HARMONIA 2015 - postdoc

Dziekan Wydziału Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Śląskiego
w Katowicach ogłasza konkurs na stanowisko adiunkta naukowego
(„postdok”) do realizacji projektu badawczego „CDKG/Ph1: czy istnieje
uniwersalny mechanizm regulujący stabilność genomu u traw?”
+ Nazwa jednostki realizującej projekt/miejsce pracy: Uniwersytet Śląski w Katowicach,
Wydział Biologii i Ochrony Środowiska, Katedra Anatomii i Cytologii Roślin
+ Rozpoczęcie rekrutacji: czerwiec 2015 r.
+ Zakończenie naboru: 31 sierpnia 2015 r.
+ Typ projektu: HARMONIA – NZ (projekt badawczy realizowany w ramach współpracy
międzynarodowej
finansowany
przez
Narodowe
Centrum
Nauki:
http://www.ncn.gov.pl/finansowanie-nauki/konkursy/typy)
+ Okres zatrudnienia: maksymalny łączny czas zatrudnienia 30 miesięcy, początek
zatrudnienia: od października / listopada 2015 r.
+ Warunki zatrudnienia: umowa o pracę w pełnym wymiarze czasu pracy
(w pierwszej kolejności planowane jest podpisanie umowy o pracę na okres próbny
jednego roku akademickiego. W przypadku pomyślnego przebiegu okresu próbnego,
kolejna umowa zostanie podpisana do końca trwania projektu)
+ Wynagrodzenie: 8 500 PLN brutto/miesiąc (łącznie z kosztami pracodawcy)
Wymagania stawiane kandydatom:
+ Stopień naukowy doktora nauk biologicznych lub pokrewnych w dyscyplinie biologia,
biotechnologia lub biochemia
+ Wiedza i doświadczenie w zakresie biologii molekularnej, genetyki molekularnej, inżynierii
genetycznej lub pokrewnej specjalności
+ Znajomość metodologii i doświadczenie w indukowaniu i analizie mutantów u roślin,
szczególnie z wykorzystaniem technologii RNAi oraz najnowszych metod edycji genomu,
typu CRISPR/Cas lub zdolność jednoznacznego wykazania chęci nabycia takich umiejętności
i doświadczenia
+ Biegła znajomość metodologii i doświadczenie w zakresie rutynowych technik pracy z DNA
i RNA (klonowanie, real-time PCR, itp.)
+ Weryfikowana w trakcie rozmowy kwalifikacyjnej biegła operacyjna znajomość języka
angielskiego
+ Mobilność - projekt jest prowadzony we współpracy naukowej z Uniwersytetem
w Aberystwyth w Wielkiej Brytanii, w którym wykonywane będą niektóre zadania
badawcze
+ Umiejętność samodzielnej pracy badawczej, formułowania i testowania hipotez,
planowania i wykonywania doświadczeń, przygotowywania formalnych raportów
i prezentacji
+ Motywacja do prowadzenia interesujących, ale wymagających prac badawczych, gotowość
do rozwoju naukowego
+ Pożądany dorobek naukowy, udokumentowany publikacjami w czasopismach o zasięgu
międzynarodowym, wygłoszonymi osobiście referatami na konferencjach naukowych,
stypendiami i wizytami naukowymi w ośrodkach zagranicznych i krajowych
+ Możliwość złożenia oświadczenia o spełnianiu wymagań wynikających z art. 109 ust. 1
ustawy z dnia 27 lipca 2005 r. Prawo o szkolnictwie wyższym (Dz. U. Nr 164, poz. 1365 ze
zm. (wzór oświadczenia znajduje się na końcu ogłoszenia)
+ Nienaganna postawa etyczna
Opis projektu:
Stabilność genomu jądrowego jest kluczowa dla istnienia eukariontów. U roślin, będących
często organizmami allopoliploidalnymi, jest to szczególnie istotne w wymiarze poprawnego
parowania i rekombinacji chromosomów homologicznych (homologów) oraz supresji
prowadzącego do zaburzeń mejozy, a w konsekwencji obniżenia płodności, parowania
chromosomów homeologicznych (homeologów). W przypadku pszenicy zwyczajnej
ograniczenie rekombinacji wyłącznie do homologów uwarunkowane jest obecnością
pojedynczego, dominującego locus Ph1, zawierającego kilka kopii genów kodujących kinazy
cyklinozależne (CDK), strukturalnie i funkcjonalnie zbliżone do zakonserwowanej ewolucyjnie
klasy CDKG/CDK11. Wyniki niedawnych badań wykazały, że kinazy CDKG/CDK11 są
zaangażowane w proces parowania chromosomów u Arabidopsis thaliana. Wydaje się zatem
prawdopodobne, że w przypadku traw strukturalnie podobne do CDKG kinazy Ph1 mogą mieć
wpływ na analogiczne procesy związane z parowaniem, przyczyniając się tym samym do
zwiększenia stabilności genomu.
