Generate PDF of this page

Nazwa modułu:
Rok akademicki:
Wydział:
Kierunek:
Techniki obrazowania medycznego
2015/2016
Kod: EME-1-606-s
Punkty ECTS:
3
Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej
Mikroelektronika w technice i medycynie
Poziom studiów:
Studia I stopnia
Język wykładowy: Polski
Profil kształcenia:
Specjalność:
Forma i tryb studiów:
Ogólnoakademicki (A)
Semestr: 6
Strona www:
Osoba odpowiedzialna:
dr inż. Skalski Andrzej ([email protected])
Osoby prowadzące: dr inż. Skalski Andrzej ([email protected])
dr inż. Socha Mirosław ([email protected])
Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć
Kod EKM
Student, który zaliczył moduł zajęć
wie/umie/potrafi
Powiązania z EKK
Sposób weryfikacji
efektów kształcenia
(forma zaliczeń)
M_W001
Potrafi omówić i przedstawić właściwości oraz
różnice występujące w technikach obrazowania
medycznego
ME1A_W14
Kolokwium
M_W002
Ma poszerzoną i uporządkowaną wiedzę
teoretyczną z zakresu algorytmów segmentacji
oraz dopasowywania obrazów cyfrowych.
ME1A_W14
Kolokwium
M_W003
Posiada szczegółową wiedzę dotyczącą doboru
algorytmów przetwarzania i analizy obrazów
umożliwiającą zaproponowanie rozwiązania
konkretnego zadania problemowego z
wykorzystaniem informacji obrazowej.
ME1A_W14
Kolokwium
Potrafi pozyskiwać informacje z specjalistycznej
literatury technicznej, którą umie
zinterpretować i wykorzystać do budowy
algorytmu rozwiązującego problem z zakresu
przetwarzania i analizy obrazów.
ME1A_U01
Aktywność na zajęciach,
Prezentacja
Wiedza
Umiejętności
M_U001
1 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
M_U002
Ma przygotowanie do projektowania, walidacji
oraz porównywania rozwiązań konkretnych
zadań z zakresu przetwarzania i analizy
obrazów.
ME1A_U01,
ME1A_U02,
ME1A_U03
Aktywność na zajęciach,
Prezentacja
M_U003
Potrafi zaimplementować wybrane algorytmy
przetwarzania i analizy obrazów w środowisku
Matlab.
ME1A_U10,
ME1A_U16
Aktywność na zajęciach,
Wykonanie ćwiczeń
laboratoryjnych
ME1A_K02,
ME1A_K03
Prezentacja
Kompetencje społeczne
M_K004
Umie przygotować prezentację oraz
dokumentację rozwiązania zadania
problemowego, którą potrafi przedstawić w
sposób zrozumiały i przystępny.
Matryca efektów kształcenia w odniesieniu do form zajęć
Konwersatori
um
Zajęcia
seminaryjne
Zajęcia
praktyczne
Zajęcia
terenowe
Zajęcia
warsztatowe
Potrafi omówić i przedstawić
właściwości oraz różnice
występujące w technikach
obrazowania medycznego
+
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
M_W002
Ma poszerzoną i
uporządkowaną wiedzę
teoretyczną z zakresu
algorytmów segmentacji oraz
dopasowywania obrazów
cyfrowych.
+
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
M_W003
Posiada szczegółową wiedzę
dotyczącą doboru algorytmów
przetwarzania i analizy
obrazów umożliwiającą
zaproponowanie rozwiązania
konkretnego zadania
problemowego z
wykorzystaniem informacji
obrazowej.
+
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Potrafi pozyskiwać informacje
z specjalistycznej literatury
technicznej, którą umie
zinterpretować i wykorzystać
do budowy algorytmu
rozwiązującego problem z
zakresu przetwarzania i
analizy obrazów.
-
-
+
-
-
-
-
-
-
-
-
E-learning
Ćwiczenia
projektowe
M_W001
Inne
Ćwiczenia
laboratoryjne
Forma zajęć
Ćwiczenia
audytoryjne
Student, który zaliczył moduł
zajęć wie/umie/potrafi
Wykład
Kod EKM
Wiedza
Umiejętności
M_U001
2 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
M_U002
Ma przygotowanie do
projektowania, walidacji oraz
porównywania rozwiązań
konkretnych zadań z zakresu
przetwarzania i analizy
obrazów.
-
-
+
-
-
-
-
-
-
-
-
M_U003
Potrafi zaimplementować
wybrane algorytmy
przetwarzania i analizy
obrazów w środowisku
Matlab.
-
-
+
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
+
-
-
-
-
-
-
-
-
Kompetencje społeczne
M_K004
Umie przygotować
prezentację oraz
dokumentację rozwiązania
zadania problemowego, którą
potrafi przedstawić w sposób
zrozumiały i przystępny.
Treść modułu zajęć (program wykładów i pozostałych zajęć)
Wykład
Podstawy obrazowania medycznego (10h)
•
•
•
•
•
•
•
metody RTG, tomografia komputerowa,
rezonans magnetyczny,
metody ultrasonograficzne,
pozytonowa tomografia emisyjna (PET),
metody endoskopowe,
koherentna tomografia optyczna (OCT),
ogólnodostępne medyczne bazy obrazów cyfrowych.
