informatyka w selekcji

INFORMATYKA W SELEKCJI
INFORMATYKA W SELEKCJI - zagadnienia
1. Dane w pracy hodowlanej – praca z dużym zbiorem danych
(Excel)
2. Podstawy pracy z relacyjną bazą danych w programie MS
Access
3. Pakiet SAS
4. Pakiet R
Z wykorzystaniem narzędzi programów Excel, SAS, R:
5. Badanie i wykorzystanie zależności cech – regresja
6. Analiza wariancji z modelem stałym i losowym
7. Ocena wartości hodowlanej z modelem mieszanym
INFORMATYKA W SELEKCJI
SELEKCJA:
• (popularnie) – każdy wybór
• w zootechnice – szczególny wybór (jaki?)
selekcja naturalna, sztuczna
???
Przykłady
???
???
Różnice
???
INFORMATYKA W SELEKCJI
METODY HODOWLANE (powtórzenie):
I. SZACOWANIE PARAMETRÓW GENETYCZNYCH
II. OCENA WARTOŚCI HODOWLANEJ
III. SELEKCJA
Selekcja – wybór najlepszych genetycznie zwierząt
na rodziców następnych pokoleń hodowlanych.
?!?!
INFORMATYKA W SELEKCJI
Selekcja – wybór najlepszych genetycznie zwierząt na rodziców. Inaczej:
jest to podział populacji na dwie części, z których tylko jednej umożliwia się
pozostawienie potomstwa (przeznaczonego do dalszej hodowli)
Rodzaje selekcji – jest ich wiele, według różnych kryteriów. Np. ze względu
na efekt selekcja może być rozdzielcza, dośrodkowa (stabilizujaca),
kierunkowa
INFORMATYKA W SELEKCJI
Jak określić, czy selekcja będzie skuteczna?
• Miarą wielkości reakcji populacji na selekcję jest
POSTĘP HODOWLANY – wzrost średniej wartości
hodowlanej populacji w kolejnych pokoleniach
• Zanim dokona się selekcji można określić tzw.
oczekiwany postęp hodowlany według wzoru:
G  R  s   G
INFORMATYKA W SELEKCJI
Oczekiwany postęp hodowlany
G  R  s   G
G
= dokładność x intensywność x zmienność genetyczna
R – dokładność oceny wartości hodowlanej
tym wyższa, im więcej
informacji
DUŻE ZBIORY DANYCH
wymaga MOCY
obliczeniowej
INFORMATYKA W SELEKCJI
Dane w hodowli to zmienne losowe: jakościowe oraz ilościowe
(dyskretne lub ciągłe)
Zbiór danych (nawet b. duży) to PRÓBA – reprezentacja POPULACJI
Populacja
Próba
pobieranie
wnioskowanie
INFORMATYKA W SELEKCJI
Próba
OPIS STATYSTYCZNY PRÓBY
1
x 
n
n

xi
i 1
n
1
2
s x2 
(
x

x
)

i
n  1 i 1
sx 
s x2
1) Sporządzenie szeregu
liczbowego wartości
2) Określenie wartości
maksymalnej, minimalnej,
rozstępu wartości, mediany i
modalnej, etc.
3) Skonstruowanie szeregu
rozdzielczego i uzyskanie
rozkładu empirycznego
(histogram)
4) Obliczenie średniej i wariancji
(odchylenia standardowego)
INFORMATYKA W SELEKCJI
Statystyka opisowa – przykład dla próby danych
o nieśności kur
Arkusz programu
Microsoft Excel
INFORMATYKA W SELEKCJI
• W pracy hodowlanej przetwarza się duże zbiory danych
• Zbiór danych zapisany wg pewnych reguł to baza danych
• Baza danych to zestaw rekordów (wierszy), z których każdy
zawiera powiązane ze sobą informacje w wielu polach (kolumnach)
INFORMATYKA W SELEKCJI
POLA
REKORDY
Organizacja zbioru jako bazy danych ułatwia wprowadzanie
danych (formularze), uzyskiwanie informacji (sortowanie,
filtrowanie, raporty obliczeniowe), korektę błędów
INFORMATYKA W SELEKCJI
Praca z dużym zbiorem danych w Excelu (prezentacja)
• Wypełnianie pól serią danych
• Zmiana formatu danych
• Transformacja zbioru w tabelę
• Sortowanie i filtrowanie danych
• Wizualizacja wyników (wykresy)
• Formuły i funkcje obsługi bazy danych
• Sumy pośrednie, tabela przestawna
Arkusz programu
Microsoft Office Excel
INFORMATYKA W SELEKCJI
Praca z dużym zbiorem danych w Excelu
• Wypełnianie pól serią danych
• Zmiana formatu danych
• Transformacja zbioru w tabelę
• Sortowanie i filtrowanie danych
• Formuły i funkcje obsługi bazy danych
• Sumy pośrednie, tabela przestawna
• Wizualizacja wyników (wykresy)
Samodzielna praca za chwilę na ćwiczeniach –
ZAPRASZAM!