Dr Katarzyna Wyrwa - Instytut Genetyki Roślin

CV
Dr Katarzyna Wyrwa
E-mail: [email protected]
Telefon: (+48 61) 65 50 217
Zakład Biometrii i Bioinformatyki
Zespół Ewolucji Funkcji Systemów Biologicznych
Specjalizacja
genomika porównawcza roślin i grzybów, filogenomika, metagenomika, bionformatyka
Profil badawczy / zakres prowadzonych badań
1. Analiza scenariuszy ewolucyjnych kształtujących współczesne rośliny strączkowe.
2. Analiza metagenomu grzybowego.
3. Analiza ewolucji domen i architektury domenowej białek.
Projekty badawcze krajowe i międzynarodowe
1. NCN
Nr projektu: 2011/03/NZ2/01420
Tytuł projektu: „Cytomolekularny wgląd w genomy Lupinus”
Kierownik projektu: dr inż. Karolina Leśniewska
Okres realizacji: 14.08.2012-13.08.2015
Nr projektu: 2013/08/T/NZ2/00796
Tytuł projektu: „Analiza genetyczno-molekularna wybranych genów uczestniczących
w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius L.)”
Kierownik projektu: mgr Katarzyna Wyrwa
Okres realizacji: 1.10.2013 – 30.09.2015
2. MNiSW
Nr projektu: N N301 391939
Tytuł projektu: „Genom jądrowy Lupinus angustifolius L.: struktura wybranych genów, ich
lokalizacja genetyczna i fizyczna oraz analiza porównawcza wybranych regionów genomu
z innymi gatunkami roślin strączkowych”
Kierownik projektu: dr hab. Barbara Naganowska, prof. IGR
Okres realizacji: 15.09.2010 – 14.09.2013
3. MRiRW
Nr projektu: 79
Tytuł projektu: „Cecha wczesności kwitnienia u łubinu wąskolistnego (Lupinus angustifolius)
- podstawy genetyczne i molekularne”
Kierownik projektu: prof. Bogdan Wolko
Okres realizacji: 2011 - 2013
Nr projektu: N301 084 32/3234
Tytuł projektu:„Analiza struktury regionu genomu Lupinus angustifolius zawierającego gen
odporności na antraknozę”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Bogdan Wolko
Okres realizacji: 09.05.2007 - 08.08.2010
Staże zagraniczne
1. 2014 - Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth
21.07.2014 – 23.02.2015
2. 2011 - France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation,
Université de Rennes, 6.11 – 20.11.2011
Współpraca krajowa
1. Instytut Chemii Bioorganicznej, współpraca w ramach projektu MNiSW
2. Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań, współpraca w ramach projektu
MNiSW
Współpraca zagraniczna
1. Uniwersytet Australii Zachodniej w Perth, Australia – dr Matthew Nelson
2. Royal Botanical Gardens, Kew, Wielka Brytania– dr Matthew Nelson
Publikacje
1. Wyrwa K., Książkiewicz M., Szczepaniak A., Susek K., Podkowiński J., Naganowska
B. 92016). Integration of Lupinus angustifolius L. (narrow-leafed lupin) genome maps
and comparative mapping within legumes. Chromosome Research. 1-24. DOI:
10.1007/s10577-016-9526-8
2. Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski
W., Wolko B., Naganowska B. (2014), Remnants of the legume ancestral genome
preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic
and comparative mapping, Plant Molecular Biology Reporter 2014.
3.Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K., Przysiecka
Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013). Comparative genomics of
Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic mapping
and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79.
4.Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013), Generich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.); Annual Report 2013,
Polish Academy of Science, 47-49.
5.Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko B.
(2011). Cytogenetic mapping – a step towards an integrated genome map of Lupinus
angustifolius. W: “Lupin crops – an opportunity for today, a promise for the future”
(Naganowska B., Wolko B., Kachlicki P., red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June
2011, Poznań, Poland. ISBN 978-83-61607-73-1. Institute of Plant Genetics Polish
Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss. 62-68.
6.Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz
sprzężone z genami odporności na grzyby
(Lupinus angustifolius L.). W: Materiały
środowiska, surowców i żywności” (Dubert
ISBN 978-83-86878-26-0, ss. 169-170.
K., Wyrwa K. (2010). Markery STS
patogeniczne u łubinu wąskolistnego
IV Sympozjum Naukowego „Jakość
F i in. red.) Kraków, 22-23.04.2010.
Nagrody i odznaczenia
1. Stypendium na wyjazd szkoleniowy TransFormation.Doc realizowane w ramach
projektu systemowego Ministra Nauki Szkolnictwa Wyższego pt. „Wsparcie systemu
zarządzania badaniami naukowymi i ich wynikami”. Szwecja, Lund 17-30.10.2015
2. Nagroda indywidualna za osiągnięcia publikacyjne w 2014 roku przyznana przez
Dyrektora Instytutu Genetyki Roślin PAN w Poznaniu.
