sylabus - Samodzielna Katedra Biotechnologii i Biologii Molekularnej

Kod ECTS: 6.15.Z-BM-12
Nazwa przedmiotu
BIOLOGIA MOLEKULARNA
Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot
Samodzielna Katedra Biotechnologii i Biologii Molekularnej
Studia
kierunek
Biotechnologia
stopień
I (licencjat)
tryb
niestacjonarne
Nazwisko osoby prowadzącej (osób prowadzących)
dr hab. Anna Krop-Watorek, prof. U.O.
dr Ewa Boniewska-Bernacka
Formy zajęć, sposób ich realizacji i przypisana im liczba godzin
A. Formy zajęć
• wykład
• ćwiczenia laboratoryjne
B. Sposób realizacji
• zajęcia w sali dydaktycznej
C. Liczba godzin
• 10W, 20L
specjalność
specjalizacja
Liczba punktów ECTS 4
Godziny kontaktowe
udział w wykładach: 10 h
udział w zajęciach laboratoryjnych: 20h
Praca własna studenta
przygotowanie do ćw. laboratoryjnych: 25h
przygotowanie sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych
15h
przygotowanie do egzaminu i obecność na egzaminie:
35h
W (45h) 2 ECTS) + L (2 p. ECTS) = 4 p. ECTS
Status przedmiotu
• obowiązkowy
Metody dydaktyczne
•
•
wykład z prezentacją multimedialną
laboratorium: ćwiczenia laboratoryjne,
dyskusja, pokaz
Język wykładowy
polski
Forma i sposób zaliczenia oraz podstawowe kryteria oceny lub
wymagania egzaminacyjne
A. Sposób zaliczenia
• egzamin pisemny (W)
• zaliczenie z oceną (L)
B. Formy zaliczenia
W - egzamin pisemny z pytaniami otwartymi i pytaniami testowymi
L - ocena zaliczeniowa na podstawie ocen cząstkowych
otrzymywanych w trakcie trwania semestru ze sprawdzianów,
aktywności na zajęciach i sprawozdań
C. Podstawowe kryteria
W: do zdania egzaminu wymagane jest udzielenie poprawnych
odpowiedzi na pytania obejmujące 60% materiału
L: ustalenie oceny zaliczeniowej na podstawie ocen cząstkowych,
aktywności na zajęciach i poprawności sprawozdań
Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymogami wstępnymi
A. Wymagania formalne: zaliczone kursy z Biologii Komórki, i Genetyki
B. Wymagania wstępne:
dobra orientacja w zagadnieniach z Biologii Komórki, biegła znajomość budowy białek i kwasów nukleinowych,
umiejętność czytania ze zrozumieniem instrukcji do ćwiczeń i obsługi sprzętu laboratoryjnego; zdolność indywidualnego doboru
właściwych źródeł uzupełniających (podręczników, materiałów internetowych); przestrzeganie zasad BHP
Cele przedmiotu
Student powinien poznać i rozumieć budowę genu i regulację ekspresji genów, sekwencję wydarzeń i uwarunkowania dogmatu
biologii molekularnej (replikacja, mutacja i naprawa DNA; transkrypcja, powstawanie, dojrzewanie i transport mRNA;
translacja). Ponadto, celem przedmiotu jest zapoznanie studentów z metodyką badań materiału genetycznego (klonowanie i
sekwencjonowanie DNA, biblioteki genomowe i cDNA, metoda PCR i jej praktyczne wykorzystanie, hybrydyzacja kwasów
nukleinowych, hybrydyzacja in situ).
zajęcia laboratoryjne: mają na celu zdobycie praktycznych umiejętności izolacji materiału genetycznego z komórek
prokariotycznych i eukariotycznych (metody izolacji genomowego i plazmidowego DNA, RNA, elektroforeza kwasów
nukleinowych).
Treści programowe
A. Problematyka wykładu: obejmuje - wprowadzenie podstawowych pojęć stosowanych w biologii molekularnej; odkrycia
w poszukiwaniu czynnika genetycznego, DNA i rodzaje RNA; zmiany w strukturze chromatyny, modyfikacje chemiczne
histonów w powiązaniu z aktywnością genu. Chromosomy, telomery i telomeraza, aberacje strukturalne chromosomów,
hybrydyzacja in situ, chromosom Philadelphia. Replikacja i jej mechanizm u pro- i eukariota, mechanizm działania polimeraza
DNA, PCR. Rekombinacja homologiczna, naprawa uszkodzonego DNA, progeria.
