TEMATY PRAC LICENCJACKICH I MAGISTERSKICH W

TEMATY PRAC LICENCJACKICH I MAGISTERSKICH W ZAKŁADZIE
FIZJOLOGII ZWIERZĄT 2015/2016
dr hab. Piotr Bębas


Rola zegara biologicznego w regulacji metabolizmu ksenobiotyków
Rola fizjologiczna kryptochromów u zwierząt
dr Jan Jabłonka





Wpływ stanu zapalnego i zmienionej ekspresji białek na plastyczność
mózgu po udarze i depresjach korowych (praca magisterska)
Wpływ interakcji międzypółkulowych na plastyczność kory mózgowej
(praca magisterska)
Wpływ interakcji międzypółkulowych na plastyczność mózgu po
udarze (praca magisterska)
Porównanie interakcji międzypółkulowych u człowieka i głównych
gatunków zwierząt laboratoryjnych (praca literaturowa – licencjacka)
Wpływ interakcji międzypółkulowych na plastyczność mózgu po
udarze (praca literaturowa - licencjacka)
dr Joanna Kotwica-Rolińska
 Metody tworzenia mutantów oraz owadów transgenicznych” (praca
literaturowa – licencjacka)
 Rytmy metaboliczne u larw Spodoptera littoralis (praca licencjacka
oraz praca magisterska)
dr Paweł Majewski





Regulacja gospodarki wapnia i fosforu nieorganicznego w organizmie
(praca licencjacka - teoretyczna)
Regulacja ekspresji genów zależnych od zegara molekularnego tzw.
clock controlled genes (CCGs) (praca licencjacka - teoretyczna)
Stworzenie nowego układu doświadczalnego do badań regulacji
aktywności biosyntetycznej szyszynki ptaków, hodowle pierwotne
i unieśmiertelnianie pinealocytów, badania in vitro (praca
magisterska)
Określenie aktywności ścieżki sygnałowej NF-kB w szyszynkach
kurcząt w ciągu doby oraz po pobudzeniu układu odpornościowego
(praca magisterska)
Wpływ cytokiny TNF na mineralizację osteoblastów ludzkich - badania
in vitro (praca magisterska)
dr Magdalena Markowska

Charakterystyka immunologiczna tkanki limfoidalnej związanej z
szyszynką (PALT) występującej u kury domowej (praca magisterska
i licencjacka)
dr Marta Polańska



Badanie okołodobowego rytmu ekspresji serotoniny w ośrodkowym
układzie nerwowym Spodoptera littoralis (Lepidoptera)
Wpływ analogów steroidowych hormonów owadzich na komórki
owadziej linii SF9 - badania in vitro
Wpływ analogów hormonów owadzich, stosowanych jako pestycydy
na zarodkowe fibroblasty rybie ZEM2S (Danio rerio) - badania in vitro
dr Aleksandra Skawina
 Biomineralizacja szkieletu mięczaków, parzydełkowców i szkarłupni,
a mineralizacja kości u kręgowców (praca literaturowa licencjacka)
 Zegar biologiczny u mięczaków (słodkowodnych) – rytmy dobowe
mineralizacji, fizjologii i behawioru (praca literaturowa licencjacka)
 Zegar biologiczny w układzie serotoninergicznym małżów z rodziny
Unionidae (lub/i Sphaeriidae )(praca magisterska)
 Układ serotoninergiczny małżów z rodziny Unionidae (lub/i
Sphaeriidae, lub/i Dreissenidae (praca magisterska)
OPIS TEMATÓW PRAC LICENCJACKICH I MAGISTERSKICH
ROLA ZEGARA BIOLOGICZNEGO W REGULACJI METABOLIZMU
KSENOBIOTYKÓW
Założenia: Zanieczyszczenie środowiska jest jedną z podstawowych
przyczyn rozwoju chorób u zwierząt i ludzi. Coraz więcej dowodów wskazuje
na to, że detoksykacja substancji szkodliwych jest kontrolowana przez
zegar biologiczny. Naszym celem jest ustalenie, czy molekularne oscylatory
biologiczne zlokalizowane w różnych narządach (między innymi układu
nerwowego i wydalniczego) są odpowiedzialne za kontrolę ekspresji genów
i białek zaangażowanych w metabolizm pestycydów nowej generacji,
głównie neonikotynoidów.
