zostać przebadane w kierunku obecności przeciwciał przeciw Borrelia. Główna˛ zaleta˛ odczynu FTA-Abs jest jego wysoka swoistość i czułość oraz wczesna reaktywność. Wyniki sa˛ wiarygodne i moga˛ być decyduja˛ce w wa˛tpliwych przypadkach. Test FTA-Abs jest jednak czasochłonny i drogi; wymaga dobrego wyszkolenia personelu przeprowadzaja˛cego badanie i odczytuja˛cego wyniki. Powinien wie˛c być traktowany jako test potwierdzenia w przypadkach niepewnej diagnozy. 148 CZE˛ŚĆ I Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do odczynu FTA-Abs Roztwór buforu Surowice kontrolne, dodatnia i ujemna Przeciwciała przeciw ludzkim immunoglobulinom znakowane fluoresceina˛ (koniugat) Liofilizowany ekstrakt kre˛tków Reitera (sorbent) T. pallidum utrwalone na szkiełkach Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do odczynu FTA-Abs Szkiełka nakrywkowe Mikroskop fluorescencyjny z UV iluminacja˛ (× 40 obiektyw) Podłoże utrwalaja˛ce Buforowana sól, pH 7,2 (PBS) Tween 80 (2%)-PBS Odczyn FTA-Abs 1. Wyja˛ć zestaw odczynników z lodówki i pozostawić do ogrzania do temperatury pokojowej. 2. Pozostawić wymagana˛ liczbe˛ szkiełek przez 15 minut do ogrzania do temperatury pokojowej. 3. Zmieszać 50 µl surowicy badanej z 0,2 ml sorbentu. Równolegle rozcieńczyć dodatnia˛ i ujemna˛ surowice˛ kontrolna˛: 1:5 z roztworem buforu i 1:5 z sorbentem. 4. Na jedno szkiełko z kre˛tkami nałożyć 10 µl roztworu buforu (kontrola koniugatu), na drugie 10 µl sorbentu (kontrola sorbentu). 5. Na każde kolejne szkiełko nałożyć 10 µl odpowiedniego rozcieńczenia surowicy badanej lub kontrolnej. 6. Umieścić szkiełka w wilgotnej komorze na 30 minut w 37°C. Zanurzyć preparaty na 5 minut w roztworze Tween-PBS. Czynność powtórzyć. Spłukać woda˛ destylowana˛, odsa˛czyć i zostawić do wyschnie˛cia w pojemniku na preparaty. 7. Nałożyć na wszystkie szkiełka po 10 µl przeciwciał przeciw immunoglobulinom ludzkim rozcieńczonych zgodnie z zaleceniami producenta w buforze. 8. Umieścić szkiełka w wilgotnej komorze na 30 minut w 37°C. Zanurzyć preparaty na 5 minut w roztworze Tween-PBS. Czynność powtórzyć. Spłukać woda˛ destylowana˛, odsa˛czyć i zostawić do wyschnie˛cia w pojemniku na preparaty. 9. Na każde szkiełko nałożyć 2 krople podłoża utrwalaja˛cego i szkiełko nakrywkowe. 10. Sprawdzić, czy koniugat, absorbent i ujemna surowica kontrolna nie wykazuja˛ fluorescencji: • Brak fluorescencji lub lekko zielonkawe kre˛tki: reakcja ujemna. • Różny stopień zielonej fluorescencji: reakcja dodatnia. 149 BADANIA SEROLOGICZNE Fluorescencje˛ można stopniować: Ujemna Graniczna Dodatnia 0 1+, 2+, 3+ 4+ Reakcja 2+ i wie˛ksza wskazuje na zakażenie T. pallidum. Wykrywanie aglutynin w gora˛czce Lekarz, który leczy pacjenta z gora˛czka˛ o nieustalonej przyczynie, cze˛sto zleca wykonanie serii badań serologicznych, wspólnie określanych nazwa˛ odczynów aglutynacyjnych w gora˛czce, w celu potwierdzenia zakażeń wywołanych przez Brucella (odczyn Wrighta), Salmonella typhi (odczyn Widala) i niektóre riketsje (odczyn Weila-Felixa). Odczyny wykrywaja˛ przeciwciała aglutynuja˛ce skierowane przeciw somatycznemu antygenowi O i/lub rze˛skowemu antygenowi H poszukiwanych drobnoustrojów lub, w przypadku odczynu Weila-Felixa, krzyżowo reaguja˛ce z antygenem somatycznym dwóch szczepów Proteus vulgaris. Odczyny Widala i Weila-Felixa, ze wzgle˛du na znaczna˛ liczbe˛ technicznych i interpretacyjnych problemów, nie sa˛obecnie zalecane do badań przesiewowych. Ujemna reakcja nie wyklucza aktywnego zakażenia, ponieważ zakażenie może być w fazie inkubacji, w której pacjent nie wytwarza jeszcze wykrywalnej liczby przeciwciał. Zjawisko prozony także daje ujemne reakcje; zapobieganiu efektowi prozony służy stosowanie seryjnych rozcieńczeń surowicy. Dodatnia reakcja z danym antygenem może okazać sie˛ niediagnostyczna ze wzgle˛du na wykazywany podczas choroby wzrost wytwarzania heterologicznych aglutynin. Takie reakcje nosza˛ nazwe˛ nieswoistej odpowiedzi wtórnej, w której w odpowiedzi na stymulacje˛ antygenowa˛ pacjent wytwarza nieswoiste aglutyniny. Diagnostyka serologiczna oparta jedynie na stwierdzeniu wysokiego miana przeciwciał nie jest pewna i tylko serokonwersja z czterokrotnym wzrostem miana przeciwciał w seryjnych rozcieńczeniach powinna być traktowana jako dowód świeżego zakażenia. Wie˛kszość pacjentów z ostra˛ bruceloza˛ pod koniec drugiego tygodnia zakażenia wykazuje miano aglutynin 1:320 i wyższe. Nawet rok po leczeniu u 20% pacjentów nadal wyste˛puja˛ znacza˛ce miana aglutynin Brucella. Wysokie miana obserwowano sa˛ również u pacjentów zakażonych Francisella tularensis i Yersinia enterocolitica, u niedawno szczepionych na bruceloze˛ i cholere˛ lub badanych testem skórnym z brucelergina˛. Obserwowano je również u pracowników rzeźni. Ponieważ hodowle krwi przez wiele tygodni moga˛ nie wykazywać obecności drobnoustrojów, określenie miana aglutynin Brucella może stanowić wste˛pna˛ diagnoze˛ ostrej brucelozy. Izolacja bakterii, zazwyczaj z krwi, dostarcza ostatecznych dowodów zakażenia. Przy podejrzeniu choroby i ujemnym wyniku posiewu krwi, w celu potwierdzenia zakażenia, można przeprowadzić hodowle˛ szpiku kostnego pobranego z mostka. Pacjent ze zlokalizowana˛ bruceloza˛ może nie gora˛czkować i nie wykazywać znacza˛cego miana aglutynin Brucella. W tych przypadkach chorobe˛ podejrzewa sie˛ na podstawie danych epidemiologicznych i obecności zwapniałych we˛złów chłonnych w badaniach radiologicznych. Diagnoze˛ należy jednak potwierdzić w hodowli krwi. 150 CZE˛ŚĆ I Szybki test szkiełkowy jest testem przesiewowym, przeznaczonym do wykrywania aglutynin, podczas gdy test probówkowy jest testem potwierdzaja˛cym, który służy do ilościowej oceny aglutynin. Każdy dodatni wynik otrzymany w teście szkiełkowym należy potwierdzić w teście probówkowym. Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do wykrywania aglutynin w brucelozie Zawiesina antygenu (B. abortus, B. melitensis) w butelce z zakraplaczem Ujemna surowica kontrolna Dodatnia surowica kontrolna Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do wykrywania aglutynin w brucelozie Aplikator patyczków Szklana płytka Dermatograf Pipety, 50 – 1000 µl Linijka Sterylny roztwór NaCl (0,85%) Probówki i stojak na probówki Stoper Łaźnia wodna z kontrolowana˛ temperatura˛ Test szkiełkowy do wykrywania aglutynin w brucelozie Preferowany w porównaniu z testem probówkowym jako mniej skomplikowany. 1. Próbka surowicy musi być czysta, bez widocznych resztek tłuszczowych. Nie powinna wykazywać hemolizy ani być zanieczyszczona przez bakterie. Nie może być inaktywowana przez podgrzewanie, ponieważ w ten sposób zniszczone zostałyby niektóre termolabilne aglutyniny. 2. Przygotować szklana˛ płytke˛, rysuja˛c za pomoca˛ dermatografu i linijki dwa rze˛dy 2,5-centymetrowych kratek. Każdy rza˛d zawieraja˛cy 5 kratek wystarcza na przeprowadzenie badania antygenu z rozcieńczeniami surowicy do 1:320. 3. Za pomoca˛ 0,2-mililitrowej pipety nanieść 0,08, 0,04, 0,02, 0,01 i 0,005 ml surowicy w rze˛dzie kratek. 4. Do każdej surowicy dodać 1 krople˛ właściwej dla testu szkiełkowego zawiesiny dobrze wymieszanego antygenu. 5. Zaczynaja˛c od najwyższego rozcieńczenia wymieszać patyczkiem mieszanine˛ surowica-antygen. Końcowe rozcieńczenia sa˛ zależne od rozcieńczeń w makroskopowym odczynie probówkowym i wynosza˛ odpowiednio 1:20, 1:40, 1:80, 1:160 i 1:320. 6. Trzymaja˛c płytke˛ w obu dłoniach delikatnie wymieszać, wykonuja˛c 15 – 20 kolistych ruchów. Ogla˛dać mieszanine˛ w dobrym świetle przez 1 minute˛, poszukuja˛c śladów aglutynacji. Reakcje pojawiaja˛ce sie˛ później moga˛ być zwia˛zane z wysychaniem reagentów na szkiełku i powinny być potwierdzone w teście probówkowym. 151 BADANIA SEROLOGICZNE 7. Odczytać wyniki w poniższy sposób: Całkowita aglutynacja Około 75% zaglutynowanych komórek Około 50% zaglutynowanych komórek Około 25% zaglutynowanych komórek Śladowa lub brak aglutynacji 4+ 3+ 2+ 1+ – Probówkowy test wykrywaja˛cy aglutyniny w brucelozie Przygotować seryjne rozcieńczenia surowicy i surowice˛ kontrolna˛ w poniżej przedstawiony sposób: 1. Dla każdej badanej surowicy umieścić po 8 probówek w stojaku. 2. Do pierwszej probówki w każdym rze˛dzie dodać pipeta˛ 1,9 ml NaCl (0,85%), do kolejnych po 0,5 ml. 3. Do probówki z 1,9 ml NaCl dodać 0,1 ml surowicy. 4. Dobrze wymieszać pipeta˛ i przenieść 0,5 ml roztworu do probówki drugiej. Dokładnie wymieszać. 5. Do kolejnych probówek w rze˛dzie, ła˛cznie z siódma˛, dodać 1 krople˛ rozcieńczonej surowicy. Wymieszać dokładnie. Z probówki 7. po wymieszaniu usuna˛ć 0,5 ml roztworu. Probówka 8. jest kontrola˛ antygenu. 6. Do każdej z 8 probówek dodać 0,5 ml odpowiedniego antygenu. Wstrza˛sna˛ć statywem, mieszaja˛c antygen z surowica˛. Kolejne rozcieńczenia wynosza˛ odpowiednio od 1:20 do 1:1280. 7. Inkubować w łaźni wodnej w 37°C przez 48 godz., zgodnie z zaleceniami producenta. 