Synteza koniugatów auksyn
Transkrypt
Synteza koniugatów auksyn
SYNTEZA I IDENTYFIKACJA METODĄ CHROMATOGRAFII CIENKOWARSTWOWEJ 1-O-IA-GLUKOZY I IA-MYO-INOZYTOLU WSTĘP Synteza estrowych koniugatów auksyn Wszystkie znane naturalne auksyny występują w roślinach w formie fizjologicznie aktywnego wolnego kwasu oraz w połączeniach z innymi związkami jako tzw. koniugaty. Reakcje syntezy koniugatów polegają na utworzeniu wiązania kowalencyjnego między grupą karboksylową auksyny, a grupą hydroksylową cukrów i inozytolu (koniugaty estrowe) lub wolnych aminokwasów, peptydów i białek (koniugaty amidowe). Koniugaty pełnią funkcję zapasowego źródła fitohormonu, z którego stopniowo w miarę potrzeby uwalniana jest hydrolitycznie aktywna auksyna. Synteza koniugatów estrowych została poznana juŜ stosunkowo dobrze w dojrzewających nasionach kukurydzy i grochu. Szczególnie bogatym źródłem połączeń estrowych jest bielmo niedojrzałych nasion kukurydzy. Ponad 50% całkowitej ilości koniugatów występuje tu w postaci nierozpuszczalnych w wodzie celulozowych β-1,4-glukanów, około 15% stanowią połączenia estrowe z myo-inozytolem, a ponad 30% całkowitej ilości koniugatów to związki, które oprócz inozytolu zawierają dodatkowo galaktozę lub arabinozę. W śladowych ilościach występują tu takŜe estrowe połączenia kwasu indolilo-3-octowego z glukozą. Pierwszym etapem biosyntezy połączeń estrowych jest odwracalna reakcja prowadząca do powstania 1-O-(indolilo-3-acetylo)-β-D-glukozy (uŜywany skrót: 1-O-IA-glukoza). Reakcja ta jest katalizowana przez glukozylotransferazę UDP-glukoza: kwas indolilo-3-octowy (IAA), nazywaną równieŜ syntazą 1-O-IA-glukozy, zgodnie z równaniem: UDP-glukoza IAA 1-O-IA-glukoza 1 UDP Powstająca w reakcji 1-O-IA-glukoza zawiera wiązanie alkiloacylowe, które jest wiązaniem bardzo nietrwałym. W pH alkalicznym 1-O-IA-glukoza łatwo ulega nieenzymatycznej izomeryzacji dając połączenia estrowe, w których reszta IAA jest związana z węglem 2, 4 i 6 glukozy. 1-O-IA-glukoza jest związkiem pośrednim w syntezie IA-myo-inozytolu, który powstaje w reakcji przeniesienia reszty IAA z 1-O-IA-glukozy na myo-inozytol. Reakcja syntezy IA-myoinozytolu jest katalizowana przez acylotransferazę zgodnie z równaniem: 1-O-IA-glukoza myo-inozytol IA-myo-inozytol glukoza Chromatografia cienkowarstwowa Adsorbenty uŜywane do chromatografii cienkowarstwowej charakteryzują się bardzo małymi cząsteczkami, a cienką warstwę adsorbentu na powierzchni płytki (0,2 mm) powinna cechować trwałość. Warstwa nośnika nie moŜe nadmiernie pęcznieć w czasie rozdziału, czy pękać w trakcie suszenia, a takŜe nie moŜe pochłaniać promieniowania UV, które jest często uŜywane do lokalizacji rozdzielanych związków. Powszechnie uŜywanym adsorbentem nieorganicznym jest Ŝel krzemionkowy (Silica Gel) o przeciętnej średnicy ziaren od 5 do 25 µm. Niektóre adsorbenty zawierają domieszkę substancji fluoryzujących, które umoŜliwiają lokalizację związków (np. związków z pierścieniami aromatycznymi) bez uŜywania wywoływaczy, a jedynie przez wystawienie chromatogramu na działanie promieniowania UV o zakresie 254 nm. W chromatografii cienkowarstwowej