3. Projekt nr PO KL 8.2.2/30-29-13/14 pt. "Analiza genetyczno-molekularna wybranych
genów uczestniczących w wiązaniu azotu atmosferycznego u łubinu wąskolistnego
(L. angustifolius L.)". „Wsparcie stypendialne dla doktorantów na kierunkach
uznanych za strategiczne z punktu widzenia rozwoju Wielkopolski” realizowanego w
latach 2013-2014 przez Wojewódzki Urząd Pracy w Poznaniu w ramach Programu
Operacyjnego Kapitał Ludzki 2007-2013.
CV
Dr Katarzyna Wyrwa
E-mail: [email protected]
Telefon: (+48 61) 65 50 217
Department of Biometry and Bioinformatics
Functional Evolution of Biological Systems Team
Specialisation
comparative genomics of plants and fungi, phylogenomics, metagenomics, bioinformatics
Research profile
1. Analysis of evolutionary mechanisms shaping contemporary legumes.
2. Fungal metagenome analysis.
3. Analysis of domain evolution and domain architecture of proteins.
National and international grants
1. National Centre of Science (NCS) grants
Project no: 2011/03/NZ2/01420
Project title: Cytomolecular insight into Lupinus genomes
Project leader: dr inż. Karolina Leśniewska
Duration: 14.08.2012-13.08.2015
Project no: 2013/08/T/NZ2/00796
Project title: Insight into Lupinus angustifolius genome: molecular analysis of several genes
involved in nitrogen fixationin narrow-leafed lupin.
Project leader: mgr Katarzyna Wyrwa
Duration: 1.10.2013 – 30.09.2015
2. Ministry of Science and Higher Education grants
Project no: N N301 391939
Project title: Nuclear genome of Lupinus angustifolius L: genes structure, their physical and
genetic localization and comparative analyzes with model legume plants gemomes.
Project leader: prof. dr hab. Barbara Naganowska
Duration: 15.09.2010 – 14.09.2013
3. Ministry of Agriculture and Rural Development
Project no: 79
Project title: Flowering time trait in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.) – genetic
and molecular background
Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko
Duration: 2011 – 2013
Project no: N301 084 32/3234
Project title: Analysis of Lupinus angistifolius genome region carrying anthracnose resistance
gene.
Project leader: prof. dr hab. Bogdan Wolko
Duration:09.05.2007 - 08.08.2010
International fellowships / trainings
1. 2014 - Australia, University of Western Australia, School of Plant Biology, Perth
21.07.2014 – 23.02.2015
2. 2011 - France, UMR CNRS 6553 Ecobio, Evolution des Génomes et Spéciation,
Université de Rennes, 6.11 – 20.11.2011
National co-operation
1. Institute of Bioorganic Chemistry, Poznań, joint Ministry of Science and Higher
Education project
2. Adam Mickiewicz University, Poznan, joint Ministry of Science and Higher
Education project
International co-operation
1. University of Western Australia Perth, Australia – dr Matthew Nelson
2. Royal Botanical Gardens, Kew, United Kingdom – dr Matthew Nelson
Papers
1. Ksiażkiewicz M., Zieleziński A., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Karłowski
W., Wolko B., Naganowska B. (2015) Remnants of the legume ancestral genome
preserved in gene-rich regions: insights from Lupinus angustifolius physical, genetic
and comparative mapping. Plant Molecular Biology Reporter 2015: 33(1).
2. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Rychel S., Majcherkiewicz K.,
Przysiecka Ł., Karłowski W., Wolko B., Naganowska B. (2013) Comparative
genomics of Lupinus angustifolius gene-rich regions: BAC library exploration, genetic
mapping and cytogenetics. BMC Genomics 2013, 14:79.
3. Książkiewicz M., Wyrwa K., Szczepaniak A., Naganowska B., Wolko B. (2013)
Gene-rich regions in narrow leafed lupin (Lupinus angustifolius L.). Annual Report
2013, Polish Academy of Science, 47-49.
4. Naganowska B., Wyrwa K., Szczepaniak A., Przysiecka Ł., Książkiewicz M., Wolko
B. (2011) Cytogenetic mapping – a step towards an integrated genome map of Lupinus
angustifolius. W: “Lupin crops – an opportunity for today, a promise for the future”
(Naganowska B, Wolko B, Kachlicki P, red.). Proc. 13th Int. Lupin Conf., 6-10 June
2011, Poznań, Poland. ISBN 978-83-61607-73-1. Institute of Plant Genetics Polish
Academy of Sciences, Polish Lupin Association, ss. 62-68.
5. Wolko B., Książkiewicz M., Majcherkiewicz K., Wyrwa K. (2010) Markery STS
sprzężone z genami odporności na grzyby patogeniczne u łubinu wąskolistnego
(Lupinus angustifolius L.). W: Materiały IV Sympozjum Naukowego „Jakość
środowiska, surowców i żywności” (Dubert F i in. red.) Kraków, 22-23.04.2010.
ISBN 978-83-86878-26-0, ss. 169-170.
Awards
1. Ministry of Science and Higher Education scholarship “TransFormation.Doc” for two
weeks training, Sweden, Lund 17-30.10.2015.
2. Director of Institute of Plant Genetics award (2014).
3. Scholarschip no PO KL 8.2.2/30-29-13/14 entitled: „Insight into Lupinus angustifolius
genome: molecular analysis of several genes involved in nitrogen fixationin narrowleafed lupin.”.