Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209

Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209
Sylabusy - Ośrodek Informatyczny UG
Nazwa przedmiotu
Kod ECTS
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK)
Nazwa jednostki prowadzącej przedmiot
13.1.0209
Katedra Biologii Molekularnej i Komórkowej
Nazwisko osoby prowadzącej (osób prowadzących)
dr Katarzyna Węgrzyn
Studia
wydział
Międzyuczelniany
Wydział
Biotechnologii UG
i GUMed
kierunek
Biotechnologia
stopień
pierwszego
stopnia
tryb
stacjonarne
specjalność
wszystkie
Formy zajęć, sposób ich realizacji i przypisana im liczba godzin
Formy zajęć
specjalizacja
wszystkie
semestr
6
Liczba punktów ECTS
Seminarium
Sposób realizacji zajęć
zajęcia w sali dydaktycznej
Liczba godzin
Seminarium: 30 godz.
3
Strategia obliczania/szacowania punktów ECTS
odbywa się w oparciu o następujące założenia:
1 punkt ECTS oznacza 25-30 godzin pracy studenta
w różnych formach takich jak: uczestniczenie w
zajęciach dydaktycznych w UG, samodzielne
przygotowywanie się do zajęć, przygotowanie
prezentacji, indywidualne konsultacje.
Cykl dydaktyczny
2015/2016 letni
Status przedmiotu
Język wykładowy
- obowiązkowy
- fakultatywny (do wyboru)
Metody dydaktyczne
angielski
Przygotowanie, prezentacja i omówienie przez
studentów wybranych technik biologii molekularnej;
indywidualna i zespołowa praca studenta (m.in. w
przygotowaniu do zajęć); dyskusja (odpowiednie
Forma i sposób zaliczenia oraz podstawowe kryteria oceny lub
wymagania egzaminacyjne
Sposób zaliczenia
Zaliczenie na ocenę
Formy zaliczenia
ustalenie oceny zaliczeniowej na podstawie ocen cząstkowych
otrzymywanych w trakcie trwania semestru
argumentów); przygotowanie prezentacji przez
studentów; indywidualne konsultacje z prowadzącym Podstawowe kryteria oceny
stawianie pytań, poszukiwanie odpowiedzi,
zajęcia (m.in. w przygotowaniu prezentacji)
W trakcie zajęć ocenie będzie podlegać:
• wiedza dotyczącą zaawansowanych technik i narzędzi badawczych
stosowanych w biologii molekularnej
• umiejętność korzystania z informacji naukowej do przygotowania opracowania
teoretycznego w tym umiejętność selekcji materiału
• wykorzystanie języka naukowego w tym specjalistycznej terminologii i aparatu
pojęciowego biologii molekularnej. W szczególności ocenie podlegać będzie
poprawne i adekwatne używanie terminów naukowych i specjalistycznych nazw
w języku angielskim niezbędnych do opisu czynności laboratoryjnych i
procedur oraz aparatury.
• umiejętność prowadzenia dyskusji i odpowiedzi na pytania
• kompetencje do pracy w zespole, wspólnej realizacji opracowań teoretycznych
Ocena końcowa będzie wynikała z oceny powyższych elementów. Prowadzący
przeprowadzi ocenę na podstawie aktywności studenta podczas zająć,
przygotowanych przez studentów materiałów, oraz sprawdzianu zawierającego
krótkie pytania otwarte oraz pytania i odpowiedzi do wyboru weryfikujące uzyskanie
zakładanych efektów kształcenia
Określenie przedmiotów wprowadzających wraz z wymogami wstępnymi
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209 | c8654d7b772aec910669e68da10e7aac | Strona 1 z 3
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209
Sylabusy - Ośrodek Informatyczny UG
A. Wymagania formalne
brak
B. Wymagania wstępne
Wymagane jest uzyskanie wiedzy, umiejętności i kompetencji określonych dla kursów Biologia molekularna wykład i ćwiczenia, Metody Inżynierii
Genetycznej (seminarium) i Pracowni inżynierii genetycznej (ćwiczenia laboratoryjne)
Cele kształcenia
Celem kursu jest przygotowanie studentów do teoretycznego opracowania metod laboratoryjnych i procedur stosowanych w biologii molekularnej a w
szczególności:
• Student zdobędzie wiedzę dotyczącą zaawansowanych technik i narzędzi badawczych biologii molekularnej (K_W07)
• Zdobędzie umiejętność korzystania z informacji naukowej, wykorzystując źródła elektroniczne dostępne w zasobach bibliotek UG i GUMed
(K_U02)
• Student nauczy się stosowania języka naukowego w tym specjalistycznej terminologii i aparatu pojęciowego biologii molekularnej (K_U06)
• Student zdobędzie umiejętność przygotowania i prezentacji w języku angielskim wystąpienia ustnego obejmujące szczegółowe zagadnienia w
zakresie biologii molekularnej (K_U03, K_U07)
Studenci pod opieką prowadzącego przygotowują oraz prezentują i omawiają w języku angielskim wybrane techniki biologii molekularnej.