Celem projektu „CDKG/Ph1: czy istnieje uniwersalny mechanizm regulujący stabilność
genomu u traw?” jest zweryfikowanie hipotezy, czy w przypadku traw wyewoluował
mechanizm stabilności genomu oparty na aktywności CDK. Allotetraploidalny obiekt analiz,
Brachypodium hybridum (2n=30), posiada liczne odpowiednie dla proponowanych badań
cechy modelowe, takie jak niewielki (ok. 600 Mpz) i w najbliższym czasie zsekwencjonowany
genom jądrowy oraz dobrze poznane tło filogenetyczne. Wymienione cechy, w połączeniu
z szybko i stale się powiększającą się bazą zasobów i narzędzi badawczych, stwarzają
w przypadku tego gatunku niezwykle atrakcyjną platformę eksperymentalną, umożliwiającą
nie tylko złożone analizy z zakresu cytogenetyki molekularnej, ale także w różnych innych
obszarach biologii. B. hybridum charakteryzuje się pełną płodnością, a obecność
15 biwalentów w trakcie metafazy I i regularny przebieg mejozy sugerują wyłącznie parowanie
chromosomów homologicznych.
W wymiarze badań podstawowych, proponowany projekt jest ważny dla lepszego
poznania procesów odpowiedzialnych za stabilność genetyczną allopoliploidów. Odkrycie
u innych allopoliploidalnych traw zarówno mechanizmów podobnych, jak i odmiennych od
występującego u pszenicy będzie miało istotne znaczenie dla bardziej dogłębnego zrozumienia
funkcjonalnych ograniczeń ewolucji mechanizmów stabilizujących roślinny genom jądrowy.
W dalszej perspektywie może to mieć także pewne przełożenie praktyczne w sensie
możliwości opracowywania lepszych strategii i narzędzi sztucznego otrzymywania nowych
mieszańców oraz ulepszania gatunków już istniejących (np. pszenica, owies) poprzez
introgresję pożądanych cech z dzikich gatunków pokrewnych. Projekt ten pozwoli także na
opracowanie technologii i umiejętności umożliwiających w przyszłości kompleksową analizę
innych genów.
Składanie zgłoszeń: do 31 sierpnia 2015 r.
Osoby zainteresowane udziałem w realizacji projektu proszone są o przesłanie listu
motywacyjnego, CV oraz wszystkich załączników potwierdzających posiadanie wymaganych
kwalifikacji, a także dwóch listów referencyjnych wraz danymi kontaktowymi osób
udzielających kandydatowi rekomendacji na adres mailowy kierownika projektu prof. dr hab.
Roberta Hasterok: [email protected] w postaci zbiorczego pliku w formacie PDF.
Prosimy o zatytułowanie maila "Harmonia 2015 - postdoc", a także o umieszczenie w jego
treści następującej informacji:
"Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w zgłoszeniu dla
potrzeb rekrutacji, zgodnie z ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 roku o ochronie danych
osobowych. (Dz. U. z 2002 r. Nr 101, poz. 926 z późn. zm.)"
Brak jednoznacznie wyrażonej zgody na przetwarzanie danych osobowych spowoduje, że
Państwa zgłoszenie nie zostanie uwzględnione w dalszych etapach procedury rekrutacyjnej.
Osoby zakwalifikowane do dalszych etapów rekrutacji, zostaną drogą e-mailową zaproszone
na rozmowę kwalifikacyjną w języku angielskim, połączoną z wygłoszeniem 20 minutowego
referatu prezentującego dotychczasowy profil badań kandydata.
Zapraszamy do składania zgłoszeń. Jednocześnie zastrzegamy sobie prawo do odpowiedzi
jedynie na wybrane zgłoszenia. Terminy rozmów kwalifikacyjnych zostaną podane
wybranym kandydatom indywidualnie
Katowice; dnia ……………………….
………………………………………….
/imię i nazwisko/
………………………………………….
………………………………………….
/adres zamieszkania/
OŚWIADCZENIE
Niniejszym oświadczam, iż spełniam warunki określone w art. 109 ust. 1 ustawy z dnia 27 lipca
2005 r. – Prawo o szkolnictwie wyższym (Dz. U. Nr 164, poz. 1365 ze zm.) dotyczące wymagań
ustawowych dla nauczyciela akademickiego, a mianowicie:
1)
2)
3)
4)
mam pełną zdolność do czynności prawnych;
nie zostałem/am ukarany/a prawomocnym wyrokiem sądowym za przestępstwo umyślne;
nie zostałem/am ukarany/a karą dyscyplinarną wymienioną w art. 140 ust. 1 pkt 4;
korzystam z pełni praw publicznych
………………………………………………….
/podpis osoby składającej oświadczenie/
The Dean of the Faculty of Biology and Environmental Protection, University
of Silesia in Katowice, Poland announces an open call for a postdoctoral
researcher in the project “CDKG/Ph1: is there a common process that
regulates genomic stability in grasses?”