8. Oceniać makroskopowo obecność aglutynacji w probówkach przez 1 minute˛ w dobrym świetle na ciemnym tle. Przy odczycie nie wstrza˛sać probówek. Dodatnia reakcja wykazuje widoczna˛aglutynacje˛ (granulacje˛); ujemna reakcja wykazuje zme˛tnienie zawiesiny bez aglutynacji. Najwyższe rozcieńczenie wykazuja˛ce aglutynacje˛ jest mianem surowicy. Odrzucić antygen, który nie aglutynuje z dodatnia˛ surowica˛ kontrolna˛ lub aglutynuje z ujemna˛ surowica˛ kontrolna˛. Aglutynacje˛ można obserwować w surowicy zdrowych osób, sta˛d pojedyncze surowice o mianie niższym niż 1:80 maja˛ nieznaczna˛ wartość. Fałszywie dodatnie wyniki otrzymuje sie˛ także u pacjentów zakażonych Francisella tularensis lub u szczepionych przeciw Vibrio cholerae. Za pomoca˛ tego testu nie można zróżnicować infekcji wywołanych B. abortus i B. melitensis. Odczyn ASO Zakażenia paciorkowcowe sa˛ cze˛ste i przeciwciała przeciw paciorkowcom wyste˛puja˛ w dużym odsetku populacji. β-hemolizuja˛ce paciorkowce grupy A wytwarzaja˛ dwie hemolizyny: wrażliwa˛ na tlen streptolizyne˛ O i tlenowo-stabilna˛ streptolizyne˛ S. Jedynie zredukowana (nieutleniona) streptolizyna O jest immunogenna i wykorzystywana w odczynie. Reakcja oparta jest na wytwarzaniu przez pacjenta zakażonego Streptococcus pyogenes (grupa paciorkowców A) przeciwciał hamuja˛cych aktywność hemolityczna˛ streptolizyny O. Przeciwciała zwykle utrzymuja˛ sie˛ długo, sta˛d pojedyncze stwierdzenie podwyższonego miana nie świadczy o aktywnej infekcji. Jedynie w przypadku czterokrotnego wzrostu miana przeciwciał w kolejnych próbkach, pobranych w 10 – 14-dniowym odste˛pie, 152 CZE˛ŚĆ I należy rozważyć obecność świeżego zakażenia. Test najcze˛ściej wykorzystywany jest w diagnostyce gora˛czki reumatycznej, ostrego kłe˛buszkowego zapalenia nerek i innych chorób popaciorkowcowych. Doste˛pne sa˛ dwa typy komercyjnych zestawów do odczynu antystreptolizyny O: • Test lateksowej aglutynacji szkiełkowej ASO używany w badaniach przesiewowych do identyfikacji podwyższonych mian ASO (200 IU i wyższych) w surowicy. • Test probówkowy ASO jest odczynem zahamowania hemolizy, wykorzystywanym do określenia miana surowic dodatnich w teście lateksowo-szkiełkowym. Miano poniżej 50 IU nie potwierdza rozpoznania ostrej gora˛czki reumatycznej. Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do lateksowego testu szkiełkowego ASO Jednorazowe kartoniki, każdy z 6 dołeczkami Jednorazowy zakraplacz Dodatnia surowica kontrolna Uczulony odczynnik lateksowy (ze streptolizyna˛ O) Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do lateksowego testu szkiełkowego ASO Aplikator patyczków Lateksowy test aglutynacji szkiełkowej ASO 1. 2. 3. 4. 5. Rozcieńczyć surowice˛ 1:20. Umieścić 1 krople˛ roztworu surowicy w dołeczku na jednorazowym kartoniku. Nowym zakraplaczem dodać 1 krople˛ uczulonego odczynnika lateksowego. Patyczkiem wymieszać 2 krople i rozprowadzić je w dołeczku. Przez 2 minuty obserwować obecność aglutynacji. Dodatnia reakcja manifestuje sie˛ drobnym kłaczkowaniem (aglutynacja˛) w cia˛gu 2 minut. Ujemna reakcja nie wykazuje aglutynacji. Jeśli aglutynacja pojawi sie˛ w cia˛gu 2 minut, miano surowicy należy określić w teście probówkowym antystreptolizyny O. Materiały i odczynniki zawarte w zestawie do testu probówkowego ASO Dodatnia surowica kontrolna Zredukowany antygen streptolizyny O (suchy preparat) Erytrocyty baranie Standardowe przeciwciała przeciw streptolizynie O (suchy preparat, 20 IU/butelka) Bufor do streptolizyny O (25 × koncentrat roztworu) 153 BADANIA SEROLOGICZNE Dodatkowe materiały i odczynniki potrzebne do testu probówkowego ASO Woda destylowana Pipety (1 ml, 2 ml) Probówki Łaźnia wodna Test probówkowy ASO 1. Rozpuścić zredukowany antygen streptolizyny O (suchy preparat) w odpowiedniej obje˛tości wody destylowanej (w opisanej butelce), przygotowuja˛c roztwór o ste˛żeniu 2 IU w 1 ml. Roztwór nie zawiera konserwantów i musi zostać wykorzystany w cia˛gu 6 godzin. 2. Rozpuścić standardowa˛ antystreptolizyne˛ O (suchy preparat, 20 IU/butelka) w 10 ml buforu streptolizyny O. Roztwór można przechowywać przez 6 miesie˛cy w 4°C, pod warunkiem, że nie uległ kontaminacji. 3. Przed użyciem rozcieńczyć bufor streptolizyny O (25 × koncentrat) w 480 ml wody destylowanej. Rozcieńczony bufor nie wykorzystany w cia˛gu tygodnia należy wyrzucić. 4. 1 ml erytrocytów baranich wypłukać trzykrotnie w buforze streptolizyny O i odwirować, zebrać pipeta˛ supernatant. Dodaja˛c buforu streptolizyny O uzyskać 8% zawiesine˛ komórek. 5. Odczynniki i surowice˛ pozostawić do ogrzania do temperatury pokojowej. 6. Przygotować w probówce rozcieńczenie surowicy pacjenta 1:10 (0,1 ml surowicy + 0,9 ml buforu streptolizyny O). Przygotować dwa wyjściowe roztwory z rozcieńczenia 1:10 w poniżej przedstawiony sposób: Surowica 0,2 ml (1:10) 1,0 ml (1:100) Bufor Rozcieńczenie 1,8 ml 0,5 ml 1:100 1:150 7. Przygotować naste˛puja˛ce serie rozcieńczeń buforu streptolizyny O dla każdego z wyjściowych roztworów: Probówka 1 2 3 4 5 6 7 8 Surowica 0,2 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml (1:10) (1:100) (1:200) (1:400) (1:150) (1:300) 0 0 Bufor 0,8 0,5 0,5 0,5 0,5 0,5 1,5 1,0 ml ml ml ml ml ml ml ml Rozcieńczenie Zredukowana streptolizyna O 1:50 1:200 1:400 1:800 1:300 1:600 — — 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0,5 ml 0 0,5 ml 8. Uporza˛dkować probówki według wzrastaja˛cych rozcieńczeń: 1:50, 1:200, 1:300, 1:400, 1:600, 1:800. 9. Do probówki kontrolnej 7. dodać 1,5 ml buforu, do probówki kontrolnej 8. dodać 1 ml buforu. 10. Do wszystkich probówek, z wyja˛tkiem kontrolnej 7., dodać 0,5 ml roztworu zredukowanej streptolizyny O. 154 CZE˛ŚĆ I 11. Wymieszać i chłodzić w 4°C przez dwie godziny, umożliwiaja˛c przebieg reakcji antygen-przeciwciało. 12. Do wszystkich probówek, wła˛czaja˛c kontrolne probówki 7. i 8., dodać 0,5 ml 8% zawiesiny erytrocytów, wymieszać i inkubować w łaźni wodnej w 37°C przez 30 minut. 13. Odwirować probówki w 1000 g przez 2 minuty i obserwować hemolize˛. W kontrolnej probówce 7. nie powinna zachodzić hemoliza, w kontrolnej probówce 8. powinna zajść całkowita hemoliza. 14. Miano ASO to najwyższe rozcieńczenie nie wykazuja˛ce hemolizy: • Jeśli we wszystkich probówkach zachodzi hemoliza, wynik opisać ,,miano ASO poniżej 200 IU’’. • Jeśli w probówkach o wyższym rozcieńczeniu nie zachodzi hemoliza, zanotować wynik ,,ASO dodatnie z mianem’’. Wykrywanie antygenów bakteryjnych Lateksowy test aglutynacji i test koaglutynacji, wykrywaja˛ce antygeny bakteryjne, stosowane sa˛ do identyfikacji mikroorganizmów i ich antygenów w hodowlach lub w próbkach klinicznych. W teście aglutynacji lateksowej cza˛steczki polimerów wykorzystuje sie˛ jako nośnik fazy stałej; w teście koaglutynacji nośnikiem fazy stałej sa˛ erytrocyty. Za pomoca˛ testu lateksowego można wykryć antygeny polisacharydowe bakterii wywołuja˛cych zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, w tym Haemophilus influenzae (tyb b), S. pneumoniae (omniwalentny), N. meningitidis (grupa A, B, C, Y i W135), E. coli (typ K1) i S. agalactiae (grupa B). Testy aglutynacji lateksowej sa˛ przydatne do identyfikacji paciorkowców z grup Lancefield A, B, C, D, F i G. Odczyny lateksowe można wykorzystać w jakościowym teście aglutynacji szkiełkowej i w ilościowym teście aglutynacji probówkowej oraz w typowaniu grup Streptococcus A-D, N. meningitidis, H. influenzae, Salmonella, Shigella, Vibrio cholerae itp. Do wykrycia antygenów polisacharydowych w próbkach klinicznych niezbe˛dny jest progowy poziom antygenu. Jeśli w preparacie barwionym metoda˛ Grama widoczne sa˛ drobnoustroje, zwykle, choć nie w każdym przypadku, przekroczony jest poziom progowy. W płynie mózgowo-rdzeniowym pacjentów z zakażeniem N. meningitidis wykrywana jest znacznie mniejsza liczba bakterii niż w zakażeniach wywołanych innymi typami Neisseria spp., dlatego rzadziej osia˛gany jest progowy poziom antygenów polisacharydowych. Kilka serogrup N. meningitidis może wywoływać zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. Serogrupy A, C, Y i W135 maja˛ stabilny antygen, który można wykazać za pomoca˛ pojedynczego poliwalentnego odczynnika, podczas gdy antygen grupy B jest stosunkowo niestabilny i w zwia˛zku z tym trudniej wykrywalny. Nie można go zróżnicować z polisacharydowym antygenem K1 E. coli, która wśród E. coli jest głównym czynnikiem wywołuja˛cym zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych u noworodków. Wykazanie w preparatach barwionych metoda˛ Grama obecności Gram-ujemnych dwoinek sugeruje N. meningitidis grupy B, obecność Gram-ujemnych pałeczek wskazuje na E. coli. W niektórych testach, polisacharydowe antygeny z drobnoustrojów uzyskiwane sa˛ przed badaniem. Pozyskiwanie antygenów przeprowadza sie˛ chemicznie lub enzymatycznie. 