Materiały i Metody: Doświadczenia będą prowadzone na kilku gatunkach
owadów, ze szczególnym uwzględnieniem pszczół, których ginięcie wydaje
się zależeć właśnie od niewłaściwego stosowania neonikotynoidów.
Realizacja zadań będzie polegała na charakterystyce transkryptomu
mózgów, cewek Malpighiego, oraz ciała tłuszczowego owadów w różnych
porach doby. Określony będzie wpływ wspomnianych insektycydów na
metabolizm tkanek: nerwowej, nabłonkowych i tworzących ciało
tłuszczowe.
Charakter pracy licencjackiej: Praca doświadczalna. Zadaniem studenta
będzie dokładna charakterystyka dobowych profili ekspresji genów zegara
biologicznego w narządach układu nerwowego oraz narządach
peryferycznych (wyżej wymienionych). Określenie minimalnych dawek
neonikotynoidów, które są śmiertelne i wpływają na behawior owadów.
Wykonanie podstawowych testów, które określą dobową zmienność w
odpowiedzi owadów na stosowane insektycydy.
Charakter pracy magisterskiej: Praca doświadczalna. Analiza dobowego
transkryptomu wymienionych narządów. Określenie wrażliwości owadów z
zaburzonym działaniem zegarów biologicznych na neonikotynoidy i dobowy
profil ich metabolizmu.
Wymagania: Podstawowa wiedza o metodach stosowanych w biologii
molekularnej
(przygotowanie
teoretyczne);
chęć
samodzielnego
prowadzenia badań, gotowość do przeprowadzania doświadczeń przez całą
dobę. Praca w terenie.
ROLA FIZJOLOGICZNA KRYPTOCHROMÓW U ZWIERZĄT
Założenia: Kryptochromy to niewielka grupa białek odpowiedzialnych za
naprawę DNA, fotorecepcję oraz regulację transkrypcji. Zróżnicowanie ich
funkcji u różnych organizmów jest bardzo duże, ale w odróżnieniu od
kryptochromów bakteryjnych i roślinnych, kryptochomy opisane u zwierząt,
są słabo zbadane. Spośród nich najmniej wiadomo o tzw. kryptochromie
DASH (CRY-DASH). Jego rola fizjologiczna jest nieznana. Nie wiadomo w
jakich tkankach i narządach ulega ekspresji, a co najciekawsze dotychczas
jego obecność opisano jedynie w genomach zwierząt wodnych. Celem
badań jest określenie typów kryptochromów występujących u różnych grup
zwierząt oraz powiązanie ich ekspresji z pozycją systematyczną tych
zwierząt oraz ze środowiskiem, w którym one występują. Zweryfikujemy
słuszność hipotezy, według której CRY-DASH zostało utracone podczas
zasiedlania środowisk lądowych, zarówno u kręgowców, jak i
bezkręgowców.
Materiały i Metody: Badania obejmą pracę w terenie i laboratorium –
zebranie
zwierząt
reprezentujących
różne
grupy
systematyczne
bezkręgowców, a następnie analizę obecności w ich genomach genów
kodujących różne typy kryptochromów. Podczas analiz in silico określona
zostanie hipotetyczna struktura białek kodowanych przez te geny, a co za
tym idzie rola, jaką potencjalnie pełnią u badanych zwierząt (ze względu na
charakterystyczne dla tych białek domeny określające ich funkcję w
komórce). Ustalimy pozycję opisanych kryptochromów na drzewie
filogenetycznym oraz postaramy się powiązać nasze wyniki z wiedzą na
temat adaptacji badanych zwierząt do życia w różnych środowiskach.
Charakter pracy licencjackiej: Praca doświadczalna. Zadaniem studenta
będzie zebranie materiału do badań (zwierząt). Izolacja kwasów
nukleinowych i sklonowanie kryptochromów poszczególnych gatunków.
Wstępna analiza filogenetyczna uzyskanych wyników.
