8.Biostatystyka z elementami informatyki cz.II

PROGRAM NAUCZANIA PRZEDMIOTU OBOWIĄZKOWEGO
NA WYDZIALE LEKARSKIM I
ROK AKADEMICKI 2016/2017
PRZEWODNIK DYDAKTYCZNY dla STUDENTÓW II ROKU STUDIÓW
1. NAZWA PRZEDMIOTU :
BIOSTATYSTYKA Z ELEMENTAMI INFORMATYKI cz.I I
2. NAZWA JEDNOSTKI realizującej przedmiot:
Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki
3. Adres jednostki odpowiedzialnej za dydaktykę:

Adres: ul. Dąbrowskiego 79, 60-529 Poznań

Tel. 61 854 68 08; Fax. 61 854 69 43

Strona WWW: www.kzis.ump.edu.pl

E-mail: [email protected]
4. Kierownik jednostki:

Prof. dr hab. Jerzy A. Moczko
5. Osoba zaliczająca przedmiot w E-indeksie z dostępem do platformy WISUS

Prof. dr hab. Jerzy A. Moczko
6. Osoba odpowiedzialna za dydaktykę na Wydziale Lekarskim I z dostępem do
platformy WISUS (listy studentów) ( koordynator przedmiotu) :

Nazwisko: dr Agnieszka Wiesiołowska

Tel. kontaktowy: 61 854 68 09

Możliwość kontaktu (dni, godz., miejsce): godziny dyżurów na stronie internetowej
Katedry www.kzis.ump.edu.pl

E-mail: [email protected]