Podstawy przetwarzania obrazów medycznych (4h)
•
•
•
•
filtracja liniowa i nieliniowa,
wyznaczanie gradientu i histogramu obrazu,
wykrywanie krawędzi (Canny Edge Detector),
operacje morfologiczne (erozja, dylatacja, otwarcie, zamknięcie).
Podstawowe algorytmy segmentacji obrazów (4h)
• progowanie, automatyczne metody wyznaczania progu,
• metody rozrostu obszarów,
• transformacja wododziałowa.
Segmentacja obrazów oparta o modele fizyczne - (2h)
• funkcje sklejane,
• metody aktywnych konturów, deformowalne modele.
Metody globalnego i lokalnego dopasowania obrazów - (4h)
•
•
•
•
•
•
miary podobieństwa,
interpolacja w zastosowaniu do przetwarzania obrazów,
idea dopasowania obrazów,
transformacja sztywna, afiniczna,
rodzina metod Demon,
dopasowanie obrazów z wykorzystaniem funkcji B-sklejanych.
3 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
Wykrywanie obiektów w obrazach - (4h)
•
•
•
•
•
cechy dobrego detektora,
momenty geometryczne,
transformacja Hougha,
detektor Harrisa,
deskryptory Fouriera.
Przykłady systemów przetwarzania i analizy obrazów z zastosowaniem metod omawianych w ramach
wykładu - (2h)
• rozpoznawanie zmian patologicznych,
• automatyczne śledzenie obiektów (np. złotych znaczników w zmiany nowotworowe
w projekcjach CBCT),
• segmentacja struktur anatomicznych z danych CT,
• wspomaganie procesu planowania leczenia oraz pozycjonowania pacjenta w
radioterapii,
• wirtualne zabiegi endoskopowe.
Kolokwium - 1h
Ćwiczenia laboratoryjne
Podstawy tworzenia i implementacji algorytmów przetwarzania wstępnego obrazów - 6h
Implementacja podstawowych operacji na obrazie:
• operacje I/O,
• filtracja,
• wyznaczanie gradientu,
• wyznaczanie i wyrównanie histogramu,
• okienkowanie danych medycznych.
Podstawowe algorytmy segmatacji - 10h
• progowanie,
• implementacja algorytmu rozrostu obszaru,
• implementacja metody aktywnych konturów.
Implementacja algorytmu dopasowania obrazów w oparciu o transformację afiniczną - 2h
Rozwiązanie indywidualnego zadania problemowego dotyczącego przetwarzania i analizy obrazów z
pomocą prowadzącego - 8h
Prezentacja rozwiązań zadań problemowych przez studentów - 2h
Sposób obliczania oceny końcowej
Średnia ważona:
• Ocena rozwiązania zadania problemowego – 50%;
• Kolokwium na wykładzie – 40%;
• Aktywność na zajęciach – 10%.
Ocena wystawiana zgodnie z regulaminem studiów AGH.
Wymagania wstępne i dodatkowe
1. Znajomość zagadnień związanych z przetwarzaniem sygnałów
2. Podstawowe umiejętności programistyczne
Zalecana literatura i pomoce naukowe
1. R. C. Gonzalez, R. E. Woods: “Digital Image Processing”. Prentice Hall; 3 ed., 2007
4 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
2. R. C. Gonzalez, R. E. Woods, S. L. Eddins: “Digital Image Processing Using MATLAB”. Prentice Hall;
2003
3. J. L. Semmlow: “Biosignal and Medical Image Processing: MATLAB-Based Applications”. CRC, 2004
4. Z. Wróbel, R. Koprowski: „Praktyka przetwarzania obrazów w programie Matlab”. Akademicka
Oficyna Wydawnicza EXIT, Warszawa, 2004
5. R. Tadeusiewicz, P. Korohoda: „Komputerowa analiza i przetwarzanie obrazów”. Wydawnictwo
Fundacji
Postępu Telekomunikacji, Kraków, 1997
6. Wybrane artykuły np. z: Medical Image Analysis, IEEE Transactions on Medical Imaging, IEEE EMB.
Publikacje naukowe osób prowadzących zajęcia związane z tematyką modułu
1. Prostate segmentation in CT data using active shape model built by HoG and non-rigid Iterative
Closest Point registration. Skalski, A., Kos, A., Zielinski, T., Kedzierawski, P., & Kukolowicz, P. In Imaging
Systems and Techniques (IST), 2015 IEEE International Conference on (pp. 1-5). IEEE. (2015,
September)
2. Zastosowanie metody zbiorów poziomicowych do wyodrębniania struktur naczyniowych w obrębie
nerki w celu minimalizacji inwazyjności zabiegów onkologicznych — The application of the level set
method to extract vascular structures in the kidneys in order to minimize invasiveness of oncological
surgeries / Katarzyna BUGAJSKA, Andrzej SKALSKI, Tomasz Drewniak, Janusz GAJDA // Przegląd
Elektrotechniczny = Electrical Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich ; ISSN 0033-2097. — 2015
R. 91 nr 5, s. 68–71. — Bibliogr. s. 71, Streszcz., Abstr.
3. Wpływ długości fonacji na ilość informacji zawartej w sygnale głosu ludzkiego — The effect of
phonation time on the amount of information contained in the signal / Daria PANEK, Andrzej SKALSKI,
Janusz GAJDA // Przegląd Elektrotechniczny = Electrical Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich ;
ISSN 0033-2097. — 2015 R. 91 nr 5, S. 57–59. — Bibliogr. s. 59, Streszcz., Abstr.
