Analiza trendów danych mikrobiologicznych z

Transkrypt

Analiza trendów danych mikrobiologicznych z
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
ANALIZA TRENDÓW DANYCH MIKROBIOLOGICZNYCH
Z ZASTOSOWANIEM KART KONTROLNYCH
Konrad Mysiakowski, FSP Galena;
Dariusz Danel, Polska Akademia Nauk, Zakład Antropologii we Wrocławiu
Wprowadzenie
Obowiązujące regulacje zawarte w rozporządzeniu Ministra Zdrowia w sprawie wymagań
Dobrej Praktyki Wytwarzania [1] narzucają zakładom farmaceutycznym rygorystyczne
zasady dotyczące monitoringu szeregu parametrów związanych z produkcją i przechowywaniem materiałów wyjściowych, produktów gotowych oraz innych komponentów (np.
opakowań) związanych z produkcją farmaceutyczną. Fundamentalnym celem ustalonych
regulacji Dobrej Praktyki Wytwarzania (Good Monufacturing Practice, GMP) jest obowiązek zapewnienia maksymalnej jakości procesów produkcyjnych, aby wytwarzane
produkty lecznicze nie narażały pacjentów na ryzyko wynikające z niedostatecznego bezpieczeństwa stosowania, nieodpowiedniej jakości lub niedostatecznej skuteczności. Jedną
z zalecanych procedur służących realizacji tego celu jest statystyczna analiza danych
związanych z parametrami wytwarzania, a w szczególności analiza trendów. Umożliwia
ona regularny, a także stały przegląd jakości środowiska produkcji, wody oczyszczonej,
mediów pomocniczych (np. gazów) oraz procesów produkcyjnych. W analizowanym
okresie czasowym daje możliwość wykrycia pojawiających się stałych tendencji wzrostowych lub spadkowych analizowanej zmiennej bądź też stwierdzenie braku zależności
pomiędzy wartościami obserwowanej zmiennej a czasem.
Można wyróżnić kilka metod wykrywania prawidłowości w rozpatrywanych danych, które
mającą charakter trendów. Metody te różnią się pod względem wykorzystywanych technik
analitycznych i obliczeniowych. Jednym z podstawowych narzędzi używanych w analizie
trendów są karty kontrolne.
Karty kontrolne, wprowadzone po raz pierwszy przez Waltera Shewharta, są stosunkowo
prostym narzędziem statystyczno-graficznym służącym do analizy danych pochodzących
z procesów przemysłowych.
Proces należy rozumieć w ujęciu ogólnym jako uporządkowany w czasie ciąg zmian
i stanów zachodzących po sobie. Mogą one dotyczyć szeregu różnych właściwości, takich
jak np. zmiany temperatury w czasie, lecz również liczby mikroorganizmów. Każdy
z takich procesów cechuje się zmiennością [2, 3, 4].
Copyright © StatSoft Polska 2014
www.statsoft.pl/czytelnia.html
107
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
Głównym celem stawianym przed kartami kontrolnymi jest wykrywanie nielosowych
zmian w obserwowanych procesach, które nie wynikają z naturalnej (własnej) zmienności
obserwowanego parametru procesu, lecz z przyczyn specjalnych, niestandardowych,
niemożliwych do przewidzenia (np. błędy wynikające z uszkodzenia aparatury
pomiarowej) [5].
Karty kontrolne - informacje ogólne
Mimo że karty kontrolne opierają się na statystycznych obliczeniach to jednak w swojej
użytkowej wersji są graficzną techniką, pozwalającą w prosty i łatwy sposób zaprezentować dane dotyczące analizowanego procesu w odniesieniu do czasu, lub też innej
cechy procesu możliwej do chronologicznego uporządkowania (np. kolejnych serii, partii
produkcyjnych, numerów analiz itd.).