Osoba zastępująca: dr Barbara Więckowska

Kontakt: [email protected]; tel. 61 854 68 13
7. Miejsce przedmiotu w programie studiów:
Rok: II
Semestr: 3
8. Liczba godzin ogółem:
20
liczba pkt. ECTS: 1
Jednostki uczestniczące w nauczaniu przedmiotu
Katedra i Zakład Informatyki i Statystyki
Semestr letni liczba godzin
W
Ć
Ćwiczenia
S
kategoria
20
A
9. SYLABUS
Nazwa
przedmiotu/modułu
Wydział
Nazwa kierunku
studiów
Poziom kształcenia
Forma studiów
Język przedmiotu
BIOSTATYSTYKA Z ELEMENTAMI INFORMATYKI
cz. II
LEKARSKI I
lekarski
jednolite magisterskie
stacjonarne
polski
Obowiązkowy 
Rodzaj przedmiotu
Rok studiów/semestr
Liczba godzin zajęć
dydaktycznych z
podziałem na formy
prowadzenia zajęć
Założenia i cele
przedmiotu
Symbol
efektów
kształcenia
zgodnie ze
standardam
i
I  II  III  IV  V 
VI  
20, w tym:
fakultatywny 
1 2 3 4 5 6 7 8
9  10  11  12 
0- wykłady, 0- seminaria, 20 – ćwiczenia, 0 – fakultety
Celem kształcenia jest zapoznanie studentów z zagadnieniami związanych ze
statystyczną weryfikacją eksperymentalnych danych medycznych
OPIS KIERUNKOWYCH EFEKTÓW KSZTAŁCENIA
Metody weryfikacji
osiągnięcia
zamierzonych
efektów
kształcenia:
WIEDZA (ZGODNIE ZE SZCZEGÓŁOWYMI EFEKTAMI
KSZTAŁCENIA)
B.W32.
zna podstawowe metody analizy statystycznej wykorzystywane w
badaniach populacyjnych i diagnostycznych
B.W34.
zna zasady prowadzenia badań naukowych, obserwacyjnych i
doświadczalnych oraz badań in vitro służących rozwojowi medycyny.
B.U12.
UMIEJĘTNOŚCI (ZGODNIE ZE SZCZEGÓŁOWYMI
EFEKTAMI KSZTAŁCENIA)
dobiera odpowiedni test statystyczny, przeprowadza podstawowe
analizy statystyczne oraz posługuje się odpowiednimi metodami
przedstawiania wyników; interpretuje wyniki metaanalizy, a także
przeprowadza analizę prawdopodobieństwa przeżycia;
wyjaśnia różnice między badaniami prospektywnymi i
retrospektywnymi, randomizowanymi i kliniczno-kontrolnymi,
B.U13.
Kolokwium
praktyczne przy
komputerze
Kolokwium
praktyczne przy
komputerze
Kolokwium
praktyczne przy
komputerze
Kolokwium
praktyczne przy
B.U14.
opisami przypadków i badaniami eksperymentalnymi oraz szereguje
je według wiarygodności i jakości dowodów naukowych;
komputerze
planuje i wykonuje proste badanie naukowe oraz interpretuje jego
wyniki i wyciąga wnioski.
Kolokwium
praktyczne przy
komputerze
KOMPETENCJE SPOŁECZNE (ZGODNIE Z OGÓLNYMI
EFEKTAMI KSZTAŁCENIA)
PUNKTY ECTS
1
TREŚCI MERYTORYCZNE PRZEDMIOTU:
Tematyka
Forma
(wykłady,seminar
ia, ćwiczenia, zaj.
fakultatywne,
itp…)
2. Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych
3. Dobór testu statystycznego dla porównania dwu grup
4. Dobór testu statystycznego dla 2 grup – skala nominalna
5. Testy diagnostyczne – czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne, OR –
iloraz szans
6. Porównania wielu grup
7. Korelacja i regresja
8. Analiza przeżycia – konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody
porównywania krzywych
9. Wstęp do metaanalizy
Ćwiczenia praktyczne w laboratorium
komputerowym
1.Zasady prowadzenia badań naukowych - typy badań
10. Kolokwium zaliczeniowe
LITERATURA PODSTAWOWA I UZUPEŁNIAJĄCA:
1.
2.
3.
4.
Petrie A., Sabin C.: Statystyka medyczna w zarysie, Wydawnictwo Lekarskie PZWL, Warszawa 2006
Stanisz A. :Przystępny kurs statystyki z zastosowaniem STATISTICA PL na przykładach z medycyny, tom
I, StatSoft, Kraków 2006
Moczko J. A., Bręborowicz G.H.: Nie samą biostatystyką… , Ośrodek Wydawnictw Naukowych, Poznań
2010
Dokumentacja elektroniczna programu STATISTICA
WARUNKI UZYSKANIA ZALICZENIA PRZEDMIOTU:
 Aktywność i obecność na wszystkich ćwiczeniach
 Zaliczenie kolokwium praktycznego przy komputerze
10.Tematyka poszczególnych wykładów, ćwiczeń i seminariów
Ćwiczenia - Semestr zimowy
Ćwiczenie 1.
Ćwiczenie 2.
Ćwiczenie 3.
Ćwiczenie 4.
Ćwiczenie 5.
Ćwiczenie 6.
Ćwiczenie 7.
Ćwiczenie 8.
Osoba
odpowiedzialna
Zasady prowadzenia badań naukowych, badania
obserwacyjne i doświadczalne, badania prospektywne
i retrospektywne badania randomizowane i klinicznokontrolne
Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych,
pojęcie błędu I i II rodzaju, p-value, hipotezy jedno i
dwustronne, model badania
Dobór testu statystycznego dla porównania dwu grup
w modelu zmiennych powiązanych i niepowiązanych,
skala interwałowa i porządkowa (test t-Studenta w
modelu zmiennych powiązanych, test t-Studenta w
modelu zmiennych niepowiązanych, test Welcha, test
Wilcoxona, test Manna-Whitney’a)
Dobór testu statystycznego dla 2 grup – skala
nominalna (test Chi2, test dokładny Fishera, test Mc
Nemary)
Testy diagnostyczne – czułość i swoistość, krzywe
ROC, RR- ryzyko względne, OR – iloraz szans
Porównania wielu grup (ANOVA w modelu
zmiennych powiązanych i niepowiązanych, test
Friedmana, test Kruskala-Wallisa)
Korelacja i regresja, model liniowy – wsp. korelacji
Pearsona,
nieparametryczny
wsp.
korelacji
Spearmana)
Analiza przeżycia – konstrukcja krzywych przeżycia
Kaplana-Meiera
oraz
metody porównywania
krzywych
Ćwiczenie 9.
Wstęp do metaanalizy
Ćwiczenie 10.
Praktyczne
komputerze
kolokwium
zaliczeniowe
Prof. J. Moczko
dr L. Kramer
dr B. Kołodziejczak
dr inż. A. Majewski
dr J. Marcinkowska
dr M. Michalak
dr I. Miechowicz
dr M. MolińskaGlura
dr M. Roszak
dr inż. A. Sowińska
dr A. Wiesiołowska
dr B. Więckowska
Sala
Zajęcia odbywają się w salach dydaktycznych Katedry - ul. Dąbrowskiego 79, II piętro,
sale nr 201, 202, 215, 216, 218
Tematyka ćwiczeń
przy
11. Organizacja zajęć:
Zajęcia na II roku odbywają w systemie zblokowanym: 5 spotkań x 4 godz. lekcyjne
w godzinach 8:00-11:00 zgodnie z planem zajęć ustalonym z Dziekanatem.
REGULAMIN ZAJĘĆ:
1. Dla
studentów II roku
Wydziału Lekarskiego I
zajęcia odbywają
się
w semestrze zimowym i obejmują:
a. 20 godzin ćwiczeń w laboratorium komputerowym.
2. Obecność studentów na ćwiczeniach jest obowiązkowa i kontrolowana.
3. Każda nieobecność na ćwiczeniach musi być usprawiedliwiona i odrobiona w terminie
ustalonym indywidualnie z prowadzącym zajęcia, lecz nie później niż przed kolokwium
zaliczeniowym. Nie odrobienie zajęć powoduje niedopuszczenie do kolokwium, co jest
jednoznaczne z otrzymaniem oceny niedostatecznej w pierwszym terminie. Zgodnie z
regulaminem studiów (rozdział III, § 11) w wyjątkowych sytuacjach dopuszcza się
usprawiedliwioną nieobecność na zajęciach.
4. Warunkiem uzyskania zaliczenia z przedmiotu:
BIOSTATYSTYKA Z ELEMENTAMI INFORMATYK I cz.I I jest:
a. aktywność oraz obecność na wszystkich ćwiczeniach,
b. zaliczenie kolokwium obejmującego całość materiału przerobionego na ćwiczeniach (próg
66%). Zaliczenie ma formę praktyczną i realizowane jest przy pomocy komputera z
oprogramowaniem stosowanym w trakcie zajęć.
Nieusprawiedliwiona nieobecność na kolokwium jest równoznaczna z otrzymaniem oceny
niedostatecznej.
W przypadku otrzymania oceny niedostatecznej istnieje możliwość dwukrotnego jej
poprawienia.
W wyjątkowych przypadkach kierownik Katedry może wyrazić zgodę na przeprowadzenie
jednego dodatkowego kolokwium z całości lub z wybranej części materiału.
Spóźnienia na ćwiczeniach przekraczające 15 minut traktowane są jako nieobecność.
Z racji charakteru przerabianego materiału studentów obowiązuje bieżąca znajomość
omawianych treści na kolejnych ćwiczeniach.
Na ostatnich ćwiczeniach studenci proszeni są o wypełnienie anonimowej ankiety dotyczącej
odbytych zajęć poprzez stronę internetową Katedry: www.kzis.ump.edu.pl (Dydaktyka 
Ankieta).
5.
6.
7.
8.
PROGRAM ZAJĘĆ:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
Zasady prowadzenia badań naukowych - typy badań.
Wprowadzenie do testowania hipotez statystycznych.
Dobór testu statystycznego dla porównania dwu grup.
Dobór testu statystycznego dla 2 grup – skala nominalna.
Testy diagnostyczne – czułość i swoistość, krzywe ROC, RR- ryzyko względne,
OR – iloraz szans.
Porównania wielu grup.
Korelacja i regresja.
Analiza przeżycia – konstrukcja krzywych przeżycia Kaplana-Meiera oraz metody porównywania
krzywych.
Wstęp do metaanalizy.
Praktyczne kolokwium zaliczeniowe przy komputerze z całości materiału.
PROGRAM NAUCZANIA



