Jak zrobić bufor TBE - DolinaBIOtechnologiczna.pl

Jak zrobić bufor TBE — protokół
TBE jest buforem do elektroforezy, który wykorzystuje się najczęściej do
elektroforezy kwasów nukleinowych (DNA i RNA). Idealnie nadaje się do
elektroforezy na żelu agrozowym, jak i na żelu poliakrylamidowym kwasów
nukleinowych krótszych fragmentów DNA; najlepiej poniżej 600bp.
Dłuższe fragmenty, szczególnie powyżej 1000bp, warto rozpuszczać w
buforze TAE, który posiada niższą pojemność buforującą oraz wyższe
przewodnictwo elektryczne od buforu TBE.
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
W przypadku, kiedy decydujesz się na reamplifikację prążka, nigdy nie zawieszaj
go w TBE (tylko, na przykład, w wodzie). TBE ze względu na zawartość w swoim
składzie kwasu borowego jest inhibitorem wielu enzymów (choćby polimeraz,
ligaz czy restryktaz).
JAK ZROBIĆ 10xTBE (1 litr).
Co musisz mieć:
1. Woda destylowana (zwykła lub ddH2O)
2. Tris (np. Sigma)
3. Kwas borowy (np. Sigma, Prochem).
4. EDTA (np. Sigma)
Do 750-800 ml najlepiej destylowanej wody dodaj:
108 g Tris
55 g kwasu borowego
40 ml zrobionego wcześniej 0,5 M EDTA (pH 8.0).
Uzupełnij objętość wodą do 1000ml, przesącz, żeby uniknąć krystalizowania.
Przechowuj bufor w lodówce, w zamkniętej szklanej butelce, w temperaturze od 4
do 8 °C.
Żeby przygotować 1xTBE, którego będziesz używać do elektroforezy,
rozcieńcz powyższy roztwór TBE — 10 razy, czyli naprzykład 100ml
odmierzonego roztworu 10xTBE dopełnij wodą do 1000ml. Pamiętaj, żeby
bufor zamieszać po dopełnieniu wodą.
Nie zapominaj o tym, że EDTA rozpuszcza się w wodzie TYLKO w pH 8.0.
Ostrożnie ustawiaj pH trakcie mieszania roztworu — jedna kropla NaOH, która
spowoduje przekroczenie pH 8.0 sprawi, że Twój roztwór EDTA będzie do
wyrzucenia a praca (i odczynniki) pójdą na marne.
CLEAN SKY
PROPOSALS
2
CALL
FOR
30 lipca 2015 roku został otwarty II konkurs CLEAN SKY 2 CALL FOR
PROPOSALS o budżecie €57,950,000. Termin złożenia wniosku o
dofinansowanie to 18 listopada 2015 r.
Szczegółowe informację na temat konkursu można znaleźć pod adresem:
http://ec.europa.eu/research/participants/portal/desktop/en/opportunities/h2020/c
alls/h2020-cs2-cfp02-2015-01.html#tab2
Lista tematów w ramach konkursu znajduje się w dokumencie dostępnym pod
adresem:
http://ec.europa.eu/research/participants/portal/doc/call/h2020/h2020-cs2-cfp02-2
015-01/1662641-call_text_-_cfp02_full_description_of_topics_en.pdf
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Wyjedź na płatny staż do Japonii
Rozpoczęła się rekrutacja do programu Fundacji Canon „Canon Fundation
in Europe”. Program jest adresowany do wysoko wykwalifikowanych
naukowców różnych specjalizacji z Europy, którzy zainteresowani są
prowadzeniem swoich badań w Japonii. Projekty w Japoni mogą być
prowadzone od 3-12 miesięcy. Wnioski mozna składać do 15 września
2015 r.
W trakcie pobytu w Japonii stypendyści otrzymają wsparcie finansowe w
wysokości od 22 500 euro do 27 500 euro rocznie (w przypadku krótszego czasu
stypendium, będzie to kwota proporcjonalnie mniejsza.
Wnioski mogą być składane przez osoby ze stopnie zawodowym magistra lub
stopniem naukowym doktora, ze stopniem naukowym uzyskanym nie dawniej niż
10 lat przed złożeniem wniosku.
Strona internetowa konkursu Fundacji Canona znajduje się tutaj.
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Letnie praktyki badawcze – nabór
uzupełniający!
