Wykrywanie czynników zakaźnych przy pomocy PCR

Wykrywanie czynników zakaźnych przy pomocy PCR

Wykrywanie czynników zakaźnych przy pomocy PCR
Metoda PCR wykorzystywana do wykrywania patogenów cechuje się bardzo wysoką
czułością połączoną ze stosunkowo krótkim czasem potrzebnym do wykonania badania
oraz niskimi wymaganiami odnośnie transportu próbek, gdyż metoda nie wymaga
zdolności namnażania się czynnika infekcyjnego. Z tych powodów metoda PCR coraz
częściej zastępuje klasyczne metody wykrywania drobnoustrojów.
W niniejszym opracowaniu znajdą Państwo informacje na temat aktualnego zakresu
rutynowego wykorzystywania metody PCR w diagnostyce chorób zakaźnych.
• Psy
Babesia canis oraz Babesia gibsoni
Babeszjoza u psów należy do najważniejszych chorób przenoszonych przez kleszcze.
Klinicznie istotne są tu dwa pasożyty: Babesia canis i Babesia gibsoni. PCR umożliwia
czułą i szybką diagnostykę tych patogenów.
Rodzaj materiału do badania: 1,0 ml krwi EDTA.
Borrelia burgdorferi
Dzięki szybkiemu wykryciu przenoszonej przez kleszcze drobnoustroju możliwe jest
uniknięcie ciężkich komplikacji tej infekcji.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA (tylko bezpośrednio po infekcji względnie przy
kardiomiopatii), kleszcz, 0,5 ml płynu stawowego, biopsja skóry, 0,5 ml płynu mózgowo
rdzeniowego
Campylobacter jejuni, Salmonella spp., Yersinia enterocolitica
Opracowana na nowo w naszym laboratorium metoda multiplex real-time PCR do
wykrywania jelitowych patogenów indukujących biegunki u psów, w szczególności
Salmonella spp., Yerisnia enterocolitica i Campylobacter jejuni, umożliwia już na drugi
dzień po nadejściu próbki powtwierdzenie względnie wykluczenie obecności w/w
patogenów w kale psów z biegunką. Test ten w porównaniu z tradycyjną bakteriolgią
cechuje wiele zalet, w tym przede wszystkim znacznie krótszy czas oczekiwania na wyniki
badania. Należy wysyłać swieżą próbkę kału. Po potwierdzeniu obecności patogenów
należy wykonać antybiogram.
Materiał do badania: kał (1g)
Coronawirus psów (CCV)
CCV oraz CPV są głównymi czynnikami etiologicznymi wirusowego zapalenie jelit u psów.
PCR umożliwia ich bardzo czułą i swoistą metodę wykrywania.
Materiał do badania: kał (1g)
Herpeswirus psów (CHV)
PCR umożliwia szybką i jednoznaczną diagnostykę, dzięki czemu możliwa jest szybka
izolacja zainfekowanych psów.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA lub 0,5 ml surowicy do 4 tygodni po infekcji, wymaz
z narządów płciowych lub migdałków, wątroba lub nerka martwych szczeniąt.
1
Parvowirus psów (CPV)
CPV należy do najważniejszych patogenów odpowiedzialnych za wirusowe zapalenie jelit
psów. Zakażenie prowadzi do biegunek, a sam wirus bardzo szybko przenoszony jest na
inne psy. PCR umożliwia swoistą i czułą metodę wykrywania wirusa.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA z fazy wiremicznej (1-5 dzień), kał.
Ehrlichia canis / Ehrlichia phagozytophila
Infekcje wywołane przez Ehrlichia spp. notowane są na całym świecie. Drobnoustroje te
należą do riketsji i są przenoszone przez kleszcze. W zależności od regionu gatunki
kleszczy są różne a wraz z tym rodzaj ehrlichiozy. Zakażenie Ehrlichia canis jest
klasycznym przykładem chorób podróżniczych, które pojawia się jako najczęstsze przy
sprowadzeniu zwierzęcia z zagranicy. Wykrywanie przy pomocy PCR obejmuje oba typy,
różnicowanie następuje w przypadku pozytywnego wyniku.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA, punktat szpiku kostnego, kleszcze.
