Materialy_do_egzaminu_biotechnologia_II 2012
Transkrypt
Materialy_do_egzaminu_biotechnologia_II 2012
ZAGADNIENIA DO EGZAMINU WSTĘPNEGO NA STUDIA MAGISTERSKIE Z BIOTECHNOLOGII NABÓR 2012/2013 Egzamin na studia magisterskie z biotechnologii w ramach rekrutacji na rok akademicki 2012/2013 odbędzie się 19 lipca i będzie obejmował wybrane zagadnienia z następujących dziedzin: • biotechnologia, • biochemia z elementami genetyki molekularnej, • biologia komórki. ZAGADNIENIA Z BIOTECHNOLOGII Biotechnologia w produkcji spoŜywczej: produkcja etanolu, kwasów organicznych, aminokwasów, preparatów enzymatycznych, przetworów mlecznych, witamin ZAGADNIENIA Z BIOCHEMII (Z ELEMENTAMI GENETYKI MOLEKULARNEJ) Enzymologia: Kinetyka i termodynamika reakcji enzymatycznych. Klasyfikacja enzymów. Budowa enzymów, budowa centrum aktywnego. Witaminy i koenzymy. Swoistość enzymów. Aktywacja i hamowanie aktywności enzymów. Enzymy allosteryczne i regulacja ich aktywności. Subkomórkowe rozmieszczenie enzymów. Proste obliczenia biochemiczne – wyznaczanie aktywności enzymatycznej, aktywności właściwej, aktywności molekularnej, maksymalnej szybkości reakcji oraz stałej Michaelisa-Menten. Energetyka komórki: Budowa i funkcja błon fotosyntetycznych, fotosyntetyczny łańcuch transportu elektronów, fosforylacja fotosyntetyczna niecykliczna i cykliczna, wiązanie dwutlenku węgla w fotosyntezie, cykl Calvina, fotoodychanie; główne substraty oddechowe i ich mobilizacja, glikoliza, fermentacje, mitochondrialny łańcuch transportu elektronów i fosforylacja oksydacyjna, cykl Krebsa. ZAGADNIENIA Z BIOLOGII KOMÓRKI Kompartmentalizacja komórki eukariotycznej: Funkcje poszczególnych organelli komórkowych. Błony plazmatyczne: Budowa i właściwości błon plazmatycznych. Jedność i róŜnorodność błon w komórce eukariotycznej. Mechanizmy transportu przez błony jonów, małych cząsteczek organicznych i nieorganicznych: dyfuzja, transport bierny, transport aktywny (nośniki, kanały jonowe, pompy i ich funkcje). Potencjał błonowy, sygnalizacja w komórkach nerwowych. Transport makrocząsteczek poprzez błony. Sortowanie białek. Mechanizmy transportu pęcherzykowego. Szlaki sekrecyjne i szlaki endocytozy. 1 Cytoszkielet: Budowa i funkcje filamentów aktynowych, filamentów pośrednich i mikrotubul. Mechanizmy polimeryzacji aktyny i tubuliny. Białka motoryczne związane z mikrofilamentami i mikrotubulami.. Zjawiska ruchowe w komórce. Mechanizmy migracji komórek prawidłowych i nowotworowych. Mechanizmy tworzenia przerzutów. Rola monomerycznych GTP-az z rodziny Rho w regulacji aktywności ruchowej komórek. Skurcz mięśni. PRZYKŁADOWE PYTANIA TESTOWE (pytania testowe są pytaniami jednokrotnego wyboru) 1. Zaznacz prawidłową odpowiedź. W procesie destylacji „nie odparowaną” pozostałość nazywa się: A. B. C. D. destylatem rektyfikatem pogonem surówką 2. Zaznacz enzym nie biorący udziału w produkcji syropu glukozo-fruktozowego: A. B. C. D. izomeraza glukozowa amyloglukozydaza pektynaza alfa amylaza 3. Bakterie kwasu octowego to: A. B. C. D. E. bezwzględne beztlenowce gram-ujemne pałeczki gram-dodatnie ziarniaki gram-dodatnie laseczki gram-dodatnie pałeczki 4. Najkrótszy etap w procesie produkcji piwa to: A. B. C. D. E. słodowanie zacieranie i warzenie słodu fermentacja leŜakowanie destylacja 5. Dopasuj enzym do współdziałającego z nim związku: A. B. C. D. dehydrogenaza mleczanowa syntaza tymidynowa hydrolaza peptydylo-peptydowa hydroksylaza prolilowa I. II. III. IV. nie wymaga koenzymu dinukleotyd nikotynamidoadeninowy kwas askorbinowy tetrahydrofolian 6. Czy moŜna obliczyć aktywność właściwą katalazy w lizacie krwinek czerwonych, jeśli dysponujesz następującymi danymi. Reakcję enzymatyczną prowadzono przez 30 minut po 2 dodaniu 1 ml lizatu krwinek do 9 ml mieszaniny reakcyjnej zawierającej stabilne źródło H2O2 o stęŜeniu 300 mM. Po 30 minutach reakcję zatrzymano i pobrano próbkę do analizy. Obliczono, Ŝe w tym czasie rozkładowi uległo 2,7 milimoli H2O2. StęŜenie białka w lizacie krwinek (stanowiącym preparat enzymu) wynosiło 9 mg/ml. Oblicz aktywność właściwą katalazy w 1 ml krwinek czerwonych lub uzasadnij dlaczego nie jest to moŜliwe. 