Streszczenie pracy dyplomowej Badania nad rolą lipidów
Transkrypt
Streszczenie pracy dyplomowej Badania nad rolą lipidów
Streszczenie pracy dyplomowej Badania nad rolą lipidów prenylowych u roślin Lipidy prenylowe to grupa związków szeroko rozpowszechniona w przyrodzie. Cząsteczki lipidów prenylowych są zbudowane z pięciowęglowych reszt izoprenoidowych (C5). W skład tej zróżnicowanej grupy wchodzą m.in. takie związki jak: sterole, tokoferole, chlorofile, karotenoidy czy alkohole poliizoprenoidowe. Alkohole poliizoprenoidowe są liniowymi polimerami złożonymi z kilku do ponad 100 reszt izoprenoidowych (merów) połączonych „głowa do ogona”. W zależności od obecności wiązania podwójnego w OH- końcowej reszcie izoprenoidowej (reszcie α) można alkohole poliizoprenoidowe podzielić na dwie grupy związków: poliprenole i dolichole. W cząsteczkach dolicholi to wiązanie podwójne uległo uwodornieniu w odróżnieniu od α -nienasyconych poliprenoli. Cechą charakterystyczną alkoholi poliizoprenoidowych jest występowanie w komórkach w postaci „rodzin” tzn. mieszanin homologów. Uważa się, że skład rodziny alkoholi poliizoprenoidowych u roślin (w tkankach fotosyntetycznych) jest charakterystyczny dla danej rośliny i może być uważany za marker chemotaksonomiczny. Trzeba jednak pamiętać, że o różnicach w składzie poliizoprenoidów w zależności od tkanki, w której występują. Alkohole poliizoprenoidowe w komórkach są umiejscowione w strukturach błonowych. Pełnią w komórkach wiele ważnych ról, formy ufosforylowane, występujące w małych stężeniach, biorą między innymi udział w prenylacji białek oraz N- i Oglikozylacji. Rola form wolnych oraz zestryfikowanych kwasami karboksylowymi, gromadzonych w komórkach w znaczących ilościach, jest jeszcze nie do końca jasna, wiadomo jednak że mają one wpływ na płynność i stabilność błon komórkowych. Stanowią także „tarczę” komórki przed reaktywnymi formami tlenu. Wiadomo, że wszystkie organizmy akumulują alkohole poliizoprenoidowe w czasie starzenia. Można by oczekiwać równoczesnych zmian poziomu ekspresji cisprenyltransferaz, enzymów odpowiedzialnych za syntezę alkoholi poliizoprenoidowych. Mało jest doniesień literaturowych o zmianach zawartości poliizoprenoidów w tkankach hodowanych in vitro. Poliizoprenoidy są podatne na oksydację, co pozwala na łatwe uzyskanie epoksydowanych pochodnych tych związków. Badania przeprowadzone na komórkach zwierzęcych ujawniły, że pochodne te wpływają stymulująco na syntezę koenzymu Q, a także hamują biosyntezę cholesterolu. Wpływ tej grupy związków na komórki roślinne pozostaje nieznany. Celem pracy było zbadanie wpływu czasu hodowli i epoksydu fitolu na zawartość alkoholi poliizoprenoidowych w korzeniach Arabidopsis thaliana. Wpływ czasu hodowli badano prowadząc hodowlę korzeni trwającą sześć tygodni. Po każdym tygodniu hodowli pobierano próbki korzeni, z których ekstrahowano lipidy i analizowano metodą HPLC/UV. Wyniki te skorelowano z badaniami poziomu ekspresji cis-prenyltransferaz metodą półilościowego RT-PCR. Kontrolowano także poziom źródła węgla (sacharozy) w pożywce metoda refraktometryczną. Uzyskane wyniki pozwalają stwierdzić, że ilość alkoholi poliizoprenoidowych wzrasta w czasie hodowli. Wyniki te sugerują, że wzmożona akumulacja poliizoprenoidów nie musi być powiązana ze wzrastającym poziomem transkrypcji cis-prenylotransferaz. Sacharoza była konsumowana przez korzenie, ale przez cały czas doświadczenia była obecna w pożywce. Stwierdzono obecność dwóch rodzin alkoholi poliizoprenoidowych, o dłuższych i krótszych cząsteczkach. Długość czasu hodowli wpływa na zmianę dominującego homologu w rodzinie dłuższych homologów. W celu zbadania wpływu epoksydu fitolu przeprowadzono syntezę tego związku metodą reakcji z nadtlenokwasem i oczyszczono na kolumnie chromatograficznej. Strukturę uzyskanego produktu potwierdzono metoda HPLC/ESI-MS. Korzenie hodowano na pożywce zawierającej różne stężenia epoksydu. Z uzyskanych korzeni wyekstrahowano lipidy prenylowe i zanalizowano metodą HPLC/UV. Na podstawie uzyskanych wyników można stwierdzić, że najkorzystniejszym stężeniem wpływającym za zwiększenie zawartości alkoholi poliizoprenoidowych jest stężenie 20μM, a negatywny wpływ ujawnia się przy stężeniu 200μM. Różnice w stężeniu epoksydu fitolu w pożywce wpływają na długość dominującego homologu w rodzinie dłuższych homologów. Stwierdzono także, że obecność alkoholu etylowego w pożywce wpływa korzystnie na zawartość alkoholi poliizoprenoidowych. Wyniki te wskazują też, że korzenie włośnikowe Arabidopsis hodowane in vitro są dobrym modelem do badań metabolizmu poliizoprenoidów.