Charakter pracy magisterskiej: Praca doświadczalna. W zależności od
tego czy chęć badań w proponowanym temacie zgłosi także osoba
wykonująca pracę licencjacką, magistrant sam lub wraz z licencjuszem
będzie pobierał materiał z terenu. Wykonywał analizy genomowe oraz
transkryptomu
celem
identyfikacji
transkryptów
poszczególnych
kryptochromów. Ponadto badania magistranta obejmą określenie pozycji
kryptochromów w systemie oscylatorów molekularnych badanych zwierząt.
Wymagania: Podstawowe przygotowanie do używania metod biologii
molekularnej (wiedza teoretyczna); preferowana jest umiejętność
samodzielnej pracy, gotowość do przeprowadzania doświadczeń przez całą
dobę. Praca w terenie, w różnych warunkach (woda, błoto, muł, gleba).
Konieczność wyjazdów w różne rejony Polski (oczywiście wraz z
opiekunami).
STWORZENIE NOWEGO UKŁADU DOŚWIADCZALNEGO DO BADAŃ
REGULACJI AKTYWNOŚCI BIOSYNTETYCZNEJ SZYSZYNKI
PTAKÓW, HODOWLE PIERWOTNE PINEALOCYTÓW, BADANIA IN
VITRO
Założenia: Metody takie jak: analizy mikromacierzy DNA, analizy in silico
oraz funkcjonalna analiza promotorów genów, wskazują na istnienie wielu
elementów regulujących ekspresję genów o rytmicznym okołodobowym
profilu ekspresji. Geny takie określa się jako kontrolowane przez geny
zegarowe (Clock Controled Genes, CCGs). Przyjmuje się, że jeśli ekspresja
genu jest rytmiczna zarówno in vivo, jak i in vitro w warunkach LD i DD, to
jest on CCG. W przeszłości podejmowano liczne próby określenia czy geny
szlaku biosyntezy MEL (Tph1, Ddc, Aanat i Asmt ) zarówno u ptaków, jak i
ssaków są CCGs. Dane literaturowe oraz wyniki przeprowadzonej przez nas
wstępnej analizy in silico wskazują, że w obrębie promotorów tych genów u
kury domowej znajdują się sekwencje DNA, przez które geny zegarowe
mogą regulować ich ekspresję. Celem pracy jest stworzenie linii
unieśmiertelnionych pinealocytów i przeprowadzenie badań zmierzających
do określenia profilów okołodobowej ekspresji genów kodujących enzymy
biorące udział w biosyntezie MEL w pinealocytach pierwotnych. Praca ta ma
za zadanie stworzyć układ eksperymentalny do prowadzenia szczegółowych
badań dotyczących regulacji ekspresji genów CCGs.
Materiał i metody: Prowadzenie hodowli linii pierwotnej pinealocytów, w
warunkach LD lub DD. Charakterystyka hodowli komórkowych pod
względem występowania specyficznych markerów dla pinealocytów takich
jak S-antygen, rod-opsyna. Oznaczenie zmian poziomu ekspresji genów
Tph1, Ddc, Aanat i Asmt techniką RT-qPCR i Western blotting. Klonowanie
i przeprowadzenie badań funkcjonalnych promotorów genów Tph1, Ddc,
Aanat i Asmt stosując bioluminescencyjne systemy reporterowe takie jak
pGL3 i pMCS-Gaussia Luc.
Charakter pracy magisterskiej: Praca doświadczalna. Zadaniem
Magistranta będzie charakterystyka hodowli pinealocytów kury domowej in
vitro.
Wymagania: Podstawowe przygotowanie do używania metod biologii
molekularnej (wiedza teoretyczna), gotowość do przeprowadzania
doświadczeń przez całą dobę.
UDZIAŁ CZYNNIKÓW TRANSKRYPCYJNYCH Z RODZINY NF-kB
W REGULACJI BIOSYNTEZY MELATONINY W SZYSZYNKACH
KURCZĄT
Założenia: Czynniki transkrypcyjne z rodziny NF-kB (nuclear factor kappalight-chain-enhancer of activated B cells) prawdopodobnie uczestniczą w
regulacji aktywności biosyntetycznych szyszynki ssaków. Dane literaturowe
wskazują, że u gryzoni laboratoryjnych czynniki te biorą udział w
hamowaniu transkrypcji Aanat, genu kodującego jeden z enzymów szlaku
biosyntezy melatoniny. Zauważono, że zwiększony poziomu czynników NFkB w komórkach szyszynki ssaków koreluje z niską ekspresją Aanat w ciągu
dnia. Celem pracy jest zbadanie, czy podobne zależności mają miejsce u
ptaków.