+ Place: University of Silesia in Katowice, Faculty of Biology and Environmental Protection,
Department of Plant Anatomy and Cytology, Katowice, Poland
+ Call opens: June 2015
+ Deadline for applications: 31 August 2015
+ Project type: HARMONIA international research project funded by the Polish National
Science
Centre
(http://www.ncn.gov.pl/finansowanienauki/konkursy/typy/4?language=en)
+ Length of employment: up to 30 months, starting in November 2015
+ Conditions: Contract of employment, full time (the first contract will be signed for a
probation period of one academic year (until 30 September 2016). If the probation period
is successful, next contract will be signed until the end of the project (May 2018)
+ Gross salary: 8 500 PLN/month (including employer contributions and benefits)
Qualifications and criteria:
+ A PhD or equivalent experience in biological sciences (essential criterion)
+ Experience in molecular biology/molecular genetics or related discipline and knowledge of
a diversity of genetic engineering approaches (essential criterion)
+ Demonstrable experience in generating and analysing mutants in plants, in particular using
RNAi and recent genome editing technologies, like CRISPR/Cas or ability to articulate the
willingness to acquire such expertise (essential criterion)
+ Proficiency in routine molecular biology techniques (cloning, real-time PCR, etc.) (essential
criterion)
+ Effective operational proficiency in English (will be verified by international recruiting panel
during the interview; essential criterion)
+ Mobility – this is an international research collaboration project with Aberystwyth
University, UK at which some of the research will be conducted by the appointee (essential
criterion)
+ Ability to work independently, formulate and test research hypotheses, plan and conduct
experiments, prepare formal reports and presentations (essential criterion)
+ Motivation and enthusiasm to undertake challenging research work, and a willingness to
further scientific development (essential criterion)
+ Research experience documented by recent, high quality publications in a relevant area
and conference papers with particular attention to oral presentations given in person,
fellowships and research visits abroad (desirable criterion)
Project description:
Nuclear genome integrity is a key prerequisite for the evolutionary success of any eukaryote.
In plants, which often are allopolyploids, it is particularly important in terms of maintaining
correct pairing and recombination of homologues and suppressing pairing of homoeologues
which could have a deleterious effect on meiosis and fertility. In common bread wheat, the
restriction of recombination to homologues only is controlled by a single dominant locus (Ph1)
which contains several copies of cyclin-dependent kinase-like (CDK) genes that are both
structurally and functionally related to the phylogenetically conserved CDKG/CDK11 class.
Since CDKG was recently found to be involved into chromosome pairing in Arabidopsis, the
strong suggestion is that the structurally related Ph1 kinase modulates this process in grasses,
and thereby promotes genome stability.
The aim of this project is to determine whether or not grasses have a genome
stabilisation mechanism based upon the activity of these CDKs. In order to answer this
question, the relatively simple and tractable allotetraploid species Brachypodium hybridum
(2n=30) has been chosen as a comparator. It has numerous ‘model’ attributes, such as a very
small (~600 Mb), sequenced nuclear genome, well-studied phylogeny identifying its putative
evolutionary ancestors, and an ever-growing repertoire of experimental resources providing
unique opportunities to address many novel and important areas of molecular cytogenetics
and biology. It is a fully fertile allotetraploid with 15 bivalents at metaphase I. Such regularity
implies that this species suppresses homoeologous pairing and recombination to maintain its
diploid-like status.
In terms of the fundamental research, comprehending the basis of such control is
important for our better understanding of the processes that govern genetic stability in
allopolyploids as they are a key source of evolutionary innovation. The discovery of similar or
different mechanisms in other grass allopolyploids would have important implications in
terms of our understanding of the functional constraints upon the evolution of genome
stabilising mechanisms, and in informing our strategies for exploiting and stabilising new
polyploids. In the long-term, it may also have some practical impact for the creation of novel
and stable interspecific and intergeneric hybrids in advanced breeding programmes, and the
genetic improvement of crops such as wheat and oats through introgression from wild
relatives. The project will also allow us to develop the technology and skills to address the role
of other genes, such as the Brachypodium Ph1-like kinases (a much larger multi-gene family),
in future projects.
How to apply: (deadline 31 August 2015)
Applications consisting of a supporting statement, CV, scan of PhD certificate, publication list
and two reference letters (the principal investigator may contact those providing a reference
to obtain more detailed information concerning the applicants) should be sent by email to
Professor Robert Hasterok ([email protected]) as a single PDF file with the title
‘’HARMONIA 2015 – postdoc”. In the email body please include the following statement,
which is formally required to process your application:
“I hereby agree for processing my personal data, included in my job offer, for the purpose of
recruitment (as defined in the Act of August 29, 1997 on the Protection of Personal Data
(Journal of Laws of 2002, No. 101, item 926, with amendments).
Shortlisted candidates will receive by email an invitation for an interview. The interview will
include a 20 minute presentation by the candidates of their research interests, academic
records and past projects, and the skills they would bring to this project.
We invite candidates to apply but reserve the right to reply only to shortlisted candidates,
who will receive individually the dates of interviews