BADANIE ZDOLNOŚCI TWORZENIA BIOFI
Transkrypt
BADANIE ZDOLNOŚCI TWORZENIA BIOFI
FAKULTET - FIZJOLOGIA BAKTERII Koordynator - dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW ĆWICZENIE: BADANIE ZDOLNOŚCI TWORZENIA BIOFILMU (na podstawie: Stepanović i wsp., 2004; Harvey i wsp., 2007) Autor i główny prowadzący dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW Asysta: mgr Marta Piotrowska, mgr Rafał Ostrowski Wstęp teoretyczny - wykład dr hab. M. Popowskiej, prof. UW Do badania zdolność tworzenia przez bakterie biofilmu wykorzystuje się polipropylenowe 96dołkowe płytki titracyjne. Dla każdego szczepu należy przygotować oddzielne płytki, zawierające w poszczególnych dołkach płynne podłoże LB (po 200 µl) lub podłoże LB z dodatkiem określonego detergentu powierzchniowo-czynnego w różnych stężeniach 1 i 10% lub 1 i 10 mM (Triton X-100, EDTA). Do każdego dołka z podłożem wprowadza się po 20 µl lub 30 µl nocnych hodowli poszczególnych szczepów bakterii, stanowiących inokulum. Przygotowane w ten sposób płytki, zabezpieczone przed parowaniem (przykryte i owinięte parafilmem) należy inkubować w temp. 30 °C lub 37 °C, w zależności od badanego szczepu bakterii. Po upływie wyznaczonego czasu inkubacji płytki trzykrotnie należy przepłukać sterylną wodą destylowaną, w celu usunięcia bakterii wolnopływających. Następnie do każdego wgłębienia należy dodać po 200 µl metanolu i inkubować 15 minut w temperaturze pokojowej, po czym usunąć alkohol i dokładnie wysuszyć płytki. W celu zabarwienia zaadherowanych komórek bakterii, do dołków dodać po 200 µl roztworu fioletu krystalicznego. Po 15-minutowej inkubacji barwnik należy wypłukać bieżącą wodą z kranu, a płytki pozostawić do wyschnięcia. Następnie do wysuszonych dołków dodać po 200 µl 33% kwasu octowego. W tak przygotowanych płytkach mierzono absorbancję roztworu, odpowiadającą gęstości komórek zadherowanych do podłoża w poszczególnych dołkach. Pomiary prowadzono przy fali o długości 570 nm, w aparacie „µQant” firmy Bio-Tek Instruments. Kontrolę negatywną doświadczenia stanowiło niezaszczepione podłoże LB. Przygotować: 1. hodowle nocne Escherichia coli oraz Bacillus subtilis 2. podłoże płynne LB 3. płytki titracyjne 4. metanol 5. fiolet krystaliczny 6. kwas octowy 33% 7. ręczniki papierowe 8. 100 mM roztwór EDTA 9. 100% Triton X-100 Wyniki należy wpisać w tabele i przedstawić za pomocą wykresów. WZÓR PŁYTKI TITRACYJNEJ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 A B C D E F G H Literatura uzupełniająca: 1. Wykłady z Fizjologii Bakterii. Popowska M. 2. Stepanović, S., Ćirković, L., Ranin, L., Švabić – Vlahović, M., 2004. Biofilm formation by Salmonella spp. And Listeria monocytogenes on plastic surface. Lett. Appl. Microbiol. 38(5):428 – 432. 3. Harvey, J., Keenan, K.P., Gilmour, A., 2007. Assessing biofilm formation by Listeria monocytogenes strains. Food Microbiol. 24(4):380 – 392.