na ogół operuje się bardzo niewielkimi ilościami rozdzielanych prób, rzędu kilku µl. Przed rozpoczęciem nanoszenia prób, na płytce zaznacza się linie startu oraz punkty, na które zostaną naniesione próby. Średnica prób (plamek) po naniesieniu powinna być moŜliwie mała (2-3 mm), dlatego próbki nanosi się zwykle małymi porcjami susząc plamki strumieniem ciepłego powietrza. Układy rozwijające dobiera się eksperymentalnie uwzględniając skład i rodzaj rozdzielanych substancji. Powtarzalność rozdziałów moŜliwa jest tylko przy uŜyciu bardzo czystych rozpuszczalników, a takŜe pod warunkiem, Ŝe skład mieszaniny rozwijającej nie ulegnie zmianie np. w wyniku odparowania jednego ze składników. Po 2 skończonym rozdziale i zaznaczeniu ołówkiem czoła układu rozwijającego, płytki suszy się delikatnie w strumieniu ciepłego powietrza. Do lokalizacji bezbarwnych substancji uŜywa się odczynników, które tworzą z rozdzielanymi związkami barwne połączenia. Oprócz tego szereg związków absorbuje UV, co uwidacznia się w postaci ciemnych plam na świecącym tle (o ile adsorbent zawiera dodatek substancji fluoryzującej np. fluoresceiny). Po wybarwieniu rozdzielanych związków mierzy się odległość środka plamki od linii startu oraz odległość czoła rozpuszczalnika od linii startu, a następnie oblicza się wartość Rf. Wartości Rf powinny być powtarzalne przy zachowaniu stałych warunków rozdziału. Wskazane jest jednak rozwinięcie (na tej samej płytce) czystych związków (wzorców), które ułatwią identyfikację rozdzielanych substancji. MATERIAŁY Materiały: • zamroŜone bielmo z niedojrzałych nasion kukurydzy • płytki do chromatografii cienkowarstwowej Silica gel 60 F254 firmy MERCK • kolumna Sephadex G-15 (15 x 1 cm) Odczynniki: • 25 mM bufor Tris-HCl, pH 7.4 • 50 mM bufor HEPES-NaOH, pH 7.4 • roztwór zawierający 24 mM UDP-glukozę, 8 mM MgCl2 w 50 mM buforze HEPES- NaOH, pH 7.4 • 64 mM IAA w 50% izopropanolu • 30 mM myo-inozytol w 50 mM buforze HEPES-NaOH, pH 7.4 • układ rozwijający: octan etylu, butanon (etylmetylketon), etanol 99.6 %, woda w stosunku 5:3:1:1 • odczynnik Van Urk-Salkowskiego: A. 2 g p-dwumetyloaminobenzaldehydu rozpuścić w 100 ml HCl, a następnie dodać 100 ml 99 % etanolu B. 2.03 g FeCl3 x 6 H2O rozpuścić w 500 ml H2O, a następnie dodać 300 ml stęŜonego kwasu siarkowego Odczynnik Van Urk-Salkowskiego zawiera 1 część roztworu A i 3 części roztworu B. 3 WYKONANIE Przygotowanie ekstraktu z bielma nasion kukurydzy: Aktywność syntazy 1-O-IA-glukozy i syntazy IA-inozytolu moŜna analizować jakościowo i ilościowo w bielmie wyciśniętym z niedojrzałych nasion kukurydzy (koński ząb), przechowywanym w stanie zamroŜonym w temp. –200 C. Metalową szpatułą zdrapać 2 g zamroŜonego materiału, po czym rozetrzeć w małym moździerzu. Dobrze roztarty materiał przelać do dwóch probówek wirówkowej Eppendorfa i odwirować przy 15 000 obr/min 10 min. W celu usunięcia endogennych koniugatów zebrany z obu probówek nadsącz uzyskany po wirowaniu naleŜy poddać sączeniu Ŝelowemu (odsalaniu) na kolumnie Sephadex G-15. W tym celu całą objętość nadsączu nanieść na powierzchnie kolumny, po uprzednim usunięciu nadmiaru