4. Voice pathology detection by fuzzy logic / Daria PANEK, Andrzej SKALSKI, Janusz GAJDA // W:
$I^{2}MTC$ [Dokument elektroniczny] : 2015 IEEE international Instrumentation and Measurement
Technology Conference : May 11–14, 2015, Pisa, Italy : proceedings / IEEE. — Wersja do Windows. —
Dane tekstowe. — Piscataway : IEEE, cop. 2015. — Dysk Flash. — e-ISBN: 978-1-4799-6113-9. — S.
289–293. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 292–293, Abstr.. — Toż w:
http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp==7151281
5.
Modyfikacja algorytmu aktywnych modeli kształtu eliminująca wpływ anizotropii danych
tomograficznych A modified ASM algorithm, that considers a CT and MRI medical data anisotropy at the
stage of statistic shape model generation / Artur KOS, Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI // Przegląd
Elektrotechniczny = Electrical Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich; ISSN0033-2097. 2015 R.91
nr5, s.41–44. Bibliogr. s.44, Streszcz., Abstr.
6. Automatyczna generacja cech z wykorzystaniem anizotropowego trójwymiarowego algorytmu SIFT
dla potrzeb segmentacji danych pochodzących z Tomografii Komputerowej Automatic features
generation based on 3D anisotropic SIFT for Computed Tomography data segmentation / Andrzej
SKALSKI, Agnieszka Szczotka, Piotr Kędzierawski, Tomasz Kuszewski, Paweł Kukołowicz // Przegląd
Elektrotechniczny = Electrical Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich; ISSN0033-2097. 2015 R.91
nr5, s.25–28. Bibliogr. s.28, Streszcz., Abstr.
7. Analiza ruchu strun głosowych w oparciu o wysokoczęstotliwościowe endoskopowe zapisy video
[Motion analysis of vocal folds based on high-speed videoendoscopy] / D.PANEK, A.SKALSKI, J.GAJDA,
T.ZIELIŃSKI, D. D.Deliyski // W: Imiędzynarodowa konferencja naukowa Nauka wtechnice, środowisku,
medycynie isporcie ; XIogólnopolska konferencja Problemy naukowo-techniczne wwyczynowym sporcie
żeglarskim : 6–16 maja 2015, Włochy, Palermo – Civitavecchia / red.nauk.Jerzy Wiciak. [Polska] : PROMADE, 2015. ISBN:978-83-61402-36-7. S.55–56. Bibliogr. s.56
8. Wizualizacja multimodalnych danych PET-CT Multimodal PET-CT data visualization / Mirosław SOCHA,
Andrzej SKALSKI // Przegląd Elektrotechniczny = Electrical Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich;
ISSN0033-2097. 2014 R.90 nr5, s.164–167. Bibliogr. s.167, Streszcz., Abstr.
9. Szybkie, wstępne wyznaczanie płaszczyzny symetrii głowy na podstawie obrazów pochodzących z
tomografii komputerowej A method of the fast, initial coarse brain symmetry plane calculation / Artur
KOS, Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI // Przegląd Elektrotechniczny = Electrical Review /
Stowarzyszenie Elektryków Polskich; ISSN0033-2097. 2014 R.90 nr5, s.110–113. Bibliogr. s.113,
Streszcz., Abstr.
10. Quantification of linear and non-linear acoustic analysis applied to voice pathology detection /
Daria PANEK, Andrzej SKALSKI, Janusz GAJDA // W: Information technologies in biomedicine, Vol.4 /
eds.Ewa Piętka, Jacek Kawa, Wojciech Więcławek. Cham [etc.] : Springer International Publishing,
cop.2014. (Advances in Intelligent Systems and Computing; ISSN2194-5357; vol.284). ISBN:978-3-31906595-3; e-ISBN:978-3-319-06596-0. S.355–364. Bibliogr. s.363–364, Abstr.
11. Dopasowanie chmur punktów do powierzchni dla potrzeb przetwarzania i analizy obrazów
5 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
medycznych oraz systemów wizyjnych Point clouds matching for medical image processing, analysis
and vision systems / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA // Przegląd Elektrotechniczny = Electrical
Review / Stowarzyszenie Elektryków Polskich; ISSN0033-2097. 2014 R.90 nr5, s.160–163. Bibliogr.
s.163, Streszcz., Abstr.