Materiał i Metody: Doświadczenia będą prowadzone na samcach kury
domowej, przetrzymywanych od dnia wyklucia w warunkach oświetlenia
L:D 12:12. Od 16-dniowych zwierząt, co 2h przez całą dobę, zostaną
pobrane szyszynki. Z komórek szyszynkowych (pinealocytów) zostanie
wyizolowana frakcja białek jądrowych, w której przeprowadzona zastanie
analiza poziomu białek ścieżki sygnałowej NF-kB, między innymi metodami
EMSA i DAPA.
Charakter pracy magisterskiej: Praca doświadczalna. Zadaniem
Magistranta będzie dokonanie analizy translokacji białek ścieżki sygnałowej
NF-kB z cytoplazmy do jąder komórkowych pinealocytów kurcząt w rytmie
dobowym, jak i po aktywacji układu odpornościowego.
Wymagania: Podstawowe przygotowanie do używania metod biologii
molekularnej (wiedza teoretyczna), gotowość do przeprowadzania
doświadczeń przez całą dobę.
WPŁYW CYTOKINY TNF NA MINERALIZACJĘ
LUDZKICH - BADANIA IN VITRO
OSTEOBLASTÓW
Założenia: TNF jest główną cytokiną prozapalną, której podniesiony
poziom w organizmie obserwuje się podczas przewlekłych stanów
zapalnych. Badania prowadzone na gryzoniach laboratoryjnych wskazują,
że podniesiony poziom TNF odpowiada za towarzyszące przewlekłym
stanom zapalnych zmniejszenie gęstości mineralnej kości prowadzące do
osteoporozy. Celem badań jest określenie mechanizmu zmniejszenia
aktywności osteoblastów, komórek kościotwórczych, pod wpływem TNF w
komórkach ludzkich.
Materiały i Metody: Doświadczenia będą prowadzone na osteoblastach
pierwotnych (HOb) i osteoblastach linii MG63 in vitro. Komórki te
traktowane będą TNF, a następnie badana będzie ekspresja genów
związanych z mineralizacją i dojrzewaniem osteoblastów oraz sam poziom
mineralizacji.
Badania
mają
doprowadzić
do
zidentyfikowania
wewnątrzkomórkowych ścieżek sygnałowych odpowiedzialnych
za
zmniejszenie aktywności osteoblastów pod wpływem TNF.
Charakter pracy magisterskiej: Praca doświadczalna.
Wymagania: Podstawowe przygotowanie do używania metod biologii
molekularnej (wiedza teoretyczna), gotowość do przeprowadzania
doświadczeń przez całą dobę.
CHARAKTERYSTYKA IMMUNOLOGICZNA TKANKI LIMFOIDALNEJ
ZWIĄZANEJ Z SZYSZYNKĄ (PALT) WYSTĘPUJĄCEJ U KURY
DOMOWEJ – PRACA MAGISTERSKA I LICENCJACKA
Założenia: Szyszynka ptaków zbudowana jest z głównych komórek
wewnątrzwydzielniczych – pinealocytów, komórek podporowych, szczątkowych
komórek fotoreceptorowych oraz komórek limfoidalnych. Wśród tych ostatnich
znajdują się limfocyty T, limfocyty B i monocyty. Wiadomo, że komórki te są zdolne
do podziałów a ich liczba w szyszynce zmienia się w ciągu doby. Nie wiadomo
jednak jaka dokładnie jest rola tych komórek w szyszynce ani czy mają właściwości
analogicznych
limfocytów
występujące
na
obwodzie
lub
tkankach
uprzywilejowanych immunologicznie.
