PRÓBA OCENY BIOMASY MIKROORGANIZMÓW W GLEBIE
Transkrypt
PRÓBA OCENY BIOMASY MIKROORGANIZMÓW W GLEBIE
R O C Z N IK I G L E B O Z N A W C Z E T. X X X V I, N R 3, S. 67—74, W A R S Z A W A 1985 B A R B A R A KOSINKIEW ICZ PRÓBA OCENY BIOMASY M IKROORGANIZM ÓW W GLEBIE K atedra M ikrob iologii R olniczej A k ad em ii R olniczej w e W rocław iu Znajomość rozm iarów m aterii organicznej zaw artej w ciałach m ikroorganizm ów i dynam iki jej przem ian jest niezm iernie ważna. Św iadczy ona o nasileniu biologicznej sorpcji w glebie* i może być w skaźnikiem szybkości pow staw ania próchnicy. Biomasę m ikroorganizm ów w glebie m ożna określić znając liczebność m ikroorganizm ów , ciężar w łaściw y kom órki i jej objętość. W yznaczenie tych wielkości jest obciążone dużym i nieścisłościam i. Zarów no m etoda płytkow a, jak m etoda bezpośredniego oznaczania ilości m ikroorganizm ów w glebie odbiega od rzeczywistości ze w zględu na trudności z oddziele niem kom órek od koloidów glebow ych oraz zróżnicow anie w ym agań po karm ow ych m ikroorganizm ów [1]. Oznaczając liczebność m ikroorganiz m ów pod m ikroskopem otrzym uje się w ielokrotnie wyższe w yniki niż m etodą płytkow ą [8 ]. Średnią objętość kom órek określa się od 0,4 ixm do 0,8 м т , natom iast ciężar w łaściw y od 1,05 do 1,2 [3, 9]. Różne w iel kości przyjm ow anych w doświadczeniach p aram etrów o raz ogrom na zmienność środow iska glebowego są powodem dużych różnic w w artoś ciach biom asy oznaczanych przez tych autorów . W ynoszą one od k ilk u do ponad tysiąca g/m 2 [4, 5, 9]. W skaźnikam i biom asy drobnoustrojów w glebie mogą być także niektóre związki chemiczne ch arakterystyczne dla żyw ych kom órek, jak ATP, kwas dw uam ino-pim elinow y lub m uram inow y [10]. Oznaczenia chem iczne składników kom órek m ikroorganizm ów są przydatne w badaniach porów naw czych ze w zględu na duże zróżni cowanie zaw artości tych zw iązków w kom órkach. O wielkości biom asy można także wnioskować stosując m etody fizjologiczne [13]. W artości biom asy uzyskane z oznaczeń liczebności m ikroorganizm ów m etodam i fizjologicznym i i enzym atycznym i są na ogół większe niż w yniki oznaczeń bezpośrednich [5]. Ze względu na duże znaczenie znajom ości biom asy m ikroorganizm ów w glebie każda nowo proponow ana m etoda jej oceny jest w a rta rozw a żenia. Celem niniejszej pracy jest opracow anie nowego sposobu oceny 68 В. Kosinkiewicz biom asy m ikroorganizm ów w glebie w oparciu o ekstrakcję gleby roz tw orem chlorku sodowego i następnie rozdział zaw artych w ekstrakcie związków za pomocą sączenia przez żel Sephadex SE-C-25. M ETODY B A D A Ń Do badań użyto następujących gleb: m urszow ej, piasku gliniastego, piasku i ogrodow ej, w ytw orzonej z piasku gliniastego na glinie średniej. W n iektórych dośw iadczeniach glebę wzbogacano hydrolizatem kazeiny lub gnojowicą. Dla celów porów naw czych analizow ano także glebę sk a żoną pyłam i pohutniczym i wi stopmiu znacznie ograniczającym w zrost m ikroorganizm ów , zwłaszcza bakterii. W ykonano także analizę gleby ogro dowej i piaszczystej po ich uprzedniej sterylizacji w autoklaw