155 BADANIA SEROLOGICZNE Do wykrywania antygenów służa˛ cztery różne testy: • W teście aglutynacji szkiełkowej antygen opłaszczony jest na cza˛steczkach lateksu lub swoiste przeciwciała zwia˛zane sa˛ na komórkach gronkowców. Reagenty miesza sie˛ re˛cznie cia˛głym ruchem kolistym przez 1 – 2 minuty i makroskopowo obserwuje reakcje˛ aglutynacji. • W testach ELISA roztwór próbki i antygenu najpierw przepuszczany jest przez błone˛ opłaszczona˛ przeciwciałami (zwykle monoklonalnymi). Naste˛pnie błone˛ umieszcza sie˛ w roztworze zawieraja˛cym kolejne (monoklonalne) przeciwciała zwia˛zane z enzymem. Obecność kompleksu antygen-przeciwciało z enzymem wykrywa sie˛ w reakcji z barwnym substratem dodanym do roztworu. • W ,,złotym’’ teście immunologicznym roztwór próbki i antygenu dyfunduje na błonie, która˛ naste˛pnie sie˛ ogla˛da. • W optycznym teście immunologicznym, przeciwciała zwia˛zane sa˛z silikonowa˛ płytka˛ o odblaskowych właściwościach. Reakcja antygenu ze specyficznym przeciwciałem powoduje zmiane˛ w warstwie powierzchownej płytki i widoczna˛ różnice˛ refleksu światła. Procedury odczynów aglutynacji lateksowej i koaglutynacji 1. Dla zwia˛zanych antygenów komórkowych: używaja˛c standardowej ezy przenieść czyste kolonie do kropli soli na szkiełku, uważnie wymieszać do uzyskania lekko opalizuja˛cej zawiesiny. Obecność aglutynacji zwykle wskazuje na szczepy szorstkie (R — ang. rough); szczepy gładkie (S — ang. smooth) nie wykazuja˛ aglutynacji w soli. W takim przypadku należy dodać odczynniki i przejść do punktu 4. Dla ekstrahowanych antygenów: używaja˛c standardowej ezy przenieść dobrze izolowane kolonie do probówki zawieraja˛cej roztwór ekstraktu, uzyskać zawiesine˛. Inkubować zawiesine˛ w 35°C lub zgodnie z zaleceniami producenta. Dla próbek klinicznych (płyn mózgowo-rdzeniowy, mocz): podgrzać próbke˛ do temperatury wrzenia lub według zaleceń producenta. Schłodzić i odwirować w 2000 g przez 5 – 10 minut. 2. Umieścić na płytce 1 krople˛ nośników opłaszczonych przeciwciałami. 3. Umieścić obok 1 krople˛ zawiesiny antygenu. 4. Wymieszać 2 krople i rozprowadzić w kratce. 5. Przechylać szkiełko re˛cznie, wykonuja˛c cia˛głe okre˛żne ruchy przez 1 minute˛. Uważać, aby mieszanina nie rozlała sie˛ poza granice˛ kratki. 6. Po określonym przez producenta czasie obejrzeć szkiełko i sprawdzić, czy obecna jest aglutynacja. Dla uzyskania lepszej widoczności trzymać szkiełko blisko źródła światła i ogla˛dać na ciemnym tle. 7. Jako wynik dodatni uznaje sie˛ obecność aglutynacji w mieszaninie antygenu i przeciwciał, np. zawiesina wykazuje aglutynacje˛ lub grudki. Aglutynacja jest najlepiej widoczna przy delikatnym przechylaniu szkiełka, tak aby płyn spływał wzdłuż dolnej granicy kratki. 156 Cze˛ść II Najważniejsze podłoża i odczynniki 157 Wprowadzenie Laboratorium, wykorzystuja˛c zaledwie niewielka˛ ilość materiału diagnostycznego, może zidentyfikować czynnik etiologiczny zakażenia, co ma istotny wpływ na leczenie pacjenta. W wie˛kszości rozwijaja˛cych sie˛ krajów działalność laboratorium bakteriologicznego jest ograniczona niedoborem podłoży hodowlanych i podstawowych odczynników, których import jest bardzo kosztowny. Podobnie jak w przypadku leków, przeprowadzaja˛c racjonalna˛ selekcje˛, można zredukować liczbe˛ koniecznych do zakupienia podłoży i odczynników. Dodatkowo, niektóre proste podłoża i odczynniki można wytwarzać lub przygotowywać na miejscu. Zastosowanie sie˛ do tych dwóch wskazówek pozwoli znacznie ograniczyć koszty, a także poprawi doste˛pność materiałów laboratoryjnych niezbe˛dnych do diagnostyk i badań epidemiologicznych. Rozdział został przygotowany w taki sposób, aby umożliwić kierownikom laboratoriów podje˛cie właściwych decyzji o przeznaczeniu środków finansowych na zakup najważniejszych podłoży i odczynników. Składa sie˛ z dwóch cze˛ści, z których każda zawiera wiele zestawień. 158 Patogeny, podłoża i odczynniki diagnostyczne Spodziewane patogeny Patogeny wymieniono uwzgle˛dniaja˛c: – cze˛stość izolacji, – znaczenie kliniczne, – cie˛żkość choroby, – prawdopodobieństwo wywołania epidemii, – współczynnik koszt–korzyść dla izolacji i/lub identyfikacji. Wykaz nie jest przeznaczony do bezwarunkowego przestrzegania i może różnić sie˛ w różnych krajach czy laboratoriach, zależnie od charakteru lokalnie wyste˛puja˛cych chorób, kompetencji laboratorium oraz doste˛pnych środków. Podłoża i odczynniki diagnostyczne o nadrze˛dnym znaczeniu Uwzgle˛dniaja˛c pewien stopień elastyczności przyje˛to poniższa˛ gradacje˛ podłoży i odczynników diagnostycznych: Stopień 1: Wysoko priorytetowe Stopień 2: Średnio priorytetowe Stopień 3: Nisko priorytetowe Priorytet podłoży i odczynników zależy od znaczenia patogenów, do izolacji i identyfikacji których służa˛. Istnieja˛ jednak wyja˛tki. Jeśli podłoże jest szeroko stosowane do hodowli wielu patogenów, może zostać ocenione wyżej niż podłoże przeznaczone do izolacji tylko jednego z nich. Stopień 1: Podłoża i odczynniki o wysokim priorytecie, które powinny być doste˛pne we wszystkich laboratoriach przeprowadzaja˛cych ogólna˛ diagnostyke˛ bakteriologiczna˛. Najcze˛ściej sa˛ przeznaczone do ogólnego użytku, proste do przygotowania i stanowia˛ nieliczna˛ grupe˛. Stopień 2: Podłoża i odczynniki o średnim priorytecie sa˛ stosowane dodatkowo, w uzupełniaja˛cej diagnostyce laboratoryjnej i przydatne w badaniach epidemiologicznych; moga˛ nie mieć istotnego bezpośredniego wpływu na leczenie pacjenta, np. surowice odpornościowe do identyfikacji serogrup meningokoków. Stopień 3: Podłoża i odczynniki o niskim priorytecie bardzo rzadko maja˛ znaczenie w leczeniu pacjenta, natomiast sa˛ przydatne w edukacji, pracach naukowych i dodatkowych badaniach prowadzonych przez laboratoria referencyjne. Ta kategoria odnosi sie˛ do podłoży i odczynników diagnostycznych o niekorzystnym współczynniku koszt:efekt, które sa˛ zbyt drogie do stosowania ogólnego lub wykorzystywane do izolacji i identyfikacji rzadko pojawiaja˛cych sie˛, trudnych do izolacji drobnoustrojów. Poniżej wymieniono patogeny, podłoża i odczynniki diagnostyczne stosowane w diagnostyce laboratoryjnej z uwzgle˛dnieniem sugerowanego priorytetu. Sto- 159 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE pień ważności należy przystosować dla każdego laboratorium, uwzgle˛dniaja˛c warunki lokalne. Krew Spodziewane patogeny Bacteroides fragilis Brucella Burkholderia pseudomallei Candida albicans i Cryptococcus neoformans Haemophilus influenzae Neisseria meningitidis Pałeczki niefermentuja˛ce, inne niż Pseudomonas aeruginosa Inne Enterobacteriaceae Pseudomonas aeruginosa Salmonella typhi i nie-typhi Staphylococcus aureus Paciorkowce (S. pyogenes, S. pneumoniae, paciorkowce zielenieja˛ce) Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża płynne do hodowli krwi Priorytet Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) może zostać zasta˛piony innym wzbogaconym bulionem, np. bulionem z wycia˛giem mózgowo-sercowym, każdy z dodatkiem polianetolosulfonianu sodu (SPS), 0,25 g/l Bulion do hodowli beztlenowców z krwi: podłoże płynne tioglikolanowe, bulion Schaedlera lub bulion beztlenowy Wilkins-Chalgrena 1 2 Podłoża do izolacji Przesiew na agar z krwia˛, agar czekoladowy i agar MacConkeya 1 Odczynniki diagnostyczne Kra˛żek z bacytracyna˛ Plazma do koagulazy Odczynnik do wykrywania β-laktamazy Kra˛żek z optochina˛ Odczynnik do wykrywania oksydazy Aglutynuja˛ce surowice odpornościowe Salmonella Czynniki V i XV Surowica odpornościowa Haemophilus influenzae typ b Surowica odpornościowa Neisseria meningitidis (poliwalentna i swoista dla grup A, B, C) 160 1 1 1 1 1 1 2 3 3 CZE˛ŚĆ II Płyn mózgowo-rdzeniowy Spodziewane patogeny Cryptococcus neoformans Enterobacteriaceae Haemophilus influenzae Listeria monocytogenes Mycobacterium tuberculosis Neisseria meningitidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumoniae Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża do izolacji Agar z krwia˛ (z posianym Staphylococcus) Agar czekoladowy Agar MacConkeya Podłoże Löwensteina-Jensena Agar Sabouraud Priorytet 1 1 1 2 2 Odczynniki diagnostyczne Tusz chiński Odczynnik do wykrywania β-laktamazy Kra˛żek z optochina˛ Odczynnik do wykrywania oksydazy Czynniki V i XV Surowica odpornościowa Haemophilus influenzae typ b Surowica odpornościowa Neisseria meningitidis (poliwalentna i swoista dla grup A, B, C) 1 1 1 1 2 3 3 Szybkie testy diagnostyczne Zestaw testów do szybkiego wykrywania bakterii wywołuja˛cych zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych Mocz Spodziewane patogeny Candida albicans Enterokoki Escherichia coli Mycobacterium tuberculosis 161 3 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE Inne Enterobacteriaceae Inne gronkowce Pseudomonas i inne niefermentuja˛ce pałeczki Staphylococcus saprophyticus Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża do izolacji i podłoża ilościowe Agar z krwia˛ Agar brolacynowy (może być zasta˛piony agarem z fioletem krystalicznym i laktoza˛, agarem MacConkeya, agarem bez fioletu krystalicznego lub agarem eozynowym z błe˛kitem metylenowym) Agar CLED Priorytet 1 1 1 Podłoża do identyfikacji i odczynniki diagnostyczne β-glukuronidaza (PGUA) do identyfikacji E. coli Dla Gram-ujemnych pałeczek: agar Kliglera (KIA) odczynnik Kovacsa do wykrywania