Celem pracy licencjackiej będzie: ustalenie metody efektywnej izolacji
komórek limfoidalnych z szyszynki kury
Celem pracy magisterskiej będzie: przeprowadzenie funkcjonalnych testów
immunologicznych, określenie rytmu dobowego, określenie ekspresji cytokin
prozapalnych i ich receptorów w limfocytach PALT.
Materiał i metody: W pracy będą wykorzystywane następujące metody:
sortowanie komórek przy użyciu sortera magnetycznego i cytofluorymetrii
przepływowej, hodowle komórkowe, testy ELISA, testy funkcjonalne limfocytów,
PCR, RT-PCR, Real time PCR.
Charakter pracy: Zarówno praca licencjacka jak magisterska będą miały
charakter doświadczalny.
Wymagania: Od Studenta wymagana będzie sumienność w pracy laboratoryjnej
i elastyczność czasowa, gdyż materiał doświadczalny pobierany będzie w różnych
porach doby.
CHARAKTERYSTYKA OKOŁODOBOWYCH ZMIAN STĘŻENIA
SEROTONINY MÓZGU I HEMOLIMFIE SZARAŃCZY PUSTYNNEJ
SCHISTOCERCA GREAGARIA.
Założenia: Szarańcza pustynna jest jednym z najważniejszych szkodników
upraw na świecie. Występuje w dwóch formach, samotnej (każdy osobnik
żeruje pojedynczo) i migrującej (do kliku tysięcy osobników skupia się, by
migrować i żerować wspólnie). Z punktu widzenia gospodarki człowieka ta
druga forma jest stanowi największe zagrożenie. Stwierdzono, że
czynnikiem odpowiedzialnym za zmianę behawioru szarańczy jest
serotoninasilnie
konserwatywny
ewolucyjnie
neuroprzekaźnik,
występujący u bezkręgowców i człowieka. Serotonina ma działanie
plejotropowe, u wszystkich badanych jak dotąd organizmów. Jest między
innymi ważnym elementem dróg wyjścia informacji z zegara biologicznego.
Potencjalne możliwości wykorzystania układu serotoninergicznego, jako
celu działania przyszłych insektycydów hamujących formowanie postaci
migrujących szarańczy, wymaga możliwie najbardziej wnikliwego poznania
funkcji tego neuroprzekaźnika u
S.gregaria. Doświadczenia w
proponowanej pracy dyplomowej skupią się na regulacji układu
serotoninergicznego przez zegar biologiczny.
Materiał i Metody: Doświadczenia będą prowadzone na szarańczy
wędrownej, Schistocerca gregaria, hodowanych w Zakładzie Fizjologii
Zwierząt. Materiał (mózgi i hemolimfa) będą pobierane w sześciu punktach
czasowych
doby
(co
cztery
godziny)
a
następnie
metodą
immunohistochemiczną i immunoenzymatyczną, zostanie określony
dobowe profil stężenia serotoniny w badanych tkankach.
Charakter pracy licencjackiej:
(1)Przegląd danych literaturowych
dotyczących neurochemicznych podstaw zmiany behawioru (z formy
samotnej w migrującą) u
S. gregaria. (2) Wykonanie preparatów
immunohistochemicznych mających na celu określenie lokalizacji
serotoniny w ośrodkowym układzie nerwowym S.gregoria.
Charakter
pracy
magisterskiej:
(1)
Określenie
metodą
immunohistochemiczną okołodobowych zmian zawartości serotoniny w
mózgu S. gregaria. Wykonanie „atlasu” połączeń serotoninergicznych w
mózgu.(2)
Określenie
metodą
immunoenzymatyczną
(ELISA)
okołodobowych zmian zawartości serotoniny w hemolimfie S. gregaria.
Wymagania: Umiejętność/chęć pracy z owadami, znajomość zasad pracy
w laboratorium, umiejętność pracy w grupie, gotowość do przeprowadzania
doświadczeń przez całą dobę.
Literatura: Anstey ML et al., Serotonin mediates behavioral gregarization
underlying swarm formation in desert locust. 323 (5914): 627-630
Science 30 Januar 2009. DOI:10.11.26/science.1165939.
