Recenzja II
Transkrypt
Recenzja II
Gliwice, 8.10.2016 dr hab. inż. Robert Michnik, Prof. nzw. w Pol. Śl. Katedra Biomechatroniki Politechnika Śląska Wydział Inżynierii Biomedycznej ul. Roosevelat 40 41-800 Zabrze e-mail: [email protected] RECENZJA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ mgr inż. Magdaleny Żuk pt.: „Spersonalizowane badanie i modelowanie chodu człowieka” 1 Podstawa formalna opracowania recenzji Podstawę opracowania recenzji stanowi decyzja Rady Wydziału Mechanicznego Politechniki Wrocławskiej oraz pismo Pana Dziekana Wydziału informujące o wyznaczeniu mnie na recenzenta rozprawy doktorskiej mgr inż. Magdaleny Żuk w dyscyplinie Mechanika. 2 Przedmiot i zawartość rozprawy Przedmiotem recenzji jest rozprawa doktorska pt.: "Spersonalizowane badanie i modelowanie chodu człowieka" autorstwa pani mgr inż. Magdaleny Żuk. Praca ma charakter teoretyczno-badawczy i składa się z 7 rozdziałów głównych, spisów: literatury, rysunków, tabel oraz załączników. Całość pracy liczy 180 stron, 92 rysunki, 19 tabel. Do napisania pracy wykorzystano 224 pozycje literaturowe związane ściśle z tematyką prowadzonych przez autorkę badań. Rozprawa uzupełniona została 6 załącznikami zawierającymi wyniki przeprowadzonych symulacji numerycznych. Podczas realizacji głównych celów pracy przeprowadzono liczne badania chodu kinematyki osób zdrowych, dokonano szeregu symulacji numerycznych pozwalających na identyfikację sił mięśniowych oraz przeprowadzono obszerną analizę uzyskanych wyników z wykorzystaniem narzędzi statystycznych. Praca została podzielona na trzy części stanowiące odpowiednio wprowadzenie do prowadzonych badań, opis badań własnych oraz podsumowanie końcowe. W skład pierwszej części pracy wchodzą rozdziały obejmujące wstęp, analizę stanu wiedzy oraz sformułowany cel i zakres pracy. Drugą część pracy zawiera trzy rozdziały poświęcone badaniom własnym. Poszczególne rozdziały tej części rozprawy poświęcone są opisowi badań związanych z: analizą kinematyki chodu z wykorzystaniem kalibracji anatomicznej (rozdział 4), analizą wrażliwości modelu mięśniowo-szkieletowego (rozdział 5) oraz walidacji wyników symulacji dynamicznych z wykorzystaniem elektromiografii powierzchniowej (rozdział 6). Wyniki tych badań przedstawiono w postaci licznych wykresów oraz poddano dokładnej analizie z wykorzystaniem metod statystycznych. Dzięki temu możliwe było sformułowanie wniosków szczegółowych, przedstawionych na końcu z każdego rozdziałów oraz zebranych w rozdziale 7 będącym podsumowaniem końcowym pracy. 3 3.1 Ocena merytoryczna pracy Tematyka rozprawy Na podstawie przeprowadzonego prze autorkę pracy bardzo obszernego przeglądu literatury w zakresie badań kinematyki chodu, metod modelowania układu ruchu człowieka, modelowania układu mięśniowego, jak również tworzenia spersonalizowanych modeli układu mięśniowo-szkieletowego sformułowano dwa cele pracy: opracowanie nowych, spersonalizowanych metod badania kinematyki chodu człowieka, walidacja współcześnie stosowanych komputerowych, wieloczłonowych modeli mięśniowo - szkieletowych oraz różnych technik symulacji dynamicznych. Tu należy zauważyć, że pełna realizacja drugiego celu, ze względu na brak istniejących nieinwazyjnych metod bezpośredniego pomiaru sił powstających w poszczególnych mięśniach, na obecnym etapie rozwoju nauki jest praktycznie nie możliwa. Realizacja powyższych celów została przeprowadzona na podstawie badań własnych obejmujących pomiary kinematyki chodu różnymi metodami oraz symulacje numeryczne