Prowadzący kierując dyskusją wskazuje na zalety i wady prezentowanych metod, przekazuje studentom wiedzę i doświadczenie praktyczne
stosowania omawianych technik laboratoryjnych. Studenci uczą się stawiania pytań, szukania odpowiedzi oraz potrzeby projektowania i
przeprowadzania odpowiednich kontroli eksperymentów. Podczas kursu studenci mają możliwość uczenia się i doskonalenia sposobu prezentacji.
Studenci poznają fachową nomenklaturę dotyczącą omawianych zagadnień. Zakłada się konsultacje studentów z prowadzącym zajęcia – pomoc w
przygotowaniu prezentacji.
Treści programowe
W programie zajęć znajdują się zagadnienia związane z zaawansowanymi metodami biologii molekularnej, opis metod, zasady stosowania, etapy
procedur laboratoryjnych i ich podstawy teoretyczne. Zajęcia obejmą zagadnienia:
1. EMSA (Electrophoretic mobility shift assay )
2. Footprinting
3. SPR (Surface plasmon resonance)
4. Wykorzystanie przeciwciał w analizie oddziaływań białko-białko i białko-DNA (ELISA, ChIP, Pull-down)
5. Mikromacierze (DNA microarray)
6. Biblioteki genowe i genomowe
7. MS (spektroskopia masowa) w analizie białek i kompleksów nukleoproteinowy
8. Białka i znaczniki fluorescencyjne oraz ich zastosowanie (FROS, białka fuzyjne, immunofluorescencja, FRET, FRAP)
9. Mikroskopia (fluorescencyjna, konfokalna, elektronowa, TIRF (ang. total internal reflection)
10. System dwuhybrydowy, BiFC (Bimolecular fluorescence complementation)
11. Metody pozwalające na analizę oddziaływania pojedynczych molekuł (mikroskopia sił atomowych, magnetic tweezers, optical tweezers)
Wykaz literatury
A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć :
“DNA-Protein Interactions” Trawers and Buckle
“Protein-Protein Interactions” Erica Golemie
Materiały samodzielnie wyszukane i wyselekcjonowane przez studentów dotyczące zajęć korzystając z zasobów bibliotecznych i elektronicznych
źródeł informacji
Efekty uczenia się
K_W07
K_U02
K_U03
K_U06
K_U07
Wiedza
K_W07 - ma wiedzę dotyczącą podstawowych technik i narzędzi badawczych
stosowanych w biotechnologii oraz wybranych metod pokrewnych dziedzin i
dyscyplin naukowych; zna rozwój metod biotechnologii; rozumie podstawowe
techniki stosowane w izolacji, selekcji, syntezie, modyfikacji i analizie organizmów,
tkanek, komórek i molekuł
Umiejętności
K_U02 - posiada umiejętność korzystania z informacji naukowej, w tym
angielskojęzycznej, dotyczącej biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin
naukowych; wykorzystuje źródła elektroniczne; posiada podstawową umiejętność
korzystania z właściwych baz danych niezbędnych w prowadzeniu działalności w
zakresie biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin naukowych
K_U03 - zna język angielski w zakresie pozwalającym na rozumienie wypowiedzi i
czytanie ze zrozumieniem literatury i prostych opracowań naukowych z dziedzin
nauki i dyscyplin naukowych właściwych dla biotechnologii; potrafi przygotować
krótkie opracowanie pisemne i prezentację ustną w języku angielskim dotyczącą
szczegółowych zagadnień biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin
naukowych
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209 | c8654d7b772aec910669e68da10e7aac | Strona 2 z 3
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209
Sylabusy - Ośrodek Informatyczny UG
K_U06 - wykorzystuje język naukowy w tym specjalistyczną terminologię i aparat
pojęciowy właściwy dla biotechnologii oraz pokrewnych dziedzin i dyscyplin
K_U07 - potrafi przygotować i przedstawić w języku polskim i/lub angielskim krótkie
wystąpienie ustne obejmujące szczegółowe zagadnienia w zakresie biotechnologii i
pokrewnych dziedzin i dyscyplin; posiada umiejętność prowadzenia dyskusji
Kompetencje społeczne (postawy)
Kontakt
[email protected]
Metodyka biologii molekularnej (seminarium) (KBMiK) #13.1.0209 | c8654d7b772aec910669e68da10e7aac | Strona 3 z 3