12. CT Segmentation based on MRI images in context of prostate radiotherapy planning / Andrzej
SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI, Piotr Kędzierawski, Tomasz Kuszewski // W: IST2013 [Dokument
elektroniczny] : 2013 IEEE international conference on Imaging Systems and Techniques : October
22–23, 2013, Beijing : proceedings. Wersja do Windows. Dane tekstowe. [Piscataway : IEEE], cop.2013.
e-ISBN:978-1-4673-5790-6. S.169–173. Wymagania systemowe: Adobe Reader. Tryb dostępu:
http://ist.ieee-ims.org/IST2013_Proceedings.zip [2013-11-21]. Bibliogr. s.173, Abstr.. W bazie Web of
Science ISBN: 978-1-4673-5791-3 oraz inna kolejność nazwisk autorów: Andrzej SKALSKI, Piotr
Kędzierawski, Tomasz ZIELIŃSKI, Tomasz Kuszewski
13. Automatic prostate segmentation in MR images based on 3D active contours with shape
constraints / Andrzej SKALSKI, Jakub Łągwa, Tomasz ZIELIŃSKI, Piotr Kedzierawski, Tomasz Kuszewski //
W: SPA2013 : Signal Processing : Algorithms, Architectures, Arrangements, and Applications : Poznań,
26–28\textsuperscript{th} September 2013 : conference proceedings / IEEE The Institute of Electrical
and Electronics Engineers Inc. Region 8 – Europe, Middle East and Africa. Poland Section. Chapters
Signal Processing, Circuits and Systems, Poznań University of Technology. Faculty of Computing. Chair of
Control and System Engineering. Division of Signal Processing and Electronic Systems. Poznań : PUT,
[2013]. ISBN:978-83-62065-15-8. S.246–249. Bibliogr. s.249, Abstr.
14. Aplikacja do projektowania indywidualnego narzędzia prowadzącego do kapoplastyki stawu
biodrowego An application for design of individual guiding tool for hip resurfacing / Mirosław ŻOŁĄDŻ,
Andrzej SKALSKI, Arkadiusz Śmigielski, Mirosław SOCHA // Pomiary, Automatyka, Kontrola /
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie Stowarzyszenie
Pomiarów Automatyki i Robotyki POLSPAR; ISSN0032-4140. 2013 vol.59 nr3, s.223–226. Bibliogr. s.226,
Streszcz., Abstr.
15. Analiza kształtu struktur anatomicznych jamy brzusznej dla potrzeb radioterapii nowotworu
prostaty Shape analysis of abdominal structures for prostate radiotherapy process / Andrzej SKALSKI,
Jakub Łągwa, Piotr Kędziarawski, Paweł Kukołowicz // Pomiary, Automatyka, Kontrola / Stowarzyszenie
Inżynierów i Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie Stowarzyszenie Pomiarów
Automatyki i Robotyki POLSPAR; ISSN0032-4140. 2013 vol.59 nr3, s.254–257. Bibliogr. s.257, Streszcz.,
Abstr.
16. Using ASM in CT data segmentation for prostate radiotherapy / Andrzej SKALSKI, Artur KOS, Tomasz
ZIELIŃSKI // W: Computer Vision and Graphics : International Conference, ICCVG2012 : Warsaw, Poland,
September 24–26, 2012 : proceedings / eds. Leonard Bolc [etal.]. Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag,
cop.2012. (Lecture Notes in Computer Science; ISSN0302-9743; 7594). W bazie Web of Science
ISBN978-3-642-33564-8. ISBN:978-3-642-33563-1. S.610–617. Bibliogr. s.616–617, Abstr.
17. Modelowanie struktur anatomicznych dla potrzeb planowania leczenia w procesie radioterapii
nowotworu prostaty Anatomical structure modelling for treatment planning in prostate cancer
radiotherapy process / Andrzej SKALSKI // Pomiary, Automatyka, Kontrola / Stowarzyszenie Inżynierów i
Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie Stowarzyszenie Pomiarów Automatyki i
Robotyki POLSPAR; ISSN0032-4140. 2012 vol.58 nr4, s.372–375. Bibliogr.375, Streszcz., Abstr.
18. Comparison of ASM and AAM-based segmentation of prostate image in the CT scans for
radiotherapy planning / Artur KOS, Tomasz ZIELIŃSKI, Andrzej SKALSKI, Paweł Kukolowicz, Piotr
Kedzierawski, Tomasz Kuszewski // W: NTAV/SPA2012 : New Trends in Audio and Video Signal Processing
Algorithms, Architectures, Arrangements and Applications : Łódź, 27–29 September 2012 : conference
proceedings / Audio Engineering Society, IEEE, PTETIS. Lodz : Lodz University of Technology Press,
[2012]. Na okł. dodatkowo: Proceedings of the joint conference: NTAV/SPA2012. ISBN:978-83-7283-5024. S.53–57. Bibliogr. s.57, Abstr.
19.
