Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii

Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
Lista badań wykonywanych w Zakładzie Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc
KIEROWNIK:
Prof. dr hab. n. med. Joanna Chorostowska-Wynimko
Sekretariat:
tel. 022.43.12.158
Laboratorium:
tel. 022.43.12.105
fax. 022.43.12.358
e-mail: [email protected]
Badanie
Kontakt
Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowopęcherzykowych
dr n. med. A. Roży, mgr A. Stępniewska, tech. analit. B. Szumna
22.43.12.105
α1-antytrypsyna (A1AT) – stężenie, określenie fenotypu/genotypu
dr n. med. A. Roży, mgr K. Duk, mgr A. Zdral
22.43.12.105
ACE - Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę
dr n. med. A. Roży, mgr A. Zdral, tech. analit. B. Szumna
22.43.12.105
Diagnostyka molekularna raka płuca
mgr K. Duk , mgr inż. P. Skrońska, mgr A. Zdral
22.43.12. 256
Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy
(PCP)
dr n. med. A. Roży, mgr K. Duk , mgr inż. P. Skrońska,
mgr A. Zdral, mgr A. Stępniewska, tech. analit. B. Szumna
22.43.12.105
UWAGA!
Materiały biologiczny na badania:
 Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych,
 Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów oddechowych met. immunofluorescencji pośredniej,
 Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii (CMV) met. immunofluorescencji pośredniej
przyjmowane są od poniedziałku do piątku w godz. 8:00 – 11:00, badania wykonywane tylko w dniu pobrania materiału.
Materiały biologiczny na pozostałe badania przyjmowane są od poniedziałku do piątku, w godzinach 8.00 -15.00
Str. 1 z 3
Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
l.p.
Badanie
Materiał
Metoda
Zakres biologicznych wartości referencyjnych:
do 5 dni
roboczych
do 5 dni
roboczych
1
Analiza cytologiczna i immunologiczna popłuczyn
oskrzelowo-pęcherzykowych
płyn z BAL
Manualna
Cytometria
przepływowa
Osoby zdrowe
niepalące
palące
Całkowita liczba komórek [x106]
< 10
< 20
Makrofagi [%]
> 80
> 90
Limfocyty [%]
< 15
< 10
Granulocyty obojętnochłonne [%]
<3
<3
Granulocyty kwasochłonne [%]
< 0,5
< 0,5
Stosunek odsetka limfocytów
1,5- 2,5
0,5- 1,5
CD4+/CD8+
2
Aktywność enzymu konwertującego angiotensynę ACE
surowica
kinetyczna
dla dorosłych: 8 – 52 U/l surowica
l.p.
Badanie
Materiał
Metoda
Zakres biologicznych
wartości referencyjnych
Wynik
Wynik
alfa1 – Antytrypsyna (AAT)
3
Stężenie alfa1-antytrypsyny
surowica
Nefelometryczna
4
Diagnostyka wrodzonego niedoboru alfa1- antytrypsyny
(fenotypowanie/genotypowanie)
krew żylna EDTA
Ogniskowanie izoelektryczne
Real time PCR
Sekwencjonowanie
dla dorosłych: 88 – 183 mg/dl
do 5 dni roboczych
Wynik opisowy
do 21 dni roboczych
Wynik opisowy
do 10 dni roboczych
Diagnostyka molekularna raka płuca
5
6
Mutacje w genie EGFR
Rearanżacja genu ALK
tkanki i komórki
FFPE , rozmazy
komórkowe
tkanki i komórki
FFPE
Allelospecyficzny Real-time PCR
PNA-LNA PCR clamp
Sekwencjonowanie
FISH (Fluorescencyjna
hybrydyzacja in situ)
Str. 2 z 3
Załącznik nr 1 do SOP ZGiIK/101, wyd. I z dn. 02.01.2014r.
l.p.
Badanie
Materiał
Metoda
Zakres biologicznych
wartości
referencyjnych
Wynik
Diagnostyka infekcji wirusowych układu oddechowego oraz pneumocystozy (PCP)
Wykrywanie obecności antygenów siedmiu wirusów
wymaz z gardła
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
wymaz z gardła
Real time PCR
Wynik opisowy
wymaz z gardła,
wymaz z nosogardła
Real time PCR
Wynik opisowy
CMV - Oznaczanie antygenu pp65 wirusa cytomegalii.
krew żylna EDTA
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
11
CMV - Wykrywanie sekwencji genu kodującego białko ppUL83
(pp65) wirusa cytomegalii
krew żylna EDTA
osocze EDTA
płyn z BAL
mocz
płyn m-r
Real time PCR
Wynik opisowy
12
Wykrywanie obecności oocyst Pneumocystis jirovecii.
13
Wykrywanie obecności materiału genetycznego Pneumocystis
jirovecii.
7
oddechowych: wirusa grypy typ A i typu B; wirusa para grypy typu 1,
2, 3; syncytialnego wirusa oddechowego, adenowirusa.
8
Wykrywanie i identyfikacja wirusa grypy typu A i podtypu AH1N1
oraz grypy typu B
Wykrywanie i identyfikacja 21 patogenów oddechowych:
Adenowirus (HAdV), Bokawirus (HBoV), Koronawirus ( 229E, HKU1,
NL63, OC43), Ludzki metapneumowirus (HMPV), Wirus grypy typu
9
A (podtyp: H1, H3, 2009 H1), Wirus grypy typuB; Wirus paragrypy
w dniu dostarczenia
materiału do ZGiIK
lub następnym dniu
roboczym
typu 1, 2, 3, 4; Enterowirus, Rinowirus (HRV), Syncytialny wirus
oddechowy (RSV) oraz Bordetella pertussis, Chlamydophila
pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae.
10
płyn z BAL
plwocina
Immunofluorescencja
pośrednia
Wynik opisowy
Real time PCR
Str. 3 z 3