Kompleksowa analiza działania oligonukleotydów jako

OFERTA DLA MAGISTRANTA
W RAMACH PROJEKTU SONATA 9
Zakład Biomedycyny Molekularnej Instytutu Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk w
Poznaniu poszukuje dwóch magistrantów do realizacji tematu:
Kompleksowa analiza działania oligonukleotydów jako potencjalnych
terapeutyków w chorobach poliglutaminowych
finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki w ramach projektu SONATA 9.
Projekt ten ma na celu znaczące pogłębienie wiedzy na temat różnego typu efektów działania
potencjalnie terapeutycznych oligonukleotydów, które mogłyby być stosowane dla grupy
neurodegeneracyjnych chorób człowieka, tj. chorób poliglutaminowych (poliQ). Niezwykle
obiecującym podejściem jest celowanie z użyciem syntetycznych oligonukleotydów bezpośrednio w
miejsce mutacji, tj. wydłużony ciąg powtórzeń CAG. Specyficznie zaprojektowane oligonukleotydy
preferencyjnie obniżają poziom allelu zmutowanego odpowiedzialnego za chorobę Huntingtona (HD)
i ataksję rdzeniowo-móżdżkową typu 3 (SCA3). W ramach zadań projektu będą wykonane różnego typu
analizy molekularne w celu pełnej charakterystyki aktywności oligonukleotydów. Badania pozwolą na
wnikliwe porównanie szerokiego spektrum działania różnego typu oligonukleotydów: efektów
odwracania ścieżek patogenezy, jak i niepożądanych efektów ubocznych. Badania wykonane w
modelach komórkach typu neuronalnego będą miały większe przełożenie na możliwą aktywność
oligonukleotydów dla komórek, których głownie dotyczy patogeneza chorób poliQ.
Metodyka
Będą zastosowane zarówno metody dedykowane do analizy poszczególnych transkryptów, miRNA i
białek (takie jak: RT-PCR, western blot, immunofluorescencja), jak i cało-transkryptomowe metody
(RNA Seq) oraz testy pozwalające na ocenę specyficznych szlaków komórkowych. Prowadzone będą
hodowle mysich i ludzkich linii komórkowych, w tym neuronalnego typu, oraz rutynowo będzie
wykonywana transfekcja tych linii z użyciem oligonukleotydów.
Zainteresowane osoby proszone są o przesyłanie aplikacji wraz z CV i listem motywacyjnym,
zawierającym następujące informacje: tytuł i opiekun pracy licencjackiej/inżynierskiej, opis aktywności
naukowej na adres kierownika projektu: [email protected] do dnia 15 listopada 2016 roku.
Wynagrodzenie płatne w formie umowy o dzieło w wysokości 500 zł brutto.
Szczegółowe informacje:
Dr Agnieszka Fiszer
Tel. 618528503 wew. 117
e-mail: [email protected]