Haemobartonella canis
Również u psów możliwe jest wykorzystanie metody PCR do czułego i swoistego
wykrywania tego patogenu.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA.
Leptospira spp.
Leptospiroza jest szeroko rozpowszechnioną bakteryjną chorobą zakaźną. Oprócz ostrej i
podostrej postaci notuje się często również postać przewlekłą, która zazwyczaj przebiega
bezobjawowo. Ponieważ leptospiry są dość wrażliwe metoda PCR bardzo dobrze nadaje
się do ich diagnostyki. PCR umożliwia szybką, czułą i swoistą diagnostykę siedmiu
patogennych serowarów.
Materiał do badania: nerka (0,2 g), mocz (ok. 5 ml).
Leishmania spp.
Wykrywanie pierwotniaków z rodzaju Leishmania z punktatu szpiku kostnego lub węzłów
chłonnych jest obecnie jedynym sensownym rodzajem kontroli terapii.
Materiał do badania: punktat szpiku kostnego lub węzłów chłonnych, biopsja skóry, wymaz
spojówkowy. Krew nie nadaje się do badania.
Neospora caninum
Wydalanie N. caninum w kale psa można bardzo czule i swoiście potwierdzić przy pomocy
PCR.
Materiał do badania: kał (1g)
Wirus nosówki
Wykrywanie wirusa przy pomocy PCR umożliwia postawienie jednoznacznej diagnozy
jeszcze przed serokonwersją.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA, 0,5 ml surowicy do 4 tygodni po infekcji, wymaz
(oko, gardło, nos), 0,5 ml płynu mózgowo rdzeniowego w nerwowej postaci nosówki.
Wirus szczepionkowy może być wykrywany we krwi przez 2 – 3 tygodnie od szczepienia.
Koszt badania PCR:
Koszt badania multiplex PCR u psów:
€ 23,00 (netto)
€ 38,- (netto)
Czas potrzebny do wykonania badania – 2 dni.
2
• Konie
Borrelia burgdorferi
Również u koni możliwe jest wykrywanie borelii przy pomocy PCR.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA (tylko bezpośrednio po infekcji), kleszcze, 0,5 ml
płynu stawowego, 0,5 ml płynu mózgowo rdzeniowego, biopsja skóry.
EHV 1 + 4
Jeśli występują ronienia lub schorzenia układu oddechowego, można przy pomocy PCR
jednoznacznie określić rolę herpeswirusów w tych procesach. Bezpośrednio po
szczepieniu z krwi izolowany jest również wirus szczepionkowy.
Materiał do badania: 0,5 ml krwi EDTA, wymaz z nosa lub dróg rodnych, poroniony płód.
Koszt badania PCR:
€ 23,00 (netto)
Czas potrzebny do wykonania badania – 2 dni
• Koty
Babesia spp.
B. canis i B. gibsoni mogą również zarażać koty. Przy pomocy PCR możliwe jest ich czułe
i swoiste wykrywanie.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA.
Bartonella henselae
Bartonella henselae jest najważniejszym czynnikiem etiologicznym choroby kociego
pazura(cat scratch disease, CSD). Choroba przenoszona jest przez ugryzienie lub
podrapanie zakażonego kota na człowieka. Możliwe wydaje się również przenoszenie
riketsji przez ślinę. U pacjentów z immunosupresją choroba może mieć przebieg z różnie
nasilonymi objawami. PCR jest czułą i swoistą metodą w diagnostyce Bartonella henselae.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA
Chlamydia spp.
Bardzo ważną diagnozą różnicową w zapaleniu spojówek u kotów jest infekcja
chlamydiami. W badaniach własnych 19 % podejrzanych próbek w badaniu antygenu były
pozytywne. Chlamydie są bezwzlędnymi pasożytami komórkowymi. Przy wymazach
spojówkowych należy wpierw usunąć wydzielinę, a następnie pobrać wymaz.
Materiał do badania: wymazówka (wymazówki nie wkładać do probówki z podłożem
transportowym dla chlamydii).