buforu znad powierzchni Ŝelu Sephadex G-15, przy zamkniętym wypływie kolumny. Po wniknięciu całej próbki do Ŝelu (UWAGA! nie dopuścić do zapowietrzenia kolumny!) pipetą Pasteura nanieść ostroŜnie na powierzchnię Ŝelu ok. 3-5 ml roztworu do elucji – 25 mM Tris-HCl pH 7,4, a następnie podłączyć butlę z roztworem elucyjnym. Po otwarciu wypływu z kolumny, śledzić przesuwanie się wzdłuŜ kolumny Ŝółto zabarwionej frakcji białek. Kiedy białka będą na wysokości ok. 2-3 cm od wylotu z kolumny rozpocząć zbieranie około 1 ml frakcji. Frakcję zawierającą największe stęŜenie białek (najbardziej intensywne Ŝółte zabarwienie), zachować do oznaczeń, natomiast pozostałe zebrane próbki wylać. Przygotowanie mieszaniny reakcyjnej Mieszanina reakcyjna I – do oznaczania aktywności syntazy 1-O-IA-glukozy Pobrać do małej probówki Eppendorfa 31.2 µl roztworu zawierającego 24 mM UDP-glukozę, 8 mM MgCl2 w 50 mM buforze HEPES-NaOH, pH 7.4, 25.1 µl 50 mM buforu HEPES-NaOH, pH 7.4 i 6.2 µl 64 mM IAA w 50 % izopropanolu (końcowa objętość 62.5 µl; wystarczy dla dwóch par) Mieszanina reakcyjna II – do oznaczania aktywności syntazy 1-O-IA-glukozy i syntazy IAinozytolu Pobrać do małej probówki Eppendorfa 31.2 µl roztworu zawierającego 24 mM UDP-glukozę, 8 mM MgCl2 w 50 mM buforze HEPES-NaOH, pH 7.4, 25.1 µl 30 mM myo-inozytolu w 50 mM buforze HEPES-NaOH, pH 7.4, i 6.2 µl 64 mM IAA w 50% izopropanolu (końcowa objętość 62.5 µl; wystarczy dla dwóch par) 4 Wykonanie oznaczeń: Do małej probówki Eppendorfa napipetować 20 µl środowiska I, a do drugiej probówki 20 µl środowiska II. Obie probówki umieścić w łaźni wodnej (300 C), a po 1-2 min do obu probówek dodać po 12 µl ekstraktu białkowego uzyskanego po przesączeniu na kolumnie Sephadex. Natychmiast po zmieszaniu roztworów pobrać 4 µl próbki, które naleŜy nanieść na wcześniej przygotowane płytki (zerówki; próbki 1). Naniesione plamki wysuszyć w strumieniu ciepłego powietrza w celu zdenaturowania naniesionych białek. Reakcję prowadzić dalej w łaźni pobierając 4 µl próbki po 10, 20 i 30 min. inkubacji (próbki 2, 3 i 4). Po zakończeniu reakcji nanieść jeszcze 2 próbki zawierające 1 µl 1-O-IA-glukozy (wzorzec; próbka 5) i 1 µl IA-inozytolu (wzorzec; próbka 6).. Po wysuszeniu wszystkich próbek, płytki włoŜyć do eksykatora i rozwijać do czasu, aŜ czoło roztworu rozwijającego znajdzie się w odległości 3-4 mm od górnego brzegu płytki. Po wyjęciu płytek z eksykatora, zaznaczyć czoło roztworu rozwijającego, a następnie płytki dokładnie wysuszyć i zanurzyć na moment do odczynnika Salkowskiego (Uwaga: proszę to robić bardzo ostroŜnie ze względu na wysokie stęŜenie kwasu siarkowego w odczynniku Salkowskiego !). Nadmiar roztworu odsączyć między dwiema warstwami papierowego ręcznika, a następnie ostroŜnie suszyć w gorącym strumieniu powietrza (uŜywając suszarki do włosów), aŜ do całkowitego wybarwienia plamek zawierających pierścień indolowy. OPRACOWANIE WYNIKÓW Zmierzyć odległości plamek zawierających 1-O-IA-glukozę i IA-myo-inozytol od linii startu i policzyć wartości Rf.. Przeanalizować przebieg reakcji w czasie i porównać ilości powstających produktów reakcji. 5