Laboratorium 02
Transkrypt
Laboratorium 02
Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki ĆWICZENIE 2 BUDOWA I FUNKCJE ENZYMÓW. ZASTOSOWANIE BADAŃ ENZYMATYCZNYCH W INŻYNIERII ŚRODOWISKA. /Opiekun merytoryczny: dr hab. Teodora M. Traczewska, prof. nadzw. PWr modyfikacja: dr inż. Agnieszka Trusz-Zdybek i mgr inż. Maciej Bełcik/ 1. Zagadnienia szczegółowe: budowa i mechanizm działania enzymów; kinetyka reakcji enzymatycznych; stała Michaelisa; regulacja aktywności enzymatycznej; inhibitory enzymów; enzymy allosteryczne – mechanizm działania; wpływ czynników zewnętrznych na aktywność enzymatyczną (pH, temp.); jednostka aktywności enzymatycznej; podstawowe typy enzymów i rodzaje katalizowanych przez nie reakcji; dehydrogenazy; test TTC – zasada i sposób wykonania testu; metody wykrywania oraz mechanizmy działania aktywności katalazowej, oksydazowej, ureazowej i proteolitycznej. 2. Literatura zalecana Pawlaczyk-Szpilowa M.: Biologia i ekologia, Oficyna Wyd. Polit. Wroc., s. 142-156. Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki CZĘŚĆ DOŚWIADCZALNA Zad. 1: Oznaczanie aktywności dehydrogenazowej osadu czynnego testem TTC. Badanie wpływu czynników fizycznych i chemicznych na aktywność enzymatyczną (temperatura, pH, związki toksyczne). a) Badanie aktywności dehydrogenazowej w zależności od temperatury Materiały: - probówki - Bufor Tris o pH 8,4 - Osad czynny - Łaźnia wodna - Roztwór TTC Wykonanie: Do sześciu probówek wlać pipetą Pasterowską po 1 cm3 buforu Tris o pH 8,4 i po 1 cm3 osadu czynnego (próbkę wcześniej uśrednić). Opisać następująco probówki: 10°C, 22°C, 37°C, 45°C, 60°C i 100°C. Probówkę opisaną jako „100°C” wstawić na 5 min. do łaźni wodnej o temp. 100°C, po czym schłodzić w strumieniu wody z kranu do temp. pokojowej. Następnie do wszystkich 6 probówek wprowadzić pipetą 0,5 cm3 roztworu TTC. Probówki umieścić w odpowiednich temperaturach: probówkę „10°C ” w lodówce, probówki „37°C” i „100°C” w termostacie o temp. 37°C, probówkę „45°C” w łaźni wodnej o temp. 45°C, a probówkę „60°C” w łaźni wodnej o temp. 60°C. Probówkę 22°C pozostawić w temperaturze pokojowej. Próby pozostawić na min. 30 min inkubacji. b) Badanie aktywności dehydrogenazowej w zależności od odczynu. Materiały: - Probówki - Bufory o różnych pH - Osad czynny - Roztwór TTC Wykonanie: Opisać 6 probówek: „pH 2”, „pH 4”, „pH 5”, pH 8,4”, „pH 10” i „pH 12”. Do probówek wlać pipetą po 1 cm3 buforu o odpowiednim pH. Następnie do wszystkich Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki 6 probówek wlać po 1 cm3 osadu czynnego (próbka uśredniona) i po 0,5 cm3 roztworu TTC. Próby umieścić na min. 30 min. w termostacie o temp. 37°C. c) Badanie aktywności dehydrogenazowej w obecności substancji toksycznej (octan ołowiu). Materiały: - Probówki - Bufor Tris o pH 8,4 - Osad czynny - Octan ołowiu - Roztwór TTC Wykonanie: Opisać 2 probówki następująco: „Pb” i „K” (kontrola). Do obu probówek wprowadzić pipetą po 1 cm3 osadu czynnego (próbka uśredniona) i po 1 cm3 buforu Tris o pH 8,4. Następnie do probówki „Pb” wprowadzić 