obciążeń układu szkieletowo-mięśniowego. W pracy przedstawiono nową, autorską metodę pomiarów kinematyki ruchu kończyn dolnych podczas chodu z wykorzystaniem systemów optycznych. Metodyka ta zakłada, że pomiar kinematyki dokonywany jest za pomocą klasterów markerów rozmieszczonych na poszczególnych segmentach ciała, których ruch śledzony jest za pomocą optycznego sytemu. Z każdym klastrem markerów związany jest układ współrzędnych danego segmentu ciała, w których dodatkowo rozmieszczono są wirtualne markery. Wyznaczone przemieszczenia klasterów markerów rozmieszczonych na segmentach ciała, pozwalają na zdefiniowanie lokalnych układów współrzędnych a następnie wyznaczenie kątów anatomicznych. W rozprawie zaproponowano również protokół pomiarowy pozwalający na identyfikację położenia środka stawu biodrowego za pomocą tzw. metody funkcjonalnej oraz metodykę badań kinematyki chodu z wykorzystaniem ultrasonografii. Z wykorzystaniem wszystkich opisanych metod przeprowadzono badania grupy osób zdrowych, a otrzymane wyniki skonfrontowano z wynikami uzyskiwanymi przy wykorzystaniu standardowych protokołów pomiarowych powszechnie stosowanych w komercyjnych systemach pomiarowych. Przeprowadzona analiza porównawcza wykazała, że wyniki otrzymywane z wykorzystaniem standardowego protokółu pomiarowego są rozbieżne z bardziej dokładnymi metodami pomiaru zaproponowanymi przez autorkę pracy. Analizę wrażliwości modelu mięśniowo-szkieletowego przeprowadzono wykonując szereg symulacji (prowadzonych w oprogramowaniu OpenSim) pozwalających na ocenę wpływu wprowadzanych parametrów modelu ciała człowieka, modelu układu mięśniowego oraz zastosowanych metod identyfikacji na wartości wyznaczanych sił mięśniowych. Badania te przeprowadzano wykorzystując dane kinematyczne zaczerpnięte z literatury. W szczególności analiza wrażliwości prowadzona była w zakresie oceny wpływu na wyznaczane siły mięśniowe takich wielkości jak: o parametry geometryczno-bezwładnościowych poszczególnych segmentów modelu - parametry te zmieniano o 4% do 19% wartości przyjętej jako prawidłowa, o wartości maksymalnej siły izometrycznej poszczególnych mięśni uwzględnionych w modelu - wartości te zmieniano zwiększając lub zmniejszając wartość przyjętą jako prawidłowa o 50%, o wyznaczanego na podstawie pomiarów kinematycznych położenia środka stawu biodrowego - wprowadzono zmianę położenia środku stawu biodrowego o 20 mm w stosunku do położenia przyjętego jako prawidłowe, Ponadto dokonano oceny wpływu na wyniki obliczeń: o różnych postaci funkcji celu w metodzie identyfikacji statycznej, o różnych technik identyfikacji sił mięśniowych (porównanie wyników z zastosowaniem metody optymalizacji statycznej i metody CMC), o różnej liczby mięśni uwzględnionych w modelu. Rozdział ten kończy się porównaniem wyników z różnych wariantów przeprowadzonych symulacji, w którym autorka wskazuje jaki wpływ na wyniki mają poszczególne modyfikacje parametrów modelu oraz wykorzystane metody obliczeniowe. Ostatnią częścią badań własnych jest walidacja wyników symulacji dynamicznych z wykorzystaniem elektromiografii powierzchniowej. W tym celu przeprowadzono pomiary kinematyki chodu z równoczesnym pomiarem sił reakcji podłoża oraz sygnałów EMG wybranych mięśni. Pomiary przeprowadzono z wykorzystaniem optycznego systemu VICON, platform dynamometrycznych firmy Kistler oraz systemu Motion Lab. W badaniach doświadczalnych zbadano grupę 3 zdrowych osób, a uzyskane wyniki wykorzystano jako dane wejściowe do wyznaczenia sił mięśniowych