Ogłoszono nabór uzupełniający na XI Letnie Praktyki Badawcze. W
ramach wielodyscyplinarnych praktyk wyłonieni w konkursie studenci i
doktoranci z różnych uczelni i kierunków – nauki ekonomiczne, techniczne
i ścisłe – kolejny raz stworzą interdyscyplinarny zespół poświęcony
rozwikłaniu naukowych problemów postawionych przez dynamiczny świat
biznesu.
Aby dołączyć do zespołu praktykantów, należy przesłać aplikację (krótkie CV, list
motywacyjny oraz rekomendację od pracownika naukowego/pracodawcy) na
adres: [email protected].
Szczegółowe
informacje
można
znaleźć
na
stronie: http://www.praktyki.ibspan.waw.pl/
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Wymiana naukowa
2016-2018
z
Austrią
Trwa nabór wniosków w ramach wymiany osobowej z Austrią na lata
2016-2018 – konkurs dotyczy wszystkich dziedzin nauki. Zasady konkursu
dopuszczają zgłaszanie wniosków z wszystkich dziedzin nauki. Zgłaszane projekty
muszą trwać od 1 maja 2016 r. do 30 kwietnia 2018 r.
Szczegółowe informacje o naborze wniosków można znaleźć na stronie
internetowej MNiSW
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Rozpiska konkursów na najbliższe
miesiące
Przedstawiamy rozpiskę konkursów na najbliższe miesiące.
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Szkolenia z komercjalizacji wyników prac badawczych (10 maja 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
ECSEL (12 maja 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
Projekty z obszaru fotoniki (12 maja 2015 r.)
Indeks Start2Star
Stypendia dla przyszłych studentów (15 maja 2015 r.)
Fundacja Lanckorońskich
Stypendia Wiedeń, Londyn, Rzym (15 maja 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
TransFormation.doc (17 maja 2015 r.)
ERA NET ERA MINI
Międzynarodowe projekty badawcze (19 maja 2015 r.)
L’Oréal Polska
Dla Kobiet i Nauki 2015 (21 maja 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Polonium 2016/2017 (29 maja 2015 r.)
Instytut Monitorowania Mediów
Staże dla studentów (31 maja 2015 r.)
Obserwator Finansowy
4. edycja konkursu Obserwatora Finansowego (31 maja 2015 r.)
Fundusz Wyszehradzki
Małe Granty (1 czerwca 2015 r.)
European Research Council
ERC Advanced Grants (2 czerwca 2015 r.)
Cyfronet
Konkurs na doktorat (5 czerwca 2015 r.)
Narodowe Centrum Nauki
JPI HDHL: Nutrition and Cognitive Function (8 czerwca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Monografie (9 czerwca 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Wymiana osobowa z Czechami 2016-2017 (10 czerwca 2015 r.)
Wymiana osobowa z Włochami 2016-2018 (10 czerwca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Polsko-Niemiecka Nagroda Naukowa „Nicolaus Copernicus” (15 czerwca
2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
Polsko-tureckie projekty (15 czerwca 2015 r.)
Narodowe Centrum Nauki
Preludium (16 czerwca 2015 r.)
Sonata (16 czerwca 2015 r.)
Opus (16 czerwca 2015 r.)
Tygodnik Polityka
Nagrody Naukowe (22 czerwca 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
Demonstrator (22 czerwca 2015 r.)
MNiSW/DAAD
Polsko-niemiecka wymiana osobowa na lata 2016-2017 (30 czerwca 2015
r.)
Galileo Masters
Konkurs z wykorzystaniem nawigacji satelitarnej (30 czerwca 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Wymiana osobowa ze Słowacją 2016-2017 (30 czerwca 2015 r.)
PO WER
Programy mobilności ponadnarodowej (30 czerwca 2015 r.)
Kobiety Nauki
Innowacja jest kobietą V (30 czerwca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Stypendium im. Leszka Kołakowskiego (30 czerwca 2015 r.)
European Pioneers
Granty na rozwój e-biznesu (30 czerwca 2015 r.)
Uniwersytet Ekonomiczny w Poznaniu
Od kreacji do ekoinnowacji (30 czerwca 2015 r.)
Ekoinnowacja w kadrze (30 czerwca 2015 r.)
Ekoinnowacja nie tylko na papierze (30 czerwca 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
GO_GLOBAL.PL (15 lipca 2015 r.)
Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości
Akademicki Mistrz Innowacji V (15 lipca 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
InnoLot (17 lipca 2015 r.)
Verba Veritatis
Konkurs na pracę z etyki biznesu (31 lipca 2015 r.)
Instytut Chemii Fizycznej PAN
Dream Chemistry Award 2015 (31 lipca 2015 r.)