Automatic tracking of implanted fiducial markers in cone beam CT projection images /
T. E.Marchant, A.SKALSKI, B. J.Matuszewski // Medical Physics; ISSN0094-2405. 2012 vol.39 no.3,
s.1322–1334. Bibliogr. s.1333–1334
20. Aplikacja wspierająca proces konturowania organów wdanych medycznych. A software application
supporting segmentation process for medical data / Edyta Flis, Mirosław SOCHA, Andrzej SKALSKI //
Pomiary, Automatyka, Kontrola / Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich. Sekcja
Metrologii, Polskie Stowarzyszenie Pomiarów Automatyki i Robotyki POLSPAR; ISSN0032-4140. 2012
vol.58 nr4, s.323–326. Bibliogr. s.326, Streszcz., Abstr.
21. Wizyjny system weryfikacji metod przezskórnej stymulacji nerwów Vision system for verification of
transcutaneous electrical nerve stimulation methods / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Łukasz
Malicki, Barbara Kaczmarska // W: Modelowanie iPomiary wMedycynie MPM2011 : materiały X
jubileuszowego sympozjum : Krynica, 8–12 maja 2011 = Modelling and Measurements in Medicine / pod
red. Janusza Gajdy ; Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica wKrakowie. Wydział
Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki iElektroniki. Katedra Metrologii, Instytut Biocybernetyki
6 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
iInżynierii Biomedycznej PAN wWarszawie. Kraków : Wydawnictwo KM AGH, 2011. Opis częśc. wg okł..
ISBN:978-83-61528-24-1. S.135–138. Bibliogr. s.138, Streszcz., Abstr.
22. Vision based evaluation of EMS rehabilitation process efficiency / IWANIECM., MALICKIŁ., HOLEWAK.,
SKALSKIA., SOCHAM. // W: Modern achievements of science and education : monograph =
Sovremennye dostiženiâ vnauke iobrazovanii / eds. BogorošA.T., [et al.]. Hmel’nickij : HNU, 2011.
ISBN:978-966-330-126-6. S.133–136. Bibliogr. s.135–136, Abstr.
23. Virtual colonoscopy – technical aspects / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Tomasz ZIELIŃSKI,
Mariusz Duplaga // W: Colonoscopy / ed.Paul Miskovitz. Rijeka : InTech, 2011. ISBN:978-953-307-568-6.
S.271–290. Bibliogr. s.286–290
24. The motion capture system to conduct an electrical muscle stimulation experiment on upper limb
movement / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Łukasz MALICKI, Marek IWANIEC // Bio-Algorithms and
Med-Systems (Print) / Jagiellonian University. Medical College; ISSN1895-9091. 2011 vol.7 no.4, s.83–88.
Bibliogr. s.88, Abstr.
25. Radioterapia adaptacyjna (dostosowawcza) nowotworu gruczołu krokowego Adaptive radiotherapy
of prostate cancer / Paweł Kukołowicz, Maria Piziorska, Piotr Kędzierawski, Andrzej SKALSKI, Tomasz
ZIELIŃSKI // W: Modelowanie iPomiary wMedycynie MPM2011 : materiały X jubileuszowego sympozjum :
Krynica, 8–12 maja 2011 = Modelling and Measurements in Medicine / pod red. Janusza Gajdy ;
Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica wKrakowie. Wydział Elektrotechniki, Automatyki,
Informatyki iElektroniki. Katedra Metrologii, Instytut Biocybernetyki iInżynierii Biomedycznej PAN
wWarszawie. Kraków : Wydawnictwo KM AGH, 2011. Opis częśc. wg okł.. ISBN:978-83-61528-24-1.
S.13–18. Bibliogr. s.17–18, Streszcz., Abstr.
26.
Heart segmentation in echo images / Andrzej SKALSKI, Paweł TURCZA // Metrology and
Measurement Systems: quarterly of Polish Academy of Sciences; ISSN2080-9050. ISSN:0860-8229.
2011 vol.18 no.2, s.305–314. Bibliogr. s.314, Abstr.
27. Computer Tomography-based raditherapy planning on the example of prostate cancer: application
of level-set segmentation method guided by atlas-type knowledge / Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI,
Paweł Kukołowicz, Piotr Kędzierawski // W: COGART ; ISABEL [Dokument elektroniczny] : 4th
international symposium on Applied sciences in biomedical and communication technologies : Smart
enablers of communication and biomedical technologies supporting post-disaster aftermath :
Barcelona, 26–29 October 2011. Wersja do Windows. Dane tekstowe. [Spain : s.n.], [2011]. 1dysk Flash.
S.[1–5]. Wymagania systemowe: Adobe Acrobat Reader ; napęd CD-ROM. Bibliogr. s.[5],
28. Automatyczny algorytm wyodrębniania głów kości udowych wzapisach tomograficznych dla potrzeb
radioterapii Automatic segmentation technique of femoral heads from the CT data for radiotherapy /
Andrzej SKALSKI, Piotr Kędzierawski, Paweł Kukołowicz, Tomasz ZIELIŃSKI, Tomasz Kuszewski // W:
Modelowanie iPomiary wMedycynie MPM2011 : materiały X jubileuszowego sympozjum : Krynica, 8–12
maja 2011 = Modelling and Measurements in Medicine / pod red. Janusza Gajdy ; Akademia GórniczoHutnicza im. Stanisława Staszica wKrakowie. Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki
iElektroniki. Katedra Metrologii, Instytut Biocybernetyki iInżynierii Biomedycznej PAN wWarszawie.
