KARTA KURSU
Transkrypt
KARTA KURSU
KARTA KURSU Nazwa Metody biologii molekularnej w ochronie środowiska Nazwa w j. ang. Molecular biological methods in environmental protection Kod Punktacja ECTS* 2 Zespół dydaktyczny Koordynator Dr Gabriela Gołębiowska-Pikania Dr Katarzyna Gawrońska Dr Gabriela Gołębiowska-Pikania Dr Michał Nosek Opis kursu (cele kształcenia) Poznanie metod analizy molekularnej materiału biologicznego oraz metod izolacji i oczyszczania substancji. Zapoznanie z zasadami pracy w laboratorium i materiałem biologicznym. Poznanie metod pracy w warunkach sterylnych, sposobów izolacji białek, oczyszczania oraz określania ich zawartości. Poznanie metodyki rozdziałów białek metodą elektroforezy. Zapoznanie z metodami spektrofotometrycznymi. Kształtowanie umiejętności planowania eksperymentu naukowego. Warunki wstępne Wiedza Umiejętności Kursy Znajomość właściwości biochemicznych i fizycznych składników budulcowych komórek roślin i zwierząt. Znajomość własności tkanek roślinnych i zwierzęcych Podstawowe doświadczenie w pracy laboratoryjnej, w pracy z odczynnikami i materiałem biologicznym oraz prostym sprzętem laboratoryjnym. Biochemia, Chemia organiczna, Genetyka 1 Efekty kształcenia Efekt kształcenia dla kursu Wiedza Odniesienie do efektów kierunkowych W01 Zna metody izolacji i oczyszczania substancji. K_W18, K_W23 W02 Opisuje rodzaje, zasady i zastosowanie rozdziału elektroforetycznego. K_W18, K_W23 W03 Określa rodzaje, zastosowanie i zasady rozdziałów chromatograficznych. K_W18, K_W23, K_W24 W04 Opisuje zasadę i zastosowanie metody hybrydyzacji Western-Blot. K_W18, K_W23, K_W24 W05 Potrafi opisać zasadę i zastosowanie metody SELDI-TOF i MALDI-TOF. K_W18, K_W23, K_W24 W06 Omawia selektywne znakowanie substancji w żywych komórkach. K_W18, K_W23, W07 Zna zastosowanie białka GFP. K_W18, K_W23, W08 Opisuje zasadę testu ELISA oraz metody mikromacierzy. K_W18, K_W23, K_W24 W09 Zna metody uzyskania trójwymiarowych obrazów molekuł. K_W10, K_W18, K_W23 W10 Zna ogólne zasady bezpiecznej pracy w laboratorium oraz pracy w warunkach sterylnych.. K_W25 2 Efekt kształcenia dla kursu Odniesienie do efektów kierunkowych U01 Poprawnie posługuje się drobnym sprzętem laboratoryjnym i aparaturą pomiarową. K_U05, K_U18 U02 Przygotowuje odczynniki do pracy z materiałem biologicznym. K_U05, K_U18 U03 Przeprowadza izolacje i oczyszczanie białek różnymi K_U05, K_U18, K_U24 metodami. Umiejętności U04 Wykonuje spektrofotometryczne oznaczenie zawartości białka. K_U05, K_U18, K_U24 U05 Przeprowadza rozdział białek metodą elektroforezy wraz z barwieniem i utrwaleniem. K_U05, K_U18, K_U24 U06 Dokumentuje i analizuje uzyskane foregramy. K_U19 U07 Szacuje właściwości białek na podstawie ich sekwencji aminokwasowej w bazach danych. K_U19, K_U20 U08 Wykonuje spektrofotometryczny pomiar aktywności wybranych enzymów. K_U05, K_U18, K_U24 Efekt kształcenia dla kursu Kompetencje społeczne Odniesienie do efektów kierunkowych K01 Wykorzystuje udostępniony sprzęt laboratoryjny zgodnie z zaleceniami. K_K11 K02 Stosuje się do obowiązujących zasad BHP. K_K10, K_K11 K03 Sprawnie realizuje powierzone zadania poprzez działanie samodzielne lub pracę w grupach. K_K08, K_K12 3 Organizacja Forma zajęć Ćwiczenia w grupach Wykład (W) A Liczba godzin K L 