Ministerstwo Spraw Wewnętrznych
Prace dyplomowe (15 sierpnia 2015 r.)
Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
Praca naukowa o własności intelektualnej (7 września 2015 r.)
Akcje Marii Skłodowskiej-Curie
Individual Fellowships (10 września 2015 r.)
Urząd Patentowy RP
III konkurs na informację medialną (15 września 2015 r.)
Konkurs na film o ochronie własności intelektualnej (15 września 2015 r.)
Komisja Europejska
Nauka z udziałem społeczeństwa i dla społeczeństwa (16 września 2015
r.)
ERA-NET Transport III
II konkurs (2 października 2015 r.)
Instytut Chemii Fizycznej PAN
Złoty Medal Chemii 2015 (16 października 2015 r.)
Narodowe Centrum Nauki
Polonez (15 grudnia 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
Szybka ścieżka (31 grudnia 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Granty na granty (31 grudnia 2015 r.)
źródło: zdobywamy granty na badania
Rekrutacja
studentów
i
absolwentów do pracy w Komisji
Europejskiej. Płaca: 4 tys.
Euro/mies.
Do 21 kwietnia 2015 r. trwa nabór zgłoszeń do pracy w strukturach
Komisji Europejskiej. Zgłoszenia mogą przesyłać kandydaci, którzy
spełniają następujące warunki:
1. Mają ukończone co najmniej trzyletnie studia wyższe w dowolnej dziedzinie (w
tym przyrodnicze, biologia, biotechnologia, ochrona środowiska, etc), lub studiują
na ostatnim roku
2. Posiadają dobrą znajomość dwóch języków europejskiich (swój język
podstawowy oraz język angielski, francuski lub niemiecki),
3. Są obywatelami UE.
Szczegółowe informacje o konkursie można znaleźć na stronie internetowej
przedstawicielstwa Komisji Europejskiej.
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Assistant Professor in Medical
genomics – oferta Królewskiego
Instytutu
Sztokholmie
Technologii
w
Znakomita instytucja naukowo-badawcza – Królewski Instytut Technologii
w Sztokholmie ogłosił konkurs na pozycję Assistant Professor w zakresie
genomiki medycznej. Serdecznie zapraszamy do składania ofert.
KTH Royal Institute of Technology
KTH Royal Institute of Technology in Stockholm is the largest and oldest technical
university in Sweden. No less than one-third of Sweden’s technical research and
engineering education capacity at university level is provided by KTH. Education
and research spans from natural sciences to all branches of engineering and
includes Architecture, Industrial Management and Urban Planning. There are a
total of 12,400 full year students at first and second levels, almost 1,900 active (at
least 50 per cent) research students and 5,100 employees.
The Science for Life Laboratory (SciLifeLab) is a collaboration between four
universities in Stockholm and Uppsala: Stockholm University, Karolinska
Institutet, the KTH – Royal Institute of Technology (KTH) and Uppsala University.
The center combines advanced technical know-how and state-of-the-art
equipment with a broad knowledge in translational medicine and molecular
bioscience. SciLifeLab is a competitive center for high-throughput biosciences
with platforms in genomics, comparative genetics, proteomics, bioimaging and
functional genomics as well as research communities (programs) in biology,
medicine and environmental sciences.
KTH is strengthening its research on a global scale. We are currently looking to
recruit 13 Assistant Professors, whom we will offer the opportunity to develop
both their research and their teaching. These recruitments are a part of a larger
effort and will be conducted within broad areas, ranging from Mathematics and
Bioelectronics to Sustainable Urban Development and Process Engineering. The
new Assistant Professors will receive a four-year starting grant, and permanent
base funding if they qualify as Associate Professors. For more information about
the recruitment initiative, see the following web page.
www.kth.se/applytoassistantprofessor
Subject field
Medical genomics
Subject description
The subject field comprises method development and application of massively
parallel DNA sequencing of the human genome in combination with targeted
functional and mechanistic experiments with the purpose to map and predict the
function of genetic variants found in the human genome. The key aim is to
facilitate identification and interpretation of genetic variants to improve
diagnostics of genetic disease and enable individualized treatment.
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
Duties
The position encompasses both research and teaching within the area of medical
genomics. The applicant is expected to establish a research program for
developing novel methods for medical genomic analysis.
The Assistant Professor will be given opportunity to develop their independence
as researcher and gain accreditation that may allow them to take other teaching
positions with higher eligibility requirements (see Chapter 4, Section 12 a of the
Higher Education Ordinance). Following application, the Assistant Professor shall
be assessed for promotion to Associate Professor.