ie. W dośw iadczeniu m odelow ym ekstrahow ano w ysuszoną do stałej w a gi m ieszaninę m ikroorganizm ów : Rhodotorula glutinia, E. coli9 Sarcina lutea, A rthrobacter sp. i Bacillus sp. E kstrakcję gleb lub kom órek m ikroorganizm ów przeprow adzono sto sując 0,5-procentow y roztw ór chlorku sodowego w ilości 150 cm 3 na 100 g gleby. Użycie do ek strak cji chlorku sodowego było podyktow ane jego zdolnością do rozpuszczania kw asów nukleinow ych d białek, przy rów noczesnym b rak u w ym yw ania kw asów hum inow ych z gleby. Po 0,5-godzinnym w ytrząsaniu i zagotow aniu glebę oddzielano na gorąco przez bibułę filtracy jn ą, w razie potrzeby odw irow yw ano, a klarow ny przesącz odparow yw ano do objętości około 10 cm 3. K larow ny e k stra k t w ilości 2 cm 3 wnoszono na kolum nę (30 cm/2 cm) w ypełnioną żelem Sephadex SE-C25. W ym yw ano ją buforem fosforanow ym o pH 6 , zbierając frak cje objętości 3 cm 3 co 3 m inuty. W yznaczano absorpcję św iatła każdej fra k c ji przy długości fali 254 nm. Zastosow anie silnie kw aśnego kationiitu, jakim jest Sephadex SE-C-25, było uzasadnione brakiem absorpcji kom órek drożdży i b ak terii na tym żelu, co stw ierdzono już poprzednio [12]. L i czebność m ikroorganizm ów w badanych glebach oznaczono m etodą p ły t kow ą na pożywce z w yciągu glebowego. Biomasę m ikroorganizm ów w badanych glebach obliczono w edług wzoru: biom asa = liczebność X śred nia objętość kom órki X średni ciężar właściwy, p rzy jm u jąc objętość ko m órki 0,35 м-m3, a ciężar w łaściw y 1,2. A nalizę chem iczną składu e k stra k tów z gleb w ykonano stosując następujące oznaczenia: białko — m etodą Low ry, cukry — m etodą antronow ą, kw asy nukleinow e — kolorym etrycz nie dwufenyloamiiną [ 11]. W Y N IK I B A D A Ń I W N IO SK I Związki zaw arte w ekstrakcie z gleby rozdzielały się na żelu na dwie frakcje: o dużej m asie cząsteczkowej (frakcie od 1 do 15) i o m n ie j szej m asie (frakcje od 15 do 30). Ilość związków wysokocząsiteczkow ych reprezentow ana przez pow ierzchnie pierw szego piku (rye. 1) była Ocena biomasy mikroorganizmów gleby 69 R ye. 1. R ozdział ek stra k tó w ch lork iem sodu z g leb y 1 — mursz, 2 — humus 2 piasku, 3 — piasek gliniasty, 4 — piasek S ep aration of so il ex tra cts w ith sodium ch lorid e fro m J — mursh, 2 — humus horizont from sand, 3 — loamy sand, 4 — sand większa dla gleb bogatszych w m ikroorganizm y. Stw ierdzono, że po-: w ierzchnie pierw szych pików pozostają w dodatniej korelacji z liczeb nością m ikroorganizm ów oraz z ich biom asą (tab. 1 i 2). Podobne zależ ności stw ierdzono analizując w te n sam sposób gleby różnie użytkow ane, w jesieni i na wiosnę (ryc. 2). W p rzypadku gleb trak to w an y ch gnojoT a b e l a Z a l e i n o d ć m i ę d z y l i c z e b n o ś c i ą b a k t e r ii w g le b ie p i a ^ o z y e t e j , ich b i o m a s ą i p o w i e r z c h n i a m i wyznaczonymi p r z s s n& ^vi'jzbze p i k i R e l a t i o n s h i p b e t w e e n t h e num be r o f b a c t e r i a i n pandy e r i l , t h e i r b i o n a s e a n d t h e a r e a s d e t e r m i n e d by t h 9 h i g h s c c р е а ^ з O biekt - T reatm ent Liczebność n>I n / g Ku nbe r m i l l ./g Biomasa Li ;r:nsa f-E /s Pow ierzchnia piku Pefci: a r e a cm2 C,C CO 13,0 1 , ;20 0,470 17,5 2 ,0 0 0 0 ,8 4 0 19,5 1,820 0,76 0 1,680 1,640 o /n o 14,5 1 2 ,0 0,690 11,6 Gleba p i a s z c z y c t a p obrana wiosną San d y s o i l t a k e n i n s p r i n g G leba p i a s z c z y s t a pobrana j e 6 i e n i ą S on dy s o i l t a k e n i n a u t u n n - po i n k u b a c j i - 1 d z i e ń a f t e r i n c u b a t i o n - 1 d ay 7 d n i - 7 d ay a 0,143 14 d r. i - 14 da y o 21 d n i - 21 d a y s - w zb o g ao o n a h y d r o l i z a t e m k a z e i n y 1 JLnkubowana: e n r i c h o d w i t h ca ca i. n h y d r o l y s e ï e and i n c u b a t e d : 1 dzień 1 d ay 7 dni 7 days 14 d n i - 14 d a y a 21 d n i - 21 d a y a 1,540 0,650 1,370 3,250 4,4 9 0 5,120 Vsp<3łobjnnlk k o r e la c ji a ię d z y biomasą i powierzchniam i piJc<5w => 0 ,9 8 Сo r r e a c t i o n c o e f f i c i e n t b e t w e e n t h e b i o n a e s an d t h e p e a k a r e s o « 0 , 9 3 1,o90 2,150 ) 15,7' 10,1 14,6 19,8 1 В. Kosinkiewicz 70 T a b e l a Z a l e ż n o ś ć m i ę d z y l i c z e b n o ś c i ą b a k t e r i i w g l e b i e o g r o d o w e j , i c h b io m as ą i p o w i e r z c h n i a m i w yzn acz on ym i p r z e z n a j w y ż s z e p i k i R e l a t i o n s h i p b e t w e e n t h e number o f b a c t e r i a i n g a r d e n s o i l , t h e i r b io m aae and п г е а з d e t e r m i n e d by .the h i g h e s t p e a k s O biekt - Treatm ent G le b a og ro do w a p o b r a n a w i o s n ą G ar de n s o i l ta k e n i n s p r i n g G le b a og ro d ow a p o b r a n a j e 3 i e n i ą Ga rd en s o i l t a k e n i n aut umn - po i n k u b a c j i 1 dzień a f t e r inc u b atio n 1 day 7 d n i - 7 days 14 d n i - 14 d a y s 21 d n i - 21 d a y e - w z b o ga co na h y d r o l i z a t e m k a z e i n y i i n k u b o w a n a : e n r i c h e d w i t h c a s e i n h y d r o l y s a t e an d i n c u b a t e d : 1 dzień 1 d ay 7 dni 14 d n i 21 d n i - 7 days - 14 d a y s - 21 d a y s Liczebność m ln/g Nuabe r m i l l . /g Biomasa Biom ass Ji g / g Powie r z c h n i a piku Peak a r e a c«2 0,170 0,071 14,0 5, 560 2,340 31,5 9,880 4,150 32,4 4,120 13,800 3,080 1,730 1,590 21,2 1,290 1 3 ,5 12,7 1 0 ,6 4 0 12,670 18,660 4,4 7 0 5,320 7,840 8,970 62 ,4 85,6 96,0 21,350 48,3 W s p ó ł c z y n n i k k o r e l a c j i m i ęd zy bi o m a s ą i p o w i e r z c h n i a m i pików ■ 0 , 9 9 C o r r e l a t i o n c o e f f i c i e n t b e t w e e n t h e b i o m a s s and t h e p e a k areaa * 0 . 9 9 Numer kolejny frakcji-Subsequent A'o. of the fraction R yc. 2. R ozdział ek stra k tó w ch lork iem sodu z gleb p obranych w io sn ą 1 — ogrodowa, 1 — piasek, oraz w jesieni: 3 — ogrodowa, 4 — piasek S ep aration of ex tr a c ts w ith sod iu m ch lorid e from soils ta k en in spring 1 — garden soil, 2 — sand, and taken in autumn: 3 — garden soil, 4 — sand 2 Ocena biomasy mikroorganizmów gleby 71 wicą otrzym ano podobne zależności, przy czym w prow adzenie ta k boga tego energetycznie m ate ria łu spowodow ało wzm ożenie dynam iki rozw oju m ikroorganizm