w oprogramowaniu OpenSim. Walidację wyników symulacji dynamicznych przeprowadzono badając korelację pomiędzy wynikami otrzymane z dwóch różnych metod stosowanych do określenia funkcjonowania układu mięśniowego: pomiarów EMG oraz identyfikacji sił mięśniowych z wykorzystaniem modelowania matematycznego i metod optymalizacyjnych. Obie metody wykorzystywane są do oceny funkcjonowania układu mięśniowego, ale ocena ta dokonywana jest na podstawie dwóch różnych wielkości fizycznych. W pomiarach EMG dokonywany jest pomiar różnicy potencjałów elektrycznych pomiędzy dwoma elektrodami umieszczonymi na skórze nad badanym mięśniem. Przetworzona wartość zarejestrowanych sygnałów pozwala oszacować wielkość aktywacji badanego mięśnia. Za pomocą metod identyfikacji wyznaczamy z kolei wartości sił mięśniowych. Tak więc ilościowe porównanie dwóch różnych wielkości, które zaproponowano w pracy nie wydaje się do końca prawidłowe. Dodatkowo należy pamiętać również, że obydwie metody mają swoje wady, które wpływają na dokładność otrzymanych wyników. Identyfikacja sił mięśniowych wymaga akceptacji wykorzystanego w procesie optymalizacji hipotetycznego kryterium sterowania przez układ nerwowy pracą mięśni. Na dokładność sygnału EMG wpływa poprawność rozmieszczenia elektrod pomiarowych, grubość skóry oraz tkanki tłuszczowej nad badanym mięśniem. Ponadto zgodnie z modelem mięśnia typu Hilla, wartość siły mięśniowej oprócz aktywacji mięśnia, przekroju poprzecznego mięśnia zależy od aktualnej długości mięśnia (lub wydłużenia) oraz od prędkości skracania włókien mięśniowych. Tak więc nie można zakładać, że pomiędzy sygnałem EMG oraz wartością siły mięśniowej powinna istnieć korelacja liniowa, a zaproponowana walidacja modeli na podstawie badania korelacji pomiędzy sygnałem EMG i wyznaczanymi siłami mięśniowym nie do końca jest miarodajna. Jest to o tyle ważna uwaga, że na podstawie przeprowadzonej w tej części pracy badań, autorka formułuje jedne z wniosków końcowych, który brzmi "Przeprowadzona walidacja z wykorzystaniem elektromiografii wykazała, że stosowane techniki optymalizacyjne i przyjęte kryteria nie opisują poprawnie funkcjonowania niektórych mięśni." Najważniejsze osiągnięcia pracy Do najważniejszych, oryginalnych osiągnięć badawczych przedstawionej pracy doktorskiej należy zaliczyć: 3.2 opracowanie autorskiego protokołu badania kinematyki chodu wykorzystującego optyczny system śledzenia ruchu i bazującego na metodzie anatomicznej oraz weryfikacja opracowanej metody pomiarowej, przeprowadzenie badań doświadczalnych chodu na grupie osób zdrowych pozwalających na porównanie wielkości kinematycznych wyznaczanych za pomocą standardowych protokołów pomiarowych oraz opracowanego anatomicznego protokołu, 4 opracowanie autorskiej metody identyfikacji położenia środka stawu biodrowego podczas pomiarów kinematyki chodu oraz walidacja tejże metody z wykorzystaniem technik obrazowania USG, ocena wpływu różnych technik kalibracji, metod oraz modeli wykorzystywanych w badaniach chodu na wyznaczane wartości i przebiegi kątów anatomicznych, przeprowadzenie wielowariantowych symulacji komputerowych obciążeń układu szkieletowo-mięśniowego z różnymi zestawami parametrów wprowadzanych do modelu, ocena wpływu na wyniki wyznaczanych w procesie identyfikacji sił mięśniowych: o parametrów geometryczno-bezwładnościowych poszczególnych segmentów modelu, o wartości maksymalnej siły izometrycznej poszczególnych mięśni uwzględnionych w modelu, o wyznaczanego na podstawie pomiarów kinematycznych położenia środka stawu biodrowego, o różnych postaci funkcji celu w metodzie identyfikacji statycznej, o różnych technik identyfikacji sił mięśniowych (porównanie wyników z zastosowaniem metody optymalizacji statycznej i metody CMC), o różnej liczby mięśni uwzględnionych w modelu, sformułowanie ogólnych wytycznych związanych z personalizacją modeli matematycznych stosowanych w identyfikacji sił mięśniowych. Uwagi krytyczne i dyskusja materiału naukowego 1. 