indolu podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) odczynnik do wykrywania oksydazy podłoże płynne z lizyna˛ (Möller) test ONPG podłoże Simmonsa z cytrynianem Dla gronkowców i enterokoków: test na obecność katalazy (H2O2) plazma do wykrywania koagulazy agar z żółcia˛ i eskulina˛ (dla enterokoków) kra˛żek z nowobiocyna˛ (5 µg) różnicuja˛cy koagulazo-ujemne gronkowce 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 3 Kał Spodziewane patogeny Aeromonas i Plesiomonas Campylobacter spp. Escherichia coli (enteropatogenne, enterotoksyczne, enteroinwazyjne i enterokrwotoczne) Salmonellae spp. nie-typhi i Edwardsiella Salmonella typhi i S. paratyphi Shigella Vibrio cholerae serogrupa O1, przecinkowce nie wywołuja˛ce cholery Yersinia enterocolitica 162 CZE˛ŚĆ II Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża transportowe Podłoże Cary’ego-Blaira (dla wszystkich patogenów) Buforowany roztwór soli i glicerolu (nie dla Vibrio lub Campylobacter) Priorytet 1 2 Podłoża selektywne Bulion seleninowy F Zasadowa woda peptonowa 1 2 Podłoża do izolacji Agar cytrynianowo-deoksycholowy (może być zasta˛piony agarem Salmonella-Shigella, agarem ksylozo-lizyno-deoksycholanowym (XLD)) Agar MacConkeya (z fioletem krystalicznym) Agar TCBS Podłoże Campylobacter: podstawowy agar Columbia lub inny agar z krwia˛ zawieraja˛cy lizat krwi i dodatek antybiotyku lub podłoże podstawowe na bazie aktywnego we˛gla 1 1 1 2 Podłoża do wste˛pnej hodowli i odczynniki diagnostyczne Agar Kliglera (KIA) (dla patogenów jelitowych może być zasta˛piony trójcukrowym agarem żelazowym, TSI) Odczynnik Kovacsa do wykrywania indolu Podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) (można zasta˛pić podłożem do wykrywania ruchu + bulion peptonowy z mocznikiem) Odczynnik do wykrywania oksydazy 1 1 1 1 Podłoża selektywne i odczynniki diagnostyczne Woda peptonowa (lub podstawowy bulion z czerwienia˛ fenolowa˛) Podłoże płynne z lizyna˛ (Möller) Test ONPG Podłoże Simmonsa z cytrynianem Kra˛żek z czynnikiem wibriostatycznym O:129 2 2 2 2 2 Surowice do aglutynacji Salmonella: 163 Priorytet poliwalentna surowica anty-O (A-I i Vi) 1 surowice anty-O: O:2 (A), O:4 (B), O:9 (D), Vi 2 surowice anty-H: H:a, H:b, H:d, H:i, H:m, H:2 3 surowice anty-H fazy inwersji: H:b, H:i, H:1,2 3 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE Shigella: poliwalentne surowice: anty-dysenteriae, anty-flexneri, anty-boydii, anty-sonnei surowica anty-dysenteriae typ 1 (Shiga) Vibrio cholerae: poliwalentna surowica anty-O1 surowica anty-B (Ogawa), anty-C (Inaba), anty-O:139 Haemophilus influenzae surowica typowa anty-b Neisseria meningitidis poliwalentna surowice grupowe anty-A, anty-B, anty-C 1 1 1 3 3 3 3 Górne drogi oddechowe Spodziewane patogeny Candida albicans (jama ustna) Corynebacterium diphtheriae (gardło i nos) Haemophilus influenzae (ucho i zatoki) Moraxella catarrhalis (ucho i zatoki) Neisseria meningitidis Pseudomonas Staphyloccoccus aureus (ucho i zatoki) Streptococcus pneumoniae (ucho i zatoki) Streptococcus pyogenes (grupa A, gardło) Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża do izolacji Agar z krwia˛ (przygotowany na bazie bez glukozy) Agar czekoladowy Podłoże Löfflera z surowica˛ lub podłoże jajeczne Dorseta Agar z krwia˛ i tellurynem Zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina dla gonokoków i meningokoków Priorytet 1 2 2 2 3 Odczynniki diagnostyczne Kra˛żek z bacytracyna˛ Odczynniki do katalazy i koagulazy Kra˛żek z optochina˛ Podłoża do rozkładu cukrów dla Neisseria spp. Odczynnik do wykrywania oksydazy Czynniki X i XV (kra˛żek lub pasek) Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) 1 1 1 2 2 2 3 Szybkie testy diagnostyczne Zestawy do identyfikacji serogrup paciorkowców β-hemolizuja˛cych 164 3 CZE˛ŚĆ II Dolne drogi oddechowe Spodziewane patogeny Candida albicans Enterobacteriaceae Haemophilus influenzae Klebsiella pneumoniae Moraxella catarrhalis Mycobacterium tuberculosis Staphylococcus aureus Streptococcus pneumoniae Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża do izolacji Agar z krwia˛ Agar czekoladowy Agar MacConkeya Podłoże Löwensteina-Jensena Agar Sabouraud Selektywny agar z krwia˛ dla Haemophilus (bacytracyna lub wankomycyna) Priorytet 1 1 1 2 3 3 Odczynniki diagnostyczne Kra˛żek z optochina˛ Odczynnik do wykrywania oksydazy Czynniki X i XV (kra˛żek lub pasek) Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) 1 2 2 3 Próbki z układu moczowo-płciowego do diagnostyki chorób przenoszonych droga˛ kontaktów seksualnych Spodziewane patogeny Candida albicans (badanie mikroskopowe) Chlamydia trachomatis Gardnerella vaginalis (badanie mikroskopowe)1 Haemophilus ducreyi Neisseria gonorrhoeae Treponema pallidum (mikroskopia w ciemnym polu) 1 Gardnerella vaginalis nie jest patogenem, lecz drobnoustrojem wskaźnikowym bakteryjnej waginozy. 165 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża transportowe Podłoża transportowe Amiesa lub Stuarta Priorytet 1 Podłoża do izolacji Zmodyfikowane podłoże Thayer-Martina (MTM) lub podłoże New York City (NYC) czekoladowy agar Mueller-Hintona z krwia˛ końska˛ + wankomycyna + IsoVitaleX dla H. ducreyi 1 3 Odczynniki do identyfikacji Test nitrocefinowy lub inne testy do wykrywania β-laktamaz Odczynnik do wykrywania oksydazy 1 1 Ropa i wysie˛ki Spodziewane patogeny Bacillus anthracis Bacteroides i inne bezwzgle˛dne beztlenowce Clostridium perfringens Enterobacteriaceae Mycobacterium tuberculosis, M. ulcerans Inne Mycobacterium spp. Pasteurella multocida Pseudomonas i inne pałeczki niefermentuja˛ce Staphylococcus aureus Streptococcus pyogenes Streptococcus (inne gatunki) Podłoża i odczynniki diagnostyczne Podłoża do izolacji Agar z krwia˛ Agar MacConkeya Agar z mannitolem Płynne podłoże tioglikolanowe (z indykatorem) (może być zasta˛pione podłożem z wycia˛giem mie˛snym, bulionem Schaedlera lub bulionem Wilkins-Chalgrena) Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) 166 Priorytet 1 1 2 2 2 CZE˛ŚĆ II Odczynniki diagnostyczne Test na katalaze˛ (H2O2) Osocze do wykrywania koagulazy Odczynnik do wykrywania oksydazy Generator wodoru do anaerostatu 1 1 1 2 Lista rekomendowanych podłoży i odczynników diagnostycznych dla laboratoriów mikrobiologicznych o średnim poziomie referencyjności Podłoża hodowlane Podłoże rekomendowane Alternatywne Stopień referencyjności Agar z żółcia˛ i eskulina˛ 1 Agar z krwia˛(patrz agar tryptozowo-sojowy) 1 Agar z brolacyna˛ Agar z laktoza˛i fioletem krystalicznym, agar CLED 1 Podłoże jajeczne Dorseta 1 Żelazowy agar Kliglera (KIA) Podłoże Löfflera z surowica˛ 1 Podłoże Löwensteina-Jensena Agar MacConkeya (z fioletem krystalicznym) 1 Eozynowy agar z błe˛kitem metylenowym Agar MacConkeya (bez fioletu krystalicznego) Podłoże ruch-indol-ureaza (MIU) 1 1 Podłoże do wykrywania ruchu + bulion ureazowy + woda peptonowa (tryptonowa) 1 Agar Mueller-Hintona 1 Dekstrozowy agar Sabouraud 1 Deoksycholanowy agar cytrynianowy Agar Salmonella-Shigella (SS) 1 Agar tryptozowo-sojowy (TSA) Agar Columbia 1 Bulion tryptozowo-sojowy (TSB) Bulion mózgowo-sercowy TCBS Podłoże transportowe (Amies) Woda peptonowa Andrade 1 1 Podłoże transportowe (Stuarta lub Cary’ego-Blaira) 1 Czerwony bulion fenolowy 2 Bulion z dekarboksylaza˛ (Möller) 2 Agar z mannitolem (MSA) 2 Bulion z selenitem F 2 Agar cytrynianowy Simmonsa 2 Podłoże tioglikolanowe Agar z DNaza˛ 167 Bulion Schaedlera, bulion do hodowli beztlenowców Wilkensa-Chalgrena, podłoże z wycia˛giem mie˛snym 2 3 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE Inhibitory i antybiotyki stosowane jako dodatek do podłoży lub odczynnik Chloramfenikol (do izolacji grzybów) Antybiotyki dodawane do podłoża dla gonokoków: wankomycyna, kolistyna, nystatyna (trimetoprim): VCN (VCNT) Dodatek antybiotyków do podłoża dla Campylobacter Roztwór tellurynu (do izolacji Corynebacterium diphtheriae) Bacytracyna (do izolacji Haemophilus spp.) Wankomycyna (do izolacji Haemophilus ducreyi lub H. influenzae) 1 1 2 2 3 3 Dodatki wzbogacaja˛ce podłoża IsoVitaleX (Polyvitex, Vitox, suplement B, suplement VX, suplement CVA) Polianetosulfonian sodu (SPS) 2 3 Kra˛żki, tabletki lub paski Kra˛żek z bacytracyna˛ Kra˛żek z nitrocefina˛ (Cefinaza) lub odczynnik Test ONPG Kra˛żek z optochina˛ Odczynnik do wykrywania oksydazy PGUA (β-glukuronidaza) Czynniki V i XV Kra˛żek z nowobiocyna˛ (5 µg) Test PYR Trójmaślan glicerylu (trójbutyryna) Kra˛żek z czynnikiem wibriostatycznym O:129 1 1 1 1 1 1 2 3 3 3 3 Zestawy diagnostyczne Zastaw do szybkiej serodiagnostyki bakterii wywołuja˛cych zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych Zestaw do identyfikacji serogrup paciorkowców hemolizuja˛cych 3 3 Inne odczynniki diagnostyczne Skala z siarczanem baru (dla metody Kirby-Bauera) (skala MacFarlanda — przyp. tłum.) Zestaw do barwienia metoda˛ Grama Nadtlenek wodoru (H2O2) (katalaza) Odczynnik Kovacsa (do indolu) Odczynnik do wykrywania oksydazy (dimetyl-p-fenylenodiamina) Osocze (do testu na