1 cm3 15% roztworu octanu ołowiu (UWAGA: trucizna!), a do probówki „K” w celu uzyskania tych samych proporcji 1 cm3 buforu Tris o pH 8,4. Do obu probówek dodać po 0,5 cm3 r-u TTC. Próby inkubować w temp. 37°C przez min. 30 min. Po 30 min. inkubacji prób wg a, b i c, należy ocenić wizualnie zmianę zabarwienia próbki. Aktywność dehydrogenazowa w obecności TTC objawia się wystąpieniem czerwonego zabarwiania wywołanego powstaniem produktu reakcji enzymatycznej TF. Intensywność zabarwiania zależy od aktywności enzymatycznej. Określić wpływ badanych czynników na aktywność dehydrogenazową osadu czynnego, wykonać wykresy aktywności enzymu w zależności od temperatury oraz odczynu na podstawie otrzymanych danych. Zad. 2: Wykrywanie aktywności oksydazowej osadu czynnego. Materiały: - Probówki - Osad czynny - Łaźnia wodna - 1% roztwór pirokatechiny Wykonanie: Do 2 probówek wlać po 2 cm3 osadu czynnego (próbka uśredniona), probówki opisać jako kontrola i próba badana. Próbę badaną wstawić do łaźni wodnej o temp. 100°C na 5 min., a następnie schłodzić do temp. pokojowej. Do obu probówek wlać po 10 kropli 1% roztworu pirokatechiny. Próby inkubować w temp. 40°C przez min. 30 min. Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki Zaobserwować zabarwienie w próbach i na podstawie zasady działania enzymów oksydaz wyjaśnić jego pojawienie się. Zad. 3: Wykrywanie aktywności katalazowej osadu czynnego. a) Osad czynny Materiały: - Probówki - Osad czynny - Łaźnia wodna - Nadtlenek wodoru - H2O2 Wykonanie: Do 2 probówek wprowadzić po 1 cm3 osadu czynnego (próbka uśredniona), probówki opisać jako kontrolę i próbę badaną. Próbę badaną włożyć na 5 min. do łaźni wodnej o temp. 100°C, po czym schłodzić w strumieniu wody z kranu do temp. pokojowej. Następnie do obu probówek wprowadzić po 0,5 cm3 roztworu H2O2 i natychmiast obserwować pojawiające się zmiany. *) Hodowle wybranych szczepów bakteryjnych na skosach agarowych Materiały: - Skosy agarowe z kulturami bakterii - Nadtlenek wodoru Wykonanie: Na powierzchnię skosu agarowego z kulturą bakterii wlać sterylnie 0,5 cm3 roztworu H2O2 i natychmiast obserwować pojawiające się zmiany. Wyjaśnić zjawisko obserwowane w punkcie a /* bazując na zasadzie działania enzymów katalazowych. Zad. 4: Wykrywanie aktywności ureazowej osadu czynnego na podłożu mocznikowym. Materiały: - Podłoże zawierające mocznik - Palnik - Eza - Osad czynny Wykonanie: Zaszczepić podłoże przy użyciu sterylnej ezy uśrednioną próbką osadu czynnego. Inkubować w temp. 22°C przez min. 48h. Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki Określić i zapisać barwę podłoża przed zaszczepem i po zaszczepieniu Po czasie inkubacji opisać i wyjaśnić zaobserwowane zmiany. Zad. 5: Wykrywanie aktywności proteolitycznej Materiały: - Słupek żelatynowy - Palnik - Igła preparacyjna - Osad czynny Wykonanie: Dokonać posiewu metodą kłutą na słupek żelatynowy. Inkubować w temp. 20°C przez min. 48h. Opisać konsystencję żelatyny przed i po wykonaniu doświadczenia. Po czasie inkubacji opisać i wyjaśnić zaobserwowane zmiany.