Eligibility
A person is eligible for appointment if they have attained a Degree of Doctor or
have the equivalent academic expertise. Primarily, persons should have attained a
Degree of Doctor or have acquired the equivalent expertise no more than seven
years before the end of the application period.
Grounds of assessment
The applicant’s long-term development potential is of significant importance. In
this context, the applicant’s skills and proven experience of change and renew
his/her own research activities will be assessed
Research expertise is of significant importance in the assessment and can be
shown, for example, through international publication and presentations at
international conferences of high scientific quality. The applicant’s ability to
establish and develop cooperation within research and education is of
importance.
It is of importance that a person who is appointed Assistant Professor at KTH has
experience from research environments other than KTH, equivalent to a postdoctorate period or doctorate degree from another institution. In more practical
areas, experience from industry can be just as valuable as a traditional postdoctoral residency at another university.
Studies or research abroad is of significant importance, as is a documented ability
to initiate international collaborations.
It is of significant importance that the applicant has experience in method
development. A documented experience of initiating and leading larger research
project financed by acquired external funds is of importance.
It is of significant importance that the applicant is an experienced programmer
and has well documented experience of developing novel algorithms for
systematic analysis and visualization of MPS data.
Ability to collaborate with the surrounding society and to disseminate information
regarding research and development work is of significant importance. In
addition, the applicant’s expertise in developing and leading activities and
personnel is also desirable. This includes having knowledge about matters of
diversity and equal treatment, with particular focus on gender equality.
The candidate’s qualities to lead the staff and organizational development are of
importance
Special grounds of assessment for promotion to Associate Professor
When assessing applications for promotion to Associate Professor, the applicant’s
ability to independently initiate and carry out research of high academic quality,
published in international publications, and the applicant’s ability to obtain
financing for research operations will be assessed. One special ground for
assessment is the applicant’s ability to independently establish new collaborations
and research specializations. Special consideration will be shown to displayed
teaching and supervising expertise.
Trade union representatives
You’ll find contact information to trade union representatives at KTH:s webbpage.
Application
Your application should follow KTH´s CV template for employment of teachers.
You are the main responsible to ensure that the application is complete according
to the ad and CV template. Your complete application must be received at KTH no
later than the last day of application. Log into KTH’s recruitment system in order
to apply to this position.
Others
Time limitation: The appointment is for an indefinite term, but no more than four
years, and may be extended if, due to the teacher’s absence due to sick leave,
parental leave or other special grounds, more time is required to reach the
objectives of the appointment. However, the total appointment period may not
exceed six years. The appointment is part of the Tenure Track system at KTH and
the Assistant Professor may apply for promotion to tenured Associate Professor.
We firmly decline all contact with staffing and recruitment agencies and job ad
salespersons.
Type of employment:
Temporary position longer than 6 months
Working hours:
Full time
First day of employment:
As soon as possible
Salary:
Monthly pay
Number of positions:
1
Working hours:
100 %
City:
Solna
County:
Stockholms län
Country:
Sweden
Reference number:
B 2015-0054
Contact:
1. Joakim Lundeberg, Professor, Email: [email protected]
2. Amelie Eriksson Karlström, Professor, Email: [email protected]
3. Jenny Wiklund, Officer, application questions, Email: [email protected]
Najbliższe konkursy – wykaz
W ciągu najbliższego miesiąca będzie można wziąć udział w bardzo wielu ważnych
konkursach. 9 marca zamykany jest Neuron II: Międzynarodowe projekty z
neurologii . 15 marca zamknięty zostanie LIDER VI ogłoszony przez NCBiR. 16
marca zamknie konkursy konkursów Etiuda, Fuga i Symfonia Narodowe Centrum
Nauki. Nie przegapcie konkursów MNiSW: Nagrody dla nauczycieli
akademickich , Nagrody za wybitne osiągnięcia naukowe oraz za osiągnięcia w
opiece naukowej i dydaktycznej, Stypendia dla wybitnych młodych
naukowców, Działalność upowszechniająca naukę, Nagroda za osiągnięcia
naukowe.
Poniżej znajduje się wykaz konkursów na najbliższe tygodnie:
ERA-NET FACCE SURPLUS
I konkurs (4 marca 2015 r.)
Eurostars 2
Współpraca międzynarodowa (5 marca 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Organizowanie i animowanie działań na rzecz środowiska akademickiego
(5 marca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Szkolenia z zakresu przedsiębiorczości (6 marca 2015 r.)