koagulaze˛ i testu filamentacji) Zestaw do barwienia metoda˛ Ziehl-Neelsena 168 1 1 1 1 1 1 1 CZE˛ŚĆ II Buforowany fizjologiczny roztwór soli z glicerolem (do transportu kału) We˛glowodany: glukoza, laktoza, maltoza, mannitol, sacharoza Generator wodoru do anaerostatu Tusz chiński (do wykrywania otoczek) Lizyna (do wykrywania dekarboksylazy) 2 2 2 2 2 Kra˛żki do oznaczania lekowrażliwości Lista ważnych antybiotyków wg WHO (2002) amoksycylina ampicylina benzylopenicylina chloramfenikol ciprofloksacyna kotrimoksazol (sulfametoksazol-trimetoprim) kloksacylina erytromycyna gentamycyna kanamycyna kwas nalidyksowy nitrofurantoina sulfonamid tetracyklina (lub doksycyklina) trimetoprim Lista antybiotyków rezerwowych amoksycylina/kwas klawulanowy amikacyna cefalotyna cefazolina cefotaksym ceftazydym ceftriakson cefuroksym ciprofloksacyna i inne fluorochinolony klindamycyna piperacylina wankomycyna Surowice do aglutynacji Salmonella: 169 poliwalentna surowica anty-O (A-I i Vi) surowice anty-O: O:2 (A), O:4 (B), O:9 (D), Vi surowice anty-H: H:a, H:b, H:d, H:i, H:m, H:2 surowice anty-H fazy inwersji: H:b, H:i, H:1,2 Priorytet 1 2 3 3 PATOGENY, PODŁOŻA I ODCZYNNIKI DIAGNOSTYCZNE Shigella: poliwalentne surowice anty-dysenteriae, anty-flexneri, anty-boydii, anty-sonnei surowica anty-dysenteriae typ 1 (Shiga) Vibrio cholerae: poliwalentna surowica anty-Ol surowica anty-B (Ogawa), anty-C (Inaba), anty-O:139 Haemophilus influenzae: surowica typowa anty-b Neisseria meningitidis: poliwalentna surowice grupowe anty-A, anty-B, anty-C 170 1 1 1 3 3 3 3 Wybrana literatura uzupełniaja˛ca August M.J. et al.: Quality control and quality assurance practices in clinical microbiology. Cumitech, 1990, 3A: 1 – 14. Basics of quality assurance for intermediate and peripheral laboratories, 2nd ed. Alexandria, WHO Regional Office for the Eastern Mediterranean, 2000. Baron E.J., Finegold S.M.: Diagnostic microbiology, 8th ed. St Louis, MO, The C.V. Mosby Company, 1990. Blazevic D.J. et al.: Practical quality control procedures for the clinical microbiology laboratory. Cumitech, 1976, 3: 1 – 12. Cheesbrough M.: Medical laboratory manual for tropical countries. Vol. II: Microbiology. London, Tropical Health Technology/Butterworths, 1989. Collins C.H., Lyne P.M.: Microbiological methods, 5th ed. London, Butterworths, 1985. Gillies R.P., Paul J.: Bacteriology illustrated. Edinburgh, Churchill Livingstone, 1983. Howard B.J. et al.: Clinical and pathogenic microbiology. St Louis, MO, The C.V. Mosby Company, 1987. Koneman E.W.: Color atlas and textbook of diagnostic microbiology, 5th ed. Philadelphia, Lippincott, 1997. Miller J.M.: Quality control in microbiology. Atlanta, GA, Centers for Disease Control and Prevention, 1987. Miller J.M., Wentworth B.B.: Methods for quality control in diagnostic microbiology. Washington, DC, American Public Health Association, 1985. Montefiore D.G. et al.: Tropical microbiology. Edinburgh, Churchill Livingstone, 1984. Murray P. et al.: Manual of clinical microbiology, 8th ed. Washington, DC, American Society for Microbiology, 2003. Stokes E.J. et al.: Quality control. In: Clinical bacteriology, 7th ed. London, Edward Arnold, 1993. Turk D.C. et al.: A short textbook of medical microbiology. London, Hodder & Stoughton, 1983. Summanen P. et al.: Wadsworth anaerobic bacteriology manual. Belmont, CA, Star Publishing Company, 1993. 171 Skorowidz Acinetobacter lwofii 20 – 22 – spp., obraz hodowli 83 – w wydzielinie z cewki moczowej u me˛żczyzn 90 Actinomyces israelii 105 Aerobacter butzleri, identyfikacja biochemiczna 67 Aeromonas 162 – caviae, biochemiczne reakcje 65 – – wywoływane zakażenia 49 – hydrophila, biochemiczne reakcje 65 – – wywoływane zakażenia 49 – sobria, wywoływane zakażenia 49 – veroni, biochemiczne reakcje 65 – wste˛pna identyfikacja 61 Agar cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowy (CCFA), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 54 – cysteinowo-tryptozowy (CTA), przechowywanie szczepów długoterminowe 26 – cytrynianowy Simmonsa 21 – czekoladowy 21 – – podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego 38 – deoksycholanowo-cytrynianowy (DCA), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – Hektoen (HEA), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – Kliglera (KIA) 22 – – procedura posiewu i odczytu 56 – 58 – – reakcje typowe Enterobacteriaceae 61 – ksylozo-lizyno-deoksycholanowy (XLD), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – MacConkeya, podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – – podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego 38 – – z fioletem krystalicznym 21 – Mueller-Hintona 21, 126 – Salmonella-Shigella (SS agar) 21 – – podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – siarczanowo-bizmutowy, podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – Tayer-Martina 21, 90, 91 – tellurynowy z krwia˛ selektywny 77 – z cytrynianem deoksycholanu 21 – – tiosiarczanowym, solami żółci i sacharoza˛ (TCBS), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 53 – z krwia˛ 21 – – podłoże dla płynu mózgowo-rdzeniowego 38 172 Agar, z mannitolem 21 – z solami żółci (BSA), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 54 – – i cytrynianem tiosiarczanowym 21 – z zasadowym ekstraktem mie˛snym (MEA), podłoże do hodowli patogenów jelitowych 54 – z żółcia˛ i eskulina˛ 21 – żelazowy trójcukrowy – patrz Agar Kliglera Aglutynacja lateksowa, procedury 156 – surowice 169 Aglutyniny, wykrywanie w gora˛czce 150 AIDS – patrz Zespół nabytego niedoboru odporności Ameby, poszukiwanie w płynie mózgowo-rdzeniowym 37 Amikacyna 123, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Aminoglikozydy 125 Amoksycylina 92, 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Ampicylina 92, 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Anaerostat, kontrola jakości 18 Angina Vincenta 74 Antybiogram – patrz też Lekowrażliwość – jako narze˛dzie badań epidemiologicznych 123 – jako wskazówka do leczenia 122 – karta kontroli jakości 137 – w hodowli z krwi 34 Antybiotyki do rutynowego oznaczania wrażliwości 123 – jako dodatek do podłoży 168 – kra˛żki 127 – lista rezerwowych 169 – określanie wrażliwości, szablon 133 – oznaczanie lekowrażliwości 24, 118, 119, 127, 133 – ste˛żenie w kra˛żkach 135 – strefy zahamowania wzrostu 126, 132, 133 – ważne wg WHO 169 Antygen(y) bakteryjne, wykrywanie 155 – do diagnostyki 23 – H, procedura identyfikacji 70 – somatyczny O, procedura identyfikacji 68 – VDRL, przygotowanie 144, 145 Antykoagulant 32 Arcobacter butzleri, wywoływane zakażenia 50 Autoklaw, kontrola jakości 18 SKOROWIDZ Bacillus anthracis 102, 111, 166 Bacteroides 166 – fragilis 20, 21, 101, 113, 160 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zakażenia szpitalne 103 – – identyfikacja 116, 118 – melaninogenicus – patrz Prevotella melaninogenica Bacytracyna 168 Badanie(a) bakteriologiczne 29 – – rodzaje gwarancji jakości 13 – – zapewnienie jakości 12 – mikrobiologiczne 14, 15 – serologiczne 138 – – metody kontroli jakości 138 – – wyposażenie laboratorium 139 Bakterie beztlenowe 20 – – diagnostyka zakażeń 114 – – identyfikacja 116 – – podłoża do hodowli 115 – – posiew i izolacja 115 – – przechowywanie długoterminowe 26 – – wrażliwość na antybiotyki 118 – – zakażenia 113 – Gram-ujemne kwasooporne 20 – jelitowe, morfologia kolonii 60 – – wste˛pna identyfikacja izolowanych szczepów 56 – kwasooporne, barwienie metoda˛ Ziehl-Neelsena 38 – mikroaerofilne 113 – podział ze wzgle˛du na wymagania tlenowe 113 Bakteriemia 30, 113 – przyczyny 31 Barwienie kwasooporne (Ziehl-Neelsena) 106 – – test jakości 23 – metoda˛ Grama 105 – – – test jakości 23 Barwniki 22 Benzylopenicylina 84, 123, 124, 126, 169 – działanie na Neisseria gonorrhoeae 92 – stefy zahamowania wzrostu 132, 133 Białko, ste˛żenie w poszczególnych typach zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 38 Biegunki, czynniki etiologiczne 48 – w zakażeniach HIV/AIDS 48 Błonica 74 Bordetella pertussis 142 Borrelia burgdorferi 148 Botulizm przyranny 102, 113 Brucella 160 – spp. a bakteriemia i fungemia 31 – wykrywanie aglutynin 150 Bruceloza, miano aglutynin 150 – wykrywanie aglutynin, test probówkowy 152 173 Bruceloza, miano aglutynin, test szkiełkowy 151 – zestaw do wykrywania aglutynin 151 BSA – patrz Agar z solami żółci Bulion azotanowy 21 – do posiewu z krwi 32 – malonianowy 21 – Schaedlera 160 – seleninowy 21 – tioglikolanowy 21 – tryptozowo-sojowy (TSB), 32, 160 – – wybór podłoża dla płynu mózgowo-rdzeniowego 38 – Wilkins-Chalgrena 160 – z mocznikiem, lekko buforowany (UREA), procedura posiewu i odczytu 56 – z wycia˛giem mózgowo-sercowym 160 Burkholderia pseudomallei 160 – – jako przyczyna bakteriemii i fungemii 31 Butelki z podłożem do posiewu krwi 32 Calymmatobacterium granulomatis 96 – – objawy zakażenia 89 Campylobacter coli, identyfikacja biochemiczna 67 – – identyfikacja końcowa 66 – – – wste˛pna 61 – – wywoływane zakażenia 