Istnieje wiele typów kart kontrolnych, które są zaprojektowane ze względu na charakter
danych, typ stosowanej statystyki, na jakiej oparta jest karta (np. średnia, mediana, rozstęp,
odchylenie standardowe), typ decyzji, jaka będzie podejmowana na jej podstawie
(np. systematyczny monitoring procesu w celu jego regulacji lub szybkie wykrycie zmian
w celu zatrzymania procesu). Mimo różnorodności typów kart istnieją pewne charakterystyczne cechy wspólne związane z ich budową [2, 3, 5].
Ogólna budowa kart kontrolnych
Karta kontrolna w podstawowej formie jest wykresem badanej właściwości procesu (oś y)
względem tzw. numeru pomiaru lub czasu (oś x). W tak zdefiniowanym układzie współrzędnych nanoszony jest wykres mierzonej cechy, będący krzywą odwzorowującą rejestrowane wartości. Kolejne punkty to albo bezpośrednio zmierzone wyniki (np. liczba CFU),
albo średnie z próbek (np. średnia liczba CFU z 5 posiewów mikrobiologicznych) lub inne
cechy analizowane przez kartę (np. frakcja wyrobów wadliwych/próbę). Numer pomiaru
może być kolejnym numerem przeprowadzonego badania, datą, kolejnym numerem
analizowanej serii czy partii badanej substancji itd.
Oprócz wykresu mierzonej cechy na karcie kontrolnej znajdują się jeszcze 3 poziome linie:
linia centralna oraz po obu stronach linii centralnej  górna granica kontrolna oraz dolna
granica kontrolna. Ich położenie wyliczane jest (na przykład przez pakiet STATISTICA)
z odpowiednich dla danej karty kontrolnej wzorów matematycznych [2, 3, 5].
Zmienność procesu, na której opiera się działanie kart kontrolnych, w sposób formalny
określona jest poprzez rozkład danych, który jest statystycznym opisem prawdopodobieństwa występowania poszczególnych wartości (obserwacji) w badanej próbie. Najczęściej
spotykane typy kart kontrolnych oparte są na rozkładzie normalnym, rozkładzie dwumianowym i rozkładzie Poissona. Na podstawie typu rozkładu i jego parametrów definiowane
są położenia linii centralnej i górnej oraz dolnej granicy kontrolnej [3, 4, 5].
108 www.statsoft.pl/czytelnia.html
Copyright © StatSoft Polska 2014
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
Ogólna zasada działania kart kontrolnych
Ogólna zasada działania i konstruowania karty kontrolnej zostanie przedstawiona na podstawie karty opartej na danych o rozkładzie normalnym. W przypadkach innych rozkładów
danych procedura jest podobna, a metody konstrukcji kart tak dopasowane, aby odzwierciedlały ogólną ideę budowy i interpretacji karty.
Jak wspomniano powyżej, precyzyjny sposób obliczania położenia linii centralnej jest
określony odpowiednimi formułami matematycznymi i zależy od typu karty. Jednak celem
uproszczenia wywodu dla niniejszych rozważań można przyjąć, że linia centralna
wyznacza wartość średnią ze wszystkich pomiarów i pokazuje wartość, którą średnio
przyjmuje badana charakterystyka. Granice kontrolne w większości kart są umieszczone
symetrycznie po obu stronach linii centralnej. Odległość od linii centralnej obliczana jest
na podstawie miary podobnej do odchylenia standardowego tzw. sigmy (σ). W ujęciu
ogólnym sigma uwzględnia zmienność obserwowaną w poszczególnych próbkach i pomiędzy próbkami. W karcie opartej na danych o rozkładzie normalnym sigma może być
traktowana jako rodzaj odchylenia standardowego obserwowanego na analizowanym
zbiorze danych. Odzwierciedla zatem zmienności procesu. Położenie granic kontrolnych
ustalane jest w odległości +/- 3σ w stosunku do linii centralnej. Jak wiadomo, z reguły
6-sigma w rozkładzie normalnym w przedziale +/- 3σ wokół średniej znajduje się 99,73%
wszystkich obserwacji. Zmienność obserwowana w tym przedziale jest uznawana za
zmienność naturalną (własną) i poza opisanymi przypadkami pojawiania się charakterystycznych konfiguracji punktów na karcie nie powinna budzić wątpliwości.