Choroby wywołane dziedziczeniem zmiennej wielkości segmentów DNA i aberracjami liczbowymi chromosomów.
Transkrypcja, potranskrypcyjna obróbka premRNA, negatywna i pozytywna regulacja transkrypcji, represory i induktory,
rodzaje i działanie czynników transkrypcyjnych, białka regulatorowe. Interferencyjny RNA (iRNA), wyciszenie genów,
translacja i degradacja białek, klonowanie i inżynieria genetyczna, organizmy transgeniczne.
B. Problematyka laboratorium: Izolacja DNA i RNA z komórek bakteryjnych metodą mikrokolumnową. Wykrywanie (1)
mutacji w genie CCR5 Homo sapiens i (2) obecności Salmonella sp. w produktach spożywczych metodą PCR. Transformacja
komórek E. coli wektorem plazmidowym pUC9 i komórek Saccharomyces cerevisiae wektorem wahadłowym pFL44L. Analiza
wyników transformacji. Degradacja DNA
Wykaz literatury
Efekty kształcenia
A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć (zdania egzaminu):
A.1. wykorzystywana podczas zajęć
• Węgleński P. Genetyka molekularna, PWN, 2008
• Berg JM., Tymoczko JL., Stryer L., Biochemia, PWN, 2009
• A.2. studiowana samodzielnie przez studenta
• Allison LA., Podstawy biologii molekularnej, Wydawnictwo uniwersytetu warszawskiego, 2007
• Brown TA., Genomy, PWN, 2001
• Augustyniak J. i Michejda J., Biologia molekularna, PWN, 1999
• Bates AD., McLennan AG., Turner PC., White MRH., Biologia Molekularna, Krótkie wykłady, PWN, 2009
• King RC, Stansfield WD, Słownik terminów genetycznych, Ośrodek Wydawnictw Naukowych, PAN, Poznań,
2002
B. Literatura uzupełniająca
• Garrett RH., Grisham CM., Biochemistry, 2005
• Alberts B., Johnson A., Lewis J.,. Raff M., Roberts K., Walter P., Molecular Biology of the Cell,
4th ed, Garland Publishing, 2002
Wiedza
W1 Charakteryzuje podstawowe zjawiska i procesy biologii molekularnej
W2 Opisuje przebieg i zależności dogmatu biologii molekularnej
W3 Opisuje mechanizmy molekularne replikacji, transkrypcji i translacji, przepływu informacji genetycznej i regulacji
ekspresji genów
W4 Opisuje reguły dziedziczenia posługując się opisem molekularnym i genetycznym oraz uwarunkowania
różnorodności biologicznej
W5 Wymienia podstawowe zasady stosowania technik inżynierii genetycznej i komórkowej oraz biotechnologii,
możliwości ich wykorzystania w praktyce, jak również obwarowania bioetyczne
W6 Posługuje się podstawową terminologią naukową w języku polskim i angielskim z zakresu biologii molekularnej i
dziedzin pokrewnych
Umiejętności
U1 Samodzielnie prowadzi doświadczenia związane z izolacją, oczyszczaniem i charakterystyką materiału
genetycznego pod kierunkiem opiekuna
U2 Potrafi uczyć się samodzielnie
U3 Czyta ze zrozumieniem naukowe teksty z dziedziny biologii molekularnej i biotechnologiii w języku angielskim
oraz komunikuje się w tym języku na poziomie B2
U4 Samodzielnie wyszukuje i korzysta z dostępnych źródeł informacji naukowych, w tym elektronicznych
U5 Opracowuje wyniki badań eksperymentalnych, szacuje błędy i niepewność pomiarów
Kompetencje społeczne (postawy)
K1 Rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie oraz podnoszenia kompetencji zawodowych i osobistych
K2 Postępuje zgodnie z zasadami bioetyki
K3 Myśli i działa w sposób przedsiębiorczy wykorzystując wiedzę biologiczną i biotechnologiczną
K4 Reaguje prawidłowo w sytuacji zagrożenia
Kontakt
dr hab. Anna Krop-Watorek
e-mail:[email protected]
tel: 695519468
dr Ewa Boniewska-Bernacka
e-mail:[email protected]
tel: 77 401 60 47