Kraków : Wydawnictwo KM AGH, 2011. Opis częśc. wg okł.. ISBN:978-83-61528-24-1. S.79–82. Bibliogr.
s.82, Streszcz., Abstr.
29. An application software for anatomical structures segmentation from tomographic data of
abdominal cavity / Grzegorz Toporek, Mirosław SOCHA, Andrzej SKALSKI // Bio-Algorithms and MedSystems (Print) / Jagiellonian University. Medical College; ISSN1895-9091. 2011 vol.7 no.4, s.95–99.
Bibliogr. s.98–99, Abstr.
30. Segmentacja serca w zapisach echokardiograficznych Heart segmentation in ECHO images /
Andrzej SKALSKI, Paweł TURCZA // W: KM2010 : VKongres Metrologii : Łódź, 6–8 września 2010 :
materiały / oprac. red.Krzysztof Gniotek, Zygmunt Kuśmierek. Łódź : Politechnika Łódzka, 2010.
S.278–279. Bibliogr. s.279, Streszcz., Abstr.. Pełny tekst W: VKongres Metrologii [Dokument
elektroniczny] : Łódź, 6–8 września 2010 r. : materiały. — Wersja do Windows. — Dane Tekstowe /
Politechnika Łódzka. — [Łódź : PŁ, 2010]. — 1dysk optyczny. — S.[1–4]. — Wymagania systemowe:
Adobe Acrobat Reader ; napęd CD-ROM. — Bibliogr. s.[4], Streszcz., Abstr
31. Marker tracks post-processing for accurate fiducial marker position estimation in Cone Beam CT
projection images / Bogdan Matuszewski, Tom Marchant, Andrzej SKALSKI // W: VISIGRAPP2010
[Dokument elektroniczny] : 3\textsuperscript{rd} international joint conference on Computer vision,
imaging and computer graphics theory and applications : VISAPP – international conference on
Computer vision theory and applications ; IMAGAPP – international conference on Imaging theory and
applications ; GRAPP – international conference on Computer graphics theory and applications ; IVAPP –
international conference on Information visualization theoery and applications ; IMTA – Image Mining
Theory and Applications ; ECSMIO – Engineering and Computational Sciences for Medical Imaging in
Oncology : Angers, France 17–21 May, 2010 : proceedings. Wersja do Windows. Dane tekstowe. [S. l. :
s. n.], [2010]. 1dysk optyczny. S.522–529. Wymagania systemowe: Adobe Acrobat Reader ; napęd CDROM. Bibliogr. s.529, Abstr.. Publikacja zawarta w części VISAPP, Vol.1
32. Level set based automatic segmentation of ultrasound echocardiographic images Automatyczna
7 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
segmentacja echokardiogramów wykorzystująca metodę zbiorów poziomicowych / Andrzej SKALSKI,
Tomasz P.ZIELIŃSKI, Paweł TURCZA // Elektronika: konstrukcje, technologie, zastosowania (Warszawa);
ISSN0033-2089. Tytuł poprz.: Przegląd Elektroniki. 2010 R.51 nr3, s.80–84. Bibliogr. s.83–84, Streszcz.,
Summ.. tekst: http://www.sigma-not.pl/download.do?mode=spsid=50809
33. Left ventricle USG image segmentation using active contour model / A.SKALSKI, P.TURCZA,
T.ZIELIŃSKI, J.Królczyk, T.Grodzicki // Procedia Computer Science; ISSN1877-0509. 2010 vol.1 iss.1,
s.2717–2726. Bibliogr. s.2725–2726, Abstr.. ICCS2010 : International Conference on Computational
Science. — [S.l.] : Elsevier Ltd., cop.2010
34. Displacement calculation of heart walls in ECG sequences using level set segmentation and BSpline Free Form Deformations / Andrzej SKALSKI, Paweł TURCZA, Tomasz ZIELIŃSKI // W: Computer
Vision and Graphics : International Conference, ICCVG2010, Warsaw, Poland, September 20–22, 2010 :
proceedings, Pt.2 / eds. Leonard Bolc[etal.]. Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop.2010. (Lecture
Notes in Computer Science; ISSN0302-9743; LNCS6375)). ISBN:978-3-642-15906-0; ISBN10:3-64215906-0. S.268–275. Bibliogr. s.275, Abstr.
35. 3D segmentation and visualisation of mediastinal structures adjacent to tracheobronchial tree from
CT data / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Mariusz Duplaga, Krzysztof DUDA, Tomasz ZIELIŃSKI // W:
Information technologies in biomedicine, Vol.2 / eds.Ewa Piętka, Jacek Kawa. Berlin ; Heidelberg :
Springer-Verlag, cop.2010. (Advances in Intelligent and Soft Computing; ISSN1867-5662; 69). ISBN:9783-642-13104-2. S.523–534. Bibliogr. s.533–534, Abstr.