Jeśli krzywa mierzonej cechy (parametru procesu) przebiega pomiędzy granicami kontrolnymi i nie tworzy charakterystycznych nielosowych konfiguracji, proces jest pod kontrolą,
przebiega prawidłowo i uznawany jest za stabilny. Ze stabilnymi poziomami zanieczyszczeń mikrobiologicznych mamy do czynienia najczęściej w przypadku zakwalifikowanych
systemów i instalacji pomocniczych oraz w przypadku dobrze wykonanej pętli wody
oczyszczonej. Zastosowanie odpowiednich materiałów (stal kwasooporna) oraz odpowiedniego sposobu obsługi takich instalacji zwykle zapewnia stały (niski) poziom zanieczyszczenia mikrobiologicznego.
Jeśli jednak wartości kolejnych obserwacji będą wykraczały poza wyznaczone granice
kontrolne lub też na wykresie pojawią się charakterystyczne konfiguracje punktów, to jest
prawdopodobne, że taka „nienaturalna” zmienność jest wynikiem zakłóceń specjalnych.
W takiej sytuacji konieczna jest szczegółowa analiza merytoryczna przypadku, w celu
ewentualnego zidentyfikowania i wyeliminowania przyczyn powstania rozregulowania.
Taka sytuacja na przykładzie pętli wody oczyszczonej może się pojawić w sytuacji, gdy
dochodzić będzie do formowania się biofilmu bakteryjnego.
Strategia budowy kart kontrolnych
Analiza i interpretacja procesów za pomocą kart kontrolnych związana jest z zapewnieniem właściwej jakości analizowanych danych.
Copyright © StatSoft Polska 2014
www.statsoft.pl/czytelnia.html
109
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
Głównymi aspektami, na jakie należy zwrócić uwagę, to odpowiednia liczebność prób
i częstość ich pobierania [4], [5]. Typowe karty kontrolne opierają się na próbach o równej
liczebności (np. dane z powtarzanego cyklicznie pięciokrotnego posiewu takiej samej objętości badanej substancji), jednak inne typy kart umożliwiają analizę danych otrzymywanych z prób o zmiennej liczebności czy nawet analizę danych z pojedynczych obserwacji.
Ten ostatni typ konstrukcji kart kontrolnych ma szczególne zastosowanie w analizie
trendów danych mikrobiologicznych. Wyniki badań mikrobiologicznych bardzo często są
przedstawiane jako wynik pojedynczego pomiaru. Dotyczy to większości danych mikrobiologicznych z zakresu monitoringu warunków wytwarzania (powietrze pomieszczeń
czystych, stan higieniczny podłóg, ścian, urządzeń produkcyjnych), badań wody oczyszczonej, mediów pomocniczych (sprężone powietrze, gazy).
Częstość pobierania prób zazwyczaj narzucana jest przez przyjęty harmonogram badań.
Zwykle w początkowych etapach „zakładania kart” próby powinny być pobierane z możliwie jak największą częstością, szczególnie jeśli mamy do czynienia z badaniami w ramach
kwalifikacji instalacji czy systemu. Warto jednak zauważyć, iż zarówno liczebność prób,
jak i częstość ich pobierania to wynik kompromisu pomiędzy chęcią maksymalnej
dokładności badań a ponoszonymi kosztami.
Procedurę zakładania i prowadzenia kart można podzielić na kilka ogólnych kroków (por.
