przepis do ćwiczenia 9
Transkrypt
przepis do ćwiczenia 9
Ćwiczenie 9 Biochemiczne mechanizmy obrony przed stresem oksydacyjnym - oznaczanie aktywności wybranych enzymów antyoksydacyjnych Oznaczanie aktywności katalazy (CAT) Odczynniki: • Bufor fosforanowy 0,067M (pH 7,0) • H2O2 2mM w buforze fosforanowym - 20 mM H2O2: sporządzić 3% roztwór nadtlenku wodoru (Pcode: 101308050 – 30,8% H2O2) – rozcieńczyć odczynnik z Sigmy – 10,27 razy (1 µl H2O2 i 9.27 µl buforu fosforanowego), pobrać 22,7 µl 3% roztworu H2O2 i zmieszać z 977 µl buforu fosforanowego. Uzyskaną mieszaninę rozcieńczyć 10 x na 1 gr (5 zespołów) potrzeba: • zhomogenizowany i zliofilizowany proszek z liści roślin poddanych stresowi i kontrolnych: 2x 100 mg • Bufor fosforanowy 0,067M (pH 7,0) 8 ml ekstrakcja + 15ml referencja • H2O2 2mM w buforze fosforanowym – 30 ml Sprzęt: • Spektrofotometr • wirówka • wytrząsarka • łaźnia wodna • łaźnia lodowa • probówki eppendorfa 1,5ml • Probówki PP zakręcane (bo do wrzącej łaźni wodnej) (co najmniej 7-15ml) • Kuwety szklane • pipety szklane i automatyczne Materiał roślinny: • wierzba poddana stresowi • wierzba – osobniki kontrolne. Procedura: • przygotować 2 probówki • do pierwszej odważyć ok 20 mg zhomogenizowanego wcześniej proszku z roślin poddanych stresowi a do drugiej z roślin kontrolnych • zanotować masę naważki • proszek zalać 800 ul buforu fosforanowego (pH 7,0) • wytrząsać przez 30 min • proszek odwirować przez 10 min a nadsącz użyć do oznaczenia aktywności enzymatycznej katalazy • przygotować 3 nowe probówki 23 • • • • do 2 z nich dodać 3ml buforu fosforanowego z H2O2 (próbka stresowa i kontrolna) a do trzeciej 3 ml buforu fosforanowego bez H2O2 (referencja). Następnie do każdej probówki dodać 40 ul ekstraktu enzymatycznego dokładnie zamieszać i pobrać 2 ml do kuwety. UWAGA ekstrakt dodawać bezpośrednio przed pomiarem.!!!! Zmierzyć na spektrofotometrze czas potrzebny do zmiany wartości absorbancji o 0,05 jednostki przy 240 nm (używać kuwet kwarcowych) – pomiar przez minimum 3 min jednostkę enzymatyczną (unit) obliczyć jako ilość enzymu potrzebna do podniesienia absorbancji o 0,05 jednostki na 1 min Oznaczanie aktywności peroksydazy (POD) Odczynniki: • H2O2 1% w 0.1M buforze fosforanowym, pH 6.5 - 20 mM H2O2: sporządzić 1% roztwór nadtlenku wodoru (Pcode: 101308050 – 30,8% H2O2) – rozcieńczyć odczynnik z Sigmy 30,8 x buforem fosforanowym 0,1M pH 6,5 • 0,1 M bufor fosforanowy II (pH 6,5) • Pirogallol: 0.05 M w 0.1M buforze fosforanowym (pH 6.5) na 1 gr (5 zespołów) potrzeba: • zhomogenizowany i zliofilizowany proszek z liści roślin poddanych stresowi i kontrolnych: 2x 100 mg • H2O2 1% w 0.1M buforze fosforanowym, pH 6.5 5 ml • 0,1 M bufor fosforanowy II (pH 6,5) 8 ml • Pirogallol: 0.05 M w 0.1M buforze fosforanowym (pH 6.5) 15 ml Sprzęt: • Spektrofotometr • wirówka • wytrząsarka • łaźnia wodna • łaźnia lodowa • probówki eppendorfa 1,5ml • Probówki PP zakręcane (bo do wrzącej łaźni wodnej) (co najmniej 7-15ml) • Kuwety szklane • pipety szklane i automatyczne Materiał roślinny: • wierzba poddana stresowi • wierzba – osobniki kontrolne. Procedura: • przygotować 2 probówki • do pierwszej odważyć ok 20 mg zhomogenizowanego wcześniej proszku z roślin poddanych stresowi a do drugiej z roślin kontrolnych • zanotować masę naważki • proszek zalać 800 ul buforu fosforanowego II (pH 6,5) • wytrząsać przez 30 min 24 • • • • • • • proszek odwirować przez 10 min a nadsącz użyć do oznaczenia aktywności enzymatycznej peroksydazy przygotować 3 nowe probówki do każdej dodać 3 ml roztworu pirogalolu i 0,1ml ekstraktu enzymatycznego takim roztworem napełnić kuwetę z referencja i wyzerować dla 430 nm do probówek testowych z próbkami dodać 0,5 ml roztworu H2O2 zamieszać i przelać 2 ml uzyskanego roztworu do kuwety testowej notować zmiany absorbancji co 30 s przez 3 min pomiaru względem referencji przy 430 nm jednostkę enzymatyczną (unit) peroksydazy obliczyć jako zmianę absorbancji / min przy 430 nm. 25