Nr wniosku: 187800, nr raportu: 6580. Kierownik (z rap.): mgr inż

Nr wniosku: 187800, nr raportu: 6580. Kierownik (z rap.): mgr inż. Piotr Szulc
Zadania projektu tyczyły się lokalizacji genów, zarówno od strony teoretycznej jak i praktycznej. Część teoretyczna to
dowody twierdzeń: o zgodności kryteriów mBIC i mBIC2 w sytuacji, gdy błąd losowy w modelu regresji nie pochodzi z
rozkładu normalnego, oraz o zgodności mBIC i mBIC2 w wersji rangowej. Oba twierdzenia dowodzą, że kryteria mają
dobre teoretyczne własności, które przekładają się na praktykę: wraz ze wzrostem liczby osobników
prawdopodobieństwo, że zlokalizujemy wszystkie istotne geny (i nie znajdziemy fałszywych) dąży do jedynki.
W części praktycznej pokazano, jak stosować mBIC i mBIC2 (po modyfikacji) w tak zwanych populacjach mieszanych,
gdy prócz genotypów posiadamy informacje o pochodzeniu fragmentów genomów. Obszerne symulacje w sytuacji
bliskiej rzeczywistej pokazały, że zastosowanie tych kryteriów umożliwia zlokalizowanie większej liczby istotnych
genów. Oprócz tego udostępniono oprogramowanie do lokalizacji genów w populacjach mieszanych oraz rozszerzono
bibliotekę programów do lokalizacji genów o algorytm genetyczny, co daje większe możliwości potencjalnym
użytkownikom w ocenie, na ile wybrany model jest prawidłowy.
Wyniki uzyskane w projekcie powinny sprawić, że wiedza o mBIC i mBIC2 trafi do szerszego grona odbiorców. Ja i mój
zespół już dawno temu pokazaliśmy, ile można zyskać, stosując proponowane przez nas podejście zamiast klasycznego.
Niestety, nie jest łatwo przekonać genetyków, by korzystali z nowych rozwiązań, gdyż po pierwsze brak jest odpowiednio
prostych narzędzi, bazujących na tych rozwiązaniach (mam nadzieję, że biblioteka programów ten stan zmieni), a po
drugie istnieje wiele innych kryteriów wyboru modelu z dobrymi wynikami w symulacjach, które jednak mogą zależeć od
odpowiednio dobranych parametrów. Pokazanie teoretycznych własności, z którymi nie ma dyskusji, powinno umocnić
pozycję mBIC i mBIC2, a końcowych rezultatem będzie to, że uda nam się znaleźć nowe geny.