[4] i [5]). Pierwszy z nich obejmuje etap „uczenia się karty”. Polega on na ustaleniu roboczego położenia linii centralnej i granic kontrolnych, zwykle opartych na niewielkiej puli
danych i/lub doświadczeniu analityka. Kolejny krok następuje po zebraniu odpowiedniej
liczby danych i polega na przeliczeniu i dopasowaniu roboczych parametrów karty do
wartości właściwych dla danego, ustabilizowanego procesu. W trzecim kroku właściwe
położenie linii centralnej i granic kontrolnych jest „blokowane” (nowe dane z procesu nie
modyfikują parametrów karty), co umożliwia monitoring procesu i wykrywanie ewentualnych „odstępstw od normy”.
Strategia analizy danych za pomocą kart kontrolnych
Analiza danych za pomocą kart kontrolnych jest prosta i intuicyjna. W dużej mierze polega
na analizie sporządzonych wykresów. Interpretacja położenia punktów oraz kształtu
otrzymanego wykresu (konfiguracji ułożenia punktów) pozwala podjąć decyzję, czy
zmienność badanej charakterystyki jest naturalna czy też działają na nią jakieś czynniki
specjalne, które należy poddać analizie.
Samą procedurę analizy danych można podzielić na dwa etapy.
1. Analiza naruszenia granic kontrolnych – polega na zbadaniu, czy któryś z punktów
widocznych na wykresie przekracza granice kontrolne. Naturalne pojawienie się
wyniku będącego poza granicami kontrolnymi występuje bardzo rzadko. W związku
z tym wynik taki sugeruje, że na proces mogły zadziałać czynniki specjalne, które
spowodowały rozregulowanie procesu. Taki przypadek często jest spotykany w analizie trendów danych monitoringu warunków wytwarzania (szczególnie powietrza),
110 www.statsoft.pl/czytelnia.html
Copyright © StatSoft Polska 2014
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
gdzie na chwilowe „odchylenie” poziomu zanieczyszczenia mikrobiologicznego od
wartości zwykle obserwowanych ma wpływ wiele czynników, które stosunkowo łatwo
mogą zaistnieć (np. przestrzeganie procedur sanitarnych przez personel produkcji,
obciążenie mikrobiologiczne materiałów wyjściowych).
2. Wykonanie testów konfiguracji – polega na analizie występowania charakterystycznych i ustandaryzowanych w normach konfiguracji punktów wykresu, których prawdopodobieństwo pojawienia się w przypadku procesu ustabilizowanego jest odpowiednio niskie. Zarejestrowanie charakterystycznego układów punktów (zob. [4])
sugeruje działanie czynników specjalnych. Jedna z tych konfiguracji, sześć kolejnych
wartości pojawiąjących się w tendencji rosnącej lub malejącej, sygnalizuje występowanie trendu. Ten test konfiguracji znajduje zatem zastosowanie jako jedna z technik
analizy trendów i jest szczególnie użyteczny w badaniach mikrobiologicznych. Program STATISTICA generuje wszystkie testy konfiguracji, umożliwiając łatwą i szybką
identyfikacje występujących trendów lub „rozregulowań” badanego parametru.
Wybór odpowiednich kart
Wybór kart kontrolnych zdeterminowany jest przez rodzaj danych, które będą podlegać
analizie. Spora część kart oparta jest na danych, których rozkład nie różni się znacząco od
rozkładu normalnego. Niestety w praktyce mikrobiologicznej taki typ rozkładu często jest
rzadkością. W takich przypadkach dane można: a) poddać odpowiednim przekształceniom,
które matematycznie „upodobnią” ich rozkład do rozkładu normalnego, b) odpowiednio
skorygować stosowane karty lub też c) wykorzystać karty kontrolne, których konstrukcja
nie bazuje na rozkładzie normalnym.
Ogólnie karty można podzielić na dwie kategorie [5]:
 Karty kontrolne przy liczbowej ocenie właściwości (np. karta X-R, X-S, IX-MR) –
opierają się na wartościach pomiarów jednostek będących przedmiotem analizy. Takim
typem analizy danych może być ocena czystości mikrobiologicznej produktu
leczniczego na przestrzeni określonego czasu (np. gdy liczba przebadanych serii jest
odpowiednio duża). Podstawowe założenie w przypadku tych kart dotyczy normalności rozkładu analizowanych danych. Istnieją jednak specjalne procedury, które
umożliwiają analizę danych, które nie mają rozkładu normalnego.