Wymagania wstępne: wiedza i umiejętności z przedmiotu BIOSTATYSTYKA
Z ELEMENTAMI INFORMATYK I cz. I.
Przygotowanie do zajęć: bieżąca znajomość zagadnień poznanych na ćwiczeniach.
Wymagania końcowe: student potrafi zrealizować wszystkie procedury prezentowane
na ćwiczeniach.
12.Kryteria zaliczenia przedmiotu: zaliczenie, egzamin teoretyczny i praktyczny
Zaliczenie – kryterium zaliczenia:
 Aktywność oraz obecność na wszystkich ćwiczeniach;

Pozytywne zaliczenie kolokwium praktycznego przy komputerze.
13.Literatura:
Zalecana literatura:
1. Petrie A., Sabin C.: Statystyka medyczna w zarysie, Wydawnictwo Lekarskie PZWL,
Warszawa 2006
2. Stanisz A.: Przystępny kurs statystyki z zastosowaniem STATISTICA PL na przykładach z
medycyny, tom I, StatSoft, Kraków 2006
3. Moczko J. A., Bręborowicz G.: Nie samą biostatystyką..., Poznań 2010
4. Dokumentacja elektroniczna programu STATISTICA
14.Studenckie koło naukowe

Opiekun koła

Tematyka

Miejsce spotkań
15. Podpis osoby odpowiedzialnej za nauczanie przedmiotu lub koordynatora
16. Podpisy osób współodpowiedzialnych za nauczanie przedmiotu (w przypadku
przedmiotów koordynowanych)