50 – fetus, identyfikacja biochemiczna 67 – hyointestinalis, identyfikacja biochemiczna 67 – jejuni 113 – – identyfikacja biochemiczna 67 – – – końcowa 66 – – – wste˛pna 61 – – wywoływane zakażenia 50 – lari, identyfikacja biochemiczna 67 – spp. 162 – – badanie wizualne próbek kału 52 – – wybór podłoża 18 – upsaliensis, identyfikacja biochemiczna 67 – warunki inkubacji 54 Candida albicans 20, 21, 95, 160, 161, 165 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zapalenie pochwy 93 – – lekowrażliwość 85 – – objawy zakażenia 89 – – obraz hodowli 83 – a zapalenie gardła 75 CCFA – patrz Agar cefoksytyno-cykloseryno-fruktozowy Cefaleksyna 125 Cefalorydyna 125 Cefalotyna 123 – 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Cefalozyna 126 – strefy zahamowania wzrostu 132 SKOROWIDZ Cefamandol 125 – strefy zahamowania wzrostu 132 Cefamycyna 125 Cefapiryna 125 Cefazolina 125, 169 Cefoksytyna 125 Cefotaksym 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Cefradyna 125 Ceftazydym 123, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Ceftriakson 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Cefuroksym 123, 125, 126, 169 – sodium, strefy zahamowania wzrostu 132 Cewka moczowa u me˛żczyzn, zapalenie 90 Chlamydia psittaci 142 – trachomatis 89, 96, 165 – – a odczyn immunofluorescencji 142 – – a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 – – – pochwy u dziewczynek 93 – – – szyjki macicy 93, 95 – – zakażenie w cia˛ży 93 – – – objawy 89 – wykrywanie 90 Chloramfenikol 84, 118, 123, 124, 126, 168, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Chlorek sodu 140 – żelaza/deaminaza fenyloalaniny 21 Chłodziarka, kontrola jakości 18 Cholera 49 – badanie wizualne próbek kału 52 Choroba(y) legionistów 79 – z Lyme 148 – przenoszone droga˛ kontaktów seksualnych, 89 – – próbki do diagnostyki 165 – – spodziewane patogeny 165 Cieplarka, kontrola jakości 18 Ciprofloksacyna 123, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Citrobacter freundi 22 – – biochemiczne reakcje 63 – spp. a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 36 Clostridium botulinum 113 – difficile, wste˛pna identyfikacja 61 – – wywoływane zakażenia 50 – perfringens 20, 102, 113, 166 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zakażenia szpitalne 102 – – identyfikacja 116 – spp. 93 – tetani 113 Corynebacterium diphtheriae 74, 142 – – hodowla 77 – – nosicielstwo 75 174 Cryptococcus neoformans 160, 161 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – posiew 39 – – poszukiwanie w płynie mózgowo-rdzeniowym 37 CTA – patrz Agar cysteinowo-tryptozowy Czas inkubacji a wielkość strefy zahamowania 134 Czerwień metylowa/Voges-Proskauer 21 Czerwonka pełzakowa, badanie wizualne próbek kału 52 Czynnik V, test jakości 23 – XV, test jakości 23 DCA – patrz Agar deoksycholanowo-cytrynianowy Deaminaza fenyloalaniny/chlorek żelaza 21 Dekarboksylaza lizyny 21 – ornityny 21 Dezynfekcja skóry w miejscu wkłucia 31 Diagnostyka mikrobiologiczna, etapy 14 Dihydrolaza argininy 21 Dikloksacylina 124 Doksycyklina 169 Drogi oddechowe dolne, spodziewane patogeny 165 – – górne, spodziewane patogeny 164 – – – zakażenia 73 Edwardsiella tarda, biochemiczne reakcje 63 Enterobacter cloacae 20 – spp. a bakteriemia i fungemia 31 – morfologia kolonii 60 – wste˛pna identyfikacja 56 Enterobacteriaceae 20, 160, 161, 162, 166 – lekowrażliwość 84, 123 – na agarze żelazowym Kliglera (KIA) 60, 61 – obraz hodowli 84 – przechowywanie długoterminowe 25 – wste˛pna identyfikacja 39, 57, 59 – wybór podłoża 17 – w wydzielinie z cewki moczowej u me˛żczyzn 90 – zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 36 Enterococcus faecalis 20, 21 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – szczep kontrolny 127 – faecium 122 – spp., morfologia kolonii 60 Enterokoki 161 Erytromycyna 84, 123, 124 – 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Escherichia coli 20 – 22, 113, 161, 162 – – a bakteriemia i fungemia 31 SKOROWIDZ Escherichia coli, a zakażenia szpitalne 102 – – a zapalenie oskrzeli 80 – – – opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – badanie wizualne próbek kału 52 – – biochemiczne reakcje 63 – – morfologia kolonii 60 – – strefy zahamowania wzrostu 126 – – szczepy standardowe do kontroli jakości 136 – – test β-glukuronidazowy do szybkiej identyfikacji 47 – – w moczu 122 – – wste˛pna identyfikacja 56 – – wykrywanie antygenów 155 – – wywoływane zakażenia 49 Fenetycylina 124 Fenoksymetylopenicylina 124 Fermentacja dekstrozy bez oleju 21 Flukloksacylina 124 Francisella tularensis 152 – – miano aglutynin 150 Fungemia 30 – przyczyny 31 Gardło, flora fizjologiczna 73 – pobieranie materiału do badań 75 – przesyłanie materiału do badań 75 – zapalenie, czynniki bakteryjne 74 Gardnerella vaginalis 95, 165 – – objawy zakażenia 89 – – zapalenie pochwy 93 Gentamycyna 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Glicerol, przechowywanie szczepów długoterminowe 25 Glukoza, ste˛żenie w poszczególnych typach zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 38 β-Glukuronidaza (PGUA), test jakości 23 Gonokoki, przechowywanie szczepów krótkoterminowe 26 – zapalenie gardła 74 Gora˛czka, wykrywanie aglutynin 150 Gronkowce 101 – identyfikacja 108 – przechowywanie długoterminowe 25 – wrażliwość na benzylopenicyliny 133 – w wydzielinie z cewki moczowej u me˛żczyzn 90 Gruźlica płuc 79, 80 Grzyby 20 Haemophilus 142 – ducreyi 96, 165 – – hodowla 98, 99 – – objawy zakażenia 89 – – pobieranie próbki 97 175 Haemophilus influenzae 21, 108, 122, 160, 161 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – – oskrzeli 79, 80 – – – płuc 80 – – lekowrażliwość 85 – – obraz hodowli 83 – – surowice do aglutynacji 164, 170 – – typ b 20 – – w aspiratach z jamy opłucnej 101 – – wste˛pna identyfikacja 39 – – wykrywanie antygenów 155 – parainfluenzae 20 – przechowywanie szczepów krótkoterminowe 26 Hafnia alvei, biochemiczne reakcje 63 HBV – patrz Wirus zapalenia wa˛troby typu B HEA – patrz Agar Hektoen Herpesvirus 96 – a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 HIV/AIDS – patrz Zespół nabytego niedoboru odporności Hodowla(e) 28 – Corynebacterium diphtheriae 77 – Mycobacterium tuberculosis 85, 87 – Neisseria gonorrhoeae 91, 92, 95 – patogenów jelitowych, podłoża 53 – płynu mózgowo-rdzeniowego, wybór podłoża 38 – podłoża 17, 159 – Streptococcus pyogenes 76 – warunki beztlenowe 114 – z krwi 31, 33 Identyfikacja antygenu H 70 – – somatycznego O 68 – Neisseria gonorrhoeae 92 – serologiczna Yersinia enterocolitica 72 – – Salmonella 67, 69 – – – paratyphi A 70 – – – typhi 70 – – Shigella 71 Indol (woda peptonowa) 21 Inhibitory jako dodatek do podłoży 168 Inoculum, ge˛stość a wielkość strefy zahamowania 134 – przygotowanie 137 Interpretacja wyników badań, jakość 13 Jama otrzewnej, drobnoustroje 101 – zapalenie 113 Kał 48 – badanie wizualne próbek 52 – – wste˛pna izolacja 54 SKOROWIDZ Kał, identyfikacja biochemiczna gatunków Campylobacter 67 – – końcowa mikrobiologiczna izolowanych szczepów 62 – – – serologiczna izolowanych szczepów 67 – – wste˛pna izolowanych szczepów 56 – izolacja bakterii wste˛pna 54 – pobieranie próbek do badania 51 – podłoża transportowo-wzbogacaja˛ce 53 – posiew próbek 53 – przesyłanie próbek do badania 51 – spodziewane patogeny 162 Kanamycyna 125, 169 Kandydiaza pochwy 95 Katalaza, test jakości 23 KIA – patrz Agar Kliglera Kiła 96 – diagnostyka, odczyny serologiczne 142 – odczyn VDRL 143 Klebsiella pneumoniae 20, 21 – – a zapalenie oskrzeli 80 – – a zapalenie płuc 80 – spp. a bakteriemia i fungemia 31 – – morfologia kolonii 60 – – wste˛pna identyfikacja 56 Klindamycyna 118, 123, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Kloksacylina 124, 169 Koaglutynacja, procedury 156 Kolistyna 168 Kontakty seksualne, przenoszone choroby 89 Kontrola jakości sprze˛tu 18 – – standardowa procedura 136 – – standardowe szczepy 136 – – wewne˛trzna 16 – – zestaw szczepów 20 – – zewne˛trzna 27 Kotrimoksazol 84, 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Kra˛żek z bacytracyna˛, test jakości 23 – z optochina˛, test jakości 23 – z tellurydem, test jakości 23 Kra˛żki 168 – czas nałożenia a wielkość strefy zahamowania 134 – do oznaczania lekowrażliwości 169 – z antybiotykami 127, 135 – – nakładanie na płytke˛ 137 Krew 30 – antybiogram 34 – butelki z podłożem do posiewu 32 – obje˛tość próbki 31 – pobieranie próbek 31 – podłoża do posiewu 32 – – płynne do hodowli 160 – prowadzenie hodowli 33 – spodziewane patogeny 160 176 Krew, zakażenie a wrażliwość antybiotyków 123 Kre˛tki Reitera 148 – odczyn immunofluorescencji w modyfikacji absorpcyjnej (FTA-Abs) 148 Kryteria jakości w mikrobiologii 14 Kwas klawulanowy 123, 126, 169 – – strefy zahamowania wzrostu 132 – nalidyksowy 123, 126, 169 – – strefy zahamowania wzrostu 132 Laboratoria referencyjne 27 Laboratorium mikrobiologiczne, zapewnienie jakości badań 13 – wyposażenie do badań serologicznych 139 Legionella pneumophila 142 – – metody