Coronawirus kotów
jako czynnik etiologiczny zakaźnego zapalenia otrzewnej (FIP). Stwierdzenie obecności
wirusa w płynie jamy brzusznej pomaga w postawieniu diagnozy. Zwierzęta bez
zamanifestowanych zmian klinicznych mogą zostać zidentyfikowane przez wykrycie wirusa
w kale.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA, 0,5 ml surowicy lub punktatu jamy brzusznej, kał.
3
Herpeswirus kotów typu 1 / Caliciwirus kotów
Metoda PCR umożliwia szybką i jednoznaczną informacje odnośnie tego, czy zapalenie
spojówek w ramach kataru kociego jest wywołane przez herpeswirus lub caliciwirus. PCR
umożliwia również potwierdzenie obecności FHV-1 jako czynnika etiologicznego keratitis.
Materiał do badania: wymaz (oko, nos), krew EDTA (1 ml).
Parvowirus kotów (FPV)
Panleukopenia kotów wywoływana jest przez mały, serologicznie jednorodny parvowirus,
który jest blisko spokrewniony z CPV. Wirus jest bardzo rozpowszechniony na świecie i
wszystkie wrażliwe koty zostają w pierwszym roku życia zainfekowane. PCR umożliwia
czułą i swoistą diagnostykę FPV.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA, kał, płyn mózgowo rdzeniowy.
Haemobartonella felis
Infekcje Haemobartonella felis u kotów występują na całym świecie. Haemobartonella felis
należy do rodziny Mycoplasmatacea, bakterii, które przyłączają się do powierzchni
erytrocytów. PCR umożliwia ich czułe i swoiste wykrywanie.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA.
Wirus białaczki kotów (FeLV)
Zakażenie wirusem białaczki kotów z jednej strony prowadzi do schorzeń, które są
wywoływane przez samego wirusa, z drugiej do wielu innych chorób towarzyszących,
które są skutkiem immunosupresji lub procesów immunopatologicznych.
Rodzaj możliwych konsekwencji infekcji FeLV to przede wszystkim zmiany nowotworowe.
W zależności od rodzaju zaatakowanych komórek wyróżniamy białaczkę limfatyczną oraz
szpikową. W 80 % przypadków białaczek limfatycznych może dojść z jednej strony do
powstania guza, z drugiej zaś do białaczki leukemicznej. W większości wypadków po
przejściowej infekcji dochodzi do eliminacji wirusa. W 10 – 15 % przypadków zakażeniu
ulegają komórki szpiku kostnego i w konsekwencji dochodzi do infekcji utajonej. U tych
zwierząt nie występuje już wiremia i w związku z tym wyniki badania krwi wychodzą
negatywne. PCR umożliwia czułe i swoiste wykrywanie przez badanie szpiku kostnego
latentnie zakażonych zwierząt. Do potwierdzenia pozytywnego wyniku serologicznego z
krwi można również wykonać badanie PCR.
Materiał do badania: 1,0 ml krwi EDTA, punktat szpiku kostnego.
Koszt badania PCR:
€ 23,00 (netto)
Czas potrzebny do wykonania badania – 2 dni
4
• świnie
Actinobacillus pleuropneumoniae (APP)
Actinobacillus pleuropneumoniae jest czynnikiem etiologicznym pleuropneumoni świń.
Przy pomocy metody PCR można teraz bezpośrednio wykryć również i ten drobnoustrój.
Metoda ta cechuje się wysoką czułością i swoistością.
Materiał do badania: tkanki (płuca, migdałki), wymaz z nosa.
Brachyspira spp.
Dyzynteria świń jest wysoko zakaźną chorobą biegunkową świń, która powoduje wysokie
straty ekonomiczne w produkcji świń. PCR umożliwia pewną i czułą metodę wykrywania
drobnoustroju. W związku z bardzo długim czasem potrzebnym do badania hodowlanego
PCR jest metodą z wyboru.
Materiał do badania: kał.
Chlamydia spp.
Dla świń spośród rodzaju Chlamydiacea istotne znaczenie mają gatunki: Chlamydia suis,
Chlamydophila abortus i Chlamydophila pecorum. Chlamydie u świń wywołują zmiany w
układzie oddechowym i rozrodczym. PCR umożliwia szybkie i pewne wykrycie chlamydii.
Materiał do badania: tkanki (płuca, jelita), w postaci rozrodczej wymaz z szyjki macicy.