36. Algorytm wyznaczania ścieżki nawigacyjnej do automatycznego ruchu wirtualnej kamery w
strukturach anatomicznych — Algorithm of centre path tracing for virtual camera automatic movement
in anatomical structure / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Mariusz Duplaga // Pomiary, Automatyka,
Kontrola / Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie
Stowarzyszenie Pomiarów Automatyki i Robotyki POLSPAR ; ISSN 0032-4140. — 2007 vol. 53 nr 9bis s.
421–424.
37. Analysis of vocal folds movement in high speed videoendoscopy based on level set segementation
and image registration / Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI, Dimitar Deliyski // W: ICSES’2008 : ICSES
2008 international conference on Signals and electronic systems : September 14–17, 2008, Kraków,
Poland : conference proceedings / eds. Stanisław Kuta, Witold Machowski. — Kraków : Department of
Electronics, AGH University of Science and Technology, cop. 2008. — ISBN 978-83-88309-52-6. — S.
223–226. — Bibliogr. s. 226, Abstr. — Toż W: ICSES 2008 international conference on Signals and
electronic systems [Dokument elektroniczny] : Kraków, September 14–17, 2008. — Wersja do Windows.
— Dane tekstowe / eds. Stanisław Kuta, Witold Machowski. — Kraków : Department of Electronics, AGH
University of Science and Technology, cop. 2008. — 1 dysk optyczny. — ISBN 978-83-88309-52-6
38. Colon cleansing for virtual colonoscopy using non-linear transfer function and morphological
operations / A. SKALSKI, M. SOCHA, T. ZIELIŃSKI, M. Duplaga // W: Proceedings of the 2007 IEEE
international workshop on Imaging systems and techniques [Dokument elektroniczny] : 4–5 May 2007,
Krakow, Poland. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe / IEEE Instrumentation & Measurement
Society. — [S. l.] : IEEE, cop. 2007. — 1 dysk optyczny. — S. [1–5]. — Wymagania systemowe: Adobe
Acrobat Reader ; napęd CD-ROM. — Tyt. przejęto z ekranu tytułowego. — Bibliogr. s. [5], Abstr.
39. CT data processing and visualization aspects of virtual colonoscopy / Andrzej SKALSKI, Mirosław
SOCHA, Tomasz ZIELIŃSKI, Mariusz Duplaga // W: EUSIPCO 2007 [Dokument elektroniczny] : 15th
European signal processing conference : September 3–7, 2007, Poznań, Poland : proceedings. — Wersja
do Windows. — Dane tekstowe / eds. Marek Domański, Ryszard Stasiński, Maciej Bartkowiak ; European
Association for Signal Processing, Poznań University of Technology, PTETiS. Poznań Section. — [S. l.] :
EURASIP, cop. 2007. — 1 dysk optyczny. — Opis częśc. wg obwoluty. — ISBN: 978-83-921340-2-2. — S.
2509–2513. — Wymagania systemowe: Adobe Acrobat Reader ; napęd CD-ROM. — Tyt. przejęto z
ekranu tytułowego. — Bibliogr. s. 2513, Abstr.
40. Data processing tasks in wireless GI endoscopy: image-based capsule localization & navigation and
video compression, [Pt.] 1 / BUŁAT Jarosław, DUDA Krzysztof, Duplaga Mariusz, FRĄCZEK Rafał, SKALSKI
Andrzej, SOCHA Mirosław, TURCZA Paweł, ZIELIŃSKI Tomasz // W: EMBC 2007 : “sciences and
technologies for health” : 29th annual international conference of the IEEE Engineering in Medicine and
Biology Society ; the biennial conference of the French Society of Biological and Medical Engineering
(SFGBM) : August 23–26, 2007, Lyon, France : final program and abstract book / IEEE EMB, SFGBM. —
[Piscataway] : IEEE, cop. 2007. — (Conference proceedings / IEEE Engineering in Medicine and Biology
Society ; ISSN: 1557-170X). — ISBN: 1-4244-0788-5. — S. 359
41. Deformable image registration – a critical evaluation: Demons, B-spline FFD and spring mass
system / Jian-Kun Shen, Bogdan J. Matuszewski, Lik-Kwan Shark, Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI,
Chirstopher J. Moore // W: MediVis 2008 : fifth international conference BioMedical Visualization :
information visualization in medical and biomedical informatics : 9–11 July 2008 London, United
Kingdom : proceedings / eds. Chris Moore, [et al.]. — Piscataway : IEEE Computer Society, cop. 2008. —
ISBN 978-0-7695-3284-4. — S. 77–82. — Bibliogr. s. 82, Abstr.
42. Image and video processing tasks in computer aided medical interventions on the example of
8 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
transbronchial biopsy — Wybrane zagadnienia przetwarzania obrazów i sekwencji wideo w
zastosowaniu do komputerowego wspomagania zabiegów medycznych na przykładzie biopsji
przezoskrzelowej / Jarosław BUŁAT, Krzysztof DUDA, Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA, Paweł TURCZA,
Tomasz TWARDOWSKI, Tomasz ZIELIŃSKI, Mariusz Duplaga // W: ,,New trends in audio and video” : XI
symposium AES : September 20–22, 2006 Białystok, Poland : conference program : abstracts and
proceedings / ed. Jarosław Baszun ; Audio AES [etc.]. — [Białystok : Wydawnictwo Politechniki
Białostockiej, 2006]. — S. 34–42. — Bibliogr. s. 34–42. — Tekst ang.-pol.