badań 79 Lekowrażliwość bakterii wyhodowanych z plwociny 84 – kra˛żki do oznaczania 169 – oznaczanie na antybiotyki 133 – – w moczu 47 – – w płynie mózgowo-rdzeniowym 40 – szczepów izolowanych z gardła 78 Leukocytoza w poszczególnych typach zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 38 Listeria monocytogenes 93, 161 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – wste˛pna identyfikacja 39 Łaźnia wodna 139 – – kontrola jakości 18 MEA – patrz Agar z zasadowym ekstraktem mie˛snym Meningokoki, przechowywanie szczepów krótkoterminowe 26 Metoda dyfuzyjno-kra˛żkowa – patrz Metoda Kirby-Bauera Metoda Grama, test jakości barwienia 23 Metoda Kirby-Bauera 119, 120 – – czynniki techniczne 134 – – zmodyfikowana 125 – – – interpretacja stref zahamowania wzrostu 132 – NEO-SENSITABS 119 Metronidazol 118 Metycylina 124 – badanie wrażliwości Staphylococcus aureus 134 Micrococcus spp. 113 Mikrobiologia, kryteria jakości 14 Mikroorganizmy Gram-dodatnie jako przyczyna bakteriemii 31 – – – – fungemii 31 SKOROWIDZ Mikroorganizmy Gram-ujemne jako przyczyna bakteriemii 31 – – – – fungemii 31 Mikroskop, kontrola jakości 18 Mikroskopy 139 MIL – patrz Podłoże ruch-indol-lizyna Minocyklina 124 Mobiluncus spp. a zapalenie pochwy 93 – – objawy zakażenia 89 Mocz, badanie przesiewowe 43 – – z użyciem kalibrowanej ezy 44 – – – pasków bibułowych 44 – hodowla i interpretacja 43 – identyfikacja drobnoustrojów 47 – metody badań przesiewowych 43 – oznaczanie lekowrażliwości 47 – pobieranie materiału do badania, 41, 42 – – u niemowla˛t i dzieci 43 – posiew ilościowy i wste˛pna identyfikacja 44 – – – interpretacja wyników 46 – spodziewane patogeny 161 – zakażenie a wrażliwość antybiotyków 123 Mononukleoza zakaźna 142 Moraxella catarrhalis 20 – – lekowrażliwość 84 – – obraz hodowli 83 – – zapalenie oskrzeli 79 Morganella, biochemiczne reakcje 63 Mycobacterium fortuitum 107 – fortuitum-chelonei 106 – marinum 107 – spp. 166 – tuberculosis 101, 161, 166 – – jako przyczyna zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – hodowla 85, 87 – – – interpretacja 88 – – – zasady bezpieczeństwa 88 – ulcerans 107, 166 Mycoplasma pneumoniae 138 – – metody badań 79 Naegleria fowleri, poszukiwanie w płynie mózgowo-rdzeniowym 37 Nafcylina 124 Narza˛dy płciowe żeńskie, pobieranie próbek 93 – – – transport próbek 93 – – owrzodzenia 96 – – – pobieranie próbek 96 Neisseria gonorrhoeae 20, 21, 122, 165 – – a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 – – – pochwy u dziewczynek 93, 95 – – – szyjki macicy 93 – – badanie wrażliwości na antybiotyki 92 – – hodowla 91, 92, 95 177 Neisseria gonorrhoeae, identyfikacja 92 – – zakażenia, objawy 89 – – – w cia˛ży 93 – meningitidis 20, 21, 122, 160, 161 – – nosicielstwo 75 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – – zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – surowice do aglutynacji 164, 170 – – wste˛pna identyfikacja 39 – – wykrywanie antygenów 155 – przechowywanie szczepów długoterminowe 26 Netylmycyna 125 Niemowle˛ta, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, przyczyny 36 o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd 23 Nitrofurantoina 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Nocardia asteroides 108, 113 Norfloksacyna 123 – strefy zahamowania wzrostu 132 NYC – patrz Podłoże New York City Nystatyna 168 Odczyn aglutynacji 141 – ASO 152 – FTA-Abs 149 – immunofluorescencji 142 – – kre˛tków w modyfikacji absorpcyjnej (FTA-Abs) 148 – kłaczkuja˛cy 141 – precypitacji 141 – RPR 142, 146 – 148 – – jakościowy 147 – – półilościowy 147 Odczyn VDRL 142 – 146 – – półilościowy 145 – Weila-Felixa 150 – Widala 150 – Wrighta 150 Odczynnik Nitrocefin 92 Odczynniki 22, 126 – diagnostyczne 159, 168 – – do hodowli płynu mózgowo-rdzeniowego 161, 162 – – – próbek z układu moczowo-płciowego 166 – – – z dolnych dróg oddechowych 165 – – – z górnych dróg oddechowych 164 – – do kału 163 – – w hodowli krwi 160 – – – ropy 167 – do badań serologicznych 140 – testy jakości 23 Odczyny aglutynacji lateksowej, procedury 156 – serologiczne 138 – – w diagnostyce kiły 142 SKOROWIDZ Odleżyny, owrzodzenia, pobieranie próbek 104 Oksacylina 84, 123, 124, 126 – badanie wrażliwości Staphylococcus aureus 134 – strefy zahamowania wzrostu 132 Oksydaza, test jakości 23 Oleandomycyna 125 Olej mineralny, przechowywanie szczepów długoterminowe 25 ONPG – patrz o-Nitrofenylo-β-D-galaktopiranozyd Oparzenia, drobnoustroje 101 – pobieranie próbek 104 Opony mózgowo-rdzeniowe, przyczyny zapalenia 36 Oskrzela, zapalenie 80 Osocze do koagulazy, test jakości 23 Owrzodzenia narza˛dów płciowych, badanie bezpośrednie próbki 97 – – – hodowla 98 – – – pobieranie próbek 96 – odleżynowe, pobieranie próbek 104 – Buruli 107 Paciorkowce 160 – α-hemolizuja˛ce jako przyczyna bakteriemii i fungemii 31 – β-hemolizuja˛ce, różnicowanie 77 – przechowywanie szczepów 26 – w aspiratach z jamy opłucnej 101 – zielenieja˛ce 160 – – a bakteriemia i fungemia 31 Pałeczki beztlenowe Gram-dodatnie, wste˛pna identyfikacja 58 – – Gram-ujemne, wste˛pna identyfikacja 59 – Gram-ujemne 20 Papilomavirus, objawy zakażenia 89 Paski 168 – bibułowe do badania moczu 44 Pasteurella multocida 102, 110, 166 Patogeny 159 – jelitowe, podłoża do hodowli 53 Peptostreptococcus, identyfikacja 117 – magnus 113 – spp. a ropień płuca 80 – – jako przyczyna bakteriemii i fungemii 31 PGUA – patrz β-Glukuronidaza Piperacylina 123, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Piwampicylina 125 Plesiomonas 162 – shigelloides, biochemiczne reakcje 63, 65 Plwocina, badanie mikroskopowe 82 – hodowla i interpretacja 82 – ocena makroskopowa 81 178 Plwocina, pobieranie próbek 81 – podłoża do hodowli 83 – ropna, badania 79 Płuca, gruźlica 80 – zapalenie 80 Płyn mózgowo-rdzeniowy, badanie mikroskopowe 37 – – barwienie preparatów metoda˛ Grama 37 – – cechy w zapaleniu opon 38 – – ocena makroskopowa 37 – – oznaczanie lekowrażliwości 40 – – pobieranie 36 – – spodziewane patogeny 161 – – transport próbek 36 Płytka hodowlana, sposób posiewu bakterii 45 Pneumokoki w aspiratach z jamy opłucnej 101 Podłoża do hodowli 17, 159 – – bakterii beztlenowych 115 – – kału 163 – – płynu mózgowo-rdzeniowego 161 – – z plwociny 83 – do identyfikacji w hodowli płynu mózgowo-rdzeniowego 162 – do izolacji w hodowli krwi 160 – – – płynu mózgowo-rdzeniowego 162 – – – próbek z układu moczowo-płciowego 166 – – – ropy 166 – – – z dolnych dróg oddechowych 165 – – – z górnych dróg oddechowych 164 – do posiewu krwi 32 – gotowe, przechowywanie 20 – hodowlane, dodatki wzbogacaja˛ce 168 – – rekomendowane 167 – płynne do hodowli krwi 160 – przygotowywane, kontrola jakości 20 – testy kontrolne 21 – z wycia˛giem mie˛snym, przechowywanie długoterminowe bakterii beztlenowych 26 Podłoże agarowe Thayer-Martina modyfikowane 21, 90, 91 – jajeczne Dorseta 77 – New York City 91 – ruch-indol-lizyna, procedura posiewu i odczytu 56, 57 – suche, zamawianie i przechowywanie 18 – tioglikolonowe płynne 160 – z mocznikiem 22 – z tellurynem, taurocholanem i żelatyna˛ (TTG) dla patogenów jelitowych 54 – przygotowanie 20 – skład a wielkość strefy zahamowania 134, 135 Porphromonas w aspiratach z jamy opłucnej 101 SKOROWIDZ Prevotella melaninogenica a ropień płuca 80 – w aspiratach z jamy opłucnej 101 Proteus mirabilis 20 – 22 – spp. a bakteriemia i fungemia 31 – – biochemiczne reakcje 63 – – wste˛pna identyfikacja 56 Proteus, morfologia kolonii 60 – strefy zahamowania wzrostu 133 – vulgaris 150 Providencia, biochemiczne reakcje 63 – spp. 60 Przecinkowce w kale, reakcje biochemiczne 65 Przeciwciała, oznaczanie 138 Przetoki, pobiernie próbek 104 Pseudobakteriemia, przyczyny 32 Pseudomonas 162, 166 – aeruginosa 20, 21, 101, 160 – – a zapalenie oskrzeli 80 – – – płuc 80 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – stefy zahamowania wzrostu 126 – – szczepy standardowe do kontroli jakości 136 – – wrażliwość na antybiotyki 123 – jako przyczyna bakteriemii i fungemii 31 – obraz hodowli 83 – spp. w wydzielinie z cewki moczowej u me˛żczyzn 90 Rany 100 – cie˛te 102 – dra˛ża˛ce, pobieranie próbek 104 – drenuja˛ce we˛złów chłonnych, pobieranie próbek 104 – penetruja˛ce 101, 102 – pooperacyjne, pobieranie próbek 104 – próbki chirurgiczne 100 – zakażenia szpitalne 102 Reakcje serologiczne 141 Rickettsia spp. 142 Riketsje, wykrywanie aglutynin 150 Ropa, odczynniki diagnostyczne 167 – podłoża do izolacji 166 – spodziewane patogeny 166 Ropień(nie) 100, 113 – otorbiony, drobnoustroje 101 – płuca 80 – próbki chirurgiczne 100 – pobieranie i transport próbek 103 Ropniak opłucnej 113 Rotawirusy 142 – wywoływane zakażenia 50 Salmonella 122, 160, 162 – arizonae, biochemiczne reakcje 63 – biochemiczne reakcje 63 – choleraesuis, biochemiczne reakcje 63 179 Salmonella, identyfikacja końcowa 62 – – serologiczna 67, 68 – – – wste˛pna 58 – paratyphi A, biochemiczne reakcje 63 – – identyfikacja serologiczna 71 – spp., identyfikacja 56 – – morfologia kolonii 60 