7. Herbicyd Paraquat przechwytuje elektrony przekazywane z PS I na NADP+. Czy związek ten będzie hamował redukcję soli Ŝelaza na świetle w obecności izolowanych tylakoidów (reakcja Hilla)? Odpowiedź uzasadnij (2 zdania). 8. Stechiometria wymiany gazowej zaleŜy od rodzaju substratu. Stosunek liczby moli produkowanego CO2 do zuŜywanego O2 nosi nazwę współczynnika oddechowego (RQ). W pewnym doświadczeniu wykazano wartość RQ >1. Zakładając całkowite utlenienie substratu, pozwala to wnioskować, Ŝe substratem mogła być substancja: A B. C. D. 9. Który zestaw obejmuje wszystkie związki chemiczne, mogące pełnić funkcję biokatalizatorów: A. B. C. D. białka proste, białka złoŜone, RNA białka złoŜone, RNA białka DNA, RNA, białka 10. W komórce zwierzęcej błona komórkowa i błony wewnątrzkomórkowe róŜnią się procentową zawartością budujących je lipidów. Najwięcej cholesterolu jest w błonie: A. B. C. D. E. komórkowej siateczki endoplazmatycznej zewnętrznej błonie otoczki jądrowej endosomów wewnętrznej mitochondrium 11. Biorąc pod uwagę funkcje pełnione przez transbłonowe białka transportujące występujące w typowej komórce ssaka (np. hepatocycie) dopasuj białko do błony, w którą jest wbudowane: A. pompa sodowo- potasowa B. syntaza ATP C. poryna - białko porów wodnych D. pompa protonowa typu-V I. II. III. IV. 3 błona komórkowa błona lizosomów wewnętrzna błona mitochondrialna zewnętrzna błona mitochondrialna 12 Ile genów kodujących białka zawiera genom człowieka: A. B. C. D. E. mniej niŜ 50 tysięcy między 50 a 100 tysięcy między 100 a 200 tysięcy ponad 200 tysięcy nie da się tej liczby określić, bo nie znamy liczby wszystkich białek człowieka 13. W rekonstytuowanych in vitro modelach stwierdzono, Ŝe do generowanie ruchu bakterii Listeria monocytogenes bezwzględnie konieczna jest obecność: A. B. C. D. aktyny i Arp2/3 aktyny i miozyny II tubuliny i miozyny I aktyny i miozyny I ZALECANA LITERATURA UWAGA! Kandydatów obowiązuje obszerna wiedza z podanych zagadnień, a nie wiedza, którą znaleźć moŜna w poszczególnych podręcznikach. JednakŜe dla ułatwienia przygotowania się do egzaminu podajemy literaturę, która moŜe pomóc w nauce. Mikrobiologia techniczna. Tom 2. Redakcja naukowa Z. Libudzisz, K.Kowal, Z. śakowska, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2007. ISBN: 978-83-01-15523-0. Podstawy biotechnologii przemysłowej. Praca zbiorowa pod redakcją Włodzimierza Bednarskiego i Jana Fiedurka. Wydawnictwa Naukowo-Techniczne, Warszawa, 2007. ISBN:978-83-204-3265-7. Technologia biochemiczna. K.W. Szewczyk, OWPW, ISBN 83-7207-431-3 Biochemia. J. M. Berg, L. Stryer, J. L. Tymoczko, Wydanie: trzecie zmienione, dodruk, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2007, lub wydanie poprzednie. ISBN: 978-83-01-14379-4. Zarys biochemii. J. Bereta i A. Koj, Seria Wydawnicza Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii przy współpracy EJB, Kraków 2009. ISBN: 978-83-88519-77-2. Praktikum z biochemii dla studentów biologii i biotechnologii. Praca zbiorowa pod redakcją P. Maka i A. Guzdek, Seria Wydawnicza Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii przy współpracy EJB, Kraków 2009. ISBN: 978-83-88519-79-6 Podstawy biologii komórki. Tom 1 i 2, B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter, Wydanie: drugie zmienione, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa 2007 (copyright 2005). ISBN: 978-83-01-14468-5 (tom 1) oraz 978-83-01-14469-2 (tom 2). 4