Rząd Francuski
Stypendia dla studentów i na doktoraty (6 marca 2015 r.)
Allegro Short Lab
Grant na realizację filmu (8 marca 2015 r.)
ERA-NET Neuron II
Międzynarodowe projekty z neurologii (9 marca 2015 r.)
Szczecin
Stypendia dla studentów i doktorantów (10 marca 2015 r.)
European Research Council
ERC Consolidator Grant (12 marca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
Praxis – staże zagraniczne (15 marca 2015 r.)
Narodowe Centrum Badań i Rozwoju
LIDER VI (15 marca 2015 r.)
Fundusz Wyszehradzki
Standardowe granty (15 marca 2015 r.)
TRANSCAN-2
Międzynarodowe projekty z onkologii (16 marca 2015 r.)
Infect-ERA
Międzynarodowe projekty z chorób zakaźnych (16 marca 2015 r.)
Niezależne Zrzeszenie Studentów SGH
Ogólnopolski Konkurs Fotografii Studenckiej (23 marca 2015 r.)
Cornet
19. konkurs (27 marca 2015 r.)
Fundacja na rzecz Nauki Polskiej
eNgage(31 marca 2015 r.)
GFPS
Stypendia na studia w Niemczech (31 marca 2015 r.)
Lean in STEM
Program mentoringowy dla kobiet (31 marca 2015 r.)
Fundacja Współpracy Polsko-Niemieckiej
Stypendium dla pisarzy i tłumaczy (31 marca 2015 r.)
MIT Technology Review
Innovators Under 35 (31 marca 2015 r.)
Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego
Nagrody dla nauczycieli akademickich (31 marca 2015 r.)
Nagrody za wybitne osiągnięcia naukowe oraz za osiągnięcia w opiece
naukowej i dydaktycznej (31 marca 2015 r.)
Stypendia dla wybitnych młodych naukowców (31 marca 2015 r.)
Działalność upowszechniająca naukę (31 marca 2015 r.)
Nagroda za osiągnięcia naukowe (31 marca 2015 r.)
źródło: zdobywamu granty na badania
Viscolase firmy A&A Biotechnology
Firma A&A Biotechnology jest producentem blisko 200 produktów obejmujących
zestawy do izolacji kwasów nukleinowych (DNA, RNA) z różnorodnych źródeł
materiału biologicznego,odczynniki do reakcji PCR, Real-Time PCR, Hot-Start
PCR, rekombinowane białka i enzymy lityczne. Nowością na rynku jest Viscolasa,
która pozwala uniknąć problemu gęstych i lepkich preparatyk białkowych.
Viscolasa jest rekombinowaną nukleazą o szerokim spektrum aktywności.
Produkowana jest w unikalnym systemie drożdżowym. Enzym posiada aktywność
endonuleazy degradującej wszystkie formy DNA i RNA do polinukleotydów o
długości od 2 do 5 zasad i jest aktywny w szerokim zakresie buforowym. Do swojej
aktywności wymaga jonów magnezu.
Zastosowanie:
1. Zmniejszenie lepkości lizatów komórkowych (bakteryjnych, drożdżowych,
ssaczych, itp.);
2. Przygotowanie próbek do rozdziału białek w elektroforezie 2D;
3. Usuwanie DNA i RNA z preparatów białek rekombinowanych.
Viscolase jest dostępna w opakowaniach po 25 000 U, 100 000 U w stężeniu 250
U/μl.
Definicja jednostki: 1 U Viscolase jest zdefiniowana jako ilość enzymu powodująca
zmianę absorpcji roztworu DNA A260 o 1,0 jednostkę w czasie 30 min, co
odpowiada całkowitemu strawieniu 37 μg DNA.
Na stronach sklepu internetowego A&A Biotechnology dostępne są opakowania
po 25 000 U i 100 000 U w stężeniu 250 U/μl.
Nukleaza Viscolase o stężeniu 250 U/µl jest dostarczona w buforze zawierającym:
50% glicerol, 20 MM Tris-HCl ph 8.0, 20 mM NaCl oraz 2 mM MgCl. W
preparacie nie stwierdzono aktywności proteolitycznej.
Enzym może być stosowany w połączeniu z powszechnie używanymi lizozymami.
TBE jest świetnym buforem do rozdziału krótszych produktów
źródło własne, dom, publ.
***
Więcej informacji o Viscolasie oraz innych produktach znaleźć można na stronie
internetowej firmy A&A Biotechnology.