43. Level set based automatic segmentation of ultrasound echocardiographic images / Andrzej
SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI, Paweł TURCZA // W: SPA 2009 : signal processing : algorithms,
architectures, arrangements, and applications : Poznań, 24–26th{} September 2009 : conference
proceedings / IEEE The Institute of Electrical and Electronics Engineers. Region 8 – Europe, Middle East
and Africa, Poland Section, Chapters Signal Processing, Circuits and Systems. — Poznań : University of
Technology, 2009 + CD-ROM. — ISBN-13 978-83-62065-00-4. — S. 52–56. — Bibliogr. s. 55–56, Abstr.
44. Porównanie metod dopasowywania obrazów w zastosowaniu do procedur radioterapii nowotworu
gruczołu krokowego — A survey of image registration methods in application to radiotherapy of
prostate cancer / Bartłomiej Papież, Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI, Paweł Kukołowicz // W:
Modelowanie i pomiary w medycynie = Modelling and measurements in medicine : materiały IX
sympozjum : Krynica, 10–14 maja 2009 / pod red. Janusza Gajdy ; Akademia Górniczo-Hutnicza im.
Stanisława Staszica w Krakowie. Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Elektroniki. Katedra
Metrologii, Instytut Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej PAN w Warszawie. — Kraków :
Wydawnictwo KM AGH, 2009. — Na s. tytułowej dodatkowo: Sympozjum organizowane w roku
Jubileuszu 90-lecia Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. — ISBN 978-8361528-08-1. — S. 161–166. — Bibliogr. s. 165–166, Streszcz., Abstr.
45. Przetwarzanie, analiza i wizualizacja danych medycznych — Processing, analysis and visualisation
of medical data / Andrzej SKALSKI, Mirosław SOCHA // W: Kierunki działalności i współpraca naukowa
Wydziału Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Elektroniki : materiały konferencji zorganizowanej z
okazji Jubileuszu 90-lecia AGH : Kraków, 28–29 maja 2009, ISBN 978-83-88309-87-8. — S. 225–226. .
46. Segmentacja i dopasowywanie cyfrowych obrazów medycznych: przetwarzanie nagrań wideoendoskopowych strun głosowych oraz danych tomograficznych zmian rakowych — Segmentation and
registration of digital medical images: processing endoscopic videos of vocal folds and tomographic
data of cancer changes / Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI // Pomiary, Automatyka, Kontrola /
Stowarzyszenie Inżynierów i Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie Stowarzyszenie
Pomiarów Automatyki i Robotyki POLSPAR ; ISSN 0032-4140. — 2008 nr 6 vol. 54 s. 330–333. — Bibliogr.
s. 333, Streszcz., Abstr.
47. The 3D watershed segmentation of CT medical data supported by statistical data analysis / Andrzej
SKALSKI, Mirosław SOCHA, Tomasz ZIELIŃSKI // W: ICSES’06 : International Conference on Signals and
Electronic Systems : September 17–20, 2006, Łódź, Poland : conference proceedings. Vol. 1 / eds.:
Michał Tadeusiewicz [et al.]. — Łódź : Technical University of Łódź. Institute of Circuit Theory, Metrology
and Materials Science, 2006. — S. 301–304. — Bibliogr. s. 304, Abstr.
48. Wybrane zagadnienia segmentacji węzłów chłonnych okolicy drzewa oskrzelowego w danych z
tomografii komputerowej — Chosen aspects of segmentation of respiratory system region lymphatic
nodes in CT data / Andrzej SKALSKI // Pomiary, Automatyka, Kontrola / Stowarzyszenie Inżynierów i
Techników Mechaników Polskich. Sekcja Metrologii, Polskie Stowarzyszenie Pomiarów Automatyki i
Robotyki POLSPAR ; ISSN 0032-4140. — 2006 [nr] 5bis wyd. spec. dodatkowe s. 133–138.
49. Zastosowanie algorytmu wododziałowego do segmentacji strun głosowych w endoskopowych
zapisach wideo — Application of Watershed algorithm to vocal folds segmentation in High Speed
Videoendoscopy / Andrzej SKALSKI, Tomasz ZIELIŃSKI // W: Modelowanie i pomiary w medycynie =
Modelling and measurements in medicine : materiały IX sympozjum : Krynica, 10–14 maja 2009, S.
149–152.
Informacje dodatkowe
Brak
9 / 10
Karta modułu - Techniki obrazowania medycznego
Nakład pracy studenta (bilans punktów ECTS)
Forma aktywności studenta
Obciążenie
studenta
Udział w wykładach
28 godz
Przygotowanie do zajęć
20 godz
Samodzielne studiowanie tematyki zajęć
10 godz
Udział w ćwiczeniach laboratoryjnych
28 godz
Sumaryczne obciążenie pracą studenta
86 godz
Punkty ECTS za moduł
3 ECTS
10 / 10