2. 3. Opis matematyczny kinematyki kończyn dolnych przedstawiony w rozdziale 4.1.1 jest bardzo skąpy. Ogranicza sie do przedstawienia macierzy rotacji. Dodatkowo nie wiadomo w jaki sposób wyznaczono elementy macierzy R, czy są one wersorami osi określonych na podstawie traid markerów, czy też zostały wyznaczone jako osie anatomiczne poszczególnych segmentów kończyny dolnej. W rozdziale 4.1.2 , w którym przedstawiono wyznaczone na podstawie autorskiej procedury pomiarowej przebiegi kątów anatomicznych dla chodu brakuje odniesienia do wyników innych autorów. Porównanie to ograniczyło się jedynie do komentarza: "Otrzymane krzywe nie odbiegają bardzo od krzywych z literatury" (str. 62). Na str. 63 znalazło się zdanie "Zgodnie z zaleceniami ISB anatomiczny układ współrzędnych stopy zdefiniowany jest prze punkty anatomiczne podudzia w pozycji neutralnej stopy i jest to przestrzenny układ współrzędnych." Sformułowanie to wymagałoby dokładniejszego opisu lub ilustracji za pomocą rysunku. 4. W rozdziale 5.1.1 "Komputerowy model układu mięśniowego" nie podano zależności, 5. opisującej siłę mięśniową. Opis wykorzystanego modelu ograniczył się do sformułowania (str. 88) "W modelu Gait2392 zaimplementowany został model mięśnia Thelena, szczegółowo opisany w pracy [193]." Brak zależności opisującej siłę mięśniową jest zaskakujący, zwłaszcza, że w tym samym rozdziale zdecydowano się na przedstawienie charakterystyk (siła-długość, siła-wydłużenie, siła-prędkość) wykorzystywanych w modelowaniu sił mięśniowych (rys. 5.4). Pewną wątpliwość budzi również nazwanie wykorzystanego w obliczeniach modelu - modelem mięśnia Thelena. W literaturze tego typu model nazywane są najczęściej modelami typu Hilla. Taki również podpis znajduje się na rys 5.4 przy schemacie mechanicznym mięśnia. W rozdziale 5.1.2 "Techniki symulacji komputerowej" przedstawiano wykorzystane w 6. obliczeniach metody identyfikacji sił mięśniowych. Jedną z zastosowanych metod jest metoda optymalizacji statycznej, dla której przedstawiono funkcję celu (wzór 5.1) oraz równościowe warunki ograniczające w dwóch opcjonalnych wariantach wzór 5.2. oraz wzór 5.3. Tu pojawia się pytanie, który z tych warunków wykorzystano ostatecznie w obliczeniach. Ma to istotne znaczenie ze względu na charakter prowadzonych w dalszej części pracy badań, w której przeprowadzono analizę wrażliwości i badano wpływ różnych wielkości na wyniki wyznaczanych wartości sił mięśniowych. W zadaniu optymalizacyjnym opisanym wzorami 5.1-5.3 zmiennymi decyzyjnymi są "poziomy aktywacji mięśnia" oznaczone jako a. Powyższy zapis powinien być uzupełniony o informacją jaka jest zmienność poziomów aktywacji mięśnia, czy zmienność ta jest skokowa (np. zmienia się co 0,1) czy też jest ciągła. Przy tak sformułowanym zapisie zadania optymalizacyjnego, które opisane jest funkcją celu (wzór 5.1) oraz jednym z warunków ograniczających opisanych zależnością 5.2 lub 5.3, zakres dopuszczalnych wartości zmiennych decyzyjnych - czyli poziomów aktywacji mięśnia a - zwiera się od - do . Według mnie brakuje