ów oraz w zrost w artości absorbancji frak cji uw alnianych w żelu, a zatem i stężenia związków wysoko cząsteczkow ych w ek strak cie glebow ym (ryc. 3). A naliza gleb zanieczyszczonych pyłam i p o h u tn iczymi w ykazała obecność dużej ilości grzybów p rzy rów noczesnym b ra k u bakteria. O trzym ane wysokie w artości ekstynkcji poszczególnych frak cji Numer kolejny frakcji— Subsequent No. of the fraction R yc. 3. R ozdział ek stra k tó w ch lork iem sodu z g leb y trak tow an ej gn o jo w icą 1 — gleba ciężka bez gnojowicy, kontrolna, 2 — z gnojowicą w ilości 40 mtyha, 3 — gleba kontrolna lekka bez gnojowicy, 4 — z gnojowicą w ilości 40 m*/ha S ep aration of ex tra cts w ith sod iu m ch lorid e iron so ils trea ted w ith liq u id m an u re I — heavy soil without liquid manure, control, 2 — with liquid manure, 40 m*/ha, 3 — light soil without liquid manure, control, 4 — with liquid manure, 40 m’/ha (ryc. 4) dowodzą, że zw iązki zaw arte w ekstrakcie z ty ch gleb pochodzą praw dopodobnie praw ie w yłącznie z kom órek grzybów lub też z m a r tw ych kom órek bakterii, nie ujaw nionych przez w ysiew na płytki. J a k w ykazała analiza chem iczna ek strak tó w glebow ych, we frak cjach wysoko cząsteczkowych znajdow ały się kw asy nukleinow e, p roteiny i cukry. W yniki badań m a te ria łu kom órkow ego drożdży glebow ych i kilku szczepów bak terii w ykazały podobne zależności jak w przypadku e k stra k tów z gleb (ryc. 5), co m ogłoby sugerow ać, że w yekstrahow ane z gleb} związki pochodzą z kom órek m ikroorganizm ów , ty m bardziej że badane e k stra k ty nie zaw ierały żadnych związków próchnicznych, poniew aż po zostaw ały klarow ne po zakw aszeniu kw asem solnym do pH 2 . A naliza gleb sterylizow anych w autoklaw ie przez 0,5 godziny przy 120 °C w ykazała, że w tych w arunkach, kiedy została zniszczona s tru k tu ra 72 B. Kasmkiewicz Numer kdejny frakcji- Subséquent No. of the fraction R ye. 4. R ozdział ek stra k tó w ch lork iem sodu z g leb y skażonej p y ła m i p oh u tn iczym i 1 — odległość od huty 600 m, 2 — odległość od huty 200 m Separation s of extracts w ith sodium ch lorid e from so il p o llu ted w ith in d u strial dusts 1 — distance from the metalurgie works 600 m, 2 — distance from the metalurgie works 200 m R ye. 5. R ozdział ek strak tów ch lork iem sodu z suchej m iesza n in y kom órek bak terii i drożdży g leb ow ych (426 mg) 1 — ekstrakt z komórek z dodatkiem hy drolizatu kazeiny, 2 — ekstrakt z komórek S ep aration of ex tra cts w ith sod iu m ch lorid e from dry m atter of bacteria c e lls and so il y ea sts (426 m g) 1 — extract from bacteria cells with added 10 20 30 Numer kolejny f r a k c ji- Subsequent Ho. o f the fraction casein hydrolysate, 2 — extract from bacteria cells n a tu ra ln a gleby, do e k stra k tu przechodziło znacznie więcej związków wysoko cząsteczkowych, będących m iarą biom asy kom órek m ikroorga nizmów, co jest zrozum iałe ze w zględu na zm niejszenie się w ty ch w a ru nkach sorpcji cząsteczek koloidu glebowego. Jakkolw iek należy zdawać sobie spraw ę z błędów w ynikających z róż nej efektyw ności ek