BIOMINERALIZACJA SZKIELETU MIĘCZAKÓW, PARZYDEŁKOWCÓW
I SZKARŁUPNI, A MINERALIZACJA KOŚCI U KRĘGOWCÓW
Założenia: Wiedza na temat mechanizmu mineralizacji biologicznej
węglanu wapnia u mięczaków, koralowców i szkarłupni jest wciąż niepełna
– ale wiadomo, że organizacja kryształów w muszli odbywa się dzięki
matriks organicznej. Okazuje się, że „mięczakowa” matriks organizuje i
pobudza pracę osteoblastów ssaków i nie wywołuje stanu zapalnego.
Podobne eksperymenty przeprowadzono także z użyciem szkieletów
koralowców, choć ich wyniki były mniej spektakularne. Nie wiadomo
dlaczego obserwujemy tak wysoką kompatybilność fizjologii tworzenia
szkieletów u różnych grup systematycznych i w jaki sposób jest ona
możliwa.
Materiał i metody: Przegląd informacji na temat współdziałania kilku
różnych systemów mineralizacyjnych. Próba odszukania wyjaśnienia
mechanizmu interakcji pomiędzy tymi systemami mineralizacyjnymi.
Charakter
prac
licencjackich:
Praca
teoretyczna
dotycząca
biomineralizacji muszli mięczaków, koralowców, szkarłupni i kręgowców
(w tym człowieka).
Wymagania: jest to praca teoretyczna – literaturowa, ważna jest
umiejętność sprawnego poszukiwania i opracowywania źródeł naukowych.
ZEGAR BIOLOGICZNY
WODNYCH) – RYTMY
I BEHAWIORU
U MIĘCZAKÓW (MAŁŻÓW SŁODKODOBOWE MINERALIZACJI, FIZJOLOGII
Założenia: Wiedza na temat mechanizmu mineralizacji biologicznej
węglanu wapnia u małżów i ślimaków jest wciąż niepełna – ale wiadomo, że
organizacja kryształów w muszli odbywa się dzięki matriks organicznej.
Często obserwowane są rytmy mineralizacji kryształów; znany jest też fakt
okołodobowego rytmu ekspresji jednego z białek matrix u perłopławów –
rytmy te jednak są obserwowane u zwierząt ze stref pływów. Nie wiadomo,
czy małże słodkowodne mają okołodobowe rytmy biomineralizacji muszli,
ale stwierdzono u nich rytmiczne, okołodobowe zachowania i okołodobowe,
regulowane endogennym oscylatorem, zmiany w fizjologii (w układzie
serotoninergicznym). Niewykluczony jest więc wpływ zegara biologicznego
na proces mineralizacji ich muszli.
Materiał i metody: Przegląd informacji na temat rytmów biologicznych
u małżów słodkowodnych i mięczaków morskich. Próba odszukania
powiązania
pomiędzy
rytmami
behawioralnymi,
fizjologicznymi
i mineralizacyjnymi.
Charakter prac licencjackich: Prace teoretyczna.
Charakter pracy magisterskiej: Praca teoretyczna dotycząca opisania
regulacji okołodobowych rytmów behawioru i fizjologii mięczaków, oraz
mechanizmów zegara biologicznego indukującego te rytmy.
Wymagania: jest to praca teoretyczna – literaturowa, ważna jest
umiejętność sprawnego poszukiwania i opracowywania źródeł naukowych
ZEGAR BIOLOGICZNY W UKŁADZIE SEROTONINERGICZNYM
MAŁŻÓW Z RODZINY UNIONIDAE (i/lub SPHAERIIDAE)
Założenia: Wiedza na temat mechanizmu zegara biologicznego
u mięczaków jest niepełna. Stwierdzono, że okołodobowe rytmy stężeń
serotoniny w hemolimfie skójek i w tkankach groszkówek są regulowane
endogennym zegarem biologicznym. Stwierdzono, że serotonina pełni
fundamentalną rolę w działaniu oscylatora w oku ślimaków (choć jej
stężenia są regulowane światłem, nie działaniem zegara). Serotonina pełni
też wiele funkcji w fizjologii ślimaków i małżów (reguluje m. in zachowania
lokomotoryczne i pokarmowe, tempo bicia serca, reakcję stresową,
rozrodczość, procesy filtracji…). Należy ustalić profil ewentualnych zmian
stężeń serotoniny w układzie serotoninergicznym małżów z rodzaju Unio
(dodatkowo warto ocenić je też u Pisidium). Należy ustalić, czy ewentualne
zmiany są związane z działaniem endogennego zegara biologicznego, czy
nie. Należy zidentyfikować tkanki będące potencjalnym oscylatorem
u skójek (i groszkówek).