tu jeszcze jednego 7. warunku ograniczającego wartości aktywacji a do wartości z zakresu od 0 do 1, co odpowiada fizjologicznym warunkom pracy mięśnia i powszechnie stosowane jest w identyfikacji sił mięśniowych z wykorzystaniem metod optymalizacji. W rozdziale 5 "Analiza wrażliwości modelu mięśniowo-szkieletowego", jako kryterium pozwalające na porównanie wyników symulacji wykorzystano wskaźnik MAV i MD będące odpowiednio średnią wartości bezwzględnych różnic lub średnia wartością różnic pomiędzy analizowanymi przebiegami sił mięśniowych. Z przedstawionego przeglądu literatury wynika, że podobną do przeprowadzonej w pracy analizę wrażliwości przeprowadziło również wielu innych autorów, stosując różne wskaźniki do oceny wrażliwości modeli układu szkieletowo-mięśniowego. Szkoda, że nie zdecydowano się zastosować ich w recenzowanej pracy. Niewątpliwie ułatwiłoby to porównanie wyników pracy z wynikami innych autorów. 8. 9. W rozdziale 5 w podsumowaniu przeprowadzonych wariantów badań w kilku miejscach pracy (str. 113, 116, 124) znalazło się sformułowanie, że wyznaczonych przebiegach odnotowano zarówno różnice w wartościach jak również w kształcie otrzymanych krzywych. Analizując, wykresy przedstawione w tym rozdziale, jak również w załączniku, można jednak odnieść wrażenie, że przebiegi poszczególnych sił mięśniowych wyznaczone przy różnych wariantach zaburzeń parametrów modelu, czy też metod identyfikacji są do siebie mocno zbliżone. Szkoda, że nie zdecydowano się tu na ocenę podobieństwa przebiegów chociażby z wykorzystaniem korelacji i poprzestano tylko na ocenie wzrokowej. W rozdziale 5.3 przeprowadzono symulację wprowadzając bardzo szeroki zakres wprowadzonych zmian wartości maksymalnej siły skurczu izometrycznego Fmax. Wartości te, przewyższający nawet zakres zmienności spotykany w literaturze. Należy pamiętać, że wartość Fmax czy też bezpośrednia z nią związana wartość przekroju fizjologicznego mięśnia PCSA jest cechą osobniczą zależną od wymiarów badanej osoby, płci, wieku, aktywności fizycznej. Jeśli porównujemy wartość Fmax czy też PCSA z badań różnych autorów to wielkość te zostały wyznaczone dla konkretnych osób. Prowadząc identyfikację sił mięśniowych z wykorzystaniem modelowania i optymalizacji należy zadbać aby wprowadzane dane Fmax odpowiadały wymiarom badanej osoby lub wykorzystać algorytmy pozwalające na przeskalowanie parametrów modelu układu mięśniowego do wymiarów badanej osoby. 10. Warto również zauważyć, że seria badań modelowych przeprowadzonych w rozdziale 5.3, w której zmieniamy wartość Fmax jednego mięśnia w rzeczywistości odpowiada sytuacji patologicznej, w której wszystkie mięśnie funkcjonują poprawnie oprócz jednego, mianowicie tego, dla którego zmieniliśmy siłę Fmax. Tak więc otrzymane różnice pomiędzy wynikami dla modelu wyjściowego i zmodyfikowanego będą raczej świadczyć o prawidłowym opisie funkcjonowania układu mięśniowego. Niepokojąca byłaby sytuacja, w której dla modelu z prawidłowymi przekrojami PCSA oraz modelu patologicznego (np. ze zmniejszonym przekrojem jednego mięśnia lub grupy mięśniowej) otrzymalibyśmy takie same lub zbliżone wyniki. 