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – – zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 36 – surowice do aglutynacji 163, 169 – typhi, biochemiczne reakcje 63 – – identyfikacja serologiczna 70 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – wste˛pna identyfikacja 56 – – wykrywanie aglutynin 150 – typhimurium 20 – wykrywanie antygenów 155 – wywoływane zakażenia 48 Salmonelozy, badanie wizualne próbek kału 52 Schemat Kauffmanna-White’a 68 Sepsa 30 Serratia marcescens 20, 21 – – biochemiczne reakcje 63 Shigella 162 – badanie wizualne próbek kału 52 – boydii 72 – – biochemiczne reakcje 63, 64 – dysenteriae 71 – – biochemiczne reakcje 63, 64 – flexneri 20 – 22, 72 – – biochemiczne reakcje 63, 64 – identyfikacja końcowa 65 – – serologiczna 71 – – wste˛pna 58 – paratyphi 162 – reakcje biochemiczne 63 – sonnei 72 – – biochemiczne reakcje 63, 64 – spp., morfologia kolonii 60 – – wste˛pna identyfikacja 56 – surowice do aglutynacji 164, 170 – typhi 162 – typhimurium 21, 22 – wykrywanie antygenów 155 – wywoływane zakażenia 49 Skaleczenia zakażone, pobieranie próbek 104 Skóra, drobnoustroje 101 Spiramycyna 125 Sprze˛t laboratoryjny, dbałość 17 – – kontrola jakości 18 SS agar – patrz Agar Salmonella-Shigella Staphylococcus agalactiae 20, 93 – aureus 20, 21, 93, 107 – 110, 113, 142, 160, 166 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zakażenia szpitalne 102 SKOROWIDZ Staphylococcus aureus, a zapalenie oskrzeli 80 – – – płuc 80 – – badanie wrażliwości na metycyline˛ 134 – – – – na oksacyline˛ 134 – – lekooporność 112 – – nosicielstwo 75 – – obraz hodowli 83 – – stefy zahamowania wzrostu 126 – – szczepy standardowe do kontroli jakości 136 – epidermidis 20, 21, 108 – 110 – – lekooporność 112 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – mitis 20 – pneumoniae 20 – pyogenes 20 – różnicowanie szczepów 110 – saprophyticus 108 – 110, 162 – – spp. przyczyna˛ zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 36 – wrażliwość na antybiotyki 123 – wste˛pna identyfikacja 109 Sterylizator szkła, kontrola jakości 18 Strefy zahamowania wzrostu, odczytywanie wyników 137 Streptococcus 142, 166 – agalactiae 161 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – – zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – wste˛pna identyfikacja 39 – – wykrywanie antygenów 155 – α-hemolizuja˛cy 21 – pneumoniae 21, 160, 161 – – a bakteriemia i fungemia 31 – – a zapalenie oskrzeli 79 – – – opon mózgowo-rdzeniowych 36 – – – płuc 80 – – lekowrażliwość 84, 85 – – obraz hodowli 83 – – wykrywanie antygenów 155 – – wste˛pna identyfikacja 39 – pyogenes 21, 122, 142, 160, 166 – – hodowla 76 – – nosicielstwo 7 – – odczyn ASO 152 – – przyczyna˛ bakteriemii i fungemii 31 – – – zapalenia gardła 74 Streptomycyna 125 Sulfafurazol 125 Sulfametoksazol 125, 169 Sulfizoksazol 126 – strefy zahamowania wzrostu 132 Sulfonamidy 123, 125, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132, 133 Surowica(e) 28, 140 – do aglutynacji 169 180 Surowica(e), do aglutynacji w kale 163 – Loefflera 77 – odpornościowe do diagnostyki 23 Szczepy izolowane z gardła, badanie lekowrażliwości 78 – kontrolne, pozyskiwanie 24 – – przechowywanie długoterminowe 25 – – – krótkoterminowe 26 – standardowe do kontroli jakości 136 Szyjka macicy, zapalenie 93 Tabletki 168 Talampicylina 125 TCBS – patrz Agar z cytrynianem tiosiarczanowym, solami żółci i sacharoza˛ Temperatura inkubacji a wielkość strefy zahamowania 134 Termin ,,oporny’’, definicja 120 – ,,wrażliwy’’, definicja 120 Test(y) aglutyncji lateksowy ASO, probówkowy 153, 154 – – – – szkiełkowy 153, 156 – – szkiełkowej 155 – – – bezpośredni 68 – CAMP odwrotny 117 – czułość diagnostyczna 16 – dyfuzji 120 – ELISA 155, 156 – FTA-Abs – patrz Odczyn immunofluorescencji kre˛tków w modyfikacji absorpcyjnej – β-glukuronidazowy do identyfikacji E. coli 47 – hemaglutynacji pośredniej 66 – IFA (indirect fluorescent antibody) – patrz Odczyn immunofluorescencji – kontrolne dla podłoży 21 – laboratoryjne, gwarancja jakości 13 – – kontrola jakości 13 – – ocena jakości 14 – – wiarygodność 12 – lekowrażliwości, kontrola jakości 136 – na oksydaze˛, procedura 60 – optyczny immunologiczny 156 – probówkowy do wykrywania aglutynin w brucelozie 152 – rozcieńczeń 120 – RPR 141 – szkiełkowy do wykrywania aglutynin w brucelozie 151 – szybkie do hodowli płynu mózgowo-rdzeniowego 161 – – – z górnych dróg oddechowych 164 – śluzowy, procedura 61 – VDRL 141 – wrażliwości na polimiksyne˛ B 66 – z nitrocefina˛ 92 – z surowicami odpornościowymi Shigella 71 SKOROWIDZ Test(y), swoistość diagnostyczna 16 – ,,złoty’’ immunologiczny 156 Tetracyklina 84, 123, 124, 126, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Te˛żec 113 – a rana penetruja˛ca 102 Tiamfenikol 124 Tkanka(i) podskórna, drobnoustroje 101 – – zapalenie 113 – zakażenie a wrażliwość antybiotyków 123 Tobramycyna 123, 125, 126 – strefy zahamowania wzrostu 132 Treponema pallidum 96, 141, 142, 148, 165 – – badanie bezpośrednie 97, 98 – – objawy zakażenia 89 – – pobieranie próbki 96 Trichomonas vaginalis a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 Trimetoprim 123, 125, 126, 168, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 Trypanosoma, poszukiwanie w płynie mózgowo-rdzeniowym 37 TSB – patrz Bulion tryptozowo-sojowy TTG – patrz Podłoże z tellurynem, taurocholanem i żelatyna˛ Ugryzienia przez zwierze˛ta 102 Układ moczowo-płciowy, próbki do diagnostyki chorób przenoszonych droga˛ kontaktów seksualnych 165 – pokarmowy, zakażenie a wrażliwość antybiotyków 123 UREA – patrz Bulion z mocznikiem, lekko buforowany Ureaplasma urealyticum a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 Utlenianie dekstrozy bez oleju 21 Vibrio cholerae 20, 162 – – biochemiczne reakcje 65 – – biotypy, różnice 65 – – identyfikacja końcowa 65 – – – wste˛pna 59, 61 – – posiew kału 53 – – surowice do aglutynacji 164, 170 – – wykrywanie antygenów 155 – – wywoływane zakażenia 49 – fluvialis, biochemiczne reakcje 65 – – wywoływane zakażenia 49 – furnissii, biochemiczne reakcje 65 – hollisae, biochemiczne reakcje 65 – – wywoływane zakażenia 49 – mimicus, biochemiczne reakcje 65 – – wywoływane zakażenia 49 – parahaemolyticus, wste˛pna identyfikacja 59 – – wywoływane zakażenia 49 – spp. 21 181 Vibrioparahaemolyticus, biochemiczne reakcje 65 Voges-Proskauer – patrz Czerwień metylowa/Voges-Proskauer Waginoza bakteryjna 93 Wankomycyna 126, 168, 169 – strefy zahamowania wzrostu 132 We˛zły chłonne, drobnoustroje 101 Wirówka, kontrola jakości 18 Wirus cytomegalii, objawy zakażenia 89 – Epsteina-Barr 142 – HIV – patrz Wirus nabytego niedoboru odporności – nabytego niedoboru odporności, objawy zakażenia 89 – opryszczki 96 – – a zapalenie cewki moczowej u me˛żczyzn 90 – – objawy zakażenia 89 – różyczki 142 – zapalenia wa˛troby typu B, objawy zakażenia 89 Woda peptonowa (indol) 21 Wrzód mie˛kki 96 Wstrza˛sarki 139 Wścieklizna 102 Wydzielina(y) ropne 100 – – badanie lekowrażliwości 112 – – – mikroskopowe105 – – hodowla 107 – – identyfikacja drobnoustrojów 108 – – ocena makroskopowa 104, 105 – z cewki moczowej u me˛żczyzn, transport próbek 90 – – badanie bezpośrednie i interpretacja 91 – – pobieranie 90 – z pochwy, badanie bezpośrednie i interpretacja 94 – – hodowla 95 – – nieprawidłowa, przyczyny 93 Wykrywanie antygenów bakteryjnych 155 Wymaz z odbytu, pobieranie 52 Wymazówki 127 Wyrostek robaczkowy, zapalenie 113 Wysie˛k(i), drobnoustroje 101 – komórkowy biegunkowego kału, badanie 52 – pobieranie próbek 104 – ropny 100 – – próbki chirurgiczne 100 – spodziewane patogeny 166 Wzorzec zme˛tnienia 127 XLD – patrz Agar ksylozo-lizyno-deoksycholanowy SKOROWIDZ Yersinia enterocolitica 20, 21, 162 – – biochemiczne reakcje 64 – – identyfikacja końcowa 64 – – – serologiczna 72 – – – wste˛pna 56, 58 – – miano aglutynin 150 – – morfologia kolonii 60 – wywoływane zakażenia 50, 51 – frederiksenii, biochemiczne reakcje 64 – intermedia, biochemiczne reakcje 64 – kristensenii, biochemiczne reakcje 64 – pseudotuberculosis, biochemiczne reakcje 64 Zadrapania przez zwierze˛ta 102 Zakażenia bakteriami beztlenowymi 113, 114 – dróg oddechowych dolnych 79 – – – górnych 73 – – – – hodowla i identyfikacja 76 – – – – mikroskopia bezpośrednia 76 – ran szpitalne 102 Zapalenie cewki moczowej u kobiet 93 – – – u me˛żczyzn 90 – gardła, czynniki bakteryjne 74 – – gonokokowe 74 – – martwicze, wrzodzieja˛ce 74 182 Zapalenie, jamy otrzewnej 113 – narza˛dów miednicy u kobiet 93, 94 – opon mózgowo-rdzeniowych, cechy płynu 38 – – – gruźlicze, posiew 38 – – przyczyny 36 – – typy 38 – oskrzeli i płuc 80 – – ostre 79 – – przewlekłe 79 – płuc 80 – – pierwotne atypowe 79 – – wywołane przez chlamydie 79 – pochwy 93 – – niespecyficzne – patrz Waginoza – szyjki macicy 93 – tkanki podskórnej 113 – wyrostka robaczkowego 113 Zespół nabytego niedoboru odporności, biegunki 48 Zestawy diagnostyczne 168 Zgorzel gazowa 113 Ziarenkowce Gram-dodatnie 20 Ziarniniak pachwiny 96 – – pobieranie próbki 97 Żelatynaza 21