 Karty kontrolne przy alternatywnej ocenie właściwości (np. karta: p, np, c, u) - opierają
się na danych pochodzących z obserwacji o charakterze jakościowym. Obserwacje
dzieli się na dwie kategorie, np. „dobre”, „złe”, „jest”/„nie ma”, i nie przeprowadza się
bezpośrednio pomiaru badanej właściwości. Zlicza się jedynie, czy dana cecha/niezgodność/wada wystąpiła lub nie, a w niektórych przypadkach analitycznych  ile
razy. Przykładem takich danych mogą być: fakt stwierdzenia zabarwienia w teście,
pojawienia się wzrostu kolonii lub nie, liczba pojemników, które nie przeszły procesu
sterylizacji w autoklawie itp. Karty tego typu nie mają założenia o normalności
rozkładu danych i oparte są na rozkładzie Bernoullego i Poissona.
Copyright © StatSoft Polska 2014
www.statsoft.pl/czytelnia.html
111
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
Przykład analizy danych za pomocą kart kontrolnych
Przedmiotem analizy były dane historyczne powietrza pomieszczeń czystych. Analizowano
liczbę drobnoustrojów w jednym metrze sześciennym powietrza (CFU/1m3), oznaczonych
w kolejnych, okresowych badaniach mikrobiologicznych. Analizę przeprowadzono za
pomocą kart kontrolnych. Do konstruowania kart wykorzystano program STATISTICA.
Analiza przeprowadzana była dwuetapowo. W pierwszym, wstępnym etapie dane zebrane
w analizowanym pomieszczeniu zostały zbadane pod kątem weryfikacji hipotezy o normalności ich rozkładu. Wyniki analizy wstępnej wskazywały na istotną statystycznie
różnicę kształtu rozkładu analizowanych danych i kształtu rozkładu normalnego. Dane
(stwierdzone w analizie mikrobiologicznej liczby CFU/m3) poddano transformacji
logarytmicznej celem „upodobnienia” ich do rozkładu normalnego. Ponowna weryfikacja
normalności rozkładu transformowanych danych wykazała, iż uzyskany rozkład nie różni
się istotnie statystycznie od rozkładu normalnego. Ostateczna analiza danych została więc
przeprowadzona za pomocą kart kontrolnych dla pojedynczych obserwacji (dane po
transformacji logarytmicznej) i testów konfiguracji.
Zamieszczone na wykresach wartości linii centralnej oraz górnych i dolnych linii kontrolnych są wartościami logarytmów naturalnych liczby CFU/m3. Kryterium akceptacji 200
CFU/m3 poddane transformacji logarytmicznej wynosiło ln(200 CFU/m3) ≈ 5,298 i zostało
naniesione na wykres.
W wyniku przeprowadzonych analiz statystycznych:
 ani razu nie stwierdzono przekroczenia ustalonego kryterium akceptacji ln(200
CFU/m3),
112 www.statsoft.pl/czytelnia.html
Copyright © StatSoft Polska 2014
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
 ani razu nie stwierdzono przekroczenia górnej granicy kontrolnej, co mogłoby świadczyć o niekontrolowanym wzroście poziomu zanieczyszczeń,
 przeprowadzone testy konfiguracji wygenerowały jeden sygnał ostrzegawczy o możliwym przesunięciu przeciętnego poziomu zanieczyszczenia; sygnał dotyczył wyników
5 kolejnych analiz przeprowadzonych w okresie od 10.12.2012 do 23.04.2013 i sugerował okresowe zmniejszenie przeciętnego poziomu zanieczyszczenia, co można
zaklasyfikować jako sygnał pozytywny. Potwierdzenie tego sygnału wymaga kontroli
poziomu zanieczyszczeń w kolejnych badaniach,
 przeprowadzone testy konfiguracji nie wygenerowały sygnału świadczącego o pojawieniu się trendów w zanieczyszczeniach powietrza w analizowanym czasookresie.