strak cji gleb za pomocą chlorku sodu, w ydaje sdę, że proponow ana m etoda może znaleźć zastosow anie w badaniach porów naw czych. O pisaną m etodę stosow ano z pow odzeniem w naszym labo rato riu m w w ielu doświadczeniach na różnym m ateriale badaw czym , jak np. na glebach trak to w an y ch w ysokim i daw kam i pestycydów . W tym przypadku stw ierdzano znaczne zaham ow anie w zrostu m ikroorganizm ów i zm niejszenie się biomasy, przy czym na w ykresach zależności m iędzy w artościam i ekstynkcji i num erem kolejnym frakcji uw idoczniała się równocześnie zaw artość herbicydu w glebie [2]. Bliskie jedności w spół Ocena biomasy mikroorganizmów gleby 73 czynniki korelacji m iędzy liczebnością m ikroorganizm ów a pow ierzchnia m i pierw szych pików, odpow iadającym i w artościom biomasy, pozw alają sugerow ać, że przedstaw iona m etoda m oże być stosow ana do porów naw czych szacunkow ych oznaczeń biom asy m ikroorganizm ów w glebie. L IT ER A TU R A [1] B a b i u k L. A., P a u l E. A.: T he u se of flu o rescein e iso -th io cy a n a te in th e determ ination of the b acterial biom ass of grassland soil. Can. J. of. Microbiol.. 16, 1970, 57. [2] B a l i c k a N.: The part of m icroorgan ism s in the com p lex action of p esticid es in sugar b e e t culture. S p raw ozd an ie z prac bad aw czych w ram ach U m ow y P ro ject No. P.L.A.R.S.-5 G rant F.G.Po.335, 1974— 1075. [3] C h u d i a k o w J. P.: W oprosy czislen n o sti b iom asy i p rod u k tiw n osti p o czw ien n ych m ikroorganizm ow . Izdat. N auka 20, 1972, 21. [4] C l a r k F., P a u l K.: The m icroflors of grassland soil. A d van ces A gric. 22, 1970, 30. [5] C l a r k h o l m M., R o s s w a l l T.: B iom ass and tu rn over o f b acteria in a fo rest soil and apeat. S o il Biol. B iochem . 12, 1980, 1, 49—57. [6] D o m s с h K. H., B e c k T. H., A n d e r s o n J. P., S о d e r s t г о m В., P a r k i n s o n D., T r o l l d e n i e r G. A.: A com parison of m ethods for soil m i crobial p op ulation and biom ass stu d ies. Z. P flan zen ern. Bodenkd. 142, 1979, 3, 520—528. [7] K a c z m a r e k W.: B iom asa i p rod u k tyw n ość drobnoustrojów w g leb ie. Rocz. AR Pozn., pr. habilit. 1978. [8] K a c z m a r e k W. , K a s z u b i a k H., G u z e k K.: The com parison of ch an ges in the num ber of m icroorgan ism s in the soil by p late and m icroscop ic m ethods. J. J. of S oil Sei. 6, 1973, 2, 133, 135. [9] K a c z m a r e k W., K a s z u b i a k H'., P ę d z i w i ł к Z.: B adania nad za w a r tością A TP w gleb ie. S em in ariu m m ik rob iologiczn e pt.: „P rocesy m ik rob iolo giczn e w g leb ie”, U stroń—P oznań 1975, 26. [10] K a s z u b i a k H., K a c z m a r e k W. , D u r s k a G.: B adania n ad rozkładem i syntezą kom órek drobnoustrojów g leb ow ych . S em in ariu m m ik rob iologiczn e pt. „P rocesy m ikrob iologiczn e w g le b ie”, U stroń —P oznań 1975, 83. [11] K ł y s z e j k o - S t e f a n o w i c z A.: Ć w iczenia z biochem ii. 1980. [12] K o s i n k i e w i c z B., V a r a n k a W.: B eh aviou r of m icrob ial cells on collum n of som e typ e of S ep h a d ex gels. J. Chrom. 