11. W rozdziale 6 zdecydowano się na walidację wyznaczanych za pomocą symulacji numerycznych sił mięśniowych z zarejestrowanymi sygnałami EMG poprzez analizę korelacji. Tak więc porównywane są dwie różne wielkości fizyczne, pomiędzy którymi istnieje zależność, ale zgodnie z modelem mięśnia typu Hilla nie jest ona liniowa. W większości podobnych badań, sygnał EMG wykorzystywany jest do walidacji jakościowej wyznaczanych przebiegów sił mięśniowych. W zasadzie ogranicza się do porównania czasowego włączania/wyłączania mięśni wyznaczanego na podstawie sygnału EMG. 12. W pracy do identyfikacji sił mięśniowych wykorzystano optymalizację statyczną oraz metodę CMC. Prawidłowe funkcjonowanie tego algorytmu wymaga odpowiedniego doboru tzw. nastaw regulatora typu PD, czyli współczynników oznaczonych w zależności 5.4 jako: kp i kv. W pracy nie podano dla jakich wartości tychże współczynników prowadzono obliczenia. Jedyna wzmianka o wartościach kp i kv znaduje się na str. 90 i brzmi ona "kp i kv to wzmocnienia wynoszące typowo 20 i 100". 13. Jakość przedstawionych w rozdziale 6 wyników symulacji numerycznych z wykorzystaniem algorytmu CMC jest mocno dyskusyjna. Uwaga ta dotyczy przede wszystkim wyników obliczeń otrzymanych dla osoby drugiej oraz trzeciej. Przebiegi sił mięśniowych przedstawione na rys. 6.3 i 6.4 z zastosowaniem algorytmu CMC charakteryzują się bardzo dużą zmiennością w czasie. Najprawdopodobniej zaburzenia w przebiegu sił mięśniowych są wynikiem nieprawidłowego doboru współczynników kp i kv. 5 Wnioski końcowe Podsumowując należy stwierdzić, że przedstawiona do oceny rozprawa zawiera cenne aspekty poznawcze w szeroko rozumianej dyscyplinie Mechanika. Prace badawcze przedstawione w rozprawie zostały zrealizowane na wysokim poziomie naukowym. Wyniki badań uzupełniają dotychczasową wiedzę w zakresie metod prowadzenia badań kinematyki chodu oraz identyfikacji sił mięśniowych. Niewątpliwym osiągnięciem recenzowanej rozprawy jest opracowanie i walidacja autorskiej metodyki pomiarów kinematyki chodu. Na wyróżnienie zasługuje również liczba przeprowadzonych symulacji numerycznych pozwalająca na wielowariantową analizę wpływu parametrów modelu układu mięśniowego oraz różnych technik obliczeń numerycznych na wyniki symulacji obciążeń układu szkieletowo -mięśniowego oraz ich staranna analiza. Bardzo utylitarnym wnioskiem wynikającym z pracy jest stwierdzenie, że korzystając z modeli matematycznych służących do wyznaczania kinematyki, czy też wyznaczania sił mięśniowych należy dołożyć wszelkiej staranności, aby zapewnić dużą dokładność wprowadzanych do modelu danych wejściowych. Rozwiązaniem zapewniającym większą dokładność wprowadzonych do tego typu modeli danych pomiarowych, czy też parametrów modelu wymaga personalizacji tychże danych. Tak więc, aby uzyskać wysokiej dokładności wyniki, pozwalające na ocenę funkcjonowania układu szkieletowego, czy też mięśniowego, wskazane jest tworzenia indywidualnych modeli dedykowanych badanej osobie. Uwagi krytyczne wymienione w punkcie 4 recenzji nie obniżają dobrego, moim zdaniem, poziomu merytorycznego i ogólnej wysokiej oceny dysertacji. Uwagi mają charakter porządkowy lub dyskusyjny i mam nadzieję, że przynajmniej w części będą pomocne podczas przygotowywania artykułów do czasopism naukowych. Recenzowana prac stanowi oryginalne rozwiązanie postawionego problemu naukowego, które wymagało posiadania szerokiej wiedzy zakresu mechaniki, techniki pomiarowych, przetwarzania danych pomiarowych, metod analizy wyników badań oraz wiedzy z zakresu anatomii i biomechaniki. Rozprawa przygotowana jest na wysokim poziomie naukowym i redakcyjnym. Biorąc pod uwagę powyższe aspekty stwierdzam, że opiniowana praca Pani mgr inż. Magdaleny Żuk spełnia wymagania stawiane rozprawom doktorskim w dyscyplinie Mechanika i jednocześnie wnoszę o dopuszczenie recenzowanej rozprawy do publicznej obrony. Robert Michnik