Materiał i metody: Podstawą do pracy będą materiały z już
przeprowadzonych eksperymentów (tkanki skójek) oraz dodatkowo/lub
przygotowany materiał samodzielnie pozyskany przez studenta (Pisidium).
Tkanki skójek zostały zakonserwowane w siedmiu punktach czasowych
w ciągu doby. Praca składać się będzie z przygotowania skrawków przekrojów
poprzecznych
ciał
skójek,
immunohistochemicznego
wybarwienia układu serotoninergicznego u nich i identyfikacji neuronów
serotoninergicznych zobrazowanych w mikroskopie fluorescencyjnym. Na
tej podstawie oceniona zostanie aktywność neuronów serotoninergicznych
w tkankach pochodzących z różnych godzin doby, z różnych warunków
oświetlenia, co także pozwoli ustalić, czy w regulację tych ewentualnych
zmian jest zaangażowany endogenny oscylator.
Podobną procedurę należy wykonać dla Pisidium, projektując wcześniej
i przeprowadzając eksperyment w którym pozyskane zostaną tkanki do
badań.
Charakter pracy magisterskiej: Praca magisterska eksperymentalna
dotycząca zegara biologicznego u małżów słodkowodnych.
Wymagania: W pracy laboratoryjnej wymagana będzie dokładność
i gotowość nauczenia się technik obrazowania. W przypadku dołączenia
materiału Pisidium niezbędne będzie zdobycie materiału w terenie;
w trakcie eksperymentu wymagana będzie dyspozycyjność czasowa,
pobrania materiału do analiz odbywać się będzie w ciągu całej doby.
UKŁAD SEROTONINERGICZNY MAŁŻÓW Z RODZINY UNIONIDAE
(i/lub SPHAERIIDAE; lub/i DREISSENIDAE)
Założenia: Wiedza na temat układu serotoninergicznego u skójek
i
groszkówek
jest
niepełna.
Stwierdzono
obecność
neuronów
serotoninergicznych w licznych tkankach i narządach tych zwierząt, ale nie
wiadomo jak – kompleksowo – jest on rozmieszczony. Stwierdzono, że
istnieją okołodobowe rytmy stężeń serotoniny w hemolimfie skójek
(uwalnianej prawdopodobnie z układu nerwowego) i w tkankach
groszkówek i że są regulowane endogennym zegarem biologicznym.
Stwierdzono, że serotonina pełni fundamentalną rolę w działaniu oscylatora
w oku ślimaków (choć jej stężenia są regulowane światłem, nie działaniem
zegara), reguluje też wiele procesów fizjologicznych u ślimaków i małżów
(m. in zachowania lokomotoryczne i pokarmowe, tempo bicia serca, reakcję
stresową, rozrodczość, procesy filtracji…). Brak jest danych o układzie
serotoninergicznym Dreiseniidae.
Materiał i metody: Należy pozyskać materiał do badań (odłowić grupę
zwierząt niewielkich rozmiarów w terenie), przygotować skrawki – przekroje
poprzeczne i podłużne, zidentyfikować narządy i tkanki. Należy
przeanalizować serię przekrojów poprzecznych i podłużnych ciała skójek
(lub/i groszkówek), metodami immunohistochemicznymi zidentyfikować
neurony serotoninergiczne i zaproponować trójwymiarowy model układu
serotoninergicznego u tych zwierząt (dzięki oprogramowaniu komputera).
Charakter pracy magisterskiej: Praca magisterska eksperymentalna
dotycząca układu serotoninergicznego u małżów słodkowodnych.
Wymagania: W pracy laboratoryjnej wymagana będzie dokładność
i gotowość opanowania technik obrazowania. Ważna będzie cierpliwość,
zaangażowanie i samodzielność. Niezbędne będzie zdobycie materiału
w terenie.