114, 1975, 463— 464. [13] L y n c h J. M., P a i n t i n g L.: C u ltivation and soil biom as. S oil Biol. Biochem . 1, 1980, 29. Б. КОСИНКЕВИЧ П О П Ы ТК А О Ц ЕН К И БИ О М А С СЫ М И КРО О РГА Н И ЗМ О В В П ОЧВЕ Кафедра сельскохозяйственной микробиологии, Сельскохозяйственной академии во Вроцлаве Р езю м е В статье рассматривается новый метод определения биомассы микроорганизмов в почве путем фракционированных экстрактов 0,5% хлоридом натрия на геле Сефадекс SE-C25. Исследования охватывали следующие виды почвы: мурш, сугилинок, гумусный слой песка, В. Kosinkiewicz 74 песок и оглородную почву. В некоторых опытах использовали почву обогащенную гидро лизатом казеина или жидким навозом. С целью сравнения анализировали также почву за грязненную промышленными пылями. Установлено, что соединения содержащиеся в соляном экстракте почвы, разделяются на две главные фракции. Содержание фракций высокомолекулярных соединений коррели ровало с количеством микроорганизмов определяемых стандартным пластиночным методом. Химический анализ высокомолекулярных фракций показал наличие нуклеиновых кислотбелка и сахаров. Результаты фракционирования соляного экстракта сухой массы клеток микроорганизмов были очень сходными с результатами полученными в анализе почвы. В связи с этим можно предполагать, что соединения содержащиеся в высокомолеку лярной фракции происходят из клеток микроорганизмов. Указанный метод пригоден для оценки биомассы микроорганизмов в почве, особенно в сравнительных исследованиях. в. K O S IN K IE W IC Z A N A TTEM PT OF ESTIM ATIO N OF THE SOIL M ICRO BIAL BIO M A SS D epartm ent of A gricu ltu ral M icrobiology, A g ricu ltu ral U n iv ersity of W rocław Summary A n ew m eth od of estim ation o f th e soil m icrob ial biom ass using 0.5°/o N aC l soil extra ct on the S ep h a d ex SE-C-25 g e l is p resen ted in th e paper. M ursh soil, clay-san d , hum us horizon of sand, san d and garden soil w ere used. In som e e x perim ents soil enriched w ith casein or liq u id m anure w a s applied. To com pare th e results, the soil p ollu ted w ith in d u strial dusts w a s tested as w ell. It has been found that the com pounds con tain ed in th e sa lin e soil ex tra ct are separated into tw o fraction s. The h ig h -m o lecu la r fraction co n ten t correlated w ith the num ber of m icroorganism s determ ined b y th e standard p late m ethod. T he chem ical a n a ly sis of h ig h -m o lecu la r fraction sh ow ed the p resen ce of nucleic acids, protein and sugars. The resu lt of fra ctio n a tio n of th e sa lin e ex tra ct of dry m icrob ial cells w a s v ery sim ilar to that of soil. It can be concluded th at th e com pounds con tain ed in th e h ig h -m o lecu la r fr a c tion originated from m icrobial cells. The m ethod presen ted can be used for estim a tio n of th e m icrob ial b iom ass in soil, p articu larly in com p arative tests. D o c . d r h a b . B a r b a r a K o s in k ie w ic z K a te d r a M ik r o b io lo g ii R o ln ic z e j A R W r o c la w , u l. G r u n w a ld z k a S3 W p ły n ę ł o d o r e d a k c ji w p a ź d z ie r n ik u 1984