Testy konfiguracji
Numery obserwacji (daty)
od
do
9 obserwacji po tej samej stroni linii centralnej
6 kolejnych obserwacji w trendzie rosnącym/malejącym
(analiza trendu)
14 obserwacji naprzemiennie w górę i w dół
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
2 z 3 obserwacji w strefie A lub powyżej
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
4 z 5 obserwacji w strefie B lub powyżej
10.12.2012
23.04.2013
15 obserwacji w strefie C
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
8 obserwacji powyżej w strefy C
Nie stwierdzono
Nie stwierdzono
Strefy: A/B/C: 3/2/1 * Sigma
Wnioski:
Stwierdzony poziom zanieczyszczeń w badanym pomieszczeniu w całym analizowanym
czasookresie kształtował się na poziomie nieprzekraczającym ustalonego kryterium
akceptacji. W analizowanym czasookresie nie wystąpiły trendy w zmianie poziomu
zanieczyszczeń. Możliwość trwałego obniżenia przeciętnego poziomu zanieczyszczeń
wymaga potwierdzenia wynikami kolejnych badań.
Podsumowanie
Karty kontrolne są prostą i szybką techniką pozwalającą analizować dane uzyskiwane
w rutynowych analizach laboratoryjnych. Połączenie w kartach kontrolnych stosunkowo
nieskomplikowanego aparatu statystycznego oraz technik analizy graficznej pozwala na
intuicyjną i sprawną interpretację wyników. Zastosowanie komputerowych technik wspomagania analiz danych takich, jakie oferuje pakiet STATISTICA (wraz z modułem Przegląd
Jakości Produktu), przyczynia się do automatyzacji i zwiększania precyzji i efektywności
pracy analityka. Zalety te znacznie ułatwiają sprostanie zaleceniom dotyczącym
statystycznej analizy danych, sformułowanym w zapisach GMP.
Copyright © StatSoft Polska 2014
www.statsoft.pl/czytelnia.html
113
StatSoft Polska, tel. 12 428 43 00, 601 41 41 51, [email protected], www.StatSoft.pl
Technikę analizy trendów z zastosowaniem kart kontrolnych z powodzeniem można zastosować w trakcie analizy danych mikrobiologicznych z:
 kwalifikacji instalacji wody oczyszczonej,
 kwalifikacji instalacji pomocniczych (powietrze sprężone, azot),
 kwalifikacji pomieszczeń czystych,
 analizy danych historycznych w ramach okresowego Przeglądu Jakości Produktu.
Literatura
1. Rozporządzenie Ministra Zdrowia z 1 października 2008 w sprawie wymagań Dobrej
Praktyki Wytwarzania z późniejszymi zmianami (Dz. U. z 2008. Nr 184 poz. 1143
z późn. zm.).
2. Montgomery, D.C. Introduction to statistical quality control, 6th ed., John Wiley &
Sons, Inc, 2009.
3. PN-ISO 7870 Karty kontrolne Ogólne wytyczne i wprowadzenie, PKN, Warszawa 2006.
4. PN-ISO 8258+AC1 Karty kontrolne Shewharta, PKN, Warszawa 1996.
5. Greber T. Statystyczne sterowanie procesami – doskonalenie jakości z pakietem
STATISTICA, StatSoft, Kraków 2000.
* praca opiera się na efektach projektu zrealizowanego w ramach programu: „Kumulacja kompetencji – stażowy program angażowania pracowników naukowych w rozwój branż Nano, Bio i Energia” - współfinansowanego ze środków Europejskiego Funduszu Społecznego i realizowanego przez
Wrocławskie Centrum Badań EIT +.
114 www.statsoft.pl/czytelnia.html
Copyright © StatSoft Polska 2014