metodyka stosowana w zakładzie biologii rozwoju roślin

METODYKA STOSOWANA W
ZAKŁADZIE BIOLOGII ROZWOJU ROŚLIN
Immunolokalizacja wybranych białek i
polisacharydów
Kaloza w gametofiach mszaków
Ksyloglukan u Arabidopsis
Immunocytochemia białek cytoszkieletu kortykalnego w mikroskopie
A- fluorescencyjnym i B- jasnego pola
A
B
Analiza ekspresji genów z wykorzystaniem genów reporterowych
GUS, GFP, YFP
Lokalizacja ekspresji genu WUS
Lokalizacja ekspresji DR5
Lokalizacja ekspresji genu KOR3
Ko-lokalizacja ekspresji genu DR5 i transportu barwnika
fluorescencyjnego RITC
Trójwymiarowa rekonstrukacja systemu przewodzącego z
wykorzystaniem mikroskopu konfokalnego
System przewodzący mutanta pin1
System przewodzący typu dzikiego
Analiza transportu krótko- i długodystansowego z wykorzystaniem
znaczników fluorescencyjnych
TEM - Immunolokalizacja pektyn w ścianie komórkowej epidermy liści u topoli
WT
1051
1002
Analiza ultrastruktury powierzchni z wykorzystaniem mikroskopu
skaningowego (SEM)
- morfologia nasion i owoców produkujących śluz
- wykrywanie śluzu, charakterystyka otoczki śluzowej
-różnice w morfologii otoczki
śluzowej u różnych gatunków
(rodzin); zależność między typem
siedliska, formą życiową, poziomem
ploidalności a zdolnością produkcji
śluzu
- wykorzystanie cech
morfologicznych diaspor w
badaniach taksonomicznych
Mikroskopia jasnego pola, kontrast fazowy, polaryzacja
Mikropreparatyka i reakcje cytochemiczne
Hodowle hydroponiczne i in vitro – analiza wpływu czynników
wzrostowych, w tym hormonów i inhibitorów
Izolacja protoplastów
Izolacja protoplastów,
transport do protoplastów związków znakowanych fluorescencyjnie
Otrzymywanie i analiza podwójnych i potrójnych mutantów
1. Fenotypowanie mutantów i linii
transgenicznych
2. Genotypowanie
WT mutant
3. Krzyżowanie roślin
Symulacje komputerowe organogenezy u roślin
Proponowane tematy prac magisterskich w
Zakładzie Biologii Rozwoju Roślin
Jest możliwe ustalenie innych tematów prac magisterskich, bądź
modyfikacja proponowanych, po ustaleniu z promotorem !!!
Prof. dr hab. Beata Zagórska-Marek
•Architektura cytoszkieletu kortykalnego komórek macierzystych strefy kambium
Metodyka:
- Analiza anatomiczna
- Immunolokalizacja tubuliny w mikroskopie fluorescencyjnym i mikroskopie jasnego pola
• Dynamika architektury systemu waskularnego w pędach kwiatostanowych
Verbena officinalis
Metodyka:
- Analiza anatomiczna zmian rozwojowych w mikroskopie fluorescencyjnym
• Przyczyny i znaczenie dyslokacji w parakrystalicznych układach organów
roślinnych
Metodyka:
- Analiza fenotypowa pędów roślin modelowych z zastosowaniem skanera 3D
-Symulacje komputerowe
Dr Alicja Banasiak
•Analiza fenotypowa linii transgenicznych topoli i Arabidopsis ze zmienioną
strukturę glukuronoksylanów w ścianach komórkowych
Metodyka:
- Analiza anatomiczna
- Maceracja i pomiary wielkości komórek drewna
- Immunolokalizacja składników ścian komórkowych
•Wpływ inhibitora polarnego transportu auksyn NPA na różnicowanie pierwotnych
tkanek waskularnych i ekspresję genu DR5 w pędach kwiatostanowych
Arabidopsis
Metodyka:
- Hodowla na pożywkach stałych
- Analiza zmian ekspresji DR5 na preparatach anatomicznych
- Indukcja różnicowania tkanek przewodzących egzogennie aplikowaną auksyną
- Analiza rozwoju tkanek przewodzących na mikroskopie konfokalnym
Dr Alicja Dołzbłasz
•Analiza ekspresji wybranych genów reporterowych u mutanta
mitochondrialnego Arabidopsis thaliana
Metodyka:
- Krzyżowanie roślin
- Selekcja roślin w kolejnych pokoleniach w celu otrzymania homozygot (genotypowanie)
- Analiza fenotypowa roślin
- Analiza histochemiczna genów reporterowych
• Analiza histochemiczna lokalizacji genów reporterowych GUS w tkankach
roślinnych po infekcji fitopatogenem Rhodococcus fascians
Metodyka:
- Fenotypowanie tkanek roślinnych
- Analiza histochemiczna genów reporterowych
Dr Edyta Gola
•Determinacja komórek inicjalnych w gametofitach paproci na przykładzie gatunku
modelowego Ceratopteris.
Metodyka:
- Analiza anatomiczna i funkcjonalna z wykorzystaniem technik fluorescencyjnych
- Indukcja komórek apikalnych w warunkach stresowych
•Różnorodność wzorów ulistnienia (filotaksji) w pędach skrzypów (Equisetum)
Metodyka:
- Analiza makromorfologiczna i anatomiczna pędów
- Korelacja liczby zawiązków liściowych z wielkością merystemów
- Porównanie z danymi taksonomicznymi
Dr Agnieszka Kreitschitz
•Właściwości biologiczne śluzu u wybranych przedstawicieli rodziny Lamiaceae.
•Porównanie struktury śluzu owoców u wybranych taksonów
Metodyka:
- Analiza morfologiczno-anatomiczna owoców i nasion tworzących śluz
- Różnorodne metody barwienia i wykrywania składników śluzu
- Mikroskopia świetlna, polaryzacyjna i fluorescencyjna
Dr Elżbieta Myśkow
•Zakładanie, rozwój oraz sezonowe zmiany w budowie merystemów wtórnych
u Actinidia arguta.
Metodyka:
-Analiza anatomiczna kolejnych etapów powstawania i funkcjonowania merystemów i ich pochodnych
•Indukcja perydermy u Pelargonium.
Metodyka:
- Analiza anatomiczna
- Zakładanie perydermy pod wpływem czynników egzogennych, analiza z wykorzystaniem
barwników fluorescencyjnych
Dr Katarzyna Sokołowska
•Funkcje biologiczne miękiszu drzewnego u Populus.
Metodyka:
- Analiza anatomiczna komórek miękiszowych
- Charakterystyka aktywności metabolicznej i transportu międzykomórkowego w cyklu rocznym z
wykorzystaniem technik fluorescencyjnych
•Charakterystyka szlaków transportowych u mchów na przykładzie gatunku
modelowego Physcomitrella patens
Metodyka:
- Analiza anatomiczna
- Charakterystyka efektywności zewnętrznych i wewnętrznych szlaków transportowych z
wykorzystaniem barwników i znaczników fluorescencyjnych