10 S P E 15 Opis metod prowadzenia zajęć Wykłady prowadzone z wykorzystaniem takich technik jak: prezentacje multimedialne, filmy instruktarzowe, przekaz bezpośredni oraz dyskusja. Ćwiczenia prowadzone w oparciu o indywidualną i zespołową pracę studentów, obejmują zajęcia praktyczne z zakresu izolacji i analizy białek. W01 W02 W03 W04 W05 W06 W07 W08 W09 W10 W11 U01 U02 U03 U04 U05 U06 U07 U08 U09 K01 K02 K03 X X X X X X X X X X X Inne Egzamin pisemny Egzamin ustny Praca pisemna (esej) Referat Udział w dyskusji Projekt grupowy Projekt indywidualny Praca laboratoryjna Zajęcia terenowe Ćwiczenia w szkole Gry dydaktyczne E – learning Formy sprawdzania efektów kształcenia X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X 4 Kryteria oceny Kryterium zaliczenia jest obecność oraz aktywność na zajęciach laboratoryjnych i wykładach a także pozytywne zaliczenie kolokwium podsumowującego kurs. Uwagi Treści merytoryczne (wykaz tematów) Podział metod analizy molekularnej materiału biologicznego. Metody izolacji i oczyszczania substancji. Elektroforeza - rodzaje, zasady rozdziału i zastosowanie. Wizualizacja i analiza rozdzielonych substancji metodą SDS PAGE i elektroforezy natywnej. Chromatografia - rodzaje, zasady rozdziału i zastosowanie. Zasada i zastosowanie metody hybrydyzacji Western-Blot. Zasady i zastosowanie metody SELDI-TOF i MALDI-TOF. Selektywne znakowanie substancji w żywych komórkach. Zastosowanie białka GFP. Zasada i zastosowanie testu ELISA i metody mikromacierzy. Metody uzyskania trójwymiarowych obrazów biomolekuł. Wykaz literatury podstawowej Amersham Biosciences: Proteomics. Principles and methods,. Handbook, 2004 Bio-Rad: A Methods and Product Manual, 2009 Kozik A., Rąpała-Kozik M., Guevara-Lora I.: Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane problemy i metody instrumentalnej biochemii analitycznej. Seria Wydawnicza Instytutu Biologii Molekularnej Uniwersytetu Jagiellońskiego, Kraków 2001 Kęcki Z.: Podstawy spektroskopii molekularnej, PWN, Warszawa 1998 Walkowiak B.: Techniki chromatografii cieczowej. Przykłady zastosowań. Amersham Pharmacia Biotech. MORPOL, Lublin 2000 Proteomika. Red. A. Kraj, J. Silberring. Wydział Chemii UJ, Kraków 2004 Wykaz literatury uzupełniającej Wprowadzenie do chemii białek. Red. A. Dubin. Wydział Biotechnologii UJ, Kraków 2003 Rasch D., Herrendorfer G.: Statystyczne planowanie doświadczeń. PWN, Warszawa 1991 Harris E.L.V., Angal S.: Protein purification methods. A practical approach, IRL Press, Oxford-UK 1995. 5 Alberts B., Bray D., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walter P. (1999). Podstawy biologii komórki Wydawnictwo Naukowe PWN. Warszawa. Bilans godzinowy zgodny z CNPS (Całkowity Nakład Pracy Studenta) Ilość godzin w kontakcie z prowadzącymi Ilość godzin pracy studenta bez kontaktu z prowadzącymi Wykład 10 Konwersatorium (ćwiczenia, laboratorium itd.) 15 Pozostałe godziny kontaktu studenta z prowadzącym 5 Lektura w ramach przygotowania do zajęć 10 Przygotowanie krótkiej pracy pisemnej lub referatu po zapoznaniu się z niezbędną literaturą przedmiotu 10 Przygotowanie projektu lub prezentacji na podany temat (praca w grupie) Przygotowanie do egzaminu Ogółem bilans czasu pracy 50 Ilość punktów ECTS w zależności od przyjętego przelicznika 2 6