Lawsonia intracellularis
Rozrostowe zapalenie jelit świń (PPE) jest wywołane przez wewnątrzkomórkową bakterię Lawsonia intracellularis. Infekcja ta występuje bardzo powszechnie w stadach świń. U
zwierząt stwierdza się biegunki oraz zahamowanie wzrostu. Przyżyciowa diagnostyka
mozliwa jest tylko przy pomocy PCR.
Materiał do badania: kał.
Mycoplasma hyopneumoniae
Mycoplasma hyopneumoniae jest głównym czynnikiem etiologicznym enzootycznego
zapalenia płuc świń (EPP). Choroba ta jest bardzo szeroko rozpowszechniona i powoduje
znaczne straty ekonomiczne w produkcji świń. PCR umożliwia czułą i swoista diagnostykę.
Materiał do badania: tkanki (płuca), wypłuczyny z oskrzeli.
PCV
Circowirus świń typu II (PCV II) jest identyfikowany z tzw. poodsadzeniowym zespołem
wyniszczającym (PMWS). PMWS obserwuje się najczęściej u prosiąt odsadzonych,
rzadziej przed odsadzeniem. PCR umożliwia wykrycie wirusa w tkankach chorych prosiąt.
Materiał do badania: płuca, wątroba, wszystkie tkanki limfatyczne, nerki, trzustka.
PPV
Infekcja PPV (parvowirus świń) powoduje zespół SMEDI, który odpowiedzialny jest za
obniżenie plenności loch. Metoda PCR charakteryzuje się wysoką czułością i swoistością.
Materiał do badania: tkanki (płuca, wątroba, nerki).
PRRSV z różnicowaniem na podtypy US / EU
Infekcja wirusem zespołu rozrodczo oddechowego świń może powodować ronienia w
ostatnich dniach ciąży, rodzenie się prosiąt martwych lub słabych jak również choroby
układu oddechowego. Przy pomocy PCR wirus może być szybko i pewnie wykryty. W
szczepieniach jest wykorzystywany typ amerykański PRRSV, dzięki czemu w badaniu
można wykryć europejski szczep terenowy.
Materiał do badania: narządy (płuca, wątroba, nerki), krew, surowica.
5
Salmonella spp.
Salmonelloza należe do najczęstszych chorób zakaźnych ludzi i zwierząt. PCR umożliwia
szybkie i pewne wykrycie bakterii, również u zwierząt będących bezobjawowymi
nosicielami.
Materiał do badania: kał.
Koszt badania PCR:
€ 23,00 (netto)
od 5 próbek
€ 17,90 (netto)
od 10 próbek
€ 14,30 (netto)
Czas potrzebny do wykonania badania – 2 dni
• ptaki
Chlamydia spp.
Chlamydia psittaci po przeniesieniu na człowieka może powodować zapalenie spojówek,
choroby dróg oddechowych. Zakażenie następuje przez wdychanie cząstek wyschniętego
kału zakażonych papug. Badanie PCR umożliwia również wykrycie i zróżnicowanie
Chlamydia trachomatis i Chlamydia pneumoniae.
Materiał do badania: kał lub wymaz z kloaki.
PBFD = Psittacine Beak and Feather Disease
Również ptaki z postacią bezobjawową choroby mogą być szybko i pewnie wykryte przy
pomocy PCR.
Materiał do badania: 1-2 krople krwi EDTA lub pióra z miazgą.
Polyomavirus u ptaków
U piskląt ma przebieg częściowo śmiertelny, zaś u ptaków dorosłych z objawami
posocznicy i zapalenia wątroby przebiegająca. PCR umożliwia jednoznaczną diagnostykę
infekcji.
Materiał do badania: 1-2 krople krwi EDTA lub pióra z miazgą.
Koszt badania PCR:
€ 23,00 (netto)
Oferta pakietowa (obejmuje PBFD, Polyomavirus oraz oznaczanie płci):
€ 51,10 (netto)
Czas potrzebny do wykonania badania – 2 dni
LABOKLIN Polska Sp. z o.o. • ul. Powstanców Slaskich 101 • PL 01-495 Warszawa • tel/fax::+ 48 22 691 93 10 • www.laboklin.pl • E-Mail: [email protected]
6